Tugas Praktikum Bioteknologi

BANK DATA NCBI : Nukleotida Blast

Nama Kelompok:
1. Nur Lailatunnisfi (A03227208)
2. Priscilla Sherly Ayu S (A03227209)
3. Riska Istikomah (A03227210)
1. Ketik(http://www.ncbi.nlm.nih.gov) pada
lokasi pencarian lalu klik
2. Muncul tampilan seperti ini
3. Ubah all databases menjadi nucleotide
4. Kemudian ketik nama gen yang ingin di cari
contoh: mitofusin(MFN2) lalu klik search.
5.Berikut hasil pencarian dan muncul berbagai
urutan gen pengkode mitofusin(MFN2)
6. Pilih urutan gen pengkode mitofusin
manusia(Homo sapiens) dengan cara discroll
kebawah
7. Berikut Hasil pencarian urutangen
pengkode mitofusin manusia(Homo sapiens)
8. Klik FASTA untuk memperoleh sekuen
nukleotida dari mitofusin dalam bentuk FASTA
9. Berikut hasil pencarian urutan gen dalam
bentuk FASTA
Homo sapiens mitofusin 2 (MFN2), transcript variant 1, mRNA

NCBI Reference Sequence: NM_014874.4

GenBank Graphics

>NM_014874.4 Homo sapiens mitofusin 2 (MFN2), transcript variant 1, mRNA

GTAGTGAGTGTGATGGCCGCCGCGAGGCCGGGAAGGTGAAGTCAGGACTGGTGGAGTCAACACAGTCAATCAATAGCCAACCTCAACCTGAGACAGGACAGAAGAGAACTCAGAATCTTTTTGTCTTTTGGACTTCAGCCATGTCCATGATGCCTACCCTGTGA
AGATCTCTCACCATCCAAAAAACGCAATGTCCCTGCTCTTCTCTCGATGCAACTCTATCGTCACAGTCAAGAAAAATAAGAGACACATGGCTGAGGTGAATGCATCCCCACTTAAGCACTTTGTCACTGCCAAGAAGAAGATCAATGGCATTTTTGAGCAGCTGGG
GGCCTACATCCAGGAGAGCGCCACCTTCCTTGAAGACACGTACAGGAATGCAGAACTGGACCCCGTTACCACAGAAGAACAGGTTCTGGACGTCAAAGGTTACCTATCCAAAGTGAGAGGCATCAGTGAGGTGCTGGCTCGGAGGCACATGAAAGTGGCTTTT
TTTGGCCGGACGAGCAATGGGAAGAGCACCGTGATCAATGCCATGCTCTGGGACAAAGTTCTGCCCTCTGGGATTGGCCACACCACCAATTGCTTCCTGCGGGTAGAGGGCACAGATGGCCATGAGGCCTTTCTCCTTACCGAGGGCTCAGAGGAAAAGAGGA
GTGCCAAGACTGTGAACCAGCTGGCCCATGCCCTCCACCAGGACAAGCAGCTCCATGCCGGCAGCCTAGTGAGTGTGATGTGGCCCAACTCTAAGTGCCCACTTCTGAAGGATGACCTCGTTTTGATGGACAGCCCTGGTATTGATGTCACCACAGAGCTGGACA
GCTGGATTGACAAGTTTTGTCTGGATGCTGATGTGTTTGTGCTGGTGGCCAACTCAGAGTCCACCCTGATGCAGACGGAAAAGCACTTCTTCCACAAGGTGAGTGAGCGTCTCTCCCGGCCAAACATCTTCATCCTGAACAACCGCTGGGATGCATCTGCCTCAGA
GCCCGAGTACATGGAGGAGGTGCGGCGGCAGCACATGGAGCGTTGTACCAGCTTCCTGGTGGATGAGCTGGGCGTGGTGGATCGATCCCAGGCCGGGGACCGCATCTTCTTTGTGTCTGCTAAGGAGGTGCTCAACGCCAGGATTCAGAAAGCCCAGGGCAT
GCCTGAAGGAGGGGGCGCTCTCGCAGAAGGCTTTCAAGTGAGGATGTTTGAGTTTCAGAATTTTGAGAGGAGATTTGAGGAGTGCATCTCCCAGTCTGCAGTGAAGACCAAGTTTGAGCAGCACACGGTCCGGGCCAAGCAGATTGCAGAGGCGGTTCGACTC
ATCATGGACTCCCTGCACATGGCGGCTCGGGAGCAGCAGGTTTACTGCGAGGAAATGCGTGAAGAGCGGCAAGACCGACTGAAATTTATTGACAAACAGCTGGAGCTCTTGGCTCAAGACTATAAGCTGCGAATTAAGCAGATTACGGAGGAAGTGGAGAGG
CAGGTGTCGACTGCAATGGCCGAGGAGATCAGGCGCCTCTCTGTACTGGTGGACGATTACCAGATGGACTTCCACCCTTCTCCAGTAGTCCTCAAGGTTTATAAGAATGAGCTGCACCGCCACATAGAGGAAGGACTGGGTCGAAACATGTCTGACCGCTGCTCC
ACGGCCATCACCAACTCCCTGCAGACCATGCAGCAGGACATGATAGATGGCTTGAAACCCCTCCTTCCTGTGTCTGTGCGGAGTCAGATAGACATGCTGGTCCCACGCCAGTGCTTCTCCCTCAACTATGACCTAAACTGTGACAAGCTGTGTGCTGACTTCCAGG
AAGACATTGAGTTCCATTTCTCTCTCGGATGGACCATGCTGGTGAATAGGTTCCTGGGCCCCAAGAACAGCCGTCGGGCCTTGATGGGCTACAATGACCAGGTCCAGCGTCCCATCCCTCTGACGCCAGCCAACCCCAGCATGCCCCCACTGCCACAGGGCTCGCT
CACCCAGGAGGAGTTCATGGTTTCCATGGTTACCGGCCTGGCCTCCTTGACATCCAGGACCTCCATGGGCATTCTTGTTGTTGGAGGAGTGGTGTGGAAGGCAGTGGGCTGGCGGCTCATTGCCCTCTCCTTTGGGCTCTATGGCCTCCTCTACGTCTATGAGCGT
CTGACCTGGACCACCAAGGCCAAGGAGAGGGCCTTCAAGCGCCAGTTTGTGGAGCATGCCAGCGAGAAGCTGCAGCTTGTCATCAGCTACACTGGCTCCAACTGCAGCCACCAAGTCCAGCAGGAACTGTCTGGGACCTTTGCTCATCTGTGTCAGCAAGTTGA
CGTCACCCGGGAGAACCTGGAGCAGGAAATTGCCGCCATGAACAAGAAAATTGAGGTTCTTGACTCACTTCAGAGCAAAGCAAAGCTGCTCAGGAATAAAGCCGGTTGGTTGGACAGTGAGCTCAACATGTTCACACACCAGTACCTGCAGCCCAGCAGATAG
TGGGCACCTGAGGCGGAGTCTGCGTGGAGAGGGGCGGTGCTGCCAGCCCTAAGTGCCATGTGGGCTCCCCCAGGGGCACGTGTGGCTCCTGCCCCCTGGCCACTGCCAAGAGAATGAAGCACCCAGTCTCGTACCATTTTGAGCCCTCCAGCACTACTTATTTTC
CCCCACCTTTGCCTGCTGTTGCTGGAAGAGCTGGCTCATACCCCCAAAGGACACTTTCAGCGACAGCTATGGACAGCATGGTACCAAGGAGTTAAGTTGAGGCTTTTTCCAGCTTTCTCTGGTTCATTTGATTGCTTGATAAGGCCTCAGGATCTCAGCATTGCACA
ATGCCTCATGGAAGCCTTTGAGGGTATCACACAGACACCCCCACCTTCCTCCAGCCTGTGCGCACCTGCCCTCCTTGCAGCCCAGCACACCTGCAGGTGTAAGGGACGATTGGAGTTTCTTCCCAGAGAGTCTGTCCCAGAAGGACTGTGGCTTGTGTGTGTCCAT
CTCGCCTGTTGGCTCAGTGCTTCATCCCATTTGCAGAGCCTCAGACACGTCTTGGTGGTGAGGCTCAGTTACCCCTGGGCTTAGGCTGAGGCGGGCCCTGTGCTGGGGGTGGTAGAAAGGATGCTGCTGAGGCAGCTGGAGGAGTGGGAGTAGCTCAGAGGGG
AGGGCTGTTGGATGTATGGGGAGCTGGCAGAGCAGGTGGCAGTCACTGGGACAAGGAGGGACTTGCCTCTCTTCTCATTATTGTGTCCTTTGCTTTAGTGTCAGTCCTGGACTTGTGCAGGCCTGTTTTGTGTAGATCTGTTTTGGAAGATGGCATGGTCTAGGT
GGTTGAAGGATGTAGTAGAAGGATGGATGGTGGAAGGTGGGGACGTTGGTGGCTGGCTGAGGTGCATGGGCCCCACACAGGACAGCTGGAGAATGGGCCGTCCACTTGGCCTCGTTCTGCGAGGGGCTCATGGGTCTGAGAGCCCCCACCCACTAGGCTTGA
TTGCATCCCTGTTGTGCCCTTTAAGAGACATGTTTCCACCCCACCCCCAACCTTGTCCCAAGTGCCCTGGACTAAATTTCCTGTGCCAGTGACTGCAGTTGGCCAAGGGACAATGTGGAAAACCCAGTGTCCATCTTTCCACCCTCCCTGATCTCCAGAACCTTCGAC
TGACCCCCTTGTCTTTATGCTGATGTTGAGTTTTGGGATTGTTACTGGTTGAAGTGGGGGCAGATGCCTGTCACCAAGGTGTTGACTGTGTGAGAAAAGCAGTTTGGGTGACAAATCCTGTGTGGCACAAGTTGGATCGCTTCCTAGAAATAAGCAACACCTCTCC
CAAAAAGCAGCCCACAAGGCAGGGGCCCAGCAGCCCAGCCATCACTCATCTTTGAGGAAATGAGTTGGTAGCCTCTGTGCACTGTTTGGTGGCCACATCACAGGTGATGTCCTGTTCACATACCTGCTTGTATTTAAAGCCCTCAGTCTGTCCTGTTGTGTGGGGC
GAAGTGATGGACTCTGCCAGGTGGACATGCTGTGGGTGGATGTTCCCGGCGTGTGCCGGGCCTGAATGGACAGGGGCCACTTCACAGCATGTCAGGGAAAATCACTGTCACACAATTCCAATGGATTTTGTGCTCTTTTTGAAAAAAAAAAATTCTTTAGCGTAA
ACATGAATTTTTTTTCAATGTAGCCCCTGGGGAATGAATGAAATTTTGAGCTTCTTCAATACGTAAAATTAAATTTATACCACTGAGGGAGAGACCCTTTCTGAAAGAAGTATGGCCAAAAGCACTTTAATGCTGCTGACATTGTTGTTTTTATGTTCATTTGCTGG
AGCGCAAGACGTGCTGACACAGTGAGTTTTCTCTGATGTATTTAAGGTGATGTATTTGCTTGAGTTACTCCTGTATCATTGCTCATAATATTGGAAACTAAAATAAAACCTAGTTGGAAATCC
10. Kembali ke urutan gen pengkode mitofusin
dan klik fasta no. 31 sebagai pembanding
 11. Berikut hasil pencarian urutan gen dalam
bentuk FASTA
Mus musculus mitofusin 2 (Mfn2), transcript variant 6, mRNA

NCBI Reference Sequence: NM_001355590.1

GenBank Graphics

>NM_001355590.1 Mus musculus mitofusin 2 (Mfn2), transcript variant 6, mRNA

GAAGGTGAGAGGGCGAGCGCGCCGGGGTGGTGGAACCGGCAGGCCCGGGCCGGGAGAGTCCTGAGCCACCCGGCTTAGGACGCTGGGCCTCTGGGGCCTCTGGGCCTCGGGCTCAGGCTCGGGTCACACGGGCGTTTCCCCTGCTGCGGCCTCG
CCGTCAAGCCCTGCTCGGCTCTGAGGAGGGGGCGGGCCACCGGACTGAAGGCTGGGAGGTGGGCTCCTCCTCGCAGCTCCCCACACCCTGATGTCTCAGCCCTGTGATCTCCATTCAAGAAGCTTGGACAGGTGGAGTCAACACCATCAGGGGCCAA
CCTGGACCTGAATCAGCACAGAGGAGACCTCGAGTCCTTTTCATCTTTCTGACTCCAGCCATGTCCACGATGCCCAACCTGTGAAGGTCTCTTACCAGCTAGAAACGAGATGTCCCTGCTCTTTTCTCGATGCAACTCCATCGTCACCGTCAAGAAGGAT
AAGCGACACATGGCTGAAGTGAATGCTTCCCCTCTCAAGCACTTTGTCACTGCCAAGAAAAAGATCAATGGAATCTTTGAGCAGCTGGGGGCCTACATCCAAGAGAGCGCCAGCTTCCTTGAAGACACCCACAGGAACACAGAACTGGACCCGGTTA
CCACGGAAGAGCAGGTCCTGGACGTCAAAGGGTACCTGTCCAAGGTCAGGGGTATCAGCGAAGTGCTGGCCAGGCGGCACATGAAGGTGGCTTTTTTTGGCCGGACGAGCAATGGGAAGAGCACCGTGATCAATGCCATGCTCTGGGACAAAGTTC
TGCCATCTGGGATTGGTCATACCACCAATTGCTTCCTGCGGGTTGGGGGCACAGATGGCCATGAGGCCTTCCTCCTCACAGAGGGCTCAGAAGAGAAGAAGAGTGTCAAGACTGTGAACCAACTGGCCCATGCCCTCCATCAGGACGAGCAGTTGCA
TGCAGGCAGCATGGTGAGTGTGATGTGGCCCAACTCCAAGTGTCCGCTCCTGAAGGATGACCTCGTGCTGATGGACAGCCCTGGGATCGATGTTACCACGGAGCTGGACAGCTGGATTGATAAGTTTTGCCTGGATGCTGATGTGTTTGTGCTGGTG
GCCAACTCAGAGTCCACGCTGATGCAGACGGAGAAGCAGTTCTTCCACAAAGTGAGTGAACGTCTCTCCCGGCCCAACATCTTCATCCTGAACAACCGCTGGGATGCGTCTGCCTCGGAGCCTGAGTACATGGAGGAGGTGCGGCGGCAGCACATGG
AGCGCTGCACCAGCTTTCTGGTGGATGAGCTGGGCGTGGTGGATCGAGCTCAGGCTGGGGACCGGATCTTCTTCGTGTCTGCCAAGGAGGTTCTCAGCGCCAGGGTCCAGAAAGCCCAGGGCATGCCAGAAGGAGGCGGCGCTCTCGCAGAAGGT
TTTCAAGTGAGGATGTTTGAGTTTCAGAATTTCGAGAGGCAGTTTGAGGAGTGCATTTCCCAGTCTGCAGTAAAGACCAAATTTGAGCAGCACACAGTCCGGGCCAAGCAGATTGCAGAGGCCGTTCGTCTCATCATGGATTCCCTGCACATCGCAGC
TCAGGAGCAGCGGGTTTATTGCCTAGAAATGCGGGAAGAGCGGCAAGACCGGCTGAGGTTTATTGACAAGCAGCTGGAGCTCCTGGCTCAAGACTACAAGCTGCGAATTAAGCAGATTACGGAGGAAGTGGAAAGGCAGGTGTCCACAGCCATGG
CTGAAGAGATCAGGCGCCTCTCTGTGCTAGTTGACGAGTACCAGATGGACTTCCACCCATCCCCAGTTGTCCTCAAGGTTTATAAGAACGAGCTGCACCGCCATATAGAGGAAGGTCTGGGCCGGAACCTGTCTGACCGCTGCTCCACTGCCATTGCC
AGTTCACTGCAGACTATGCAGCAGGACATGATAGACGGCTTGAAGCCCCTTCTTCCTGTATCTATGCGGAATCAGATAGACATGCTGGTCCCTCGACAGTGTTTCTCCCTCAGCTATGACCTGAATTGTGACAAGCTGTGTGCTGACTTTCAGGAGGAC
ATCGAGTTCCACTTCTCCCTTGGATGGACTATGCTAGTGAACAGGTTCCTGGGCCCCAAGAATAGCCGCCGGGCCTTGCTAGGCTACAGTGATCAGGTTCAGCGTCCTCTCCCTCTGACACCTGCCAACCCCAGCATGCCCCCCTTGCCACAGAGCTCC
CTCACCCAGGAGGAGCTCATGGTCTCCATGGTTACTGGCCTGGCCTCTCTGACGTCTAGGACCTCCATGGGCATTCTTGTGGTCGGAGGAGTGGTGTGGAAGGCAGTGGGCTGGAGACTCATCGCCCTCTCCTTTGGACTGTATGGCCTCCTGTACGT
CTATGAGCGACTGACCTGGACCACCAAAGCCAAAGAGAGGGCCTTCAAGCGCCAGTTTGTGGAATACGCCAGTGAGAAGCTACAGCTCATCATCAGTTACACCGGCTCTAACTGCAGCCACCAAGTCCAGCAGGAATTGTCTGGGACATTTGCTCATC
TGTGCCAGCAAGTTGACATCACCCGAGATAATCTGGAGCAGGAAATTGCTGCCATGAACAAGAAAGTCGAGGCTCTGGATTCACTTCAGAGCAGAGCCAAACTGCTCAGGAATAAAGCTGGCTGGTTGGACAGCGAACTCAACATGTTCACACACCA
GTACCTGCAGCCCAGCAGATAGTGGGCAGCCAGGGCGGACCTGCACGAAGAAGAGGCAGGGCCGCACCTCCCATCAGCTCTAGTCCTTGGCCGCTGCAGAGAGAAGGAAAGCACCCAGTCTTGTACCAGTTACTCCCTACCCCCTGCAGGAAGACC
CCTGGCTCATACCCTAATGGAGACCAACAAGGACTGGACAGCTCGGCTCCAAGGAGTTATGCATGTGTCTGTGTCTGCTCCTCACGCTCACCCGGTTGAAAGTCACTGTGCATTTGATAAAGTTTTCCTCAGAATGGCACCCTGCAGAATGACTGATGG
GCGCCTTCACAGGCATCAGGCAGCCACTCCTACTTTCTCCAGCCTGAGCACACCTACAGAGAGACAGTGTTGGGGGTGACAGGATGCCCCAGAAAAATTCAGGATACTTCTGAAATTGCCATGTTTGTCTCAGAACTTGTATCTTGCGTTTGGCCCTCA
GCTTTAGCACTTTTTCCCACTTGCAGAGTCTTTCAGTTGTGCTTGGTAGCCAGGCTCAACACACCGGGGCTTTAGACTCAAGCAGCTTATATGGGAAGCTGGAGACCCCTGCCAGCCAGAGCACAGTAAGGGCTCGGAGAAGGTATGTGAACTAGGGT
ATCTGATGTGGTAGTGCAGTTGGTGTCTGGCATTGTGACGACAAGGGACTTGCCTCCCTTCTTGCCACTGAGGCCCTTGCTTTTCCTTCAGCTCTTGGCCTGTTGGTCCGGTTTATTAGTGAGAGCTAGTTTGCTCCAGGTGGTTAAAGGATGTAGCAG
GAGGAATGGTGGAAGATGGGAGCTGCCCGGGTTAGTACAGAAGAGGTCTGTCTATCTGACCTAGCACTGAGGGGTTCACAAACCTGTGAGGTGCACCTCACTAATTTTGGCTCATCCCTGCCTTGCTACAAGCTCCCTGTGGCCACCATTCTCTGGAC
TGTACCGTGCTGATGACTGCAGCTGGCTACAAAACAGCATGAGAACCTGGCCGCTGTTCTCCTACTGCCTCCACCCTCAGGCAGGCCTCCTCCTCTTCTGCCCCTGAAGCCTCCTGCTGCTTGCTCCTCCTGCCTCCACCCTCAGGCAGGCCTCCTCCTCT
TCTGCCCCTGAAGCCTCCTGCTGCTGCTCCTCCACCTCAGTCAGTGCTGAACTTCTCACTGTTGAGTGTTGAAATTGTTAATGGTCAAAGCAGGGAGGATGCCAGTCACCAAGGTTGATTGTCTTGGGAAAGCAGTTTTAGAGTGATGAATCCTTTGTA
GGACAGGTAGAGAGTATCTTAGAGATAAAAAAATGGGCTATGTCCTCTCCTGCCCATGTCTTGTGCTCACTCGCCCCTCAGTCTACCCTTTTTGCTGGGACAGTGATGGTCTTGGCCAAGGTCAGCATGTAATGGAAAGACAGTGTATTGCCAGGCTGG
ATAGATGGGGTCATCTCACAGTGGGTCACGTGAAAATCAGTGTCACGTAGTCCCAGTGAATGTTGTGTTCTTTCTGGGGGGAGGGGGGAATAGAATAAACTCAAATTCTTTTTCAGTATAGCCCCTGAGTAATGAATGAAAATTTGAGCTTATGTAAG
TAAAGATTCATTTATGCCACCAGGGAGAGCCTGTATCTGAGAGACATTTAGCAGAGAGCACTTTAGTTTTTTGCTGCTAACTGTTGTGTGATCCTTTGCTGGGGTGCAAAAGGCACCGGACACAGTGTGTTTGCTTCTGGTATATTTAGGTGATGCATCC
GCCTGGGTTACCTGTATCTCTGCTGATCATATTGGAAACTAAAATAAAGCCCCATTTGTGACCCTGTGTGAGCTCTCTG
12. Kembali ke menu awal dan klik BLAST
yang berada di pilihan sebelah kanan
13. Klik menu nucleotide blast
14. Copy paste urutan gen pada fasta kedalam
kolom dan tulis job title sesuai dengan nama gen
15. Klik menu BLAST
16. Berikut adalah hasil Analisa blast gen
MFN2
Description
Graphic Summary
17. Kembali klik menu nucleotide blast dan
masukkan fasta urutan gen dan fasta urutan gen
pembanding
18. Klik menu BLAST
19. Berikut adalah hasil Analisa blast gen
MFN2 dan pembandingnya
Description
Graphic Summary