Paraf Asisten

LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK

Judul

: Penggunaan Software Kimia untuk Penggambaran Struktur

Molekul
TujuanPercobaan

: Mempelajari dan mengaplikasikan keterampilan menggambar

struktur molekul senyawa kimia menggunakan software Chemsketch.

Pendahuluan
Semakin hari semakin banyak perkembangan yang terjadi di dunia termasuk perkembangan
dalam ilmu pengetahuan, di mana semua orang berlomba-lomba membuat alat yang dapat
memudahkan melakukan sesuatu. Teknologi yang ada saat ini memungkinkan manusia tidak
perlu lagi datang kehadapan dosen untuk mengumpulkan tugas, cukup dengan mengupload
atau mengirim tugas melalui e-mail atau lainnya menggunakan koneksi internet. Kemajuan
tersebut juga mengharuskan manusia untuk mengikuti perkembangannya, termasuk juga di
kimia. Membuat struktur senyawa kini tidak harus dilakukan dengan cara menulis di kertas
secara manual. Struktur kimia dapat dibuat menggunakan software yang menyediakan
layanan untuk menggambar struktur sehingga kemudian dapat dikirim melalui internet. Salah
satu software yang dapat diunduh secara gratis atau freeware adalah ACD / Chemsketch.
ACD/Chemsketch adalah sebuah software yang digunakan untuk menggambar struktur kimia
diantaranya kimia organic, organologam, polimer dan Struktur Markush. Software
chemsketch dapat menggambarkan struktur kimia dalam bentuk 2D dan 3D. Software ini
dapat digunakan untuk membuat struktur dan diagram yang baik untuk laporan. Software ini
sangat mudah digunakan hanya dengan mengklik dan mendrag tool-tool yang tersedia untuk
menggambar struktur yang diinginkan. Program ini juga menyediakan struktur asam amino,
alkaloid, karbohidrat, asam nukleat, DNA/RNA, peralatan laboratorium yang berupa gelas,
orbital, steroid, terpen dan lain-lain yang tersimpan dalam menu templates. Software ini juga
menyediakan penggambaran kurva dan grafik. Chemsketch dikeluarkan oleh ACD/Labs.com
yang dapat diunduh secara gratis
Fitur-fitur yang terdapat dalam Chemsketch diantaranya :

Membentuk dan melihat struktur dalam 2D (2 dimensi) atau membuat bentuk 3D agar

dapat dilihat dari berbagai sudut.

Menggambar reaksi dan menghitung kuantitas reaktan.

Menghasilkan struktur dari InChI

Menghasilkan nama sistematik (IUPAC) untuk berbagai molekul hingga 50 atom dan
3 cincin (siklis)

Memprediksi log P untuk struktur individu.

Chemsketch menyediakan lebih dari 165 ribu struktur dengan nama sistematik dan
trivial.

(Anonim, 2014).
Software ChemSketch dapat dijalankan seperti program-program lain pada komputer,
sebelumnya pengguna software terlebih dahulu harus menginstall sofware ChemSketch. Cara
memulai program ChemSketch yang telah terinstall yaitu dari menu windows klik start, lalu
klik program, pilih ChemSketch maka jendela program ChemSketch akan terbuka.
Menggambar bentuk molekul dalam bentuk 3D (misalkan molekul CH 4) dapat dilakukan
rotasi untuk memberikan gambaran yang utuh dapat dilakukan dengan membuka aplikasi
Chemsketch yang telah terinstall. Klik Atom C pada Mode Structure yang ada di tool kiri dan
klik sekali pada area kerja hingga menghasilkan rumus molekul CH 4. Add explicite hydrogen
dari menu Tools untuk membuat bentangan rumus struktur, seleksi rumus struktur, klik menu
Tools dan pilih Strucutre Properties maka akan muncul menu pop up dan pada tab Common
beri centang All Show Carbons. Optimisasi struktur 3D dengan cara klik menu Tools
kemudian klik 3D structure optimization, jika ada pilihan (klik yes untuk menghilangkan
atom H saat optimisasi 3D-nya), setelah itu buka 3D Viewer Acd Lab dari Start menu.
Kembali ke Chemsketch 2D untuk mengkopi 2D ke 3D. Merotasi untuk dapat menunjukkan
berbagai properties bentuk molekul seperti panjang ikatan dan sudut yang dibentuk oleh 3
buah atom dengan ChemSketch ini (Martoprawiro, 2008).
Keuntungan

yang

didapat

dengan

menggunakan

Chemsketch

adalah

dapat

memvisualisasikan struktur kimia dalam bidang 2 dimensi (2D) atau 3 dimensi (3D) dengan
harapan dapat memperoleh pengetahuan lebih mengenai konfigurasi ruang dan hubungan
antara sifat-sifat molekul. Chemsketch juga dapat mengecek bentuk tautomer lain dari
struktur yang telah dibuat. Bentuk tautomer sangat penting untuk pencarian struktur, prediksi
pKa dan sifat psikokimia, serta interpetasi atau penerjemahan (NMR, MS dan data analitik

lainnya).
Software ACD / Labs dapat membantu dalam pengajaran konsep kimia untuk SMA, sarjana,
dan mahasiswa pascasarjana kimia. Siswa ataupun mahasiswa juga mendapatkan manfaat
menggunakan ACD/Chemsketch pada saat belajar, untuk dapat dijadikan pengalaman pada
saat berada di dunia kerja.
Prinsip Kerja
Prinsip kerja dari praktikum ini adalah dengan menggunakan manual Chemsketch untuk
membuat dan menggambar struktur molekul kimia dalam bentuk 2D atau 3D.
Alat
Laptop atau PC, dan aplikasi ACD Chemsketch.
Prosedur Kerja
Prosedur pertama adalah menghidupkan laptop atau PC, membuka Software ACD
Chemsketch. Kemudian menggambar struktur senyawa kimia.
Hasil
1. Menggambar Struktur Sederhana
H3C

CH3
CH3

a.

F
F

b.

H3C
menjadi

F
(CH 2)3Ph

CH2
H3C

CH3
N

H2C

CH3

c.

2. Menggambar Struktur yang lebih kompleks

HO
O
OH

HO

O
O

OH
OH

O
O

OH

3. Memberi muatan
H3C

NH2

CH3

4. Stereodescriptor
Z

CH3

Cl

CH3

5. Membuat ikatan terkoordinasi

O
O

CH3

Li
O

CH3

6. Ikatan dan muatan terdelokalisasi

Br CH3
H3C

CH3
+

CH3

7. Markush Bond
CH3

Br

8. Menggambar peptisida siklik : Tyr-Ala-Trp

HO
O
NH

NH

O
H3C

N
H

O
N
H

Referensi
Anonim, 2015. ACD/Chemsketch for Academic and Personal Use : ACD/Labs.com. [Serial
Online]. http://www.acdlabs.com/resources/freeware/chemsketch/. Diakses tanggal
tanggal 3 Maret 2015.

Martoprawiro, Muhamad. 2008. Chemsketch :Membuat Molekul di Windows. (www.elearning.unej.ac.id). Diakses pada 19 Februari 2014.
.
Nama Praktikan
Rizka Fithriani Safira Sukma (131810301049)