A.

Mencari sekuen gen (Gen Insulin, INS)

1. Kunjungi situs (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) pada lokasi pencarian.

2. Setelah masuk kedalam halaman NCBI. Pada menu “search’’ ganti “All
database” menjadi “Nukleutida” kemudian ketik Insulin (INS) klik “search”.

3. Dari hasil pencarian, muncul berbagai pilihan urutan gen pengkode INS
4. Pilih dua Sekuen (accession number) gen INS dengan cara scroll ke bawah, klik.
 5. Hasil gen INS di tentukan ukuran gennya dalam satuan pasang basa (pb). Pada
gen Insulin homo sapien pada mRNA varian 1 memiliki 465 pasang basa.

6. Untuk memperoleh sekuen gen dalam notepad. Ubah sekuen dalam format
FASTA dengan cara KLIK link FASTA, send to > File > Format Fasta > Create
File > Save

B. Nucleutida blast (Blastn) -> align one, two ore more sequence
1. Ketik (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) pada halaman pencarian. Klik BLAST

2. Tampil beberapa pilihan pensejajaran, pilih nucleutide BLAST, klik.

3. Masukkan masing-masing urutan gen dalam format FASTA ke kolom dengan
cara copy paste urutan gen yang telah di cari. Ketika ingin membandingkan
dua urutan gen maka centang pada kolom align two or more sequence.

4. Masukkan urutan gen INS pada kolom, kolom pertama sebagai pembanding
dan kolom kedua sebagai sampel gen yang akan di analisis.
5. Tekan “BLAST” -> tunggu hingga proses selesai -> analisis
Dari hasil membandingkan gen di atas dapat dilihat bahwa, gen tersebut memiliki kesamaan
urutan nukleutida dari nomor urut pasang basa 40 (Pembanding) dan 66 pb (sampel) hingga
465 pb (pembanding) dan 491 (sampel)

C. Protein blast (Blastp) -> align one, two or more sequence

1. Mencari urutan asam amino / protein dalam masing masing gane Insulin. Sama seperti
mencari gen Insulin, lalu di save untuk urutan asam aminonya.
2. Ketik Ketik (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) pada halaman pencarian. Klik BLAST.

3. Tampil beberapa pensejajaran, pilih Protein BLAST, Klik.

4. Masukkan masing-masing urutan asam amino yang telah di cari, masukkan ke dalam
kolom dengan cara copy paste urutan asam amino.
5. Tekan “BLAST” -> tunggu hingga proses selesai -> analisis