Negara
No. Nama pulau Perairan Wilayah administrasi
terdekat
Kabupaten Maluku
2. Ararkula Laut Aru Australia
Tenggara, Maluku
Kabupaten Bolaang
4. Bangkit Laut Sulawesi Filipina
Mongondow, Sulawesi Utara
Samudra
5. Barung Kabupaten Jember, Jawa Timur Australia
Hindia
Kabupaten Kepulauan
8. Batu Bawaikang Laut Sulawesi Filipina
Sangihe, Sulawesi Utara
Selat
9. Batu Berhanti Kota Batam, Kepulauan Riau Singapura
Singapura
Kabupaten Maluku
10. Batu Goyang Laut Aru Australia
Tenggara, Maluku
Samudra
13. Benggala Kota Sabang, Aceh India
Hindia
Samudra
14. Bepondi Kabupaten Biak Numfor, Papua Palau
Pasifik
Kabupaten Deli
15. Berhala Selat Malaka Malaysia
Serdang, Sumatera Utara
Samudra
16. Bras Kabupaten Biak Numfor, Papua Palau
Pasifik
Samudra
17. Budd Kabupaten Sorong, Papua Barat Palau
Pasifik
Samudra
21. Deli Kabupaten Pandeglang, Banten Australia
Hindia
Kabupaten Maluku
23. Enu Laut Arafuru Australia
Tenggara, Maluku
Samudra
24. Fani Kabupaten Sorong, Papua Barat Palau
Pasifik
Samudra
25. Fanildo Kabupaten Biak Numfor, Papua Palau
Pasifik
Kabupaten Kepulauan
27. Intata Laut Sulawesi Filipina
Talaud, Sulawesi Utara
Laut
29. Jiew Halmahera, Maluku Utara Palau
Halmahera
Kabupaten Maluku
31. Karang Laut Aru Australia
Tenggara, Maluku
Kabupaten Maluku
32. Karaweira Laut Aru Australia
Tenggara, Maluku
Kabupaten Kepulauan
34. Kawalusu Laut Sulawesi Filipina
Sangihe, Sulawesi Utara
Kabupaten Kepulauan
35. Kawio Laut Sulawesi Filipina
Sangihe, Sulawesi Utara
Kabupaten Maluku
39. Kultubai Selatan Laut Aru Australia
Tenggara, Maluku
Kabupaten Maluku
40. Kultubai Utara Laut Aru Australia
Tenggara, Maluku
Samudra
44. Liki Kabupaten Sarmi, Papua Papua Nugini
Pasifik
Kabupaten Kepulauan
47. Makalehi Laut Sulawesi Filipina
Sangihe, Sulawesi Utara
Kabupaten Bolaang
50. Manterawu Laut Sulawesi Filipina
Mongondow, Sulawesi Utara
Kabupaten Kepulauan
52. Marampit Laut Sulawesi Filipina
Talaud, Sulawesi Utara
Kabupaten Kepulauan
54. Marore Laut Sulawesi Filipina
Sangihe, Sulawesi Utara
Kabupaten Kepulauan
58. Miangas Laut Sulawesi Filipina
Talaud, Sulawesi Utara
Samudra
59. Miossu Kabupaten Sorong, Papua Barat Palau
Pasifik
Selat
60. Nipa Kota Batam, Kepulauan Riau Singapura
Singapura
Selat
61. Nongsa Kota Batam, Kepulauan Riau Singapura
Singapura
Samudra
62. Nusakambangan Kabupaten Cilacap, Jawa Tengah Australia
Hindia
Kabupaten Maluku
63. Panambulai Laut Aru Australia
Tenggara, Maluku
Selat
65. Pelampong Kota Batam, Kepulauan Riau Singapura
Singapura
Samudra
66. Raya Kabupaten Aceh Barat, Aceh Laut Lepas
Hindia
Samudra
67. Rondo Kota Sabang, Aceh India
Hindia
Negara
No. Nama pulau Perairan Wilayah administrasi
terdekat
Samudra
68. Rusa Kabupaten Aceh Besar, Aceh Laut Lepas
Hindia
Samudra
70. Salaut Besar Kabupaten Aceh Utara, Aceh Laut Lepas
Hindia
Samudra
81. Simeuleuceut Kabupaten Aceh Barat, Aceh Laut Lepas
Hindia
Samudra
82. Simuk Kabupaten Nias, Sumatera Utara Laut Lepas
Hindia
Laut Lepas
Samudra
91. Wunga Kabupaten Nias, Sumatera Utara
Hindia