SINTESIS PROTEIN (TRANSLASI)

RESUME
untuk memenuhi tugas mata kuliah Genetika I
yang dibimbing oleh Prof. Dr. A. Duran Corebima, M.Pd.

Kelompok 14
Offering B
Anggota:
Didik Dwi Prastyo
130341624788
Imroatun Hasana
130341614818

UNIVERSITAS NEGERI MALANG

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
JURUSAN BIOLOGI
Februari 2015

Translasi
Translasi merupakan proses di mana informasi genetik (yang
disimpan

dalam urutan nukleotida

dalam sebuah molekul

mRNA)

diterjemahkan. Setelah uraian kode genetik, dalam urutan asam amino berada
didalam polipeptida gen-produk yang kompleks. Hal tersebut membutuhkan
fungsi sejumlah besar molekules makro. Ini termasuk (1) lebih dari 50
polipeptida dan dari 3 sampai 5 molekul RNA hadir di setiap ribosom
(komposisi yang tepat bervariasi dari spesies ke spesies), (2) paling sedikit 20
amino acid-activiting enzim (amynoacyl-tRNA sintetase), (3 ) 40 sampai 60
molekul tRNA yang berbeda, dan (4) setidaknya 9 protein larut terlibat dalam
inisiasi rantai polipeptida, elongasi, dan terminasi. Karena banyak dari
makromolekul ini, terutama komponen ribosom, yang hadir dalam kuantitas
besar dalam setiap sel, sistem penerjemahan membuat sebagian besar dari
mesin metabolisme setiap sel (Gardner, 1984).
Proses penerjemahan terjadi pada ribosom. Struktur makromolekul
kompleks terletak di sitoplasma. Translasi melibatkan tiga jenis RNA, yang
semuanya ditranskripsi dari DNA template (gen kromosom). Selain mRNA, 3
sampai 5 RNA molekul (molekul rRNA) yang hadir sebagai bagian dari
struktur masing-masing ribosom, dan 40-60 macam (seukuran 70-80
nukleotida) molekul RNA (molekul tRNA) berfungsi sebagai mediasi
penggabungan asam amino yang tepat dalam menanggapi kodon spesifik di
mRNA. Ribosom dapat dianggap sebagai workbenches, lengkap dengan
mesin dan peralatan yang diperlukan untuk membuat polipeptida. Mereka
nonspesifik dalam arti bahwa mereka dapat mensintesis setiap polipeptida
(setiap urutan asam amino) yang ditentukan oleh molekul mRNA tertentu.
Mengingat gambaran dangkal sintesis protein ini,

Gambar 1.1 Skema diagramatik sintesis protein (Snustad, 2012).

Penelitian awal menggunakan pulse-label (dengan asam amino
radioaktif) dan autoradiografi menunjukkan bahwa protein disintesis sebagian
besar dalam sitoplasma di dalam bentukan kecil, tapi kompleks, struktur
makromolekul yang disebut ribosom. Pada prokariota, ribosom didistribusikan
di seluruh sel; pada eukariota, mereka berada dalam sitoplasma. Mereka terdiri
dari dua subunit, satu besar dan satu kecil, yang memisahkan ketika
terjemahan dari molekul mRNA selesai. Ukuran ribosom yang paling sering
dinyatakan dalam tarif mereka sedimentasi selama sentrifugasi, dalam satuan
yang disebut S atau unit Svedberg. Ribosom E.coli, seperti yang terdapat pada
kenayakan prokariot, Memiliki berat molekul 2.7x106 dan "ukuran" dari
"70S". Ribosom dari eukayotes besar (biasanya sekitar 80S). Namun, ukuran
bervariasi dari spesies ke spesies. Ribosom hadir dalam organel (mitokondria
dan kloroplas) sel eukariotik yang kecil (biasanya sekitar 60S) (Gardner,
1984).
Dalam semua kasus, masing-masing ribosom terdiri dari dua subunit.
Dalam kasus E.coli, yang kecil (30S) subunit ribosom mengandung 16S (mol.
Wt. Tentang 6x105) molekul RNA ditambah 21 polipeptida yang berbeda, dan

besar (50S) subunit mengandung dua molekul RNA (5S, mol. Wt. Tentang
4x104, dan 23S, mol. Wt. Tentang 1.2x106) ditambah 31 polipeptida. Dalam
ribosom eukariotik, subunit kecil berisi 18S (ukuran rata-rata) molekul RNA
dan subunit besar berisi 5S, sebuah 5,8S dan 28S (ukuran rata-rata) molekul
RNA. Ribosom pada Drosophila juga tampak mengandung molekul RNA 2S
kecil. Di organel, ukuran rRNA yang sesuai adalah 5S, 13S, 21S (Gardner,
1984).
Dalam kasus E.coli, M. Nomura dan
rekan-rekannya

telah mampu

sepenuhnya

memisahkan subunit 30S ribosom ke dalam

makromolekul

individu

dan

kemudian

menyusun kembali 30S subunit fungsional dari

komponen. Hal ini memungkinkan mereka
untuk mempelajari fungsi (s) dari RNA dan
protein molekul individu (Gardner, 1984).
Molekul-molekul

RNA

ribosom

ditranskripsi dari template DNA, seperti

molekul mRNA. Pada eukariota, sintesis
rRNA terjadi di nukleus dan dikatalisis oleh
RNA polimerase khusus hadir hanya dalam
nukleolus. Terlebih lagi, transkripsi gen rRNA
menghasilkan rRNA prekursor yang lebih
besar dari molekul RNA ditemukan dalam
ribosom. Prekursor rRNA menjalani proses
posttranscriptional

untuk

menghasilkan

molekul rRNA yang terlibat dalam terjemahan.

Di

E.coli,

rRNA transkrip

gen

adalah

prekursor 30S, yang mengalami pembelahan

oleh endoribonucleases untuk menghasilkan 5S, 16S rRNA 28S Dan ditambah
4S molekul RNA transfer. Pada eukariota, 2S (saat sekarang), 5,8S, 18S, 28S
rRNA dan dipotong dari 40S rRNA 45S ke (tergantung pada spesies)
prekursor, sedangkan 5S rRNA dihasilkan oleh pengolahan posttranscriptional

dari transript gen yang terpisah.Selain pemecahan posttranscriptional dari

rRNA prekursor, metilasi posttranscriptional dari banyak nukleotida dalam
rRNA terjadi. Metilasi melindungi molekul rRNA dari ribonucleases
intraseluler yang terlibat dalam degradasi mRNA; Fungsi pastinya belum
jelas, namun beberapa salinan dari gen untuk rRNA yang hadir dalam genom
dari semua organisme dipelajari untuk saat ini. Hal ini tidak mengherankan
mengingat sejumlah besar ribosom hadir pada setiap sel. Di E.coli, ada
diperkirakan 5-10 salinan rRNA (RRN) gen, dengan setidaknya satu salinan di
masing-masing tiga lokasi yang berbeda pada kromosom tersebut. Pada
eukariota, gen rRNA yang hadir dalam ratusan hingga ribuan eksemplar. The
5,8S-18S rRNA 28S-gen eukariota yang hadir dalam duplikasi tandem di
daerah penyelenggara nukleolus dari kromosom. Dalam beberapa eukariota,
seperti jagung, ada satu pasang penyelenggara nukleolus (pada pasangan
kromosom 6 pada jagung). Manusia, memiliki lima pasang penyelenggara
nukleolus, yang terletak di lengan pendek kromosom 13,14,15,21, dan 22.
penelitian yang cermat menunjukkan bahwa ada sekitar 500 eksemplar dari
5,8S-18S-28S gen rRNA nukleolus di Xenopus laevis. Tingkat yang sama
redundansi telah diperkirakan penghematan di beberapa hewan lain. Tanaman
menunjukkan variasi yang lebih besar dalam rRNA redundansi gen, dengan
beberapa ribu eksemplar hadir di beberapa genom. Intraspesies variasi dalam
jumlah rRNA redundansi gen juga telah didokumentasikan dalam beberapa
spesies (Gardner, 1984).
Gen 5S rRNA pada Eukariota yang tidak terletak di daerah
nukleolus. Sebaliknya, mereka biasanya didistribusikan ke beberapa
kromosom. Mereka sangat berlebihan, seperti gen 5,8S-18S rRNA 28S-.
Walaupun ribosom menyediakan tempat yang diperlukan untuk sintesis
protein, dan spesifikasi untuk setiap polipeptida yang dikodekan dalam
molekul mRNA, terjemahan dari pesan mRNA terkode menjadi urutan asam
amino dalam apolypeptide membutuhkan satu kelas tambahan molekul RNA,
transfer RNA (tRNA) molekul. Pertimbangan kimia menunjukkan bahwa
interaksi langsung antara asam amino dan urutan nukleotida atau kodon pada
mRNA (kodon adalah urutan nucleotid dalam mRNA yang menentukan

penggabungan satu asam amino) tahun 1958. Oleh karena itu Crick
mengusulkan bahwa beberapa jenis dari "adapter" molekul asam amino yang
menengahi kodon pengakuan selama sintesis protein. The "adapter" molekul
segera diidentifikasi dan ditemukan untuk menjadi kecil (4S, 70-80 nukleotida
panjang) molekul RNA. Molekul-molekul ini, pertama kali disebut "RNA
larut" (Srna) molekul dan kemudian mentransfer RNA (tRNA) molekul,
mengandung urutan basa triplet, yang disebut urutan antikodon, yang
melengkapi dan mengakui urutan kodon dalam terjemahan mRNA. Ada dari
satu sampai empat tRNA dikenal untuk setiap asam amino (Gardner, 1984).

Gambar 1.3 Transkripsi dari gen E.coli yang menghasilkan 30s rRNA
prekursor (Snustad, 2012).
Asam amino yang melekat pada tRNA dengan energi tinggi (sangat
reaktif) ikatan antara gugus karboksil dari asam amino dan termini 3'-hidroksil
dari tRNA. Aminoasil tRNA ini reaktif terbentuk dalam dua-langkah proses,
baik langkah yang dikatalisasi oleh spesifik "mengaktifkan enzim" atau
aminoasil-tRNA sintetase. Ada setidaknya satu aminoasil-tRNA sintetase
untuk masing-masing 20 asam Amino. Langkah pertama dalam sintesis
aminoasil-tRNA melibatkan aktivasi asam amino menggunakan energi dari
Adenosin trifosfat (ATP): Asam amino - AMP intermadiate biasanya tidak
dilepaskan dari enzim sebelum menjalani langkah kedua dalam aminoasiltRNA

sintesis,

yaitu

reaksi

dengan

tRNA

yang

sesuai:

Aminoasil-tRNA (asam amino -tRNAs) adalah prekursor langsung sintesis

polipeptida pada ribosom, dengan masing-masing tRNA diaktifkan kodon

mRNA dan penyajian asam amino dalam konfigurasi sterik (struktur tiga
dimensi) yang memfasilitasi pembentukan ikatan peptide (Gardner, 1984).
Asam amino diikat pada tRNA oleh ikatan energi tinggi (sangat
reaktif) antara kelompok karboksil dari asam amino dan ujung 3-hidroksil
dari tRNAs. Aminoasil tRNAs yang reaktif ini dibentuk dalam 2 tahap, kedua
tahap dikatalisis oleh enzim pengaktivasi yang spesifik yaitu aminoacyltRNA synthetase. Terdapat paling sedikit satu aminoacyl-tRNA sinthetase
untuk setiap 20 asam amino. Tahap pertama yaitu sintesis aminoacyl-tRNA
melibatkan aktivasi dari asam amino menggunakan energi dari ATP (Gardner,
1984).

Intermediet asam amino-AMP secara normal tidak dilepaskan dari enzim

sebelum melalui tahap kedua pada sintesis aminoacyl-tRNA, reaksi dengan
tRNA yang tepat:

Aminoacyl-tRNAs (asam amino-tRNAs) merupakan perekursor intermediet

dari sintesis polipeptida pada ribosom, dengan masing-masing diaktivasi oleh
tRNA yang mengenali kodon mRNA yang tepat dan menghasilkan asam
amino dalam konfigurasi sterik (struktur tiga dimensi) yang memfasilitasi
pembentukan ikatan peptida (Gardner, 1984).

Gambar 1.4 Susunan dari Ikatan Peptida antara Dua Asam Amino (Snustad,
2012).

Gambar 1.5 Struktur Tiga Dimensional dari Protein (Snustad, 2012).

tRNAs ditranskrip dari gen kromosomal. tRNAs ditranskrip dalam
bentuk molekul precursor besar yang menjalani proses posttranskripsional
(pembelahan, trimming, metilasi dan sebagainya). Molekul tRNA dewasa
mengandung beberapa nukleosida yang tidak terdapat pada mRNA atau
transkrip gen tRNA primer. Nukleosida yang tidak biasa ini, seperti inosin,
pseudoridin, dihidroridin, 1-metilguanosin, dan lainnya dihasilkan oleh
posttranskripsional, enzim yang mengkatalisis modifikasi dari 4 nukleosida
disatukan menjadi RNA saat transkripsi (Gardner, 1984).
tRNAs ukurannya kecil, panjangnya 70-80 nukleotida. Sekuen
nukleotida lengkap dengan struktur cloverleaf dari tRNA alanin ragi
diusulkan oleh R.W. Holley dan koleganya tahun 1965. Semenjak itu, banyak
tRNAs telah dirangkai, gen tRNA alanin ragi telah disintesis secara in vitro
dari mononukleotida oleh H.G. Khorana dan timnya. Struktur tiga dimensi
dari tRNA fenilalanin ragi telah ditetapkan dengan penelitian difraksi sinar X.
Antikodon dari tRNA alanin dan fenilalanin ragi terbentuk dalam lingkaran
(daerah ikatan nonhidrogen) dekat pusat molekul. Faktanya, antikodon dari
seluruh sekuen tRNAs sampai saat ini (70 lebih dari seluruh organisme) telah
ditemukan terletak dalam lingkaran antikodon (Gardner, 1984).

Gambar 1.6 Sekuen Nukleotida dan Konfigurasi Cloverleaf dari tRNA Alanin
Ragi. Struktur sekunder dihasilkan oleh ikatan hidrogen antar
dasar pada segmen berbeda dari molekul. Struktur tersebut
mengandung tiga lingkaran, dengan tanpa base pairing yang
terjadi. Satu dari lingkaran tersebut mengandung sekuen
antikodon, pada kasus tRNA alanine ragi yaitu sekuen 3-CGI-5
(Snustad, 2012).
Masing-masing ribosom memiliki 2 tempat ikatan tRNA yaitu A site
dan P site. A atau aminoacyl site mengikat aminoacyl-tRNA yang datang,
tRNA membawa asam amino yang selanjutnya akan ditambahkan untuk
pemanjangan rantai polipeptida. P atau Peptidyl site mengikat tRNA ke
pemanjangan polipeptida tersambung. Spesifikasi untuk ikatan aminoacyltRNA pada tempat ini ditentukan oleh kodon mRNA yang menyusun bagian A
dan P binding site. Saat ribosom bergerak sepanjang mRNA, spesifikasi untuk
aminoacyl-tRNA binding pada tempat A dan P berubah sebagai kodon mRNA
yang berbeda yang berpindah ke register pada binding site. Ribosomal

binding site dengan sendirinya (tanpa mRNA) mampu mengikat semua

aminoacyl-tRNA (Gardner, 1984).

Gambar 1.7 Photograph (a) dan Gambar Interpretasi (b) dari Model Molekular
tRNA Fenilalanin Ragi Berdasarkan Data Difraksi Sinar X.
Lingkaran antikodon berada pada bagian bawah. Rangka ribosafosfat dari RNA digambar sebagai silinder yang terputus-putus.
Tonggak mengindikasikan ikatan hydrogen base pair. Dasar yang
tidak berpasangan diindikasikan oleh tangkai pendek (Snustad,
2012).

Gambar 1.8 Struktur Ribosom pada E. coli. Masing-masing ribosom/ komplek

mRNA mengandung tiga aminoacyl-tRNA binding site. A atau

aminoacyl-tRNA site ditempati oleh alanyl-tRNAala. P atau

peptidyl-tRNA site ditempati oleh phenylalanyl-tRNAphe, dengan
pemanjangan polipeptida dihubungkan secara kovalen pada
phenylalanyl-tRNA. E atau exit site ditempati oleh Trnagly, untuk
melepaskan dari ribosom (Snustad, 2012).
Molekul RNA mengandung spesifisitas yang baik disamping
ukurannya yang kecil. Tidak hanya itu, RNA harus:
1. Mengandung sekuen antikodon yang tepat, agar kodonnya juga tepat
2. Dikenali oleh aminoacyl-RNA synthetase yang tepat, sehingga diaktivasi
dengan asam amino yang tepat
3. Terikat pada A dan P site pada ribosom
F. Chapeville dan G. von Ehrenstein dan koleganya mengadakan eksperimen
tentang spesifisitas untuk pengenalan kodon pada bagian tRNA dari
aminoacyl-tRNA,

dibandingkan

dengan

pada

asam

amino.

Mereka

menghilangkan cysteyl-tRNAcys (tRNA sistein yang diaktivasi oleh sistein)

dengan mereduksi bubuk nikel secara kuat (Raney nikel), yang mengubah
(reduksi) sistein menjadi alanine yang masih berikatan, akan tetapi pada
cysteine tRNA. Saat hybrid aminoacyl-tRNA yaitu alanyl-tRNA cys telah
digunakan pada protein sebagai sistem penyintesis secara in vitro, alanine
telah ditemukan terdapat pada posisi dalam polipeptida yang secara normal
ditempati oleh sistein (Gardner, 1984).
Sintesis protein diinisiasi oleh tRNA initiator yang khusus yaitu
tRNAfMet . Artinya seluruh polipeptida diawali oleh metionin saat sintesis.
Amino yaitu metionin pada ujung setelah itu dipotong dari banyak
polipeptida. Dengan demikian, protein fungsional tidak memiliki amino
metionin pada ujungnya. Pada organel eukariot dan prokariot, metionin pada
initiator tRNAfMet memiliki kelompok amino yang dihalangi dengan kelompok
formyl (-CO-H). Pada sistem sitoplasmik eukariot, initiator tRNAfMet khusus
juga hadir namun kelompok amino tanpa adanya formyl. Metionin tRNA yang
berbeda yang merespon pada kodon metionin internal, hadir dalam sistem
prokariot dan eukariot. Pada keduanya, tRNAs memiliki antikodon yang sama
dan keduanya juga merespon pada kodon yang sama (AUG) untuk metionin.
Pada prokariot, kelompok amino dengan formil pada tRNAfMet mencegah

pembentukan ikatan peptida antara kelompok amino dan kelompok karboksil

dari asam amino pada akhir dari pemanjangan rantai polipeptida. Pada
eukariot, kelompok amino dari tRNAiMet tidak dihalangi. Apa yang mencegah
tRNAiMet (i untuk inisiator) pada kodon AUG internal dan methionyl-tRNA Met
dari respon inisiator kodon AUG pada mRNAs eukariot? hanya methionyltRNAMet yang bereaksi dengan protein faktor penginisiasi, IF-1, IF-2, dan IF-3,
dan hanya methionyl-tRNAMet yang berinteraksi dengan protein faktor
pemanjangan, EF-Ts dan EF-Tu. Pada banyak kasus, hanya methionyltRNAiMet yang merespon pada kodon inisiasi AUG dan hanya methionyltRNAMet yang merespon pada kodon internal AUG. Methionyl-tRNA fMet juga
merespon pada kodon penginisasi pengganti yaitu GUG (kodon valin ketika
hadir pada posisi internal), diketahui hadir pada beberapa mRNAs alami
(Gardner, 1984).
Pada prokariot, inisiasi rantai polipeptida terjadi dalam formasi
komplek antar mRNA yaitu methionyl-tRNAfMet dan subunit ribosom 30S.
Formasi dari komplek inisiasi ini membutuhkan aktivitas dari 3 protein faktor
penginisiasi yaitu IF-1, IF-2, DAN IF-3 ditambah dengan guanosine
triphosphate (GTP). Kemungkinan hal ini difasilitasi oleh interaksi basepairing antara base sequence dekat akhir 3 dari 16S rRNA dan base sequence
pada leader sequence dari mRNA. (leader sequence dari molekul mRNA
adalah sekuen yang tidak ditranslasikan dari akhir 5 ke kodon penginisiasi
AUG atau GUG pertama. Sekuen yang tidak ditranslasikan ini berbeda
panjangnya dari beberapa nukleotida pada beberapa ratus nukteotida)
(Gardner, 1984).
Komplek penginisiasi selanjutnya bergabung dengan subunit
ribosom 50S, dan methionyl-tRNAfMet menjadi terikat pada tempat peptidyl.
Hal tersebut membutuhkan hidrolisis dari satu molekul GTP. Penjajaran dari
kodon penginisiasi AUG dengan antikodon dari tRNA fMet (pada P site)
mengatur kodon yang hadir pada A site, lalu mensabilkan spesifisitas unuk
aminoacyl-tRNA binding pada A site. Contohnya ikatan dari alanyl-tRNAala
pada A site (dan seluruh subsekuen ikatan aminoacyl-tRNA) membutuhkan
hidrolisis satu molekul GTP dan faktor pemanjangan protein yaitu EF-Ts dan

EF-Tu. Formasi ikatan peptida antara kelompok karboksil dari ikatan fmethionine pada tRNAfMet di P site dan kelompok amino dari molekul alanine
berikatan dengan tRNAala pada A site selanjutnya dikatalisis oleh peptidyl
transferase, yaitu enzim yang terikat pada subunit ribosom 50S. Reaksi ini
menghasilkan dipeptida f-met-ala yang melekat pada tRNAala yang terikat
pada A site dari ribosom (Gardner, 1984).
Tahap selanjutnya pada translasi, dinamakan translokasi, melibatkan:
1. Perpindahan dari f-met-ala-tRNAala dari A site ke P site
2. Perpindahan dari molekul mRNA persisnya 3 nukleotida, relatif dari posisi
ribosom, sehingga kodon sebelumnya masuk pada A site berpindah ke P
site.
Contohya kodon alanine GCC berpindah dari posisinya pada A site ke P site,
dan kodon subsekuen yaitu kodon serin UCC berpindah masuk ke A site.
Translokasi membutuhkan aktifitas dari elongation factor yaitu Ef-G dan
hidrolisis satu molekul GTP (Gardner, 1984).
Aminoacyl-tRNA selanjutnya dispesifikkan oleh kodon mRNA pada
A site lalu terikat pada A site, dan pembentukan ikatan peptida dan tahap
translokasi diulang. Sekuen diulang untuk masing-masing kodon mRNA (ratarata sekitar 300 kodon) sampai rantai kodon terminasi dicapai. Kelompok
formyl pada amino dengan ujung methionine biasanya dipindahkan dengan
deformylase sebelum sintesis polipeptida selesai. Ketika satu dari tiga
polipeptida rantai dengan terminasi kodon (UAG, UAA, atau UGA) masuk ke
A site, polipeptida terbentuk, tRNA pada P site dan mRNA dilepaskan, dan
subunit ribosom memisah. Terminasi membutuhkan aktivitas dari satu dari dua
protein release factor yaitu RF-1 dan RF-2. Permisahan subunit ribosomal
kemudian bebas untuk menginisiasi translasi dari molekul mRNA lain
(Gardner, 1984).
Dibandingkan masing-masing molekul mRNA yang ditranslasikan
oleh ribosom tunggal, sebagian besar mRNA secara simultan ditranslasikan
oleh beberapa ribosom, dengan jarak 90 nukleotida sepanjang molekul
mRNA. Ukuran dari komplek translasi ini disebut polyribosomes atau
polysome, sangat berubah-ubah namun berkorelasi dengan ukuran polipeptida

yang disintesis. Rantai hemoglobin (sekitar 150 asam amino) disintesis

komplek pentaribosom (rata-rata ukuran) (Gardner, 1984).

Daftar Pustaka
Gardner, E.J., dan Snustad, D.P. 1984. Principle of Genetics 6th edition. NewYork:
John Wiley and Sons.Inc.
Snustad, D.P. dan Simmons, M.J. 2012. Principles of Genetics 6th edition. USA:
John Wiley and Sons.Inc. (ebook).
Pertanyaan
1. Didik Dwi P.
-

Jelaskan perbedaan translasi pada eukariot dan prokariot !

Jawab: Pada prokariot, proses translasi dilakukan secara hampir serentak
dengan proses transkripsi, artinya sebelum transkripsi selesai maka
proses translasi sudah dimulai. Sebaliknya pada eukariot translasi
baru dapat dilaksanakan jika proses transkripsi sudah selesai.

2. Imroatun Hasana
-

Ribosom memiliki 3 site yaitu A site, P site, dan E site. Mengapa pada
awal translasi tersebut AUG (kodon untuk metionin) langsung masuk pada
P site sedangkan yang lain masuk dari A site?
Jawab: AUG adalah kodon dari metionin yang berfungsi sebagai kodon
start pada proses translasi. Kodon start ini menstabilkan
penerjemahan yang tepat untuk mRNA yang masuk. Prokariot dan
eukariot mengandung dua tRNAs metionin yang berbeda yaitu
tRNAiMet dan tRNAMet. tRNAiMet yang menginisiasi proses sintesis
polipeptida (translasi) sedangkan tRNAMet dapat menggabungkan
metionin hanya untuk pemanjangan rantai polipeptida. Hanya MettRNAiMet (dengan kata lain diaktivasi metionin yang melekat pada
tRNAiMet) dapat berikatan pada P site untuk memulai sintesis rantai
polipeptida dan tRNAs lain terikat hanya pada Asite. Oleh karena
itu AUG langsungmasuk ke P site dengan alasan tRNA yang
bertugas menerjemahkan metionin berada pada P site.

Mengapa pada beberapa polipeptida mengandung sekuen asam amino

pendek pada amino atau karboksil termini?
Jawab: Beberapa polipeptida mengandung sekuen asam amino pendek
pada amino atau karboksil termini karena nantinya sekuen
tersebut

berfungsi

sebagai

sinyal

untuk

transportnya

ke

kompatemen sel yang spesifik seperti RE, mitokondria, kloroplas,

atau nucleus. Contohnya protein sekretori yang mengandung
sekuen sinya pendek pada amino terminus yang mengarahkannya
ke membran dari RE.