Stereokimia

Kimia dalam tiga dimensi

 Isomer
Senyawa-senyawa yang berbeda, rumus molekul sama.

2
 Isomer Konstitusional
 Perbedaan ikatan menghasilkan perbedaan kerangka karbon
dan/atau perbedaan gugus fungsi

3
 Bioactivity

 Isomer gugus fungsi  Isomer posisi

C H3 CH3
Ph C O O Et Ph
N H2 HN O

C O O Et
N N
O
O O C H2CH3 CH3 CH3
3,4-M D A p h en acetin M e p irid in e
(E cstasy) (analgesic) (A n a lg e sic) (n o t a n a lg e sic)
 Stereoisomer (Isomer Ruang)
 Rumus molekul sama, berbeda penyusunan atom-atom / bentuk 3 dimensinya

5
Enantiomer
Enantiomer
 Bioactivity

O O

NHCH3 NHCH3

Cl Cl

S-(+)-Ketamine R-(-)-Ketamine
2-4 times more potent than Causes spontaneous motor
R-(-)-ketamine in activity and post-emergent
anaesthesia distress
 Bioactivity

(R)(+) Thalidomide (S)(-) Thalidomide

O O H O O H
H N N
H
N O N O

O O
a sedative and hypnotic a teratogen
 Stereokimia

Kiralitas Molekul

Proyeksi Fischer
Rumus Tiga Dimensi
Konformasi Newman
Molekul kiral

an asymmetric carbon
 Molekul Kiral

Suatu molekul di mana ke empat atom/gugus yang

terikat pada atom pusat tidak sama

Video: Stereoisomer
Proyeksi Fischer
 * Proyeksi Fischer

CH3 CH3 CH3 CH3

H Cl Cl H H Cl Cl H
Cl H H Cl H Cl Cl H
C2H5 C2H5 C2H5 C2H5
I II III IV
 * Rumus Tiga Dimensi

Ph D Ph
D
H CH3 H3C H
Even ‘D’ makes it different
 * Proyeksi Newman

H CH3
H H H H

H3C H H H
CH3 CH3
* Rumus Bola Pasak
* Rumus Bola Pasak
 Stereoisomer (Isomer Ruang)

Jenis-jenis Isomer Ruang :

Jenis Syarat
1. Isomer optik Atom C-kiral
2. Isomer geometri Hambatan rotasi bebas: alkena, sikloalkana
H3C CH3 H3C H
C C C C
H H H CH3
eg. cis-2-butena trans-2-butena
3. Konformer Rotasi bebas C-C (konformasi)
 ISOMER GEOMETRIK PADA ALKENA

• salah satu contoh stereoisomer

• terdapat pada alkena, tetapi bukan pada semua alkena
• terjadi karena adanya HAMBATAN ROTASI pada ikatan
C=C
• dikenal dua bentuk cis dan trans

CIS (Z) TRANS (E)

Gugus/atom berada pada Gugus/atom berada pada
SISI SAMA dari ikatan SISI BERSEBERANGAN
rangkap dua dari ikatan rangkap dua
 ISOMERI GEOMETRIK PADA ALKENA

• salah satu contoh stereoisomeri

• terdapat pada alkena, tetapi bukan pada semua alkena
• terjadi karena adanya HAMBATAN ROTASI pada ikatan C=C
• dikenal dua bentuk ...

CIS (Z) TRANS (E)

Gugus/atom berada pada Gugus/atom berada pada SISI
SISI SAMA dari ikatan rangkap BERSEBERANGAN dari ikatan
dua rangkap dua
 ISOMERI GEOMETRIK

HAMBATAN ROTASI PADA IKATAN C=C

Pada ikatan C=C terdapat hambatan rotasi sehingga gugus pada

kedua ujung ikatan tetap pada satu posisi, tidak dapat
dipertukarkan. Animation doesn’t
work in old
versions of
Powerpoint

Hal ini menimbulkan dua kemungkinan. Kedua struktur tidak

mudah untuk saling berubah, akibatnya atom-atom pada kedua
molekul menempati posisi dalam ruang yang berbeda.
 ISOMERI GEOMETRIK PADA ALKENA

E/Z atau CIS-TRANS

Z (zusammen) gugus / atom dengan prioritas lebih

tinggi pada sisi SAMA dari ikatan C=C

E (entgegen) gugus / atom dengan prioritas lebih

tinggi pada sisi BERLAWANAN dari
ikatan C=C
 ISOMERI GEOMETRIK PADA ALKENA

Z (zusammen) gugus / atom dengan prioritas lebih

tinggi pada sisi SAMA dari ikatan
C=C

E (entgegen) gugus / atom dengan prioritas lebih

tinggi pada sisi BERLAWANAN dari
ikatan C=C

Penentuan prioritas berdasarkan konvensi Cahn, Ingold and Prelog (C.I.P).

eg C2H5 > CH3 > H and I > Br > Cl > F > C > H
 ISOMERI GEOMETRIK PADA ALKENA

E/Z atau CIS-TRANS

E/Z Z (zusammen) gugus / atom dengan
prioritas lebih tinggi pada sisi
SAMA dari ikatan C=C

E (entgegen) gugus / atom dengan prioritas

lebih tinggi pada sisi
BERLAWANAN dari ikatan
C=C prioritas berdasarkan konvensi Cahn, Ingold and Prelog (C.I.P).
Penentuan
eg C2H5 > CH3 > H and I > Br > Cl > F > C > H

E Z E
Z
 ISOMERI GEOMETRIK PADA ALKENA

E/Z atau CIS-TRANS

CIS / Hanya dipakai bila terdapat dua atom H dan dua gugus non-
TRANS hidrogen yang terikat pada setiap atom karbon

cis gugus / atom non-hidrogen pada sisi

SAMA dari ikatan C=C

trans gugus / atom non-hidrogen pada sisi

BERLAWANAN dari ikatan C=C

cis trans cis trans

 sp3, bond angles = 109.5o H H
σ-bonds (sigma) C C
  HH H H
rotation about C--C (conformations)
 
representation:
“andiron” or “sawhorse”

C2H6 ethane H H
H—C—C—H
H H
 Cara Penulisan Konformer
H H H H
H
C C H H
HH H H H
HH
H H H H
1. “andiron” atau
“sawhorse” Staggered Eclipsed

H H H
H H
2. Proyeksi Newman
H
H H H H
H H

Bentuk staggered lebih stabil daripada bentuk eclipsed

 Kurva energi potensial vs rotasi

potential energy

3 Kcal

rotation about C-C

The barrier to rotation about the carbon-carbon bond in

ethane is 3 Kcal/mole. The rotation is ~ “free.”
Konformasi ikatan C2-C3 pada butana
Conformations about C2-C3 in n-butane:

CH3 H CH3
H H
H
H H H H
CH3 H3C

anti CH3/H eclipsed

CH3 H3C CH3

H3C H
H
H H H H
H H

gauche CH3/CH3 eclipsed

Kurva energi potensial vs rotasi pada C2-C3
dalam n-butana
H3CCH3

CH3

H3C
4.4-6.1 Kcal
potential energy

3.4 Kcal
0.8 Kcal
CH3
CH3 H3C

CH3 gauche
anti
rotation
Semua ikatan dalam posisi staggered dan sudut
ikatan atom karbon mendekati tetrahedral.
 180 pm

Semua sudut ikatan mendekati tetrahedral

tetapi atom H pada C1 dan C4 berdekatan
menyebabkan tegangan van der Waals.
Semua ikatan dalam posisi eclipsed,
mengakibatkan tegengan torsi pada
kinformasi perahu
Konformasi kursi dari sikloheksana
adalah bentuk yang paling stabil
dan turunan sikloheksana
hampir selalu
berada dalam konformasi kursi.
Posisi Substituen

Ikatan ekuatorial letaknya sepanjang

bidang ekuator (6 buah ikatan)
 •interkonversi kursi-kursi (ring-flipping)
•proses cepat (energi aktivasi = 45 kJ/mol)
•Semua ikatan aksial menjadi ekuatorial dan sebaliknya
KEKIRALAN
Tangan kiri & kanan: merupakan bayangan cermin, tidak dapat
dihimpitkan  tidak identik , disebut : benda kiral
Contoh benda kiral lain : sepatu, sarung tangan, kursi kuliah,
mobil
Cangkir : benda asal dan bayangan cerminnya identik, dapat
dihimpitkan  identik, disebut benda akiral
Contoh benda akiral lain : bola, hidung, kursi dosen
Suatu Benda dikatakan punya Bidang simetri : bila punya
bidang yg membagi 2 benda, shg bayangan cerminnya bisa
dihimpitkan. Benda yg punya bid. Simetri  bersifat akiral
Aktivitas optis – bila suatu senyawa memutar
bidang polarisasi (dari) cahaya terpolarisasi
bidang. (1815 oleh Biot)
Cahaya terpolarisasi bidang – cahaya yang
melewati prisma nicol atau medium polarisasi lain
sehingga semua cahaya tervibrasi pada bidang
yang sama.

tidak terpolarisasi terpolarisasi

polarimeter – alat yang digunakan untuk mengukur
aktivitas optik suatu senyawa

Lensa polarisasi analyzer

light source sample tube

dextrorotatori – bila cahaya terpolarisasi bidang
berputar searah jarum jam ketika dilihat dengan alat
polarimeter.
(+) atau (d) berbeda dengan D

levorotatori – bila cahaya terpolarisasi bidang

berputar berlawanan arah jarum jam ketika dilihat
dengan alat polarimeter.
(-) atau (l) berbeda dengan L
Rotasi spesifik – sudut perputaran cahaya
terpolarisasi bidang dari 1.00 gram per cm-3 sample
dalam tabung yg panjangnya 1 dm. [α ]D (D = lampu
Natrium, λ = 589 mμ).
α
[ α ]D = dimana α = perputaran yang diamati
l*d
l = panjang tube (dm)
d = konsentrasi (g/cc)

(+)-alanin [ α ]D = +8.5

(-)-asam laktat [α ]D = -3.8

Molekul akiral : molekul dan bayangan cerminnya adalah
senyawa sama (bukan isomer)

Molekul kiral : molekul dan bayangan cerminnya adalah

sepasang enantiomer : (-) dan (+)
enantiomer - stereoisomer yang mrpkn bayangan
cerminnya.
Sifat fisika dan sifat kimia sepasang senyawa
enantiomer adalah sama, kecuali dalam 1) arah
perputaran bid. Polarisasi (dari) cahaya terpolarisasi
bidang. 2) antaraksi dengan zat kiral lain.
Pusat kiral– adalah atom karbon yang keempat
tangannya mengikat gugus yang berbeda. (do not
confuse with “chiral”)
*
CH3CH2CHBrCH3 (CH3)2CHCH2OH

* *
CH3CHBrCHBrCH3
konfigurasi – urutan penataan gugus di sekitar suatu
atom karbon kiral (pusat kiral).
(berbeda dengan konformasi=bentuk2 yg disebabkan
rotasi mengelilingi ikatan2).
Bagaimana cara menunjukkan konfigurasi?
“wedge” formulas Proyeksi Fischer
“struktur silang”
hanya digunakan ut senyawa
yg punya pusat kiral!
Br Br
H Cl H
F Cl F
Dalam Proyeksi Fischer , ikatan horizontal pd atom
pusat selalu berposisi diatas bidang datar dan ikatan
vertikal pd atom pusat selalu berposisi di belakang
bidang datar.
( garis horizontal = “mengarah mendekati sdr.”)
Rotasi pada Proyeksi Fischer:
Proyeksi Fischer dapat diputar 180o dalam bidang
kertas/datar.
CH3 CH3
Br Cl Br Cl
H H
kiral – tidak dapat dihimpitkan pada bayangan
cerminnya. .bersifat optis aktif
akiral – dapat dihimpitkan pada bayangan cerminn;
tidak kiral. Bersifat tidak optis aktif
Hasil uji Aktivitas optis : dari molekul kiral
adalah optis aktif.
Senyawa rasemat – campuran sepasang senyawa
enantiomer dengan perbandingan 1 : 1 (bersifat optis
in-aktif) (+).
-senyawa yang punya satu pusat kiral akan
menunjukkan aktivitas optis.
-Senyawa yang tidak punya pusat kiral tidak
menunjukkan aktivitas optis (tidak optis aktif)
-Senyawa dengan lebih dari satu pusat kiral :
mungkin menunjukkan optis aktif atau mungkin
tidak menunjukkan aktifitas optis tergantung
keadaan atau mungkin dalam senyawa tersebut
punya bidang simetri (akiral) atau tidak punya
bidang simetri (kiral).
Penentuan Konfigurasi Molekul Kiral
1. Konfigurasi absolut ( R & S)
2. Konfigurasi relatif (D & L)  pada karbohidrat
& aa
Contoh: Konfigurasi relatif
Gliseraldehida

CHO CHO
H OH OH H
CH2OH CH2OH

D(+)-gliseraldehida L(-)-gliseraldehida
[20D = + 8,7 [20D = - 8,7
 1 1

Br OH
2 Cl H 4 4 H CH3 3
F CH2Br
3 2
3
CH2CH3
1 Br CH=CH2 2
H
4
Konfigurasi absolut (R/S):
A. Penentuan prioritas substituen (Sistem C.I.P/ Cahn, Ingold, Prelog).
1.Urutkan mulai dengan no.atom terbesar
2.Sbg isotop, maka prioritas adalah isotop dengan massa terbesar.
3.bila 2 atom sama, dilihat nomor dr atom berikutnya
4.bila ada ikatn rangkap, dijabarkan sbg perkalian iktn tunggalnya
B. Proyeksikan molekul dg gugus prioritas terkecil plng jauh dr mata
C. Buat lengkungan panah mulai dr prioritas tertinggi
D. Bila memutar searah jarum jam : “R” (rectus=kanan)
Bila memutar berlawanan jarum jam : “S” (sinister=kiri)
Dengan memakai model, pegang gugus prioritas terendah,
putar model sedemikian shg ketiga gugus lainnya
menghadap kita:

1 2 2 1

3 3

R S
 2
2
rotate #4 away
Cl Cl
4 H F 3 3 F
Br Br
1
1

(S)-configuration
Latihan :
a. Tentukan konfigurasinya:

H OH COOH
C2H5 CH3 H3C CH3 H2N H
NH2 H CH2OH

b. Gambar rumus konfigurasi dan Fisher dari :

1. (R)-3-bromoheptana
2. (S)-2-pentanol
Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 36, 1057 (1997).
Konfigurasi absolut untuk bromochlorofluoromethane:

Br Br

Cl H H Cl

F F

(R)-(-)- (S)-(+)-
 * * * *
aldoheksosa CH2-CH-CH-CH-CH-CH=O
OH OH OH OH OH

n pusat kiral  2n stereoisomer maksimum

n = 4  24 = 16 stereoisomer

* *
2,3-dichloropentana CH3CHCHCH2CH3
Cl Cl

n = 2  22 = 4 stereoisomer
 CH3 CH3 CH3 CH3
H Cl Cl H H Cl Cl H
H Cl Cl H Cl H H Cl
CH2 CH2 CH2 CH2
CH3 CH3 CH3 CH3
I II III IV

I & II : enantiomers; III & IV : enantiomers; I & III :

diastereomers;
I & IV : diastereomers.
diastereomer – stereoisomer yang bukan bayangan cerminnya.
(sifat fisika dan kimia senyawa2 diastereomer adalah berbeda.)
 3
H,H,H
C 3
4 H Cl 1 1
C Cl,C,H 2
CH3
2
H Cl (S)-
H Cl
CH2 2
Cl,C,H
C C 2
H2 4 H Cl 1 1
C C,H,H 3

3 (R)-
(2S,3R)-2,3-dichloropentana
 CH3 CH3 CH3 CH3
H Cl Cl H H Cl Cl H
H Cl Cl H Cl H H Cl
CH2 CH2 CH2 CH2
CH3 CH3 CH3 CH3
(2S,3R)- (2R,3S)- (2S,3S)- (2R,3R)-
 * *
2,3-dichlorobutana CH3CHCHCH3
Cl Cl

CH3 CH3 CH3 CH3

H Cl Cl H H Cl Cl H
H Cl Cl H Cl H H Cl
CH3 CH3 CH3 CH3

I II III
Senyawa-meso – senyawa yang punya pusat kirak
tetapi tidak kiral (tidak optis aktif).
Senyawa rasemat (campuran rasemat) –
campuran sepasang senyawa enantiomer dengan
perbandingan 1 : 1 (bersifat optis in-aktif) (+).
Pemisahan campuran rasemat:
- Dari bentuk kristalnya (bila berbeda)
- Mereaksikan dengan enzim tertentu
- Mengubah menjadi diastereomer
Contoh: CH3 CH3
H Cl Cl H
C2H5 C2H5

(S)-(+)-sec-butyl chloride (R)-(-)-sec-butyl chloride

[]20D = 0, dapat menunjukkan :
-Senyawa tersebut akiral
-Senyawa tersebut bentuk meso
-Merupakan senyawa rasemat
(b) reaction of a chiral molecule where bonds to the chiral
center are not broken.

* *
CH3CH2CHClCH3 + Cl2, hv  CH3CH2CHClCH2Cl
+ etc.
A reaction that does not involve the breaking of a bond to a
chiral center proceeds with retention of configuration about the
chiral center.
Can be used to “relate” configurations. If a compound can be
synthesized by such a reaction from a compound of known
configuration, then the configuration is known in the product.
 * *
CH3CH2CHCH2OH + HCl CH3CH2CHCH2Cl + H2O
CH3 CH3

It is known from X-ray crystallography that (-)-2-methyl-1-butanol is the (S)-isomer.

When pure (-)-2-methyl-1-butanol is reacted with HCl, the product is dextrorotatory.
Since no bonds to the chiral center were broken in the reaction, the (+)-1-chloro-2-methyl
butane is now known to be the (S)-isomer.

CH3 CH3
H CH2OH + HCl H CH2-Cl
C2H5 C2H5
(c) reactions like (b) in which a second chiral center is
generated:
* * *
CH3CH2CHClCH3 + Cl2, hv  CH3CHClCHClCH3
+ isomers
CH3 CH3 CH3
H Cl H Cl H Cl
+
CH2 H Cl Cl H
CH3 CH3 CH3

(S)- (R,S)- (S,S)-

diastereomers in unequal amounts

The transition states are “diastereomeric”, the Eact’s are not

equal, the rates are different.
(d) reactions of chiral compounds with optically active
reagents.
Enantiomers have the same physical properties and cannot
be separated by normal separation techniques like
distillation, etc.
Enantiomers differ in reaction with optically active reagents.
Enantiomeric acids or bases can be reacted with an optically
active base or acid to form salts that are diastereomers.
Since diastereomers have different physical properties
they can be separated by physical methods. The salts
can then be converted back into the free acids or bases.
Resolution – the separation of enantiomers.
(+)-HA + (-)-Base  [(-)-baseH+,(+)A-] +
(-)-HA [(-)-baseH+,(-)A-]
(enantiomers) (diastereomers, separable)

[(-)-baseH+,(+)-A-] + H+  (+)-HA + (-)-baseH+

[(-)-baseH+,(-)-A-] + H+  (-)-HA + (-)-baseH+

A racemic modification is converted by optically active

reagents into a mixture of diastereomers which can then be
separated. (resolved)
 (e) a reaction of a chiral compound in which a bond to a chiral
center is broken…
In a reaction of a chiral compound in which a bond to a chiral
center is broken, the stereochemistry depends on the
mechanism of the reaction.

CH3 CH3
CH3CH2CHCH2-Cl + Cl2, hv CH3CH2CCH2-Cl + isomers
* *Cl

(S)-(+)-1-chloro-2-methylbutane racemic-1,2-dichloro-2-methylbutane
optically inactive mixture
Cl-Cl 2 Cl.

C2H5
CH3
CH2-Cl + Cl. .
CH3
+ HCl
C2H5 CH2-Cl
H

Cl-Cl

CH3
sp2 hybridized flat free radical
C2H5 CH2-Cl

CH3 Cl
C2H5 CH2-Cl + C2H5 CH2-Cl
Cl CH3
In a reaction of a chiral compound in which a bond to a
chiral center is broken, the stereochemistry depends on the
mechanism of the reaction. This means that we can use the
stereochemistry of such a reaction to give us information
about the mechanism for that reaction.
Homework problem 4.24
“Altogether, the free radical chlorination of
(S)-(-)-1-chloro-2-methylbutane gave six
fractions of formula C5H10Cl2. Four fractions
were found to be optically active, and two
fractions optically inactive. Draw structural
formulas for the compounds making up each
fraction. Account in detail for optical activity
or inactivity in each case.”
 CH2Cl
H3C H Cl2, hv
C5H10Cl2 + HCl
CH2
CH3

(S)-(-)-1-chloro-2-methylbutane six fractions:

four optically active
two optically inactive
 CH2Cl CHCl2
H3C H Cl2, hv H3C H
CH2 CH2
CH3 CH3
A
No bonds to the chiral center
are broken, configuration is
retained. Product is optically
active
 CH2Cl CH2Cl CH2Cl
H3C H Cl2, hv H3C Cl Cl CH3
+
CH2 CH2 CH2
CH3 CH3 CH3
B
A bond is broken to the chiral center.
Stereochemistry depends on the
mechanism. Here, the intermediate
free radical is flat and a racemic
modification is formed. This fraction
is optically inactive.
 CH2Cl CH2Cl
H3C H Cl2, hv ClH2C C H
CH2 CH2
CH3 CH3
C
The product no longer has
a chiral center. It is achiral
and optically inactive.
 CH2Cl CH2Cl CH2Cl
H3C H Cl2, hv H3C H H3C H
+
CH2 H Cl Cl H
CH3 CH3 CH3

D E

No bond is broken to the chiral center

and a new chiral center is formed. The
products are diastereomers and each
fraction is optically active.
 CH2Cl CH2Cl
H3C H Cl2, hv H3C H
CH2 CH2
CH3 CH2Cl
F
No bonds to the chiral center
are broken, configuration is
retained. Product is optically
active
 CH2Cl
Cl2, hv CHCl2 CH2Cl CH2Cl
H3C H
H3C H H3C Cl Cl CH3
CH2
CH2 CH2 CH2
CH3
CH3 CH3 CH3
(S)-(-)-1-chloro-2-methylbutane
A B

CH2Cl CH2Cl CH2Cl

ClH2C C H H3C H H3C H
CH2 H Cl Cl H
CH3 CH3 CH3

C D E

CH2Cl
H3C H optically active
CH2 optically inactive
CH2Cl