KEMOINFORMATIKA

DASAR
TABITHA RACHEL TURNIP
110121175
KP D
 TUJUAN DAN TEORI
• Tujuan:
Tujuan: Pengenalan
Pengenalan terhadap
terhadap dasar-dasar
dasar-dasar aplikasi
aplikasi teknologi
teknologi IT
IT di
di bidang
bidang kimia
kimia maupun
maupun kefarmasian
kefarmasian
• Teori:
Teori:
Kemometrik
Kemometrik adalah
adalah pendekatan
pendekatan kimia
kimia analitik
analitik yang
yang didasarkan
didasarkan pada
pada observasi
observasi data
data hasil
hasil analisis
analisis kimia.
kimia.
Pengukuran
Pengukuran yang
yang berkaitan
berkaitan dengan
dengan komposisi
komposisi kimia
kimia suatu
suatu zat
zat dilakukan
dilakukan dan
dan nilai
nilai parameter
parameter yang
yang
diinginkan
diinginkan selanjutnya
selanjutnya disimpulkan
disimpulkan melalui
melalui pendekatan
pendekatan hubungan
hubungan matematis.
matematis. Definisi
Definisi ini
ini memberi
memberi pesan
pesan
bahwa
bahwa kemometrik
kemometrik adalah
adalah suatu
suatu proses.
proses. Pengukuran
Pengukuran dilakukan,
dilakukan, data
data dikumpulkan,
dikumpulkan, dan
dan informasi
informasi yang
yang
diperoleh
diperoleh dinilai
dinilai secara
secara berkala
berkala untuk
untuk memperoleh
memperoleh pengetahuan
pengetahuan aktual
aktual dari
dari data.
data.
Kemoinformatika,
Kemoinformatika, yang
yang merupakan
merupakan subbidang
subbidang dari
dari kemometrik,
kemometrik, meliputi
meliputi analisis,
analisis, visualisasi,
visualisasi, dan
dan
penggunaan
penggunaan informasi
informasi kimia
kimia sebagai
sebagai variabel
variabel pengganti
pengganti untuk
untuk data
data atau
atau informasi
informasi lain.
lain. Kemoinformatika
Kemoinformatika
memanfaatkan
memanfaatkan teknik
teknik dari
dari banyak
banyak disiplin
disiplin ilmu
ilmu seperti
seperti pemodelan,
pemodelan, informasi
informasi kimia,
kimia, dan
dan kimia
kimia komputasi.
komputasi.
Kemoinformatika
Kemoinformatika mengembangkan
mengembangkan teknik
teknik eksperimen
eksperimen seperti
seperti kimia
kimia kombinatorial
kombinatorial dandan penyaringan
penyaringan
throughput
throughput tinggi,
tinggi, yang
yang membutuhkan
membutuhkan keahlian
keahlian kimia
kimia untuk
untuk menganalisis
menganalisis data.
data. Akses
Akses ke
ke algoritma
algoritma yang
yang
sesuai
sesuai sangat
sangat penting
penting jika
jika teknik
teknik eksperimen
eksperimen seperti
seperti itu
itu ingin
ingin dimanfaatkan
dimanfaatkan secara
secara efektif
efektif untuk
untuk penelitian.
penelitian.
 PROSEDUR
• Unduh Marvin terlebih dahulu pada laptop
•Buka MarvinSketch, kemudian gambarkan struktur kimia dari etana (C2H6),
etena (C2H4), dan etuna (C2H2).
•Simpanlah gambar struktur-struktur kimia tersebut dalam format (.mol2) dan
(.SMILES)
•Gambarlah reaksi kimia asam asetat yang terionisasi menjadi ion asetat dan
H+
•Salinlah gambar tersebut dalam aplikasi notepad ataupun wordpad.
• Gambar struktur obat (pilih 3 dari literatur) dan tentukan berat molekul,
formula, komposisi, pKa menggunakan program MarvinSketch
ETANA (C2H6) 2D
ETANA (C2H6) 3D
ETANA (C2H6) 3D
ETENA (C2H4) 2D
ETENA (C2H4) 3D
ETENA (C2H4) 3D
ETUNA (C2H2) 2D
ETUNA (C2H2) 3D
ETUNA (C2H2) 3D
CH3OOH
IBUPROFEN
IBUPROFEN
 PEMBAHASAN IBUPROFEN
• Berdasarkan
Berdasarkan MarvinSketch,
MarvinSketch, ibuprofen
ibuprofen memiliki
memiliki rumus
rumus molekul
molekul C
C13 022 dan
H180
13H18 dan berat
berat molekul
molekul 206,285
206,285
g/mol
g/mol serta
serta memiliki
memiliki komposisi
komposisi atom
atom C
C (75,69%),
(75,69%), atom
atom H
H (8,80%),
(8,80%), dan
dan atom
atom O
O (15,51%).
(15,51%).
• Kita
Kita juga
juga mengetahui
mengetahui bahwa
bahwa nilai
nilai pKa
pKa ibuprofen
ibuprofen terdapat
terdapat pada
pada struktur
struktur 1
1 di
di pH
pH 0,0
0,0 hingga
hingga 0,40
0,40
memiliki
memiliki presentase
presentase 100%
100% pada
pada suasana
suasana asam.
asam.
• Ibuprofen
Ibuprofen adalah
adalah obat
obat dengan
dengan fungsi
fungsi untuk
untuk meredakan
meredakan nyeri
nyeri sakit
sakit kepala,
kepala, sakit
sakit gigi,
gigi, sakit
sakit
punggung,
punggung, nyeri
nyeri haid,
haid, nyeri
nyeri otot
otot juga
juga untuk
untuk menurunkan
menurunkan demam
demam dan
dan meredakan
meredakan nyeri
nyeri ringan
ringan dan
dan
sakit
sakit akibat
akibat pilek
pilek atau
atau flu.
flu. Ibuprofen
Ibuprofen adalah
adalah golongan
golongan nonsteroidal
nonsteroidal anti-inflammatory
anti-inflammatory drug
drug
(NSAID).
(NSAID). Obat
Obat ini
ini bekerja
bekerja dengan
dengan menghalangi
menghalangi produksi
produksi zat
zat alami
alami dalam
dalam tubuh
tubuh yang
yang menyebabkan
menyebabkan
peradangan.
peradangan. Ketika
Ketika merasakan
merasakan sakit,
sakit, nyeri,
nyeri, atau
atau mengalami
mengalami peradangan,
peradangan, tubuh
tubuh akan
akan secara
secara alami
alami
menghasilkan
menghasilkan zatzat kimiawi
kimiawi yang
yang disebut
disebut dengan
dengan prostaglandin.
prostaglandin. Ibuprofen
Ibuprofen mempunyai
mempunyai kemampuan
kemampuan
untuk
untuk menghentikan
menghentikan produksi
produksi prostaglandin
prostaglandin oleh
oleh tubuh,
tubuh, sehingga
sehingga rasa
rasa nyeri
nyeri pun
pun hilang.
hilang.
ASPIRIN
ASPIRIN
PEMBAHASAN ASPIRINC9H8O4

• Diketahui pada MarvinSketch, bahwa rumus molekul aspirin adalah C99H88O44 dan
memiliki berat molekul sebesar 182,175 g/mol serta memiliki komposisi atom C
(59,34%), atom H (5,53%), dan atom O (35,13%)
• Kita juga mengetahui bahwa nilai pKa aspirin terdapat pada struktur 1 dimana pH
0,0 hingga 13,20 memiliki presentase 100%
• Aspirin adalah obat untuk meredakan nyeri, demam, dan peradangan. Selain itu, obat
yang dikenal juga dengan nama asam asetisalisilat ini juga digunakan untuk
mencegah terbentuknya gumpalan darah, sehingga menurunkan risiko terjadinya
serangan jantung atau stroke pada penderita penyakit kardiovaskular.
SIMVASTATIN
SIMVASTATIN
 PEMBAHASAN SIMVASTATIN
oBerdasarkan MarvinSketch, simvastatin memiliki rumus molekul C2525H3838O55, berat molekul
sebesar 418,574 g/mol dengan komposisi atom C (71,74%), atom H (9,15%), dan atom O
(19,11%).
oDidapatkan juga, bahwa dari hasil praktikum ini, bahwa nilai pKa simvastatin terdapat
pada struktur 1 dimana pH 0,0 hingga 10,60 memiliki presentase 100%.
oSimvastatin adalah obat yang berfungsi menurunkan kolestrol dan lemak jahat seperti LDL
dan trigliserida. Obat ini juga dapat membantu kolestrol baik seperti HDL dalam darah.
Simvastatin adalah obat yang berfungsi menurunkan kolesterol dan lemak jahat (seperti
LDL, trigliserida). Obat ini juga dapat membantu meningkatkan kolesterol baik (HDL)
dalam darah. Simvastatin termasuk dalam golongan obat statin. Obat ini bekerja dengan
cara menurunkan jumlah kolesterol yang dihasilkan hati. Menurunkan kolesterol jahat,
trigliserida, serta meningkatkan kolesterol baik yang dapat membantu mencegah penyakit
jantung, stroke, dan serangan jantung.
 PEMBAHASAN
Berdasarkan hasil dari praktikum kemoinformatika ini, kita dapat
membentuk stuktur kimia dari etana, etena, etuna, juga asam asetat,
bahkan obat-obatan seperti ibuprofen, aspirin, dan simvastatin. Kita
juga dapat mengetahui susunan pembentuk dari senyawa tersebut dari
berat molekul, formula, komposisi, pH, dan pKa. Struktur kimia dari
setiap senyawa kimia selalu berbeda, maka dapat disimpulkan bahwa
dengan mengetahui perbedaan struktur tersebut dapat mempengaruhi
pembuatan obat.
TERIMA KASIH!