 METABOLISME
 TUJUAN INSTRUKTIONAL
UMUM (TIU)
 Setelah mempelajari mata
kuliah ini mahasiswa dapat
menjelaskan konsep
pencernaan, bioenergetika,
metabolisme biomolekul dan
regulasinya.
 TUJUAN INSTRUKTIONAL
KHUSUS (TIK)
 Setelah menyelesaikan mata
kuliah ini diharapkan
mahasiswa dapat menjelaskan
tentang metabolisme yang
meliputi klasifikasi, koenzim,
regulasi dan tempat
berlangsungnya metabolisme
 METABOLISME
SUB POKOK BAHASAN
1. Pengertian umum metabolisme
2. Klasifikasi organisme
3. Reaksi – reaksi kimia dalam
metabolisme
4. Koenzim dalam metabolisme
5. Klasifikasi metabolisme
6. Regulasi metabolisme
7. Tempat metabolisme
 METABOLISME
 Metabolisme ▬▬► reaksi-reaksi
kimia yang terjadi dalam organisme
 Perbedaan metabolisme dipelajari
melalui pembagian jenis makhluk
hidup
• Autotrop/kemoautotrop
▬▬►organisme yang
menggunakan sumber C dari
CO2
• Heterotrop ▬▬►bentuk
kehidupan yang memperoleh
energi dari mencernakan sumber
C kompleks
 Metabolisme mempunyai ribuan
tahapan reaksi yang dikontrol secara
enzimatik
 SEL AUTOTROP DAN
HETEROTROP
Sel Autotrop
 Prokariot : bakteri fotosintetik (alga
biru hijau, mengandung pigmen
fotosintetik didalam membran sel)
 Eukariot : sel tumbuhan dan alga
(mengandung pigmen kloroplas, dalam
keadaan tanpa cahaya, sel ini menjadi
heterotrop
Sel Heterotrop
 Prokariot : bakteri non fotosintetik
(contoh: rickettsiae dan mikoplasma)
 Eukariot : manusia dan hewan
 SIKLUS CO2 DAN O2 ANTARA SEL
AUTOTROP DAN HETEROTROP
 JALUR METABOLISME
 Metabolisme intermediet
▬▬►produk dari satu tahap reaksi
sering menjadi reaktan untuk tahap
selanjutnya
 Jalur metabolisme ▬▬►serangkaian
reaksi spesifik
 Linier ▬▬►glikolisis
 Bercabang ▬▬►biosintesis
asam amino
 Siklik ▬▬►siklus asam sitrat
 Spiral ▬▬►degradasi asam
lemak
 JALUR METABOLISME
 Contoh jalur metabolisme: a) Linier
b)Siklik c)Spiral
 CARA METABOLISME
MENGHASILKAN ENERGI
 REAKSI-REAKSI KIMIA DALAM
METABOLISME
 Oksidasi – reduksi
 Transfer gugus
 Hidrolisis
 Pemotongan non hidrolitik
 Isomerisasi dan pengaturan kembali
(rearrangement)
 Reaksi pembentukan ikatan
menggunakan energi dari ATP
 REAKSI OKSIDASI REDUKSI
 Reaksi oksidasi reduksi ▬▬► reaksi
yang paling umum terjadi dalam
metabolisme
 Reaksi oksidasi reduksi mempunyai
ciri-ciri:
• Mengandung 2 molekul reaktan
• Dapat diidentifikasi melalui
transfer atom H
• Enzim yang terlibat dalam
reaksi ini ▬▬►
oksidoreduktase
(dehidrogenase)
 REAKSI OKSIDASI REDUKSI
 Kapan sebuah atom atau gugus
dioksidasi? beberapa spesies yang lain
harus menerima elektron
 Banyak reaksi di couple oleh pasangan
koenzim
 NAD+ / NADH
 NADP+ / NADPH
 FAD / FADH2
 KOENZIM NAD+ / NADH
 Digunakan dalam reaksi redoks
 Turunan dari ADP dan vitamin
nikotinamida
 Sisi reaksi terletak pada bagian
nikotinamida dari NAD+
 NAD+ ▬▬►bentuk teroksidasi
 NADH ▬▬►bentuk tereduksi
 STRUKTUR NAD+ / NADH
 Reaksi yang melibatkan NADH
 NADH is produced from NAD+ in
reactions such as conversion
of acetaldehyde to ethanol by alcohol
dehydrogenase. NADH is converted
back to NAD+ by donating electrons
(such as in the conversion
of pyruvateto lactate) or by depositing
electrons into the electron
transport system.
 NADH
NADH carries electrons to the electron
transport system inside the
mitochondrion via a shuttle system .
Electrons that enter via the shuttle
in bypass complex I of the electron
transport system, whereas electrons
that enter via the shuttle in  enter at
complex I.
 STRUKTUR NADPH
 NADPH
 NADPH is an electron carrier.
 The molecule exists in two forms that
vary in whether or not they are
carrying electrons.
  NADPH is the reduced form the of the
molecule (has electrons). 
 NADP+ is the oxidized form of the
same molecule (lacks electrons).
 NADPH is produced in cells primarily
by reactions in the pentose phosphate
pathway. In plants, photosynthesis is
another source of NADPH.
 In contrast to the related
compound, NADH, which donates
electrons to the electron
transport system for energy
generation, NADPH donates electrons
to biosynthetic reactions, such as the
one below, catalyzed by ribonucleotide
reductase:
 CDP + NADPH <=> dCDP + NADP+
 KOENZIM FAD (FLAVIN ADENIN
DINUKLEOTIDA)
 Pembawa elektron lain yang
digunakan dalam metabolisme
▬▬►substratnya beda dengan NAD+
 FAD ▬▬►transfer 2 elektron
 Flavin Adenine Dinucleotide (FAD)
 FAD is an important acceptor of
electrons.
  FAD is the oxidized form of the
molecule (lacks electrons).
  FADH2 is the reduced form (carries
electrons).
 FAD and FADH2 function in many
oxidation reactions, such as those
catalyzed by succinate
dehydrogenase and fatty acyl-CoA
dehydrogenase.
 Electrons carried by FADH2 do not
pass through complex I of the
mitochondrial electron
transport system and thus do not result
in synthesis of as
many ATPs in oxidative
phosphorylation as electrons
from NADH, which do pass through
Complex I.
 It is estimated that each pair of
electrons donated by FADH2 results in
two ATPs, whereas each pair of
electrons from NADH results in three
ATPs.
 STRUKTUR FAD
 CONTOH REAKSI FAD
 FAD sering digunakan dalam reaksi
▬▬► -CH2- CH2- dioksidasi
menjadi ikatan ganda
 Flavin Mononucleotide (FMN)
 FMN, also known as riboflavin
phosphate, is a flavin containing
electron carrier in the cell.
 It participates in oxidation/reduction
reactions and, like FAD, differs from
the nicotinamide coenzymes
(NAD+ and  NADP+) in being able to
accept electrons either singly or in
pairs NAD+ and NADP+ can only
accept electrons in pairs.
 Oxidation and reduction reactions
involving flavin coenzymes.
 TRANSFER GUGUS
 Reaksi yang berfungsi memindahkan
gugus kimia ▬▬►ada dua jenis:
 Intermolekular ▬▬►transfer
dari satu molekul ke molekul
lain
 Intramolekular
▬▬►pemindahan satu tempat
ke tempat lain dalam satu
molekul
Fosfat ▬▬► gugus penting
yang ditransfer dalam reaksi
metabolisme
 TRANSFER GUGUS ASIL
 Koenzim A (CoASH) akan
membentuk ikatan tioester pada gugus
asil ▬▬►lebih aktif
 STRUKTUR KOENZIM A
 CaASH
 The coenzyme is derived metabolically
from ATP, the vitamin pantothenic
acid, and -mercaptoethylamine
 REAKSI HIDROLISIS
 Air digunakan untuk memisahkan
suatu molekul menjadi dua molekul
yang lain
 Jenis- jenis ikatan yang dapat
dipisahkan:
 Ikatan ester ▬▬►lemak
 Ikatan amida ▬▬►protein
 Ikatan glikosidik
▬▬►karbohidrat
 REAKSI HIDROLISIS
KARBOHIDRAT
 REAKSI HIDROLISIS PROTEIN
 HIDROLISIS LEMAK
 PEMOTONGAN NON HIDROLITIK
 Reaksi pemotongan tanpa
menggunakan air
 Enzim yang berperan dalam reaksi ini
liase
Contoh reaksi pemotongan non
hidrolitik
 ISOMERISASI DAN PENGATURAN
KEMBALI
 Reaksinya meliputi dua jenis
transformasi kimia
 Pergantian atom hidrogen
intermolekular pada lokasi
ikatan ganda
Contohnya : isomerisasi aldosa
– ketosa
 Pengaturan kembali
intramolekular gugus fungsi,
namun hal ini jarang terjadi
 REAKSI PEMBENTUKAN IKATAN
 Reaksi pembentukan ikatan biokimia,
semuanya memerlukan energi
Contoh reaksinya:
 EKSPERIMEN METABOLISME
 Untuk memahami jalur metabolisme,
masing-masing tahap harus diketahui
secara detail
 Karakterisasi masing-masing
enzim dan koenzim
 Identifikasi jalur kimia, meliputi
substrat, intermediat, produk
dan tipe-tipe reaksi
 Identifikasi molekul dan kondisi
yang meregulasi kecepatan
seluruh jalur metabolisme
 EKSPERIMEN METABOLISME
 Organisme keseluruhan
▬▬►menggunakan pelacak isotop
(radioaktif) dan diukur produk yang
terlabel
 Jaringan dan sel ▬▬►metode ini
telah dapat mempelajari jalur
metabolisme yang selama ini belum
terungkapkan ▬▬►siklus asam sitrat
dipelajari menggunakan pendekatan ini
 Ekstrak bebas sel ▬▬►sel
dihomogenisasi dalam bufer untuk
membebaskan komponen sel yang
akan dipelajari
 METABOLISME SECARA UMUM
(Gbr 12.2. Biochem, Mathew)
 METABOLISME SECARA
SINGKAT (Gbr 12.1. Biochem,
Mathew)
 KLASIFIKASI METABOLISME
 Katabolisme ▬▬►jalur degradasi
(penguraian)
▬▬►produksi energi
Molekul organik kompleks didegradasi
menjadi molekul yang lebih kecil
 Anabolisme ▬▬►jalur konstruksi
(biosintesis) ▬▬►memerlukan
energi
Biosintesis senyawa organik yang
lebih kompleks
 HUBUNGAN ENERGI ANTARA
LINTAS KATABOLIK DAN
ANABOLIK
 TIGA TAHAP KATABOLISME
 Pemecahan makromolekul menjadi
senyawa unit pembangun (building
block) ▬▬►tidak ada energi yang
berguna
 Oksidasi produk tahap 1 menjadi
asetil KoA ▬▬►menghasilkan
energi yang terbatas
 Oksidasi asetil KoA menjadi CO2,
H2O dan energi
 SKEMA KATABOLISME
 PROSES KATABOLISME
 ENERGI HASIL METABOLISME
 Metabolisme 1 mol glukosa
menghasilkan 32 ATP
 REGULASI METABOLISME
 Melalui kerja enzim alosterik
▬▬►penghambatan kembali atau
penghambatan produk akhir
 Pengaturan hormon ▬▬►hormon
melakukan rangsangan atau hambatan
aktivitas metabolik spesifik
 Pengaturan sintesis enzim
▬▬►menghidupkan atau mematikan
biosintesis enzim ▬▬► induksi
enzim
 REGULASI ENZIM ALOSTERIK
 Dua jenis regulasi enzim alosterik
▬▬►
 Mekanisme biasa
 Aktivasi feedforward
 REGULASI HORMON (Gbr 13.16
Lehninger)
 REGULASI INDUKSI ENZIM (Gbr
13.17 Lehninger)
 SEL DAN MITOKONDRIA
 TEMPAT METABOLISME
 Sitosol ▬▬► glikolisis,
glukoneogenesis, aktivasi asam amino
dan sintesis asam lemak
 Mitokondria ▬▬► siklus asam sitrat,
transport elektron dan fosforilasi
oksidatif, oksidasi asam lemak dan
katabolisme asam amino
 Ribosom ▬▬► sintesis protein
 Retikulum endoplasma ▬▬► sintesis
lipid
 Badan mikro ▬▬► siklus glioksilat
(pada tumbuhan)
 METABOLISME
 KESIMPULAN
 Metabolisme ▬▬►Reaksi – reaksi
kimia dalam organisme
 Klasifikasi organisme ▬▬►
autotrop dan heterotrop
 Koenzim dalam metabolisme
▬▬►NAD+/NADH, FAD/FADH2
dan koenzim A
 Klasifikasi metabolisme
▬▬►anabolisme dan katabolisme
 Regulasi metabolisme ▬▬►enzim
alosterik, pengaturan hormon dan
induksi enzim
 Tempat metabolisme ▬▬►sitosol:
glikolisis, mitokondria: siklus asam
sitrat, transpor elektron dan fosforilasi
oksidatif
 METABOLISME
 Soal – soal latihan
 Jelaskan hubungan antara organisme
autotrop dan heterotrop
 Jelaskan klasifikasi metabolime
 Jelaskan perbedaan antara koenzim
NAD+ dan FAD
 Jelaskan mekanisme regulasi induksi
enzim
 Sebutkan organel-organel tempat
berlangsungnya metabolisme
METABOLISME PROTEIN
Sumber asam amino (mamalia)
Essensial (dari makanan)
Isoleusin
Leusin
Lisin
Metionin
Fenil alanin
Treonin
Triptofan
Arginin
valin
histidin
Non essensial
Glutamat
Glutamin
Prolin
Aspartat
Asparagin
Alanin
Glisin
Serin
Sistein
Tirosin
Seberapa besar kemampuan suatu
organisme menggunakan asam amino sbg
sumber energi à jenis organismenya
II. Oksidasi Asam Amino
Degradasi asam amino
Transaminasi
Enzim amino tranferase
Membutuhkan ko enzim piridoksal posapat
Enzim glutamate-oxaloacetate transaminase
(SGOT) and serum glutamate-pyruvate
transaminase (SGPT): merupakan enzim
aminotransferase yg digunakan untuk
mendeteksi kelainan fungsi
organ/monitoring treatmen pasien (terdapat
pada hati, hanya diproduksi jika ada organ
yg terluka)
Serin dan Threonin dapat langsung
dideaminasi !
Transport ammonia ke hati
Ammonia diubah menjadi Urea dng
SIKLUS UREA (UREA CYCLE)
Amonia secara umum terlibat dalam
biosintesis dan degradasi asam amino,
bersifat racun jika terjadi akumulasi dalam
sel
Dikonversi menjadi bentuk lain yg
dapat diekresi : pada burung ->asam
urea, mamalia -> urea --à melalui
siklus urea
Ditemukan oleh Hans Krebs dan Kurt
Henseleit
Terjadi dalam hati (mitokondria dan sitosol),
urea yg dihasilkan di trnspor ke ginjal
melalui pembuluh darah untuk di ekresi Asam amino diikat ke tRNA oleh enzim
melalui urin aminoacyl-tRNA synthetase
Atom C hasil degradasi Asam amino à
senyawa intermediet metabolisme utama Enzim ini mampu mengenali tRNA dan
tubuh asam amino yang tepat
Biosintesis asam amino
Pengikatan asam amino
Biosintesis asam amino Code genetik (kodon)
Tahap-tahap sintesis protein
Berdasarkan prekursor nya, biosintesis asam Tahap 1: Inisiasi
amino dibagi menjadi 6 famili: Tahap-tahap sintesis protein
α – ketoglutarat Tahap 2: elongasi rantai
piruvat Tahap-tahap sintesis protein
3-phosphogliserat Tahap 3: Terminasi
fosfoenolpiruvat dan eritrose -4P
Oksaloasetat METABOLISME
Ribosa 5-P NUKLEOTIDA
Biosintesis famili glutamat Peran nukleotida dalam sel
Biosintesis Famili aspartat Nukleotida berperan sebagai:

Biosintesis protein Precursor aktif untuk DNA dan RNA

Proses translasi Derivat nukleotida merupakan
Terjadi dalam ribosom senyawa intermediate aktif dalam
Melibatkan banyak jalur biosintesis (mis: UDP-
Untai DNA glukosa, CDP-diacylglicerol)
RNA (mengandung kodon) Sumber energi sel (mis: ATP)
tRNA (anti kodon) Komponen dari 3 coenzim utama:
Enzim NAD+, FAD, dan CoA
Regulator metabolit (mis: cyclic
Dimana sintesis protein mulai? AMP)
Sintesis protein dimulai pada amino Basa nitrogen
terminus Ada dua jenis basa nitrogen: purin dan
primidin
Peran tRNA
Sebagai adapter yang menterjemahkan Purin terdiri dari satu cincin 6 dan satu
bahasa urutan codon pada mRNA menjadi cincin 5 yang mengandung nitrogen yang
20 asam amino tergabung bersama

Mengikat satu asam amino pada salah satu Pirimidin hanya mempunyai satu cincin 6
ujungnya yang mengandung nitrogen

Membawa asam amino yang tepat ke titik
yang tepat di kompleks mRNA-ribosom
tRNA
Pengikatan asam amino
Ada 4 basa purin dan 4 basa pirimidin yang
akan dibahas
Basa pirimidin
Uracil = 2,4-dioxy pyrimidine
Thymine = 2,4-dioxy-5-methyl pyrimidine
Hypoxanthine = 2-oxy-4-amino pyrimidine
Orotic acid = 2,4-dioxy-6-carboxy
pyrimidine
Basa purin
Adenine = 6-amino purine
Guanine = 2-amino-6-oxy purine
Hypoxanthine = 6-oxy purine
Xanthine = 2,6-dioxy purine
Nukleosida
Bila gula, ribosa atau 2-deoksiribosa
dilekatkan dengan basa nitrogen akan
menghasilkan senyawa nukleosida
Atom C1 pada gula berikatan dengan atom
nitrogen 9 pada basa purin atau pada atom
nitrogen 1 pada basa pirimidine
Nama nukleosida purine akan berakhir
dengan –osine: Adenosine, Guanosine; dan
nama nukleosida pirimidin berakhir dengan
–idine: Uridine, Thymidine dan Cytidine
Nukleotida
Penambahan phosphate pada bagian gula
nukleosida menghasilkan: Nukleotida
Gugus fosfat berikatan dengan atom C no. 5
pada gula.
Polinukleotida
Nukleotida bergabung satu sama lain dengan
ikatan 3’-5’ fosfodiester membentuk
polinukleotida
Polimerisasi ribonukleotida menghasilkan
RNA, dan polimerisasi deoxyribonukleotida
menghasilkan DNA
Biosintesis nukleotida
Dua jalur biosintesis nukleotida
Jalur de novo
Jalur salvage
Hampir semua organisme mampu
mensintesis nukleotida dr prekursor yg lebih
sederhana à jalur de novo untuk nukleotida 
mirip utk setiap organisme
Nukleotida juga dapat disintesis dari hasil
pemecahan nukleotida yang telah ada 
salvage pathway (recycle) yaitu dari
degradasi pirimidin dan purin  dari sel yang
mati (regenerasi) atau dari makanan
Degradasi nukleotida
Di dalam usus halus tjd pemutusan ikatan
fosfodiester oleh endonuklease (pankreas) à
oligonukleotida
Dipecah lebih lanjut dg fosfodiesterase
(ensim exonuclease non spesifik) 
monofosfat
Dipecah lbh lanjut fosfomonoesterase
dikenal sebagai nukleotidase à
menghasilkan nukleosida and
orthophosphate.
phosphorylaseà menghasilkan
Nucleosida phosphorylaseà
basa dan and ribose-1-phosphate.
ribose-1-phosphate.
Jika basa atau nukleosida tidak digunakan
kembali utk salvage pathways, basa akan
lebih lanjut didegradasi
asam urat ureidopropionat
(purin) (pyrimidine).
Jalur De novo
Overview of nucleotide metabolism.
Jalur Salvage
90% dari basa nitrogen dipakai kembali -
sedikit energi diperlukan
Dua enzim penting yang terlibat :
o Adenine phosphoribosyl
transferase
o Hypoxanthine guanine
phosphoribosiyl
transferase
Degradasi nukleotida
Di dalam usus halus tjd pemutusan ikatan
fosfodiester oleh endonuklease (pankreas) à
oligonukleotida
Dipecah lebih lanjut dg fosfodiesterase
(ensim exonuclease non spesifik) 
monofosfat
Dipecah lbh lanjut fosfomonoesterase
dikenal sebagai nukleotidase à
menghasilkan nukleosida and
orthophosphate.
phosphorylaseà menghasilkan
Nucleosida phosphorylaseà
basa dan and ribose-1-phosphate.
ribose-1-phosphate.
Reutilization of purine and pyrimidine
bases.
5-Phospho- -D-ribosyl-1-pyrophosphate
(PRPP)
Intermediet untuk baik proses de novo and
salvage pathway
Berasal dari ribosa 5 phosphat
Dari mana bagian-bagian basa nitrogen
berasal?
Sintesis de novo nukleotida purin
Cincin purin disintesis secara de novo dari 5
precursor yang berbeda: Aspartat (atom N-
1), CO2 (atom C-6), glycine (atom C-4,C-5,
N-7), tetrahydrofolate (atom C-2, C-8) dan
glutamine (N-3, N-9)
Purin disintesis sebagai ribonukleotida
(ribose 5-phosphate); bukan sebagai basa
bebas
Ribose 5-phosphate bereaksi dengan ATP
membentuk 5-phoshporibosyl-1-
pyrophosphate (PRPP)
Ribose 5-phosphate bereaksi dengan ATP
membentuk 5-phoshporibosyl-1-
pyrophosphate (PRPP)
Cincin purine kemudian dibuat di ribose 5-
phosphate melibatkan 10 tahapan; glutamin,
glisin, tetrahydrofolate, dan glutamin
berkontribusi membentuk cincin 5 anggota,
Kemudian konstruksi cincin 6 anggota
membentuk inosine 5-monophosphate (IMP)
Skema sintesis nukleotida purin
De novo biosynthesis of the purine ring,
from PRPP to inosinic acid.
Hal-hal penting dalam sintesis de novo
purin:
 Sangat tergantung pada “pool” ribosa
 Gugus amina à didonor oleh
glutamin dgn enzim amidotransferase
 Glisin dan fumarat à donor ring dlm
nukleotida
 Daur reaksi à dikontrol secara
alosterik dgn AMP, ADP, GMP dan GDP. 
bekerja pada PRPP amidotransferase
Daur diawali dgn perubahan PRPP à IMP
IMP = Inosine monofosfat mrpkn bentuk
nukleotida purin yang pertama dibentuk dlm
daur ini
Sebagai basa adalah hypoxanthin
DAUR dr IMP à AMP & GMP
Jalur salvage sintesis nukleotida purin
Jalur salvage lebih hemat energi dari jalur
de novo
Basa purine bebas diperoleh dari degradasi
asam nukleat dan nukleotida
Bagian ribose phosphate dari PRPP
ditransfer ke purine membentuk
ribonukleotida
Jalur salvage sintesis nukleotida purin
Dua enzim yang dapat merekoveri basa
purin
Adenine phosphoribosyl transferase
Adenine + PRPP
--------------> adenylate +Ppi
Hypoxanthine-guanine
phosphoribosyl transferase
(HGPRTase)
Hypoxanthine +
PRPP -------> inosinate + Ppi

Guanine + PRPP
-------> guanylate + PPi
Jalur de novo sintesis nukleotida pirimidin
Cincin pirimidin dirakit terlebih dahulu,
baru kemudian dilekatkan ke ribosa
phosphate ------> nukleotida pirimidin
Membutuhkan sedikit ATP dibandingkan
dengan sintesis purin (2 Vs 4)
Cincin pirimidin mempunyai 3 precursor :
bicarbonate, gugus amida dari glutamin, dan
aspartat
Jalur de novo sintesis nukleotida pirimidin
Ada 6 tahap sintesis de novo UMP
• Glutamine bergabung dengan ion
bicarbonat + 2 ATP -----> carbamoyl
phosphate + glutamate
Jalur de novo sintesis nukleotida pirimidin
Ada 6 tahap sintesis de novo UMP:
2). Carbamoyl phosphate bergabung dengan
aspartat via aspartate transcarbamoylyase
membentuk carbamoyl aspartate
Jalur de novo sintesis nukleotida pirimidin
Ada 6 tahap sintesis de novo UMP:
• Carbamoyl phosphate akan
membentuk cincin menjadi L-
dihydroorotate
• L-dihydroorotate dioksidasi oleh
dihydroorotate dehydrogenase
membentuk orotate
• L-dihydroorotate dioksidasi oleh
dihydroorotate dehydrogenase
membentuk orotate
• OMP didekarboksilasi oleh OMP
decarboxylase membentuk uridine 5-
monophosphate (UMP)
Ada 6 tahap sintesis de novo UMP
De novo synthesis of pyrimidine
nucleotides.
Metabolisme de novo nukleotida pirimidine
Hal-hal penting dalam sintesis de novo
pirimidine:
cincin pirimidine disintesis terpisah dr gula
ribosa nya
Daur pirimidine de novo tidak bercabang
àproduk akhir dr daur adalah UMP yang
mrpkn bahan dari CMP
Reaksi pertama à pembtkan karbamoyl
aspartate dr asp dan carbomoyl-P
carbomoyl-P titik
regulasi yg penting dlm daur tsb
Aspartat transcarbomoylase (ATCase) 
diaktivasi oleh diaktivasi oleh ATP dan
dihambat oleh CTP sbg produk akhir
 Hidrolisis Polinukleotida
Katabolisme Nukleotida Purin
Produk akhir katabolisme nukleotida purin
pada manusia adalah asam urat
Mammalia dapat mengekskresikan dalam
bentuk allantoin yang lebih larut sebagai
produk akhirnya
Mammalia mempunyai enzim urate oxidase
yang dapat merubah asam urat menjadi
allantoin
Asam urat dibentuk di hati dan kemudian
diekskresikan ke dalam urin oleh ginjal
Dari nukleotida ke basa nitrogen
Nukleotida guanin dihidrolisis menjadi
nukleosida guanosin, yang kemudian
mengalami fosforolisis menjadi guanin dan
ribose 1-P
Nukleotidase pada manusia tidak begitu
aktif terhadap AMP, tetapi AMP
dideaminasi menjadi IMP oleh enzim
adeylate (AMP) deaminase
IMP kemudian dihidrolisis oleh nucleotidase
menjadi inosine dan difosforolisis menjadi
hypoxanthine
Adenosine (yang berasal dari S-
Adenosylmethhionine dari hasil reaksi
transmethylasi) dideaminasi menjadi inosine Satu untai ganda DNA akan mengasilkan
oleh adenosine deaminase dua untai ganda ..dst

Kedua nukleotida adenine dan guanine DNA Replikasi

dirubah menjadi Xanthine oleh enzim Membutuhkan dNTP (deoxyribonucleoside-
xanthine oxidase 5'-triphosphates) untuk membangun rantai
Dari nukleotida ke basa nitrogen DNA
Katabolisme Pirimidine Dikatalisis oleh DNA polimerase
Berbeda dengan purine, pirimidin DNA polimerase I
mengalami pemutusan cincin dengan produk DNA polimerase II
akhir adalah: beta-asam amino, ammonia DNA polimerase III
dan CO2 Terbagi 3 tahap
Inisiasi
Pirimidin dari asam nukleat dihidrolisis oleh Elongasi
nucleotidase dan pyrimidine nucleoside Terminasi
phosphorylase menghasilkan basa-basa DNA Replikasi (Details of lagging strand
bebas synthesis.)
The Okazaki model
Gugus 4-amino dan gugus 5-methyl cytosine The DNA polymerase reaction
dilepaskan sebagai ammonia Three models of DNA replication
Pemutusan cincin pirimidine A model for DNA replication.
Trnskripsi DNA
Agar cincin dapat diputuskan, cincin
pertama sekali direduksi oleh METABOLISME LIPID
NADPH
Ikhtisar Metabolisme
Atom 2 dan 3 kedua cincin Metabolisme LIPID
dilepaskan sebagai ammonia dan Metabolisme LIPID
CO2 Degradasi Lipid  Oksidasi asam lemak
Pencernaan, penyerapan dan transpot lemak
Beta-amino isobutyrate dari thymine -oksidasi asam lemak
atau 5-methyl cytosine dieskresikan
Lipid Biosintesis
Beta-alanine dari cytosine atau uracil Biosintesis asam lemak
dapat diekskresikan atau digunakan Biosintesis triasilgliserol
di otak dan dipeptida otot; carnosine Biosintesis fosfolipid
(his-beta-ala) atau anserine (methyl Biosintesis kolesterol dan steroid
his-beta-ala)
Metabolisme Lipid
 Pemutusan cincin pirimidine
Degradasi purine Pencernaan, penyerapan, & transportasi
Produk akhir katabolisme purin : asam urat lemak
Penggunaan lemak sebagai energi bersama
Replikasi DNA dengan metabolisme lipoprotein dan
Proses penggandaan DNA kolesterol.
Mammal memiliki 5 - 25% / lebih  lipid
dan 90% dlm bentuk lemak (TAG) yg
disimpan di dalam jaringan adipose
Hewan  gemuk disimpan dalam adiposit
Tumbuhan  biji  untuk perkembangan
embrio
 Sumber lemak:
 Makanan
 Biosintesis de novo
 Simpanan tubuh  adiposit
 Masalah utama  sifatnya yang tidak
larut dalam udara.
 Lemak  diemulsi oleh garam empedu -
disintesis oleh hati & simpan dlm empedu 
mudah dicerna & diserap
 Transportasi  membentuk kompleks dg
protein  lipoprotein
Penyerapan Lemak
 Lemak (TGA: triasil gliserol) dari
makanan dihidrolisis dalam lumen usus
halus oleh lipase pankreas: menghasilkan
gliserol, asam lemak bebas,
monoasilgliserol, dan diasilgliserol.
 Hasil hidrolisis ini di satukan kembali
menjadi lemak dlam retikulum endoplasmik
dan badan golgi sel mukosa usus halus.
1. Pemecahan TAG dari makanan
Terjadi dalam duodenum
Di bantu dengan adanya
Garam empedu (emulsifikasi)
Media alkali (jus pankreas)
2. Penyerapan oleh sel mukosa usus halus
Asam lemak yg diserap  disintesis kembali
mjd lemak dalam  badan golgi dan
retikulum endoplasma sel mukosa usus
halus
TAG  masuk ke sistem limfa
komplekssedia dengan protein 
chylomicrons
Transportasi lemak
Lemak berikatan dengan Fats apoproteins
untuk membentuk chylomicrons, yang akam
membawa lemak melalui aliran darah
Lemak dalam kilomikron di dalam sistem
kapiler membentuk sisa-sisa chylomicron,
seperti VLDL (Very Low-Density
Lipoproteins) yaitu komplek lipoprotein
yang membawa lemak dalam aliran darah.
Asam lemak bebas sangat jarang diemukan
dalam aliran darah. Lebih sering membuat
komplek dengan serum albumin
Albumin
Protein protein plasma paling banyak sekitar
50% dari total protein plasma pada manusia.
Protein, dengan Mr 66.200, mengandung 17
disulfida jembatan.
Albumin membawa asam lemak bebas ke
aliran darah. Setiap molekul albumin dapat
menghubungkan lebih dari 10 molekul
lemak (bersama jumlah asam lemak yang
selalu lebih sedikir)
Asam lemak dari albumin dan diserap oleh
jaringan dengan proses difusi.
Penyerapan Lemak dan Transportasi
Hati-hati bertindak penting dalam mengenal
lemak
Lemak yang disintesis dalam hati berikatan
dengan lipoprotein (VLDLs),
VLDLs dihidrolisis pada permukaan dalam
sistem kapiler. oleh lipoprotein lipase
menghasilkan intermediate-density
lipoproteins (IDLs)
IDLs di ambil oleh hati dan diproses
menjadi low-density lipoproteins (LDLs).
LDLs membawa kolesterol dari hati ke
jaringan dan high-density lipoproteins
(HDLs) yang mentranspor kolesterol dari
jaringan kembali kehati
Gambaran jalur transportasi lipoprotein dan
nasib.
Penyimpanan Lemak
Terutama sebagai triasilgliserol (trigliserida)
dalam sel adiposa
Merupakan 84% dari energi yang tersimpan
Protein - 15%
Karbohidrat (glukosa atau glikogen) - <1%
Degradasi Asam lemak Tahap I
Tahap pertama adalah konversi asam lemak
menjadi fattyacyl CoA
Proses aktivasiuksi energi
Fattyacyl CoA kemudian masuk ke dalam
mitokondria untuk proses degradasi lebih
lanjut
Tahap II. β-Oksidasi
Asam lemak didegradasi melalui 4 tahap
yang sama
Dua atom karbon diputuskan setiap putaran
Satu acetyl CoA di hasilkan setiap putaran
Acetyl CoA kemudian dimasukkan ke dalam
lingkaran TCA untuk menghasilkan energi
β oksidasi
Kenapa disebut β-oksidasi?
Atom karbon β- pada asam lemak dioksidasi
menjadi thioester melalui komponen
intermediate keton.
 Oksidasi asam lemak jalur metabolisme
penghasil energi utama pada hewan, bbrp
protista, dan beberapa bakteri
 Elektron dr proses oksidasi asam lemak
melewati rantai respirasi mitokondria 
menghasilkan ATP
(asetil ko A hasil oksidasi FA  dioksidasi
sempurna menjadi CO2 mll TCA  ATP
sintetik) þ
 Pada bbrp vertebrata  Asetil ko A hsl β
oksidasi  rubah menjadi badan keton di
hati (larut dlm air) dan di transpor ke otak
dan jaringan lain pd saat ini tidak tersedia
Tumbuhan Pada tumbuhan  asetil koA
memperlakukan utama sebagai prekursor
biosintesis
β-Oksidasi
β-Oksidasi
β oksidasi
Terdiri dari 4 proses utama:
Dehidrogenasi
Hidratasi
Dehidrogenasi
Thiolisis
β-Oksidasi: asam stearat
Acetyl CoA dioksidasi lebih lanjut dalam
siklus TCA
Energi dari FADH2 dan NADH kemudian
Balik menjadi
     ATP melalui rantai transportasi elektron
dan fosforilasi oksidatif
Penggunaan Asetil CoA
β-Oksidasi asam lemak tak jenuh
Asam lemak tak jenuh ditransport dan
diaktivasi dengan cara yang sama dengan
asam lemak jenuh
β-Oksidasi berlangsung sampai dijumpai
ikatan rangkap
Bila ikatan rangkapnya “trans”; tahapan
pembentukan enoyl dapat dilangkahi
Bila ikatan rangkapnya “cis”; diperlukan
proses tambahan
β-Oksidasi asam lemak tak jenuh
Degradasi asam lemak tak jenuh
membutuhkan dua
ensim tambahan:
Enoyl-CoA isomerase
    Mengkatalis proses penataan ulang asam
cis ∆3 menjadi ikatan trans ∆2
2,4-Dieenoyl-CoA reduktase
Rearrangement sirip trans ∆2 Cis ∆4
menjadi ikatan trans ∆2
β-Oksidasi asam lemak tak jenuh
β-Oksidasi asam lemak dengan jumlah atom
karbon ganjil
Meskipun tidak lazim, beberapa tumbuhan
dan mikroorganisme laut dapat
menghasilkan asam lemak beratom C ganjil
Proses degradasi berlangsung sama seperti
degradasi asam lemak berat C genap, sampai
dihasikan propionil CoA pada tahap terakhir
Propionyl CoA tidak bisa masuk ke sikuls
TCA

Diperlukan 3 reaksi untuk mengubah
propionil CoA menjadi succinyl CoAa dapat
digunakan
β-Oksidasi asam lemak dengan jumlah atom
karbon ganjil
Ulas Degradasi Asam Lemak
Asam lemak merupakan bentuk simpanan
energi metabolik yang paling efisien.
TAG terdiri dari 3 asam lemak dan gliserol
TAG didegradasi oleh enzim lipase di dalam
usus halus menjadi asam lemak dan gliserol.
Asam lemak melewati dinding usus halus,
dan TAG kembali disintesis dan ditransport
di dalam darah oleh chylomicrons.
Chylomicrons GRATIS pada sel lemak
(adipocytes) dan TAG didegradasi lagi
menjadi asam lemak dan gliserol
 Asam lemak masuk sel adiposa kmdn
disintesis kembali mjd TAG dan disimpan.
 TAG di dalam adiposa didegradasi
menjadi asam lemak sebagai respon
terhadap hormon.
 Asam lemak bergabung dengan Co A
terlebih dahulu sebelum didegradasi.
 Degradasi asam lemak menjadi asetil Co
A terjadi dalam matriks mitokondria.
 Karnitine membawa asam lemak ke dalam
mitokondria untuk didegradasi
 4 langkah reaksi degradasi asam lemak
adalah: oksidasi, hidrasi, oksidasi, tiolisis.
Asetil CoA
Konversi metabolik lipid
Badan keton
Setelah degradasi asam lemak, asetil CoA
dioksidasi lebih lanjut di dalam siklus TCA
Tahap pertama dalam siklus TCA
Badan Keton
Badan keton diproduksi oleh proses
ketogenesis, yang terjadi ketika asetil-CoA
terakumulasi di luar kapasitasnya untuk
dioksidasi atau digunakan untuk sintesis
asam lemak.
Dalam kondisi ini, reaksi katalis-tiolase
mendukung produksi acetoacetyl-CoA, yang
pada akhirnya diubah menjadi badan keton -
acetoacetate, acetone, dan -hydroxybutyrate.
Badan keton
Dihasilkan dari kelebihan acetyl CoA
(ketogenesis)
Ketosis
Kenaikan tidak normal konsentrasi keton
bodi dalam
darah akibat:
 Lapar
 Makanan rendah karbohidrat
 Diabetes mellitus
Menanggapi Kelaparan
Manusia dengan BB 70-kg manusia dapat
menyimpan sekitar 6700 kJ energi sebagai
glikogen -> glukosa darah - hanya akan
hidup beberapa jam setelah makan
Kebutuhan digital pada otak harus
dipertahankna sekitar 4,4 mM.  adaptasi
dengan mengambil tipis dari sumber lain
Tubuh menyimpan 565.000 kJ sebagai
triacylglycerol, sebagian besar dalam
jaringan adiposa, dan sekitar 100.000 kJ
sebagai protein mobilitas, sebagian besar di
otot.  Dapat menjadi energi dengan
modifikasi TAG
Mobilisasi triasilgliserol menghasilkan
energi sebagian besar sebagai asetil-KoA,
yang oksidasi lebih lanjut dalam siklus asam
sitrat membutuhkan oksaloasetat.
Oxaloacetate dan intermediet siklus asam
sitrat lainnya digunakan dalam reaksi
metabolik lainnya
 Yang paling penting dari proses ini adalah
reaksi piruvat karboksilase, dengan sebagian
besar piruvat berasal dari katabolisme
karbohidrat.
Selama pembatasan karbohidrat, intermediet
siklus asam sitrat dapat diberikan dari
gliserol yang dilepaskan dari pencernaan
lemak, tetapi gliserol tidak diproduksi dalam
jumlah yang cukup untuk mempertahankan
tingkat siklus asam sitrat.
Sebagai alternatif, intermediet ini dapat
dihasilkan dari katabolisme protein dan
transaminasi.
Akibatnya, proteolisis dipercepat selama
beberapa hari pertama kelaparan, karena
asam amino untuk sintesis protein tidak
hadir dalam jumlah yang cukup untuk
mengimbangi pemecahan protein, yang
berlanjut pada tingkat normal.
 Nasib utama dari asam amino yang
dilepaskan adalah glukoneogenesis. Selama
waktu ini, hati dan otot bergeser ke asam
lemak sebagai bahan bakar yang dominan
untuk digunakan sendiri
Karena pemecahan lemak telah diaktifkan,
baik asetil-CoA dan pembawa elektron
berkurang terakumulasi dalam hati ke titik
bahwa asetil-KoA tidak dapat dioksidasi.
Badan keton kemudian mulai terakumulasi.
Akumulasi acetoacetate dan
hydroxybutyrate menyukai reaksi yang
membentuk badan keton ini.
Dengan demikian, otak beradaptasi dengan
penurunan kadar glukosa dengan
meningkatkan penggunaan tubuh keton
sebagai substrat energi alternatif.
Tren ini berlanjut untuk durasi kelaparan.
Perubahan metabolik yang menyertai
kelaparan berkompromi dengan kemampuan
organisme untuk merespon tekanan lebih
lanjut, seperti pilek atau infeksi ekstrem.
Namun, adaptasi memungkinkan hidup terus
selama berminggu-minggu tanpa asupan
makanan, periode total ditentukan oleh
ukuran timbunan lemak.
Biosintesis tubuh keton di hati.
Ketogenesis: Pembentukan Badan Keton
Ketogenesis: Formasi
Badan Keton (Lanjutan)
Ketoasidosis
Jika produksi keton bodies (asam
acetoacetic dan beta-hydroxybutyric acid)
berlebih  Terjadi Vaksin dalam darah  pH
darah turun
Terjadi pada penderita Diabetik ketoacidosis
dan pecandu alkohol
Keton dalam Diabetes Mellitus
Keton dalam Diabetes Mellitus
Ketosidosis Alkoholic
 Dalam ketoasidosis alkoholik, alkohol
menyebabkan dehidrasi dan anti
glukoneogenesis.
Tubuh tidak bisa mensistesis glukosa yang
dibutuhkan perubahan energi 
menstimulasi metabolisme asam lemak
menjadi ketone tubuh
Badan keton
Lipogenesis
Pencegahan Gangguan Lipid
Kurangi lemak
Kurangi makanan berlemak tinggi
Misalnya. mentega, margarin, minyak,
mayones
Konsumsi sedikit lemak tak jenuh
Jangan menghilangkan lemak sepenuhnya
karena tinggi kalori
Pencegahan Gangguan Lipid
Batasi tambahan gula dan alkohol
Menambahkan gula dan alkohol adalah
'kalori kosong'
Perhatikan bagian dari semua makanan
‘Bebas lemak’ ≠ ‘bebas kalori’
Minum minimal 8 gelas air setiap hari
Air bebas kalori, menyegarkan, dan
mengenyangkan
Pencegahan Gangguan Lipid
Tingkatkan asupan sayuran, buah-buahan,
dan gandum utuh
Sarat dengan serat
Berisi banyak vitamin, mineral, dan
fitonutrien
Sertakan makanan kaya protein rendah
lemak setiap kali makan
Misalnya. tahu, kacang, telur, dan ikan
Pencegahan Gangguan Lipid
Pelan saat makan
Makan terlalu cepat akan melebihi
kebutuhan kalori sebelum menyadari kita
kenyang
Biosintesis asam lemak
Semua organisasi dapat mensintesis asam
lemak untuk mengirimkan energi dan
menggunakan struktur membran.
Dalam tubuh, lebih dari acetylCoA diubah
menjadi ester asam lemak
Sintesis asam lemak mirip dengan
degradasinya. Mencari tempat yang berbeda
Perbedaan antara sintesa dan degradasi asam
lemak
Sintesis asam lemak terjadi di sitoplasma
Degradasi hanya terjadi mitokondria
Acyl carrier Protein (ACP) selama es
sebagai tempat titik pelekatan
Semua proses sintetik yang dilakukan dalam
proses enzim kompleks-asam lemak sintase
NADH dan FADH2 dihasilkan pada
degradasi
NADPH untuk proses sintesa
Tahapan dalam sintesis asam lemak
Biosintesis kolesterol
Kolesterol:
Molekul tidak menghantar udara yang sukar
bagi pelaku untuk melarutkan dan
transportasi
Penting bagi semua kehidupan hewan, juga
memiliki pengaruh jelek
Kolesterol mengatur fluditas membran sel
hewan
Merupakan prekursor banyak biomolekul
termasuk hormon steroid, garam empedu
dan vitamin D
Ada 4 tahapan biosintesis kolesterol
Biosintesis kolesterol
Tahap 1. Sintesis mevalonate:
3 molekul molekul dalam dua tahap reaksi
3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA (HMG-
CoA)
HMG-CoA reduktase kemudian mengkatalis
pembentukan mevalonate
Reaksi ini berlangsung di sitoplasma sel hati
Biosintesis kolesterol
Tahap 1:
Biosintesis kolesterol
Tahap 2. Pengubahan dari C6 menengah
menjadi C5
Dalam 3 langkah yang berturutan,
mevalonate menerima 3 gugus fosfat, dari
ATP
Hasinya kemudian didekarboksilasi menjadi
isopentenil pirofosfat - bentuk dari dua
isoprenes aktif
isopentenyl pyrophosphate berada dalam
kesetimbangan dengan dimethylallyl
pyrophosphate-bentuk lain isoprene aktif
Biosintesis kolesterol
Biosintesis kolesterol
Tahap 4. Siklisasi squalene
Metabolisme kolesterol
      Kolesterol adalah titik awal sintesa
banyak biomolekul lainnya:
Garam empedu - menumpuk steroid kutub
Vitamin D3 - Cholecalciferol
Steroid Hormon: - Progesteron
- Glukokortikoid
- Mineralokortikoid
- Androgen
- Estrogen
 Metabolisme protein
 Struktur dan fungsi nutrisi asam amino
dan protein
 Deaminasi dan dekarboksilasi asam
amino
 Metabolisme ammonia dan urea
 Struktur dan fungsi nutrisi asam amino
dan protein
 Protein
 Protein adalah polimer asam-asam
amino.
 Ada 20 asam amino penyusun protein.
 Semua asam amino adalah asam -
amino, kecuali proline.
 -karbon berikatan dengan amina
primer, gugus karboksilat dan gugus
rantai samping
 20 Asam Amino
 PEPTIDA
 Protein merupakan polimer yang
memiliki asam amino sebagai
monomernya.
 Ikatan Peptida: Ikatan kovalen yang
menghubungkan asam-asam amino
untuk membentuk protein.
 PEPTIDA
 Protein Metabolism
 Metabolisme protein
 METABOLISME SECARA UMUM
(Gbr 12.2. Biochem, Mathew)
 SKEMA KATABOLISME
 Perbedaan metabolisme protein
dengan metabolisme biomolekul lain
 Karbohidrat dan lipid dapat disimpan
dan digunakan jika dibutuhkan ketika
membutuhkan energi atau untuk
biosintesis
 Pada umumnya organisme tidak
mempunyai polimer senyawa nitrogen
untuk disimpan
 Bbrp tanaman mampu menyimpan
senyawa N (Asparagine pd
Asparagus)
 Bbrp insect mempunyai protein
simpanan di dalam darah mereka à
Tidak mewakili bentuk simpanan N
  Hewan harus selalu menyediakan
suplai N yg cukup melalui makanan à
mengganti N yg hilang karena
katabolisme
 Kemampuan suatu organisme
menggunakan asam amino sbg
sumber energi
 Carnivora à 90% energi yang
dibutuhkan berasal oksidasi asam
amino (setelah makan)
 Herbivora à hanya sedikit
memperoleh energi dari oksidasi asam
amino.
 Sebagian bsr energi berasal dr
karbohidrat
 Katabolisme asam amino hanya
untuk menyuplai biosintesis
senyawa lain
 Pencernaan Proteins
The digestion of proteins (stage 1)
 Dimulai dari lambung à HCl dalam
lambung mengaktifkan enzim pepsin
untuk menghidrolisis ikatan peptida
 Masuk ke usus halus -- trypsin and
chymotrypsin hydrolyze peptides to
amino acids.
 Asam amino masuk ke pembuluh
darah untuk di transpor ke sel
 Digestion of Proteins
 Proses pencernaan protein
 Pepsin à memotong peptide pd N
terminal dkt Tyr, Phe and Trp
 Enzim pada usus halus à berasal dari
pakcreas (trypsinogen,
chymotrypsinogen,
procarboxypeptidase) à belum aktif 
di aktifkan oleh pH usus yang netral
(pankreas mengeluarkan bikarbonant
kedalam usus halus)
 Enzim aktif dlm usus  degradasi
polipeptida lanjut
◦ Trypsin à memecah ikatan peptida
yg karbonil nya berasal dr Lys
dan Arg
◦ Chymotrypsin à memecah iktn
peptida pada karboksi terminal dr
Phe, Tyr, dan Trp
◦ Carboxypeptidase à memecah
karboksi terminal scr berurutan
◦ Aminopeptidase à memecah N-
terminal
 KATABOLISME ASAM AMINO
 Sekitar 75% dari semua asam amino
digunakan untuk membuat protein
 Asam amino dapat berasal dari bahan
makanan atau hasil degradasi protein-
protein tubuh
 Degradasi protein tubuh adalah suatu
proses yang kontinyu, karena setiap
protein dalam tubuh secara tetap
diperbaharui – protein turnover
 Contoh protein turnover dalam tubuh
 Jalur utama metabolisme asam amino
 Katabolisme asam amino
 Katabolisme asam amino
 Asam amino tidak bisa disimpan
 Bila kelebihan asam amino atau
kekurangan sumber energi lainnya,
tubuh akan menggunakan asam amino
untuk menghasilkan energi
 Tidak seperti lipid dan karbohidrat,
asam amino membutuhkan jalur untuk
menghilangkan gugus amino sebagai
ammonium
 Amonium harus dibuang karena
bersifat racun untuk tubuh
 Katabolisme asam amino
* Dietary proteins are a vital source of
amino acids.
* Discarded cellular proteins are another
source of amino acids.
 Tahap katabolisme asam amino
 Degradasi asam amino dengan
memindahkan gugus a-amino à
transaminasi
 Degradasi karbon back bond
 Penghilangan gugus α-amino
 Semua kelebihan asam amino
dideaminasi
 Deaminasi menghasilkan ion
amonium yang bersifat racun dan
harus dihilangkan
 Penghilangan ion amonium dilakukan
melalui siklus urea
 Penghilangan gugus α-amino
 Transamination
In transamination
 Amino acids are degraded in the liver.
 An amino group is transferred from an
amino acid to an a-keto acid, usually
-ketoglutarate.
 The reaction is catalyzed by a
transaminase or aminotransferase.
◦ Reaksi transaminasi
membutuhkan koenzim piridoxal
phosphat (PLP) yang berasal dari
vitamin B6
 A new amino acid, usually glutamate,
and a new -keto acid are formed.
 Contoh transaminasi
 Contoh deaminasi oksidatif
 Secara keseluruhan…
 Hasil reaksi transaminasi
 Transamination of pyruvate yields
alanine;
 Transamination of oxaloacetate yields
aspartate;
 Transamination of aspartate yields
asparagine;
 Transamination of -ketoglutarate
yields glutamate;
 Transamination of glutamate yields
glutamine.
 Transaminasi dalam Metabolisme
Asam Amino
 Transaminasi dapat terjadi dalam
biosintesis atau degradasi asam amino
 Sebagian besar aminotransferase
menggunakan glutamat / -ketoglutarat
sebagai salah satu dari dua pasang
asam amino / keto yang terlibat.
 Dua enzim penting dalam diagnosis
klinis penyakit manusia adalah serum
glutamat-oksaloasetat transaminase
(SGOT) dan serum glutamat-piruvat
transaminase (SGPT):
SGOT: Oxaloacetate + Glutamate 
Aspartate + -Ketoglutarate
SGPT: Glutamat + Piruvat 
Ketoglutarat + Alanine
 Katabolisme berbicara karbon
 Asam amino didegradasi menjadi
salah satu atau dua komponen
menengah
 Semua berakhir ke siklus TCA
 Asam amino ketogenik
 Menghasilkan tubuh keton
 Didegrdasi menjadi asetil CoA atau
acetoacetyl CoA
 Asam amino glukonik
 Didegradasi menjadi piruvat,
-ketoglutarate, succinyl CoA,
Fumarate, atau oxaloacetate
 Dapat digunakan untuk sintesis
glukosa
 Tempat asam amino masuk ke siklus
TCA
 Katabolisme berbicara karbon
   Katabolisme isoleucine, leucine dan
valin memiliki beberapa tahapan yang
sama:
◦ Transaminasi dikatalis oleh amino
tranferase rantai bercabang
◦ Produk alfa-keton kemudian
didekarboksilasi via latihan komplek
yang mirip dengan kompleks piruvat
dehidrogenase
◦ Hasil katabolismenya kemudian ke
jalur yang berbeda
 Katabolisme valin, isoleusin, leusin
 Katabolisme fenilalanin
 Phenylalanine tidak membahas
transaminasi
 Tahap awal dimuali dengan
hidroksilasi menjadi tyrosine
 Katabolisme fenilalanin
 Tempat asam amino masuk ke siklus
TCA
 Hubungan metabolik antara asam
amino yang berasal dari intermediet
siklus asam sitrat
 Siklus asam sitrat
 Atom Karbon dari Asam Amino
Ketika dibutuhkan, kerangka karbon
dari asam amino digunakan
untuk menghasilkan energi dengan
membentuk zat antara dari sitrat
siklus asam.
 Skeleton tiga karbon
alanin, serin, dan cysteine piruvat
 Skeleton empat karbon
aspartat, oksaloasetat asparagin
 rangka Lima karbon
glutamin, glutamat, prolin,
arginin, histidin glutamat
 Asam Amino Glukogenik dan
Ketogenik
Asam amino diklasifikasikan sebagai
 Glukogenik jika mereka
menghasilkan piruvat atau oksaloaset,
yang dapat digunakan untuk
mensintesis glukosa.
 Ketogenik jika mereka
menghasilkan acetoacetyl CoA atau
acetyl CoA, yang dapat membentuk
badan keton atau asam lemak.
 Jalur Asam Amino ke Asam Citrat
Menengah
 Jalur Asam Amino ke Piruvat dan
Oksaloasetat
 Asam Amino Glukogenik yang
membentuk intermediet dari Siklus
Asam Sitrat
 Sumber Asam Amino
 Asam amino esensial harus
diperoleh dalam makanan.
 Asam amino non-esensial disintesis
di dalam tubuh.
 Gambar 2.1
 Gambar 2.11
 Metabolisme amonia dan urea
 Transport ammonia ke hati
 Amonia adalah toksik bagi jaringan
hewan.
 Pengubahan amonia menjadi urea
terjadi di dalam hati
 Dari jaringan: Amonia  menjadi
glutamin  transport ke hati
 Glutamin  tidak toksik, bersifat
netral dan dapat melewati membran
sel secara langsung.
◦ merupakan bentuk utama utk
transpor ammonia  shg tdpt di dlm
darah lebih tinggi dr a. Amino yg lain
 jg bekerja untuk gugus amino pada
berbagai reaksi biosintesis
 Transport ammonia ke hati
 Dari otot
◦ Siklus glukosa-alanin 
menghilangkan toksisitas amonia
◦ Di sini glutamat dehidrogenase
menghubungkan amonia ke
-ketoglutarat untuk membentuk
glutamat.
◦ Glutamat kemudian
menyumbangkan gugus aminnya ke
piruvat (dari glikolisis) untuk
membentuk alanin dan -ketoglutarat.
◦ Alanine diangkut ke hati, di mana ia
kehilangan kelompok amina oleh
pembalikan dari proses sebelumnya,
menghasilkan amonia untuk sintesis
urea dan piruvat.
◦ Piruvat, pada gilirannya, mengalami
glukoneogenesis untuk membentuk
glukosa, yang dilepaskan ke darah dan
bergerak kembali ke otot.
◦ Dengan demikian, otot
menghilangkan amonia dan piruvat
dan menerima glukosa (akhirnya)
sebagai gantinya.
 Transpor amonia dalam tubuh
 Pemanfaatan Amonia
 Pada kadar rendah, amonia
merupakan metabolit sentral, tetapi
pada tingkat tinggi cukup beracun.
 Amonia adalah substrat untuk lima
enzim yang mengubahnya menjadi
berbagai senyawa nitrogen organik
 Semua organisme berasimilasi
amonia melalui reaksi yang mengarah
ke glutamat, glutamin, asparagin, dan
karbamoil fosfat
 Reaksi dalam asimilasi amonia dan
nasib utama nitrogen tetap.
 Siklus Urea
Siklus urea
 Mendetoksifikasi ion amonium dari
degradasi asam amino.
 Mengubah ion amonium menjadi
urea di hati.
              HAI
               ||
H2N — C — NH2 urea
 Menyediakan 25-30 g urea setiap
hari untuk pembentukan urin di ginjal.
Siklus Urea
 Carbamoyl Phosphate
Karbamoil fosfat terbentuk
 Dalam mitokondria, ketika ion
amonium bereaksi dengan CO2 dari
siklus asam sitrat, 2 ATP, dan air.
carbomyl phosphatesynthetase
NH4 + + CO2 + 2ATP + H2O
OO
|| ||
H2N — C — O — P — O- + 2ADP +
Pi
|
HAI-
carbamoyl phosphate
 Reaksi 1 Transfer Kelompok
Karbamoil
Dalam reaksi 1 dari siklus urea,
 Kelompok karbamoil dipindahkan
ke ornithine untuk membentuk
citrulline.
 Citrulline bergerak melintasi
membran mitokondria ke sitosol.
 Reaksi 2 Kondensasi dengan
Aspartate
Dalam reaksi 2 dari urea
siklus,
 Itu terjadi di sitosol, citrulline
bergabung dengan aspartat.
 Hidrolisis ATP ke AMP
memberikan energi.
 N dalam aspartat adalah bagian dari
urea.
 Reaksi 3 Pembelahan Fumarate
Pada reaksi 3 dari siklus urea,
fumarate
 Dibelah dari argininosuccinate.
 Memasuki siklus asam sitrat.
 Reaksi 4 Bentuk Hidrolisis Urea
Dalam reaksi 4 dari urea
siklus,
 Arginine dihidrolisis
 Bentuk urea.
 Ornithine kembali ke mitokondria
untuk mengambil gugus carbamoyl
lain untuk mengulang siklus urea.
 Siklus Urea
 Ringkasan Siklus Urea
Siklus urea mengkonversi:
 Ion amonium menjadi urea
 Aspartasi ke Fumarate
 3ATP ke 2ADP, AMP, 4Pi
NH4 + + CO2 + 3ATP + aspartat +
2H2O
    urea + 2ADP + AMP + 4Pi +
fumarate
 Tempat dikunjungi Silus urea
 1. Mitokondria
 Pembentukan karbamoil fosfat.
 Bentuk Citrulline.
2. Sitosol
 Aspartate bergabung dengan
citrulline.
 Fumarat dibelah.
 Pembentukan urea.
KROMOSOM, GEN, DAN DNA
 Kompetensi Dasar:
 Mahasiswa dapat menjelaskan
hubungan antara kromosom, gen,
dan DNA
 Menjelaskan proses replikasi,
transkripsi, dan translasi
 Membuat peta pikiran tentang
kromosom, gen, dan DNA
PETA KONSEP
Apakah itu KROMOSOM ?
KROMOSOM
Pengertian Kromosomà Struktur
pembawa materi genetik
Kromà Warna ; Soma Tubuh (karena
sifatnya mudah mengikat warna)
Tiap kromosom terdiri atas satu molekul
DNA yang sangat panjang dan protein-
protein yang terasosiasi dengan DNA
tersebut
Terdapat di dalam nukleus (inti sel)
Terlihat jelas saat sel membelahà karena
menebal
Jumlah kromosom yang dimiliki spesies
tertentuà Tetap
• Manusiaà 46 kromosom
PENYUSUN KROMOSOM
DNAà Dipintal pada protein Histonà
Menjadi Nukleosomà Dipintal jadi
Solenoidà Tersusun menjadi Benang
Kromatinà Kromosom
NUKLEOSOM
Nukleosom merupakan unit dasar
kromosom.
PENGEMASAN KROMOSOM SECARA
SINGKAT
Untaian DNA di pintal pada suatu set
protein yaitu histon menjadi suatu bentukan
yang disebut nukleosom.
Unit-unit nukleosom membentuk benang-
benang yang lebih padat dan terpintal
menjadi lipatan-lipatan solenoid.
Lipatan solenoid membentuk benang-
benang kromatin.
Benang-benang kromatin tersusun
membentuk kromosom.
PENGEMASAN DNA
MORFOLOGI KROMOSOM
Bentuk kromosom berbeda-beda,
tergantung pada species, namun bentuk
kromosom tetap untuk setiap spesies
Ukuran p = 0,2-50mm,  = 0,2-20m
Lengan: satu atau dua; sama panjang
atau tidak sama panjang; bentuk simetris
atau tidak simetris
STRUKTUR KROMOSOM
Pada kromosom yang belum mengalami
penggandaan (Replikasi/Duplikasi) 
Struktur kromosom berupa satu lengan
panjang saja
Apabila kromosom telah mengalami
penggandaan pada tahap Profaseà
Struktur kromosom yang tadinya satu
lengan saja akan mengganda menjadi dua
lengan yang menyatu di bagian
tengahnya (sentromer)
Pada kasus inià Tiap lengan disebut
Kromatid (Chromatids), dan kromatid
satu lagi yang menyatu dengannya
disebut Sister Chromatids (Kromatid
Saudara/Kromatid Kembaran)
KROMOMER DAN KROMONEMA
SUATU KROMOSOM.
Kromomer.
Kromonema.
MACAM-MACAM BENTUK
KROMOSOM
Metasentrik adalah kromosom yang letak
sentromernya berada di ditengah-tengah
kromatid, sehingga kromatid terbagi dua.
Submetasentrik adalah kromosom yang letak
sentromernya berada tidak di tengah-tengah
kromatid sehingga kromatid tidak terbagi
sama panjang.
Akrosentrik adalah kromosom yang letak
sentromernya dekat ujung.
Telosentrik adalah kromosom yang letak
sentromernya di ujung kromatid.
MACAM-MACAM KROMOSOM
Autosom
kromosom tubuh merupakan kromosom
yang tidak menentukan jenis kelamin.
Pada manusia pria dan wanita bentuk serta
jumlahnya sama.
(22 pasang autosom)
Gonosom
kromosom seks, merupakan kromosom
yang menentukan jenis kelamin.
Pada manusia pria (XY) dan
wanita(XX), memiliki bentuk atau jenis
yang berbeda.
BAGIAN-BAGIAN KROMOSOM
Kromomer adalah struktur berbentuk manik-
manik yang merupakan akumulasi materi
kromatin.
Sentromer adalah daerah lekukan (kontriksi)
disekitar daerah pertengahan kromosom,
dimana juga dijumpai kinetokor.
Kinetokor adalah daerah tempat perlekatan
benang-benang spindel dan tempat
melekatnya lengan kromosom.
Satelit adalah bagian kromosom yang
berbentuk bulatan dan terletak di ujung
lengan kromatid.
Telomer adalah daerah terujung kromosom
fungsinya menjaga stabilitas bagian ujung
kromosom agar DNA tidak terurai.
BAGIAN-BAGIAN KROMOSOM
 A. telomer.
 B. kontriksi sekunder.
 C. satelit.
 D. kontriksi primer : sentromer
dengan kinetokornya.
 E. lengan.
Morfologi KROMOSOM
Sentromerà Bagian yang menyempità
Membagi kromosom menjadi 2 lengan
Bentuk kromosom berdasar letak sentromer:
Metasentrisà Sentromer di tengah
kromosomSeperti huruf V
SubmetasentrisàSentromer ke arah
salah satu ujung kromosomà Seperti
huruf J
Akrosentrisà Sentromer di dekat
ujung kromosomà Bentuk kromosom
lurus seperti batangà Satu lengan
pendek, lengan lain panjang
Telosentrisà Sentromer di ujung
kromosomà Bentuk kromosom lurus
seperti batangà hanya terdiri dari
satu lengan sajaà Kromosom
manusia tidak ada yang telosentris
BENTUK KROMOSOM
TIPE KROMOSOM
AUTOSOM
-Kromosom yang tidak ada hubungannya
dengan penentuan jenis kelamin
-Dari 46 kromosom dalam tubuh manusiaà
44 adalah Autosom
SEKS KROMOSOM
- Sepasang kromosom yang
menentukan jenis kelamin
- Dibedakan jadi Kromosom-X dan
Kromosom-Y
- Dari 46 kromosom dalam tubuh manusiaà
2 adalah Seks Kromosom
TIPE KROMOSOM
 Autosom (jumlahnya 2n-2)
 Kromosom seks (jumlahnya 2)
 Contoh: ada 46 kromosom pada
sel soma (2n) manusia, maka
jumlah autosom = 44; kromosom
seks = 2
 Berapa jumlah autosom dan
kromosom seks pada sel sperma
atau sel telur manusia?
TIPE DAN JUMLAH KROMOSOM
Setiap sel somatik manusia memiliki
kromosom sebanyak 46, kecuali sel gamet.
Kromosom tersebut dapat tersusun secara
berpasang-pasangan, dimulai yang
terpanjang.
Kromosom yang membentuk pasangan
mempunyai panjang, posisi sentromer, dan
pola pewarnaan yang sama, disebut
kromosom homolog.
Lokus adalah letak / posisi gen dalam
kromosom.
Terjadinya pasangan kromosom homolog
dari kariotipe adalah konsekuensi asal usul
seksual.
Sperma dan ovum memiliki kromosom
tubuh 22 buah dan kromosom sex (X) untuk
ovum dan (Y) / (X) untuk sperma, sehingga
dinamakan haploid.
Sedangkan sel yang memiliki 23 pasang
kromosom disebut diploid.
JUMLAH KROMOSOM
JUMLAH KROMOSOM PADA
BEBERAPA JENIS HEWAN
Lalat buah = 8 / 4 ps.
Nyamuk = 6 / 3 ps.
Manusia =46/23ps.
Orang utan =48/24ps.
Simpanse = 48/24 ps.
Gorila = 48 / 24 ps.
3A + XX / 3A + XY.
2A + XX / 2A + XY.
22A + XX / 22A + XY.
23A + XX / 23A + XY.
23A + XX / 23A + XY.
23A + XX / 23A + XY.
KARYOTIPE
Pengaturan kromosom secara standar
berdasarkan panjang, jumlah, serta bentuk
kromosom suatu individu
GEN
 Konvensional: materi yang
menentukan karakter tertentu
 Molekuler: segmen DNA yang
membawa infromasi genetik untuk
karakter tertentu
 Hanya sebagian kecil DNA yang
membawa informasi genetik (coding
DNA), sebagian besar tidak
mengkode (non coding DNA)
 Gen menempati lokus tertentu pada
sebuah kromosom
KROMOSOM DAN GEN
Kromosom mengandung DNA.
Total informasi genetik yang disimpan
dalam DNA suatu sel disebut genom.
Genom DNA tersusun atas gen-gen.
Satu gen mengandung satu unit informasi
mengenai suatu karakter yang dapat diamati.
Gen merupakan fragmen DNA di dalam
kromosom.
LETAK DAN SIMBOL GEN
Letak suatu gen di dalam kromosom disebut
lokus.
Dianalogikan seperti manik-manik yang
berjejer pada seutas benang.
Pada sel diploid memiliki 2 lokus untuk
setiap karakter tertentu.
LETAK DAN SIMBOL ALEL
Homozigot dominan = buah manis MM.
Homozigot resesif = buah asam mm.
Heterozigot = buah manis Mm.
Fenotip = sifat yang tampak.
Genotip = penyusun genetik
dari fenotip.
STRUKTUR DNA
STRUKTUR DNA DOUBLE HELIX
GENOM
 Pengertian: seluruh informasi genetik
yang terdapat dalam sel haploid
 Jenis: intrakromosom (genom utama)
dan ekstrakromosom (pada plasmid,
mitokondria, kloroplas)
 Genom utama umumnya berbentuk
linier (kecuali pada bakteri)
 Genom ekstrakromosom berbentuk
sirkuler
DOGMA GENETIK
REPLIKASI
 Apa: penggandaan materi DNA
 Di mana: di dalam nukleus
 Kapan: pada fase S interfase
 Apa yang dibutuhkan:
 Enzim DNA polimerase I dan III,
primase RNA, helikase, single strand
binding protein (SSBP), ligase,
topoisomerase, protein inisiator
 Bagaimana cara: semikonservatif
REPLIKASI SEMIKONSERVATIF
TRANSKRIPSI
Apa: penyalinan materi genetik yang
menyandi informasi
Di mana: dalam nukleus
Kapan: selama interfase
Apa yang dibutuhkan: DNA cetakan,
enzim RNA polimerase
Bagaimana tahapan: inisiasi, elongasi,
dan terminasi
INISIASI, ELONGASI, DAN
TERMINASI TRANSKRIPSI
KERJA POLIRIBOSOM
 TRANSLASI
Apa: proses penerjemahan kode genetik
pada RNA menjadi polipeptida
Di mana: di sitoplasma
Kapan: interfase
Apa yang dibutuhkan: faktor inisiasi,
ribosom, RNAm, RNAt, enzim
Tahapan: inisiasi, elongasi, dan terminasi
INISIASI TRANSLASI
KODE GENETIK
ELONGASI TRANSLASI
TERMINASI TRANSLASI
 KATABOLISME ASAM AMINO
 Sekitar 75% dari semua asam
amino digunakan untuk membuat
protein
 Asam amino dapat berasal dari
bahan makanan atau hasil degradasi
protein-protein tubuh
 Degradasi protein tubuh adalah
suatu proses yang kontinyu, karena
setiap protein dalam tubuh secara
tetap diperbaharui – protein
turnover
 Contoh protein turnover dalam
tubuh
 Jalur utama metabolisme asam
amino
 Katabolisme asam amino
 Katabolisme asam amino
 Asam amino tidak bisa disimpan
 Bila kelebihan asam amino atau
kekurangan sumber energi lainnya,
tubuh akan menggunakan asam
amino untuk menghasilkan energi
 Tidak seperti lipid dan karbohidrat,
asam amino membutuhkan jalur
untuk menghilangkan gugus amino
sebagai ammonium
 Amonium harus dibuang karena
bersifat racun untuk tubuh
 Tahap katabolisme asam amino
 Degradasi asam amino dengan
memindahkan gugus a-amino à
transaminasi
 Degradasi karbon back bond
 Penghilangan gugus α-amino
 Semua kelebihan asam amino
dideaminasi
 Deaminasi menghasilkan ion
amonium yang bersifat racun dan
harus dihilangkan
 Penghilangan ion amonium
dilakukan melalui siklus urea
 Penghilangan gugus α-amino
 Penghilangan gugus α-amino
 Semua kelebihan asam amino
dideaminasi
 Deaminasi menghasilkan ion
amonium yang bersifat racun dan
harus dihilangkan
 Penghilangan ion amonium
dilakukan melalui siklus urea
 Contoh transaminasi
 Contoh deaminasi oksidatif
 Secara keseluruhan…
 Siklus Urea
 Terjadi di hati
 Menghasilkan pembentukan urea
 Urea dieliminasi secara ekskresi
(urine)
 Siklus Urea
 Transpor amonia dalam tubuh
  Katabolisme kerangka karbon
 Asam amino didegradasi menjadi salah
satu atau dua senyawa intermediate
 Semua berakhir ke siklus TCA
 Asam amino ketogenik
 Menghasilkan keton
bodies
  Didegrdasi menjadi acetyl
CoA atau acetoacetyl
CoA
 Asam amino glukonik
 Didegradasi menjadi
pyruvate, -ketoglutarate,
succinyl CoA, Fumarate,
atau oxaloacetate
 Dapat digunakan untuk
sintesis glukosa
 Tempat asam amino masuk ke
siklus TCA
 Katabolisme kerangka karbon
Katabolisme isoleucine, leucine dan valin
memiliki beberapa tahapan yang
sama :
 Transaminasi dikatalis oleh amino
tranferase rantai bercabang
 Produk alfa-keton kemudian
didekarboksilasi via suatu komplek yang
mirip dengan kompleks pyruvate
dehydrogenase
 Hasil katabolismenya kemudian
berlanjut ke jalur yang berbeda
  Katabolisme valine, isoleucine,
leucine
 Katabolisme phenylalanine
 Phenylalanine tidak mengalami
transaminasi
 Tahap awal dimuali dengan
hidroksilasi menjadi tyrosine
  Katabolisme phenylalanine
 Biosintesis asam amino
 Semua kehidupan mampu
menggunakan ammonia menjadi
senyawa organik
 Reaksi pembentukan carbamoil
fosfat, glutamat dan glutamin
memegang peranan kunci
 Glutamat dan glutamin digunakan
untuk membuat senyawa asam
amino lain dan senyawa-senyawa
lain
 Karbamoil phosphate digunakan
mensintesis urea, pirimidine, …….
 Sintesis glutamat
 Sintesis glutamin
Glutamine synthetase diinhibisi
feedback oleh beberapa produk
akhir diantaranya: histidine,
triptofan, AMP, dan CTP
 Glutamat dan glutamin
 Semua kehidupan/organisme
mempunyai glutamate
dehydrogenase dan glutamine
synthethase
 Tumbuhan tingkat tinggi dan
prokariot mempunyai enzim
glutamate synthase
 Biosintesis asam amino
 Setiap asam amino mempunyai
jalur biosintesis yang unik
 Ada 6 kelompok biosintesis
didasarkan precursor yang sama
 Asam amino mendapatkan
kerangka karbonnya dari senyawa
intermediate glikolisis, siklus asam
sitrat atau jalur fosfoglukonat
 Gugus –NH2 biasanya berasal dari
glutamate
 Biosintesis asam amino
 Asam amino non essensial
 Yaitu asam amino yang dapat
dibuat oleh hewan
 Jalur sintesis biasanya lebih
langsung
 Beberapa jalur lebih kompleks,
seperti jalur sintesis serine
 Biosintesis serin
 Biosintesis glisine
 Glisin disintesis dari serine
 Tetrahydrofolate (FH4) adalah
kofaktor yang penting untuk reaksi
ini

 Biosintesis glisine
 Asam amino essensial
 Dibuat oleh tanaman dan bakteri
 Jalur biosintesis panjang dan lebih
kompleks
 Contoh :
 Sintesis fenilalanin, tirosine dan
triptofan mempunyai dua tahapan reaksi
yang sama
 Fenilalanin dan tirosin mempunyai
tiga tahapan reaksi yang sama
 Biosintesis asam amino essensial
 Sintesis triptofan
 Sintesis fenilalanin dan tirosin
 Produksi Intermediate
 Jalur sintesis asam amino aromatik
 Produksi Intermediate
 Asam amino sebagai precursors …
Asam amino sebagai precursors sintesis
senyawa biomolekul lainnya:
Contoh: Porphyrins
Struktur ini digunakan
sebagai gugus
prosthetic pada: heme,
chlorophyll,
cytochromes
 Biosintesis phorphyrin
 Tahap pertama kondensasi glisin
dan succinyl CoA menghasilkan δ-
aminolevulinate (ALA)
 Biosintesis phorphyrin
 2 molekul ALA kemudian
digunakan untuk menghasilkan
porphobilinogen
 Biosintesis phorphyrin
 4 molekul porphobilinogen
kemudian berkondensasi
menghasilkan protophorphyrin IX
 Biosintesis phorphyrin
 Insersi Fe2+ ke dalam
protophorphyrin IX, menghasilkan
heme
 Ringkasan
 Tidak seperti karbohidrat dan asam
lemak, kelebihan asam amino yang
dibutuhkan untuk biosintesis tidak
bisa disimpan di dalam tubuh.
 Kelebihan asam amino harus
didegradasi.
 Kerangka karbon didegradasi
menjadi piruvat, asetil coenzim A
atau salah molekul intermediet di
dalam siklus Krebs, sedangkan
gugus aminonya dikonversikan
menjadi ion amonium dan urea
yang kemudian diekskresikan dalam
urine.
Dogma Central
 Transfer Informasi Genetik
 Transkripsi - informasi dalam DNA
disalin sebagai urutan nukleotida
RNA
Terjemahan - polipeptida disintesis dari
sekuen nukleotida RNA
 Dogma sentral dari genetika
 DNA ditranskripsi ke RNA
 RNA diterjemahkan untuk membentuk
polipeptida
 Replikasi DNA
 Proses polimerisasi anabolik yang
membutuhkan monomer dan energi
 Triphosphate deoxyribonucleotides
melayani kedua fungsi
 Kunci untuk replikasi adalah struktur
pelengkap dari dua untai
 Replikasi adalah semikonservatif -
untaian baru yang terdiri dari satu
untai asli dan satu helai putri
 Proses Awal dalam Replikasi DNA
 Proses Awal dalam Replikasi DNA
 DNA polimerase berikatan dengan
masing-masing untai dan
menambah nukleotida ke gugus
hidroksil pada 3 ′ ujung asam
nukleat
 Replikasi DNA hanya 5 ′ hingga 3 ′
Karena untaian antiparalel, untaian baru
disintesis secara berbeda
 Leading strand disintesis secara terus
menerus
 Lagging untai disintesis diskontinu
 Sintesis dari Leading Strand
 Sintesis Unting Strand
 Reaksi polymerase DNA
 Replikasi DNA Eukariotik
 Serupa dengan replikasi bakteri
 Beberapa perbedaan
 Gunakan empat polimerase DNA
 Ribuan asal replikasi
 Fungsi Gen
 Genotip - set gen dalam genom
 Fenotipe - fitur fisik dan sifat
fungsional dari organisme
 Acara dalam Transkripsi
 Empat jenis RNA ditranskripsi dari
DNA
 RNA primer
 mRNA
 rRNA
 tRNA
 Terjadi di nukleoid prokariot
 Tiga langkah
 Inisiasi
 Perpanjangan
 Penghentian
 RNA
 Sekitar 5-10% dari berat total sel
adalah RNA (DNA hanya 1%).
 RNA terdiri dari 3 bentuk:
 RNA Ribosom - rRNA
merupakan struktur kombinasi dengan
protein yang merangkai ribosom
sebagai tempat sintesis protein.
 Messenger RNA - mRNA
membawa informasi genetik dari DNA ke
ribosom.
 Transfer RNA - tRNA
ester, melalui akar ester, dengan asam
amino yang akan digunakan untuk
sintesis protein.
 RNA polynerase
 RNA polymerase adalah enzim yang
membuat RNA menggunakan DNA
sebagai template.
 RNA polymerase menggunakan
trifosfat nukleosida, ATP, GTP,
CTP, dan UTP (uridine
triphosphate) untuk membuat RNA.
 Nukleosida mendasarkan adenin,
guanin, sitosin dan pasangan urasil
dengan basis timin, sitosin, guanin,
dan adenin, masing-masing, dalam
DNA untuk membuat RNA.
Seperti DNA polimerase, RNA polimerase
mengkatalisasi polimerisasi
nukleotida hanya dalam arah 5
'hingga 3'.
 Tidak seperti polimerase DNA,
bagaimanapun, polimerase RNA
tidak memerlukan primer untuk
memulai sintesis.
 Inisiasi Transkripsi
 Pemanjangan Transkrip RNA
 RNA RNA Bersamaan
 RNA Polymerase Versus Polimerase
DNA
 RNA polimerase tidak memerlukan
helicase
 RNA polimerase lebih lambat dari
DNA polimerase
 Uracil dimasukkan sebagai pengganti
thymine
 Fungsi proofreading RNA polymerase
kurang efisien daripada DNA
polymerase (lebih banyak
kesalahan)
 Pengakhiran Transkrip
 Transkripsi di Eukariota
 Transkripsi RNA terjadi di nukleus
 Transkripsi juga terjadi pada • Jalur utama metabolisme asam
mitokondria dan kloroplas amino
 Tiga jenis polimerase RNA
• Tahap katabolisme asam amino
 Banyak faktor transkripsi
 mRNA diproses sebelum terjemahan
 Capping • Degradasi asam amino dengan
 Poliadenilasi memindahkan gugus a-amino à
 Penyambungan transaminasi
 Kode Genetik
 Prokariotik mRNA
 Eukariotik mRNA • Degradasi karbon back bond
 tRNA
 Ribosom dan rRNA • Contoh transaminasi
 Tahapan Terjemahan • Contoh deaminasi oksidatif
 Tiga tahap • Secara keseluruhan…
 Inisiasi • Siklus Urea
 Perpanjangan
 Penghentian • Terjadi di hati
 Semua tahap membutuhkan faktor • Menghasilkan pembentukan urea
protein tambahan • Urea dieliminasi secara ekskresi
 Inisiasi dan elongasi membutuhkan (urine)
energi (GTP) •  Katabolisme kerangka karbon
 Inisiasi • Asam amino didegradasi menjadi
 Perpanjangan
 Perpanjangan salah satu atau dua senyawa
 Perpanjangan intermediate
 Perpanjangan • Semua berakhir ke siklus TCA
 Perpanjangan • Asam amino ketogenik
 Perpanjangan • Menghasilkan keton
 Polyribosome
bodies
 Penghentian
 Faktor rilis entah bagaimana • Didegrdasi menjadi
mengenali kodon berhenti dan acetyl CoA atau
memodifikasi ribosom untuk acetoacetyl CoA
mengaktifkan ribozim yang • Asam amino glukonik
memotong polipeptida dari tRNA • Didegradasi menjadi
akhir
pyruvate,
 Ribosom berdisosiasi menjadi subunit
 Polipeptida yang dilepaskan saat -ketoglutarate,
penghentian mungkin berfungsi succinyl CoA,
sendiri atau bersama. Fumarate, atau
• Metabolisme Protein, Asam oxaloacetate
nuklat, Lipid • Dapat digunakan
• Overview untuk sintesis glukosa
• METABOLISME SECARA • Tempat asam amino masuk ke
UMUM siklus TCA
• Biosintesis asam amino
• Biosintesis nukleotida
Dua jalur biosintesis nukleotida
• Jalur de novo
• Jalur salvage
• Asam Nuklat
• Hampir semua organisme
mampu mensintesis nukleotida dr
prekursor yg lebih sederhana à
jalur de novo untuk nukleotida 
mirip utk setiap organisme
• Nukleotida juga dapat disintesis
dari hasil pemecahan nukleotida
yang telah ada  salvage pathway
(recycle) yaitu dari degradasi
pirimidin dan purin  dari sel
yang mati (regenerasi) atau dari
makanan
• Jalur De novo
• Overview of nucleotide
metabolism.
• Jalur Salvage
• 90% dari basa nitrogen dipakai
kembali - sedikit energi
diperlukan
• Dua enzim penting yang terlibat :
o Adenine
phosphoribosyl
transferase
o Hypoxanthine
guanine
phosphoribosiyl
transferase
• Degradasi nukleotida
• Di dalam usus halus tjd
pemutusan ikatan fosfodiester
oleh endonuklease (pankreas) à
oligonukleotida
• Dipecah lebih lanjut dg
fosfodiesterase (ensim
exonuclease non spesifik) 
monofosfat
• Dipecah lbh lanjut
fosfomonoesterase dikenal
sebagai nukleotidase à
menghasilkan nukleosida and
orthophosphate.
• Nucleosida phosphorylaseà
menghasilkan basa dan and
ribose-1-phosphate.
• Dari mana bagian-bagian basa
nitrogen berasal?
• De novo biosynthesis of the
purine ring, from PRPP to
inosinic acid.
• De novo synthesis of pyrimidine
nucleotides.
• Metabolisme LIPID
• NEUTRAL ACYLGLYCEROLS
• Ester dari gliserol dan asam
lemak.
• Berfungsi untuk menyimpan
energi.
• Memiliki 1-3 asam lemak yang
dapat berbeda-beda.
– 1-monoacilglycerol
– 2-diacilglycerol
– 3-triacilglycerol
• Overview of lipoprotein transport
pathways and fates.
• Pemecahan TAG dari makanan
• Terjadi dalam duodenum
• Di bantu dengan adanya
• Bile salts
(emulsification)
• Alkaline medium
(pancreatic juice)
• Degradasi Asam lemak Tahap I
• Tahap pertama adalah konversi
asam lemak menjadi fattyacyl
CoA
• Proses aktivasi memerlukan
energi
• Fattyacyl CoA kemudian masuk
ke dalam mitokondria untuk
proses degradasi lebih lanjut
• Tahap II. β-Oksidasi
• Asam lemak didegradasi melalui
4 tahap yang sama
• Dua atom karbon diputuskan
setiap putaran
• Satu acetyl CoA di hasilkan
setiap putaran
• Acetyl CoA kemudian masuk ke
dalam siklus TCA untuk
menghasilkan energi
• Asam lemak merupakan
bentuk simpanan energi metabolik
yang paling efisien.
• TAG terdiri dari 3 asam
lemak dan gliserol
• TAG didegradasi oleh enzim
lipase di dalam usus halus menjadi
asam lemak dan gliserol.
• Asam lemak melewati
dinding usus halus, dan TAG
kembali disintesis dan ditransport
di dalam darah oleh chylomicrons.
• Chylomicrons terikat pada sel
lemak (adipocytes) dan TAG
didegradasi lagi menjadi asam
lemak dan gliserol
 Asam lemak masuk sel adiposa
kmdn disintesis kembali mjd
TAG dan disimpan.
 TAG di dalam adiposa
didegradasi menjadi asam lemak
sebagai respon terhadap sinyal
hormon.
 Asam lemak bergabung dengan
Co A terlebih dahulu sebelum
didegradasi.
 Degradasi asam lemak menjadi
asetil Co A terjadi dalam matriks
mitokondria.
 Karnitine membawa asam lemak
rantai panjang ke dalam
mitokondria untuk didegradasi
 4 urutan reaksi degradasi asam
lemak adalah : oxidation,
hydration, oxidation, thiolysis.
• Metabolic conversions of lipids
• Metabolisme kolesterol
• Biosintesis asam lemak
• Semua organisme dapat
mensintesis asam lemak untuk
cadangan energi jangka panjang
 dan penggunaan untuk membran
struktur.
• Dalam tubuh, kelebihan
acetylCoA diubah menjadi ester
asam lemak
• Sintesis asam lemak mirip
dengan degradasinya. Tetapi
lokasinya berbeda.