Tujuan Umum:

memahami fakta bahwa adanya berbagai struktur yang

BERBEDA, walaupun rumus molekulnya SAMA

Tujuan khusus:
• memahami adanya berbagai jenis keisomeran
• mampu membedakan satu isomer dengan jenis isomer
lainnya
• mampu menuliskan berbagai kemungkinan struktur
molekul dari satu rumus yang sama
Konformasi
• Konformasi adalah penataan bentuk-bentuk molekul pada ruang tiga dimensi akibat
putaran pada poros ikatan tunggal (gol. alkana atau molekul yang memiliki gugus alkil)
• Setiap molekul yang tersusun oleh ikatan tunggal memiliki tak terhingga konformer
• Kajian konformasi hanya ditujukan pada konformer-konformer tertentu saja, yaitu yang
paling stabil dan paling tidak stabil
Contoh: konformer-konformer pada molekul etana (C2H6)

Konformer A dan C adalah dua konformer yang sama dan lebih stabil dari konformer B
Cara menyatakan konformasi dengan proyeksi Newman

Perhatikan kembali konformer pada etana

C depan
kiri
atas
kanan

kiri
bawah
kanan
C belakang kiri kanan

atas
C depan digambarkan oleh ‘titik’
kanan kiri C belakang digambarkan oleh ‘bola’

Proyeksi Newman

kanan
kiri

bawah
Cara menyatakan konformasi dengan proyeksi Newman
Dua konformer etana yang penting: ‘nyaman’ dan ‘gerhana’

‘gerhana’
‘nyaman’ ‘nyaman’

‘nyaman’ ‘gerhana’ ‘nyaman’

Jarak antar gugus hidrogen Jarak antar gugus hidrogen Jarak antar gugus hidrogen
lebih berjauhan lebih berdekatan lebih berjauhan
Energi potensial konformer etana
TS = keadaan transisi yang diperlukan untuk terjadi perputaran ke sudut torsi
selanjutnya = besarnya 3 kkal/mol
Analisis konformer lebih lanjut: butana (C4H10)

Ada tiga konformer yang penting: anti, gauche (kurang nyaman), dan ‘gerhana’

Interaksi tolak-menolak antar gugus metil cukup signifikan

Energi potensial konformer pada butana

Semakin besar gugus-gugus yang berinteraksi secara fisik, semakin

menyulitkan perputaran pada sumbu ikatan tunggal
Konformasi senyawa siklik: sikloheksana (konformer kursi)

Perhatikan:
posisi aksial pada konformer A  berubah menjadi posisi ekuatorial pada konformer B
posisi  ( atau β) pada konformer A  tetap posisi  (atau β) pada konformer B
Energi potensial konformer-konformer pada sikloheksana

Perhatikan:
Perubahan konformer pada senyawa siklik memerlukan energi aktivasi yang jauh lebih besar
Definisi
Isomer: rumus molekul sama, tetapi struktur molekul berbeda
perbedaan struktur tersebut dapat berupa
• kerangka dasar molekul
• posisi gugus samping
• jenis gugus fungsi
• posisi gugus fungsi
• stereokimia ISOMER

Konstitusional Stereokimia
• kerangka • stereokimia relatif
• posisi gugus samping • stereokimia absolut
• jenis gugus fungsi
• posisi gugus fungsi
perlu konsep KONFORMASI
Isomer konstitusional: contoh isomer dari C4H8O
Konsep DBE (double bond equivalency)

Cincin (siklik)

Ikatan rangkap dua

Setiap kekurangan 2H dari hidrokarbon jenuh sejenis = 1 DBE

Konsep DBE (double bond equivalency)
Nilai DBE gugus fungsi:
• DBE = 0  alkohol, eter, halida, amina
• DBE = 1  alkena dan gugus karbonil (keton, aldehida, asam karboksilat, …
• DBE = 2  alkuna, nitril, …
• DBE = 3  cincin furan, piran, …
• DBE = 4  cincin benzena, piridin, …
 A New Type of Stereoisomerism
Recall: a. Constitutional isomers (butane, 2-methylpropane)
b. Stereoisomers (cis-trans cycloalkanes / alkenes)
(geometric isomers): restricted rotation molecule
c. Image-mirror image stereoisomers /
(configurational isomers)

Remember the bromination of butane:

The two 2-bromobutanes are not identical
(nonsuperimposable): They are image and mirror
image.

The two isomers are called enantiomers. Molecules

that lack reflection symmetry are chiral.
*Greek: cheir, hand  “handedness”
50:50 Mix of enantiomers : Racemic mix or
racemate
 Image and Mirror Image of
Limonene

Spruce tree Orange

 Most organic molecules owe their chirality to
the presence of a stereocenter, usually a
carbon with 4 different substituents:
Asymmetric carbon.

*C Stereocenter

If image and mirror image are superimposable:

Achiral.
Quick test: Chiral molecules lack a mirror
plane.
Asymmetric Carbon:
No Mirror Plane
Objects are Chiral and Achiral
Stereokimia: karbon kiral
C-kiral adalah ‘gugus’ karbon yang mengikat empat ‘gugus’ yang berbeda
Adanya C-kiral berakibat adanya stereokimia, yaitu perbedaan struktur molekul
HANYA akibat arah posisi ruang 3-D

Gugus alkohol pada kedua molekul Tidak ada stereokimia

memiliki stereokimia yang berbeda
Symmetry in Nature
 Escargot

20,000 : 1
Enantiomers: Absolute configuration.
Sepasang isomer yang merupakan bayangan cermin satu dari
yang lain, yang tak dapat diimpitkan

1. X-ray crystal structure. “Photo.”

2. Polarimeter: Optical rotation of plane polarized light:
Image  dextrorotatory (clockwise), (+)-
enantiomer

Mirror image  levorotatory (counter-clockwise), (-)-

enantiomer.
The Polarimeter
 Enantiomers are optically active.
Racemates are not.
Measured
α rotation
Optical rotation: [α]λ t(ºC)
=
lc
C H 2C H 3 CH2CH3
Length of Concentration
*C C* vessel (in dm (g ml-1)
H CH3 H3C H usually)
Br Br [] is called specific rotation.
-23.1 +23.1
Mirror
plane

Note: Sign of rotation does not tell you

absolute configuration
Stereokimia: stereokimia absolut (R dan S)
Stereokimia absolut adalah stereokimia pada karbon kiral yang ditetapkan secara
independen, tidak dihubungkan dengan stereokimia pada karbon kiral yang lain
Notasi yang digunakan adalah R (putaran kanan) dan S (putaran kiri)
 Naming Enantiomers
Cahn-Ingold-Prelog R,S-Nomenclature
Label all substituents at stereocenter,
starting at point of attachment, according to
the sequence rules in order of decreasing
priority: a, b, c, d (note color scheme). Look
down C-d bond:
a

a, b, c clockwise : R c C d
R
b
a, b, c counterclockwise : S
Cahn-Ingold-Prelog
1966
 Sequence Rules
1. Order by atomic number, i.e. H = 1, lowest.
Hd

* Exception: lone pair,

a
I
C c
# “zero”. E.g., amines:
N :
R CH3
d
Br
b
2. If same priority at first atom: Go to first
point of difference.
CH3
-CH2CH3 -CCH3
‹H -CH2CH2SH -CH2CH2SCH3 ‹
CH3 D
-CH2CH2OH
‹ -CHCH3 -CH2CBr3
‹ -CHCH 3
3. Multiple bonds: Add double or triple
representations of atoms at the respective other
end of the multiple bond.

C C
H H H H C C C C
C C C C
C C
C C
N C
C O H C O C N C N
H O C N C
Procedure for Assignment
of R, S
Fischer Projection: A flat stencil
Br H
Br
CH3 C CH2CH3
H

Br
Eyes in the
plane of the CH3 CH2CH3
board
H

Depending on your starting dashed-wedged line

structure, several Fischer projections are possible
for the same molecule.
Fischer Projections
Rules for handling Fischer projections:
1. Don’t rotate.
2. The mutual exchange of
any pair gives the other
enantiomer
Therefore: Two exchanges leave absolute
configuration. Example: (2R)-Bromobutane

Br CH 3 C H 2CH 3
R R R
CH3 CH2CH3 Br H H Br

H C H 2CH 3 C H3
This procedure can be used to readily assign R,S :

Do double exchanges to place d on top.

Example:
a Br a d
c b
CH3 CH2CH3 c b b c

H a
R !!
d
d

Note: There are three possible arrangements for each, R orS, e.g., R :

d R d R d R

c a b c a b

b a c
Problem: Are these two molecules the same
or opposite enantiomers? R or S ?

F F

H CH3 I H

I CH3
Solution:
b
F F d

H CH3 H CH3 b a
d c S
I I c
a

b
F F d

I H I H c b
a d S
CH3 CH3 a
c
Two Stereocenters: The Chlorination of 2-
Bromobutane
Cl
Generates:
* Cl2, hν ** RR, RS SR, SS
-HCl
Br Br
Four stereoisomers

RR SS and RS SR are enantiomer pairs

Diastereomers

Diastereomers are stereoisomers that are not

image-mirror-image-related.
Conclusion: Two stereocenters lead to
four stereoisomers Enantiomers

CH3 CH3
H Cl H Cl H
Br S Br R
H Br H
S S
S S H H
Cl S R Cl
H Br
CH3 CH3

Diastereomers CH3 CH3

S R
H Br Br H
H R
Cl Cl H
S
CH3 CH3
Assigning R,S in Diastereomers
Remember: a b c d

Piaf
Walba
The cyclic analogy:
R,R (and S,S) = trans Link carbon
R,S (and S,R) = cis atoms
Assigning R,S in Cyclic Analogs
Two Stereocenters with the Same Substituents
Br
Br2, hv
* Same procedure: SS SR RS RR
-HBr **
Br Br Diastereomers

CH3 CH3 CH3 CH3

H Br Br H H Br Br H
Br H H Br H Br Br H
CH3 CH3 CH3 CH3

This diastereomer is special: Image is superimposable with

mirror image!!! The molecule has an internal mirror plane.
The diastereomer with a mirror plane is achiral;
such diastereomers are called meso.
The Mirror Plane in a Meso
Diastereomer

Rory
Walba
The Great Kudu
Is Meso
Teaser: The Kiss of the Elephants
Chiral or Meso?
 More examples:
CH3 CH3 CH3 CH3
CH3
H * Br *
H H *
but
H * Br
CH3
CH3 CH3
No stereocenters

All cis-disubstituted cycloalkanes (with identical

substituents) are meso (or have no stereocenters;
e.g., any 1,4-disubstituted cyclohexane).
The Cyclic Analogy:
Meso is Cis
 Three Stereocenters
RRR SSS
RRS SSR Diastereomers
RSR SRS 8 Stereoisomers (maximum):
SRR RSS 4 Diastereomeric pairs of
enantiomers.
Enantiomers
Less if meso present, e.g., meso-2,3,4–tribromopentane:
CH3 CH3
H Br H Br
H Br Br H
H Br H Br
CH3 CH3
Generally: n Stereocenters give rise to a
maximum of 2n stereoisomers, e.g. 2, 4, 8, 16,
32…

Note: Stereocenters need not be adjacent for

these relationships to hold:

Br Cl H3CO F

* * *
H3C H
Stereokimia dan
unsur simetri

Jumlah stereo-
isomer = 3

Adanya simetri bidang

memperkecil jumlah
stereoisomer

Jumlah stereo-
isomer = 4
Stereokimia: stereokimia relatif (cis dan trans)

• Stereokimia relatif
menjelaskan posisi
ruang suatu gugus
terhadap gugus yang
lain
• Stereokimia relatif
berlaku untuk suatu
molekul yang memiliki
sekurang-kurangnya
dua C-kiral
Stereokimia: stereokimia cis dan trans pada alkena
Stereokimia dan konformasi: cis- dan trans-dekalin
Stereokimia dan konformasi: kolesterol
Stereokimia dan konformasi: kolesterol (semua-cis)
 How do we
separate
racemates?

Pasteur: Ammonium tartrate

crystallizes as two “enantiomeric
crystals”.
 Resolution:
The Chemical
Separation of

Enantiomers
 From nature:
The chiral
“pool”

Similar value
coincidental
Enantiomers and Physiological Activity

The handedness of the chiral herbicide metolachlor.

Drugs: Enantiomers Act Very Differently
O O

H2N R NH2
S
OH HO
H NH2
H2N H O
O

Bitter Sweet

Asparagine

Cl Cl
H3C H H CH3
HO OH
S O R
O

O Cl Cl O
Active Inactive
Dichlorprop
(Herbicide)

H OH HO H
H H
N CH2OH HOH2C N
S R

OH HO

Antagonist Bronchodilator

Albuterol
 Enantiomer Recognition
In nature: Enzymes, receptors

Synthetic: Enantiomerically pure reagents and catalysts

 Enantioselectivity:
Generating One Enantiomer from
Achiral Material

Which? A “handed”
reagent
or catalyst can
tell
the difference

Nevertheless, we still need a chiral auxiliary to generate a

new stereocenter selectively. What generated the “first”
enantiomer?
Mengapa perlu mempelajari isomer ?

Isomer-isomer memiliki sifat-sifat fisik dan kimia, serta spektroskopi dan sifat
biologis yang BERBEDA:
• Sifat fisik: titik leleh, titik didih, kelarutan, dan putaran optik
• Spektroskopi: spektrum ultra violet, inframerah, dan nuclear magnetic resonance
adalah khas untuk masing-masing senyawa
• Sifat kimia: sifat kimia tergantung kepada jenis gugus fungsi dan stereokimia
• Sifat biologis: sifat kimia tergantung kepada jenis gugus fungsi dan stereokimia
Software penulisan struktur: CS Chemdraw atau Isisdraw
Software penulisan struktur: CS Chemdraw
Software penulisan struktur: CS Chemdraw
Software penulisan struktur: CS Chem3D
Software penulisan struktur: CS Chem3D
Software penulisan struktur: CS Chem3D
Software penulisan struktur: CS Chem3D
Software penulisan struktur: CS Chem3D
Software penulisan struktur: CS Chem3D