(The "asam ketoglutarat," panjang ketika tidak lebih berkualitas, hampir selalu mengacu pada varian alpha. -ketoglutarat asam bervariasi hanya dengan posisi keton kelompok fungsional , dan jauh kurang umum.) Its anion , -ketoglutarat (-KG, juga disebut okso-glutarate) adalah senyawa biologis penting. Ini adalah asam keto yang dihasilkan oleh de- aminasi dari glutamat , dan perantara dalam siklus Krebs .
Isi
[hide]
1 Fungsi o 1,1 siklus Krebs o 1.2 Pembentukan asam amino o 1.3 Nitrogen transporter o 1.4 Hubungan dengan molekul oksigen o 1,5 diet suplemen 2 Produksi 3 Peta Interaktif jalur 4 Referensi
[ sunting ] Fungsi
[ sunting ] siklus Krebs
-ketoglutarat adalah antara kunci dalam siklus Krebs , datang setelah isocitrate dan sebelum suksinil KoA . Reaksi Anaplerotic dapat mengisi siklus pada saat ini dengan sintesis ketoglutarat dari transaminasi glutamat, atau melalui aksi glutamat dehidrogenase pada glutamat.
-ketoglutarat yang transaminated, bersama dengan glutamin, untuk membentuk excitatory neurotransmitter glutamat . Glutamat kemudian dapat dekarboksilasi (memerlukan vitamin B 6 ) ke neurotransmitter inhibisi GABA . Hal ini melaporkan bahwa tinggi amonia dan / atau tingkat nitrogen yang tinggi dapat terjadi dengan tinggi protein asupan, paparan aluminium yang berlebihan, sindrom Reye , sirosis , dan gangguan siklus urea .
[ sunting ] Produksi
-ketoglutarat dapat diproduksi oleh:
Dekarboksilasi oksidatif dari isocitrate oleh dehidrogenase isocitrate ; Deaminasi oksidatif dari glutamat oleh glutamat dehidrogenase .
Creatine-alfa ketoglutarat
]] [[
Nama IUPAC [hide] 2-Oxopentanedioic asam Nama lainnya [hide] 2-ketoglutarat Asam alfa-ketoglutarat asam 2-Oxoglutaric asam Oxoglutaric asam Identifier Nomor CAS 328-50-7 PubChem 51 ChemSpider 50 UNII 8ID597Z82X DrugBank DB03806 KEGG C00026 MESH alfa-ketoglutarat + asam ChEBI CHEBI: 30915 ChEMBL CHEMBL1686 Jmol -3D gambar Gambar 1 SMILES [show] Inchi [show] Properti Rumus molekul C5H6O5 Massa molar 146,11 g / mol Titik lebur 113.5 (verifikasi) (apa yang: / Kecuali jika disebutkan sebaliknya, data diberikan untuk bahan dalam mereka keadaan standar (pada 25 C, 100 kPa) Infobox referensi
Siklus asam sitrat - juga dikenal sebagai siklus asam trikarboksilat (siklus TCA), siklus Krebs, atau siklus Szent-Gyorgyi-Krebs [1] [2] - adalah serangkaian reaksi kimia yang digunakan oleh semua aerobik organisme hidup untuk menghasilkan energi melalui oksidasi dari asetat yang berasal dari karbohidrat , lemak dan protein menjadi karbon dioksida dan air . Selain itu, siklus menyediakan prekursor untuk biosintesis senyawa tertentu termasuk asam amino serta agen pereduksi NADH yang digunakan dalam reaksi biokimia banyak. Penting utamanya untuk jalur biokimia menunjukkan bahwa itu adalah salah satu komponen didirikan awal selular metabolisme dan mungkin berasal abiogenically . [3] Nama jalur metabolisme ini berasal dari asam sitrat yang pertama kali dikonsumsi dan kemudian diregenerasi dengan jalur untuk melengkapi siklus. Selain itu, siklus mengkonsumsi asetat dalam bentuk asetil-KoA , mengurangi NAD + menjadi NADH, dan menghasilkan karbon dioksida. NADH yang dihasilkan oleh siklus TCA adalah pakan ke dalam fosforilasi oksidatif jalur. Hasil bersih dari dua jalur terkait erat adalah oksidasi nutrisi untuk menghasilkan energi dalam bentuk ATP . Dalam eukariotik sel, siklus asam sitrat terjadi dalam matriks mitokondria . Bakteri juga menggunakan siklus TCA untuk menghasilkan energi, tetapi karena mereka tidak memiliki mitokondria, urutan reaksi dilakukan dalam sitosol .
Komponen dan reaksi-reaksi siklus asam sitrat didirikan pada tahun 1930 oleh pekerjaan mani dari pemenang Hadiah Nobel Albert Szent-Gyorgyi [4] dan Hans Adolf Krebs . [5]
Isi
[hide]
1 Evolusi 2 Ikhtisar 3 Langkah 4 Produk 5 Peraturan 6 jalur metabolik utama berkumpul di siklus TCA 7 Peta Interaktif jalur 8 Lihat juga 9 Referensi 10 Pranala luar
[ sunting ] Evolusi
Komponen dari siklus TCA berasal dari bakteri anaerob dan siklus TCA sendiri mungkin telah berevolusi lebih dari sekali. [6] Secara teoritis ada beberapa alternatif untuk siklus TCA, namun siklus TCA tampaknya menjadi yang paling efisien. [7] Jika beberapa alternatif secara mandiri berevolusi, mereka semua pasti cepat berkumpul dengan siklus TCA.
[ sunting ] Ikhtisar
Siklus asam sitrat adalah komponen kunci dari jalur metabolik dengan mana semua organisme aerob menghasilkan energi. Melalui katabolisme gula, lemak, dan protein, dua karbon produk organik asetat dalam bentuk asetil-KoA yang dihasilkan. Asetil-KoA bersama dengan dua setara air (H 2 O) yang dikonsumsi oleh siklus asam sitrat menghasilkan dua setara karbon dioksida (CO 2) dan dan satu ekuivalen HS-KoA . Selain itu, satu siklus jalur mengkonversi tiga setara nikotinamida adenin dinukleotida (NAD +) menjadi tiga setara berkurang NAD + (NADH), satu ekuivalen ubiquinone (Q) dari ke satu ekuivalen ubiquinone berkurang (QH 2), dan satu ekuivalen masing-masing guanosin difosfat (PDB) dan anorganik fosfat (P i) ke satu ekuivalen guanosin trifosfat (GTP). NADH dan QH 2 yang dihasilkan oleh siklus asam sitrat pada gilirannya digunakan oleh fosforilasi oksidatif jalur untuk menghasilkan energi yang kaya adenosin trifosfat (ATP). Salah satu sumber utama asetil-KoA adalah gula yang dipecah oleh glikolisis untuk menghasilkan piruvat yang pada gilirannya dekarboksilasi oleh enzim piruvat dehidrogenase menghasilkan asetil-KoA sesuai dengan skema reaksi berikut:
Produk dari reaksi ini, asetil-KoA, adalah titik awal untuk siklus asam sitrat. Di bawah ini adalah garis besar skema siklus:
Para asam sitrat Siklus dimulai dengan transfer dua-karbon asetil kelompok dari asetil-KoA dengan senyawa empat karbon akseptor (oksaloasetat) untuk membentuk suatu senyawa enam karbon (sitrat). Sitrat kemudian pergi melalui serangkaian transformasi kimia, kehilangan dua karboksil kelompok sebagai CO 2. Para karbon hilang sebagai CO 2 berasal dari apa yang oksaloasetat, bukan langsung dari asetil-KoA. Para karbon disumbangkan oleh asetil-KoA menjadi bagian dari tulang punggung karbon oksaloasetat setelah pergantian pertama dari siklus asam sitrat. Rugi dari asetil-KoA-menyumbangkan karbon sebagai CO 2 memerlukan beberapa putaran siklus asam sitrat. Namun, karena peran dari siklus asam sitrat dalam anabolisme , mereka mungkin tidak hilang, karena banyak intermediet siklus TCA juga digunakan sebagai prekursor untuk biosintesis molekul lain. [8] Sebagian besar energi yang disediakan oleh langkah-langkah oksidatif siklus ditransfer sebagai energi yang kaya elektron ke NAD +, membentuk NADH. Untuk setiap gugus asetil yang memasuki siklus asam sitrat, tiga molekul NADH yang dihasilkan. Elektron juga ditransfer ke akseptor elektron T, membentuk QH 2. Pada akhir setiap siklus, oksaloasetat empat-karbon telah diregenerasi, dan siklus terus.
[ sunting ] Langkah
Dua karbon atom teroksidasi untuk CO 2 , energi dari reaksi ini dipindahkan ke proses metabolisme lainnya oleh GTP (atau ATP ), dan sebagai elektron dalam NADH dan QH 2 . NADH yang dihasilkan dalam siklus TCA kemudian dapat menyumbangkan elektron dalam fosforilasi oksidatif untuk mendorong sintesis ATP, FADH 2 secara kovalen melekat pada suksinat dehidrogenase , suatu enzim yang berfungsi baik dalam siklus TCA dan mitokondria rantai transpor elektron dalam fosforilasi oksidatif. FADH 2, oleh karena itu, memfasilitasi transfer elektron untuk koenzim Q , yang merupakan akseptor elektron terakhir dari reaksi dikatalisis oleh suksinat:. ubiquinone kompleks oxidoreductase, juga bertindak sebagai perantara dalam rantai transpor elektron [9] Siklus asam sitrat secara terus-menerus dipasok dengan karbon baru dalam bentuk asetilKoA, masuk pada langkah 1 di bawah. [10]
Substrat Produk Enzim Jenis Reaksi Kondensasi aldol Komentar ireversibel, memperluas oksaloasetat 4C ke molekul 6C
Sitrat sintase
2 Sitrat
Isocitrate + 4 NAD +
Oxalosuccinate + NADH + H +
menghasilkan NADH (setara dengan 2,5 ATP) tingkat-membatasi, tahap ireversibel, menghasilkan molekul 5C ireversibel panggung, menghasilkan NADH (setara dengan 2,5 ATP), meregenerasi rantai 4C (CoA dikecualikan) atau ADP ATP bukannya PDB GTP, [9] menghasilkan 1 ATP atau setara menggunakan FAD sebagai kelompok palsu (FAD FADH 2 pada langkah pertama dari reaksi) dalam enzim, [9] menghasilkan setara dengan 1,5 ATP
-ketoglutarat 5 Oxalosuccinate + CO 2
Oksidatif dekarboksilasi
Suksinil-KoA sintetase
Oksidasi
Fumarat + H2O
L - Malate
Fumarase
Hidrasi reversibel (pada kenyataannya, keseimbangan nikmat malat), menghasilkan NADH (setara dengan 2,5 ATP)
10
L-Malate + NAD +
Oksidasi
Mitokondria pada hewan, termasuk manusia, memiliki dua suksinil KoA sintetase-:. Salah satu yang menghasilkan GTP dari GDP, dan lain yang menghasilkan ATP dari ADP [11] . Tanaman memiliki tipe yang menghasilkan ATP (ADP membentuk suksinil-KoA sintetase-) [ 10] Beberapa enzim dalam siklus mungkin longgar terkait dalam multienzim kompleks protein dalam matriks mitokondria . [12] GTP yang dibentuk oleh PDB-membentuk suksinil KoA sintetase-dapat dimanfaatkan oleh nukleosida difosfat kinase- untuk membentuk ATP (reaksi dikatalisis adalah GTP ADP + + ATP PDB). [9]
[ sunting ] Produk
Produk giliran pertama dari siklus ini adalah: satu GTP (atau ATP), tiga NADH, satu QH 2, dua CO 2. Karena dua asetil-KoA molekul yang dihasilkan dari setiap glukosa molekul, dua siklus yang diperlukan per molekul glukosa. Oleh karena itu, pada akhir dua siklus, produk adalah: dua GTP, enam NADH, dua QH 2, dan empat CO 2
Deskripsi Reaktan Produk
Asetil-KoA + 3 NAD + KoA-SH + 3 Jumlah dari semua reaksi dalam siklus asam sitrat adalah: + Q + PDB + P i + 2 H 2 NADH + 3 H + + 2 + O GTP QH + 2 CO 2 Menggabungkan reaksi yang terjadi selama oksidasi piruvat dengan yang terjadi selama siklus asam sitrat, reaksi oksidasi piruvat keseluruhan berikut diperoleh: Ion Piruvat + 4 NAD + 4 NADH + 4 H + + + Q + PDB + P i + 2 H 2 2 + GTP QH + 3 CO 2 O
Menggabungkan reaksi di atas dengan yang terjadi dalam Glukosa + 10 NAD + + 10 NADH + 10 H proses glikolisis , glukosa berikut reaksi oksidasi 2 ADP + 2 T + 2 + 4 + + 2 QH 2 + 2 ATP + keseluruhan (termasuk reaksi dalam rantai pernapasan) PDB P i + 2 H 2 O 2 + 6 CO GTP 2 diperoleh:
Reaksi di atas seimbang jika P i merepresentasikan H 2 PO 4 - ion, ADP dan PDB ADP 2 - dan PDB 2 - ion, masing-masing, dan ATP dan GTP ATP 3 - dan GTP 3 - ion, masing-masing. Jumlah total ATP yang diperoleh setelah oksidasi lengkap satu glukosa dalam glikolisis, siklus asam sitrat, dan fosforilasi oksidatif diperkirakan antara 30 dan 38. Sebuah penilaian baru-baru ini hasil ATP total dengan proton-ke-rasio ATP diperbarui memberikan perkiraan 29,85 molekul ATP per glukosa. [13]
[ sunting ] Peraturan
Meskipun piruvat dehidrogenase tidak secara teknis bagian dari siklus asam sitrat, peraturan yang disertakan di sini. Pengaturan siklus TCA sangat ditentukan oleh ketersediaan substrat dan inhibisi produk. NADH, sebuah produk dari semua dehydrogenases dalam siklus TCA dengan pengecualian dehidrogenase suksinat , menghambat piruvat dehidrogenase , dehidrogenase isocitrate , ketoglutarat dehidrogenase , dan juga sitrat sintase . Asetil-CoA menghambat piruvat dehidrogenase , sedangkan suksinil-CoA menghambat suksinil-CoA sintetase dan sitrat sintase . Ketika diuji secara in vitro dengan enzim TCA, menghambat ATP sintase sitrat dan -ketoglutarat dehidrogenase , namun, tingkat ATP tidak berubah lebih dari 10% secara in vivo antara istirahat dan olahraga berat. Tidak ada diketahui alosterik mekanisme yang dapat menjelaskan perubahan besar dalam laju reaksi dari alosterik efektor yang konsentrasi perubahan kurang dari 10%. [14]
Kalsium digunakan sebagai regulator. Ini mengaktifkan piruvat dehidrogenase , dehidrogenase isocitrate dan -ketoglutarat dehidrogenase . [15] Hal ini meningkatkan laju reaksi dari banyak langkah-langkah dalam siklus, dan karenanya meningkatkan fluks seluruh jalur tersebut. Sitrat digunakan untuk inhibisi umpan balik, karena menghambat fosfofruktokinase , enzim yang terlibat dalam glikolisis yang mengkatalisis pembentukan fruktosa 1,6-bifosfat , pendahulu dari piruvat. Hal ini untuk mencegah tingkat tinggi terus-menerus berubah ketika ada akumulasi sitrat dan penurunan substrat untuk enzim. Karya terbaru telah menunjukkan link penting antara intermediet dari siklus asam sitrat dan regulasi faktor hypoxia-inducible ( HIF ). HIF memainkan peran dalam regulasi homeostasis oksigen, dan merupakan faktor transkripsi yang menargetkan angiogenesis, renovasi vaskular, pemanfaatan glukosa, transportasi zat besi dan apoptosis. HIF consititutively disintesis, dan hidroksilasi dari setidaknya satu dari dua menengahi penting residu prolin interaksi mereka dengan von Hippel Lindau ligase E3 ubiquitin yang kompleks, yang menargetkan mereka untuk degradasi cepat. Reaksi ini dikatalisis oleh prolyl 4-hydroxylases . Fumarat dan suksinat telah diidentifikasi sebagai inhibitor poten dari hydroxylases prolyl, sehingga mengarah ke stabilisasi HIF. [16]
[ sunting ] Referensi
1. ^ Lowenstein JM (1969) Metode dalam enzim, Volume 13:. Siklus Asam Sitrat. Boston:. Academic Press ISBN 0-12-181870-5 . 2. ^ Krebs HA, Weitzman PDJ (1987) asam sitrat Krebs 'siklus:. setengah abad dan masih berputar. Jakarta: Masyarakat Biokimia. ISBN 0-904498-22-0 . 3. ^ Lane, Nick (2009) Kehidupan Ascending:. Sepuluh Penemuan Besar Evolusi. New York: WW Norton & Co ISBN 0-393-06596-0 . 4. ^ "Hadiah Nobel dalam Fisiologi atau Kedokteran 1937" . Yayasan . Diperoleh 2011/10/26. 5. ^ "Hadiah Nobel dalam Fisiologi atau Kedokteran 1953" . Yayasan . Diperoleh 2011/10/26. 6. ^ Gest H (1987). "Evolusi akar dari siklus asam sitrat dalam prokariota". Biochem. Soc. Gejala 54:. 3-16. PMID 3332996 . 7. ^ Melndez-Hevia E, Waddell TG, Cascante M (September 1996). "Teka-teki dari siklus asam sitrat Krebs: merakit potongan-potongan reaksi kimia layak, dan oportunisme dalam desain jalur metabolik selama evolusi" J.. Mol. . Evol 43 (3): 293-303. PMID 8703096 . 8. ^ Wolfe RR, Jahoor F (Februari 1990). "Pemulihan CO2 berlabel selama infus C-1-vs C-2-label asetat: implikasi untuk studi pelacak oksidasi substrat". Am. J. Clin. Nutr 51 (2):.. 248-52 PMID 2106256 . 9. ^ a b c d Stryer L, Berg J, Tymoczko JL (2002). Biokimia. San Francisco:. WH Freeman ISBN 07167-4684-0 . 10. ^ a b Jones RC, Buchanan BB, Gruissem W (2000). Biokimia & biologi molekuler tanaman (1st ed.). Rockville, Md:. American Society of fisiologi Tanaman ISBN 0-943088-39-9 . 11. ^ Johnson JD, Mehus JG, Tews K, Milavetz BI, Lambeth DO (Oktober 1998). "Bukti genetik untuk ekspresi ATP dan GTP-spesifik suksinil KoA sintetase-di eucaryotes multisel". J. Biol. Chem 273 (42):.. 27580-6 DOI : 10.1074/jbc.273.42.27580 . PMID 9765291 . 12. ^ Barnes SJ, Weitzman PD (Juni 1986). "Organisasi enzim siklus asam sitrat ke dalam sebuah cluster multienzim" FEBS Lett 201 (2):... 267-70 DOI : 10.1016/0014-5793 (86) 80621-4 . PMID 3086126 . 13. ^ Kaya PR (Desember 2003). "Mesin molekul rantai pernapasan Keilin itu". Biochem. Soc. Trans 31 (Pt 6):.. 1095-105 DOI : 10.1042/BST0311095 . PMID 14641005 . 14. ^ Voet D, Voet JG (2004) Biokimia (3rd ed.).. New York: John Wiley & Sons, Inc. hal 615. 15. ^ Denton RM, Randle PJ, Jembatan BJ, Cooper RH, Kerbey AL, Pask HT, Severson DL, Stansbie D, Whitehouse S (Oktober 1975). "Peraturan piruvat dehidrogenase mamalia". Mol. Sel. Biochem 9 (1):.. 27-53 DOI : 10.1007/BF01731731 . PMID 171557 . 16. ^ Koivunen P, Hirsil M, Remes PM, Hassinen IE, Kivirikko KI, Myllyharju J (Februari 2007). "Penghambatan hypoxia-inducible factor hydroxylases (HIF) dengan intermediet siklus asam sitrat: kemungkinan kaitan antara metabolisme sel dan stabilisasi HIF" J.. Biol. Chem 282 (7):.. 4524-32 DOI : 10.1074/jbc.M610415200 . PMID 17182618 . 17. ^ Halarnkar PP, Blomquist GJ (1989). "Perbandingan aspek metabolisme propionat". Comp. Biochem. Physiol, B 92 (2):.. 227-31 DOI : 10.1016/0305-0491 (89) 90270-8 . PMID 2647392 . 18. ^ Peta jalur interaktif dapat diedit pada WikiPathways: "TCACycle_WP78"
2. 3. 4. Sekilas dari siklus asam sitrat 5. Siklus asam sitrat - juga dikenal sebagai siklus asam trikarboksilat (siklus TCA), siklus
]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]]
[[peta
jalur Interaktif
Klik pada gen, protein dan metabolit di bawah ini untuk link ke artikel masing-masing. [18]
[[File:
]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]] [[ ]]
[ sunting ] Referensi