LAPORAN PRAKTIKUM

KIMIA KOMPUTASI

Nama : AMELLIYANI

NPM : 11171045

KELAS : 3 FA 2

GEL. : G3

UNIVERSITAS BHAKKTI KENCANA

2020/2021
 1. TUJUAN
- Menentukan sifat fisikokimia senyawa obat dengan menggunakan program
CHEMOFFICE
- Menggambar struktur 3D dan NMR menggunakan CHEMOFFICE
2. TEORI DASAR

Chemoffice merupakan salah satu software yang digunakan untuk membuat sstruktur kimia
dengan mudah dan digunakan untuk menggambar secara 2 dimensi dan 3 dimensi. Struktur 2D
akan terlihat dalam satu bidang datar sementara struktur 3D akan terlihat seperti struktur ruang.

ChemDraw merupkan software kimia dari produk CambridgeSoft.inc. ChemDraw merupakan

salah satu program aplikasi dari Chemoffice yang digunakan untuk menggambar struktur 2D dalam
bidang ilmu kimia, terutama kimia organic,biokimia, dan polimer. Software ini dilengkapi dengan
tool-tools yang mewakili berbagai macam bentuk ikatan yang dapat digunakan untuk menyusun
struktur kimia sehingga memudahkan dalam penggambaran struktur kimia suatu senyawa, bahkan
yang kompleks sekalipun. Dapat pula untuk berbagai bentuk konformasi dan dalam bentuk
proyeksi.

Struktur-struktur tertentu yang telah umum dapat digambar secara langsung dengan meng-klik
tool, misalnya seperti struktur cincin benzene, siklopentana, sikloheksena dan senyawa siklik
lainnya. Tools yang ada jga menyajikan gambar struktutr untuk asam amino, DNA, RNA dll yang
terdapat pada template. Selain itu ChemDraw dilengkapi dengan peringatan jika terjadi kesalahan
dalam penggambaran struktur kimia. Peringatan tersebut biasanya berwarna merah yang
mengelilingi struktur yang salah.

Keunggulan lain dari ChemDraw yaitu dapat sekaligus digunakan untuk menganalisis struktur
kimia yang telah dibuat dengan menggunakan Analys Structure yang terdaat pada menu Structure.
Analisis yang dapat dilakukan antara lain sifat kimia fisika dari struktur yang dibuat, misalnya titik
didih, titik leleh, berat molekul (BM), molar refraction (MR), temperature, takanan dll. Sealin itu
juga dapat diketahui puncak-puncak dari NMR proton dan karbon. Kemudian dengan penggunaan
ChemDraw 3D dapat digambar struktur 3D dari senyawa obat, dapat diprediksikan struktur kimia
suatu senyawa yang paling stabil dengan enegi yang paling minimum, dan dapat mengetahui
panjang ikatan antar atom.
 3. ALAT
- Komputer dan kelengkapannya
- Program computer Chemoffice 2008

4. CARA KERJA
Mencari Data Sifat Kimia Fisika Senyawa Obat

Gambar struktur kimia obat. Beri kotak pada struktur tersebut.

Tekan View, tekan Show Analyze Window, lalu Paste maka dapat diketahui
formula, berat molekul dan analisis elemen dari senyawa obat

Tekann View, tekan Show Chemical Properties Window lalu tekan Paste
maka akan dapat diketahui sifat kimia fisika seperti : titik didih, titik lebur, nilai
log P, refraksi molar, panas pembentukan dll dari senyawa obat

Menggambar Struktur 3-Dimensi Senyawa Obat

Beri kotak pada struktur kimia senyawa obat

Tekan Copy. Buka program CS Chem3D Ultra (Versi 14.0)

Tekan Paste maka akan terlihat struktur 3Dimensi senyawa obat yang ingin
dibuat

Membuat Estimasi Gambaan NMR Senyawa Obat

Membuat Estimasi Gambaran 1H-NMR Asetosal

 Beri kotak struktur

Tekan Structure

Tekan Pedict 1H-NMR Shifts

Membuat Estimasi Gambaran 13C-NMR Asetosal

Beri kotak struktur

Tekan Structure

Tekan Pedict 13C-NMR Shifts

 5. HASIL PENGAMATAN

Hasil gambar 2D

3-(4-((7-chloroquinolin-4-yl)amino)butyl)-2-(3,4-dimethoxyphenyl)thiazolidin-4-one

Hasil Gambar 3D

Hasil penentuan sifat fisikokimia

SIFAT FISIOKIMIA CHEMDRAW 2D CHEMDRAW 3D

Boiling Point 1166.22 K 896.71 K
LogP 4.06 4.0644
Heat of Formation -72.63 Kcal/mol at 25 C -72.63 Kcal/mol at 25 C
Hendry’s Law Constant 19.55 log[unitles] 19.5536 log[unitles]
Critical Temperature 1102.93 K 1102.93 K
 6. PEMBAHASAN

Dalam praktikum kali ini hal yang dilakukan pertama kali adalah membuka aplikasi
ChemDraw Ultra (versi 14.0). Kemudian setelah membuka aplikasi Ultra adalah membuat
struktur kimia yang ingin kita ketahui struktur sifat fisika kimianya. Setelah struktur aspirin
sudah dibuat maka langkah selanjutnya yakni memberi kotak pada struktur yang sudah di buat,
kemudian pilih menu view, kemudian kita pilih show analyze window. Maka akan muncul data
sifat kimia fisika dari struktur tersebut untuk mencetak hasilnya pilih paste.

Langkah selanjutnya yakni kita klik Show chemical properties window kemudian
menekan paste, maka kita akan memperoleh nformasi mengenai sifat fisika dari struktur yang
kita buat, kita bisa mendapatkan informasi mengenai sifat fisika senyawa seperti titik didih,
titik lebur, nilai log P, molar refraksi (MR), panas pembentukan dll. Untuk memperoleh sifat
fisika dari struktur tersebut kita tekan paste maka kita akan memperoleh sifat fisika obat tersebut.

Selanjutnya yang dilakukan adalah menggambar struktur 3D dari suatu senyawa obat.
Langkah pertama yang dilakukan adalah membuat terlebih dahulu struktur yang ingin dicari
pada Chemdraw 2D, kemudian beri kotak struktur tersebut dan klik copy. Selanjutnya
membuka program Chem3D Ultra (versi 14.0). Setelah itu, pilih Paste maka akan muncul
tampilan 3D
 Selanjutnya setelah struktur 3D selesai dibuat, hak yang dilakukan selanjutnya adalah
menggambar estimasi NMR suatu senyawa obat. Seperti sebelumnya dibuat terlebih dulu
struktur, kemudian struktur tersebut di beri kotak, tekan Structure, tekan Predict 1H-NMR
Shifts dan Predict 13C-NMR Shifts. Maka akan muncul hasilnya sebagai berikut:

Predict 1H-NMR Shifts

Predict 13C-NMR Shifts.

7. KESIMPULAN
 Dengan menggunakan CHEMOFFICE kita dapat menetukan sifak kimia fisika
dari struktur senyawa obat sekaligus menggambar struktur 3D dan estimasi
NMR dari senyawa suatu obat.
 Berdasarkan sifat kimia fisika dari struktur dapat diketahui bagaimana suatu
obat dapat memberikan efek bagi tubuh dan juga dapat memudahkan dalam
penemuan obat baru.
 DAFTAR PUSTAKA

Boyce, C. B. C., and Milborrow, B. V., Nature, 208, 537 (1965)

Brady, J. E. 1999. Kimia Universitas Asas dan Struktur. Binarupa Aksara. Bandung.

CambridgeSoft Corporation. 2001. ChemDraw : Chemical Structure Drawing Standard : CS

ChemDraw 7.0 for Windows and Macintosh : User Guide. CambridgeSoft

Chang, Raymond. 2007. Chemistry Ninth Edition. New York: Mc Graw Hill.

Karthikeyan, Muthukumarasamy, dan Vyas, Renu. 2014. Practical Chemoinformatics. India :

Springer p 12-13

Kurniawati, Linda .2008. Studi Hubungan Kuantitatif Antara Sifat Fisika Kimia Turunan
Fluorokuinolon Dengan Aktivitas Antibakterinya Terhadap Pseudomonas Aeruginosa
Atcc 27853. Surabaya: Uiniversitas Airlangga

Siswandono dan Soekardjo, B., (2000). Kimia Medisinal. Edisi 2. Surabaya: Airlangga
University Press.

Tim Dosen Kimia Fisik. 2011. Diktat Petunjuk Praktikum Kimia Fisik. Semarang :
Laboratorium Kimia Universitas Negeri Semarang.