Enzim dan Bioteknologi

Presentasi-2

Prof. Dr. Ramlan Silaban, M.Si.

Irving Josafat Alexander, S.Si., M.Si.
Delanining Saragih, S.Si.
Prodi Kimia-Jurusan Kimia - FMIPA
Universitas Negeri Medan
05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 1
 Referensi :
• Campbell, Essential in Biochemistry
• Harper, Review of Physiological Chemistry, last edition
• Lehninger, Biochemistry,
• Page D., Biochemistry,
• Voet & Voet, Biochemistry; John Wiley & Sons,
Singapore, 1995
• Wiseman A., Enzyme biotechnology, John Wiley&Sons
• Journal of enzymology
• Journal of Biochemistry
• Journal of Analytical Biochemistry
• Berbagai artikel ilmiah dari jurnal lainnya cetak
maupun on-line di internet
• Lapangan
• Industri
05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 2
 Ada 2 Zat kimia penting dalam
tubuh manusia :
• ENZIM • HORMON

• Zat kimia yang • Zat kimia yang

berperan sebagai berperan sebagai
KATALIS reaksi REGULATOR reaksi
kimia di dalam kimia di dalam tubuh
maupun luar sel • Merupakan PROTEIN
• Merupakan PROTEIN dan NON PROTEIN

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 3

04/05/21 Prof Ramlan Silaban 4
 Enzim :

1. Sangat diperlukan dan proses bioteknologi

2. Berubahnya substrat (zat awal) menjadi
produk, dapat berlangsung oleh SEL utuh
atau juga oleh Enzim
3. Proses pengubahan oleh SEL bakteri,
sangat kompleks, produknya beragam
4. Proses pengubahan oleh ENZIM, sangat
spesifik produknya, namun terbatas.
05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 5
04/05/21 Prof Ramlan Silaban 6
 Introduction
(Lehninger, pp 190)
• Apakah enzim itu ? Mengapa diperlukan
oleh tubuh
• Mengapa “Bioteknologi” membahas enzim
• Apakah hubungan enzim dengan protein
• Apakah spesifitas enzim
• Coba sebutkan dan jelaskan komponen
suatu enzim
• Enzim adalah protein yang menunjukkan
aktifitas katalitik
05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 7
 PROTEIN FUNCTIONS
• Catalys or biocatalys
• Transportation
• Respiration
• To form structure
• Antibodi
• Signaling on the cell communication
• Source of energy and others chemical
compounds (metabolites) in the cell
 Beberapa Terminologi
-Enzim adalah protein yang memiliki
aktifitas katalitik sehingga sering disebut
sebagai BIOKATALIS
-Reaksinya sangat spesifik, artinya satu
enzim satu substrat
-- bahkan sangat streospesifik, misalnya
enzim yang dihasilkan oleh ragi yaitu
alcohol dehydrogenase, yang
mengkatalisis oksidasi alkohol menjadi
asetaldehida dan menghasilkan energi
dalam bentuk NADH

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 9

• Enzim merupakan senyawa organik
bermolekul besar yang berfungsi untuk
mempercepat jalannya reaksi
metabolisme di dalam tubuh tumbuhan
tanpa mempengaruhi keseimbangan
reaksi
• Enzim tidak ikut bereaksi, struktur enzim
tidak berubah baik sebelum dan sesudah
reaksi tetap
• Enzim sebagai biokatalisator
• Bagian enzim yang aktif adalah sisi aktif
dari enzim
05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 10
Enzim bekerja dengan cara
menempel pada permukaan
molekul zat-zat yang bereaksi
dan dengan demikian
mempercepat proses reaksi.
Percepatan terjadi karena
enzim menurunkan energi
pengaktifan (gambar)
05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 11
 Komponen Enzim
• Apoenzyme
• Cofactor Latihan-1 :
• Holoenzyme Agar mahasiswa
• Active site mencari defenisi
atau pengertian
• Active centre
nya dan ditulis di
• Specifity residue Buku Catatan
• Catalytic residue
• Coenzyme
• Prostetic

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 12

 Susunan enzim
• Komponen utama enzim adalah protein
• Protein yang sifatnya fungsional, bukan
protein struktural
• Tidak semua protein bertindak sebagai
enzim

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 13

 The common coenzyme
Coenzyme Reaction mediated
Biotin Carboxylation
Cobamide (B12) Alkylation
Coenzyme A Acyl transfer
Flavin Oxidation-reduction
Lipoic acid Acyl trasfer
Nicotinamide Oxidation-reduction
Pyridoxal phosphate Amino group transfer
Tetrahydofolate One-carbon group
05/04/21
transfer
Prof. Ramlan Silaban 14
 Vitamins are coenzyme precursors
Vitamin Coenzyme Human deficiency
disease
Biotin Biocytin X
Cobalamin (B12) Cobamide Pernicious anemia
Folic acid Tetrahydofolate Megaloblastic anemia
Nicotinamide Nicotinamide coenzyme Pellaggra
Pantothenate Coenzyme-A X
Pyridoxine (B6) Pyridoxal phosphate Sistem syaraf pusat
Riboflavin (B2) Flavin coenzyme X
Thiamine (B1) Thiamine pyrophasphate Beri-beri

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 15

 Enzyme classification

Classification Type of reaction catalyzed

Oxidoreductases Oxidation-reduction reaction

Transferases Transfer of functional groups

Hydolases Hydrolisis reaction

Lyases Group elimination to form

double bonds
Isomerases Isomerization

Ligases Bond formation coupled with

05/04/21
ATP hydolysis
Prof. Ramlan Silaban 16
 Contoh
beberapa
enzim dalam
metabolisme

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 17

 Tata nama enzim
• Enzim diberi nama sesuai dengan nama substrat dan
reaksi yang dikatalisis
• Biasanya ditambah akhiran ase
• Enzim dibagi ke dalam 7 golongan besar
• Nomor EC (Enzyme Commission / EC number) adl
sistem klasifikasi untuk enzim berdasarkan reaksi
kimia yang dikatalisasi, cth:EC 3.4.11.4
• (1995, International Conggress of Biochemistry)

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 18

 Mechanism of enzyme action
• Enzim sebagai biokatalis, bekerja
menurunkan energi aktifasi (Ea)
• Tidak mengubah apakah pada awalnya
eksoterm atau endoterm
• Energi aktifasi adalah energi minimum
yang harus dimiliki oleh pereaksi untuk
dapat melangsungkan reaksi

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 19

 Quantitative analysis of enzyme activity
Analisis Kuantitatif Reaksi Enzim

• Unit activity (Aktifitas unit)

• Specifity activity (Aktifitas spesifik)
• Angka pergantian (Turn over number)

Agar di cari
defenisi dan
contoh soalnya
05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 20
 Latihan-2
• Mengapa suatu enzim rusak? Jelaskan beberapa
faktor yang mungkin dapat merusak enzim
• Seorang ibu rumah tangga memasak ekstrak
nenas untuk membuat kue. Apakah nama enzim
dalam nenas, lalu bagaimana kah nasib enzim
kandungannya?
• Apa beda enzim terdenaturasi dengan enzim
terhidrolisis? Jelaskan
• Dikumpul pada pertemuan kedua, pribadi, tulis
tangan

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 21

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 22
 Mekanisme Reaksi Enzim
• Enzim sebagai biokatalis, bekerja
menurunkan energi aktifasi (Ea)
• Tidak mengubah apakah pada awalnya
eksoterm atau endoterm
• Energi aktifasi adalah energi minimum
yang harus dimiliki oleh pereaksi untuk
dapat melangsungkan reaksi

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 23

FAKTOR YANG MEMPENGARUHI
AKTIFITAS ENZIM
• SUHU
• KEASAMAN
• WAKTU
• KONSENTRASI SUBSTRAT
• KONSENTRASI ENZIM
• INHIBITOR
• AKTIVATOR

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 24

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 25
 Latihan-3
Suatu enzim protease diisolasi dari
pankreas sapi. Reaksi enzim dilakukan
pada suhu 37oC dan pH 5,0 selama 60
menit. Jika substrat semula ada sebanyak
0,050 gr dan sesudah reaksi sisa 0,045 gr.
Tentukanlah aktifitas enzim jika dalam
preparat enzim ada protein sebanyak
0,020 gr

05/04/21 Prof. Ramlan Silaban 26