TRANSLASI

RQA (Resume, Question, Answer)

Untuk Memenuhi Tugas Mata Kuliah Genetika I

Yang dibina oleh Prof.Dr. A Duran Corebima, M.Pd dan Prof. Dr. Siti Zubaidah, S.Pd, M.Pd

Oleh:
Kelompok 3/Off C
Inaya Setiani (170341615028)
Mileni Umi R (170341615023)

UNIVERSITAS NEGERI MALANG

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI
Maret 2019
 TRANSLASI

GAMBARAN UMUM SINTESIS PROTEIN

Langkah pertama dalam ekspresi gen, transkripsi, melibatkan transfer penyimpanan
informasi d dalam gen ke perantara RNA (mRNA), yang membawa informasi tersebut ke situs
sintesis polipeptida dalam sitoplasma. Transkripsi dibahas secara rinci dalam Bab 11. Langkah
kedua, terjemahan, melibatkan transfer informasi pada molekul mRNA ke dalam urutan asam
amino dalam produk gen polipeptida.
Terjemahan terjadi pada ribosom, yang merupakan struktur makromolekul
kompleks terletak di sitoplasma. Terjemahan melibatkan tiga jenis RNA, yang
semuanya ditranskripsi dari templat DNA (gen kromosom ). Selain mRNA, tiga hingga lima
molekul RNA (molekul rRNA) hadir sebagai bagian dari struktur setiap ribosom, dan 40 hingga
60 molekul RNA kecil ( molekul tRNA ) berfungsi sebagai adaptor dengan memediasi
penggabungan asam amino yang tepat. menjadi polipeptida sebagai respons terhadap urutan
nukleotida spesifik dalam mRNA. Asam amino terikat pada molekul tRNA yang benar oleh satu
set enzim pengaktif yang disebut aminoacyl-tRNA synthetases.
Urutan nukleotida dari molekul mRNA diterjemahkan ke dalam urutan asam amino yang
sesuai sesuai dengan dikte kode genetik. Beberapa polipeptida yang baru lahir mengandung
sekuens asam amino pendek seperti amino atau karboksil termini yang berfungsi sebagai sinyal
untuk transpornya ke dalam kompartemen seluler tertentu seperti sebagai retikulum
endoplasma, mitokondria, kloroplas , atau inti. Protein sekretor yang baru lahir , misalnya,
mengandung urutan sinyal pendek pada ujung amino yang mengarahkan polipeptida yang
muncul ke membran retikulum endoplasma. Urutan penargetan yang serupa juga terdapat pada
amino t ermini protein yang ditujukan untuk impor ke mitokondria dan
kloroplas. Beberapa protein nuc lear mengandung ekstensi penargetan di carboxyl
termini. Dalam banyak kasus, peptida penargetan dihapus secara enzimatik
oleh peptidase spesifik setelah pengangkutan protein ke kompartemen seluler yang sesuai.
Ribosom dapat dianggap sebagai meja kerja, lengkap dengan mesin dan alat yang
dibutuhkan untuk membuat polipeptida. Mereka tidak spesifik dalam arti bahwa mereka
dapat mensintesis setiap polipeptida (setiap urutan asam amino e) yang dikodekan
oleh molekul mRNA tertentu , bahkan mRNA dari spesies yang berbeda. Setiap molekul mRNA
simultan eously diterjemahkan oleh beberapa ribosom, sehingga t ia pembentukan
polyribosome, atau polysome. Dengan ikhtisar singkat tentang sintesis protein ini , kami
sekarang akan memeriksa beberapa komponen yang lebih penting dari mesin terjemahan lebih
dekat.

KOMPONEN YANG DIBUTUHKAN UNTUK PROTEIN SINTESIS: RIBOSOM

Sel-sel hidup mencurahkan lebih banyak energi untuk sintesis protein daripada aspek
lainnya metabolisme. Sekitar sepertiga dari total massa kering sel-sel tubuh terdiri dari molekul -
molekul yang berpartisipasi langsung dalam biosintesis protein. Dalam E. coli, sekitar 200.000
ribosom merupakan 25 persen dari berat kering t dari setiap sel. Komitmen ini dari proporsi
utama dari metabolisme sel untuk proses sintesis protein mendokumentasikan pentingnya
dalam bentuk kehidupan yang ada di planet kita.
Ribosom adalah sekitar setengah protein dan setengah RNA. Mereka terdiri dari dua
subunit, satu besar dan satu kecil, yang berdisosiasi ketika penerjemahan molekul mRNA selesai
dan bergabung kembali selama inisiasi terjemahan. Setiap subunit mengandung molekul RNA
besar yang terlipat tempat protein ribosom berkumpul. Ukuran ribosom paling sering ditekan
dalam hal lajusedimentasi selama sentrifugasi, di unit Svedberg (S). [Satu unit Svedberg
adalah sama dengan sien sedimentasi sien (kecepatan/gaya sentrifugal) dari
10_13 detik.] E. coli ribosom, seperti ribosom prokariota lainnya, memiliki berat
molekul 2,5 x 106 ukuran 70S, dan dimensi dari sekitar 20 nm x 25 nm. Ribosom eukariota lebih
besar (biasanya sekitar 80-an); Namun, ukuran bervariasi dari satu spesies ke spesies
lainnya. Ribosom hadir dalam mitokondria dan klor oplast sel eukariotik lebih kecil (biasanya
sekitar 60S).
Molekul RNA ribosomal, seperti molekul mRNA , adalah lapisan transkrip dari cetakan
DNA. Dalam eukariota, sintesis rRNA terjadi pada nucleolus dan dikatalisis oleh
RNA polimerase I. Nukleolus adalah komponen yang sangat khusus dari nukleus yang
dikhususkan untuk sintesis rRNA dan rakitannya menjadi ribosom. Gen RNA ribosomal hadir
secara bersamaan dalam duplikasi dipisahkan oleh daerah sperer intergenik . Transkripsi set
tandem gen rRNA ini dapat divisualisasikan dengan mikroskop elektron.
Beberapa salinan gen untuk rRNA hadir dalam genom semua organisme yang telah
dipelajari hingga saat ini. Redundansi gen rRNA ini tidak mengejutkan mengingat sejumlah
besar ribosom hadir per sel. Pada E. coli, tujuh gen rRNA ( rrnA — rrnE, rrnG, rrnH )
didistribusikan di antara tiga situs berbeda pada kromosom. Pada eukariota, gen rRNA hadir
dalam jumlah kurang dari ribuan salinan. Gen 5,8S-18S-28S rRNA dari eukariota hadir dalam
susunan tandem di daerah pengatur nukleolus dari kromosom. Pada beberapa eukariota, seperti
jagung, ada satu pasang pengatur nukleolar (pada kromosom 6 pada jagung). Di Drosophila dan
kodok cakar Afrika Selatan, Xenopus laevis, kromosom seks membawa
penyelenggara olar inti. Manusia memiliki lima pasang pengatur eolar nukle yang terletak
pada lengan pendek kromosom 13, 14, 15, 21, dan 22. Gen 5S rRNA pada eukariota tidak
terletak di daerah pengatur nukleol. Ins tead, mereka didistribusikan melalui beberapa
kromosom. Namun, gen 5S rRNA sangat berlebihan, seperti halnya gen rRNA 5.8S-18S-28S.
KOMPONEN YANG DIPERLUKAN UNTUK SINTESIS PROTEIN: RNA TRANSFER
Meskipun ribosom menyediakan banyak komponen yang diperlukan untuk sintesis
protein, dan kation spesifik untuk setiap polipeptida disandikan dalam molekul
mRNA, terjemahan pesan mRNA yang dikodekan ke dalam urutan asam amino dalam
polipeptida membutuhkan satu kelas tambahan dari molekul RNA, molekul RNA transfer
(tRNA). Pertimbangan kimia menunjukkan bahwa tindakan antar langsung antara asam
amino dan kembar tiga nukleotida atau kodon dalam mRNA kemungkinan besar terjadi. Jadi,
pada tahun 1958, Francis Crick mengusulkan bahwa beberapa jenis molekul adaptor harus
memediasi spesifikasi asam amino oleh kodon dalam mRNAs selama tesis protein . Molekul
adaptor segera diidentifikasi oleh peneliti lain dan terbukti menjadi molekul RNA kecil (4S, 70-
95 nukleotida ). Molekul-molekul ini, pertama-tama disebut molekul RNA (sRNA) terlarut dan
selanjutnya mentransfer molekul RNA (tRNA) , mengandung sekuens nukleotida triplet ,
antikodon, yang saling melengkapi dan berpasangan dengan sekuens kodon dalam mRNA
selama penerjemahan. Ada pada e hingga empat tRNA untuk masing-masing dari 20 asam
amino.
Asam amino melekat pada tRNA dengan ikatan energi tinggi (sangat
reaktif) (disimbolkan ~) antara gugus karboksil dari asam amino dan 3 '-hidroksil termini dari
tRNA. TRNA diaktifkan atau diisi dengan asam amino dalam a proses dua langkah,
dengan kedua reaksi dikatalisis oleh enzim yang sama, aminoasil-tRNA sintetase. Setidaknya
ada satu hetase sintaks aminoasil-tRNA untuk masing-masing dari 20 asam amino. Langkah
pertama dalam sintesis aminoasil-tRNA melibatkan aktivasi asam amino menggunakan energy
dari adenosin triphosphate (ATP):

Asam amino ~ AMP intermediate biasanya tidak dilepaskan dari enzim sebelumnya menjalani
langkah kedua dalam aminoacyl-tRNA synth esis, yaitu reaksi dengan tRNA yang sesuai:

Asam aminoasil ~ tRNA adalah substrat untuk sintesis polipeptida pada ribosom masing-
masing tRNA yang diaktifkan mengenali kodon mRNA yang benar dan menyajikan asam amino
dalam konfigurasisterik (struktur tiga dimensi) yang memfasilitasi pembentukan ikatan peptida .
TRNA ditranskripsi dari gen. Seperti dalam kasus rRNA, tRNA ditranskripsikan dalam
bentuk molekul-molekul prekursor yang lebih besar yang menjalani pemrosesan pasca-
transkripsional(pembelahan, pemangkasan, metilasi, dan sebagainya). Molekul tRNA
dewasa mengandung beberapa nukleosida yang tidak p ada dalam transkrip gen tRNA
primer . Nukleosida yang tidak biasa ini, seperti inosin, pseudouridin, dihidrouridin, 1-metil
guanosin, dan beberapa lainnya, diproduksi oleh post-transkripsi, modifikasi kation yang
dikatalisis oleh enzim dari empat nukleosid yang dimasukkan ke dalam RNA selama transkripsi.
Karena ukurannya yang kecil ( panjangnya paling banyak 70-95 nuc leotides),
tRNA lebih cocok untuk analisis struktural daripada yang lain, molekul molekul RNA yang
terlibat dalam sintesis protein lebih kecil. Persamaan nukleotida lengkap dan struktur semanggi
yang diusulkan dari alanine tRNA ragi diterbitkan oleh Robert W. Holley dan rekan-rekannya
pada tahun 196 ; Holley membagikan Hadiah Nobel 1968 di bidang Fisiologi atau Kedokteran
untuk pekerjaannya. Struktur tiga dimensi dari tRNA fenilalanin dari ragi ditentukan oleh studi
difraksi sinar-X pada tahun 1974. Antikodon dari masing-masing tRNA terjadi dalam satu
lingkaran (daerah non-hidrogen ) dekat bagian tengah molekul.
Harus jelas bahwa molekul tRNA harus mengandung yang besar kesepakatan kota
tertentu meskipun si ze kecil mereka . Mereka tidak hanya harus (1) memiliki urutan antikodon
yang benar, sehinggauntuk menanggapi kodon yang tepat, tetapi mereka juga harus (2)
dikenali oleh sintetase aminoasil-tRNA yang benar , sehingga mereka diaktifkan dengan amino
yang benar asam, dan (3) mengikat ke situs yang sesuai pada ribosom untuk menjalankan fungsi
adaptor mereka.

TERJEMAHAN: SINTESIS POLYPEPTIDES MENGGUNAKAN TEMPLAT mRNA

Molekul mRNA memberikan spesifikasi untuk urutan asam amino dari produk gen
polipeptida. Ribosom menyediakan banyak komponen makromolekul yang diperlukan untuk
proses penerjemahan. TRNA menyediakan molekul adaptor yang diperlukan untuk memasukkan
asam amino ke dalam polipida sebagai respons terhadap kodon dalam mRNA. Selain itu,
beberapa protein larut berpartisipasi dalam proses. Penerjemahan urutan nukleotida
dalam molekul mRNA ke dalam urutan asam amino dalam produk polipeptida dapat dibagi
menjadi tiga tahap: (1) inisiasi rantai polipeptida , (2) perpanjangan rantai, dan (3) pemutusan
rantai.
Terjemahan: Inisiasi Rantai Polipeptida
Inisiasi terjemahan mencakup semua peristiwa yang mendahului pembentukan
peptida ikatan antara dua asam amino pertama dari rantai peptida poli baru. Meskipun
beberapa aspek dari proses inisiasi adalah sama dalam proka ryote dan eukaryotes, ada
yang berbeda. Oleh karena itu, pertama-tama kita akan memeriksa inisiasi rantai polipeptida
pada E. coli, dan kemudian kita akan melihat aspek unik inisiasi translasi dalam eukariota.
Dalam E. coli, proses inisiasi melibatkan subunit 30S dari ribosom, khusus inisiator tRNA,
molekul mRNA, tiga faktor inisiasi protein terlarut : IF-1, IF-2, dan IF-3, dan satu molekul
GTP.
Terjemahan terjadi pada 70S ribosom, tetapi ribosom berdisosiasi menjadi 30S dan 50S
subunit mereka setiap kali mereka menyelesaikan sintesis rantai polipeptida. Pada tahap pertama
inisiasi terjemahan, subunit 30S bebas berinteraksi dengan molekul m RNA
dan faktor inisiasi . Subunit 50S bergabung dengan kompleks untuk membentuk ribosom 70S
dalam langkah terakhir dari proses inisiasi.
Sintesis polipeptida dimulai oleh tRNA khusus, yang disebut tRNAf Met , sebagai respons
terhadap kodon inisiasi terjemahan (biasanya AUG, kadang-kadang GUG). Karena itu,
semua polipeptida dimulai dengan metionin selama sintesis. Metinin o-terminal amin selanjutnya
dibelah dari banyak polipeptida. Jadi , protein fungsional tidak perlu memiliki metionin amino-
terminal. Metionin pada inisiator tRNAfMet memiliki gugus amino

diblokir dengan formyl grup (dengan demikian subskrip "f"

pada tRNA f Met ). Metionin tRNA yang berbeda, tRNAMet , merespons kodon metionin
internal. Kedua tRNA metionin memiliki antikodon yang sama, dan keduanya merespons kodon
yang sama (AUG) untuk metioni ne. Namun, hanya methionyl- tRNA f Bertemu di terak
dengan faktor inisiasi protein IF-2 untuk memulai proses inisiasi (Gambar 1 2.16). Jadi, hanya
methionyl- tRNAfMet mengikat ribosom sebagai respons terhadap kodon inisiasi AUG dalam
mRNA, meninggalkan metionil-tRNAMetuntuk mengikat sebagai respons terhadapkodon AUG
internal. Metionil - tRNA f Met juga mengikat ribosom sebagai respons terhadap kodon inisiator
alternatif, GUG (kodin valin bila ada pada posisi internal), yang terjadi pada beberapa molekul
mRNA.
Inisiasi rantai polipeptida dimulai dengan pembentukan dua kompleks: (1) satu
mengandung inisiatio n factor IF-2 dan metionyl- tRNAf Met , dan (2) yang lain berisi molekul
mRNA, subunit osomal iga 30S, dan faktor inisiasi IF-3 (Gambar 12.16 ). Kompleks subunit /
mRNA 30S hanya akan terbentuk dengan adanya IF-3; dengan demikian, IF-3 mengontrol
kemampuan dari subunit 30S untuk memulai proses inisiasi . Pembentukan kompleks subunit /
mRNA 30S sebagian tergantung pada pasangan-pasangan antara a urutan nukleotida di dekat
ujung 3' dari 16S rRNA dan urutan di dekat 5' akhir molekul mRNA (Gambar 12.17). mRNA
Prokariota mengandung saluran polypurine dilestarikan, konsensus AGGAGG,
terletak pertarungan tujuh nukleotida hulu dari inisiasi Agustus kodon. Hexamer yang
dilestarikan ini, disebut Shine-Dalgarno urutan setelah para ilmuwan yang
menemukannya, melengkapi urutan dekat 3 ' ujung RNA ribosom 16S. Ketika urutan Shine-
Dalgarno dari mRNA dimodifikasi secara eksperimental sehingga mereka tidak lagi berpasangan
dengan rRNA 16S, mRNA yang dimodifikasi tidak diterjemahkan d atau diterjemahkan dengan
sangat tidakefisien, menunjukkan bahwa pasangan pemasangan berbasis ini
memainkan peran penting dalam terjemahan.
IF-2 / methionyl- tRNAfMet kompleks dan subunit mRNA / 30S / kompleks IF-
3 kemudian bergabung satu sama lain dan dengan faktor inisiasi IF-1 dan satu molekul GTP
untuk membentukkompleks inisiasi 30S yang lengkap. Langkah terakhir dalam inisiasi
terjemahan adalah penambahan sub-unit 50S ke kompleks inisiasi 30S untuk menghasilkan
ribosom 70S yang lengkap. Initiation fa ctor IF-3 harus dilepaskan dari kompleks sebelum
subunit 50S dapat bergabung dengan co mplex; IF-3 dan subunit 50S tidak pernah ditemukan
terkait dengan subunit 30S secara bersamaan. Penambahan subunit 50S membutuhkan energi
dari GTP dan kemudahan rel faktor inisiasi IF-1 dan IF-2.
Penambahan subunit ribosom 50S ke posisi kompleks inisiator tRNA, metionyl-
tRNAfMet, di situs peptidil (P) dengan antikodon tRNA yang disejajarkan dengan kodon inisiasi
AUG dari mRNA. Methionyl-tRNA f Met adalah satu-satunya aminoasil-tRNA yang dapat
memasuki situs P secara langsung, dengan terlebih dahulu melewati situs aminoasil (A). Dengan
inisiator AUG diposisikan di situs P, kodon kedua mRNA didaftarkan pada situs A,
mendikte kota spesifik pengikatan aminoasil-tRNA di situs tersebut dan menetapkan tahap
untuk fase kedua dalam sintesis polipeptida, perpanjangan rantai.
Inisiasi terjemahan lebih kompleks pada eukariota, yang melibatkan beberapa soluble
faktor inisiasi. Namun demikian, keseluruhan prosesnya serupa kecuali untuk dua fitur. (1)
Kelompok amino metionin pada i nitiator tRNA tidak diformilasi seperti pada prokariota. (2)
Kompleks inisiasi terbentuk pada jam 5 ' akhir mRNA, bukan di situs awal terjemahan Shine-
Dalgarno / AUG seperti pada E. coli . Pada eukariota, kompleks inisiasi scan mRNA, mulai di
5' akhirnya, mencari kodon-inisiasi terjemahan AUG . Dengan demikian, dalam eukariota,
trans lation sering dimulai pada AUG terdekat dengan terminal 5' dari molekul mRNA ,
meskipun efisiensi yang diberikan AUG digunakan untuk memulai penerjemahan
bergantung pada urutan nukleotida yang berdekatan . Urutan inisiasi optimal adalah 5'-GCC (A
atau G) CC AUG G-3'. The purin (A atau G) tiga basis hulu dari kodon Agustusinisiator dan G
segera mengikutinya adalah yang paling penting — memengaruhi efisiensi itiasi sebesar sepuluh
kali lipat atau lebih. Perubahan basis lain dalam urutan menyebabkan penurunan efisiensi inisiasi
yang lebih kecil . Urutan persyaratan ini untuk inisiasi terjemahan optimal dalam prokariota
disebut aturan Kozak ini, setelah Marilyn Kozak, yang pertama kali diusulkan mereka.
 Seperti prokariota, eukariota mengandung inisiator khusus tRNA, tRNAiMet ("I" untuk
inisiator), tetapi gugus amino dari metionyl-tRNAiMet tidak diformat. Inisiator methio nyl-
tRNA iMet berinteraksi dengan faktor inisiasi yang larut dan memasuki situs P secara langsung
selama proses inisiasi, seperti pada E. coli . Pada eukariota, protein pengikat tutup (CBP)
berikatan dengan 7-metil guanosin pada ujung 5' dari mRNA. Kemudian, inisiati lain pada
faktor-faktor berikatan dengan kompleks CBP-mRNA , diikuti oleh subunit kecil (40S)
dari ribosom. Seluruh kompleks inisiasi bergerak 5'→ 3 'di sepanjang molekul mRNA, mencari
kodon AUG. Ketika triplet AUG ditemukan, faktor inisiasi terlepas dari kompleks, dan subunit
besar (60S) berikatan dengan kompleks subunit metionil -tRNA / mRNA / 40S, membentuk
ribosom (80S) lengkap. Kompleks ribosom / mRNA / tRNA 80 S siap untuk memulai fase kedua
terjemahan, rantai informasi. Coba Selesaikan: Kontrol Terjemahan di Eukaryotes untuk
mengeksplorasi proses ini lebih lanjut.

Terjemahan: Pemanjangan Rantai Polipeptida

Proses perpanjangan rantai polipeptida pada dasarnya sama di kedua prokariota dan
eukariota. Penambahan setiap asam amino ke pol ypeptide yang tumbuh terjadi dalam tiga
langkah: (1) pengikatan aminoacyl-tRNA ke situs A ribosom, (2) transfer rantai polipeptida yang
sedang tumbuh dari tRNA di situs P ke tRNA di situs A dengan pembentukan peptida baru , dan
(3) translokasi ribosom sepanjang mRNA untuk memposisikan kodon berikutnya
di situs A . Selama langkah 3, polypeptide-tRNA yang baru lahir dan tRNA yang tidak
bermuatan ditranslokasi dari situs A dan P ke situs Pdan E , masing-masing . Ketiga langkah
ini diulang secara siklik selama elongati dalam proses. Faktor terlarut yang terlibat dalam
perpanjangan rantai pada E. coli dijelaskan dia kembali. Faktor serupa
berpartisipasi dalam perpanjangan rantai pada eukariota.
Langkah pertama, RNA aminoasil-t masuk dan menjadi terikat pada situs A dari ribosom,
dengan kota sp ecifi yang disediakan oleh kodon mRNA dalam register dengan situs A (Figur e
12,18).Tiga nukleotida dalam antikodon dari aminoasil-tRNA yang masuk harus berpasangan
dengan nukleotida dari kodon mRNA yang ada di situs A. Langkah ini membutuhkan faktor
perpanjangan Tu yang membawa molekul GTP (EF-Tu.GTP). GTP diperlukan untuk ikatan
aminoasil-tRNA di situs A tetapi tidak dibelah sampai ikatan peptida
terbentuk. Setelah pembelahan GTP, EF-Tu.GDP dilepaskan dari ribosom. EF-Tu.GD P tidak
aktif dan tidak akan berikatan dengan aminoasil-tRNA. EF-Tu.GDP adalah co nverted
ke bentuk EF-Tu.GTP aktif oleh faktor elongasi Ts (EF-Ts), w hich menghidrolisis satu
molekul GTP dalam proses. EF-Tu berinteraksi dengan semua aminoasil-tRNA kecuali metionil-
tRNA.
Langkah kedua dalam elongasi rantai adalah pembentukan ikatan peptida antara gugus
amino dari aminoasil-tRNA di situs A dan ujung karboksil dari rantai polipeptida sayap gro
yang melekat pada tRNA di situs P. Uncou ini Ples rantai tumbuh dari tRNA di situs P dan
kovalen bergabung dengan rantai ke tRNA di situs A (Gambar 12.18). Reaksi kunci ini
dikatalisis oleh peptidil transferase, suatu aktivitas enzimatik yang dibangun ke dalam subunit
50S dari ribosom. Kita harus mencatat bahwa aktivitas transferase peptidil berada di dalam
kolega rRNA 23S daripada dalam protein ribosom , mungkin peninggalan lain dari dunia
berbasis RNA awal. Peptida pembentukan ikatan membutuhkan hidrolisis molekul GTP
yang dibawa ke ribosom oleh EF-Tu pada langkah 1.
Selama langkah ketiga dalam rantai perpanjangan, peptidil-tRNA hadir di situs A dari
ribosom adalah translokasi ke situs P, dan t RNA bermuatan di situs P translokasi
ke situs E, sebagai ribosome bergerak tiga nukleotida menuju ujung 3 ' dari molekul mRNA
m . Langkah translokasi membutuhkan GTP dan elongation factor G (EF-G). Ribosom
mengalami perubahan konformasi selama proses trokasi, menunjukkan bahwa ia
mungkin berpindah sepanjang molekul mRNA. Energi untuk pergerakan ribosom disediakan
oleh hidrolisis GTP. Translokasi peptidil-tRNA
dari situs A ke situs P meninggalkan Sebuah situs unocc upied dan ribosom siap
untuk memulai siklus berikutnya rantai perpanjangan.
Perpanjangan satu polipeptida eukariotik, sutera protein fi broin, dapat
divisualisasikan dengan mikroskop elektron dengan menggunakan teknik yang dikembangkan
oleh Oscar Miller, Barba raHamkalo, dan rekan. Sebagian besar protein terlipat di
permukaan ribosom selama sintesis. Namun, fibroin tetap memanjang dari permukaan ribosom
dalam kondisi yang digunakan oleh Mil dan rekan kerja.Akibatnya, rantai polipeptida yang baru
lahir dari bertambahnya panjang dapat terlihat melekat pada ribosom saat dipindai dari
5' ujung mRNA ke ujung 3'. Fibroin adalah protein besar dengan massa lebih dari 200.000
dalton; itu disintesis pada polyribosom besar yang mengandung 50 hingga 80 ribosom.
 Perpanjangan rantai polipeptida berlangsung dengan cepat. Dalam E. coli, ketiga langkah
yang diperlukan untuk menambahkan satu asam amino ke rantai polipeptida tumbuh terjadi
sekitar 0,05 detik.Dengan demikian, sintesis mengandung polipeptida 300 asam amino hanya
membutuhkan waktu sekitar 15 detik. Mengingat kerumitannya, akurasi dan efisiensi aparatur
penerjemahan memang luar biasa.

Terjemahan: Pemutusan Rantai Polipeptida

Perpanjangan rantai polipeptida mengalami pemutusan ketika salah satu dari
tiga pemutusan rantai kodon (UAA, UAG, atau UGA) memasuki situs A pada ribosom
( Gambar 12.20 ). Ini tiga kodon stop dikenali oleh protein larut yang disebut faktor pelepas
(RF). Di E. coli, ada dua faktor pelepasan, RF-1 dan RF-2. RF-1 mengakui pemutusan hubungan
kerja kodon UAA dan UAG; RF-2 mengenali UAA dan UGA. Dalam eukariota, satu release
factor ( eRF ) mengenali ketiga kodon terminasi. Kehadiran rilis faktor dalam situs A mengubah
aktivitas peptidyl transferase sehingga menambahkan air molekul ke ujung karboksil dari
polipeptida yang baru lahir. Reaksi ini dilepaskan polipeptida dari molekul tRNA di situs P dan
memicu translokasi dari tRNA gratis ke situs E. Pengakhiran selesai dengan rilis mRNA molekul
dari ribosom dan disosiasi ribosom ke dalam subunitnya. Subunit ribosom kemudian siap untuk
memulai babak lain sintesis protein, seperti yang dijelaskan sebelumnya.

QUESTION
1. Mengapa ribosom berperan penting dalam proses translasi ?

ANSWER
1. Ribosom merupakan suatu partikel, molekul, atau juga organel yang terdiri dari protein
serta asam ribonukleat (RNA) yang bekerja secara bersama-sama dalam sintesis protein.
Dengan kata lain, ribosom merupakan tempat untuk sintetis protein. Ribosom memiliki
ukuran yang kecil, dimana organel padat ini memiliki diameter yang hanya mencapai 20
nanometer saja. Ribosom merupakan struktur berbentuk bulat yang bisa dijumpai dalam
sitoplasma sel prokariotik dan sel eukariotik. Beberapa jenis ribosom terjadi secara bebas
di dalam sitosol, dan beberapa jenis yang lain melekat pada retikulum endoplasma (RE)
yang kasar atau yang juga disebut sebagai membran nuklir.
proses penerjemahan urutan nukleotida yang terdapat pada molekul mRNA menjadi
rangkaian asam amino penyusun protein atau polipeptida. Ini adalah salah satu proses
utama yang dapat menghubungkan gen ke protein, selain proses transkripsi. Proses ini
hanya terjadi pada molekul mRNA, sedangkan molekul lain seperti rRNA dan tRNA
tidak mengalami proses translasi. mRNA merupakan salinan urutan DNA, yang dalam
proses ini molekul tesebut menyusun gen dalam bentuk kerangka baca terbuka. Selain itu,
mRNA juga menyampaikan informasi urutan asam amino. Ribosom merupakan tempat
dimana proses translasi ini berlangsung