Translasi

Oleh Kelompok 4 :
Rinaldi Rizal P 1056
Yasir Sidiq 1070
NurheningY.E. 1069

Program Pascasarjana Fakultas Biologi

Universitas Gadjah Mada
2012
 Pengertian Translasi
 RNA Splicing
 Komponen Translasi
 Proses Translasi
 Kode Genetik
 Hipotesis Wobble
 Pengertian Translasi

Translasi adalah proses penerjemahan urutan nukleotida

yang ada pada molekul mRNA menjadi rangkaian asam-
asam amino yang menyusun suatu polipeptida atau
protein (Yuwono, 2005: 209)

Menurut Campbell et.al (2010: 355), translasi adalah

sintesis polipeptida yang terjadi di bawah arahan mRNA.

Dalam pengertian lain adalah proses sintesis polipeptida

spesifik berdasarkan sandi genetika pada mRNA
  RNA Splicing

Bagian 5’ dari intron disebut GU sedangkan 3’ intron disebut

AG. Bagian tengah intron yang mengandung adenine juga
dibutuhkan dalam pemutusan intron dari pre-Mrna yang
disebut branch site.
  RNA Splicing

RNA splicing terdiri dari tiga tahap utama

perlekatan U1 snRNPs pada GU dan U2 snRNPs pada
1 branch site

U4, U6, dan U5 snRNPs menempel pada daerah intron

menjadi komplek spliceosome yang utuh. GU putus
2 kemudian menempel pada adenine dan membentuk
lariat. Pada tahap ini U1 dan U4 snRNPs lepas sedangkan
U6 dan U5 snRNPs berubah posisi

AG terputus sedangkan exon terhubung menjadi satu.

3 Lariat lepas dibawa oleh U2, U5, dan U6. Setelah U2, U5,
dan U6 lepas maka lariat akan terdegradasi
 RNA Splicing
  Komponen Translasi

Release Factor rRNA membentuk komplek

(RF) adalah ribosom,terdiri dari sub unit
kompleks protein besar dan sub unit kecil. Dua
yang berperan
dalam tahap
rRNA sub unit ini akan menjadi
komplek fungsional saat
terminasi untuk terjadi translasi
melepaskan
tRNA dari rRNA
tRNA tersusun atas
molekul RNA , terdiri
atas 80 nukleutida
yang berfungsi
membawa asam
amino dan
Release
Factor tRNA mengandung urutan
basa anticodon.
 Komponen Translasi

Campbell et al
  Komponen Translasi
tRNA membentuk struktur tiga dimensi mirip
semanggi
Dengan formasi tersebut membentuk 5
lengan, yaitu :
1. Lengan aseptor (acceptor arm) dibentuk
oleh tujuh pasangan basa di antara
basa‐basa ujung 5’ dan 3’ molekul tRNA.
2. Lengan D (D arm), dinamakan demikian
karena struktur ini selalu mengandung
nukleotida termodifikasi dihidrouridin
3. Lengan antikodon (anticodon arm)
mengandung triplet nukleotida yang
disebut antikodon yang membentuk
pasangan basa dengan mRNA selama
translasi..
4. Loop V ( V loop) mengandung 3‐5
nukleotida tRNAs kelas 1 atau 13–21
nukleotida tRNAs kelas 2
5. Lengan TΨC (TΨC arm), dinamakan
demikian karena pada bagian ini selalu
Solomon mengandung timidin psudouridin‐sitosin
  Komponen Translasi

tRNA mengikat asam amino dikatalisis oleh enzim aminoasil‐tRNA sintetase

Pertama, pembentukan asam amino

intermediet yang diaktivasi ATP

Kedua, transfer asam amino intermediet ke

ujung 2′ atau 3′ tRNA
  Komponen Translasi

Sumber : http://www.phschool.com/science/biology_place/biocoach/images/transcription/eunotcol.gif

Sumber : http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/2/2e/MRNA_structure.png
  Proses Translasi

 Tahap inisiasi
 Menyatukan mRNA, tRNA membawa asam amino pertama
dari polipeptida, dan dua subunit dari ribosom
Large
ribosomal
P site subunit
3 U A C5
5 A U G3

Initiator tRNA
GTP GDP
E A
mRNA
5 3 5 3
Start codon

mRNA binding site Small Translation initiation complex

ribosomal
subunit
1 A small ribosomal subunit binds to a molecule of
mRNA. In a prokaryotic cell, the mRNA binding site
on this subunit recognizes a specific nucleotide
sequence on the mRNA just upstream of the start
codon. An initiator tRNA, with the anticodon UAC,
base-pairs with the start codon, AUG. This tRNA
carries the amino acid methionine (Met).
Figure 17.17
2 The arrival of a large ribosomal subunit completes
the initiation complex. Proteins called initiation
factors (not shown) are required to bring all the
translation components together. GTP provides
the energy for the assembly. The initiator tRNA is
in the P site; the A site is available to the tRNA
bearing the next amino acid.
  Proses Translasi

 In the elongation stage of translation

 Asam amino ditambahkan satu per satu untuk asam amino
sebelumnya
1 Codon recognition. The anticodon
TRANSCRIPTION DNA
Amino end of an incoming aminoacyl tRNA
mRNA of polypeptide base-pairs with the complementary
Ribosome
TRANSLATION
Polypeptide
mRNA codon in the A site. Hydrolysis
E of GTP increases the accuracy and
mRNA 3 efficiency of this step.
Ribosome ready for P A
5 site site
next aminoacyl tRNA 2 GTP
2 GDP

E E

P A P A

2 Peptide bond formation. An

GDP rRNA molecule of the large
3 Translocation. The ribosome GTP subunit catalyzes the formation
translocates the tRNA in the A
site to the P site. The empty tRNA of a peptide bond between the
in the P site is moved to the E site, E new amino acid in the A site and
where it is released. The mRNA the carboxyl end of the growing
moves along with its bound tRNAs, polypeptide in the P site. This step
P A
bringing the next codon to be attaches the polypeptide to the
Figure 17.18 translated into the A site. tRNA in the A site.
  Proses Translasi

 The final stage of translation is termination

 Ketika ribosom mencapai kodon stop di mRNA

Release
factor
Free
polypeptide

3 3
5 5
Stop codon
(UAG, UAA, or UGA)
1 When a ribosome reaches a stop
codon on mRNA, the A site of the
ribosome accepts a protein called
a release factor instead of tRNA.
Figure 17.19
5
3
2 The release factor hydrolyzes 3 The two ribosomal subunits
the bond between the tRNA in and the other components of
the P site and the last amino the assembly dissociate.
acid of the polypeptide chain.
The polypeptide is thus freed
from the ribosome.
  Proses Translasi

 Sejumlah ribosom dapat menerjemahkan sebuah

molekul mRNA secara bersamaan Completed
Growing polypeptide
 Membentuk polyribosome polypeptides
Incoming
ribosomal
subunits
Start of End of
mRNA mRNA
(5 end) (3 end)
(a) An mRNA molecule is generally translated simultaneously
by several ribosomes in clusters called polyribosomes.

Ribosomes
mRNA

0.1 µm
(b) This micrograph shows a large polyribosome in a prokaryotic
Figure 17.20a, b cell (TEM).
 Proses Translasi
  Kode Genetik

Kode genetika adalah urutan basa yang dikode

sebagai asam amino, atau disebut juga dengan
kodon

Kode genetik dapat diterjemahkan ke dalam

asam amino atau berfungsi sebagai sinyal
penghenti atau penginisiasi translasi

Kodon harus dibaca oleh antikodon yang benar-

benar cocok, Agar dihasilkan polipetida yang
spesifik
  Kode Genetik

Kode genetik bersifat universal, Mulai dari makhluk hidup yang sederhana
seperti bakteri sampai hewan dan tumbuhan yang tergolong organisme
kompleks
Second mRNA base
U C A G
UUU UCU UAU UGU U
Phe Tyr Cys
UAC
U UUC UCC
Ser
UGC C
UUA UCA UAA Stop UGA Stop A
UUG Leu UCG UAG Stop UGG Trp G

Third mRNA base (3 end)

First mRNA base (5 end)

CUU CCU CAU CGU U

His
CUC CCC CAC CGC C
C Leu Pro Arg
CUA CCA CAA CGA A
Gln
CUG CCG CAG CGG G
AUU ACU AAU AGU U
Asn
A
AUC lle ACC AAC AGC Ser C
Thr
AUA ACA AAA AGA A
Met or Lys Arg
AUG start ACG AAG AGG G
GUU GCU GAU GGU U
G GUC GCC GAC Asp GGC C
Val Ala Gly
GUA GCA GAA GGA A
Figure 17.5 GUG GCG GAG Glu GGG G
  Kode Genetik

 Mutations
 Are changes in the genetic material of a cell

 Point mutations
 Are changes in just one base pair of a gene
  Kode Genetik

 Point mutations within a gene can be divided

into two general categories

 Base-pair insertions or deletions

 Base-pair substitutions
  Kode Genetik

 A base-pair substitution
 Is the replacement of one nucleotide and its partner
with another pair of nucleotides
 Can cause missense or nonsense
Wild type

mRNA
A U G A A G U U U G G C U A A
5 3
Protein Met Lys Phe Gly Stop
Amino end
Carboxyl end
Base-pair substitution
No effect on amino acid sequence
U instead of C
A U G A A G U U U G G U U A A

Met Lys Phe Gly Stop

Missense A instead of G

A U G A A G U U U A G U U A A

Met Lys Phe Ser Stop

Nonsense
U instead of A
A U G U A G U U U G G C U A A
Met Stop
  Kode Genetik

 Insertions and deletions

 Are additions or losses of nucleotide pairs in a gene
 May produce frameshift mutations Wild type
A U G A A G U U U G G C U A A
mRNA 5 3
Protein Met Lys Phe Gly Stop
Amino end Carboxyl end
Base-pair insertion or deletion
Frameshift causing immediate nonsense
Extra U
A U G U A A G U U U G G C U A
Met Stop
Frameshift causing
extensive missense U Missing
A U G A A G U U G G C U A A
Met Lys Leu Ala
Insertion or deletion of 3 nucleotides:
no frameshift but extra or missing amino acid
A A G Missing

A U G U U U G G C U A A
Met Phe Gly
Stop
 (Sumber : Alberts, Bruce. 2008: 639)

 Hipotesis Wobble & miRNA

Francis Crick mengemukakan suatu hipotesis yang disebut hipotesis

wobble yang menunjukkan bahwa diperlukan tRNA sejumlah kodon
yang ada pada saat proses translasi.

Crick juga mengemukakan bahwa kedua basa pertama dari kodon

triplet harus berpasangan dengan basa lain yang sesuai, sedangkan
basa ketiga tidak harus dengan basa pasangannya. Dari hipotesis ini
muncullah pasangan basa wobble dimana basa G berpasangan dengan
basa U

Crick menyatakan bahwa terdapat struktur basa yang unik pada tRNA
yaitu inosine (I) yang strukturnya mirip Guanosine (G). Pada posisi basa
ketiga dari kodon, basa I dapat berpasangan dengan C atau U, dalam
keadaan tertentu I dapat juga berpasangan dengan A
 (Sumber : Alberts, Bruce. 2008: 639)

 Hipotesis Wobble & miRNA

(Sumber : Alberts, Bruce. 2008: 639)

 (Sumber : Alberts, Bruce. 2008: 639)

 Hipotesis Wobble & miRNA

MicroRNA adalah bagian kecil dari non-coding RNA.

Terdiri dari rantai pendek antara 21-25 nukleotida RNA.
microRNA (miR) secara normal berada dalam tubuh dan
mengenali mRNA target. Melekatnya miR pada mRNA target
akan menghambat translasi mRNA, baik dengan memacu
degradasi maupun dengan memblok translasi mRNA.
 Hipotesis Wobble & miRNA
 (Sumber : Alberts, Bruce. 2008: 639)

 Hipotesis Wobble & miRNA

 Translasi

SEKIAN & TERIMA KASIH

Program Pascasarjana Fakultas Biologi

Universitas Gadjah Mada
2012