Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.

com

LECT-10
pemrosesan mRNA, kode
genetik, dan sintesis protein
Hasil Pembelajaran (LO)
Setelah mahasiswa mempelajari perkuliahan ini mahasiswa
mampu menjelaskan:

11.1 Pemrosesan mRNA (LO 10.1)

11.2 kode genetik (LO 10.2)
11.3 aspek sintesis protein (LO 10.3)
11.4 sintesis protein (LO 10.4)
 PENGOLAHAN mRNA
-Pada dasarnya tidak ada pemrosesan mRNA prokariotik; itu
dapat mulai diterjemahkan sebelum selesai ditranskripsi.

-Pada eukariota, mRNA disintesis oleh RNA Pol II sebagai

prekursor yang lebih panjang (pre-mRNA), populasi pra-
mRNA yang berbeda disebut RNA nuklir heterogen (hnRNA
).
-Protein spesifik mengikat hnRNA untuk membentuk hnRNP dan kemudian
partikel RNP nuklir kecil (snRNP) berinteraksi dengan hnRNP untuk
melakukan beberapa peristiwa pemrosesan RNA.
-Pemrosesan hnRNA eukariotik melibatkan empat peristiwa:
5- capping, 3-cleavage dan poliadenilasi, splicing dan
metilasi.

LO 10.1: Mahasiswa mampu menjelaskan pemrosesan mRNA

 PENGOLAHAN mRNA
hnRNP
-Transkrip RNA Pol II (hnRNA) kompleks dengan tiga protein hnRNP
paling melimpah, protein A, B dan C, untuk membentuk partikel
hnRNP.
-Ini berisi tiga salinan dari tiga tetramer dan sekitar 600-700
nukleotida hnRNA.
-Mereka membantu acara pemrosesan RNA.

LO 10.1: Mahasiswa mampu menjelaskan pemrosesan mRNA

 PENGOLAHAN mRNA
partikel snRNP
-Ada banyak molekul snRNA kaya urasil yang dibuat oleh RNA Pol II yang
kompleks dengan protein spesifik untuk membentuk snRNPs.
-Yang paling melimpah terlibat dalam penyambungan, dan sejumlah
besar menentukan situs metilasi di pra-rRNA.
-Protein yang mengandung urutan 5-RA(U)nGR-3' mengikat
delapan protein umum dalam sitoplasma, menjadi
hipermetilasi dan diimpor kembali ke dalam nukleus.

LO 10.1: Mahasiswa mampu menjelaskan pemrosesan mRNA

 PENGOLAHAN mRNA
Pembatasan 5'

-Ini adalah penambahan 7-

metilguanosin nukleotida
(m7G) ke ujung 5' dari
transkrip RNA Pol II ketika
panjangnya sekitar 25 nt.
-M7G, atau tutup, ditambahkan dalam
polaritas terbalik (5' hingga 5'), sehingga
bertindak sebagai penghalang terhadap
serangan 5'- exonuclease, tetapi juga
mendorong penyambungan,
pengangkutan, dan translasi.

LO 10.1: Mahasiswa mampu menjelaskan pemrosesan mRNA

 PENGOLAHAN mRNA
3' Pembelahan dan poliadenilasi
-Sebagian besar pra-mRNA eukariotik dibelah pada situs poliadenilasi dan poli(A)
polimerase (PAP) kemudian menambahkan ekor poli(A) sekitar 250 nt untuk
menghasilkan ujung 3' yang matang.

LO 10.1: Mahasiswa mampu menjelaskan pemrosesan mRNA

 PENGOLAHAN mRNA
Penyambungan

-Dalam pemrosesan pra-mRNA eukariotik, urutan intervensi

(intron) yang mengganggu daerah pengkodean (ekson)
dihilangkan (disambung), dan dua ekson yang mengapit
bergabung.
-Reaksi penyambungan ini terjadi di nukleus dan
membutuhkan intron untuk memiliki urutan 5'-GU, AG-3'
dan titik cabang.
-Dalam reaksi dua langkah, intron dihilangkan sebagai molekul
melingkar berekor, atau lariat, dan terdegradasi.
-Penyambungan melibatkan pengikatan snRNPs ke urutan yang
dilestarikan untuk membentuk spliceosome di mana reaksi
pembelahan dan ligasi berlangsung.

LO 10.1: Mahasiswa mampu menjelaskan pemrosesan mRNA

 PENGOLAHAN mRNA
Penyambungan

LO 10.1: Mahasiswa mampu menjelaskan pemrosesan mRNA

 KODE GENETIK
Alam
-Kode genetik adalah cara urutan nukleotida dalam asam
nukleat menentukan urutan asam amino dalam protein.

-Ini adalah kode triplet, di mana kodon (kelompok tiga

nukleotida) berdekatan (nonoverlapping) dan tidak
dipisahkan oleh tanda baca (tanpa koma).
-Karena banyak dari 64 kodon menentukan asam amino yang sama,
kode genetik mengalami degenerasi (memiliki redundansi).

LO 10.2: Siswa mampu menjelaskan kode genetik

 KODE GENETIK
Menguraikan
-Kode genetik standar diuraikan dengan menambahkan homopolimer,
kopolimer atau triplet nukleotida sintetik ke ekstrak sel yang mampu
translasi terbatas.
-Ditemukan bahwa 61 kodon menentukan 20 asam amino dan ada tiga
kodon stop.

LO 10.2: Siswa mampu menjelaskan kode genetik

nukleotida IUPAC asam amino IUPAC
Basis kode
Kode tiga huruf Asam amino
kode
SEBUAH ala Alanin
SEBUAH adenin C Cys Sistein
C Sitosin D asp Asam aspartat

E lem Asam glutamat

G Guanin
F Phe Fenilalanin
T (atau U) Timin (atau Urasil) G Gly glisin
H histidin
R
Miliknya
A atau G
Saya ile isoleusin
kamu C atau T K Lys Lisin

S G atau C L Leu Leusin

M metionin
W
bertemu

A atau T
N Asn asparagin
K G atau T P Pro prolin

M A atau C Q Gln Glutamin

R Arg arginin
B C atau G atau T
S Ser serin
D A atau G atau T T melalui treonin

H A atau C atau T V Val Valin

W Trp triptofan
V A atau C atau G
kamu Tiru Tirosin
N dasar apapun

- celah
 KODE GENETIK
Fitur
-Delapan belas dari 20 asam amino ditentukan oleh beberapa
(atau sinonim) kodon yang dikelompokkan bersama dalam
tabel kode genetik.
-Biasanya mereka hanya berbeda pada posisi kodon ketiga.
-Jika ini adalah pirimidin, maka kodon selalu menentukan asam
amino yang sama.
-Jika purin, maka ini biasanya juga benar.

LO 10.2: Siswa mampu menjelaskan kode genetik

 KODE GENETIK
Efek mutasi
-Pengelompokan kodon sinonim berarti bahwa efek mutasi
diminimalkan.
-Transisi di posisi ketiga sering tidak berpengaruh, seperti halnya
transversi lebih dari separuh waktu.
-Mutasi pada posisi pertama dan kedua sering menghasilkan
sejenis asam amino yang digunakan secara kimiawi.

LO 10.2: Siswa mampu menjelaskan kode genetik

 KODE GENETIK
Keuniversalan

-Sampai saat ini, kode genetik standar dianggap universal:

namun, beberapa penyimpangan sekarang diketahui terjadi
pada mitokondria dan beberapa organisme uniseluler.

LO 10.2: Siswa mampu menjelaskan kode genetik

 KODE GENETIK
ORF
-Bingkai pembacaan terbuka diduga merupakan daerah pengkode yang biasanya
diidentifikasi oleh komputer dalam DNA yang baru diurutkan.
-Mereka adalah kelompok terus menerus dari kodon yang berdekatan mengikuti
kodon awal dan berakhir pada kodon berhenti.

LO 10.2: Siswa mampu menjelaskan kode genetik

 KODE GENETIK
Gen yang tumpang tindih

-Ini terjadi ketika wilayah pengkodean satu gen sebagian atau

seluruhnya tumpang tindih dengan yang lain.
-Jadi satu kerangka baca mengkodekan satu protein, dan salah satu
kerangka lain yang mungkin mengkodekan sebagian atau seluruh
protein kedua.
-Beberapa genom virus kecil menggunakan strategi ini untuk meningkatkan
kapasitas pengkodean genom mereka.

LO 10.2: Siswa mampu menjelaskan kode genetik

 ASPEK SINTESIS PROTEIN

Interaksi kodon-antikodon

-Di itu celah dari itu

ribosom, pembentukan
antiparalel dari tiga
pasangan basa terjadi
antara kodon pada mRNA
dan antikodon pada tRNA.

-Jika 5 basis antikodon

dimodifikasi, tRNA biasanya
dapat berinteraksi dengan
lebih dari satu kodon.

LO 10.3: Mahasiswa mampu menjelaskan aspek sintesis protein

 ASPEK SINTESIS PROTEIN
Goyangan

-Hipotesis goyangan menggambarkan pasangan basa tidak standar

yang dapat terbentuk antara basa 5'-antikodon yang dimodifikasi
dan basa 3'-kodon.
-Ketika nukleosida goyangan adalah inosin, tRNA dapat berpasangan
dengan tiga kodon – yang berakhiran A, C atau U.

LO 10.3: Mahasiswa mampu menjelaskan aspek sintesis protein

 ASPEK SINTESIS PROTEIN
Situs pengikatan ribosom

Tempat pengikatan ribosom adalah urutan yang berada tepat di

hulu kodon inisiasi dalam mRNA prokariotik yang
berpasangan dengan urutan komplementer di dekat ujung 3'
dari rRNA 16S untuk memposisikan ribosom untuk inisiasi
sintesis protein.
-Hal ini juga dikenal sebagaiurutan Shine–Dalgarnosetelah
penemunya.

LO 10.3: Mahasiswa mampu menjelaskan aspek sintesis protein

 ASPEK SINTESIS PROTEIN
Polisom

-Poliribosom (polisom) terbentuk pada mRNA ketika ribosom yang

berurutan menempel, mulai menerjemahkan dan bergerak di
sepanjang mRNA.
-Polisom adalah kompleks beberapa ribosom dalam berbagai
tahap translasi pada satu molekul mRNA.

LO 10.3: Mahasiswa mampu menjelaskan aspek sintesis protein

 ASPEK SINTESIS PROTEIN
RNA inisiator

-Sebuah tRNA khusus (tRNA inisiator), mengenali kodon awal

AUG, digunakan untuk memulai sintesis protein baik pada
prokariota maupun eukariota.
-Pada prokariota, tRNA inisiator pertama kali diisi dengan
metionin oleh metionil-tRNA sintetase.
-Residu metionin kemudian diubah menjadi
Nformylmethionine oleh transformilase.
-Pada eukariota, metionin pada tRNA inisiator tidak
dimodifikasi.
-Ada perbedaan struktural antara tRNA inisiator E. coli dan
tRNA yang menyisipkan residu Met internal.

LO 10.3: Mahasiswa mampu menjelaskan aspek sintesis protein

 ASPEK SINTESIS PROTEIN
RNA inisiator

LO 10.3: Mahasiswa mampu menjelaskan aspek sintesis protein

 MEKANISME SINTESIS PROTEIN
Ringkasan

- Ada tiga tahap sintesis protein:

- inisiasi – perakitan ribosom pada mRNA;
- elongasi – siklus berulang dari pengiriman asam amino,
pembentukan ikatan peptida dan pergerakan sepanjang
mRNA (translokasi);
- terminasi – pelepasan rantai polipeptida.

LO 10.4: Mahasiswa mampu menjelaskan mekanisme sintesis protein

 MEKANISME SINTESIS PROTEIN
Inisiasi

-Pada prokariota, inisiasi membutuhkan subunit ribosom

besar dan kecil, mRNA, tRNA inisiator, tiga faktor inisiasi
(IFs) dan GTP.
-IF1 dan IF3 mengikat subunit 30S dan mencegah pengikatan subunit besar.
IF2 + GTP kemudian dapat mengikat dan akan membantu tRNA inisiator
untuk mengikat nantinya.
-Kompleks subunit kecil ini sekarang dapat menempel pada mRNA melalui
situs pengikatan ribosomnya.
-TRNA inisiator kemudian dapat berpasangan dengan kodon inisiasi
AUG yang melepaskan IF3, sehingga menciptakan kompleks inisiasi
30S.
Subunit besar kemudian mengikat, menggantikan IF1 dan IF2 +
GDP, memberikan kompleks inisiasi 70S yang merupakan
ribosom yang dirakit penuh pada posisi yang benar pada mRNA.
LO 10.4: Mahasiswa mampu menjelaskan mekanisme sintesis protein
 MEKANISME SINTESIS PROTEIN
Inisiasi

LO 10.4: Mahasiswa mampu menjelaskan mekanisme sintesis protein

 MEKANISME SINTESIS PROTEIN
Pemanjangan
-Elongasi melibatkan tiga faktor (EF), EF-Tu, EF-Ts dan EF-G,
GTP, tRNA bermuatan dan kompleks inisiasi 70S (atau yang
setara).
-Ini terjadi dalam tiga langkah.
- TRNA bermuatan dikirim sebagai kompleks dengan EF-Tu
dan GTP. GTP dihidrolisis dan EF-Tu:GDP dilepaskan yang
dapat digunakan kembali dengan bantuan EF-Ts dan GTP
(melalui siklus pertukaran EF-Tu–EF-Ts).
- Peptidil transferase membuat ikatan peptida dengan menggabungkan
dua asam amino yang berdekatan tanpa masukan lebih banyak energi.

- Translocase (EF-G), dengan energi dari GTP, menggerakkan

ribosom satu kodon di sepanjang mRNA, mengeluarkan tRNA yang
tidak bermuatan dan mentransfer rantai peptida yang sedang
tumbuh ke situs-P.
LO 10.4: Mahasiswa mampu menjelaskan mekanisme sintesis protein
 MEKANISME SINTESIS PROTEIN
Pemanjangan

LO 10.4: Mahasiswa mampu menjelaskan mekanisme sintesis protein

 MEKANISME SINTESIS PROTEIN
Penghentian

-Faktor pelepas (RF1 atau RF2)

mengenali kodon stop dan, dibantu
oleh RF3, membuat peptidil
transferase bergabung dengan
rantai polipeptida ke molekul air,
sehingga melepaskannya.
Faktor pelepasan ribosom
membantu untuk memisahkan
subunit ribosom dari mRNA.

LO 10.4: Mahasiswa mampu menjelaskan mekanisme sintesis protein

Manipulasi gen