& peraga 16.1 Bagaimanakah struktur DNA bisa diketahui?
ffiwsw
'16.1 DNA adalah materi genetik
16.2 Banyak protein bekerja sama dalam replikasi
dan perbaikan DNA
16.3 Kromosorn terdiri atas suatu molekul DNA
yang dikemas bersama-sarna dengan protein
WtrffiEffi
i lnstruksi Kerja Kehidupan
adaApril 1953, James 'Watson dan Francis Crick
menggemparkan dunia ilmiah dengan suatu
model heliks-ganda elegan untuk struktur asam
deoksiribonukleat, atau DNA. Feraga 'X6"'! menunjukkan
Watson (kiri) dan Crick yang sedang mengagumi model
DNA, yang dibuat dari kaleng dan kawat. Selama 50 tahun
terakhir, model tersebut telah berevolusi dari gagasan baru
menjadi ikon biologi modern. DNA, zat pewarisan-sifat,
merupakan molekul yang paling dielu-elukan di zaman
kita. Faktor-faktor terwariskan temuan Mendel dan gen-
gen pada kromosom temuan Morgan sebenarnya tersusun
atas DNA. Dari aspek kimiawi, susunan genetik Anda
adalah DNA yang terkandung dalam 46 kromosom yang
Anda warisi dari orangtua dan dalam mitokondria yang
diwariskan meialui ibu Anda.
Dari semua molekul yang ada di alam, asam nukleat
bersifat unik karena mampu mengarahkan replikasinya
sendiri dari monomer. Bahkan, kemiripan anak dengan
induknya didasari oleh replikasi DNA secara tepat-sama dan
pewarisan DNA dari satu generasi ke generasi berikutnya.
Informasi herediter dikodekan dalam bahasa kimiawi DNA
dan direproduksi dalam semua sel tubuh Anda. Program
DNA inilah yang mengarahkan perkembangan sifat
biokimiawi, anatomi, fisiologis, dan, sampai taraf tertentu,
perilaku Anda. Pada bab ini, Anda akan mempelajari
bagaimana ahli biologi menyimpulkan bahwa DNA-iah
'Watson dan Crick
materi genetik kita dan bagaimana
330 UNIT TIGA Genetika
menemukan struktur molekul tersebut. Anda juga akan
melihat bagaimana DNA direplikasi-dasar molekular
pewarisan-sifat-dan bagaimana se1 memperbaiki DNA-
nya. Terakhir, Anda akan menjelajahi bagaimana molekul
DNA dikemas bersama dengan protein dalam kromosom.
$ 6.,8
I DNA adalah materi genetik
I(ini, bahkan anak sekolah pun pernah mendengar tentang
DNA, para ilmuwan secara rutin memanlpulasi DNA dalam
laboratorium, seringkali untuk mengubah sifat terwariskan
dari sel-sel dalam percobaan. Akan tetapi, pada awal
abad ke-20, identifikasi molekul-molekul pewarisan-sifat
merupakan tantangan yang sangat besar bagi ahli biologi.
Fencarian Materi Genetik:
Fenefiffari i{nniah
Begitu kelompok T.H. Morgan menunjukkan bahwa gen
terletak di sepanjang kromosom (dideskripsikan pada Bab
15), kedua komponen kimiawi kromosom-DNA dan
protein-menjadi kandidat materi genetik. Sampai tahun
I940-an, para ahli lebih cenderung menganggap protein
sebagai materi genetik, terutama karena ahli biokimia
telah mengidentlfikasi protein sebagai kelas makromolekul
yang memiliki heterogenitas dan kespesifikan fungsi
yang tinggi, persyaratan-persyaratan penting bagi
materi herediter. Terlebih lagi, saat itu hanya sedikit
yang diketahui tentang asam nukleat, yang sifat-sifat
fisik dan kimiawinya tampaknya terlalu seragam untuk
bisa bertanggung jawab terhadap keanekaragaman sifat
turunan spesifik yang ditunjukkan oleh setiap organisme.
Pandangan ini perlahan-lahan berubah seiring kemunculan
hasil-hasil yang tak terduga dari berbagai percobaan
dengan mikroorganisme. Seperti penelitian Mendel dan
Morgan, faktor kunci dalam menentukan identitas materi
genetik adalah pilihan terhadap organisme percobaan
yang sesuai. Peran DNA dalam hereditas pertama kali
dipecahkan melalui penelitian terhadap bakteri dan virus
yang menginfeksi mikroorganisme tersebut, yang jauh Dapatkah sifat genetik ditransfer di antara
lebih sederhana daripada tanaman ercis, Ialat buah, atau galur-galur bakteri yang berbeda?
manusia. Di bagian ini kita akan menelusuri pencarian
materi genetik secara cukup terperinci sebagai contoh
kasus dalam penelitian ilmiah.
FERCO AN, Frederick Griffith mempelajari dua galur
bakteri Streptococcus pneumonlae. Bakteri galur S (smooth,
mulus) dapat menyebabkan pneumonia pada mencit.
S{.rkti C}&lA Sapaf fu{entransfo,rffrasi Sakfers Bakteri S bersifat patogenik karena memiliki kapsul yang
melrndungi dirinya dari sistem pertahanan hewan. Bakteri
Klta dapat menelusuri kisah penemuan peran genetik gaiur R (rough, kasar) tidak memiliki kapsul dan bersifat
DNA hingga ke 1928. I(etika mencoba mengembangkan nonpatogenik. Untuk menguji sifat patogenisitas, Griffith
vaksin pneumonia, seorang petugas medis Inggris menyuntik mencit dengan dua galur bakteri seperti yang
bernama Frederick Griffith mempelajari Streptococcus ditunjukkan di bawah:
pneumoniae, bakteri penyebab pneumonia pada mamalia.
Campuran sel S
Griffith memiliki dua galur (varietas) bakteri tersebut, Se -sel S yang yang
Sel-sel R Sel-se S yang yang mat karena
yang satu patogenik (penyebab penyakit) dan yang satu hidup (kontro ) hidup (kontrol) dimat kan dengan panas dan sel R

panas (kontrol) yang h duP

lagi nonpatogenik (tidak berbahaya). Ia terkejut ketika

'6)
menemukan bahwa sebagian sel yang masih hidup menjadi
patogenik {Feraga '!6.?} saat ia membunuh bakteri tersebut
dengan panas dan kemudian mencampurkan sisa-sisa se1
dengan bakteri hidup dari galur nonpatogenik. Terlebih
!ry7
. i:
-.,::'.&' .. ;: ;:
;:i:;:, l* '!r.'lilii.,.\>
lagi, sifat patogenisitas yang baru diperoleh ini diwarisi oleh :i: llf t'!:i!: *:{ ::ii
semua keturunan bakteri yang tertransformasi (berubah). t,/f :i, ,{-/
a./ i
!it: Ay'
.:
'iii i
/elaslah, ada komponen kimiawi sel patogenik yang mati il
F' fl
{
yang menyebabkan perubahan terwariskan ini, walaupun

l,
identitas zat tersebut belum diketahui. Griffith menyebut HASIt
feno mena ini sebagai transformas i (tran sfor matio n), kini
didefinisikan sebagai perubahan genotipe dan fenotipe
akibat asimilasi DNA eksternal oleh suatu sel. (Penggunaan
,t,
Mencit mati Mencit sehat
l,
Mencit sehat Mencit mati
I
l<ata transformasi yang satu ini tidak boleir dikacaukan
dengan pengubahan sel hewan normal menjadi sel kanker,
dibahas pada Bab 12.)
ffi \T!
ffi
F"--
Penelitian Griffith meletakkan dasar bagi pencarian A:,,.,r'
selama 14 tahun oleh ahli bakteriologi dari Amerika /rn
'**f t \ ) sel-selsyans
i h,dup ditemulan
Serikat, Oswald Avery, untuk menemukan identitas zat i"ffrl
\ dalam sampel
pentransformasi itu. Avery memusatkan perhatiannya pada daral. yang dapat
tiga kandidat utama: DNA, RNA (asam nukleat yang satu bereproduksi,
lagi), dan protein. Avery membongkar bakteri patogenik menghasilkan
yang dibunuh dengan panas dan mengekstraksi kandungan lebih banyak
sel 5.
sel. Dalam sampel-sampel yang terpisah, ia menggunakan
perlakuan-perlakuan spesifik yang menginaktivasi satu (i$ilYFiUffilrl, Griffith
menyimpulkan bahwa bakteri R yang
hidup telah ditransformasi menjadi bakteri S patogenik oleh
dari ketiga tipe molekul. Ia kemudian menguji setiap
suatu zat terwariskan yang belum diketahui dari sel-sel S
sampel yang telah diberi perlakuan untuk mengetahui yang mati yang memungkinkan sel-sel R membuat kapsul.
kemampuan sampel mentransformasi bakteri nonpatogenik
yang masih hidup. Hanya ketika DNA dibiarkan aktif- SUSn*f$'r!:l,il F. criiflth, The significance of pneumococcal types,

lah transformasi terjadi. Pada tahun J.944, Avery dan Journal of Hygiene 27:113-159 (92q.
kolega-koleganya, Maclyn McCarty dan Colin Macleod, Bagaimana percobaan ini dapat
mengumumkan bahwa agen pentransformasi itu adalah menghapuskan kemungkinan bahwa sel-sel R mungkin
DNA. Temuan mereka disambut dengan penuh minat sekadar menggunakan kapsul sel S yang mati sehingga
namun disertai rasa skeptis yang cukup besar, sebagian menjadi patogenik?
karena kepercayaan yang masih melekat bahwa protein
merupakan kandidat yang lebih bagus sebagai materi
genetik. Terlebih lagi, banyak ahli biologi belum yakin Akan tetapi alasan utama dari keraguan tersebut adalah
bahwa gen bakteri berkomposisi dan berfungsi sama para ahli biologi belum banyak mengetahui tentang DNA
dengan gen organisme-organisme yang lebih kompleks. pada saat itu.

BAB ENAM BELAS Dasar Molekular Pewarisan-Sifat 331

Bukti DNA.Virus Dapat Memprogram Sel
Bukti tambahan yang mendukung DNA sebagai materi
genetik berasal dari penelitian tentang virus yang
menginfeksi bakteri (Peraga 16.3). Virus-virus semacam
ini disebut bakteriofag (bacteriophage, berarti
'pemakan-bakteri') atau fag (phage) saja. Virus jauh
Iebih sederhana daripada sel. Virus tidak lebih dari DNA
(atau terkadang RNA) yang diselubungi oleh lapisan
pelindung, yang seringkali hanya tersusun atas protein.
Untuk bereproduksi, virus harus menginfeksi sel dan
membajak mekanisme metabolisme sel.
Fag telah banyak digunakan sebagai alat oleh para
peneliti genetika molekular. Pada tahun 1952, Alfred
Hershey dan Martha Chase melakukan beberapa
percobaan yang menunjukkan bahwa DNA adalah materi
genetik fagyangdikenal sebagai T2.T2 adalah salah satu
dari sekian banyak fag yang menginfeksi Escherichia coli
(E. coli), bakteri yang normalnya hidup di usus mamalia.
Pada saat itu, ahli biologi sudah mengetahui bahwa T2,
seperti banyak fagyang lain, tersusun hampir semuanya
oleh DNA dan protein. Mereka juga mengetahui bahwa
fagT2 dapat dengan cepat mengubah sel E. coli menjadi
pabrik penghasil-T2 yang melepaskan banyak salinan
virus tersebut ketika sel pecah. T2 bisa memprogram
ulang sel inangnya untuk menghasilkan virus. Namun
komponen virus manakah-protein atau DNA-yang
melakukan hal tersebut?
Hershey dan Chase menjawab pertanyaan ini dengan
merancang suatu percobaan yang menunjukkan bahwa
hanya satu dari kedua komponen T2 yang betul-betul
memasukl sel E. coli selama infeksi (Peraga 16.4). Dalam
percobaan mereka, Hershey dan Chase menggunakan
isotop radioaktif sulfur untuk melabeii protein pada
salah satu kelompok T2 dan isotop radioaktif fosfor
untuk melabeli DNA pada kelompok kedua. I(arena
protein, bukan DNA, mengandung sulfur, maka atom-
T=
lc
lo
IO
t-
A Peraga 16.3 Virus menginfeksi sel bakteri. T2 dan fag-
fag yang terkait melekat ke sel inang dan menyuntikkan materi
genetiknya melalui membran plasma, sedangkan kepala dan bagian
ekor tetap berada di permukaan luar bakteri (TEM diwarnai).
332 UNIT TIGA Genetika
atom sulfur radioaktif diinkorporasikan hanya ke dalam
protein fag. Dalam cara yang serupa, atom-atom fosfor
radioaktif hanya melabeli DNA, bukan protein, karena
hampir semua fosfor fag berada dalam DNA-nya. Dalam
percobaan ini, sampel-sampel terpisah dari seI-sel E. coli
yang nonradioaktif dibiarkan diinfeksi oleh kelompok
T2 berlabel protein dan berlabel DNA. Para peneliti
kemudian menguji kedua sampel segera setelah infeksi
dimulai untuk melihat tipe molekul mana-protein atau
DNA-yang telah memasuki sel-sel bakteri sehingga
mampu memprogram ulang sel-sel tersebut.
Hershey dan Chase menemukan bahwa DNA fag
memasuki sel inang, namun protein fag tidak. Terlebih
lagi, sewaktu bakteri-bakteri ini dikembalikan ke medium
kuitur, infeksi terus berjalan, dan E. coli melepaskan fag
yang mengandung sejumlah fosfor radioaktif. Ini adalah
bukti lebih lanjut bahwa DNA di dalam sel memainkan
peran yang terus berlangsung dalam proses infeksi.
Hershey dan Chase menyimpulkan bahwa DNA yang
disuntikkan fag pastilah molekul yang membawa informasi
genetik yang menyebabkan sel memproduksi DNA dan
protein virus yang baru. Percobaan Hershey-Chase
merupakan penelitian terobosan karena memberikan bukti
kuat bahwa asam nukleat, bukan protein, yang merupakan
materi genetik, setidaknya untuk virus.
Bukti Tambahan Bahwa DNA
Merupakan Materi Genetik
Bukti lebih lanjut bahwa DNA merupakan materi genetik
berasal dari laboratorium ahli biokimia Erwin Chargaff.
Saat itu sudah diketahui bahwa DNA merupakan polimer
dari nukleotida-nukleotida, yang masing-masing terdiri
atas tiga komponen: basa bernitrogen (mengandung
nitrogen), guia pentosa yang disebut deoksiribosa, dan
gugus fosfat (Peraga 16.5). Basa dapat berupa adenin
(A), timin (T), guanin (G), atau sitosin (C). Chargaff
menganaiisis komposisi basa DNA dari beberapa
organisme yang berbeda. Pada tahun 1950, ia melaporkan
bahwa komposisi dasar DNA berbeda-beda dari satu
spesies ke spesies lain. Misalnya, 30,3o/o nukleotida DNA
manusia mengandung basa A, sedangkan DNA dari
bakteri E. coli hanya mengandung 26,00/o basa A. Bukti
keanekaragaman molekuiar di antara spesies ini, yang
dahuiu diduga tidak ada untuk DNA, menjadikan DNA
sebagai kandidat yang iebih sesuai untuk materi genetik.
Chargaff juga menyadari keteraturan yang aneh
pada rasio basa nukleotida dalam satu spesies. Dalam
DNA masing-masing spesies yang diteliti, jumlah adenin
kira-kira sama dengan jumlah timin, sedangkan jumlah
guanin kira-kira sama dengan jumlah sitosin. Misalnya,
daiam DNA manusia, keempat basa terdapat dalam
persentase sebagai berikut: A = 30,3o/o dan T = 30,3o/o; G
= 1.9,5o/o dan C = 19,9%. Kesamaan antara jumlah basa A
dan T serta jumlah basa G dan C dalam spesies apa pun
dikenal sebagai aturan Chargaf (Chargafk rules). Dasar
dari aturan-aturan ini tetap tidak dapat dijelaskan hingga
akhirnya heliks ganda ditemukan.
Membangun Model Struktur DNA:
Penelitian llmiah
Setelah sebagian besar ahli biologi yakin bahwa DNA
merupakan materi genetik, tantangan berikutnya adalah
menentukan bagaimana struktur DNA dapat menyebabkan
molekul tersebut berperan dalam pewarisan-sifat.
awal 1950-an, susunan ikatan kovalen daiam polimer asam
nukleat telah dipahami dengan baik (lihat Peraga 16.5), dan
para peneliti memusatkan perhatian terhadap pencarian
struktur berdimensi tiga DNA. Salah satu peneliti yang
menyelidiki masalah tersebut adalah Linus Pauling, di
California Institute of Technology, serta Maurice Wilkins
dan Rosalind Franklin, di I(ing s College, London. Akan
tetapi, yang pertama menemukan jawaban yang benar
adalah dua ilmuwan yang saat itu relatif tidak tersohor-
James'Watson dari Amerika dan Francis Crick dari Inggris.
Pada I(emitraan yang singkat namun berhasil dalam
memecahkan teka-teki struktur DNA dimulai segera
setelah'Watson pindah ke Cambridge University, tempat
Crick sedang mempelajari struktur protein dengan teknik
yang disebut kristalografi sinar-X (1ihat Peraga 5.25),

Apakah protein atau DNA yang merupakan materi genetik lag T2?

PqRCO$AAN Alfred Hershey dan Martha Chase menggunakan sulfur radioaktif untuk melacak nasib protein, dan menggunakan
fosfor radioaktif untuk tujuan yang sama terhadap nasib DNA fag T2 yang menginfeksi sel-sel bakteri. Mereka ingin mengetahui
molekul mana yang memasuki dan dapat memprogram ulang sel agar membuat lebih banyak fag.

i$ Fag berlabel radioaktif dicampur @ Camouran orblender agar $) Carprra. dtsertnfugasi @ Radioaktivitas di
dengan bakteri. Fag menginfeksi bagian-bagian tag di luar sehingga bakteri membentuk dalam pelet dan
sel bakteri. bakteri terlepas dari sel. pelet di bawah tabung reaksi. cairan diukur.
Fag bebas dan bagian fag
yang 1epas, yang lebih ringan,

n.n { I t1i"38i,,,
.,,"",*Tfr"*.$,.fl:i;
_
Radioaktivitas
(protein fag)
dalam cairan
Sel bakteri
-'
''"-:- -"- -"'s. l :.i
"' .'&.4 ,*-- '!- . , :l!

Kelompok 1: Fag dilumbuhkdl '@ *- ona "P;,

dalam sulfur radioaktif (3sS),
yang diinkorporasikan ke dalam
protein fag (merah muda).

\ p"t.t G"t o.n

DNA radioaktil
kandungan bakteri)

.,.,r,$i',,i-r:;

' ;€ .:i;.
". '!Bil.
' 1 :;iii;
,i :it
Kelompok 2: Fag dltumbuhkan
dalam fosfor radioaktif (32P).
yang diinkorporasikan ke dalam
,o,u'"*;l;**ilf;i4*
DNA fag (biru) l
lw.fro)
to**"****--,"
*-'H

Radloaktivitas (DNA
fag) dalam pelet.

llA5tl ,
Ketika protein dilabeli (kelompok 1), radioaktivitas tertinggal di luar sel. Namun saat DNA dilabeli (kelompok 2), radioaktivitas
ditemukan di dalam sel. Sel-sel bakteri dengan DNA fag radioaktif melepaskan fag-fag baru dengan sejumlah fosfor radioaktif.

KESIMP,tltAf*l'. DNA fag memasuki sel-sel bakteri, namun protein-protein fag tidak. Hershey dan Chase menyimpulkan bahwa
DNA, bukan protein, berfungsi sebagai materi genetik bagi fag T2.

$Ufrltfg6,l,ilr;, A.D. Hershey and Martha Chase, Independent functions of viral protein and nucleic acid in growth of bacteriophage, Journal of
General Physiology 36:39*56 (1 952).

Akan seperti apa hasil percobaan ini jika protein-protein mengandung informasi genetik?

BAB ENAM BELAS Dasar Molekular Pewarisan-Sifat JJJ

I(etika mengunjungi laboratorium Maurice Wilkins,
Watson melihat suatu citra difraksi sinar-X terhadap
DNA yang dihasilkan oleh kolega Wilkins yang andal,
Rosalind Franklin : P*raq:6; '! fr.il*]. Citra-citra yang
dihasilkan oleh kristalografi bukanlah gambar sungguhan
dari molekul. Bercak dan sumir yang terlihat pada Ferag;*
': irr.i ii
dihasilkan oleh sinar-X yang didifraksi (dibelokkan)
saat melewati serat-serat berjejer DNA hasil purifikasi.
I(ristalografer menggunakan persamaan matematis
untuk menerjemahkan pola-pola semacam itu menjadi
informasi tentang bentuk tiga dimensi molekul, dan
'Watson tahu benar tipe-tipe pola yang dihasilkan oleh
(a) Rosalind Franklin (b) Foto difraksi sinar-X
molekul heliks. Penelitian mendalam terhadap foto difraksi DNA buatan Franklin

& Fere.tl: 1.1.6 Rosalind Franklin dan foto difraksi sinar-X

Tulang punggung Basa bernitrogen DNA buatannya. Franklin, seorang kristalografer sinar-X yang
gula fosfat andal, melakukan beberapa percobaan penting yang menghasrlkan
foto yang memungkinkan Watson dan Crick menyimpulkan struktur
Ujung 5' heliks ganda DNA. Franklin meninggal dunia karena kanker pada
o tahun 1958, saat usianya baru 38 tahun. Koleganya, Maurice
t. Wilkins, menerima Hadiah Nobel tahun 1962 bersama Watson
^ .u H
dan Crick.
N. -N.
Y'n
o sinar-X DNA oleh Franklln tidak hanya membuat'Watson
Timin (T)
mengetahui bahwa DNA berbentuk heliks. Ia juga mampu
memperkirakan lebar heliks dan jarak di antara basa-basa
bernitrogen di sepanjang heliks tersebut. Lebar heliks
O:P O menunjukkan bahwa heiiks tampaknya tersusun atas dua
- -CHz
I
untai, bertentangan dengan model tiga-untai yang diajukan
o-
oleh Linus Pauling tak lama sebelum itu. I(eberadaan dua
untai itu melahirkan istilah yang kini akrab kita sebut
H
sebagai heliks ganda (double helix, Peraga 1S.7).
'Watson dan Crick mulai membangun model-model
Adenin (A)
heliks ganda yang sesuai dengan hasil pengukuran sinar-X
o HH
ll dan pengetahuan saat itu tentang kimia DNA. Setelah
I

IJ
-L
H2 I-TYN\H membaca laporan tahunan yang belum diterbitkan yang
I
o _N
H Y o
N merangkum penelitian Pauling, mereka mengetahui bahwa
Franklin menyimpuikan tulang punggung gula fosfat
terletak di luar heliks ganda. Susunan ini menarik karena
Sitosin (C)
meletakkan basa bernitrogen yang relatif hidrofobik di
sebelah dalam molekul, sehingga jauh dari larutan berair
o
I
di sekelilingnya.'Watson membangun suatu model dengan
basa-basa bernitrogen yang menghadap ke sebelah dalam
heliks ganda. Dalam model ini, kedua tulang punggung
I

o 4'

Fosfat
N ukleotida gula-fosfat bersifat antiparalel-artinya, subunit tulang
DNA
OHH punggung saling berlawanan arah (lihat Peraga 16.7). Anda
Gula (deoksiribosa) dapat membayangkan keseluruhan susunan tersebut seperti
zN.-H
Uiunq 3' H tangga tali dengan anak tangga yang kaku. Tali samping
Guanin (G) analog dengan tulang punggung gula-fosfat, sedangkan
:!:,::r,rii: anak tangga merepresentasikan pasangan basa bernitrogen.
s" iii.5 Struktur dari untai DNA. Setiap monomer
nukleotida terdiri atas satu basa bernitrogen (I A, C, atau G), satu Sekarang bayangkan Anda memegang salah satu ujung
gula deoksiribosa (biru), dan satu gugus fosfat (kuning). Fosfat tangga tali dan memuntir ujung yang satu lagi, sehingga
dari suatu nukleotida melekat ke qula nukleotida di sampingnya, terbentuk spiral. Data sinar-X Franklin mengindikasikan
menghasilkan 'tulang punggung' yang terdiri atas fosfat dan gula bahwa heliks tersebut membentuk satu putaran penuh setiap
berselang-seling. Basa menonjol dari tulang punggung tni. Untai
polinukleotida memiliki arah tertentu, dari ujung 5' (dengan gugus
3,4 nm. Dengan basa-basa bertumpukan yang jaraknya
fosfat) ke ujung 3' (dengan gugus -OH). 3' dan 5' mengacu ke hanya 0,34 nm, ada sepuluh lapisan pasangan basa, atau
nomor yang diberikan pada karbon-karbon dalam ctncin gula. anak tangga tali, dalam setiap putaran penuh heliks.

334 UNIT TIGA Genetika

 ulunq 5'

3,4 nm

rc- {z
or
.P
-o
\,-U\\
G@_,
b
Ho -'\\
o
uiunq 5

(a) Ciri-ciri kunci struktur DNA (b) Struktur kimia sebagian (c) Model pengisian-ruang

A Peraga 16.7 Heliks ganda. (a) 'Pita-
pita' dalam diagram ini merepresentasikan
tulang punggung gula-fosfat dari dua untai
DNA. Heliks disebut 'tidak-kidal'. alias meliuk
ke kanan. Kedua untai itu dihubungkan oleh
ikatan hidroqen (qaris titik-titik) di antara
basa-basa bernitrogen, yang berpasangan
di sebelah dalam heliks ganda. (b) Agar
jelas, kedua untai DNA ditunjukkan tidak
mengulir dalam struktur kimia sebagian ini.
lkatan kovalen yang kuat menautkan unit-
unit setiap untai, sedangkan ikatan hidrogen
yanq lebih lemah menghubungkan kedua
untai. Perhatikan bahwa kedua untai bersifat
antiparalel, yang berarti berorientasi ke arah
yang berlawanan. (c) Tumpukan rapat dari
pasangan basa terlihat jelas dalam model
komputer ini. Gaya tarik van der Waals di
antara pasangan-pasangan yang tertumpuk
memainkan peranan penting dalam menjaga
molekul ini tetap menyatu (lihat Bab 2).

Basa-basa bernitrogen pada heliks ganda dipasangkan

dalam kombinasi yang spesifik: adenin (A) dengan timln
(T), dan guanin (G) dengan sltosin (C). Melalui coba-
cobalah Watson dan Crick berhasil menyimpulkan ciri
kunci DNA ini. Watson awalnya membayangkan bahwa
basa berpasangan dengan sesamanya-misalnya A dengan
A, C dengan C. Akan tetapi model ini tidak sesuai dengan
data sinar-X yang menunjukkan bahwa heliks ganda
tampaknya memiliki diameter yang seragam. Mengapa
hal ini tidak konsisten dengan perpasangan basa dengan
sesamanya? Adenin dan guanin merupakan purin, basa
bernitrogen dengan dua cincin organik. Sebaliknya, sitosin
dan timin tergolong famili basa bernitrogen yang dikenal
sebagai pirimidin, yang memiliki satu cincin. Dengan
demikian, purin (A dan G) kira-kira dua kali lebih lebar
daripada pirimidin (C dan T). Pasangan purin terlalu
lebar, sedangkan pasangan pirimidin terlalu sempit untuk
menjelaskan diameter 2 nm heliks ganda. Akan tetapi,
memasangkan purin selalu dengan pirimidin menghasilkan
diameter yang seragam (lihat gambar di kanan).
\i(atson dan Crick menalar bahwa pastilah ada
kespesifikan tambahan dalam perpasangan tersebut yang
melandasi struktur basa. Setiap basa memiliki gugus
samping kimiawi yang dapat membentuk pasangan
hidrogen dengan pasangan yang sesuai. Adenin bisa
Purin + purin: terlalu lebar
Pirimidin + pirimidin: terlalu sempil
Purin + prrimidin: lebarnya
konsisten dengan data sinar-X
membentuk dua ikatan hidrogen dengan timin dan hanya
timin. Guanin membentuk tiga ikatan hidrogen dengan
sitosin dan hanya sitosin. Jika disingkat, A berpasangan
dengan T, dan G dengan C (Peraga 16.8).
Model Watson-Crick menjelaskan dasar aturan
Chargaff. Di mana pun satu untai molekul DNA
mengandung A, untaian pasangannya mengandung T;
dan G di salah satu untai selalu berpasangan dengan C
di untai komplementernya. Oleh karena itu, dalam DNA
organisme apa pun, jumlah adenin setara dengan jumlah
timin, sedangkan jumlah guanin setara dengan jumlah
sitosin. Walaupun aturan perpasangan basa mendiktekan
kombinasi basa bernitrogen yang membentuk 'anak
tangga' heliks ganda, aturan tersebut tidak membatasi
urut-urutan nukleotida di sepanjang setiap untai DNA.

BAB ENAM BELAS DasarMolekularPewarisan-Sifat 335


Adenin (A) Timin (T)
H
o.'....".H- N Mereka mengakhiri makalah klasiknya dengan pernyataan
H Pninsip Dasar: Perpasangan Basa
Guanin (G) Sitosin (C)
&. Pe!'aga 16.8 Perpasangan basa dalam DNA. Pasangan basa-
basa bernitrogen dalam heliks ganda DNA dihubungkan oleh ikatan
hrdroqen, di sini ditunjukkan sebagat garis putus-putus merah muda.
Urutan (sekuens) lurus keempat basa dapat bervariasi
dalam berbagai cara yang tak terhitung jumlahnya, dan
setiap gen memiliki urutan, atau sekuens basa, yang unlk.
Bulan April 1953, Watson dan Crick mengejutkan
dunia sains dengan makalah ringkas sepanjang satu
halaman di jurnal Inggris, Nature." Makalah itu me-
laporkan model molekular DNA yang mereka ajukan:
heliks ganda, yang sejak saat itu telah menjadi simbol
biologi molekular. I(eindahan model tersebut adalah
struktur DNA menunjukkan mekanisme dasar replikasinya.
ffimffi16"tr
1. Seekor laiat merniliki nukleotida dalam DNA-nya
dengan persentase sebagai berikut: 27,37o A, 27,60/o
T,22,5okc, dan 22,5o/o C. Bagaimana angka-angka ini
mendemonstrasikan aturan Chargaff
2. Bagaimanakah model Watson dan Crick menjelaskan
dasar aturan Chargafi?
3. ffi lika transformasi tidak terjadi
dalam percobaan Griffith, akan seperti apakah
hasilnya? Ielasl<an.
Untuk mengetahui lawaban yang dianjurkan,
Apendiks A.
.1. D. Watson and F. H. C. Crick, Molecular structure of nucleic
acids: a structure for deoxyribose nucleic acids, Nature: 177:737 -738
(1e53).
336 uNtT TtGA Genetika
,g
6,4
i Banyak protein bekerja sama
dalam replikasi dan perbaikan
DNA
Hubungan antara struktur dan fungsi terwujud dalam untai
ganda. Gagasan bahwa ada perpasangan spesilik di antara
basa-basa bernitrogen dalam DNA merupakan kilasan
ilham yang membimbing'Watson dan Crick menemukan
heliks ganda yang tepat. Mereka sekaligus melihat nilai
penting yang fungsionai dari aturan perpasangan basa.
yang menggugah 1n1: "Tak lolos dari pengamatan kami
bahwa perpasangan spesifik yang telah kami postulasikan
segera mengajukan suatu l(emungkinan mekanisme
penyalinan untuk materi genetiki' Di bagian ini, Anda
akan mempelajari mengenai prinsip dasar replikasi DNA,
dan sejumlah perincian penting tentang proses tersebut.
ke Untai Cetakan
Dalam makalah kedua, 'Watson dan Crick menyatakan
hipotesis tentang cara DNA bereplikasi:
I(ini model kami tentang asam deoksiribonukleat
merupakan, sebagai akibatnya, sepasang cetakan, masing-
masing saling komplementer. I(ami membayangkan
bahwa sebelum duplikasi, ikatan hidrogen putus, dan
kedua rantai membuka serta memisah. Setiap rantai
kemudian bertindak sebagai cetakan untuk pembentukan
rantai pendamping pada dirinya sendiri, sehingga kita
akhirnya akan memperoleh dua pasang rantai, yang
awalnya hanya satu. Terlebih 1agi, urut-urutan pasangan
basa akan diduplikasi secara tepat sama."
Peraga 16.9 mengilustrasikan gagasan dasar Watson
dan Crick. Agar lebih mudah diikuti, kami hanya
menunjukkan bagian pendek heliks ganda dalam bentuk
yang tidak terulir. Perhatikan bahwa jika Anda menutupi
salah satu untai DNA pada Peraga 16.9a, Anda masih
dapat menentukan urutan linear basa-basa di untai
tersebut dengan mengacu kepada untai yang tidak ditutupi
dan menerapkan aturan perpasangan basa. I(edua untai
tersebut bersifat komplementer. Setiap untai menyimpan
informasi yang diperlukan untuk merekonstruksi untai yang
satu lagi. I(etika setiap sel menyalin suatu molekul DNA,
setiap untai berperan sebagai cetakan untuk mengurutkan
nukleotida menjadi untai baru yang komplementer.
Nukleotida berjejer di sepanjang untai cetakan berdasarkan
aturan perpasangan basa dan ditautkan membentuk untai
.F. H- C. Crick and D. \Xatson, The compiementary structure of
J.
deoxyribonucleic acrd, Proceedings of the Royal Society of London A
22380 (19s4).
(a) induk memiliki dua
H,,tolekul
untai DNA komplementer.
Setiap basa berpasangan
melalui ikatan hidrogen
dengan pasangan spesifiknya,
A dengan T dan G dengan C.
(b) Langkah pertama dalam replikasr
adalah pemisahan kedua untai DNA.
Setiap untai induk kini dapat berperan
sebagai cetakan yang menentukan
urut-urutan nukleotida di sepanjang
untai baru yang komplementer.
(c) nukleotida-nukleotida komplementer
berjejer dan dihubungkan untuk
membentuk tulang punggung gula{osfat
dari untar baru. Setiap molekul DNA
'anakan' terdiri atas satu untai induk (biru
gelap) dan satu untai baru (biru muda).

A Peraga 16.9 Model replikasi DNA: konsep dasar. Dalam ilustrasi yang disederhanakan ini, suatu
segmen pendek DNA telah diluruskan menjadi struktur yang menyerupai tangga tali Tali samping tangga
merupakan tulang punggung gula-fosfat dari kedua untai DNA, Anak tangga merupakan pasangan basa
bernitrogen. Bentuk-bentuk sederhana menyimbolkan keempat jenis basa. Biru gelap merepresentasikan
untai DNA yang ada pada mo ekul induk. Biru muda merepresentasikan DNA yang baru disintesis.

baru. Pada awal proses hanya ada satu molekul DNA yang Sel induk Replikasi Replikasi
pertama kedua
beruntai ganda, namun kemudian ada dua, masing-masing
merupal(an replika yang sama persis dengan molekul (a) Model konservatif.
'indukl Mekanisme penyalinan ini analog dengan negatif Kedua untai induk

foto untuk membuat citra positif, yang kemudian juga

menyatu lagi / ;1il';
,.'irr !,,.1
setelah bertindak
bisa digunakan untuk membuat negatif foto yang 1ain, \ :ln:'r$x
dan demikian seterusnya. :'j:?'f,'j:5:t 7Btt /
Model replikasi DNA ini tetap tidak teruji selama baru, sehinqqa
beberapa tahun setelah publikasi struktur DNA. Percobaan mengembalikan \
heliks ganda induk.
yang diperlukan bersifat sederhana secara konsep,
namun sulit dilaksanakan. Model 'Watson dan Crick
memprediksikan bahwa saat heliks ganda bereplikasi,
masing-masing dari kedua molekul anakan mengandung
(b) Model semi-
satu untai lama, yang berasal dari molekul induk, dan konservatif. Kedua
satu untai yang baru dibuat. Model semikonservatif untai rrolekul induk
(semiconservative model) ini dapat dibedakan dari model
/
replikasi konservatil yang menyatakan kedua untai induk il:ffi1k,li;,
berlungsi sebagai
7srt1 'titir-$
.ti,t"rtff
kembali menyatu setelah proses tersebut (artinya, molekul \
induk akan dilestarikan). Dalam model yang ketiga, disebut
cetakan untuk \
sintesis untai baru
model dispersif, keempat untai DNA yang ada setelah yang komplementer.
replikasi merupakan campuran DNA lama dan baru
(Peraga 16.10). Walaupun mekanisme untuk replikasi DNA
konservatif atau dispersif tidak mudah ditentukan, model-
model ini tetap berkemungkinan benar sampai dibuktikan (c) Model dispersif.
Setrap untai
salah. Setelah menjalani dua tahun penelitian awal di akhir
pada kedua
1950-an, Matthew Meselson dan Franklin Stahl merancang molekul anakan
percobaan cerdik yang membedakan ketiga model itu. mengandu ng
Percobaan mereka mendukung model semikonservatif campuran DNA
replikasi DNA, seperti yang diprediksi oleh 'Watson dan sintesis yang lama
dan baru.
Crick, dan dikenal luas di kalangan ahli biologi sebagai
suatu contoh klasik dari rancangan percobaan yang elegan
(Peraga 16.11).
A Peraga 16.10 Tiga model alternatif replikasi DNA. Setiap
Prinsip dasar replikasi DNA sebenarnya sederhana
segmen pendek heliks ganda menyimbolkan DNA dalam sel.
secara konseptual. Akan tetapi, proses sesungguhnya Dimulai dari sel induk, kita menglkuti DNA selama dua generasi
meiibatkan beberapa 'akrobat' biokimiawi yang rumit, sel-dua putaran replikasi DNA. DNA yang baru dibuat berwarna
seperti yang akan kita lihat. biru muda.

BAB ENAM BELAS Dasar Molekular Pewarisan-Sifat 337

 Replikasi DNA: Pengamatan Lebih Dekat
Bakteri E. coli memiliki satu kromosom tunggal yang
Apakah replikasi DNA mengikuti model mengandung sekitar 4,6 miliar pasangan basa. Dalam
konservatif, semikonservatif, atau dispersif? lingkungan yang sesuai, suatu sel E. coli dapat menyalin
PERCOBAAN, Di California lnstitute of Technology, Matthew semua DNA ini dan membelah untuk membentuk dua sel
Meselson dan Franklin Stahl mengultur E. coli selama beberapa anakan yang identik secara genetik dalam waktu kurang
qenerasi dalam medium yang mengantung prekursor nukleotida dari sejam. Setiap sel Anda memiliki 46 molekul DNA
berlabel isotop berat nitrogen, 15N. Mereka lalu mentransfer dalam nukieusnya, setiap kromosom berupa satu molekul
bakteri ke medium yang hanya mengandung ]aN, isotop yang heliks ganda yang panjang. Secara total, terdapat 6 miliar
lebih ringan. Dua sampel DNA diambil dari labu ini, sekali pada
pasangan basa dalam sel Anda, atau lebih dari seribu kali
menit ke-20 dan sekali pada menit ke-40, setelah replikasi
pertama dan kedua. Meselson dan Stahl dapat membedakan lipat jumlah DNA dalam sel bakteri. lika kita mencetak
DNA dari densitas yang berbeda dengan cara menyentrifugasi simboi satu huruf untuk basa-basa ini (A, G, C, dan T)
DNA yang diekstraksi dari bakteri. dalam ukuran yang sama dengan huruf yang sedang Anda
baca ini, keenam miliar pasangan basa informasi dalam
& Bakteri dikuitur i"i -
.r S aakteri ditransfer sel diploid manusia akan mengisi kira-kira 1.200 buku
ff.il.{:3:'J/,-..
UJig'
r,,-^ 5rr .ffi,
[".ff.1:T.un-ia*
setebal tiga jilid Campbell jika digabungkan. Tetap saja sel
membutuhkan hanya beberapa jam untuk menyalin semua
6M
-r/\
DNA ini. Replikasi informasi genetik dalam jumlah yang
HASIL / \ luar biasa besar ini bisa tuntas hanya dengan kesalahan
3t\
yang sangat sedikit-kira-kira hanya satu per 10 miliar
@ sampel DNA Sampel DNA
it-,.] S ,,....' a.ntn.t
disentrifugasi ::::il disentrifugasi ri; '+l ,; |uruno
tt:
nukleotida. Penyaiinan DNA sangat luar biasa dalam hal
seterah 20" menit n*-, sete,al 40 menrt : E t kecepatan dan akurasi.
(setelan .eplikasi , I

tsetelan 'eplilasi :
pertarral. .eduar
i
Lebih dari selusin enzim dan protein lain terlibat
t' ir :,' r lebih
dalam replikasi DNA. Jauh lebih banyak yang diketahui
tentang bagaimana 'mesin replikasi' ini bekerja pada
KESIIdFUI.AN Meselson dan Stahl membandingkan hasil bakteri (misalnya E. coli) dibandingkan pada eukariota,
yang diperoleh dengan hasil yang diprediksi oleh ketiga
model pada Peraga '1 6.10, seperti yang ditunjukkan di bawah
dan kita akan mendeskripsikan langkah-langkah dasar
ini. Replikasi pertama dalam medium 1aN menghasilkan dari proses tersebut untuk E. coli, kecuali jika disebutkan
pita DNA hibrid (1sN-14N). Hasii ini mengeliminasi model untuk organisme yang lain. Akan tetapi, apa yang telah
konservatif. Replikasi kedua menghasilkan DNA ringan dipelajari oleh para ilmuwan tentang replikasi DNA
maupun hibrid, hasil yang membantah model dispersif dan eukariota menunjukkan bahwa sebagian besar proses itu
mendukung model semikonservatif. Oleh karena itu, mereka
pada dasarnya sama untuk prokariota dan eukariota.
menyimpulkan bahwa replikasi DNA bersifat semikonservatif.

Replikasi pertama Replikasi kedua Memulai Replikasi

Replikasi molekul DNA dimulai dari tempat khusus yang
Model disebut titik mula replikasi (origins of replication),
konservatif
x;^ bentangan pendek DNA yang memiliki sekuens
nukleotida spesifik. I(romosom E. coli, seperti banyak
kromosom bakteri lain, melingkar dan memiliki satu
...:(,,'..
Model .
, lr \l'r : ll I':''', ', titik mula. Protein-protein yang menginisiasi replikasi
'!kq,1
semikonservatif
L/w-\ DNA mengenali sekuens ini dan melekat ke DNA,
t'iq ri iJi linr'\ memisahkan kedua DNA dan membuka 'gelembung'
t -t l
"t. replikasi. Replikasi DNA kemudian berianjut ke kedua
i .'A arah sampai keseluruhan molekul tersalin (Peraga
Model u*; I,\\ r'tr
disoersif i,l,zr 16.12a). I(ebalikan dengan kromosom bakteri, kromosom
'\&\j
iii iti eukariota mungkin memiliki beberapa ratus atau beberapa
ribu titik mula replikasi. Gelembung replikasi terbentuk
t:,tSUM,g itiir M. Meselson and F.W. Stahl, The replication of DNA in dalam jumlah yang banyak dan kemudian menyatu,
Escherichia colt, Proceedings of the National Academy of Sciences USA sehingga mempercepat penyalinan molekul DNA yang
' 44:671-682 (1958).
sangat panjang (Peraga 16.12b). Seperti pada bakteri,
Baca dan analisis makalah asli dalam replikasi DNA eukariota berlanjut ke kedua arah dari
ffi
lnquiry in Action: lnterpreting Scientific Papers. setiap titik mula.
Pada setiap ujung gelembung replikasi terdapat
1ffi]W Jika Meselson dan stahl menumbuhkan garpu replik asi (replication fork), wilayah berbentuk-Y
, sel dalam medium yang mengandung laN terlebih dahulu dan
: rsru
kemudian memindahkan sel ke medium yang mengandung tempat untai induk sedang dibuka. Beberapa macam
sebelum mengamb sampe, akan seperti apakih haslnya? protein berpartisipasi dalam pembukaan untai ganda
, (Peraga 16.13). Helikase (helicase) adalah enzim-enzim

338 uNtT T|GA Genetika

 Titik mula==& Untai induk (cetakan) Molekul DNA beruntai ganda
reol.kasi nfffi Untai anakan (baru)
8{ \1-
,@88{ Untai induk (cetakan)

1M
ii?,""t?)fi.=*
_ 'w'\:H'o"o
Untai anakan (baru)

cetemouns renrilasidLffi
Gelembung Garpu replikasr

fl\ tI EE

"#
LJ*
Duamoe(,
DNAanakardh
fl*} /
{ 'h-{
$*4 Dua molekul DNA anakan

\*J LJ ,
}

0,5 pm
0.25 um

(a) Dalam kromosom melingkar E. coli dan banyak bakteri lain,
hanya ada satu titik mula replikasi. Untar induk
memisah
di titik mula, membentuk gelembung repl kasi dengan dua
garpu. Replikasi berlanjut ke kedua arah sampai kedua
garpu bertemu di sisi lain, menghasilkan dua molekul DNA
anakan. TEM menunjukkan kromosom bakteri dengan suatu
gelembung 'eplikas;.
(b) Dalam setiap kromosom linear eukariota, replikasi DNA
dimulai saat gelembung replikasi terbentuk di banyak tempat
di sepanjang molekll DNA raksasa. Gerembung mengembang
saat replikasi berlanlut ke kedua arah. Akhirnya gelembung-
gelembung menyatu dan sintesis untai-untai anakan pun
selesar TEM menunjukkan tiga gelembung replikasi di
sepanjang DNA sel hamster cina hasil kultur.

& i,erage 16"i2 Titik mula replikasi pada E coli dan eukariota. Anak ffiffiffiiffiffiffi
Datam TEM di (b), tambahkan
panah merah mengindikasikan pergerakan garpu replikasi, dan dengan demikian anak panah merah untuk gelembung ketiga.
mengrndikasikan pula arah keseluruhan replrkasi DNA pada setiap geiembung.

il 'l r i). lr f.rt.rrt ix.l t .r . i'-' ' -:' li lr' l:i-'r. r' li- lli
I l. .t, l: I
i]i,.1,.,, I :trlirL ,,-.:rit i'tl.
. r.it , l.tlr': .{,ir,:ata air,n^i,,tl
' -' ---'-^'i"-'

i:irl (.rri, f,-ill ilil(l:l i llllrli i

({:,.:alarirq.ri !.1 rl al :ii ii I .:r iril

1tt:'lftL lr,.,rir i i; :
r---'.'.-.-
primer RNA

F"r
/\
h Feraga '16.13 Beberapa protein
yang terlibat dalam inisiasi replikasi
DNA. Protein-protein yang sama
berfungsi pada kedua garpu replikasi lF .,,r.at itji.:it ,Ii:t I tilt
dalam gelembung replikasi. Agar mudah, ir i, llr-!llli'i,rlti.t r t; t ;l
rtltr,r i-,ii.\ ittlll i.
hanya satu garpu yang ditunjukkan.

BAB ENAM BELAS Dasar Molekular Pewarisan-Sifat 339

 Untai baru Untai cetakan
Ujung 5' Ujung 3'
ffi
(Pre.
Pirofosfat
,oH
L_-,-_--- \2€)'
Nukleosida
trifosfat Ujunq 5' - Ujung 5'
yang membuka uliran heliks ganda di garpu replikasi,
memisahkan dua untai induk dan menjadikan keduanya
tersedia sebagai untai cetakan. Setelah pemisahan untai
induk, protein pengikatan beruntai-tunggal (single-
strand binding protein) berikatan dengan untai-untal
DNA tak berpasangan dan menstabilkan untai tersebut.
Pembukaan uliran heliks ganda menyebabkan uliran
dan tegangan yang lebih ketat di depan garpu replikasi.
Topoisomerase membantu mengurangi tegangan ini
dengan cara mematahkan, memuntir, dan menggabungkan
kembali untai-untai DNA.
Bagian-bagian untai DNA induk yang terbuka kini
tersedia sebagai cetakan untuk sintesis untai-untai
DNA komplementer baru. Akan tetapi, enzim-enzim
yang menyintesis DNA tidak dapat menginisiasi
sintesis poiinukleotida. Enzim semacam itu hanya
dapat menambahkan nukleotida-nukleotida ke untai
cetakan. Rantai nukleotida awal yang dihasilkan selama
sintesis DNA sebenarnya merupakan bentangan pendek
RNA, bukan DNA. Rantai RNA ini disebut primer
dan disintesis oleh enzim primase (lihat Peraga 16.13).
Primase mengawali rantal RNA dari satu nukleotida
RNA tunggal, menambahkan nukleotida-nukleotida RNA
satu per satu, menggunakan untai DNA induk sebagai
cetakan. Primer yang telah selesai, biasanya sepanjang
5 sampai 10 nukleotida, kemudian berpasangan basa
dengan untai cetakan. Untai DNA baru akan dimulai
dari ujung 3' primer RNA.
Sinfesis Untai DNA Baru
Enzim-enzim yang disebut DNA polimerase (DNA
polymerase) mengkatalisis sintesis DNA baru dengan
cara menambahkan nukleotida-nukleotida ke rantai yang
telah ada sebelumnya. Pada E coli, ada beberapa DNA
polimerase yang berbeda, namun tampaknya ada dua yang
berperan utama dalam replikasi DNA: DNA polimerase
III dan DNA polimerase I. Situasi pada eukariota lebih
34O uNtr T|GA Genetika
"( Peraga 16.14 lnkorporasi suatu
Ujunq 5' Ulung 3' nukleotida ke dalam untai DNA. DNA
polimerase mengkatalisis penambahan
suatu nukleo:ida lrifosfat ke ujung
3' untai DNA yang sedang tumbuh,
dengan pelepasarr dua fosfat.
ffiGunakan diagram ini untuk
menjelaskan apa yang kita maksud
dengan untai DNA yang memiliki
ketera ra h a n (d i reksi o n a I i ta s).
rumit dengan setidaknya 11 DNA polimerase yang
telah ditemukan sejauh ini. Akan tetapi, prinsip-prinsip
umumnya tetap sama.
Sebagian besar DNA polimerase membutuhkan primer
dan untai cetakan DNA, selaln jejeran nukleotida DNA
komplementer. Pada E. col1, DNA polimerase III (disingkat
DNA pol III) menambahkan suatu nukleotida DNA ke
primer DNA dan kemudian meneruskan penambahan
nukleotida DNA, yang komplementer dengan untai
cetakan DNA induk, ke ujung untai baru DNA yang sedang
tumbuh. Laju pemanjangan kira-kira 500 nukleotida per
detik pada bakteri dan 50 per detik pada sel manusia.
Setiap nukleotida yang ditambahkan ke untai DNA
yang sedang tumbuh berasal dari nukleosida trifosfat,
yang merupakan suatu nukleosida (gu1a dan basa) dengan
tiga gugus fosfat. Anda sudah pernah menjumpai molekul
semacam itu-ATP (adenosin trifosfat, lihat Peraga
8.8). Satu-satunya perbedaan antara ATP metabolisme
energi dan dATB nukleosida trifosfat yang memberikan
nukleotida adenin ke DNA, adalah komponen gulanya.
Guia yang digunakan pada balok pembangun DNA berupa
deoksiribosa, sedangkan pada ATP berupa ribosa. Seperti
ATB nukleosida trifosfat yang digunakan untuk sintesis
DNA reaktif secara kimiawi, sebagian karena ekor trifosfat
memiliki gugus muatan negatif yang tak stabil. I(etika
setiap monomer bergabung ke ujung untai DNA yang
sedang tumbuh, dua gugus fosfat hilang sebagai suatu
molekul pirofosfat @-@.. Hidrolisis pirofosfat yang
terjadi setelahnya menjadi dua molekul fosfat anorganik @1
i adalah reaksi eksergonik tergandengkan yang membantu
menggerakkan reaksi polimerisasi (Peraga 16.14).
Pemanjangan Antiparalel
Seperti yang telah kami singgung sebelumnya, kedua
ujung untai DNA berbeda satu sama lain, sehingga setiap
untai memiliki keterarahan (direksionalltas), seperti jalan
satu arah (lihat Peraga i6.5). Selain itu, kedua untai DNA
 Gambaran umum
Titik mula replikasi
Untai lamban
Untai maju
Untai lamban
Arah keseluruhan
repl kasr
r
$ Sete ah primer RNA dibuat,
Titik mula
DNA pol lll mu a menyintesis
Llntat rna
repl ikasi
f
Primer RNA
Jepitan geser'
DNA pol lll
DNA induk
€) untai maju d perpanjang
terus menerus dengan arah
5'-; 3' se ring garpu yang
bergerak ma1u.
A Peraga 16.15 Sintesis untai maju saat replikasi DNA.
Diagram ini berJokus pada garpu replikasi kiri yang ditunjukkan
di kotak gambaran umum. DNA polimerase lll (DNA pol lll),
berbentuk seperti tangan yang dikatupkan, berasosiasi erat dengan
selenis protein yang disebut 'jepitan geser' yang melingkari
untai ganda yang baru disintesis bagaikan donat. Jepitan geser
menggerakan DNA pol lll di sepanjang untai cetakan DNA.
dalam suatu heliks ganda bersifat antiparalel, yang berarti
terorientasi ke arah yang berlawanan, seperti jalan tol
dua arah (lihat Peraga 16.14). ]elaslah, kedua untai baru
yang terbentuk saat replikasi DNA pastilah antiparalel
terhadap untai cetakan.
Bagaimanakah tatanan antiparalel heliks ganda
memengaruhi replikasi? I(arena strukturnya, DNA
polimerase dapat menambahkan nukleotida-nukleotida
hanya ke ujung 3' bebas dari suatu primer atau untai
DNA yang sedang tumbuh, tidak pernah ke ujung 5' (lihat
Peraga 16.14). Dengan demikian, untai DNA baru hanya
dapat memanjang ke arahS'-)3'. Dengan mengingat ini,
marilah kita kaji suatu garpu replikasi (Peraga 16.15).
Di sepanjang salah satu untai cetakan, DNA polimerase
* Sintesis untai maju dan untai lamban terjadi secara bersamaan
dengan laju yang sama. Untai lamban dinamai demikian karena
sintesisnya sedikit tertunda daripada sintesis untai maju. Masing-
masing fragmen baru pada untai lamban tidak bisa dimulai sebelum
ada cukup banyak cetakan yang telah terbuka pada garpu replikasi.
iil dapat menyintesis suatu untai komplementer secara
terus-menerus dengan memperpanjang DNA baru ke
arah wajib 5'-)3'. DNA poi III cukup menempel ke
garpu replikasi di untai cetakan itu dan terus-menerus
menambahkan nukleotida ke untai komplementer baru
seiring majunya garpu replikasi. Untai DNA yang dibuat
melalui mekanisme ini disebut untai maju (leading
strand)*. Hanya satu primer yang dibutuhkan agar DNA
pol III menyintesis untai maju (lihat Peraga i6.15).
Untuk memperpanjang untai baru DNA yang satu
lagi ke arah wajib 5'-+3', DNA pol III harus bekerja
di sepanjang untai cetakan yang satu lagi ke arah yang
menjauhi garpu replikasi. Untai DNA yang memanjang
ke arah ini disebut untai lamban (lagging strand)*.
I(ebalikan dengan untai maju, yang diperpanjang terus-
menerus, untai lamban disintesis secara tersendat-sendat,
sebagai rangkaian dari segmen-segmen. Segmen-segmen
untai lamban ini disebut fragmen Okazaki (Okazaki
fragments), berdasarkan nama ilmuwan Jepang yang
menemukan fragmen-fragmen tersebut. Fragmen Ol<azaki
pada E. coli panjangnya sekitar 1.000 sampai 2.000
nukleotida, sedangkan pada eukariota panjangnya sekitar
100 sampai 200 nukleotida.
Peraga 16.16 mengilustrasikan iangkah-langkah
sintesis untai lamban. Sementara hanya satu primer yang
dibutuhkan untuk untai maju, setiap fragmen Okazaki
pada untai lamban membutuhkan satu primer tersendiri.
Sejenis DNA polimerase lain, DNA polimerase I (DNA
pol I), menggantikan nukleotida RNA primer dengan
nukleotida versi DNA, menambahkan nukleotida satu
demi satu ke ujung 3' fragmen Okazaki yang bersebelahan
(fragmen 2 pada Peraga 16.16). Akan tetapi, DNA
pol I tidak dapat menggabungkan nukleotida terakhir
dari segmen DNA pengganti ini ke nukleotida DNA
pertama pada fragmen Okazaki yang primernya baru
saja digantikan (fragmen 1 pada Peraga 16.16). Sejenis
enzim lain, DNA ligase, menyelesaikan tugas ini,
menggabungkan tulang punggung gula fosfat dari semua
fragmen Okazaki menjadi untai DNA tak terputus.
Feraga 16.17 dan Tabel 16.1, di halaman berikut,
merangl(um replikasi DNA. Pelajari keduanya baik-baik
sebelum melanjutkan membaca.
Kompleks Replikasi DNA
Secara tradisional-dan memudahkan-molekul DNA
polimerase direpresentasikan sebagai lokomotif yang
bergerak di sepanjang'rel'DNA, namun model semacam
itu tidak akurat karena dua alasan penting. Pertama,
berbagai protein yang berpartisipasi dalam replikasi DNA
sebenarnya membentuk satu kompleks besar tunggal,
'mesin replikasi DNA Banyak interaksi protein-protein
yang memfasilitasi efisiensi kompleks ini. Misalnya,
dengan berinteraksi dengan protein-protein lain di
bagian garpu, primase tampaknya bekerja sebagai rem
molekular, memperlambat gerak maju garpu replikasi
dan mengoordinasi laju replikasi pada untai maju dan
untai lamban. I(edua, kompleks replikasi DNA tidak
BAB ENAM BELAS DasarMolekularPewarisan-Sifat 341
 bergerak di sepanjang DNA. Sebagai gantinya, DNA
bergerak melalui kompieks itu selama proses replikasi.
Untai lamban Pada sel eukariot, banyak salinan kompleks itu, barangkali
tergugus menjadi'pabrik-pabrikl mungkin tertambat
ke matriks nukleus, rangka serat yang membentang di
sepanjang interior nukleus. Penelitian-penelitian terbaru
menyokong model berupa dua molekul polimerase DNA,
I Arah keseluruhan
satu pada masing-masing untai, 'menggulung masuk'
reprKasr
ke DNA parental dan mengeluarkan molekul DNA
- anakan yang baru dibuat. Bukti tambahan menunjukkan
@ P, *,,,,.o rrengqabungkarr nuk eot da-
,ro,dD.^.1', lr bahwa untai iamban dilengkungkan mundur melalui
kompleks tersebut, sehingga ketika DNA polimerase
menyelesaikan sintesis fragmen Okazaki dan melepaskan
Untar
cetakan diri, DNA polimerase tidak perlu pergi jauh-jauh untuk
mencapai primer fragmen berikutnya, di dekat garpu
& olL,q pot I menambahkan
rrukleoi da DNA l<e prlmer, replikasi. Peiengkungan mundur dari untai lamban ini
rnembr:ntuk iragnrc.n Okazak 1. memungkinkan lebih banyak fragmen Okazaki yang
ffi
disintesis dalam waktu yang lebih singkat.

Membuka uliran heliks ganda induk

pada garpu replikasi

Protein pengikatan Berikatan dengan dan menstabilkan

beruntai tunggal DNA beruntai ganda hingga dapat
digunakan sebagai cetakan
@ Serejal, fraErren 2 mendrpatkaa
prii-net DNA pol lll rnenarrbahkan Topoisomerase Mengurangi tegangan'pembukaan
rrlr.iaolrd.r ,NA l, nqgd nron(.tpd berlebihan di depan garpu replikasi
g' n,* f ,o gt11 l_!q dll-l
melalui pematahan, pemuntiran, dan
".1:l:lk.l
I
5'
penggabungan kembali untai DNA

Primase Menyintesis Primer RNA di ujung

5'untai maju dan masing-masing
fragmen Okazaki dari untai lamban

DNA pol III Menggunakan DNA induk sebagai

cetakan, menyintesis untai DNA
baru dengan cara menambahkan
nukleotida secara kovalen ke ujung
3'dari untai DNA atau primer RNA
yang telah ada sebelumnya
SDNA lrgase rlenr- @ i.rn'iai lamban cii
bentuk ikataf di ant:rra
Menyingkirkan nukleotida-nukleotida
wilayah lni sekarang
DNA terbaru dan DNA telah selesai. RNA primer dari ujung 5'dan
fraqnren 1. menggantikannya dengan nukleotida- .
---"-\
a--
nukleotida DNA

DNA ligase Menggabungkan ujung 3' dari

DNA yang menggantikan primer
ke bagian lain dari untai maju dan
<- Arah keseluruhan replikasi menggabungkan fragmen-fragmen
Okazaki untai lamban
A Peraga 16.16 Sintesis untai lamban.

342 uNtr ilGA Genetika


S) untu malu disrntesrs
terus-menerus dengan arah
5'+3'oleh DNA pol 1 I
@ vot.ku protein peng katan
unlar-tunqgal menstabrlkan
untar-untai cetakan yang terbuka
@ Hetikase
membuka u ran
heliks ganda
induk.
Primer Prirnase
5',
tJntaian DNA
@ Pri.ut" memula srntesis primer
RNA untuk fraqmen Okazak kelima
--*-- --''
Q) Orun pol lll menyelesa kan s ntesis fragmen
keempat. Saat mencapai primer RNA di fragmen
ketiga, DNA pol lli me epasran diri, bergerak ke
qarpu replikasi, dan menambahkan nuk eotida
DNA ke ujung 3' pr mer fragmen kei ma.
A Peraga 16.17 Rangkuman replikasi DNA bakteri. Diagram terperinci ini menunjukkan satu garpu replikasi, namun
seperti yang diindikasikan oleh gambaran umum (kanan atas), replikasi biasanya terladi secara bersamaan pada dua garpu,
yang masing-masing terletak di satu ujung gelembung replikasi. Jika melihat setiap untai anakan secara keseluruhan dalam
gambaran umum, Anda bisa melihat bahwa setengah untai dibuat secara terus-menerus sebagai untai maju, sedangkan
setengah lagi (di sisi berlawanan dari titik mula replikasi) disintesis sebagai fragmen-fragmen untai lamban.
Pengecekan dan Perbaikan DNA
Akurasi replikasi DNA bukan hanya disebabkan oleh
kespesifikan perpasangan basa. Walaupun kesalahan-
kesalahan dalam molekul DNA yang sudah selesai
hanya sekitar satu daiam 10 miliar nukleotida, kesaiahan
perpasangan awal arltara nukleotida yang baru datang
dan nukleotida pada untai cetakan 100.000 kali lipat
lebih umum-kesaiahan sebanyak satu di antara 100.000
nukleotida. Selama replikasi DNA, DNA polimerase
mengecek (proofread) setiap nukleotida terhadap
cetakannya setelah nukleotida ditambahkan ke untai
yang sedang tumbuh. Saat menemukan nukleotida yang
dipasangkan secara tidak benar, poiimerase menyingkirkan
nukleotida itu dan melanjutkan kembali sintesis. (Tindakan
ini mirip dengan memperbaiki kesalahan pada pengolah
kata menggunakan tombol 'delete' dan kemudian
mengetikkan huruf yang benar.)
Nukleotida yang salah berpasangan kadang menghindari
pengecekan oleh DNA polimerase. Pada perbaikan
kesalahan pasangan (mismatch rep6ir), enzim-enzim
Gambaran umum
Titik mula replikasi
Untai lamban
(
Untai lamban
o"nF;],'l!iin'n*
Untar maju
DNA pol Untai lamban
DNA pol i DNA liqase
./
@ Crun pol I menyinqkrrkan prinrer dari ulLrng 5'
$ lt'ln lrgase mcngrkatkan
fragmen kedua, menggantrkan pnmer denqan ujung 3'fraqrnen kedua ke
nukleotrda DNA yang drlambahkan satu detni satu ulunq 5' lraqmen pertama.
ke ulung 3' fragrren (et g.1. Penqqant an nukieot cj.r
RNA terakh r dengan DNA menghas kan tulanq
punqqung qula fosfat denqan ujunq 3'bebas.
menyingkirkan dan menggantikan nukleotida yang
dipasangan secara salah akibat kesalahan replikasi. Para
peneliti menyoroti nilai penting enzim-enzim semacam
itu saat mereka menemukan bahwa cacat herediter pada
salah satu enzim tersebut berkaitan dengan bentuk
kanker usus besar. Tampaknya, cacat ini memungkinkan
kesaiahan-kesalahan penyebab kanker terakumulasi dalam
DNA dengan laju yang lebih tinggi daripada normal.
Nukleotida yang dipasangkan secara salah atau
berubah juga dapat muncul setelah replikasi. Bahkan,
pemeliharaan informasi genetik yang dikodekan dalam
DNA membutuhkan berbagai macam perbaikan rutin
terhadap kerusakan DNA yang telah ada. Molekul
DNA terus-menerus menghadapi agen-agen kimiawi
dan fisik yang berpotensi membahayakan, seperti yang
akan kita bahas pada Bab 17. Zat-zat kimiawi reaktif (di
lingkungan dan terjadi secara alamiah di dalam sel), emisi
radioaktif, sinar-X, sinar ultraviolet, dan molekul-molekul
tertentu dalam asap rokok dapat mengubah nukleotida
sedemikian rupa sehingga memengaruhi informasi genetik
yang terkodekan. Selain itu, basa DNA kadang-kadang
BAB ENAM BELAS DasarMolekularPewarisan,Sifat 343
mengalami perubahan kimiawi yang spontan dalam
kondisi-kondisi sel yang normal. Akan tetapi, perubahan-
perubahan dalam DNA ini biasanya dikoreksi sebelum
menjadi mutasi yang diperbanyak melalui replikasi
berturut-turut. Setiap sel terus-menerus mengawasi dan
memperbaiki materi genetiknya. I(arena perbaikan DNA
rusak sedemikian penting terhadap kesintasan organisme,
tidak mengejutkan bahwa ada banyak enzim perbaikan
DNA berbeda yang telah dievolusikan. Ada sekitar 100
enzim semacam itu yang sudah diketahui pada E. coli, dan
sejauh ini pada manusia telah diidentifikasi 130 enzim.
Sebagian besar sistem selular untuk memperbaiki
nukleotida yang dipasangkan secara salah, entah itu karena
kerusakan DNA atau kesalahan replikasi, menggunakan
mekanisme yang memanfaatkan struktur perpasangan basa
DNA. Seringkali, segmen suatu untaian yang mengandung
kerusakan dipotong (dieksisi) oleh enzim pemotong
DNA-nuklease (naclease)-dan celah yang terbentuk
diisi oleh nukleotida, dengan menggunakan untai yang
tidak rusak sebagai cetakan. Enzim-enzim yang terlibat
dalam pengisian celah adalah DNA polimerase dan DNA
ligase. Salah satu sistem perbaikan DNA semacam itu
disebut perbaikan dengan pemotongan nulcleotida
(nucleotide excision repair, PeraEa 16.18).
Suatu fungsi penting dari enzim-enzim perbaikan
DNA dalam sel kulit kita adalah memperbaiki kerusakan
genetik akibat sinar ultraviolet dalam sinar matahari'
Salah satu kerusakan semacam itu, ditunjukkan pada
Peraga 16.18, adalah tautan kovalen basa timin yang
bersebelahan pada seuntai DNA. Dimer timin semacam
itu menyebabkan DNA tertekuk dan mengganggu
replikasi DNA. Nilai penting dari perbaikan kerusakan
ini digarisbawahi oleh kelainan bernama xeroderma
pigmentosum, yang sebagian besar disebabkan oleh cacat
turunan pada enzim perbaikan dengan pemotongan
nukleotida. Pengidap kelainan ini hipersensitif terhadap
sinar matahari. Mutasi dalam sel-sel kulit akibat sinar
ultraviolet dibiarkan salah dan menyebabkan kanker kulit.
Replikasi Uiung-ujung MoleFcul DNA
Terlepas dari kemampuan DNA polimerase yang
mengagumkan, ada sebagian kecil DNA sel yang tidak
dapat direplikasi atau diperbaiki oleh DNA polimerase.
Untuk DNA lurus, misalnya DNA kromosom eukariot,
fakta bahwa DNA polimerase hanya dapat menambahkan
nukleotida ke ujung 3' polinukleotida yang sudah ada
sebelumnya menyebabkan masalah. Mekanisme replikasi
yang biasa tidak memberikan cara untuk menyelesaikan
ujung-ujung 5' untai DNA anakan. Meskipun fragmen
Okazaki bisa dimulai dengan primer RNA yang berikatan
dengan bagian paling ujung dari untai cetakan, begitu
dibuang, primer tidak dapat digantikan oieh DNA karena
tidak ada ujung 3' yang tersedia untuk penambahan
nukleotida (Peraga 16.19). Akibatnya, putaran demi
putaran replikasi yang berulang-ulang menghasilkan
344 uNlT TIGA Genetika
; $ inz rr rL-rklease inernoiong
urrtar DNA yang rusak dt dua
trtik, dan baqian yano i-usak
$ Siirtes s perbarkan cleh
polil.erase DNA meng si
klcc ticia-n u kleotrcia
n u
yanq h lanq.
DNA.ligase
; S n;,q r r.Jd(r marveqer
\* J ulung
r rrrfl bebas Il\tA baru
herras DNA o-rrr
I
[. ;il t;"i.,,n.,,"t,."r
Iuntai menladi riuh
A Peraga 16.18 Perbaikan terhadap kerusakan DNA dengan
pemotongan nukleotida. Sekelompok enzim mendeteksi dan
memperbaiki DNA yang rusak. Peraga ini menunjukkan DNA yang
mengandung dimer timin, tipe kerusakan yang sering disebabkan
oleh radiasi ultraviolet. Sejenis enzim nuklease memotong wilayah
DNA yang rusak, dan DNA polimerase (pada bakteri, DNA pol l)
menggantikan wilayah itu dengan nukleotida yang komplementer
dengan untai yang tidak rusak. DNA ligase menuntaskan proses
tersebut dengan menutup patahan yang tersisa di tulang
punggung gula-fosfat.
molekul-moiekul DNA yang semakin pendek dengan
ujung tak rata ('somplak').
Pemendekan DNA tidak terjadi pada sebagian besar
prokariota karena DNA prokariot berbentuk melingkar,
sehingga tidak memiliki ujung. Namun, apa yang mencegah
gen-gen eukariot terkikis habis meskipun replikasi
DNA terjadi berulang-ulang? Ternyata molekul DNA
kromosom eukariot memiliki sekuens nukleotida khusus
yang disebut telomer (telomere) di bagian ujung (Peraga
15.20). Telomer tidak mengandung gen. Sebagai gantinya,
DNA umumnya mengandung banyak pengulangan satu
sekuens nukleotida pendek. Pada setiap telomer manusia,
misalnya, sekuens enam nukleotida TTAGGG diulang-
ulang sebanyak 100 sampai 1.000 kali. DNA telomer
melindungi gen-gen organisme. Selain itu, protein spesifik
yang terkait dengan DNA telomer mencegah ujung
somplak dari molekul anakan mengaktivasi sistem-sistem
sei untuk mengawasi kerusakan DNA. (Ujung somplak
molekul DNA, yang sering disebabkan oleh patahan untai
ganda, dapat memicu jalur-jalur transduksi sinyal yang
menyebabkan penghentian siklus sel atau kematian sel.)
 UJUng untat
DNA nduk

,ilt

l;tll; Fragmen terakhrr Fraqmen sebelumnya

t\
Primer RNA
Untai lamban

Untai induk
Pembuangan primer dan & Peraga 16.20 Telomer. Eukariota memiliki sekuens repetitif
Pr frer drbuanq namtlr) penggantian dengan DNA bukan pengode, disebut telomer, di ujung-ujung DNA. Telomer
t dak bisa digantikan jika ujung 3' tersedia diwarnai jingga dalam kromosom-kromosom mencit ini (LM).
dengan DNlA karena
l. dak acla u unq 3' unluk

i:cl mcrase DNA (telomerase) mengkatalisis pemanjangan telomer dalam

3',
:*ru;n::r
f sebagian besar sel somatik manusia, namun aktivitasnya
Untai maju baru
Untai lamban baru
Puta ra n-putara n
replikasi berikutnya
Molekul anakan yang
semakin pendek
a Peraga 16.19 Pemendekan ujung-ujung molekul DNA
linear. bi sini kita mengikuti salah satu ujung untai molekul DNA
melalui dua putaran replikasi. Setelah putaran pertama, untai
lamban yang baru lebih pendek daripada cetakannya. Setelah
putaran kedua, untai maju maupun lamban telah menjadi lebih
pendek daripada awal DNA induk. Walaupun tidak ditunjukkan
di sini, ujung-ujung lain dari molekul DNA ini juga menjadi lebih
pendek.
Teiomer tidak mencegah pemendekan molekul DNA
akibat putaran demi putaran replikasi, melainkan hanya
menunda pengikisan gen di dekat ujung-ujung molekul
DNA. Seperti yang ditunjukkan pada Peraga 16.19, telomer
menjadi semakin pendek setiap kali replikasi terjadi' Seperti
yang bisa kita duga, DNA telomer memang cenderung
semal(in pendek pada sel-sel somatik yang membelah dari
individu yang berusia tua dan dalam sel-sel kultur yang
telah membelah berkali-kali. Ilmuwan telah mengajukan
bahwa pemendekan telomer terkait dengan proses penuaan
jaringan-jaringan tertentu dan bahkan terkait dengan
penuaan organisme secara keseiuruhan.
Bagaimana dengan sel-sel yang genomnya harus tetap
tak berubah dari organisme ke keturunannya selama
beberapa generasi? Jika kromosom-kromosom dari sel-
sel nutfah (yang menghasilkan gamet) semakin pendek
dalam setiap siklus sel, gen-gen yang esensial akhirnya
akan hilang dari gamet yang dihasilkan. Akan tetapi,
hal ini tidak terjadi. Sejenis enzim bernama telomerase
sel-sel nutfah eukariot, sehingga mengembalikan panjang
awal dan mengompensasi pemendekan yang terjadi
selama replikasi DNA. Teiomerase tidak aktif pada
daiam se1 nutfah menghasilkan telomer dengan panjang
maksimum pada zlgot.
Pemendekan normal telomer mungkin melindungi
organisme dari kanker dengan cara membatasi jumlah
pembelahan yang bisa dialami oleh sel somatik. Sel-sel dari
tumor besar seringkali memiliki telomer yang pendeknya
tak biasa, seperti yang bisa diduga dari sel-sel yang telah
mengalami banyak pembelahan sel. Pemendekan lebih
lanjut mungkin menyebabkan penghancuran diri sel
tumor. Para peneliti ternyata telah menemukan aktivitas
telomerase dalam sel-sel somatik yang menjadi kanker.
Hal tersebut menunjukkan bahwa kemampuan aktivitas
enzim tersebut tampaknya menstabilkan panjang telomer
sehingga sel-se1 kanker bisa terus membelah. Banyak sel
kanker tampaknya mampu membelah tanpa terbatas,
seperti pada gaiur imortal sel-sel kultur (lihat Bab 12). Jika
telomerase ternyata memang faktor penting pada banyak
kanker, mungkin telomerase dapat menjadi target yang
berguna untuk diagnosis maupun kemoterapi kanker.
Sejauh ini, Anda telah mempelajari tentang struktur
dan replikasi molekul DNA. Di bagian berikut, kita akan
mengulas bagaimana DNA dikemas menjadi kromosom,
struktur yang mengandung informasi genetik'
ffir6"2
1. Peran apa yang dipegang oleh perpasangan basa
komplementer dalam rePlikasi DNA?
2. Identifikasikan dua fungsi utama DNA pol III dalam
replikasi DNA.
3. m lika DNA pol ldalam suatu sel
tidak fungsional, apa pengaruhnya pada sintesis DNA
maju? Dalam kotak gambaran umum pada Peraga
16.17, tunjukkan di mana DNA pol I normalnya
berfungsi pada untai maiu sebelah atas.
lihat I
Untuk mengetahui jawaban yang dianjurkan, t
Apendiks A.
* I

BAB ENAM BELAS Dasar Molekular Pewarisan-Sifat 345

serangkaian diagram dan mikrograf elektron transmisi ini menggambarkan model
terbaru tentang tingkat progresif pengumparan dan penggulungan DNA. Ilustrasi
diawali dari satu molekul tunggal DNA, diperbesar hingga menjadi kromosom
metafase, yang cukup besar untuk dilihat dengan mikroskop cahaya.

Heliks ganda DNA

r' +4 i ,i .;t'j .
:*lYqr.g.
(berdiameter 2 nm)
"*dk.-*
. "'.*bf,-.
: ,s;s"
,\ \ ;
I H1

II
I
1':

i ;,i
Di sini ditunjukkan model pita Protein yang disebut histon bertanggung
DNA, dengan setiap pita yang jawab atas tingkat pertama pengemasan
merepresentasikan satu tulang punggung DNA dalam kromatin. Walaupun setiap
histon kecil-rnengandung sekitar 100
gula fosfat. Seperti yang bisa Anda
ingat dari Peraga 16.7, gugus-gugus asam amino-massa total histon dalam
fosfat di sepanjang tulang punggung kromatin kira-kira setara dengan massa
DNA. Lebih dari seperlima asam amino
menyumbangkan muatan negatif di
histon bermuatan positif (iisin atau
sepanjang sisi luar setiap untai. TEM
arginin) dan berikatan erat dengan DNA
menunjukkan molekul DNA telanjang.
yang bermuatan negatif.
Heliks ganda itu sendiri lebarnya 2 nm.
Ada empat tipe histon yang paling
umum dalam kromatin: H2A', H2B,
H3, dan H4. I(eempatnya sangat mirip
pada eukariota. Misalnya, hampir semua
l<ecuali dua asam amino pada H4 sapl
identik dengan pada H4 ercis. Pelestarian
gen-gen histon saat evolusi mungkin
mencerminkan peran penting histon
dalam mengorganisasi DNA dalam se1.
I(eempat tipe utama histon sangat
penting untuk tingkat pengemasan DNA
berikutnya. (Tlpe histon kelima, Hl,
terlibat dalam pengemasan tahap lanjut.)
ffi'
Pada mikrograf elektron, kromatin yang
tak menggulung berdiameter 10 nm
(serat 10 nm). I{romattn itu menyerupai
manik-manik yang dironce (lihat TEM).
Setiap'manik-manik' merupakan
nukleosom, unit dasar pengemasan DNA.
'Benang' di antara manik-manik disebut
DNA penaut (linker DNA).
Nukleosom terdiri atas DNA yang
melilit dua kali di sekeliling inti protein
yang terdiri atas dua molekul, masing-
masing dari empat tlpe histon. Ujung
amino (N-terminus) setiap histon (e/<or
histon) menjulur keluar dari nukleosom.
Pada siklus sel, histon meninggalkan
DNA hanya sejenak saat replikasi.
Umumnya, histon melakukan hal yang
sama saat ekspresi gen, proses lain
yang membutuhkan akses ke DNA oleh
mekanisme molekular sel. Bab 18 akan
membahas beberapa temuan terbaru
tentang peran ekor histon dan nukleosom
dalam regulasi ekspresi gen.

HHiilAg;:#F,, :Ei:*# $ ffi"ffi yang terdiri atas suatu molekul DNA lurus yang
I
berasosiasi dengan banyak protein. Pada E. coil, DNA
i .tuirclrs"g#sellitr t*s"die $ ata:+ s*,eatut kromosom terdiri dari sekitar 4,6 jula pasangan basa,
r-1:c.l$*${#-c $ E} ruA,i,r,,sETF-; # c E'rff r$;is merepresentasikan 4.400 gen. Ini 100 kali lebih banyak
[t qr q.
$$a {'e3 * -, $ffi *3 ft q:$
L- c" 3.ta rt g} H'q: -ttr f r, B
daripada DNA dalam virus pada umumnya, namun hanya
ada sekitar seperseribu jumlah DNA dalam sel somatik
manusia. Tetap saja, bakteri memiliki banyak DNA untuk
I(omponen utama genom pada sebagian besar bakteri dikemas dalam wadah sekecil itu.
adalah suatu molekul DNA melingkar beruntai ganda Jika direntangkan, DNA sel E. coli panjangnya sekitar
yang berasosiasi dengan beberapa kecil protein. Walaupun satu milimeter, 500 kali lebih panjang daripada sel bakteri
kita menyebut struktur int kromosom bakteri, namun tersebut. Akan tetapi, pada bakteri, protein-protein
perbedaannya sangat jauh dari kromosom eukariot, tertentu dapat menyebabkan kromosom mengumpar dan

346 uNlr flGA Genetika

 Kromatid (700 nm)
, ,/l

Serat 30 nm

";;9;

Perancah

Serat 300 nm

(1.400 nm)

4 Serat 3O nr"n 5 Dar"nais* fuenksg$#k, 6 $. i"i.iE'}3+i,: ;JI'i'E t:': ::?1.iiif i+!::tr

Tingkat pengemasan berikutnya
disebabkan oleh interaksi antara ekor-
ekor histon salah satu nukleosom
dan DNA penaut serta nukleosom di
sisi lain. Histon kelima, H1, terlibat
dalam tingkat ini. Interaksi-interaksi
ini menyebabkan serat 10 nm yang
membentang menjadi terkumpar atau
tergulung, membentuk serat kromatin
setebal kira-kira 30 nm, serat 30 nm.
Walaupun serat 30 nm cukup banyak
terdapat dalam nukleus interfase, tatanan
pengemasan nukleosom dalam bentuk
kromatin ini masih diperdebatkan.
{serat 3S{i nsrc}
Serat 30 nm sendiri membentuk
kelokan-kelokan yang disebut domain
berkelok (looped domain) yang melekat
ke perancah kromosom dari protein,
sehingga membentuk serat 300 nm.
Perancah kaya akan salah satu tipe
topoisomerase, dan tampaknya terdapat
pula molekul H1.
Dalam kromosom mitotik, domain
berkelok mengumpar dan menggulung
lagi dengan cara yang belum sepenuhnya
dimengerti, sehingga kromatin makin
dipadatkan, membentuk kromosom
metafase khas yang ditunfukkan oleh
mikrograf di atas. Lebar satu kromatid
adalah 700 nm. Gen tertentu selalu
terdapat di tempat yang sama dalam
kromosom metafase, mengindikasikan
bahwa langkahJangkah pengemasan
sangat spesifik dan tepat.

'super-mengumpar] mengemas kromosom rapat-rapat
sehingga hanya mengisi setengah sel. Tidak seperti nukleus
sel eukariot, wilayah dalam bakteri yang berdensitas DNA
tinggi ini, disebut nukleoid (nucleoid), tidak terselubung
oleh membran (lihat Peraga 6.6).
Masing-masing kromosom eukariot mengandung
satu heliks ganda DNA linear yang, pada manusia,
jumlahnya kira-kira 1,5 x 108 pasangan nukleotida. Jumlah
ini relatif lebih banyak daripada panjang kromosom
yang terkondensasi. |ika sepenuhnya direntangkan, satu
molekul DNA tersebut panjangnya dapat mencapai 4
cm, ribuan kali dibandingkan dengan diameter nukleus
sel-belum lagi memperhitungkan DNA dari ke-45
kromosom lain pada manusia!
Di dalam sel, DNA eukariot berpasangan secara tepat
dengan banyak protein. I(ompleks DNA dan protein
ini, disebut kromatin (chromatin), bisa muat di dalam
nukleus berkat sistem multitingkat pengernasan DNA
yang rumit. Pandangan kita saat ini tentang urut-urutan
tingkat pengemasan DNA dalam krornosom dituangkan
dalam Per**a 15.3i. Pelajari Peraga ini baik-baik sebelum
membaca lebih lanjut.
IQomatin mengalami perubahan derajat pengemasan
secara besar-besaran selama siklus sel (lihat Peraga 12.6).

BAB ENAM BELAS DasarMolekularPewarisan-Sifat 347

Apa peran fosforilasi histon dalam perilaku kromosom saat meiosis?

FER{Otsl{Alrl i Terry Orr-Weaver dan para koleganya di Massachusetts Institute of Technology memutasi lalat buah dan
mencari mutasi yang menyebabkan sterilitas. Mereka menalar bahwa mutasi semacam itu dapat ditemukan dalam gen-gen
yang mengodekin protein yang berperan penting dalam meiosis. Mereka menemukan suatu mutasi dalam gen nhk-1 yang
menyebabkan sterilitas pada Drosophila betina. Mereka mengetahui bahwa produk gen tersebut, nucleosomal histone kinase-1 ,
atau NHK-i, merupakan enzim yang memfosforilasi suatu asam amino spesifik di ekor histon H2A. Mereka mengajukan hipotesis
bahwa sterilitas disebabkan oleh meiosis yang tidak berhasi{ akibat perilaku kromosom abnormal ketika enzim ini tidak berfungsi
dengan benar.
Untuk menguji hipotesis ini, mereka mengamati perilaku kromosom secara dekat selama meiosis dalam sel-sel ovarium lalat
normal dan muian. Pada salah satu percobaan, mereka menggunakan pewarna fluoresen merah untuk menandai letak DNA dan
pewarna fluoresen hijau untuk menandai letak protein kondensin, yang normalnya menyelubungi kromosom pada pengujung
profase i dan membantu kondensasi struktur tersebut.

, Pada pengujung profase I dalam sel-sel ovarium

fiA$ii'i,r'. ",j' Kondensin dan Garis tepi Kondensin DNA (merah
lalat normal, kondensin dan DNA sama-sama terlokalisasi di suatu DNA (kuninq) nukleus (hijau) di bagian tepi)
wilayah yang sangat kecil dalam nukleus (kiri bawah, warna kuning
merupakan akibat dari pewarna hilau dan merah yang berada
pada tempat yang sama). Akan tetapi, pada lalat mutan' kondensin
tersebar luas di seluruh nukleus sedangkan DNA terbatas di tepi-
tepi nukleus (kanan bawah; warna merah DNA sangat samar). Hasil
ini menunjukkan bahwa kondensin tampaknya tidak menyelubungi
kromosom dalam sel-sel lalat mutan dan, dengan demikian,
kromosom Lidak berkondensasi.

XE$lMp$!4*: Karena proses ini dan proses-proses lainnya selama

meiosis tidak terlaksana secara tuntas saat histon ktnase NHK-1
tidak berfungsi dengan benar, para peneliti menyimpulkan bahwa Nukleus sel normal Nukleus sel mutan
fosforilasi spesifik dari histon H2,A dibutuhkan untuk perilaku normal
kromosom saat meiosis.

. ggMggnl.:.r,,r,; l. tvanovska, T. Khandan, T. lto, and lL. Orr-WeaveL A histone code in meiosisl the histone kinase, NHK-I, is required for proper
chromosomal architecture in Drosophila oocytes, Genes and Development 19:2511-2582 (2005)

*ffi
ffiAnggap|ahSeorangpene|itimenemukanseekorla|atmutandenganekorhistonH2Ayangtidakmemj|iki
am;;ipeiiiiI yang blasanya difosforilasi oleh histon kinase NHK-'l . Bagaimanakah mutasi ini mungkin memengaruhi
perilaku kromosom saat meiosis dalam sel-sel ovarium?

Dalam sel-sel interfase yang diwarnai untuk mikroskopi
cahaya, kromatin biasanya tampak sebagai massa gelap
yang tersebar dalam nukleus, yang menunjukkan bahwa
kromatin tampaknya sangat terurai. I(etika sel bersiap-siap
untuk mitosis, kromatinnya mengumpar dan menggulung
(berkondensasi), akhirnya membentuk kromosom metafase
yang pendek dan tebal dalam jumlah yang l&as, yang dapat
dibedakan satu sama lain dengan mikroskop cahaya.
W'alaupun umumnya lebih tak terkondensasi
daripada kromatin kromosom mitotik, kromatin interfase
menunjuld(an beberapa tingkat pengemasan ordo tinggi
yang sama. Beberapa kromatin yang menyusun suatu
kromosom tampaknya terdapat sebagai serat 10 nm,
namun banyak yang terpadatkan menjadi serat 30 nm,
yang di beberapa wilayah menggulung lagi menjadi domain
berkelok. W'aiaupun kromosom interfase tidak memiliki
perancah yang jelas, domain berkeloknya tampaknya
melekat ke lamina nuldeus, di sebelah dalam selaput nukleus,
mungkin juga ke serat-serat matriks nukleus. Pelekatan
ini mungkin membantu mengorganisasi wilayah-wilayah
kromatin tempat gen-gen aktif. i(romatin dari masing-
masing kromosom menempati wilayah terbatas yang spesifik
di dalam nukleus interfase, dan serat-serat kromatin dari
kromosom-kromosom yang berbeda tidak saling membelit.
Bahkan saat interfase, sentromer dan telomer
kromosom, serta wilayah-wilayah kromosomal lain
dalam beberapa sel, terdapat dalam kondisi yang sangat
terkondensasi, mirip dengan yang terlihat pada kromosom
metafase. Tipe kromatin interfase ini, terlihat sebagai
gumpalan-gumpalan tak teratur dengan mikroskop
cahaya, disebut heterokromatin (heterochromatin),
untuk membe dakannya dari eukrom atin (euchr omatin,
'kromatin sejati') yang tidak begitu terpadatkan dan lebih
tersebar. I(arena terpadatkan, DNA heterokromatin tidak
bisa diakses oleh mekanisme sel yang bertanggung jawab
untuk mengekspresikan (memanfaatkan) informasi genetik
yang dikodekan dalam DNA. Sebaiiknya, pengemasan
eukromatin yang lebih longgar menjadikan DNA-nya
dapat diakses untuk mekanisme ini, sehingga gen-gen
yang terdapat dalam eukromatin dapat diekspresikan.

348 uNlr ilGA Genetika

 I(romosom merupakan struktur dinamik yang
terkondensasi, melonggar, termodifikasi, dan dimodel
ulang sesuai keperluan untuk berbagai proses sel, termasuk
mitosis, meiosis, dan aktivitas gen. Jalur,jalur yang
meregulasi transformasi ini kini sedang menjadi fokus
penelitian yang giat dilakukan oleh para peneliti. Telah
dipahami bahwa histon bukanlah sekadar kelosan (spools)
pasif yang dililiti oleh DNA. Sebagai gantinya, histon
dapat mengalami modifikasi kimiawi yang menyebabkan
perubahan organisasi kromatin. Terry Orr-Weaver, ilmuwan
yang diwawancarai di awal unit ini, telah lama tertarik pada
mekanisme molekular dari dinamika kromosom selama
mitosis dan meiosis. Dengan menggunakan pendekatan
genetik terhadap Drosophila, Orr-'Weaver dan para
koleganya menunjukkan bahwa fosforilasi asam amino
tertentu pada ekor histon memainkan peranan penting
dalam perilaku kromosom saat profase I meiosis (Peraga
'!6.22'). Fosforilasi dan berbagai modifikasi kimiawi lain
dari histon juga memiliki banyak efek pada aktivitas gen,
seperti yang akan Anda lihat pada Bab 18.
Dalam bab ini, Anda telah mempelajari bagaimana
molekul DNA ditata dalam kromosom dan bagaimana
replikasi DNA menyediakan salinan gen yang diwariskan
oleh induk ke anaknya. Akan tetapi, tak cukup hanya
menyalin dan mewariskan gen; informasi yang dibawa
oleh gen harus digunakan oleh sel. Dengan kata lain,
gen-gen harus diekspresikanl Pada bab berikutnya, kita
akan mengulas bagaimana sel menerjemahkan informasi
genetik yang dikodekan dalam DNA.
ffi16.3
1. Deskripsikan struktur nukleosom, unit dasar
pengemasan DNA dalam sel-sel eukariot.
2. Apa dua sifat yang membedakan heterokromatin dari
eukromatin?
3. ffi Walaupun protein-protein yang
menyebabkan kromosom E. coli mengttmpar bukaniah
histon, kesamaan sifat apa yang Anda harapkan
dimiliki oleh protein-protein tersebuI dengan histon,
mengingat kemampuan mereka untuk berikatan
dengan DNA?
Untuk mengetahui jawaban yang dianjurkan, lihat I
Apendiks A. I

ffi;i rr'E'rrr Kunjungi study Area di wwwmasteringbio'com IJrI;r]il

q*r untuk memperoleh Animasi 3D Bioflix, Tutorial MP3, Video, ,{litivitas The Hershey-Chase Experiment
Soal Latihan, eBook, dan banyak lagi. Aktivitae DNA and RNA Structure
-Aktivi.t*s DNA Double Helix

ffiffiffiffi'!6.2
ffiw'16.'l Banyak protein bekerja sama dalam replikasi dan
DNA adalah rnateri genetik (hal. 330*336) perbaikan DNA (hal. 336-345)

Percobaan-percobaan dengan bakteri dan fag menyediakan Percobaan Meselson-Stahl menunjukkan bahwa replikasi
bukti kuat pertama bahwa materi genetik adalah DNA. DNA bersifat semikonservatif: molekul induk membuka,
F A,ternbangun Modei Struktur Dht"A; Peneff#arl dan setiap untai kemudian berperan sebagai cetakan untuk
lfmfair Watson dan Crick menyimpulkan bahwa DNA sintesis untai baru berdasarkan aturan perpasangan basa.
merupakan heliks ganda. Dua rantai gula fosfat antiparalel > Rep!!!<asi DFJI\: Penganratar [e$g& f]e&af
mengulir di sekeliling bagian luar molekul tersebut. Basa-
basa bernitrogen menjulur ke bagian interior, tempat
ikatan-hidrogen membentuk pasangan-pasangan basa yang
spesifik, A dengan I G dengan C.

DNA pol lll memulai sintesis

DNA pada ujung 3' primer,
Basa bernitrogen
berlanjut dengan arah 5'+3'
Tulang punggung
gula fosfat

BAB ENAM BELAS Dasar Molekular Pewarisan-Sifat 349

 dua generasi lagi (dua putaran replikasi DNA). DNA
mengecek kesalahan pada DNA baru, menggantikan yang diekstraksi dari sel-sel ini disentrifugasi. Distribusi
nukleotida-nukleotida yang salah. Pada perbaikan densitas DNA macam apa yang Anda harapkan dari
percobaan ini?
kesalahan-pemasangan, enzim-enzim membetulkan
kesalahan yang masih ada. Perbaikan dengan pemotongan a. satu pita berdensitas tinggi dan satu pita berdensitas
nukleotida adalah proses umum berupa pemotongan dan rendah.
penggantian bagian DNA yang rusak oleh berbagai enzim. b. satu pita berdensitas menengah.
c. satu pita berdensitas tinggi dan satu pita berdensitas
menengah.
DNA kromosom eukariot semakin pendek setiap kali
putaran replikasi. I(eberadaan telomer, sekuens berulang d. satu pita berdensitas rendah dan satu pita berdensitas
di ujung-ujung molekul DNA linear, menunda pengikisan menengah.
gen. Telomerase mengkatalisis pemanjangan telomer pada e. satu pita berdensitas rendah.
sel-sel nutfah. J. Seorang ahli biokimiawi mengisolasi dan memurnikan

rolilrr molekul-molekul DNA yang dibutuhkan untuk replikasi

DNA. I(etika ia menambahkan beberapa DNA, replikasi
Aktivitas DNA Replication: An Overview terjadi, namun setiap molekul DNA terdiri atas seuntai
lnvestigasi What Is the Correct Model for DNA Replication? normal yang berpasangan dengan banyak segmen DNA
Aktivitas DNA Replication: A Closer Look sepanjang beberapa ratus nukleotida. Apa yang mungkin
Aktivitas DNA Replication: A Review ia lupakan saat membuat campuran tersebut?
a. DNA polimerase.
rre[s 16.3 b.
c.
DNa ligase.
nukleotida.
Kromosom terdiri atas suatu molekul DNA yang d. fragmen Okazaki.
dikemas bersama-sama protein (hal. 346-3a9) e. primase.

Apa dasar perbedaan cara sintesis untai maju dan untai

melingkar disertai beberapa protein terkait. I(romatin
lamban molekul DNA?
eukariot yang menyusun suatu kromosom sebagian besar
tersusun atas DNA dan protein histon. Histon berikatan
a. Titik mula replikasi terjadi hanya di ujung 5'.
satu sama lain dan berikatan dengan DNA membentuk b. Helikase dan protein pengikatan beruntai-tunggal
nukleosom, unit paling dasar dari pengemasan DNA. Ekor hanya bekerja pada ujung 5'.
histon menjulur keluar dari setiap inti nukleosom yang c. DNA polimerase dapat menggabungkan nukleotida
seperti manik-manik. Penggulungan tambahan akhirnya baru hanya ke ujung 3' dari untai yang sedang
membentuk kromatin yang amat terkondensasi dari tumbuh.
kromosom metafase. Pada sel-sel interfase, sebagian besar d. DNA ligase bekerja hanya dengan arah 3'--> 5'.
kromatin tidak terlalu terpadatkan (eukaromatin), namun e. Polimerase hanya bisa bekerja pada satu untai dalam
sebagian tetap sangat terkondensasi (heterokromatin). satu waktu.
Modifikasi histon mungkin memengaruhi kondisi
kondensasi kromatin. 5. Dalam menganalisis l'umlah basa-basa berbeda dalam
sampel DNA, hasil manakah yang konsisten dengan
EET aturan perpasangan basa?
Aktivitas DNA Packing a. A=G
b. A+G=C+T
c. A+T=G+T
d. A=C
e. G=T
r.(gls_llArtgl!! 6. Pemanjangan untai maju selama sintesis DNA
a. maju menjauhi garpu replikasi.
l. Dalam penelitiannya tentang bakteri penyebab
b. terjadi dengan arah 3'-> 5'.
pneumonia dan mencit, Griffith menemukan bahwa
c. menghasilkan fragmen-fragmen Okazaki.
a. selubung protein dari sel-sel patogenik mamPu d. bergantung pada kerja DNA polimerase.
mentransformasi sel-sel nonpatogenik.
b. sel-sel patogenik yang dipanaskan sampai mati e. tidak memerlukan untai cetakan.
menyebabkan pneumonia. 7. Hilangnya gugus amino secara spontan dari adenin
c. suatu zat dari sel-sel patogenik ditransfer ke sel-sel menghasilkan hipoxantin, basa yang tal< umum, di
nonpatogenik sehingga menjadi patogenik. seberang timin dalam DNA. I(ombinasi molekul mana
d. selubung polisakarida bakteri menyebabkan yang dapat memperbaiki kerusakan semacam itu?
pneumonia. a. nuklease, DNA polimerase, DNA ligase.
e. bakteriofage menyuntikkan DNA ke dalam bakteri. b. telomerase, primase, DNA polimerase.
, Sel-sel E coli
yang ditumbuhkan pada medium
15N c. telomerase, helikase, protein pengikatan beruntai
ditransfer ke medium laN dan dibiarkan tumbuh selama tunggal.

350 UNIT TIGA Genetika

 d. DN,{ ligase, protein garpu replikasi, adenilil siklase. P€*SH!.'TNAEq g*RNIAH
e. Nuklease, telomerase, primase.

8. Dalam nukleosom, DNA melilit mengelilingi

a. molekul polimerase.
b. ribosom.
c. histon.
d. dimer timin.
e. DNA satelit.

Untuk mengetahui iawaban,Kuis Mand.iri, lihat Apend.iks A.

10. ffi Pembuatan model bisa merupakan
EEIII Kunjungi Study Area di www.masteringbio.com bagian penting dari proses ilmiah. Ilustrasi di atas
untuk memperoleh Soal Latihan. merupakan model buatan komputer dari suatu kompleks
replikasi DNA. Untai DNA induk dan yang baru
!t v P" _t{ ry
g 4s' _q
y gt Ltst disintesis diberi warna berbeda, demikian pula dengan
masing-masing dari ketiga protein ini: DNA pol III,
9. Beberapa bakteri mungkin mampu menanggapi stres jepitan geser, dan protein pengikatan beruntai tunggal.
lingkungan dengan cara meningkatkan laju kejadian Gunakan pengetahuan yang Anda pelajari dari bab ini
mutasi saat pembelahan sel. Bagaimana hal ini bisa untuk memperjelas modei ini dengan melabeli setiap
dilakukan? Mungkinkah ada keuntungan evolusioner dari untai DNA dan setiap protein serta menunjukkan arah
kemampuan ini? Jelaskan. keseluruhan replikasi DNA.

BAB ENAM BELAS DasarMolekularPewarisan-Sifat 351