TRANSLASI

Translasi merupakan proses dimana informasi genetik (yang disimpan dalam urutan
nukleotida dalam sebuah molekul mRNA) diterjemahkan, mengikuti aturan dan cetakan dari
kode genetik. Dalam prosesnya membutuhkan fungsi sejumlah besar makromolekul. Dalam
hal ini termasuk (1) lebih dari 50 polipeptida dan dari 3 sampai 5 molekul RNA hadir di
setiap ribosom (komposisi yang tepat bervariasi dari spesies ke spesies), (2) paling sedikit 20
amino acid-mengaktifkan enzim (aminoasil-tRNA sintetase), (3 ) 40 sampai 60 molekul
tRNA yang berbeda, dan (4) setidaknya 9 protein larut terlibat dalam polipeptida rantai
initation, elongasi, dan terminasi. Hal ini dikarenakan oleh banyak dari makromolekul ini
merupakan komponen ribosom, kebanyakan molekul ini hadir dalam jumlah yang banyak
dalam setiap sel, maka proses translasi menjadi proses utama dalam metabolism pada setiap
sel.

Dalam translasi, terjemahanan melibatkan tiga jenis RNA, yang semuanya

ditranskripsi dari DNA template (gen kromosom). Ribosom dapat dianggap sebagai work-
benches (meja kerja), lengkap dengan mesin dan peralatan yang diperlukan untuk membuat
polipeptida. Mereka tidak spesifik dalam arti bahwa mereka dapat mensintesis setiap
polipeptida (setiap urutan asam amino) yang ditentukan oleh molekul mRNA tertentu. Studi
awal menggunakan pulse-labeling atau penandaan (dengan asam amino radioaktif) dan
autoradiografi menunjukkan bahwa protein disintesis sebagian besar dalam sitoplasma pada
kecil, tapi kompleks, struktur makromolekul yang disebut ribosom. Pada prokariota, ribosom
didistribusikan di seluruh sel; di eucaryotes, mereka berada dalam sitoplasma, sering pada
jaringan membran intraseluler yang luas yang disebut retikulum endoplasma.

Ribosom adalah setengah protein dan setengah RNA. Mereka terdiri dari dua subunit,
satu besar dan satu kecil, yang memisahkan terjemahan dari molekul mRNA selesai; mereka
beberapa ukuran yang paling sering dinyatakan dalam tarif mereka sedimentasi selama
sentrifugasi, dalam satuan yang disebut S atau Svedberg Unit. Ribosom E.coli, seperti yang
kebanyakan prokariota, memiliki berat molekul 2,7 x 10 6 dan "ukuran"sebesar"70S".
Ribosom eukariota besar (biasanya sekitar 80S); Namun, ukuran bervariasi dari spesies.
Kehadiran ribosom dalam organel (mitokondria dan kloroplas) sel eukariotik yang lebih kecil
(biasanya 60S).
Dalam semua kasus, masing-masing ribosom terdiri dari dua subunit. Dalam kasus
E.coli, yang kecil (30S) ribosom subunit berisi 16S (5S, mol. Wt. sekitar 6x10 5) molekul
RNA ditambah 21 polipeptida yang berbeda, dan besar (50S) subunit berisi 18S (ukuran rata-
rata) molekul RNA dan subunit besar berisi 5S, sebuah 5.8S, dan 28S (ukuran rata-rata)
molekul RNA. Perhatikan gambar berikut ini.
Drosophila ribosom, tapi bukan dari beberapa eukariota lainnya diperiksa, juga tampak
mengandung molekul RNA 2S kecil. Di organel, ukuran rRNA yang sesuai adalah 5S, 13S,
dan 21S.
Transkripsi dari gen rRNA E.coli untuk menghasilkan prekursor rRNA 30S dan
proses subsekuennya dalam membentuk molekul rRNA 5S, 16S, dan 23S, serta molekul
tRNA 4S. Seperti pada gambar berikut ini.
 RNA ribosom ditranskripsi dari template DNA, seperti molekul mRNA. Pada
eukariota, bagaimanapun, rRNA sintesis terjadi di nucleolus dan dikatalisis oleh polimerase
RNA khusus hadir hanya dalam nukleolus. Selain itu, transkripsi gen RNA menghasilkan
rRNA prekursor yang largevthan molekul RNA ditemukan dalam ribosom. Ini prekursor
rRNA menjalani proses posttrancriptional untuk menghasilkan transkrip gen rRNA adalah
30S precusor, yang mengalami pembelahan oleh endiribonucleases untuk menghasilkan 5S,
16S, 23S rRNA dan ditambah molekul RNA transfer 4S. Pada eukariota, 2S (saat ini), 5.8S,
18S, 28S rRNA dan dipotong dari 40S ke 45S (tergantung pada spesies) precusor, sedangkan
5S rRNA dihasilkan oleh pengolahan posttranscriptional dari transkrip gen yang terpisah.
Selain perpecahan precursor pasca-transkripsitRNA, metilasi pasca-transkripsi dari banyak
nukleotida dalam rRNA terjadi. Agaknya, metilasi melindungi molekul rRNA dari
ribonuklease intraseluler yang terlibat dalam degradasi mRNA.
Sudah banyak genom dari organisme yang sudah dipelajari. Misalnya di E.coli, ada
diperkirakan 5-10 salinan rRNA (RRN) gen, dengan setidaknya satu salinan di masing-
masing tiga lokasi yang berbeda pada kromosom. Pada eukariota, gen rRNA yang hadir
dalam ratusan hingga ribuan eksemplar. The 5.8S-18S-28S rRNA gen eukariota yang hadir
dalam duplikasi tandem di daerah penyelenggara nukleolus dari kromosom. Dalam beberapa
eukariota, seperti jagung, ada satu pasang penyelenggara nukleolus (pada pasangan
kromosom 6 pada jagung). Di Drosophila dan dipelajari secara ekstensif Afrika Selatan
mencakar katak, Xenopus laevis, kromosom seks membawa penyelenggara nukleolus.
Manusia, di sisi lain, memiliki lima pasang penyelenggara nukleolus, yang terletak di lengan
pendek kromosom 13, 14, 15, 21, dan 22. Penelitian yang cermat menunjukkan bahwa ada
sekitar 500 eksemplar dari 5.8S-18S rRNA 28S- gen per organizer nukleolus di Xenopus
laevis.Ttingkat yang sama redundansi telah diperkirakan terjadi pada beberapa hewan
lainnya. Tanaman menunjukkan variasi yang lebih besar dalam rRNA redundansi gen,
dengan beberapa ribu eksemplar hadir di beberapa genom. Intraspesies variasi dalam jumlah
rRNA redundansi gen juga telah didokumentasikan dalam beberapa spesies.
Pada tahun 1958, Crick karena itu mengusulkan bahwa beberapa jenis sebuah
"adapter" molekul asam amino yang menengahi kodon pengakuan selama sintesis protein.
The "adapter" molekul segera diidentifikasi dan ditemukan untuk menjadi kecil (4S, 70-80
nukleotida panjang) molekul RNA. Molekul-molekul ini, firt disebut "RNA larut" (Srna)
molekul dan kemudian mentransfer RNA (tRNA) molekul, mengandung urutan basa triplet,
yang disebut urutan antikodon, yang melengkapi dan diakui urutan kodon di mRNA selama
terjemahan. Ada dari satu sampai empat tRNA dikenal untuk setiap asam amino yang ada.
Asam amino yang melekat pada tRNA dengan energi tinggi (sangat reaktif) ikatan antara
gugus karboksil dari asam amino dan termini 3'-hidroksil tRNA th. Ini tRNA aminoasil
reaktif terbentuk dalam proses dua-langkah, baik langkah yang dikatalisasi oleh tertentu
"enzim activatng" aminoasil-tRNA sintetase. Ada setidaknya satu aminoasil-tRNA sintetase
untuk masing-masing asam amino 20. Langkah pertama dalam aminoasil-tRNA sintetase
melibatkan aktivasi asam amino menggunakan energi dari adenosine triphosphate (ATP):
Asam amino + ATP

Aminoasil-tRNA
 sintetase

Asam amino ~ AMP + ~

Aminoasil-tRNA (asam amino-tRNA) adalah precusors langsung sintesis polipeptida

pada ribosom, dengan masing-masing tRNA diaktifkan mengakui benar kodon mRNA dan
penyajian asam amino dalam configuraion sterik (struktur tiga-dimensioanal) yang
memfasilitasi pembentukan ikatan peptida. tRNA ditranskripsi dari gen kromosom. Seperti
dalam kasus rRNA, tRNA ditranskripsi dalam dari molekul precusor besar yang mengalami
pengolahan posttanscriptional (pembelahan, pemangkasan, metilasi, dll.). molekul tRNA
matang mengandung beberapa nukleosida tidak hadir dalam mRNA atau dalam transkrip gen
tRNA utama. Ini nukleosida yang tidak biasa, seperti inosin, pseudouridine, dihydrouridine,
1-methylguanosine, dan beberapa orang lain, yang diproduksi oleh posttranscriptional,
modifikasi enzim-katalis dari empat nukleosida dimasukkan ke dalam RNA selama
transkripsi.
Urutan nukleotida lengkap yang disebutstruktur
"daun semanggi" adalah alanin tRNAdari ragi
(Gambar.1) ditemukan oleh R.W. Holley dan rekan
pada tahun 1965; Holley
mendapatkanPenghargaanNobletahun1968dalam
fisiologi dan obat-obatan untuk penelitian ini. Sejak itu,
banyak tRNA telah diurutkan, dan gen ragi tRNA
alanin bahkan telah disintesissecara in vitro dari
mononukleotida oleh H.G. Khorana. Struktur tiga-
dimensi dari fenilalanin tRNA ragi telah ditentukan
oleh studi difraksi sinar-X (Gambar. 2). Para anticodons
dari alanin dan fenilalanin tRNA ragi terjadi dalam loop
(wilayah ikatan nonhidrogen) dekat pusat molekul.
Gambar 1.
StrukturdaunsemanggipadatRNA
alanine ragi
 Gambar 2. Foto 3 dimensi dari fenil alanin tRNAragi (a) dan model molekulnya (b)

Setiap ribosom memiliki dua situs ikatan tRNA. A atau aminoasil disebut
aminoasil-tRNA, tRNA membawa asam amino yang berikutnya yang akan ditambahkan ke
rantai polipeptida yang sedang tumbuh. P atau situs ikatanpeptidil tRNA yang mana
polipeptida berkembang secara terpasang. Kekhususan aminoasil-tRNA untuk mengikat
dalam situs ini disediakan oleh kodon mRNA yang membentuk bagian dari situsikatan A dan
P. Saatribosom bergerak sepanjang mRNA (atau sebagai mRNA shuttled di ribosom),
kekhususan untuk aminoasil-tRNA dalam mengikat situs A dan P perubahan kodon mRNA
yang berbeda pindah ke situs ikatan. Ribosom mengikat situs sendiri (minus mRNA) dengan
demikian mampu mengikat setiap aminoasil-tRNA. Hal ini harus cukup jelas bahwa molekul
tRNA mengandung banyak kekhususan meskipun ukurannya yang kecil. Tidak hanya harus
(1) memiliki urutan antikodon yang benar, sehingga dapat merespon kodon yang tepat, tetapi
mereka juga harus (2) dikenalidengan benar oleh sintetase aminoasil-tRNA, sehingga mereka
diaktifkan dengan asam amino yang tepat, dan (3) mengikat ke situs A dan P dari ribosom. F.
Chapeville dan G. von Ehrenstein dan rekan telah membuktikan, melalui eksperimen
sederhana dan langsung, bahwa kekhususan untuk penerimaan kodon berada di bagian tRNA
dari aminoasil-tRNA, bukan dalam asam amino. Mereka memperlakukan CYS cystecyl-
tRNA (tRNA sistein yang diaktifkan dengan sistein) dengan bubuk nikel yang
sangattereduksi (nikel Raney), yang mengubah (mereduksi) sistein untukmenjadi alanin,
namun untuk sistein tRNA. Ketika "hybrid" aminoasil-tRNAini (alanyl-tRNA CYS)
digunakan dalam sistem percobaanin vitro protein-sintesis, alanin yang ditemukan
dimasukkan ke dalam posisi di polipeptida yang mana biasanya ditempati oleh sistein.
Dalam prosesnya, sintesis protein dimulai dengan tRNA inisiator khusus, ditunjukkan
oleh tRNAfMet. Ini berarti bahwa semua polipeptida dimulai dengan metionin selama sintesis.
Amino-terminal metionin selanjutnya dibelah dari banyak polipeptida. Dengan demikian,
protein fungsional tidak perlu memiliki metionin amino-terminal. Dalam organel prokariota
dan eukariota, metionin pada tRNA inisiator f Met memiliki gugus amino yang diblokir
dengan kelompok formil. Dalam sistem sitoplasma eukariotik, inisiator khusus tRNAfMetjuga
ada, tapi gugus amino tidak terformylasi. Sebuah metionin yang berbeda tRNA, tRNAfMet,
yang merespon kodon metionin internal ada di kedua sistem prokariotik dan eukariotik.
Kedua tRNA metionin memiliki antikodon yang sama dan keduanya menanggapi kodon yang
sama (AUG) untuk metionin. Pada prokariota, gugus amino formylated pada tRNA
methionylfMetmencegah pembentukan ikatan peptida antara gugus amino dan gugus karboksil
dari asam amino pada akhir rantai polipeptida yang sedang tumbuh. Pada eukariota, gugus
amino dari methionyl-tRNAiMettidak diblokir. Ternyata, hanya methionyl-tRNAiMetakan
bereaksi dengan faktor inisiasi protein, IF-1, IF-2, dan IF-3 dan hanya methionyl-
tRNAMetakan berinteraksi dengan faktor elongasi protein, Ef-Ts dan Ef-Tu. Dalam hal apapun,
hanya methionyl-tRNAiMetmerespon AUG inisiasi kodon dan hanya methionyl-
tRNAMetmerespon kodon intern AUG.
Pada prokariota, inisiasi rantai polipeptida terjadi dengan pembentukan kompleks
antara mRNA, methionyl-tRNAfMet, dan 30S subunit ribosom. Pembentukan kompleks
inisiasi ini memerlukan aktivitas faktor inisiasi tiga protein, yang ditunjuk IF-1, IF-2, dan IF-
3, ditambah guanosin trifosfat (GTP). Ini dapat difasilitasi oleh interaksi dasar-pasangan
antara urutan basa dekat ujung 3 'dari 16S rRNA dan urutan dasar dalam "urutan pemimpin"
dari mRNA. (Urutan pemimpin molekul mRNA adalah urutan nontranslated dari ujung 5 'ke
AUG atau GUG inisiasi kodon pertama).
Inisiasi kompleks maka menggabungkan dengan 50S ribosom subunit, dan methionyl-
Met
tRNAf menjadi terikat ke situs peptidil. Hal ini memerlukan hidrolisis satu molekul GTP.
Keselarasan dari inisiasi AUG kodon dengan antikodon tRNAfMet(dalam situs P) perbaikan
kodon hadir di lokasi A, sehingga membentuk kekhususan untuk aminoasil-tRNA mengikat
di lokasi A.
Langkah selanjutnya dalam penerjemahan, yang disebut translokasi, melibatkan (1)
pergerakan f-met-ala- tRNAala dari situs A ke situs P dan (2) gerakan molekul mRNA tepat
tiga nukleotida, relatif terhadap posisi ribosom, sehingga bahwa kodon sebelumnya dalam
register dengan situs A bergerak ke dalam register dengan situs P. Berikutnya aminoasil-
tRNA yang ditentukan oleh kodon mRNA di lokasi A (seryl-tRNAser) kemudian mengikat di
lokasi A, dan pembentukan ikatan peptida dan translokasi langkah yang berulang.

Pertanyaan:
1. Apakah yang menyebabkan tiap kodon bukan mengandung dua nukleotida tetapi
mengandung tiga nukleotida?
2. Bagaimana ketentuan yang harus dilakukan oleh ribosom dalam mengikat setiap
aminoasyl-tRNA tanpa bantuan mRNA?
3. Apa perbedaan dari ribosom E. coli dan ribosom pada Eukariotik ?
4. Apa perbedaan dari situs pegikatan A dan P ?

Jawaban:
1. Karena ada 20 jenis asam amino yang berbeda sehingga paling sedikit ada 20 kodon
yang berbeda yang harus dibentuk menggunakan empat simbol (basa) yang tersedia di
dalam pesan (mRNA). Dua basa per kodon akan menghasilkan hanya 42 atau 16
kodon yang mungkin. Tentu saja kodon itu tidak mencukupi. Sementara itu, tiga basa
per kodon akan menghasilkan 43 atau 64 kodon yang mungkin. Jumlah ini tentu saja
mencukupi, bahkan berlebih. Adanya kelebihan ini memungkinkan beberapa kodon
yang berbeda mengkode atau menentukan asam amino yang sama, misalnya kodon
GUU, GUC, GUA, dan GUG sama-sama mengkode atau menentukan asam amino
valin.
2. Ketentuan yang harus dilakukan oleh ribosom dalam mengikat setiap aminoasyl-
tRNA tanpa bantuan mRNA adalah:
memiliki urutan antikodon yang benar, sehingga dapat merespon kodon yang
tepat
harusdapatdikenalidengan benar oleh sintetase aminoasil-tRNA, sehingga
mereka diaktifkan dengan asam amino yang tepat
mengikat ke situs A dan P dari ribosom
3. Pada ribosom E.coli seperti pada kebanyakan prokariotik, mempunyai berat molekul
2.7 x 106 dan ukuran dari 70S. Di E.coli ribosom subunit kecil terdiri dari 16S
molekul RNA + 21 polipeptida berbeda dan subunit besar terdiri dari dua molekul
 RNA + 31 polipeptida. Sedangkan pada ribososm dari eukariotik lebih besar namun,
ukurannya berbeda dari spesies. Ribosom hadir di organel sel eukariotik lebih kecil.
Dalam ribosom eukariotik subunit kecil terdiri dari 18S molekul RNA dan subunit
besar terdiri 5S, 5,8S, dan 28S molekul RNA.
4. A atau amynoacyl mengikat masuk aminoasil-tRNA, tRNA membawa asam amino
yang berikutnya yang akan ditambahkan ke rantai polipeptida yang sedang tumbuh
sedangkan pada P atau peptidil situs mengikat tRNA mejadi polipeptida.