MAKALAH BIOLOGI SEL DAN MOLEKULER

Inti Sel dan DNA (Replikasi, Transkripsi, Dan Translasi)

Dosen: Dr. Ahmad Sukri, M.Pd

Disusun Oleh: Kelompok 8

1. SAPARWADI (12.211.047)

PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI

FAKULTAS PENDIDIKAN MATEMATIKA DAN IPA
INSTITUT KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN (IKIP)
MATARAM
2014

KATA PENGANTAR

Puji syukur ke hadirat Allah SWT atas segala rahmat, inayah serta hidayahnya sehingga penulis
dapat menyelesaikan makalah ini tepat pada waktunnya. Tidak lupa pula penulis ucapakan banyak
terima kasih kepada semua pihat yang tidak bisa penuli sebut namanya satu persatu yang telah
membantu dalam pengerjaan makalah ini. Semoga amal ibadahnya diterima oleh Allah SWT.
Makalah ini merupakan tugas mata kuliah biologi sel dan molekuler yang membahas tentang inti sel
dan DNA. Inti sel merupakan salah satu organela sel yang sangat penting karena berfungsi sebagai
pusat pengatur sel. Selain itu, inti sel juga berperan dalam hal reproduksi sel dan hereditas. Dengan
peran pentingnya ini, diperlukan pemahaman yang lebih mendalam tentang inti sel dengan cara
mempelajarinya secara seksama.
Penulis sepenuhnya menyadari bahwa makalah ini masih jauh dari kata sempurna. Oleh sebab itu,
penulis mengharapkan saran maupun kritikan yang bersifat membangun demi perbaikan makalah
ini. Semoga makalah tentang inti sel dan DNA ini dapat bermanfaat bagi kita semua, amin.

Mataram, 5 Desember 2014

Penulis
DAFTAR ISI

HALAMAN COVER......................................................................................................... i
KATA PENGANTAR........................................................................................................ ii
DAFTAR ISI...................................................................................................................... iii
BAB I PENDAHULUAN.................................................................................................. 1
A. LATAR BLAKANG................................................................................................. 1
B. RUMUSAN MASALAH.......................................................................................... 1
C. TUJUAN.................................................................................................................... 2
BAB II TINJAUAN PUSTAKA....................................................................................... 3
A. INTI SEL................................................................................................................ 3
1. Sejarah Penemuan Inti Sel.................................................................................. 3
2. Pengertian Nukleus............................................................................................. 3
3. Struktur Nukleus................................................................................................. 4
a. Membrane Nucleus...................................................................................... 5
b. Nukleoplasma.............................................................................................. 7
c. Kromatin ..................................................................................................... 8
d. Nucleolus..................................................................................................... 9
4. Fungsi Inti Sel .................................................................................................... 10
5. Transportasi inti................................................................................................... 11
6. Integrasi dan Disintegrasi................................................................................... 11
B. DNA........................................................................................................................ 12
1. Pengertian DNA................................................................................................. 12
2. Struktur DNA..................................................................................................... 12
a. Purin dan Pirimidin ..................................................................................... 14
b. Ikatan Purin dan pirimidin........................................................................... 14
3. Replikasi DNA.................................................................................................... 15
a. Pengertian Replikasi.................................................................................... 15
b. Teori Mekanisme Replikasi.......................................................................... 17
c. Arah Pertumbuhan Rantai........................................................................... 18
d. Prasyarat Replikasi....................................................................................... 19
e. Faktor pendukung........................................................................................ 19
f. Garpu Replikasi .......................................................................................... 19
g. Tahapan Replikasi........................................................................................ 19
1) Inisiasi..................................................................................................... 20
2) Sintesis Primer......................................................................................... 21
3) Sintesis leading strand............................................................................. 21
4) Sintesis lagging Strand (untai tertinggal)................................................ 22
5) Penghapusan Primer................................................................................ 23
6) Ligasi....................................................................................................... 23
7) Terminasi (pemutusan)............................................................................ 24
4. Transkripsi........................................................................................................... 24
a. Pengertian.................................................................................................... 24
b. Pengaturan Transkripsi................................................................................. 25
c. Tahap Transkripsi ........................................................................................ 26
1) Inisiasi (Permulaan)................................................................................. 27
2) Elongasi (Pemanjangan).......................................................................... 27
3) Terminasi................................................................................................. 28
5. Translasi ............................................................................................................. 29
a. Pengertian.................................................................................................... 29
b. Tahap Translasi............................................................................................ 29
1) Inisiasi .................................................................................................... 30
2) Elongasi .................................................................................................. 31
3) Terminasi ................................................................................................ 33
6. Asam Amino ...................................................................................................... 33
a. Struktur asam amino ................................................................................... 33
b. Sintesis asam amino..................................................................................... 34
c. Kode Asam Amino ..................................................................................... 35
BAB III PENUTUP............................................................................................................ 38
A. Kesimpulan................................................................................................................ 38
B. Saran.......................................................................................................................... 38
DAFTAR PUSTAKA......................................................................................................... 39

BAB I
PENDAHULUAN

A. LATAR BLAKANG
Sel merupakan unit struktur dan fungsional terkecil makhluk hidup. Sel dikendalikan oleh suatu
organel yaitu nucleus. Nukleus merupakan organel yang penting karena nucleus sebagai pengendali
semua kegiatan sel, tanpa adanya nucleus maka kegiatan-kegiatan sel tidak dapat berlangsung.
Tidak dapat berlangsungnya kegiatan di sel tentu akan mengganggu fungsi jaringan serta organ
dalam tubuh kita, serta tanpa adanya nucleus maka sel tidak akan dapat hidup dalam waktu yang
lama. Inti sel atau nukleus adalah organel yang ditemukan pada sel eukariotik. Organel ini
mengandung sebagian besar materi genetik sel dengan bentuk molekul DNA linier panjang yang
membentuk kromosom bersama dengan beragam jenis protein. Gen di dalam kromosom-kromosom
inilah yang membentuk genom inti sel. Fungsi utama nukleus adalah untuk menjaga integritas gen-
gen tersebut dan mengontrol aktivitas sel dengan mengelola ekspresi gen. Selain itu, nukleus juga
berfungsi untuk mengorganisasikan gen saat terjadi pembelahan sel, memproduksi mRNA untuk
mengkodekan protein, sebagai tempat sintesis ribosom, tempat terjadinya replikasi dan transkripsi
dari DNA, serta mengatur kapan dan di mana ekspresi gen harus dimulai, dijalankan, dan diakhiri.
Nukleus adalah organel pertama yang ditemukan, yang pertama kali dideskripsikan oleh Franz
Bauer pada 1802 dan dijabarkan lebih terperinci oleh ahli botani Skotlandia, Robert Brown, pada
tahun 1831. Pada satu sel umumnya ditemukan hanya satu nukleus. Namun demikian, beberapa
jaringan tertentu, atau beberapa spesies tertentu memiliki lebih daripada satu nukleus. Inti-inti dalam
sel multinuklei ini dapat memiliki peran yang saling mengganti atau saling mengkhususkan diri. Pada
Paramecium, terdapat dua inti sel: makronukleus (inti besar) dan mikronukleus (inti kecil).
Makronukleus menjamin keberlangsungan hidup, sedangkan mikronukleus bertanggung jawab
terhadap reproduksi.

B. RUMUSAN MASALAH
1. Apa pengertian Nukleus atau inti sel?
2. Bagaiman struktur dari Nukleus?
3. Apa yang di maksud dengan DNA, Replikasi, Transkripsi dan Translasi DNA?
4. Bagaimanakah proses yang terjadi saat replikasi, transkripsi dan tranlasi
C. TUJUAN
1. Untuk mengetahui apa yang di maksud dengan inti sel, DNA, Replikasi, Transkripsi dan
Translasi DNA.
2. Memahami struktur dari nucleus
3. Mengetahui pengertian DNA, replikasi, transkripsi dan translasi
4. Memahami proses selama terjadi replikasi, transkripsi dan translasi

BAB II
TINJAUAN PUSTAKA

A. Inti Sel atau Nukleus

Inti sel adalah organel pertama yang diteliti. Penggambaran inti sel pertama kali dilakukan oleh
Antonie van Leeuwenhoek. Kala itu dia sedang meneliti inti sel di dalam sel darah merah salmon.
Inti sel juga dijelaskan oleh Franz Bauer pada tahun 1802 dan dijelaskan secara lebih detail lagi oleh
ahli botani Skotlandia Robert Brown pada tahun 1831 saat dia menjadi pembicara di Linnean
Society of London. Kala itu Robert Brown meneliti inti sel dari sel pada epidermis bunga anggrek.
Namun, dia tidak menjelaskan apa fungsi dari inti sel tersebut. Pada tahun 1838, Matthias Schleiden
mengatakan bahwa inti sel berperan dalam pembentukan sel dan kemudian dia menamakannya
“cytoblast” yang berarti “pembentuk sel”. Dia yakin bahwa dia telah melihat sel baru terbentuk
disekitar “cytoblast”.
Diantara tahun 1877 dan 1878, Oscar Hertwig mempublikasikan sejumlah studi dari fertilisasi telur
landak laut yang menunjukkan bahwa inti sel sperma memasuki sel telur dan menyatu dengan inti
sel tersebut. Itu adalah pertama kalinya diduga bahwa sebuah individu terbentuk dari sebuah inti sel.
Selain itu, Hertwig juga telah meneliti hewan lain seperti amfibi dan moluska. Eduard Strasburger
menghasilkan hasil penelitian yang sama pada tumbuhan pada tahun 1884. Pada abad ke-20, teori
kromosom pun dikembangkan.
Pada satu sel umumnya ditemukan hanya satu nukleus. Namun demikian, beberapa jaringan
tertentu, atau beberapa spesies tertentu memiliki lebih daripada satu nukleus. Inti-inti dalam sel
multinuklei ini dapat memiliki peran yang saling mengganti atau saling mengkhususkan diri. Pada
Paramecium, terdapat dua inti sel: makronukleus (inti besar) dan mikronukleus (inti kecil).
Makronukleus menjamin keberlangsungan hidup, sedangkan mikronukleus bertanggung jawab
terhadap reproduksi.
1. Pengerian Nukleus atau Inti Sel
Nukleus berasal dari kata Latin, yang berarti kernel (biji). Nukleus adalah organel berbentuk bola
hanya ditemukan dalam sel eukariotik. Inti sel atau nukleus adalah organel yang ditemukan pada sel
eukariotik. Organel ini mengandung sebagian besar materi genetik sel dengan bentuk molekul DNA
linier panjang yang membentuk kromosom bersama dengan beragam jenis protein. Gen di dalam
kromosom-kromosom inilah yang membentuk genom inti sel.
Nukleus merupakan organel terbesar sel, dengan ukuran diameter antara 10-20 nm. Nukleus
memiliki bentuk bulat atau lonjong. Hampir semua sel memiliki nukleus, karena nukleus ini berperan
penting dalam aktivitas sel, terutama dalam melakukan sintesis protein. Namun ada beberapa sel
yang tidak memiliki nukleus antara lain sel eritrosit dan sel trombosit. Pada kedua sel ini aktivitas
metabolisme terbatas dan tidak dapat melakukan pembelahan.
Biasanya sebuah sel hanya memiliki satu nukleus saja, yang terletak di tengah. Namun ada sel-sel
yang memiliki inti lebih dari satu yaitu pada sel parenkim hati dan sel otot jantung, yang memiliki dua
buah nukleus. Adapun pada sel otot rangka terdapat banyak nukleus.
2. Fungsi Nukleus
Fungsi utama nukleus adalah untuk menjaga integritas gen-gen tersebut dan mengontrol aktivitas
sel dengan mengelola ekspresi gen. Selain itu, nukleus juga berfungsi untuk mengorganisasikan
gen saat terjadi pembelahan sel, memproduksi mRNA untuk mengkodekan protein, sebagai tempat
sintesis ribosom, tempat terjadinya replikasi dan transkripsi dari DNA, serta mengatur kapan dan di
mana ekspresi gen harus dimulai, dijalankan, dan diakhiri.
Berikut adalah daftar fungsi penting yang dilakukan oleh inti sel.:
a. Penyimpanan materi herediter, gen dalam bentuk helai DNA yang panjang dan tipis (asam
deoksiribonukleat), disebut sebagai kromatin.
b. Penyimpanan protein dan RNA (asam ribonukleat) dalam nukleolus.
c. Inti adalah sebuah situs untuk transkripsi di mana RNA duta (mRNA) yang diproduksi untuk
sintesis protein.
d. Pertukaran molekul keturunan (DNA dan RNA) antara inti dan bagian lain dari sel.
e. Selama pembelahan sel, khromatin disusun ke dalam kromosom dalam inti.
f. Produksi ribosom (pabrik protein) dalam nukleolus.
g. Transportasi selektif dan energi molekul melalui pori-pori inti.
h. mengelola gen-gen dan mengontrol aktivitas sel.
i. Berperan penting dalam proses pembelahan sel,
j. Memproduksi mRNA
k. Tempat mensintesis ribosom,
l. Tempat terjadinya replikasi dan transkripsi DNA,
m. Mengatur gerak ekspresi gen. mengatur kapan dan di mana ekspresi gen harus dimulai,
dijalankan, dan diakhiri.
n.
Ketika inti mengatur integritas gen dan ekspresi gen yang juga disebut sebagai pusat kontrol sel. Inti
berisi semua materi genetik dari suatu organisme seperti kromosom, DNA, gen, dll.
3. Struktur Nukleus
Nukleus memiliki peran yang sangat vital dalam kehidupan sebuah sel. Peranan nucleus dalam hal
ini adalah untuk mengatur dan mengontrol segala aktifitas kehidupan sel serta membawa informasi
genetik yang diturunkan ke generasi berikutnya. Informasi genetik ini disimpan dalam suatu molekul
polinukleutida yang disebut DNA (Deoxyribonucleic acid). DNA pada umumnya tersebar di dalam
nucleus sebagai matriks seperti benang yang disebut kromatin. Ketika sel akan memulai membelah,
kromatin akan berkondensasi membentuk struktur yang lebih padat dan memendek yang
selanjutnya disebut kromosom. Kromosom tersusun atas molekul DNA dan protein histon. Struktur
di dalam nucleus yang merupakan tempat berkonsentrasinya molekul DNA adalah nucleolus (anak
inti.). Nucleolus berperan sebagai tempat terjadinya sintesis molekul RNA (Ribonucleic acid) dan
ribosom. RNA merupakan hasil salinan DNA yang akan ditransfer ke sitoplasma untuk
diterjemahkan menjadi rantai asam amino yang disebut protein.
Nucleus dapat menjalankan fungsi di atas karena memiliki struktur sebagai berikut.
a. Membran nucleus
Membrane sel inilah yang membedakan antara sel eukaripotik dengan sel prokariotik, dimana pada
sel prokariotik tidak ada membrane sel.
Melalui membrane sel inilah nucleus dapat mengeluarkan berbagai macam RNA dan sub unit
ribosom ke sitoplasma karena memiliki struktur sebagai berikut:
Dalam mikroskop elekron menunjukkan bahwa membrane nucleus memiliki 2 lapis membrane unit
pararel yang dipisahkan oleh celah sempit berukuran antar 40-70 nm yang disebut sisterna
perinukleus atau intermembran space. Bersama-sama, pasangan membrane inti serta celah
diantarnya merupakan selaput inti. Setiap lapis membrane strukturnya sama dengan struktur
membrane organel yang lain, yaitu adanya pospolipid bilayer. Membrane luar dari selaput inti
berhubungan langsung dengan sistem membrane sitoplasma yang dikenal dengan reticulum
endoplasma. Karena itu membrane luar inti dan reticulum memiliki satu ciri sama yaitu keduanya
ditaburi oleh ribosom, yang merupakan organel yang berperan dalam sintesis protein.
Dalam membrane nucleus terdapat lamina fibrosa yaitu struktur protein yang berhubungan erat
dengan selaput inti, yang variasi ketebalannya antar 80-300nm tergantung dari sel yang diamati,
namun pori membrane nucleus tidak ditutupi oleh struktur ini. Lamina fibrosa terdiri dari 3 lapis
polipeptida , disebut lamin, yang merupakan bagian dari matriks inti. Lamin inilah yang akan
berperan saat pembelah sel. Saat fase telofase lamin inti akan terfosforilasi dan saat telofase pori
dan lamin akan mengalami defosforilasi yaitu lamina inti terbentuk kembali. Maka pada saat profase
membrane nucleus akan hilang akibat dari terfosforilasinya lamin.
Dalam membrane nucleus terdapat pori inti yang menyediakan jalan diantara inti dan sitoplasma.
Pori ini begaris tengah rata-rata 70nm. Pori ini tidak terbuka namun dijembatani oleh sebuah
membrane kedap electron berupa diafragma protein lapis-tunggal. Struktur ini lebih tipis dari
membrane yang membentuk selaput inti. Permeabilitas inti terhadap molekul sangat bervariasi
namun semua pori permeable terhadap beberapa molekul misalnya mRNA, protein sitoplasma.
Berikut struktur dari pori pada membrane nucleus.
b. Kromatin
Kromatin pada saat interfase tampak sebagai butir-butir yang tersebar pada seluruh inti tanpa
adanya benang-benang kromosom. Namun sebaliknya, jika inti sel sedang bermitosis buti-butir
kromatin tidak terlihat dan akan tampak benang-benang kromosom. Istilah kromosom diperuntukan
bagi kromatin yang membentuk gambaran sebagai batang-batang halus saat pembelahan sel.
Kromosom tersusun atas molekul DNA (16%), RNA (12%) dan nucleoprotein (72%). Nukleoprotein
sendiri tersusun atas berbagai jenis protein, yaitu protamin, histon, nonhiston dan berbagai enzim di
antaranya polymerase DNA dan RNA.
Karena memiliki komatin inilah maka nukleus berfungsi sebagai imformasi genetik serta pengendali
seluruh kegiatan sel. Pengendali seluruh kegiatan sel, karena dalam nukleus terdapat kromatin yang
didalamnya terdapat DNA, melalui DNA inilah protein disintesis dengan bantuan RNA dan enzim.
Protein merupakan molekul yang sangat penting bagi sel dan tubuh kita, karena enzim , hormon dan
antibodi memerlukan protein
c. Nukleolus
Struktur nucleolus (anak inti) akan terlihat di bawah pengamatan mikroskop electron sebagai sebuah
atau lebih bangunan basofil yang berukuran lebih besar daripada ukuran butir-butir kromatin.
Nukleolus merupakan tempat berlangsungnya transkripsi gen yang dari proses tersebut didapatkan
molekul rRNA. rRNA adalah salah satu jenis RNA yang merupakan materi penyusun ribosom.
Molekul rRNA yang baru terbentuk segera dikemas bersama protein ribosom untuk dikeluarkan dari
inti sel. Transkripsi molekul rRNA di dalam nucleolus menjamin terbentuknya molekul ribosom yang
ada di dalam sitoplasma. Untuk kebutuhan tersebut, maka di dalam anak inti terdapat sejumlah
potongan-potongan DNA (rDNA) yang ditranskripsi menjadi rRNA secara berulang-ulang dan
berjalan sangat cepat dengan bantuan enzim RNA polymerase I. Potongan-potongan DNA tersebut
dinamakan nucleolar organizer. Kandungan RNA dalam anak inti jika dibandingkan dengan bagian
lain dari inti sel adalah tidak tetap, yaitu diperkirakan 5%-20%. Berikut gambar dari nucleolus
d. Nukleoplasma
Nukleoplasma merupakan substansi transparan, semi solid (agak padat), yang terletak di dalam
nukleus. Komposisi tersusun dari asam, nukleat (DNA & RNA), yang merupakan materi genetik,
protein dan garam-garam mineral.
1) Asam Nukleat
Asam terdapat dalam dua bentuk, yaitu : asam dioksiribosa (DNA) dan ribosa (RNA). Biasanya
dalam nukleus kedua asam nukleat ini bergabung dengan protein yang disebut nukleuprotein.
Banyaknya DNA dalam nukleus bervariasi. Misalnya pada nukleus sel salamander (Amphibia)
mengandung DNA lebih banyak dibandingkan dengan nukleus sel mamalia.
2) Protein Nukleus
Jenis protein yang terdapat pada nukleus (Nukleuprotein) yaitu, protamin dan histon. Selain kedua
jenis protein ini pada nukleus terdapat protein lain yang bersifat asam, yaitu: nonhiston protein dan
enzim nukleus
3) Garam-garam Mineral
Nukleus mengandung sejumlah kofaktor, prekursor dan mineral NAD, ATP, dan acetil CoA. Hasil
analisis abu nukleus mengandung unsur fosfor kalium, natrium, kalsium dan magnesium. Fosfor
banyak terdapat pada nucleolus.
B. DNA
1. Pengertian DNA
Molekul DNA dikenal sebagai materi genetik yang menyimpan semua informasi penting tentang
segala aktivitas sel yang harus dilakukan melangsungkan sebuah kehidupan. DNA atau
Deoxyribonucleic acid diibaratkan sebagai perpustakaan besar yang didalamnya terdapat buku-buku
penting (gen) dan tersimpan rapi di dalam inti sel. Molekul DNA memiliki struktur berupa dua untai
polinukleutida (double strand) yang masing-masing untai polinukleutida tersusun atas rangkaian
nukleutida dalam bentuk deoksiribonukleutida. Setiap molekul nukleutida terdiri atas tiga gugus,
yaitu gugus gula pentosa dalam bentuk deoksibosa, gugus fosfat dan gugus basa nitrogen.
2. Struktur DNA
Bahan bangunan DNA adalah molekul yang disebut nukleotida, yang terdiri dari gula deoksiribosa
(gula 5-karbon), sebuah basa nitrogen yang melekat pada gula, dan gugus fosfat. Ada empat jenis
molekul nukleotida tergantung pada jenis basa nitrogen terpasang. Keempat nukleotida (dan basa
nitrogen masing-masing) adalah:
Adenosine (Adenin)
Thymidine (Timin)
Guanosine (Guanin)
Cytidine (Sitosin)
a. Purin dan Pirimidin
Sitosin dan timin adalah pirimidin, sejenis molekul heterosiklik beranggota enam. Di sisi lain, adenin
dan guanin adalah purin, yang merupakan molekul dua cincin yang terdiri dari cincin pirimidin dan
cincin imidazol. Ini nukleotida dihubungkan melalui gugus fosfat dan gugus gula untuk membentuk
untai tunggal dari molekul DNA. Gugus fosfat satu nukleotida dan gugus hidroksil dari nukleotida
yang berdekatan terhubung melalui ikatan fosfodiester. gugus Gula dan gugus fosfat membentuk
tulang punggung masing-masing untai DNA. Setiap untai memiliki ujung 5 ‘ fosfat dan ujung 3′
hidroksil.
b. Ikatan Purin dan pirimidin
Helix ganda DNA terdiri dari dua untai komplementer yang berjalan anti-sejajar satu sama lain. Satu
untai berjalan di arah 5’→ 3′, sedangkan lainnya berjalan ke arah anti-paralel 3 ‘→ 5′. Ini untai
melekat satu sama lain melalui ikatan hidrogen yang terjadi antara purin dan pirimidin dengan untai
yang berlawanan. Pasangan adenin dengan timin melalui ikatan ganda (A = T), sedangkan
pasangan guanin dengan sitosin melalui ikatan rangkap tiga (G ≡ C). DNA berputar pada jarak
tertentu karena sudut ikatan dari molekul tulang punggung DNA. Ini membentuk struktur heliks
bukannya tangga lurus. A = T dan G ≡ C pasangan basa membentuk anak tangga heliks ini.
DNA membawa informasi genetik dan bagian DNA yang membawa ciri khas yang diturunkan
disebut gen. Perubahan yang terjadi pada gen akan menyebabkan terjadinya perubahan pada
produk gen tersebut. Gen sering juga diartikan sebagai ruas DNA yang menghasilkan produk gen
yang berupa enzim yang dikenal dengan teori satu gen satu enzim. Karena enzim dapat merupakan
kombinasi polipeptida. maka teori tersebut diubah menjadi satu gen satu polipeptida.
Konsep dasar menurunnya sifat secara molekuler adalah merupakan aliran informasi dari DNA ke
RNA ke urutan asam amino. Konsep dasar ini disebut sebagai dogma genetik. Pada dogma genetik
juga tercermin cara mempertahankan ciri khas supaya tetap sama melalui proses replikasi. Dogma
genetik ini bersifat universal yang berlaku baik bagi prokariot maupun eukariot.
3. Replikasi DNA
a. Pengertian Replikasi
Setiap sel dapat memperbanyak diri dengan cara membelah. Sebuah sel membelah menjadi 2 sel, 2
sel membelah menjadi 4 sel, 4 sel membelah menjadi 8 sel dan seterusnya. Sebelum sel
membelah, terjadi perbanyakan komponen-komponen di dalam sel termasuk DNA. Perbanyakan
DNA dilakukan dengan cara replikasi. Dengan demikian, replikasi adalah proses pembuatan
(sintesis) DNA baru atau penggandaan DNA di dalam nukleus. Dengan kata lain replikasi
merupakan Proses perbanyakan bahan genetic. Pada saat replikasi berlangsung, DNA induk
membentuk kopian DNA anak yang sama persis sehingga DNA induk berfungsi sebagai cetakan
untuk pembentukan DNA baru. Replikasi merupakan tahapan rumit yang mengawali sintesis protein.
Replikasi bahan genetik dapat dikatakan sebagai proses yang mengawali pertumbuhan sel,
meskipun sebenarnya pertumbuhan merupakan suatu resultan banyak proses yang saling berkaitan
satu sama lain. Sel mempunyai mekanisme replikasi bahan genetik yang dilengkapi dengan system
penyutingan (editing) yang sangat akurat sehingga bahan genetik yang diturunkan kepada sel
anakan (progeny) mempunyai komposisi yang sangat identik dengan komposisi bahan genetik sel
induk. Replikasi bahan genetik diikuti oleh pembentukan sel-sel anakan yang membawa duplikat
bahan genetik hasil replikasi. Sehingga kesalahan dalam proses replikasi bahan genetik dapat
mengakibatkan perubahan pada sifat-sifat sel anakan.
Mekanisme replikasi bahan genetik sangat kompleks dan melibatkan banyak protein yang masing-
masing mempunyai peranan spesifik. Protein-protein yang terlibat di dalam proses replikasi bahan
genetik dikode oleh gen-gen yang terdapat di dalam bahan genetik itu sendiri. Oleh karena itu, ada
kaitan fungsional yang sangat erat dan tidak terpisahkan antara proses replikasi bahan genetik
dengan proses ekspresi genetik dan metabolisme sel secara keseluruhan. Hambatan yang terjadi
pada proses metabolisme, misalnya penghambatan produksi energy, dapat pula mempengaruhi
proses replikasi karena replikasi juga memerlukan pasokan energy.

Gambar 1. Tahapan replikasi DNA.

Proses replikasi dimulai pada beberapa daerah spesifik dari rantai DNA, disebut pangkal replikasi.
Beberapa tahapan dan enzim yang berperan dalam sintesis protein, antara lain:
1) DNA helikase, berfungsi untuk membuka rantai ganda DNA induk.
2) Enzim primase, membentuk primer yang merupakan segmen pendek dari RNA sebagai
pemula untuk terjadinya sintesis protein.
3) Dari ujung 3´ RNA primer, DNA polimerase menambahkan pasangan basa nitrogen (dari
nukleotida-nukleotida) pada rantai tunggal DNA induk dan terbentuk rantai DNA yang
bersambungan secara kontinyu (tanpa terpisah-pisah) yang disebut leading strand.
4) Pada rantai tunggal DNA induk yang lain, DNA polimerase membentuk lagging strand
(merupakan keseluruhan rantai kopian DNA yang pertumbuhannya tidak kontinyu) dengan
memperpanjang RNA primer-RNA primer di beberapa tempat sehingga membentuk segmen-
segmen DNA baru yang saling terpisah. Segmen-segmen itulah yang disebut fragmen Okazaki.
5) DNA polimerase yang lainnya, menggantikan RNA primer dengan DNA dan enzim ligase
menghubungkan segmen-segmen okazaki, sehingga terbentuk salinan DNA baru. Nah, DNA baru
yang telah terbentuk (identik dengan DNA induk) akan melanjutkan tahapan untuk mensintesis
protein yaitu tahapan transkripsi dan translasi.
b. Tahapan Replikasi
Proses replikasi DNA merupakan suatu masalah yang kompleks, dan melibatkan rangkaian protein
dan enzim yang secara kolektif merakit nukleotida dalam urutan yang telah ditentukan. Dalam
menanggapi isyarat molekul yang diterima selama pembelahan sel, molekul-molekul ini melakukan
replikasi DNA, dan mensintesis dua untai baru menggunakan helai yang ada sebagai template atau
‘cetakan’. Masing-masing menghasilkan dua, molekul DNA yang identik terdiri dari satu untai baru
dan salah satu DNA lama. Oleh karena itu proses replikasi DNA disebut sebagai semi-konservatif.
Rangkaian peristiwa yang terjadi selama replikasi DNA prokariotik telah dijelaskan di bawah ini.
1) Inisiasi
Replikasi DNA dimulai pada lokasi spesifik disebut sebagai asal replikasi, yang memiliki urutan
tertentu yang bisa dikenali oleh protein yang disebut inisiator DnaA. Mereka mengikat molekul DNA
di tempat asal, sehingga mengendur untuk perakitan protein lain dan enzim penting untuk replikasi
DNA. Sebuah enzim yang disebut helikase direkrut ke lokasi untuk unwinding (proses
penguraian/seperti membuka resleting) heliks dalam alur tunggal.
Helikase melepaskan ikatan hidrogen antara pasangan basa, dengan cara yang tergantung energi.
Titik ini atau wilayah DNA yang sekarang dikenal sebagai garpu replikasi (Garpu replikasi atau
cabang replikasi adalah struktur yang terbentuk ketika DNA bereplikasi). Setelah heliks yang
terbuka, protein yang disebut untai tunggal mengikat protein (SSB) mengikat daerah terbuka dan
mencegah mereka untuk menempel kembali. Proses replikasi sehingga dimulai, dan garpu replikasi
dilanjutkan dalam dua arah yang berlawanan sepanjang molekul DNA.
Pelepasan untai DNA
2) Sintesis Primer
Sintesis baru, untai komplementer DNA menggunakan untai yang ada sebagai template yang
dibawa oleh enzim yang dikenal sebagai DNA polimerase. Selain replikasi mereka juga memainkan
peran penting dalam perbaikan DNA dan rekombinasi.
Namun, DNA polimerase tidak dapat memulai sintesis DNA secara independen, dan membutuhkan
3′ gugus hidroksil untuk memulai penambahan nukleotida komplementer. Ini disediakan oleh enzim
yang disebut DNA primase yang merupakan jenis DNA dependent-RNA polimerase. Ini mensintesis
bentangan pendek RNA ke untai DNA yang ada. Ini segmen pendek disebut primer, dan terdiri dari
9-12 nukleotida. Hal ini memberikan DNA polimerase platform yang diperlukan untuk mulai menyalin
sebuah untai DNA. Setelah primer terbentuk pada kedua untai, DNA polimerase dapat
memperpanjang primer ini menjadi untai DNA baru.
Pembukaan resleting DNA dapat menyebabkan supercoiling (bentukan seperti spiral yang
mengganggu) di wilayah garpu berikutnya. Ini superkoil DNA dibuka oleh enzim khusus yang
disebut topoisomerase yang mengikat ke bentangan DNA depan garpu replikasi. Ini menciptakan
memotong pada untai DNA dalam rangka untuk meringankan supercoil tersebut.
Sintesis DNA Primer
3) Sintesis leading strand
DNA polimerase dapat menambahkan nukleotida baru hanya untuk ujung 3′ dari untai yang ada, dan
karenanya dapat mensintesis DNA dalam arah 5′ → 3′ saja. Tapi untai DNA berjalan di arah yang
berlawanan, dan karenanya sintesis DNA pada satu untai dapat terjadi terus menerus. Hal ini
dikenal sebagai untaian pengawal (leading strand).
Replikasi DNA untaian pengawal (leading strand)
Di sini, DNA polimerase III (DNA pol III) mengenali 3′ OH ujung RNA primer, dan menambahkan
nukleotida komplementer baru. Saat garpu replikasi berlangsung, nukleotida baru ditambahkan
secara terus menerus, sehingga menghasilkan untai baru.
4) Sintesis lagging Strand (untai tertinggal)
Pada untai berlawanan, DNA disintesis secara terputus dengan menghasilkan serangkaian fragmen
kecil dari DNA baru dalam arah 5 ‘→ 3′. Fragmen ini disebut fragmen Okazaki, yang kemudian
bergabung untuk membentuk sebuah rantai terus menerus nukleotida. Untai ini dikenal sebagai
lagging Strand (untai tertinggal) sejak proses sintesis DNA pada untai ini hasil pada tingkat yang
lebih rendah.
sintesis lagging Strand
Di sini, primase menambahkan primer di beberapa tempat sepanjang untai terbuka. DNA pol III
memperpanjang primer dengan menambahkan nukleotida baru, dan jatuh ketika bertemu fragmen
yang terbentuk sebelumnya. Dengan demikian, perlu untuk melepaskan untai DNA, lalu bergeser
lebih lanjut kebagian atas untuk memulai perluasan primer RNA lain. Sebuah penjepit geser
memegang DNA di tempatnya ketika bergerak melalui proses replikasi.
5) Penghapusan Primer
Meskipun untai DNA baru telah disintesis primer RNA hadir pada untai baru terbentuk harus
digantikan oleh DNA. Kegiatan ini dilakukan oleh enzim DNA polimerase I (DNA pol I). Ini khusus
menghilangkan primer RNA melalui ‘5→ 3′ aktivitas eksonuklease nya, dan menggantikan mereka
dengan deoksiribonukleotida baru dengan 5 ‘→ 3′ aktivitas polimerase DNA.
Menghilangkan primer RNA
6) Ligasi
Setelah penghapusan primer selesai untai tertinggal masih mengandung celah antara fragmen
Okazaki berdekatan. Enzim ligase mengidentifikasi dan menyumbat celah tersebut dengan
menciptakan ikatan fosfodiester antara 5 ‘fosfat dan 3′ gugus hidroksil fragmen yang berdekatan.
Ligasi
7) Terminasi (pemutusan)
Replikasi ini terhenti di lokasi terminasi khusus yang terdiri dari urutan nukleotida yang unik. Urutan
ini diidentifikasi oleh protein khusus yang disebut tus yang mengikat ke situs tersebut, sehingga
secara fisik menghalangi jalur helikase. Ketika helikase bertemu protein tus itu jatuh bersama
dengan untai tunggal protein pengikat terdekat.
4. Transkripsi
Pada tahapan ini, DNA akan membentuk RNA dengan cara menerjemahkan kode-kode genetik dari
DNA. Proses pembentukan RNA ini disebut transkripsi, yang menghasilkan 3 macam RNA seperti
yang telah kalian ketahui sebelumnya, yaitu mRNA, tRNA, dan rRNA. Transkripsi terjadi di dalam
sitoplasma dan diawali dengan membukanya rantai ganda DNA melalui kerja enzim RNA
polimerase. Sebuah rantai tunggal berfungsi sebagai rantai cetakan atau rantai sense, rantai yang
lain dari pasangan DNA ini disebut rantai anti sense. Tidak seperti halnya pada replikasi yang terjadi
pada semua DNA, transkripsi ini hanya terjadi pada segmen DNA yang mengandung kelompok gen
tertentu saja. Oleh karena itu, nukleotida-nukleotida pada rantai sense yang akan ditranskripsi
menjadi molekul RNA dikenal sebagai unit transkripsi.

Gambar 3. Tahapan transkripsi RNA.

Transkripsi meliputi 3 tahapan, yaitu tahapan inisiasi, elongasi, dan terminasi.
a. Inisiasi (Permulaan)
Jika pada proses replikasi dikenal daerah pangkal replikasi, pada transkripsi ini dikenal promoter,
yaitu daerah DNA sebagai tempat melekatnya RNA polimerase untuk memulai transkripsi. RNA
polimerase melekat atau berikatan dengan promoter, setelah promoter berikatan dengan kumpulan
protein yang disebut faktor transkripsi. Nah, kumpulan antara promoter, RNA polimerase, dan faktor
transkripsi ini disebut kompleks inisiasi transkripsi. Selanjutnya, RNA polimerase membuka rantai
ganda DNA.
enzim RNA polymerase menyalin gen, sehingga pengikatan RNA polymerase terjadi pada tempat
tertentu yaitu tepat didepan gen yang akan ditranskripsi. Tempat pertemuan antara gen (DNA)
dengan RNA polymerase disebut promoter. Kemudian RNA polymerase membuka double heliks
DNA. Salah satu utas DNA berfungsi sebagai cetakan.
b. Elongasi (Pemanjangan)
Setelah membuka pilinan rantai ganda DNA, RNA polimerase ini kemudian menyusun untaian
nukleotida-nukleotida RNA dengan arah 5´ ke 3´. Pada tahap elongasi ini, RNA mengalami
pertumbuhan memanjang seiring dengan pembentukan pasangan basa nitrogen DNA.
Pembentukan RNA analog dengan pembentukan pasangan basa nitrogen pada replikasi. Pada RNA
tidak terdapat basa pirimidin timin (T), melainkan urasil (U). Oleh karena itu, RNA akan membentuk
pasangan basa urasil dengan adenin pada rantai DNA. Tiga macam basa yang lain, yaitu adenin,
guanin, dan sitosin dari DNA akan berpasangan dengan basa komplemennya masing-masing
sesuai dengan pengaturan pemasangan basa. Adenin berpasangan dengan urasil dan guanin
dengan sitosin (Gambar 2).
Gambar 2. Tahap elongasi transkripsi.
c. Terminasi (Pengakhiran)
Penyusunan untaian nukleotida RNA yang telah dimulai dari daerah promoter berakhir di daerah
terminator. Setelah transkripsi selesai, rantai DNA menyatu kembali seperti semula dan RNA
polimerase segera terlepas dari DNA. Akhirnya, RNA terlepas dan terbentuklah RNA m yang baru.
Pada sel prokariotik, RNA hasil transkripsi dari DNA, langsung berperan sebagai RNA m.
Sementara itu, RNA hasil transkripsi gen pengkode protein pada sel eukariotik, akan menjadi RNA
m yang fungsional (aktif) setelah malalui proses tertentu terlebih dahulu. Dengan demikian, pada
rantai tunggal RNA m terdapat beberapa urut-urutan basa nitrogen yang merupakan komplemen
(pasangan) dari pesan genetik (urutan basa nitrogen) DNA. Setiap tiga macam urutan basa nitrogen
pada nukleotida mRNA hasil transkripsi ini disebut sebagai triplet atau kodon.
5. Translasi
Setelah replikasi DNA dan transkripsi mRNA di dalam nukleus, mRNA dari nukleus dipindahkan ke
sitoplasma sel. Langkah selanjutnya adalah proses translasi mRNA untuk membentuk protein.
Translasi merupakan proses penerjemahan beberapa triplet atau kodon dari RNA m menjadi asam
amino-asam amino yang akhirnya membentuk protein. Urutan basa nitrogen yang berbeda pada
setiap triplet, akan diterjemahkan menjadi asam amino yang berbeda. Misalnya, asam amino
fenilalanin diterjemahkan dari triplet UUU (terdiri dari 3 basa urasil), asam amino triptofan (UGG),
asam amino glisin (GGC), dan asam amino serin UCA.
Sebanyak 20 macam asam amino yang diperlukan untuk pembentukan protein merupakan hasil
terjemahan triplet dari mRNA. Selanjutnya, dari beberapa asam amino (puluhan, ratusan, atau
ribuan) tersebut dihasilkan rantai polipeptida spesifik dan akan membentuk protein spesifik pula.
Langkah-langkah pada proses translasi adalah sebagai berikut:
a. Inisiasi Translasi
Ribosom sub unit kecil mengikatkan diri pada mRNA yang telah membawa sandi bagi asam amino
yang akan dibuat, serta mengikat pada bagian inisiator tRNA. Selanjutnya, molekul besar ribosom
juga ikut terikat bersama ketiga molekul tersebut membentuk kompleks inisiasi. Molekul-molekul
tRNA mengikat dan memindahkan asam amino dari sitoplasma menuju ribosom dengan
menggunakan energi GTP dan enzim. Bagian ujung tRNA yang satu membawa antikodon, berupa
triplet basa nitrogen. Sementara, ujung yang lain membawa satu jenis asam amino dari sitoplasma.
Kemudian, asam amino tertentu tersebut diaktifkan oleh tRNA tertentu pula dengan
menghubungkan antikodon dan kodon (pengkode asam amino) pada mRNA.

Gambar 4. Tahap inisiasi translasi.

Kodon pemula pada proses translasi adalah AUG, yang akan mengkode pembentukan asam amino
metionin. Oleh karena itu, antikodon tRNA yang akan berpasangan dengan kodon pemula adalah
UAC. tRNA tersebut membawa asam amino metionin pada sisi pembawa asam aminonya.
b. Elongasi
Tahap pengaktifan asam amino terjadi kodon demi kodon sehingga dihasilkan asam amino satu
demi satu. Asam-asam amino yang telah diaktifkan oleh kerja tRNA sebelumnya, dihubungkan
melalui ikatan peptida membentuk polipeptida pada ujung tRNA pembawa asam amino. Misalnya,
tRNA membawa asam amino fenilalanin, maka antikodon berupa AAA kemudian berhubungan
dengan kodon mRNA UUU. Fenilalanin tersebut dihubungkan dengan metionin membentuk peptida.
Nah, melalui proses elongasi, rantai polipeptida yang sedang tumbuh tersebut semakin panjang
akibat penambahan asam amino.
Gambar 5. Tahap elongasi translasi.
Keterangan:
1) tRNA membawa antikodon AAA & asam amino (fenilalanin)
2) antikodon AAA berpasangan dengan kodon mRNA
3) pembentukan ikatan peptide
4) pemanjangan rantai polipeptida & ribosom siap menerima tRNA selanjutnya.
c. Terminasi
Proses translasi berhenti setelah antikodon yang dibawa tRNA bertemu dengan kodon UAA, UAG,
atau UGA. Dengan demikian, rantai polipeptida yang telah terbentuk akan dilepaskan dari ribosom
dan diolah membentuk protein fungsional.

Gambar 6. Terminasi translasi.

BAB III
PENUTUP

A. Kesimpulan
Pada satu sel umumnya ditemukan hanya satu nukleus. Namun demikian, beberapa jaringan
tertentu, atau beberapa spesies tertentu memiliki lebih daripada satu nukleus. Inti-inti dalam sel
multinuklei ini dapat memiliki peran yang saling mengganti atau saling mengkhususkan diri.
Inti sel atau nukleus adalah organel yang ditemukan pada sel eukariotik. Organel ini mengandung
sebagian besar materi genetik sel dengan bentuk molekul DNA linier panjang yang membentuk
kromosom bersama dengan beragam jenis protein. Gen di dalam kromosom-kromosom inilah yang
membentuk genom inti sel.
Di dalam inti sel terdapat DNA yang bertugas dalam pewarisan sifat serta sintesis protein. Dalam
melaksanakan fungsinya DNA mengalami bebrapa proses seperti replikasi, transkripsi dan translasi.
Replikasi merupakan penggandaan DNA. Transkripsi adalah proses pembentukan RNA dari DNA.
Translasi merupakan proses pembentukan kode asam amino oleh RNA.

B. Saran
Adapun saran yang bisa penyusun berikan antara lain:
1. Selalu berusaha untuk meningkatkan pengetahuan demi menjadi insan yang berilmu dan
berfikir
2. Belajar tidak hanya dari bangku pendidikan tapi bisa dari lingkungan sekitar
3. Ilmu adalah cahaya, maka bukalah dan bersihkan hati agar ilmu bisa masuk
DAFTAR PUSTAKA

Rochmah, S. N., Sri Widayati, Mazrikhatul Miah. 2009. Biologi : SMA dan MA Kelas XII. Pusat
Perbukuan, Departemen Pendidikan Nasional, Jakarta, p. 282.
Yuwono, Triwibowo. 2005. Biologi Molekuler. Jakarta: Penerbit Erlangga