LAPORAN PRAKTIKUM

KIMIA KOMPUTASI

Perhitungan parameter fisikokimia dengan chem office

Disusun oleh :

Nama : Maria Gabriela Uba Kelang

NPM : 11151066

Kelas : 3FA2

Sekolah Tinggi Farmasi Bandung

Jalan Soekarno-Hatta No. 754 Cibiru-Bandung

2018

MARIA GABRIELA UBA KELANG 1

TUJUAN PRAKTIKUM

Dalam praktikum ChemOffice 1 ini mahasiswa dapat menggambar struktur 2 dimensi

dari beberapa senyawa obat serta dapat mencari nama kimia struktur menggunakan

program komputer CHEM-OFFICE

DASAR TEORI

Kimia komputasi adalah suatu metode pemodelan dari struktur suatu molekul
dengan menggunakan komputer. Chemoffice merupakan salah satu aplikasi atau
program computer yang berperan dalam kimia komputasi. Chemoffice 2008 adalah
program komputer untuk menggambar struktur kimia obat secara 2 dimensi dan 3
dimensi serta dapat secara langsung menghitung secara teoritis nilai parameter sifat
kimia fisika obat.seperti berat molekul (BM). molar refraksi (MR). dll.

ChemDraw merupakan salah satu program aplikasi dari Chem Office, untuk
menggambar struktur 2D dalam bidang ilmu kimia, terutama kimia organik, biokimia, dan
polimer. ChemDraw memiliki banyak fungsi, diantaranya membuat nama dan struktur
senyawa. membuat struktur streokimia dengan benar dari nama kimia, dan mendapatkan
nama IUPAC dengan akurat dari struktur. perkiraan spektra NMR dari struktur suatu
senyawa dengan atom langsung dengan korelasi spektral. Selain itu, ChemDraw
dilengkapi dengan peringatan jika terjadi kesalahan dalam pembuatan struktur kimia.
Peringatan tersebut biasanya berwarna merah dan mengelilingi bagian struktur yang
salah.Tool-tool dalam ChemDraw mewakili berbagai macam bentuk ikatan yang dapat
disusun menjadi struktur kimia sehingga tidak sulit bagi untuk menggambarkan struktur
yang kompleks sekalipun, bahkan juga dalam berbagai bentuk konformasi dan dalam
bentuk proyeksi. Struktur-struktur tertentu yang telah umum dapat digambar secara
langsung dengan mengklik tool, seperti struktur cincin benzena, siklopentana,
sikloheksana dan senyawa siklis yang lain. Tool dalam ChemDraw juga menyajikan
gambar struktur untuk asam amino, DNA, dan RNA yang terdapat dalam template.
ChemDraw merupakan program aplikasi untuk menggambar yang di lengkapi dengan

MARIA GABRIELA UBA KELANG 2

tool-tool sehingga pengguna dapat dengan mudah membuat gambar yang diinginkan
hanya dengan mengklik tool-tool tersebut. ChemDraw juga dapat menganalisis struktur
kimia yang telah digambar dengan menggunakan Analys Struktur pada menu Structure,
di sini anda dapat mengetahui sifatsifat fisik struktur tersebut, misalnya, titik didih,titik
lelehv,beratmolekul,temperatur,tekanan,dll.
https://id.scribd.com/document/326219676/LAPORAN-PRAKTIKUM-KIMIA-
MEDISINAL-doc donwload 4-3-2018 : pkl 21.30 Wib

Chem Office merupakan salah satu software yang digunakan untuk membuat
struktur kimia dengan mudah.Sofware ini banyak memilki kelebihan untuk mempermudah
kita menggambar rumus kimia. Untukmenggambar rumus molekul kimia Chem Office
menyertakan Chem Draw dan Chem 3D.

Chemdraw merupakan software kimia dari produk Cabridgesoft.inc. ChemDraw

memiliki banyak fungsi, diantaranya membuat nama dan struktur senyawa, membuat
struktur streokimia dengan benar dari nama kimia, menghitung rumus molekul dan berat
molekul, dan mendapatkan nama IUPAC dengan akurat dari struktur. Perkiraan spektra
NMR dari struktur suatu senyawa dengan atom langsung dengan korelasi spektral. Selain
itu, ChemDraw dilengkapi dengan peringatan jika terjadi kesalahan dalam pembuatan
struktur kimia. Peringatan tersebut biasanya berwarna merah dan mengelilingi bagian
struktur yang salah.

Sedangkan Chem3D dapat digunakan untuk menggambar struktur molekul dalam

bentuk 3 Dimensi (3D), menghitung energi minimum, panjang ikatan antar atom Struktur-
struktur tertentu yang telah umum dapat digambar secara langsung dengan mengklik
tool, seperti struktur cincin benzena, siklopentana, sikloheksana dan senyawa siklis yang
lain. Tool dalam ChemDraw juga menyajikan gambar struktur untuk asam amino, DNA,
dan RNA yang terdapat dalam template, anda tinggal klik, membawanya ke layar, drag,
maka jadilah gambar struktur anda. https://hanifatiforict.wordpress.com/aplikasi-
kimia/chem-office/ ,didonwload 4-32018. pkl 22.20 Wib

MARIA GABRIELA UBA KELANG 3

ALAT DAN BAHAN

Komputer dan kelengkapannya

Program komputer Chemoffice 2008

PROSEDUR KERJA

1. Menggambar senyawa yang diinginkan di chem draw ultra

2. Select senyawa tersebut lalu klik view ,chemical propoties, lalu paste
3. Select senyawa ,klik vew, analisis, lalu paste
4. Select senyawa ,klik structure,predict H-NMR shift
5. Klik window untilted document-1
6. Select senyawa ,klik structure ,predict C-NMR shift
7. Klik window u ntilted document-1, select senyawa lalu copy
8. Buka aplikasi chembio3D ultra, lalu paste senyawa yang telah dicopy sebelumnya
9. Klik calculation, lalu klik gausian interface, lalu pilih minimize energi/geometri
10. Rubah metodenya ke DFT dan basis set dengan STO- 3G, lalu klik run
11. Klik calculation, lalu klik gausian interface, lalu pilih run frequensi
12. Klik calculation ,computer properties , lalu klik log p, log s, dll ini untuk melihat sifat
fisikokimia
13. Rubah propoties (select all) metodenya ke DFT dan basis set dengan STO-3G lalu
klik run
14. Klik calculation, lalu klik gausian interface, lalu pilih Predict UV/VIS spectrum
15. Rubah metodenya ke DFT dan basis set dengan STO- 3G, lalu klik run

MARIA GABRIELA UBA KELANG 4

DATA PENGAMATAN

Hasil gambar 2D

chemical propoties analisis

H-NMR

MARIA GABRIELA UBA KELANG 5

 C-NMR

As. Benzoate sebelum Proses optimasi As.benzoat sesudah

Hasil Run frequensi

MARIA GABRIELA UBA KELANG 6

Jumlah energi yang di dapat yaitu -260661.31 Kcal/Mol (-415,391382)

Nilai log p,log s, molecular area,gibbs energy,pKa

Predict uv/vis as. Benzoate

Optimasi predict uv/vis Hasil optimasi

Hasil spektrum

MARIA GABRIELA UBA KELANG 7

PEMBAHASAN

Pada praktikum kali ini mahasiswa melakukan latihan computer program

Chemoffice 2008. Dimana Chemoffice sendiri merupakan program aplikasi yang
digunakan untuk membuat struktur kimia baik dalam bentuk 2-Dimensi dan 3-Dimensi
dan juga sekaligus dapat mengetahui nilai parameter fisika kimia. dalam praktikum kali
ini yang dilakukan hanya membat struktur kimia dalam bentuk 2 dimensi dengan
menggunakan chemDraw Ultra 8.0. Menggambar struktur kimia 2-Dimensi dari senyawa
asam benzoate Langkah-langkah yang dapat dilakukan dalam menggambar secara
manualstrukturnya atu menulis nama senyawanya langsung. Menggambar secara
manual strukturnya dapat dilakukan dengan membuat kerangka cincin dan struktur
tersebut, dilanjutkan dengan menambahkan rantai-rantainya. dan lengkapi cincin dan
dengan unsure atom setelah timbul kotak hitam kecil, karena apabila terjadi kesalahan
maka akan timbul warna kotak merah.

Dalam memanfaatkan program aplikasi chemoffice untuk menggambar struktur

kimia khususnya dari senyawa obat, banyak sekali tool dari menu view yang dapat
dimanfaatkan sesuai dengan kebutuhan untuk senyawa yang ingin digambar.Tool-tool
dalam chemDraw mewakili berbagai macam bentuk ikatan yang dapat disusun menjadi
struktur kimia sehingga tidak akan menjadi sulit untuk menggambar struktur yang
kompleks sekalipun.

MARIA GABRIELA UBA KELANG 8

 Log p merupakan koevisien partisi dan. merupakan hasil dari pernelitian yang
dimasukan ke aplikasi chem ,sedangkan C log p adalah hasil dari perhitungan dari
aplikasi chem C adalah calculation dan log p adalah hasil perhitungannya.pada aplikasi
came 3D juga terdapat nilai log p

Pada aplikasi chem bio bisa memperediksi NMR (nuclear magnetic resumen) dan
juga CNMR (carbon nuclear magnetic resume) untuk HNMR dan CNMR mempunyai nilai
yang berbeda – beda karena tergantung dari tiap ikatannya. Jika ikatannya beda maka
nilainya pn beda.perlu diketahui nilai dari HNMR dan CNMR dimana tujuannya untuk
mengetahui pergeseran kimia obat.

Sedangkan energi bebas gibbs adalah fungsi kuantitas termodinamika yang

menyatakan hubungan antara entalpi,entropi,dan temperature system .jika hasil
perhitungan di peroleh nilai energi bebas gibbs negative atau kurang dari nol, maka
proses reaksi kimia terjadi spontan .jika perubahan energi bebas sama dengan nolmaka
proses reaksi revesibel atau kesetimbangan dan jika energi bebas nilainya positif atau
lebih besar dari nol maka proses tidak spontan.
Dari proses perhitungan diperoleh hasil energi yang di dapat yaitu -260661.31 Kcal/Mol
(-415,391382 heartrees) dan juga diperoleh log p yaitu 1.862,connoly molecular area
sebesar 128,3 angstromsbsquared, dan energi bebas gibbs sebesar 56.131 Kcal/Mol

MARIA GABRIELA UBA KELANG 9

KESIMPULAN

Chemoffice merupakan program computer yang digunakan untuk menggambar struktur

kimia obat secara 2D atau 3D. Chemoffice juga dapat di gunakan untuk mencari sifat
fisikokimia kimia suatu obat ,seperti log p, log S,pka,gibbs free energy.selain itu juga kita
dapat melihat prediksi spektrum suatu senyawa.

DAFTAR PUSTAKA

https://id.scribd.com/document/326219676/LAPORAN-PRAKTIKUM-KIMIA-
MEDISINAL-doc
https://hanifatiforict.wordpress.com/aplikasi-kimia/chem-office/
Siswandono dan Soekardjo B. (Eds). KIMIA MEDISINAL 1, Surabaya:UNAIR PRESS,
2000

MARIA GABRIELA UBA KELANG 10