LANGKAH – LANGKAH

MENCARI GEN DARI

GENBANK NCBI

FANABILA PUTRI BHAYANGKARI //

27216707A
Ketik (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) pada lokasi
pencarian
Klik bagian All Database kemudian pilih
Nucleotide
ketik Adrenalin, kemudian klik search
Hasil pencarian, muncul berbagai pilihan urutan
gen pengkode Adrenalin
Pilih urutan gen pengkode adrenalin dengan cara di
scroll kebawah, kemudian klik berurutan
Hasil pencarian urutan gen pengkode Adrenalin
Kemudian scroll kebawah untuk melihat hasil
penomoran dan ukuran gen dari adrenalin
Klik FASTA untuk memperoleh sekuen nukleotida
dari adrenalin dalam bentuk FASTA
Berikut adalah hasil pencarian urutan gen dalam
bentuk FASTA
Mengubah sekuen yang didapat menjadi format
FASTA dengan cara klik send to>File>Format
Fasta>Create file
Diperoleh sekuen gen dalam notepad, kemudian
“save”
 LANGKAH – LANGKAH
MEMBANDINGKAN DATA
YANG KITA PEROLEH
DENGAN DATABASE
Mencari data lain pada nucleotide ‘adrenalin’
sebagai data pembanding
Kemudian scroll kebawah untuk melihat hasil
penomoran dan ukuran gen dari adrenalin
Klik FASTA untuk memperoleh sekuen nukleotida
dari adrenalin dalam bentuk FASTA
Berikut adalah hasil pencarian urutan gen dalam
bentuk FASTA
Mengubah sekuen yang didapat menjadi format
FASTA dengan cara klik send to>File>Format
Fasta>Create file
Diperoleh sekuen gen dalam notepad, kemudian
“save”
Kemudian Kembali ke menu awal untuk memulai
BLAST
Scroll ke bawah untuk klik Nucleotide Blast
 Setelah itu masukkan data pertama dengan data
pembanding yang kita cari untuk dilakukan BLAST
Untuk melakukan perbandingan data, jangan lupa
untuk klik ‘Align two or more sequences’
 Setelah itu scroll kebawah, pastikan program selection
dicentang ‘Highly similar sequences (megablast)’, kemudian
klik BLAST
Hasil Descriptions
Hasil Graphic Summary
Hasil Allignments
 Kesimpulan

Antara data nucleotide adrenaline synthetic

construct dengan data nucleotide mus muculus
(house mouse) memiliki kemiripan 100%
TERIMA KASIH