CROSSING OVER SEBAGAI DASAR FISIK

DARI REKOMBINASI

Gamet rekombinan dihasilkan sebagai hasil persilangan antara homolog

kromosom. Proses ini melibatkan pertukaran fisik antara kromosom,

seperti yang digambarkan dalam? Gambar 7.6. Pertukaran terjadi selama profase dari

pembelahan meiosis pertama, ketika kromosom digandakan dipasangkan. Meskipun empat

kromatid homolog ada, membentuk apa yang disebut tetrad, hanya dua kromatid

menyeberang pada satu titik. Setiap kromatid ini pecah di situs

crossover, dan potongan yang dihasilkan pasang kembali

untuk menghasilkan rekombinan. Dua yang lainnya

kromatid tidak rekombinan di situs ini.

Setiap peristiwa crossover menghasilkan dua

chromatid rekombinan di antara total empat.

Perhatikan bahwa hanya ada dua kromatid

terlibat dalam pertukaran pada satu titik.

Namun, dua kromatid lainnya mungkin

menyeberang ke titik yang berbeda. Jadi, disana

adalah kemungkinan untuk beberapa pertukaran dalam

tetrad of chromatids (? Gambar 7.7). Sana

dapat, misalnya, menjadi dua, tiga, atau bahkan

empat pertukaran terpisah — disebut biasa

crossover ganda, triple, atau quadruple. (Kita

pertimbangkan signifikansi genetik dari ini

di bagian selanjutnya dari bab ini.) Perhatikan, bagaimanapun, bahwa pertukaran antara sister
chromatids

tidak menghasilkan rekombinan genetik karena saudara perempuannya

kromatid identik.

Apa yang bertanggung jawab atas kerusakan kromatid

selama menyeberang? Istirahat disebabkan oleh enzim

bertindak atas DNA di dalam kromatid. Enzimnya

juga bertanggung jawab untuk memperbaiki kerusakan ini — yaitu, untuk

merekatkan fragmen chromatid satu sama lain. Kami mempertimbangkan

rincian molekuler dari proses ini di Bab 13.

BUKTI YANG MELINTASI LEBIH

MENYEBABKAN REKOMBASI

Pada 1931 Harriet Creighton dan Barbara McClintock

memperoleh bukti bahwa rekombinasi genetik dikaitkan

dengan pertukaran materi antar kromosom.

Creighton dan McClintock mempelajari kromosom homolog

di jagung yang dapat dibedakan secara morfologis.

Tujuannya adalah untuk menentukan apakah fisik

pertukaran antara homolog ini berkorelasi dengan

rekombinasi antara beberapa gen yang mereka bawa.

Dua bentuk kromosom 9 tersedia untuk

analisis; yang satu normal, dan yang lainnya memiliki sitologi

penyimpangan di setiap ujungnya — kenop heterokromatik

satu ujung dan sepotong kromosom yang berbeda di

lainnya (? Gambar 7.8). Kedua bentuk kromosom ini

9 juga ditandai secara genetik untuk mendeteksi rekombinasi.

Satu gen penanda mengontrol warna kernel (C, berwarna;

c, tidak berwarna), dan tekstur kernel yang dikontrol lainnya

(Wx, tepung, wx, lilin). Creighton dan McClintock

melakukan testcross berikut: Mereka kemudian memeriksa progeni rekombinan untuk bukti
pertukaran antara

dua bentuk kromosom yang berbeda 9. Hasilnya menunjukkan bahwa C Wx dan c wx

rekombinan membawa kromosom dengan hanya satu penanda sitologi yang abnormal;
penanda abnormal lainnya ternyata hilang melalui pertukaran dengan

kromosom normal 9 pada generasi sebelumnya: Penemuan ini sangat membantah bahwa
rekombinasi disebabkan oleh pertukaran fisik

antara kromosom yang dipasangkan.

CROSSING OVER SEBAGAI UKURAN JARAK GENETIKA

Pemikiran mendasar Sturtevant adalah memperkirakan jarak antara titik-titik pada a

kromosom dengan menghitung jumlah persilangan di antara mereka. Poin yang jauh

selain harus memiliki lebih banyak crossover di antara mereka daripada titik-titik yang berdekatan.

Namun, jumlah crossover harus dipahami secara statistik. Di mana saja

sel tertentu, kemungkinan bahwa crossover akan terjadi antara dua titik mungkin rendah,

tetapi dalam populasi besar sel, crossover ini mungkin akan terjadi beberapa kali

hanya karena ada begitu banyak peluang independen untuk itu. Demikian,

kuantitas yang harus kita ukur adalah jumlah rata-rata

crossover di wilayah kromosom tertentu. Jarak peta genetik

pada kenyataannya, berdasarkan rata-rata tersebut. Ide ini cukup penting

untuk membenarkan definisi formal: Jarak antara dua titik pada genetik

peta kromosom adalah jumlah rata-rata crossover di antara mereka.

Satu cara bagi kita untuk memahami definisi ini adalah dengan mempertimbangkan 100 oogonia

melalui meiosis (? Gambar 7.10). Di beberapa sel, tidak ada crossover yang akan terjadi antar situs

A dan B; di lain, satu, dua, atau lebih crossover akan terjadi antara lokus ini. Pada

akhir meiosis, akan ada 100 gamet, masing-masing mengandung kromosom dengan keduanya

nol, satu, dua, atau lebih crossover antara A dan B. Kami memperkirakan peta genetik

jarak antara lokus ini dengan menghitung jumlah rata-rata crossover dalam hal ini

sampel kromosom. Hasil dari data pada Gambar 7.10 adalah 0,42.

Dalam prakteknya, kita tidak bisa "melihat" setiap titik pertukaran pada kromosom

keluar dari meiosis. Sebaliknya, kami menyimpulkan keberadaan mereka dengan mengamati
rekombinasi

dari alel yang mengapitnya. Sebuah kromosom di mana alel

telah direkombinasi pasti muncul dengan menyeberang. Perhitungan

kromosom rekombinan karena itu menyediakan cara penghitungan

titik pertukaran silang.

PEMETAAN RECOMBINATION DENGAN

TUJUAN DUA TITIK

Untuk mengilustrasikan prosedur pemetaan, mari kita pertimbangkan dua poin

melakukan testcross? Gambar 7.11. Betina Drosophila jenis liar dikawinkan

untuk laki-laki homozigot untuk dua mutasi autosom — vestigial (vg),

yang menghasilkan sayap pendek, dan hitam (b), yang menghasilkan hitam

tubuh. Semua lalat F1 memiliki sayap panjang dan tubuh abu-abu; demikian, itu

alel tipe liar (vg? dan b?) dominan. Betina F1 adalah

kemudian testcrossed untuk vestigial, laki-laki hitam, dan progeni F2 diurutkan berdasarkan fenotipe
dan dihitung. Seperti yang ditunjukkan data, ada empat fenotipik

kelas, dua melimpah dan dua langka. Kelas yang melimpah memiliki fenotipe yang sama

orang tua asli, dan kelas langka memiliki fenotipe rekombinan. Kami tahu itu

gen vestigial dan gen hitam terkait karena rekombinan jauh lebih sedikit daripada

50 persen dari total keturunan dihitung. Oleh karena itu gen-gen ini harus sama

kromosom. Untuk menentukan jarak di antara mereka, kita harus memperkirakan rata-rata

jumlah crossover di gamet dari betina F1 heterozigot ganda. Kita dapat

lakukan ini dengan menghitung frekuensi lalat F2 rekombinan dan mencatat bahwa masing-masing

Fly mewarisi kromosom yang telah menyeberang satu kali antara vg dan b. Rata-rata

jumlah crossover di seluruh sampel progeni karenanya

rekombinan non-rekombinan

(0)? 0,82? (1)? 0,18? 0,18

Dalam ungkapan ini, jumlah crossover untuk setiap kelas lalat ditempatkan dalam tanda kurung;

nomor lainnya adalah frekuensi kelas itu. Progeni non-rekombinan

jelas tidak menambahkan kromosom crossover ke data, tetapi kami memasukkannya ke dalamnya

perhitungan untuk menekankan bahwa kita harus menghitung jumlah rata-rata crossover
dengan menggunakan semua data, bukan hanya dari rekombinan.

Analisis sederhana ini menunjukkan bahwa, rata-rata, 18 dari 100 kromosom pulih

dari meiosis memiliki crossover antara vg dan b. Jadi, vg dan b dipisahkan oleh 18 unit

di peta genetik. Kadang-kadang ahli genetika menyebut unit peta sebagai centiMorgan, disingkat
cM,

untuk menghormati T. H. Morgan; 100 centiMorgans sama dengan satu Morgan (M). Karena itu kita
bisa

mengatakan bahwa vg dan b adalah 18 cM (atau 0,18 M) terpisah. Perhatikan bahwa jarak peta
sama dengan

frekuensi rekombinasi, ditulis sebagai persentase. Nanti kita akan melihat bahwa ketika

frekuensi rekombinasi mendekati 0,5, itu meremehkan jarak peta. Untuk mengetes

pemahaman Anda tentang prinsip-prinsip yang mendasari pemetaan rekombinasi, dikerjakan

latihan dalam Memecahkannya: Memetakan Dua Gen dengan Testcross Data. PEMETAAN
RECOMBINATION DENGAN

TUJUAN TIGA TITIK

Kami juga dapat menggunakan prosedur pemetaan rekombinasi dengan data dari

testcrosses yang melibatkan lebih dari dua gen. ? Gambar 7.12 mengilustrasikan sebuah

percobaan oleh C. B. Bridges dan T. M. Olbrycht, yang menyeberangi tipe liar

Laki-laki Drosophila untuk perempuan homozigot untuk tiga resesif X-link resesif-

scute (sc) bulu mata, mata echinus (ec), dan sayap crossveinless (cv). Mereka

kemudian bersilangan dengan progeni F1 untuk menghasilkan lalat F2, yang mereka klasifikasikan

dan dihitung. Kami mencatat bahwa betina F1 di intercross ini membawa ketiganya

mutasi resesif pada salah satu kromosom X dan tipe liar

alel-alel mutasi ini pada kromosom X lainnya. Selanjutnya, F1

laki-laki membawa tiga mutasi resesif pada kromosom X tunggal mereka.

Dengan demikian, kawin silang ini setara dengan testcross dengan ketiga gen di

Wanita F1 hadir dalam konfigurasi penggandengan.

The F2 terbang dari interkoda terdiri delapan fenotipe

kelas-kelas yang berbeda, dua diantaranya orangtua dan enam rekombinan. Orang tua
kelas yang paling banyak. Semakin sedikit kelas rekombinan masing-masing

mewakili kromosom crossover yang berbeda. Untuk mencari tahu crossover mana

terlibat dalam memproduksi setiap jenis rekombinan, pertama-tama kita harus menentukan
bagaimana

gen diperintahkan pada kromosom.

Menentukan Orde Gene

Ada tiga kemungkinan urutan gen:

1. sc — ec — cv

2. ec — sc — cv

3. ec — cv — sc

Kemungkinan lain, seperti cv? Ec? Sc, adalah sama dengan salah satunya karena kiri

dan ujung kanan kromosom tidak dapat dibedakan. Yang mana dari pesanan itu

benar?

Untuk menjawab pertanyaan ini, kita harus melihat enam rekombinan

kelas. Empat dari mereka pasti berasal dari satu crossover di salah satu dari keduanya

wilayah yang dibatasi oleh gen. Dua lainnya pasti berasal dari penyeberangan ganda

over — satu pertukaran di masing-masing dua wilayah. Karena switch crossover ganda

gen di tengah sehubungan dengan penanda genetik di kedua sisi itu, kita

memiliki, pada prinsipnya, cara menentukan urutan gen. Secara intuitif, kami juga tahu

bahwa crossover ganda harus terjadi lebih jarang daripada satu crossover.

Akibatnya, di antara enam kelas rekombinan, dua yang langka harus mewakili

kromosom crossover ganda.

Dalam data kami, kelas crossover ganda yang langka adalah 7 (sc ec? Cv) dan 8 (sc? Ec cv?),

masing-masing berisi lalat tunggal (Gambar 7.12). Membandingkan ini ke kelas orangtua 1 (sc

ec cv) dan 2 (sc? ec? cv?), kita melihat bahwa alel echinus telah berubah dengan hormat

untuk bersisik dan crossinginless. Akibatnya, gen echinus harus terletak di antara

dua lainnya. Urutan gen yang benar karena itu (1) sc? Ec? Cv.

Menghitung Jarak antar Gen

Setelah menetapkan urutan gen, kita sekarang dapat menentukan jarak antara yang berdekatan

gen. Sekali lagi, prosedurnya adalah menghitung jumlah rata-rata crossover di

setiap wilayah kromosom (? Gambar 7.13).