Filogenetik adalah cabang dari biologi yang berhubungan dengan mempelajari dan menentukan

hubungan evolusioner, atau pola keturunan, kelompok organisme. Ada tiga jenis kelompok
filogenetik:

Kelompok monofiletik: mengandung leluhur dan semua keturunannya

Kelompok parafiletik: berisi leluhur tetapi hanya beberapa keturunannya

Kelompok polifiletik: berisi berbagai organisme tanpa nenek moyang yang sama baru-baru ini.
Sebuah kelompok parafletik adalah jenis seperti sebuah kelompok yang terdiri dari orang tua dan
saudara kandung Anda tetapi tidak seperti Anda. Orang tua Anda adalah nenek moyang dari
kelompok, dan keturunan yang Anda dan saudara Anda. Jika Anda atau salah satu dari saudarasaudaramu yang tersisa dari kelompok, akan parafiletik karena termasuk nenek moyang dan
hanya beberapa keturunan. Dalam filogenetik, bagaimanapun, parafiletik istilah (atau
monofiletik atau polifiletik) biasanya digunakan ketika menggambarkan sekelompok spesies dan
nenek moyang evolusi mereka dan bukan hanya sebuah unit keluarga kecil.
Ketiga jenis kelompok filogenetik dapat lebih dipahami dengan menggunakan diagram yang
disebut pohon filogenetik atau pohon evolusi.

Pohon filogenetika atau pohon evolusi adalah diagram percabangan atau "pohon" yang
menunjukkan hubungan evolusi antara berbagai spesies makhluk hidup berdasarkan kemiripan
dan perbedaan karakteristik fisik dan/atau genetik mereka. Takson yang terhubung pada pohon
tersebut berarti diturunkan dari satu nenek moyang bersama. Penggambaran pertama pohon ini
antara lain ditemukan pada buku Elementary Geology dari Edward Hitchcock (1840) dan The
Origin of Species dari Charles Darwin (1859).
Pohon filogenetika ini dapat diaplikasikan untuk membuat sistematika biologi, seperti pohon
kehidupan. Selain itu pohon ini dapat digunakan untuk mencari fungsi dari suatu gen atau
protein, riset medis dan epidemiologi seperti HIV, dan studi evolusi
Contoh :
Filogeni di bawah ini menggambarkan masing-masing dari tiga jenis kelompok filogenetik.
Keturunan D dan E (ungu) merupakan kelompok monofiletik. Keturunan B dan C, bersama-sama
dalam jeruk, mewakili kelompok polifiletik. Kelompok kuning yang mencakup keturunan B, C,
D, dan E adalah kelompok parafiletik. Ingat kelompok parafiletik adalah salah satu yang
memiliki nenek moyang yang sama tetapi tidak termasuk semua keturunan. Dalam contoh ini,
nenek moyang terbaru untuk kelompok parafiletik adalah akar pohon. Anda dapat menentukan
ini dengan memulai pada keturunan (B, C, D, E) dan menelusuri cabang mereka kembali (ke
arah akar) sampai mereka bertemu. Akar memiliki lima keturunan (A, B, C, D, dan E), tetapi
hanya empat dari mereka (B, C, D, E) yang termasuk dalam kelompok kuning. Jadi kelompok
kuning memiliki nenek moyang (akar filogeni) tapi hanya beberapa keturunannya. Hal ini
membuat parafiletik.