2.

MOLEKUL YANG DISINTESIS

a. Asam ribonukleat (RNA)
Asam ribonukleat (RNA) merupakan makromolekul yang berfungsi sebagai penyimpan
dan penyalur informasi genetik. RNA juga dapat berfungsi sebagai enzim (ribozim) yang
dapat mengkatalis formasi RNA nya sendiri atau molekul RNA lain. RNA merupakan rantai
tunggal polinukleotida. RNA berfungsi dalam mengkonversi informasi genetik dari gen ke
dalam sekuens asam amino protein.

b. Struktur RNA
Purin dan pirimidin yang berkaitan dengan ribosa membentuk suatu molekul yang
dinamakan nukleosida atau ribonukleosida, yang merupakan precursor dasar untuk sintesis
DNA. Ribonukleosida yang berkaitan dengan gugus fosfat membentuk suatu nukleotida atau
ribonukleotida. RNA merupakan hasil transkripsi dari suatu fragmen DNA, sehingga RNA
merupakan polimer yang jauh lebih pendek dibandingkan DNA.
c. Jenis RNA
1) RNA messenger (mRNA)
mRNA merupakan RNA yang urutan basanya komplementer dengan salah satu urutan
basa rantai DNA. mRNA membawa pesan atau kode genetik (kodon) dari kromosom (di
dalam inti sel) ke ribosom (di sitoplasma). Kode genetik mRNA tersebut kemudian
menjadi cetakan untuk menentukan spesifitas urutan asam amino pada rantai polipeptida.
mRNA berupa rantai tunggal yang relatif panjang.

Messenger RNA (mRNA) adalah keluarga besar RNA molekul yang menyampaikan
informasi genetik dari DNA ke ribosom, dimana mereka menentukan asam amino urutan
protein produk dari ekspresi gen. Setelah transkripsi dari transkrip primer mRNA (dikenal
sebagai pre-mRNA) oleh enzim RNA polymerase, diproses, matang mRNA diterjemahkan
ke dalam polimer asam amino: protein, seperti yang dirangkum dalam dogma sentral
biologi.
Seperti dalam DNA, informasi genetik mRNA adalah di urutan nukleotida, yang
dibagi menjadi kodon terdiri dari tiga basa masing. Setiap kodon mengkode untuk
spesifik asam amino, kecuali kodon berhenti, yang mengakhiri sintesis protein. Proses
penerjemahan kodon menjadi asam amino membutuhkan dua jenis RNA: transfer RNA
(tRNA), yang menengahi pengakuan kodon dan menyediakan asam amino yang sesuai,
dan ribosom RNA (rRNA), yang merupakan komponen utama ribosom ini protein-
manufaktur mesin.
Keberadaan molekul mRNA secara singkat dimulai dengan transkripsi, dan akhirnya
berakhir di proses degradasi. Selama hidupnya, sebuah molekul mRNA juga dapat
diproses, diedit dan diangkut sebelum terjemahan. Molekul mRNA eukariotik sering
membutuhkan pengolaahan yang luas dan transportasi, sedangkan pada molekul
prokariotik tidak.
Transkripsi adalah ketika RNA dibuat dari DNA. Selama transkripsi, enzim RNA
polimerase membuat salinan gen dari DNA untuk mRNA yang diperlukan. Proses ini
mirip pada eukariotik dan prokariotik. Satu perbedaan penting, adalah eukariotik rekan
enzim RNA polimerase dengan enzime pemrosesan mRNA selama transkripsi sehingga
pengolahan yang dapat berlanjut dengan cepat setelah dimulainya transkripsi. Dengan
waktu yang pendek, diproses atau sebagian produk olahan disebut precursor mRNA atau
pra-mRNA; menghasilkan suatu yang disebut mRNA sempurna.
 Struktur mRNA
Struktur mRNA terdiri dari:
o 5’cap;
adalah nukleotida guanine yang dimodifikasi ditambahkan ke “depan” (5’ akhir)
dari pra-mRNA menggunakan ikatan 5’-5’-trifosfat. Modifikasi ini sangat penting
untuk pembentukan yang tepat dari mRNA ke ribosom, serta perlindungan dari 5’-
exonuclear. Selain itu penting untuk penyambungan dan transportasi.
o Daerah coding;
terdiri dari kodon, yang diterjemahkan menjadi protein oleh ribosom. Daerah
coding dimulai dengan kodon awal (start) dan akhir (end) dengan kodon stop.
Secara umum, kodon start adalah triplet AUG dan kodon stop adalah UAA, UAG
atau UGA. Daerah coding cenderung stabil dengan pasangan basa internal ini
menghambat degradasi. Selain menjadi coding protein, bagian dari daerah coding
dapat berfungsi pengurutan dalam pra-mRNA sebagai peningkat penyambungan
exonic atau predam exonic splicing.
o Daerah yang belum terjemahkan(untranslated regions/UTRs);
adalah bagian dari mRNA sebelum memulai kodon dan setelah kodon stop yang
tidak diterjemahkan, disebut lima wilayah utama diterjemahkan (five prime
untranslated region/5’ UTR) dan tiga wilayah diterjemahkan pertama (three
prime unstraslated region/3’ UTR). Daerah ini ditranskripsi dengan wilayah
coding dan dengan demikian exonic karena ada dalam mRNA matang/jadi.
Beberapa peran dalam ekspresi gen telah dikaitkan dengan daerah belum
diterjemahkan, termasuk stabilitas mRNA, lokalisasi mRNA dan efisiensi
 translasi. Kemampuan UTR untuk melakukan fungsi-fungsi ini tergantung pada
urutan UTR dan dapat berbeda antara mRNA. Varian genetik di 3’ UTR juga telah
terlibat dalam kerentanan penyakit karena perubahan dalam struktur RNA dan
translasi protein.
Stabilitias mRNA dapat dikendalikan oleh 5’ UTR dan 3’ UTR karena berbagai
afinitas untuk RNA menurutnkan suatu enzim yang disebut ribonucleases dan
untuk protein tambahan yang dapat memromosikan atau menghambat degradasi
RNA. Efisiensi translasi dapat dikendalikan oleh UTRs. Protein yang mengikat
baik 3’ atau 5’ UTR dapat mempengaruhi terjemahan dengan mempengaruhi
kemampuan ribosom untuk mengikat mRNA. MicroRNAs yang terikat pada
3’UTR. Protein yang dibutuhkan di daerah tertentu dari sel juga dapat
diterjemahkan. Beberapa unsur yang terkandung di daerah diterjemahkan
membentuk karakteristik struktur sekunder ketika ditranskripsi menjadi RNA.
o dan poli (A) tail;
adalah urutan panjang adenin nukleotida ditambahkan ke ujung 3’ dari pra-
mRNA. Ekor ini mempromosikan ekspor dari inti dan terjemahan, dan melindungi
mRNA dari degradasi.
Dalam sel, masa hidup Mrna berkisar dari beberapa menit sampai hari. Semakin besar
stabilitas mRNA yang lebih banyak protein dapat dihasilkan dari mRNA itu. Terbatasnya
umur hidup mRNA memungkinkan sel untuk mengubah sintesis protein cepat dalam
mencukupi kebutuhan yang berubah. Ada banyak mekanisme yang menyebabkan
kehancuran mRNA.
2) RNA transfer (tRNA)
tRNA merupakan RNA yang membawa asam amino satu persatu ke ribosom. Pada
salah satu ujung tRNA terdapat tiga rangkaian basa pendek (antikodon). Suatu asam
amino akan melekat pada ujung tRNA yang bersebrangan dengan ujung anticodon.
Perlekatan ini merupakan cara berfungsinya tRNA, yaitu membawa asam amino spesifik
yang nantinya berguna dalam sintesis protein yaitu pengurutan asam amino sesuai urutan
kodonnya pada mRNA.

tRNA adalah adaptor molekul yang terdiri dari RNA, biasanya 76-90 nukleotida
panjang, yang berfunsi sebagai penghubung fisik antara mRNA dan urutan asam amino
protein. Hal ini dilakukan dengan membawa asam amino ke mesin sintesis protein dari sel
(ribosom) seperti yang diarahkan oleh urutan tiga nukleotida (kodon) dalam RNA
pembawa pesan (mRNA). Dengan demikian, tRNA merupakan komponen penting dari
terjemahan, sintesis protein baru biologis sesuai dengan kode genetik.
Urutan nukleotida spesifik mRNA menentukan asam amino yang dimasukkan ke
dalam produk protein dari gen ditranskripsi mRNA. Peran tRNA adalah untuk
menentukan urutan dari kode genetik sesuai dengan asam amino. Salah satu ujung tRNA
sesuai dengan kode genetik dalam urutan tiga nukleotida disebut antikodon.
Antikodon membentuk tiga pasangan basa dengan kodon di mRNA selama sintesis
protein. mRNA mengkode protein sebagai serangkaian kodon yang berdekatan, masing-
masing yang diakui oleh tRNA tertentu. Di ujung lain tRNA adalah lampiran kovalen ke
asam amino yang sesuai dengan urutan antikodon. Setiap jenis tRNA molekul dapat
dilampirkan ke satu jenis asam amino, sehingga setiap organisme memiliki banyak jenis
tRNA.
Kovalen 3’ ke tRNA akhir dikatalisis oleh enzim yang disebut aminoasil tRNA
sintetase Selama sintesis protein, tRNA dengan asam amino yang melekat dikirim ke
ribosom oleh protein yang disebut factor elognasi, yang membantu dalam decoding
urutan kodon mRNA. Jika antikodon tRNA yang sesuai dengan mRNA, tRNA lain sudah
terikat ribosom transfer rantai polipeptida berkembang dari ujung ke asam amino yang
melekat pada 3’ sampai akhir yang baru disampaikan tRNA, reaksi dikatalis oleh
ribosom.

3) RNA ribosom (rRNA)

rRNA merupakan komponen strukturan yang utama di dalam ribosom. Setiap subunit
ribosom terdiri dari 30-46% molekul rRNA dan 70-80% protein. Dalam biologi
molekuler, asam ribonukleat ribosomal (rRNA) sangat penting untuk sintesis protein di
semua organisme hidup. Ini merupakan bahan utama dalam ribosom, yang sekitar 60%
rRNA dan 40% protein. Ribosom mengandung dua rRNA utama dan 50 atau lebih
protein. RNA ribosom membentuk dua subunit, subunit besar (LSU) dan subunit kecil
(SSU). LSU rRNA bertindak sebagai ribozim. Ribozim adalah katalis pembentukan
ikatan peptida.
RNA ribosom komplek dengan protein untuk membentuk dua subunit, subunit besar
(LSU) dan subunit kecil (SSU). Mrna terjepit diantara subunit kecil dan besar, dan
ribosom mengkatalis pembentukan ikatan peptida antara dua asam amino yang
terkandung dalam rRNA.
 Sebuah ribosom juga tiga situs mengikat disebut A, P dan E. Sebuah situs di ribosom
mengikat ke aminoasil-tRNA (tRNA terikat asam amino). Gugus amino (-NH 2) dari
aminoasil-tRNA yang berisi asam amino baru, menyerang ikatan ester dari peptidil-
tRNA. Peptidil-tRNA berisi asam amino terakhir dari rantai yang tumbuh untuk
membentuk baru ikatan peptida. Reaksi ini dikatalis oleh enzim peptidil transferase.
tRNA yang memegang pada asam amino terakhir dipindahkan ke situ E, dan petidil-
tRNA digunakan untuk menjadi aminoasil-tRNA. Sebuah mRNA tunggal dapat
diterjemahkan secara bersamaan oleh beberapa ribosom.
Terjemahan ini efek bersih dari protein yang disintesis oleh ribosom, dari salinan
(mRNA) dari template DNA dalam nucleus. Salah satu komponen dari pasangan basa
komplementer ribosom (16S rRNA) ke urutan Shine-Galgarno sequence hulu kodon start
di mRNA.
Sejumlah besar nukleotida individu dalam molekul tRNA dapat dimodifikasi secara
kimia, sering dengan metilasi atau deamidasi, ini basis yang tidak biasa kadang-kadang
mempengaruhi interaksi tRNA dengan ribosom dan kadang-kadang terjadi di antikodon
untuk mengubah dasar-pasangan sifat.

d. Fungsi RNA
1) RNA juga mengarahkan produksi protein baru dengan mengirimkan informasi genetik
pada struktur bangunan protein.
2) RNA mengarahkan sintesis protein.
3) mRNA mengambil pesan genetik dari DNA.
4) tRNA aktif asam amino, ke tempat sintesis protein.
 5) rRNA sebagian besar hadir dalam ribosom, dan bertanggungjawab atas stabilitas
mRNA.

DAFTAR PUSTAKA
Sumbono, Aung. 2019. Biomolekul. Yogyakarta: PENERBIT DEEPUBLISH.