UNIVERSITAS GADJAH MADA

FAKULTAS PASCASARJANA
PROGRAM STUDI ILMU-ILMU MIPA, JURUSAN KIMIA
UJIAN AKHIR SEMESTER TH AKADEMIK 2005/2006
MATA KULIAH
: KEMOMETRI
TANGGAL UJIAN : RABU, 11 JANUARI 2006
WAKTU
: 90 MENIT
SIFAT UJIAN
: CLOSED BOOK
DOSEN PENGUJI : DRS. MUDASIR, M.ENG., PH.D.
1. Salah satu aplikasi di Bidang khemometri adalah analisis QSAR dengan regresi
multilinear. Jelaskan apa yang saudara ketahui tentang analisis QSAR dan
sebutkan keuntungan-keuntungannya.
Jawab:
QSAR adalah metode analisis yang mencoba untuk mencari hubungan
konsisten (model matematika) antara variasi sifat molekular dan aktivitas
biologi dari deretan molekul sehingga model yang didapatkan dapat
digunakan untuk memprediksi aktivitas biologis dari senyawa yang baru
didesain dari turunan deretan senyawa tadi.
Keuntungan:
1. Mereduksi biaya yang harus dikeluarkan untuk riset eksperimental
yang sifatnya trial dan error semata
2. Memberikan guideline sekaligus prediksi dalam mendesain senyawa
baru dengan aktivitas yang lebih tinggi
3. Memprediksi sisi aktif molekul atau bagian dari molekul yang
memberikan sumbangan paling besar (paling bertanggung jawab)
terhadap aktivitas molekul tersebut.
4. Mengurangi penggunaan binatang untuk uji trial and error.
2. Dalam analisis QSAR, kita harus mempunyai seri senyawa dengan data
aktivitasnya yang telah ditentukan secara eksperimen yang diasumsikan tidak
mengandung kesalahan-kesalahan (kit compounds) dan beberapa senyawa lain
yang dikelompokkan sebagai senyawa uji (test compounds). Berikan penjelasan
mengapa data aktivitas biologis senyawa sering ditransformasikan terlebih
dahulu ke dalam bentuk logaritma sebelum analisis regresi multilinear
dikerjakan dan sebutkan parameter-parameter statistik apa saja yang
digunakan dalam menguji kualitas model persamaan QSAR yang dihasilkan
dari analisis serta jelaskan kegunaan test compounds.
Jawab:

mengapa data aktivitas biologis senyawa sering ditransformasikan terlebih

dahulu ke dalam bentuk logaritma sebelum analisis regresi multilinear
dikerjakan?
Karena data aktivitas biologis sangat variatif, distribusinya akan mendekati
distribusi normal apabila data tersebut ditransformasikan ke bentuk
logaritmik. Selain itu, untuk potensi suatu obat, prubahan energi bebas
interaksi antara senyawa obat dengan senyawa respon dapat dianggap
proporsional dengan logaritma terbalik dari kosentrasi.
G= -2,303RT logK= log 1/[S]
sebutkan parameter-parameter statistik apa saja yang digunakan dalam
menguji kualitas model persamaan QSAR yang dihasilkan dari analisis!
1. Koefisien korelasi (r atau r2)
2. Standar error estimasi (SE)
3. Harga kriteria Fisher (F)
jelaskan kegunaan test compounds!
Sebagai senyawa yang akan dipresiksi aktivitas biologisnya.
3. a. Jelaskan perbedaan mendasar antara metode pendekatan Hansch dan CoMFA
(comparative molecular field analysis) dalam QSAR dan berikan alasan
mengapa pendekatan CoMFA dikembangkan?
Jawab:
Pada metode Hansch masih 2 dimensi, dia tidak memperhitungkan
aktivitas yang berbeda akibat orientasi ruang. Sedangkan CoMFA
merupakan analisis QSAR 3 dimensi yang sudah memperhitungkan
aktivitas yang berbeda akibat orientasi ruang.
CoMFA dikembangkan karena aktivitas senyawa obat juga
memperhatikan orientasi ruangnya. Misal suatu senyawa obat memiliki
sifat farmakoaktif, sedangkan enantiomernya tidak memiliki sifat
farmakoaktif bahkan toksik.
b. Dalam kasus tertentu analisis regresi multilinear kurang tepat digunakan
dalam analisis QSAR dan sebaiknya digunakan kombinasi metode PCA dan
PCR, jelaskan mengapa demikian?
Jawab:

UNIVERSITAS GADJAH MADA

FAKULTAS PASCASARJANA
PROGRAM STUDI ILMU-ILMU MIPA, JURUSAN KIMIA
UJIAN AKHIR SEMESTER TH AKADEMIK 2001/2002
MATA KULIAH
: KIMIA KOMPUTASI
TANGGAL UJIAN : JUMAT, 20 JUNI 2002
SIFAT UJIAN
: CLOSED BOOK
DOSEN PENGUJI : DRS. MUDASIR, M.ENG., PH.D.
4. Jelaskan mengapa dalam proses analisis QSAR data aktivitas biologis senyawa
biasanya ditransformasi terlebih dahulu ke dalam bentuk logaritma dan sebutkan
parameter-parameter yang dipakai untuk menguji kualitas model persamaan
QSAR yang dihasilkan dari analisis!

5. Apakah yang saudara ketahui tentang metode QSAR CoMFA dan apa
kelebihan-kelebihannya dibandingkan dengan metode QSAR konvensional seperti
pendekatan Hansch dan Free-Wilson?
Jawab:
Metode Free Wilson:
Kelemahan:
1. Menghasilkan model persamaan yang hanya dapat memprediksi turunan
baru dalam jumlah terbatas.
2. Tidak dapat digunakan untuk memprediksi gugus lain yang berbeda dari
jenis gugus yang digunakan pada analisis.
3. Pada kebanyakan kasus, jumlah parameter akan jauh lebih besar dari
pada jumlah senyawa sehingga secara statistik akan tidak signifikan.