Nama : Talitha Zakia

NIM : 2206203010007
Mata Kuliah : Mikrobiologi

Karakteristik Mikroorganisme
Prokariot dan Eukariot Serta Potensi Pemanfaatannya

I. Prokariotik (Bakteri dan Archae)

Struktur Eksternal
Kecil dan tampak sederhana, prokariota ada di antara alam mikroorganisme yang
paling melimpah dan ada di mana-mana. Sekarang secara umum dianggap bahwa sel-sel
pertama yang muncul di bumi adalah sejenis archaea yang mungkin terkait dengan
bentuk modern yang hidup dari senyawa belerang di ventilasi laut geotermal. Fakta
bahwa organisme ini telah bertahan begitu lama di berbagai habitat menunjukkan struktur
dan fungsi seluler yang luar biasa fleksibel dan mudah beradaptasi. Organisasi seluler
umum dari sel prokariotik dapat direpresentasikan dengan diagram alir berikut:

Semua sel bakteri selalu memiliki membran sel, sitoplasma, ribosom, dan
kromosom; mayoritas memiliki dinding sel dan beberapa bentuk lapisan permukaan atau
glycocalyx. Struktur spesifik yang ditemukan pada beberapa, tetapi tidak semua, bakteri
adalah flagela, pili, fimbriae, kapsul, lapisan lendir, dan butiran.
 Struktur Generalisasi

Sel-sel bakteri tampak tanpa sifat dan dua dimensi bila dilihat dengan mikroskop
biasa. Baru setelah mereka diperiksa dengan mikroskop elektron dan studi biokimia, sifat
mereka yang rumit dan kompleks secara fungsional menjadi jelas. Uraian struktur
bakteri, kecuali jika ada catatan lain, merujuk pada bakteri, kategori prokariota dengan
peptidoglikan di dinding selnya. Gambar 4.1 menyajikan tampilan anatomi tiga dimensi
dari sel bakteri umum (berbentuk batang). Saat kita mensurvei fitur anatomi utama sel
ini, kita akan melakukan semacam pembedahan mikroskopis, mengikuti jalur yang
dimulai dengan struktur sel luar dan berlanjut ke isi internal.

 Ekstensi Sel

Beberapa jenis struktur tambahan berlainan berkecambah dari permukaan bakteri.

Pelengkap memanjang ini umum tetapi tidak ada pada semua spesies. Pelengkap dapat
dibagi menjadi dua kelompok utama: yang menyediakan motilitas (flagella dan filamen
aksial) dan yang memberikan lampiran (fimbriae dan pili). Flagela—Baling-Baling
Bakteri Flagela prokariotik* adalah embel-embel dari konstruksi yang benar-benar
menakjubkan, tentu saja unik di dunia biologis. Fungsi utama flagella adalah untuk
memberikan motilitas, atau self-propulsion yaitu kapasitas sel untuk berenang bebas
melalui habitat berair. Ketipisan ekstrim dari flagel bakteri memerlukan perbesaran tinggi

untuk mengungkap arsitektur khususnya, yang terjadi pada tiga bagian berbeda: filamen,
kait (selubung), dan badan basal (gambar 4.2)

Filamen, struktur heliks yang terdiri dari protein, berdiameter sekitar 20 nm dan
panjangnya bervariasi dari 1 hingga 70 nm. Itu dimasukkan ke dalam kait tubular yang
melengkung. Pengait ditambatkan ke sel oleh badan basal, setumpuk cincin diikat dengan
kuat melalui dinding sel, ke membran sel. Pengaturan ini memungkinkan pengait dengan
filamennya berputar 360°, bukannya bergelombang bolak-balik seperti cambuk seperti
yang pernah diperkirakan. Saat flagel berputar berlawanan arah jarum jam, hal itu
menyebabkan badan sel berenang dalam jalur langsung ke depan (lihat gambar 4.5).
 Flagela bervariasi baik dalam jumlah maupun susunan menurut dua pola umum:
(1) Dalam susunan kutub , flagela melekat pada salah satu atau kedua ujung sel. Tiga
subtipe dari pola ini adalah: monotrik,* dengan satu flagel; lophotrichous, * dengan
tandan kecil atau jumbai flagela muncul dari situs yang sama; dan amfitrichous,* dengan
flagela di kedua kutub sel. (2) Dalam susunan peritrichous* , flagela tersebar secara acak
di atas permukaan sel (gambar 4.3). Jenis pengaturan memiliki pengaruh pada kecepatan
renang bakteri. Bentuk tercepat adalah sel polar berflagel seperti Thiospirillum, yang
dapat bergerak dengan kecepatan 5,2 mm/menit, dan Pseudomonas aeruginosa, yang
dapat berenang dengan kecepatan 4,4 mm/menit. Mempertimbangkan dimensi kecil dari
bakteri ini, kecepatan tersebut sebanding dengan beberapa protozoa dan hewan. Batang
peritrichous seperti Escherichia coli cenderung berenang di kecepatan yang relatif lebih
lambat (1 mm/menit).

Kehadiran motilitas adalah salah satu bagian dari informasi yang digunakan dalam
laboratorium identifikasi atau diagnosis patogen. Noda khusus atau preparat mikroskop
elektron harus digunakan untuk melihat susunannya, karena flagela terlalu kecil untuk
dilihat pada preparat hidup dengan mikroskop cahaya. Seringkali cukup untuk
mengetahui secara sederhana apakah suatu spesies bakteri motil. Salah satu cara untuk
mendeteksi motilitas adalah dengan menusuk massa kecil sel ke dalam media lunak
(semipadat).

Flagela efektif dalam membimbing bakteri melalui lingkungan terutama karena

sistem untuk mendeteksi bahan kimia terkait dengan mekanisme yang menggerakkan
flagel. Terletak di membran sel adalah kelompok reseptor1 yang mengikat molekul
molekul tertentu yang berasal dari lingkungan terdekat. Penempelan molekul-molekul ini
dalam jumlah yang cukup mengirimkan sinyal ke fla gellum dan membuatnya bergerak
berputar. Jika ada beberapa flagela, mereka menjadi sejajar dan berputar sebagai satu
kelompok (gambar 4.5). Saat flagel lum berputar berlawanan arah jarum jam, sel itu
sendiri berenang ke arah garis halus menuju stimulus, yang disebut lari. Lari diinterupsi
pada berbagai interval oleh tumbles, di mana flagel membalikkan arah dan menyebabkan
sel berhenti dan mengubah jalurnya. Dipercayai bahwa molekul atraktan menghambat
kejatuhan dan memungkinkan kemajuan menuju rangsangan. Penolak menyebabkan banyak
tumbang, memungkinkan bakteri mengalihkan dirinya sendiri dari rangsangan (gambar
4.6). Beberapa bakteri fotosintetik menunjukkan fototaksis, suatu jenis gerakan sebagai
respons terhadap cahaya daripada bahan kimia.
 Pelengkap untuk Perlekatan dan Perkawinan Struktur yang disebut pilus* dan
fimbria* keduanya mengacu pada pelengkap permukaan bakteri yang memberikan
beberapa jenis adhesi, tetapi tidak bergerak. Kami akan menggunakan istilah fimbriae
untuk merujuk pada untaian yang lebih pendek dan banyak, dan istilah pili untuk
merujuk pada pelengkap yang lebih panjang dan lebih jarang. Fimbriae kecil, serat
seperti bulu tumbuh dari permukaan banyak sel bakteri (gambar 4.8).

Komposisi persisnya bervariasi, tetapi kebanyakan mengandung protein. Fimbriae

memiliki sepuluh yang melekat kecenderungan untuk menempel satu sama lain dan ke
permukaan. Mereka mungkin bertanggung jawab untuk sel yang saling menempel yang
mengarah ke biofilm dan kumpulan sel tebal lainnya di permukaan cairan dan untuk
kolonisasi mikroba dari padatan mati seperti batu dan kaca (Spotlight on Microbiology
4.1).

Beberapa patogen dapat berkolonisasi dan

menginfeksi jaringan inang karena adhesi yang erat
antara fim briae dan sel epitelnya (gambar 4.8b).
Misalnya, gonococ cus (agen gonore) menyerang
saluran genitourinari, dan Esch erichia coli
menyerang usus dengan cara ini. Bentuk mutan dari
patogen yang kekurangan fimbriae ini tidak dapat
menyebabkan infeksi. Pilus (juga disebut pilus seks)
adalah struktur tubular kaku dan memanjang yang
terbuat dari protein khusus, pilin. Sejauh ini, pili
sejati telah ada hanya ditemukan pada bakteri gram
negatif, di mana mereka terlibat terutama dalam
proses kawin antar sel yang disebut konjugasi,*
yang melibatkan transfer sebagian DNA dari satu
sel ke sel lainnya (gambar 4.9). Sebuah pilus dari
sel donor bersatu dengan sel penerima, sehingga
memberikan koneksi sitoplasma untuk melakukan
transfer. Produksi pili dikendalikan secara genetik,
dan konjugasi hanya terjadi antara sel-sel gram
negatif yang kompatibel.

 Pembungkus Bakteri Luar

Sebagian besar bakteri memiliki penutup luar yang kompleks secara kimiawi,
disebut selubung sel, yang terletak di luar sitoplasma. Ini terdiri dari tiga lapisan dasar
yang dikenal sebagai glikokaliks, dinding sel, dan membran sel (gambar 4.10). Lapisan-
lapisan amplop ditumpuk satu sama lain dan seringkali diikat erat seperti kulit luar
dan selongsong kelapa. Meskipun setiap lapisan amplop melakukan fungsi yang berbeda,
bersama-sama mereka bertindak sebagai unit pelindung tunggal. Amplop itu luas dan
dapat menghitung sepersepuluh hingga setengah volume sel. Pelapisan Permukaan Bakteri,
atau Glycocalyx Permukaan sel bakteri sering terpapar pada kondisi lingkungan yang
parah. Glikokaliks berkembang sebagai lapisan molekul makro untuk melindungi sel dan,
dalam beberapa kasus, membantunya menempel lingkungan. Glikokaliks berbeda di antara
bakteri dalam hal ketebalan, atau ganisasi, dan komposisi kimia. Beberapa bakteri
diselimuti oleh perisai lepas dan larut yang disebut lapisan lendir yang ternyata
melindungi mereka dari kehilangan air dan nutrisi (gambar 4.11a). Bakteri lain
menghasilkan kapsul unit polisakarida berulang, protein, atau keduanya (gambar 4.11b).
Kapsul terikat lebih erat ke sel daripada lapisan lendir, dan memiliki konsistensi
bergetah yang lebih tebal yang memberikan karakter lengket (lendir) yang mencolok pada
koloni kebanyakan bakteri yang dikapsulkan (gambar 4.12)

Fungsi Khusus Kapsul Glycocalyx dibentuk oleh beberapa bakteri patogen, seperti
Streptococcus pneu moniae (penyebab pneumonia, infeksi paru-paru), Haemophilus
influenzae (salah satu penyebab meningitis), dan Bacillus an thracis (penyebab antraks). ).
Sel bakteri yang dienkapsulasi umumnya memiliki patogenisitas yang lebih besar karena
kapsul melindungi bakteri dari sel darah putih yang disebut fagosit. Fagosit adalah
pertahanan tubuh alami yang dapat menelan dan menghancurkan sel asing melalui
fagositosis, sehingga mencegah infeksi. Lapisan kapsul membuat bakteri terlalu licin
untuk ditangkap atau dicerna oleh fagosit. Dengan lolos dari fagositosis, bakteri bebas
berkembang biak dan menginfeksi jaringan tubuh. Bakteri berkapsul yang bermutasi
menjadi bentuk tidak berkapsul biasanya kehilangan patogenisitasnya.
 Jenis lain dari glikokaliks dapat menjadi
penting dalam pembentukan biofilm. Plak
putih tebal yang terbentuk pada gigi sebagian
berasal dari lendir permukaan yang dihasilkan
oleh streptokokus tertentu di rongga mulut.
Lendir ini awalnya memungkinkan mereka
untuk menempel pada gigi dan menyediakan
ceruk bagi bakteri mulut lainnya yang, pada
waktunya, dapat menyebabkan penyakit gigi.
Glikokaliks beberapa bakteri sangat melekat
sehingga bertanggung jawab untuk kolonisasi
terus-menerus dari bahan tak hidup seperti
kateter plastik, alat kontrasepsi, dan alat pacu
jantung logam yang umum digunakan medis
(gambar 4.13)
  Struktur Dinding Sel
Tepat di bawah glikokaliks terletak lapisan kedua, dinding sel. Struktur ini
menyumbang sejumlah karakteristik bakteri penting. Secara umum, itu menentukan
bentuk bakteri, dan juga memberikan jenis dukungan struktural yang kuat yang
diperlukan untuk itu menjaga agar bakteri tidak meledak atau runtuh karena perubahan
tekanan osmotik. Dengan cara ini, dinding sel berfungsi seperti ban sepeda yang
mempertahankan bentuk yang diperlukan dan mencegah ban dalam yang lebih halus
agar tidak pecah saat dilebarkan. Dinding sel sebagian besar bakteri memperoleh kualitas
yang relatif kaku dari makromolekul unik yang disebut peptidoglikan (PG). Peptidoglikan
hanyalah salah satu dari beberapa bahan yang ditemukan di dinding sel, dan jumlah
serta komposisi pastinya bervariasi di antara kelompok bakteri utama.
 Perbedaan Struktur Dinding Sel Lebih dari seratus tahun yang lalu, jauh sebelum
anatomi rinci bakteri diketahui, seorang dokter Denmark bernama Hans Christian Gram
mengembangkan teknik pewarnaan, pewarnaan Gram, yang menggambarkan dua
kelompok bakteri yang berbeda secara umum (Histori cal Sorotan 4.2). Kita sekarang
tahu bahwa reaksi pewarnaan kontras yang terjadi dengan pewarnaan ini sepenuhnya
disebabkan oleh beberapa perbedaan mendasar yang sangat menyenangkan dalam struktur
dinding sel bakteri. Dua kelompok besar yang ditunjukkan oleh teknik ini adalah bakteri
gram positif dan bakteri gram negatif. Karena pewarnaan Gram bisa tidak benar-benar
mengungkapkan sifat dari perbedaan fisik ini, kita harus beralih ke mikroskop elektron
dan analisis biokimia.

Besarnya perbedaan antara bakteri

gram positif dan gram negatif terlihat
jelas pada tampilan fisik selubung selnya
(gambar 4.15). Pada sel gram positif,
bagian mikroskopis menyerupai sandwich
berwajah terbuka dengan dua lapisan:
dinding sel luar yang tebal, terutama
terdiri dari peptidoglikan, dan membran
sel. Bagian serupa dari selubung sel
gram negatif menunjukkan sandwich
lengkap dengan tiga lapisan: dinding sel,
terdiri dari membran luar dan lapisan
tipis peptidoglikan, dan membran sel.
Lihat tabel 4.1 untuk perbandingan jenis
dinding sel lebih lanjut.
 Dinding Sel Gram-Positif Sebagian besar dinding sel gram positif adalah selubung
peptidoglikan yang tebal dan homogen dengan ketebalan mulai dari 20 hingga 80 nm.
Ini juga mengandung polisakarida asam yang terikat erat, termasuk asam teichoic dan
asam lipoteichoic (gambar 4.16). Asam teikoat adalah polimer ribitol atau gliserol dan
fosfat yang tertanam dalam selubung peptidoglikan. Asam lipoteikoat memiliki struktur
yang mirip tetapi melekat pada lipid di membran plasma. Molekul-molekul ini
tampaknya berfungsi dalam pemeliharaan dan pembesaran dinding sel selama pembelahan
sel, dan mereka juga berkontribusi pada muatan asam pada permukaan sel. Dalam
beberapa kasus, dinding sel bakteri gram positif menempel erat pada membran sel
dengan sedikit ruang di antara mereka, ruang periplasmik* tipis tampak jelas di antara
membran sel dan dinding sel.

Dinding Sel Gram-Negatif Dinding sel gram-negatif lebih kompleks secara

morfologi karena mengandung membran luar (OM), memiliki cangkang peptidoglikan
yang lebih tipis, dan memiliki ruang luas yang mengelilingi peptidoglikan (gambar 4.16).
Membran luar agak mirip dalam konstruksi dengan membran sel, kecuali bahwa ia
mengandung jenis wahana dan protein polysaccha khusus. Lapisan paling atas dari OM
berisi lipopolisakarida (LPS). Rantai polisakarida yang memanjang dari permukaan
berfungsi sebagai antigen dan reseptor. Lapisan paling dalam dari OM adalah lapisan
lipid lain yang ditambatkan melalui lipoprotein ke lapisan peptidoglikan di bawahnya.
Membran luar berfungsi sebagai saringan kimia parsial dengan hanya memungkinkan
molekul yang relatif kecil untuk menembus. Akses disediakan oleh saluran membran
khusus yang dibentuk oleh protein porin yang sepenuhnya menjangkau membran luar.
Ukuran porin ini dapat diubah sehingga menghalangi masuknya bahan kimia berbahaya,
menjadikannya salah satu pertahanan bakteri gram negatif terhadap antibiotik tertentu.

Lapisan
bawah
dinding
gram
negatif
adalah
satu
lembar
peptidoglikan tipis (1-3 nm). Meskipun bertindak sebagai struktur pelindung yang agak
kaku seperti yang dijelaskan sebelumnya, ketipisannya memberikan bakteri gram negatif
fleksibilitas dan kepekaan yang relatif lebih besar terhadap lisis. Ada ruang periplasma
yang berkembang dengan baik di sekitar peptidoglikan. Ruang ini merupakan tempat
reaksi yang penting bagi sekumpulan besar dan beragam zat yang masuk dan keluar sel.
infeksi seperti meningitis dan demam tifoid. Protein yang melekat pada bagian luar
dinding sel beberapa spesies gram positif, termasuk Corynebacterium diphtheriae
(penyebab diphtheria) dan Streptococcus pyogenes (penyebab radang tenggorokan), juga
memiliki sifat toksik. Lipid di dinding sel spesies Mycobacter terium tertentu juga
berbahaya bagi sel manusia. Karena sebagian besar makromolekul dalam dinding sel
asing bagi manusia, mereka merangsang produksi antibodi oleh sistem kekebalan.

 Struktur Membran Sel

Muncul tepat di bawah dinding sel adalah membran sel, atau sitoplasma, sangat
tipis (5-10 nm), lembaran fleksibel yang dibentuk sepenuhnya di sekitar sitoplasma.
Komposisi umumnya dijelaskan dalam bab 2 sebagai lipid bilayer dengan protein yang
tertanam dalam berbagai derajat (lihat Microbits 2.3). Membran sel bakteri memiliki
struktur khas ini, terutama mengandung fosfolipid (membentuk sekitar 30-40% massa
membran) dan protein (berkontribusi 60-70%). Pengecualian utama untuk deskripsi ini
adalah membran mikoplasma, yang mengandung sterol dalam jumlah tinggi—lipid kaku
yang menstabilkan dan memperkuat membran—dan membran archaea, yang mengandung
hidrokarbon bercabang yang unik daripada asam lemak.
Di beberapa lokasi, membran sel membentuk kantong internal di dalam sitoplasma
yang disebut mesosom* (lihat gambar 4.1). Ini menonjol pada bakteri gram positif tetapi
lebih sulit dilihat pada bakteri gram negatif karena ukurannya yang relatif kecil.
Mesosom mungkin meningkatkan luas permukaan internal yang tersedia untuk aktivitas
membran. Beberapa fungsi mesosom yang diusulkan adalah untuk berpartisipasi dalam
sintesis dinding sel dan untuk memandu kromosom bakteri yang digandakan ke dalam
dua sel anak selama pembelahan sel (lihat gambar 7.14).Prokariota fotosintesis seperti
cyanobacteria mengandung tumpukan padat membran internal yang membawa pigmen
fotosintesis (lihat gambar 4.34)
Fungsi Membran Sel Karena bakteri tidak memiliki organel eukariotik, membran
sel menyediakan tempat untuk fungsi seperti reaksi energi, pemrosesan nutrisi, dan
sintesis. Tindakan utama dari membran sel adalah untuk mengatur transportasi, yaitu
lewatnya nutrisi ke dalam sel dan pembuangan limbah. Meskipun berair dan kecil
molekul bermuatan dapat berdifusi melintasi membran tanpa bantuan, membran adalah
struktur permeabel selektif dengan mekanisme pembawa khusus untuk lewatnya sebagian
besar molekul (lihat bab 7). Glikokaliks dan dinding sel dapat menghalangi lewatnya
molekul besar, tetapi mereka bukan alat transportasi utama. Membran sel juga terlibat
dalam sekresi, atau pelepasan produk metabolisme ke lingkungan ekstraseluler.Selaput
prokariota adalah situs penting untuk sejumlah aktivitas metabolisme. Sebagian besar
enzim respirasi dan sintesis ATP berada di membran sel karena prokariota tidak
memiliki mitokondria. Struktur enzim yang terletak di membran sel juga membantu
mensintesis makromolekul struktural untuk digabungkan ke dalam selubung dan
pelengkap sel. Produk lain (enzim dan toksin) disekresikan oleh membran ke lingkungan
ekstra seluler.

Struktur internal
 Isi Sitoplasma Sel
Terbungkus oleh membran sel adalah padat, solusi agar-agar disebut sebagai
sitoplasma, yang merupakan situs lain yang menonjol untuk banyak aktivitas biokimia
dan sintetik sel. Komponen utamanya adalah air (70–80%), yang berfungsi sebagai
pelarut untuk kumpulan sel, campuran kompleks nutrisi termasuk gula, asam amino, dan
garam. Komponen kolam ini berfungsi sebagai blok bangunan untuk sintesis sel atau
sebagai sumber energi. Sitoplasma juga mengandung massa sel diskrit yang lebih besar
seperti badan kromatin, ribosom, mesosom, dan butiran.

 Kromosom Bakteri dan Plasmid: Sumber Informasi Genetik

Materi herediter bakteri ada dalam bentuk untaian DNA sirkular tunggal yang
disebut sebagai kromosom bakteri.* Menurut definisi, bakteri tidak memiliki nukleus;
yaitu, DNA mereka tidak tertutup oleh membran inti melainkan dikumpulkan di area
padat sel yang disebut nukleoid.* Kromosom sebenarnya adalah molekul DNA yang
sangat panjang yang melingkar erat
di sekitar molekul protein dasar
khusus sehingga agar pas di dalam
kompartemen sel (lihat Microbits
9.3). Tersusun sepanjang panjangnya
adalah unit genetik (gen) yang
membawa informasi yang diperlukan
untuk pemeliharaan dan pertumbuhan
bakteri. Ketika terkena pewarnaan
atau pengamatan khusus yang
disajikan dengan mikroskop elektron,
kromosom memiliki tampilan
granular atau berserat (gambar 4.18).
Meskipun kromosom adalah
persyaratan genetik minimal untuk kelangsungan hidup bakteri, banyak bakteri
mengandung potongan DNA non-esensial lainnya yang disebut plasmid.* Untaian
mosomal ekstra kromosom yang kecil dan melingkar ini dapat bebas atau terintegrasi ke
dalam kromosom; mereka digandakan dan diteruskan ke keturunannya. Mereka tidak
penting untuk pertumbuhan dan metabolisme bakteri, tetapi mereka sering memberi sifat
protektif seperti menolak obat dan memproduksi toksin dan enzim (lihat bab 9). Karena
mereka dapat dengan mudah dimanipulasi di laboratorium dan dipindahkan dari satu sel
bakteri ke sel bakteri lainnya, plasmid merupakan agen penting dalam teknik rekayasa
genetika modern.

 Ribosom:
Tempat Sintesis Protein Sebuah sel
bakteri mengandung ribuan unit kecil
dan diskrit yang disebut ribosom.* Bila
dilihat bahkan dengan perbesaran yang
sangat tinggi, ribosome tampak sebagai
bintik bulat halus yang tersebar di
seluruh sitoplasma yang sering terjadi
dalam rantai (polisom). Mereka juga
melekat pada membran sel. Secara
kimiawi, ribosom adalah kombinasi dari
jenis RNA khusus yang disebut RNA
ribosom, atau rRNA (sekitar 60%), dan
protein (40%). Salah satu metode untuk
mengkarakterisasi ribosom adalah dengan
unit S, atau Svedberg,2 , yang menilai
ukuran molekul berbagai bagian sel yang
telah dipintal dan dipisahkan
berdasarkan berat dan bentuk molekul
dalam mesin sentrifus. Struktur yang
lebih berat dan lebih kompak mengendap
lebih cepat dan diberi peringkat S yang lebih tinggi. Menggabungkan metode analisis ini
dengan mikroskop elektron beresolusi tinggi telah mengungkapkan bahwa ribsom
prokariotik, yang memiliki peringkat keseluruhan 70S, sebenarnya terdiri dari dua subunit
yang lebih kecil.Unit 30S terlihat seperti hati; unit 50S memiliki kemiripan dengan
mahkota (gambar 4.19). Mereka cocok bersama untuk membentuk platform miniatur di
mana sintesis protein dilakukan. Kami memeriksa fungsi ribosom yang lebih rinci di bab
9.

 Inklusi, atau Butiran:

 Badan Penyimpan Sebagian besar
bakteri terpapar perubahan parah dalam
ketersediaan makanan.Selama periode
kelimpahan nutrisi, mereka
mengkompensasi dengan meletakkan nutrisi
secara intraseluler dalam badan inklusi,
atau inklusi,* dengan berbagai ukuran,
jumlah, dan kandungan. Karena sumber
lingkungan dari nutrisi ini habis, sel
bakteri dapat memobilisasi gudangnya
sendiri sesuai kebutuhan. Beberapa badan
inklusi menyelubungi zat organik padat
kaya energi, termasuk glikogen dan poli-
hidroksibutirat (PHB), di dalam membran
membran berlapis tunggal khusus (gambar
4.20). Jenis inklusi unik yang ditemukan pada beberapa bakteri air adalah vesikel gas
yang memberikan daya apung dan pengapungan. Inklusi lain, juga disebut butiran,
mengandung kristal senyawa anorganik dan tidak tertutup oleh membran. Butiran
belerang dari bakteri fotosintetik (lihat gambar 4.35b) dan butiran polifosfat dari
Corynebacterium (lihat gambar 4.22) dan Mycobacterium adalah jenis ini. Yang terakhir
merupakan sumber penting dari blok bangunan untuk asam nukleat dan sintesis ATP.
Butiran ini disebut butiran metakromatik* karena warnanya kontras (merah, ungu) dengan
adanya pewarna biru metilen.

 Bakteri Endospores:

Banyak bukti menunjukkan bahwa anatomi bakteri membantu mereka menyesuaikan

diri dengan baik terhadap habitat yang merugikan. Tetapi dari semua struktur mikroba,
tidak ada yang dapat dibandingkan dengan endospora* bakteri (atau hanya spora) untuk
bertahan dalam kondisi yang tidak bersahabat dan memfasilitasi kelangsungan hidup
Endospora adalah tubuh tidak aktif yang diproduksi oleh genera gram positif Bacillus,
Clostridium, dan Sporosarcina. Bakteri ini memiliki siklus hidup dua fase—sel vegetatif
dan en dospora (gambar 4.21a). Sel vegetatif adalah entitas yang aktif secara metabolik
dan tumbuh yang dapat diinduksi oleh kondisi lingkungan untuk menjalani pembentukan
spora, atau sporulasi. Setelah terbentuk, spora berada dalam kondisi istirahat dan inert
yang terlihat jelas pada pewarnaan spora atau Gram (gambar 4.21b). Foto pembuka bab
juga menunjukkan tahapan dalam siklus ini, diwarnai dengan pewarna fluoresen
diferensial. Ciri-ciri spora, termasuk ukuran, bentuk, dan posisi dalam sel vegetatif,
berguna untuk mengidentifikasi beberapa spesies.
 Pembentukan dan Perlawanan Endospora Penipisan nutrisi, terutama sumber karbon
atau nitrogen yang memadai, merupakan rangsangan bagi sel vegetatif untuk memulai
pembentukan spora.Setelah rangsangan ini diterima oleh sel vegetatif, ia mengalami
konversi menjadi sel sporulasi yang berkomitmen yang disebut sporangium. Transformasi
lengkap sel vegetatif menjadi sporangium dan kemudian menjadi spora membutuhkan 6
hingga 8 jam pada sebagian besar spesies pembentuk spora .

Tabel 4.2 mengilustrasikan beberapa peristiwa fisik dan kimia utama dalam proses
ini. Endospora bakteri adalah yang paling keras dari semua bentuk kehidupan, mampu
menahan panas ekstrem, pengeringan, pembekuan, radiasi, dan bahan kimia yang siap
membunuh sel vegetatif. Kelangsungan hidup mereka dalam kondisi yang keras seperti
itu disebabkan oleh beberapa faktor. Panasresistensi spora telah dikaitkan dengan
kandungan kalsium dan asam dipicolinic yang tinggi, meskipun peran yang tepat dari
bahan kimia ini belum jelas. Kita tahu, misalnya, bahwa panas merusak sel dengan
menonaktifkan protein dan DNA dan bahwa proses ini memerlukan sejumlah air dalam
protoplasma. Karena pengendapan kalsium dipi colinate dalam spora menghilangkan air
dan membuat spora sangat kering, spora kurang rentan terhadap efek panas. Ini juga
secara metabolik tidak aktif dan sangat tahan terhadap kerusakan akibat pengeringan
lebih lanjut. Lapisan korteks dan spora yang tebal dan kedap air juga melindungi dari
radiasi dan bahan kimia (gambar 4.21c). Umur panjang spora bakteri mendekati
keabadian. Satu catatan menggambarkan isolasi spora yang layak dari fosil lebah yang
berusia 25 juta tahun. Baru-baru ini, ahli mikrobiologi menemukan spora yang layak dari
kristal garam berusia 250 juta tahun
 Perkecambahan Endospora Setelah berada dalam keadaan tidak aktif untuk waktu
yang tidak terbatas, spora dapat direvitalisasi ketika kondisi yang menguntungkan
muncul. Pemecahan dormansi, atau perkecambahan, terjadi dengan adanya air dan bahan
kimia tertentu atau rangsangan lingkungan (agen perkecambahan).Setelah dimulai, proses
penyelesaiannya cukup cepat (11 2 jam). Meskipun agen perkecambahan spesifik

bervariasi di antara spesies, umumnya

merupakan molekul organik kecil
seperti asam amino atau garam
anorganik. Agen ini merangsang
pembentukan enzim hidrolitik
(pencernaan) oleh membran spora.
Enzim ini mencerna korteks dan
memaparkan inti ke air. Saat inti
mengalami rehidrasi dan mengambil
nutrisi, ia mulai tumbuh dari mantel
spora. Pada waktunya, ia kembali ke
sel vegetatif yang sepenuhnya aktif,
melanjutkan siklus vegetatif.
  Bentuk, Susunan, dan Ukuran Bakteri
Sebagian besar, bakteri berfungsi sebagai organisme bersel tunggal atau uniseluler
yang independen. Meskipun benar bahwa sel bakteri individu dapat hidup menempel
pada yang lain dalam koloni atau pengelompokan lain semacam itu, masing-masing
sepenuhnya mampu melakukan semua aktivitas kehidupan yang diperlukan, seperti
reproduksi, metabolisme, dan pemrosesan nutrisi (tidak seperti lebih banyak bakteri). sel
khusus dari organisme multiseluler). Bakteri menunjukkan variasi yang cukup besar
dalam bentuk, ukuran, dan susunan koloni. Lebih mudah untuk mendeskripsikan
sebagian besar bakteri dengan salah satu dari tiga bentuk umum seperti yang ditentukan
oleh konfigurasi dinding sel (gambar 4.22).
Jika sel berbentuk bulat atau bola, bakteri terium dideskripsikan sebagai coccus.*
Cocci bisa berbentuk bola sempurna, tetapi bisa juga berbentuk oval, berbentuk kacang,
atau bahkan varian runcing. Sel yang berbentuk silindris (lebih panjang dari lebarnya)
disebut batang, atau bacillus.* Ada juga genus bernama Bacillus. Seperti yang
diharapkan, batang juga cukup bervariasi dalam bentuk aslinya. Bergantung pada spesies
bakteri, mereka dapat berbentuk kotak, berbentuk gelendong, ujung bulat, panjang dan
seperti benang (berfilamen), atau bahkan berbentuk tongkat atau stik drum.
 Batang yang pendek dan montok disebut coc cobacillus; jika melengkung dengan
lembut, itu adalah vibrio.* Bakteri yang memiliki bentuk silinder melengkung atau
berbentuk spiral disebut spir illum,* heliks kaku, memutar dua kali atau lebih di
sepanjang sumbunya (seperti pembuka botol). Sel spiral lain yang disebutkan
sebelumnya bersamaan dengan flagela periplasma adalah spirochete, bentuk yang lebih
fleksibel yang menyerupai pegas. Lihat tabel 4.3 untuk perbandingan fitur lain dari dua
bentuk bakteri heliks. Karena sel bakteri terlihat agak dua dimensi dan datar dengan
teknik pewarnaan dan mikroskop tradisional, mereka terlihat paling menguntungkan
dengan mikroskop elektron pemindaian yang menekankan bentuk tiga dimensi mereka
yang mencolok (gambar 4.23).

Agak umum bagi sel-sel dari spesies yang sama untuk bervariasi sampai batas
tertentu dalam bentuk dan ukuran. Fenomena ini, yang disebut pleomor phism* (gambar
4.24a), disebabkan oleh variasi individu dalam struktur dinding sel yang disebabkan oleh
nutrisi atau sedikit perbedaan herediter. Misalnya, meskipun sel-sel Corynebacterium
diphtheriae umumnya dianggap berbentuk batang, dalam kultur mereka menunjukkan
variasi seperti klub berbentuk, bengkak, melengkung, berserabut, dan coccoid.

Pleomorfisme mencapai tingkat ekstrim pada mikoplasma, yang sama sekali tidak
memiliki dinding sel sehingga menunjukkan variasi bentuk yang ekstrim (lihat Gambar
4.33).Sel-sel bakteri juga dapat dikategorikan menurut susunan, atau gaya
pengelompokan (lihat gambar 4.22). Faktor utama yang mempengaruhi susunan jenis sel
tertentu adalah pola pembelahannya dan bagaimana sel tetap melekat setelahnya. Variasi
terbesar dalam susunan terdapat pada kokus, yang dapat tunggal, berpasangan
(diplokokus),* dalam tetrad (kelompok empat), dalam susunan tidak teratur. kelompok
(baik stafilokokus* dan mikrokokus),* atau dalam rantai beberapa hingga ratusan sel
(streptokokus).* Pengelompokan yang lebih kompleks lagi adalah paket kubus yang
terdiri dari delapan, enam belas, atau lebih sel yang disebut sarcina (sar´-sih -nah).
Pengelompokan coccal yang berbeda ini adalah hasil dari pembagian coccus dalam satu
bidang, dalam dua bidang tegak lurus, atau dalam beberapa bidang yang berpotongan;
setelah pembelahan, sel anak sultan yang tersisa tetap melekat (gambar 4.25).
 Archaea: Prokariot Lainnya
Penemuan dan karakterisasi sel prokariotik baru yang memiliki anatomi, fisiologi,
dan genetika yang tidak biasa mengubah pandangan kami tentang taksonomi dan
klasifikasi mikroba. Organisme bersel satu dan sederhana ini, disebut archaea* sekarang
dianggap sebagai tipe sel ketiga dalam super kingdom terpisah (Domain Archaea).
Sebagian besar archaea memiliki morfologi konvensional, yaitu batang, kokus, dan
heliks, tetapi beberapa memiliki morfologi yang sangat tidak biasa. Beberapa gram positif
membelah dengan pembelahan biner, yang lain dengan fragmentasi atau tunas. Secara
fisiologis, archaea ditemukan pada kondisi lingkungan yang ekstrim. Ekstremofil, seperti
yang diketahui, termasuk halofil, termofil, dan asidofil.
Tidak ada archaea patogen yang diketahui. Halofil tumbuh dalam konsentrasi garam
lebih dari 25%. Contohnya ditemukan dalam genus Halobacterium, beberapa di antaranya
bahkan mungkin memerlukan konsentrasi garam tersebut untuk tumbuh. Suhu optimal
pertumbuhan archaea yang sangat termofilik adalah 80°C atau lebih tinggi. Rekor suhu
pertumbuhan saat ini adalah 121°C, yang ditetapkan oleh archaea yang tumbuh di dekat
lubang hidrotermal pada kedalaman 2000 meter di lautan. Archaea asidofilik dapat ditemukan
tumbuh pada nilai pH di bawah nol, dan seringkali juga pada
suhu tinggi. Contohnya adalah Silifolobus, yang pH optimalnya sekitar 2 dan suhu
optimalnya lebih dari 70°C.

Gambar 5. Archaea Pyrodictium abyssi

Secara nutrisi, lautan mengandung banyak archaea nitrifikasi yang mengoksidasi

amonia untuk energi. Beberapa mungkin juga ditemukan di tanah. Metanogen adalah arkea
anaerobik ketat yang menghasilkan metana sebagai produk akhir dengan menggabungkan
hidrogen (H2) dengan karbon dioksida (CO2). Tidak ada metanogen bakteri yang diketahui.
Archaea ini sangat penting secara ekonomi ketika digunakan dalam pengolahan limbah.
Metanogen juga merupakan bagian dari mikrobiota usus besar manusia, vagina, dan mulut.

 Sel Eukariotik

Sel eukariotik sebagian besar lebih besar dan jauh lebih kompleks daripada prokariota

mengandung berbagai organel subselular khusus. Dalam dunia mikroba, kelompok utama

eukariota adalah jamur dan protista (protozoansandalgae) semua kelompok ini memiliki

perwakilan bersel tunggal dan ada bentuk multiseluler dalam ganggang dan jamur. Struktur sel

eukariotik dimulai sekali lagi dengan materi genetik, dan bekerja ke luar. Perbedaan utamanya

adalah membran eukariotik mengandung lipid yang disebut sterol, yang meningkatkan
kekakuannya. Kolesterol yang biasanya kita dengar dalam konteks yang sangat negatif adalah

sterol yang sangat penting yang ditemukan di membran banyak eukariota.

Gambar 1.6 Contoh struktur sel eukariotik

Sel eukariotik lainnya mungkin berbeda sehubungan dengan dinding sel dan kepemilikan

choroplasts. Perhatikan struktur internal yang jauh lebih rumit dibandingkan dengan sel

prokariotik khususnya keberadaan organel yang dibatasi membran seperti mitokondria,

kloroplas, retikulum endoplasma, dan nukleus sejati.

 Nukleus

Perbedaan utama antara sel prokariotik dan eukariotik terletak pada akomodasi materi

genetiknya. Sel eukariotik memiliki nukleus sejati dikelilingi oleh membran inti. Ini sebenarnya

adalah membran ganda mengandung pori-pori di mana messenger RNA meninggalkan nukleus

menuju ribosom selama sintesis protein. Organisasi materi genetik pada eukariota sangat

berbeda dengan yang ada pada prokariota. Alih-alih ada sebagai loop tertutup tunggal DNA

eukariota disusun menjadi satu atau lebih pasang kromosom. Fakta bahwa mereka muncul

berpasangan menyoroti perbedaan penting lainnya dari prokariota: eukariota secara genetik

diploid setidaknya dalam beberapa bagian dari siklus hidup mereka, sementara prokariota

bersifat haploid.
 DNA dari kromosom eukariotik berbentuk garis lurus dalam hal ini memiliki ujung

bebas, namun karena terdapat begitu banyak kecocokan DNA ini sangat padat dan melilit

protein yang disebut histon. Ini membawa muatan positif yang kuat dan berhubungan dengan

gugus fosfat bermuatan negatif pada DNA.Seperti halnya kromosom, nukleus juga

mengandung nukleolus, struktur diskrit yang kaya akan RNA, tempat berkumpulnya ribosom.

Ribosom sendiri memiliki fungsi yang sama dengan bagian prokariotiknya, perbedaan ukuran

telah dibahas. Mereka dapat ditemukan bebas di sitoplasma atau terkait dengan retikulum

endoplasma tergantung pada jenis protein yang disintesis.

 Retikulum Endoplasma

Berjalan di seluruh sel dan mengambil sebagian besar volumenya, retikulum endoplasma

(RE) adalah sistem membran tabung dan kantung pipih yang kompleks. Adanya banyak

ribosom pada permukaannya memberikan gambaran RE kasar pada bagian yang terlibat dalam

sintesis protein ketika dilihat di bawah mikroskop elektron, sehingga disebut RE kasar. Area

RE yang tidak berhubungan dengan ribosom dikenal sebagai RE halus; ini adalah tempat

sintesis lipid membran berlangsung. RE juga berfungsi sebagai jaringan komunikasi, yang

memungkinkan pengangkutan material antar berbagai bagian sel.

 Aparatus Golgi

Aparatus Golgi adalah organel membran lainnya, yang terdiri dari satu set vesikel pipih,

biasanya tersusun dalam tumpukan yang disebut dictyosome. Fungsi aparatus Golgi adalah

untuk mengemas zat yang baru disintesis seperti protein dan membantu pengangkutannya

keluar dari sel. Zat-zat tersebut terkandung dalam vesikel yang dilepaskan dari bagian utama

kompleks, dan menyatu dengan membran sitoplasma. Aparatus Golgi tidak terdefinisi dengan

baik pada jamur dan protozoa tertentu.

  Lisosom

Fungsi lain dari aparatus Golgi adalah mengemas enzim hidrolitik (pencernaan) tertentu

ke dalam paket yang terikat membran yang disebut lisosom. Enzim diperlukan untuk mencerna

molekul nutrisi yang masuk ke dalam sel melalui endositosis dan akan memecah struktur sel itu

sendiri jika tidak terkandung di dalam lisosom. Peroksisom mirip dengan lisosom tetapi lebih

kecil dan juga mengandung enzim degradatif. Mereka mengandung enzim katalase, yang

memecah hidrogen peroksida yang berpotensi beracun yang dihasilkan oleh reaksi pemecahan

lainnya di dalam peroksisom.

Gambar 1.7 Endositosis

Vakuola yang terikat membran mengelilingi partikel makanan dan

menginternalisasikannya dalam bentuk fagosom. Ini bergabung dengan lisosom yang

melepaskan enzim pencernaan mengakibatkan kerusakan isi. Proses endositosis mirip dengan

sel eukariotik.

 Mitokondria

Terkait dengan membran plasma, pada eukariota mereka ditemukan dalam organel

khusus yang disebut mitokondria. Ini umumnya berbentuk batang dan mungkin ada dalam
jumlah besar. Mereka diselimuti oleh membran ganda permukaan dalamnya terlipat menjadi

tonjolan-tonjolan seperti jari yang disebut krista. Enzim pernapasan terletak pada peningkatan

luas permukaan yang disediakannya sementara reaksi metabolik lainnya berlangsung dalam

matriks semi-cair. Krista mitokondria ganggang, jamur dan protozoa masing-masing memiliki

bentuk karakteristiknya sendiri. Sampai baru-baru ini beberapa protozoa primitif seperti

Giardia, tampaknya tidak memiliki mitokondria sama sekali dan dianggap mewakili tahap

peralihan dalam evolusi kondisi eukariotik. Penelitian terbaru bagaimanapun telah

menunjukkan mereka memiliki sisa-sisa mitokondria yang sangat tereduksi yang telah diberi

nama mitososom. Tampaknya organisme seperti itu, setelah semua memiliki mitokondria tetapi

kemudian kehilangan banyak fungsinya sebuah contoh dari apa yang disebut evolusi reduktif.

Gambar 1.8 Struktur Mitokondria

Membran dalam lokasi rantai transpor elektron dalam respirasi aerobik, dibentuk oleh

invaginasi membran luar yang lebih permeabel. Mitokondria memiliki dimensi serupa dengan

banyak bakteri (sekitar 1–3µm) tetapi bentuknya dapat bervariasi karena plastisitas

membrannya.

 Kloroplas

Kloroplas adalah organel khusus yang terlibat dalam proses fotosintesis, konversi cahaya

menjadi energi seluler. Dengan demikian, mereka adalah ciri khas tanaman hijau dan alga.

Seperti mitokondria, kloroplas dikelilingi oleh membran ganda, dan berfungsi sebagai lokasi
reaksi penghasil energi. Di dalam kloroplas terdapat kantung membran pipih yang dikenal

sebagai tilakoid, yang mengandung klorofil pigmen fotosintetik. Tilakoid tersusun dalam

tumpukan yang disebut grana. Mitokondria dan kloroplas keduanya mengandung 70 sribosom

(mirip dengan yang ditemukan pada prokariota), DNA sirkular dalam jumlah terbatas dan

sarana untuk mereplikasi diri. Ini terlihat sebagai bukti kunci untuk teori endosimbiotik

eukariotik evolusi yang membayangkan bahwa organel khusus dalam sel eukariotik muncul

dari konsumsi prokariota kecil yang dalam jangka waktu lama kehilangan eksistensi

independennya.

Gambar 1.9 Struktur Kloroplas

Generasi adenosin trifosfat dari fotosintesis terjadi pada membran tilakoid. Dalam

ganggang hijau ini berbentuk struktur diskrit yang disebut grana. Enzim ribulosa bifosfat

karboksilase, bertanggung jawab untuk memfiksasi karbon dioksida melalui siklus Calvin

terletak di stroma. Membran luar kloroplas relatif permeabel, memungkinkan difusi produk

fotosintesis ke dalam sitoplasma sekitarnya.

 Dinding Sel

Tidak semua eukariota memiliki dinding sel di antara yang melakukannya adalah jamur,

alga, dan tanaman. Sementara fungsinya seperti prokariota memberikan kekuatan pada sel,

komposisi kimianya sangat berbeda, umumnya jauh lebih sederhana. Dinding sel tanaman,

ganggang dan anggota jamur yang lebih rendah didasarkan pada selulosa rantai molekul

glukosa berulang yang dihubungkan oleh ikatan β-1,4, dan mungkin juga termasuk pektin dan
hemiselulosa, keduanya juga merupakan polimer dari gula sederhana. Sebagian besar jamur

seperti ragi dan jamur mengandung kitin, suatu polimer dari N-asetilglukosamin.

Kitin juga dapat ditemukan sebagai komponen utama dari eksoskeleton serangga dan

krustasea, dimana fungsinya juga untuk memberikan kekuatan dan kekakuan. Seperti pada

prokariota, dinding sel memainkan peran kecil dalam pertukaran bahan antara sel dan

lingkungannya peran yang dipenuhi oleh membran plasma. Beberapa protozoa dan alga

uniseluler dikelilingi oleh pelikel fleksibel yang terbuat dari protein.

 Flagela dan Silia

Motilitas dalam sel eukariotik dapat dicapai melalui flagela atau silia. Silia dapat

dianggap sebagai pada dasarnya flagela pendek. Keduanya tertutup di dalam membran plasma

dan berlabuh melalui tubuh basal. Sel berflagel umumnya memiliki flagel tunggal, sedangkan

silia sering hadir dalam jumlah yang sangat besar pada setiap sel. Di dunia mikroba flagela

ditemukan dalam protozoa dan bentuk alga motil, sedangkan silia sebagian besar ditemukan

dalam kelas protozoa yang disebut Ciliophora. Flagela dan silia tidak ditemukan pada anggota

Jamur. Meskipun mereka berbagi morfologi kasar seperti benang yang sama.

Flagela eukariotik berbeda secara dramatis dalam ultrastruktur mereka dari prokariota.

Terlihat pada penampang, mereka memiliki penampilan yang sangat khas, terdiri dari dua

mikrotubulus pusat dikelilingi oleh sembilan pasang lagi yang disusun dalam lingkaran.

Mikrotubulus terbuat dari protein yang disebut tubulin. Flagela pada eukariota berdenyut dalam

gelombang, bukannya berputar. Silia hadir dalam jumlah besar berdetak secara terkoordinasi

sehingga beberapa bergerak maju sementara yang lain dalam gerakan pemulihan. Pada hewan,

gerakan silia diadaptasi untuk memindahkan materi partikulat melintasi permukaan jaringan sel

bersilia pada saluran pernapasan misalnya, bertindak sebagai garis pertahanan pertama dalam

membuang partikel yang terhirup seperti bakteri dari saluran udara.

 Gambar 1.10 Flagella eukariotik memiliki karakteristik struktur '9+2'

Meskipun secara fungsional analog dengan rekan prokariotiknya, flagela eukariotik

sangat berbeda dalam struktur halusnya. Sebuah membran mengelilingi susunan mikrotubulus

berprotein, di mana sembilan pasang mengelilingi satu pasangan pusat. Gerakan flagela

eukariotik adalah melalui gerakan mirip cambuk yang digerakkan oleh adenosin trifosfat.

Pembelahan Sel pada Prokariota dan Eukariota

Pada prokariota uniseluler pembelahan sel dengan pembelahan biner mengarah pada

penciptaan individu baru. Pertumbuhan terjadi pada sel individu sampai ukuran maksimum

tercapai dan dinding silang terbentuk. Sebelum pembelahan sel terjadi, materi genetik harus

mereplikasi dirinya sendiri dan satu salinan diteruskan ke setiap sel anak baru. Pembelahan sel

pada eukariota juga menghasilkan dua sel anak yang identik. Dalam kasus eukariota uniseluler

ini menghasilkan dua organisme individu (reproduksi aseksual) sedangkan dalam bentuk

multiseluler terjadi peningkatan ukuran keseluruhan.

Pembelahan sel didahului oleh proses pembelahan inti yang disebut mitosis, yang

memastikan bahwa kedua sel anak menerima kromosom lengkap. Pada interfase, kromosom

tidak terlihat jelas di bawah mikroskop replikasi DNA terjadi selama periode ini. Kromosom

yang digandakan, disatukan sebagai kromatid saudara perempuan oleh sentromer, bergerak

menuju pusat sel selama profase. Serangkaian mikrotubulus membentuk gelendong di

antaranya sentriol, dan kromosom berbaris sepanjang ini selama metafase. Juga, selama fase ini

membran nukleus rusak, dan setiap sentromer bereplikasi. Satu kromosom dari setiap pasangan

kemudian bermigrasi dari pusat ke ujung gelendong yang berlawanan. Tahap ini disebut

anafase. Akhirnya, dalam telofase, membran inti baru mengelilingi dua set kromosom, untuk

membentuk dua inti. Mitosis diikuti oleh pembelahan sel. Secara keseluruhan, proses mitosis

menghasilkan dua inti identik yang mengandung nomor kromosom asli (diploid).

Gambar 1.11 Fisi biner pada E. Coli

Replikasi kromosom sirkular tunggal disertai dengan peningkatan ukuran sel. Membran

plasma berinvaginasi, dan dinding silang baru disintesis, menghasilkan dua sel anak baru. Pada

berbagai tahap siklus hidup eukariotik proses meiosis dapat terjadi yang membagi dua jumlah

kromosom sehingga setiap nukleus hanya berisi satu salinan dari masing-masing. Dalam

reproduksi seksual gamet haploid terbentuk dengan cara ini, dan kondisi diploid dipulihkan saat

dua gamet yang berbeda melebur. Pada beberapa eukariota, bukan hanya gamet tetapi bagian

penting dari siklus hidup dapat terjadi dalam bentuk haploid. Meiosis terdiri dari dua

pembelahan inti, yang kedua sangat mirip dengan proses mitosis. Pada pembelahan meiosis

pertama, kromosom homolog (yaitu dua anggota dari suatu pasangan) berbaris bersama-sama

pada gelendong dan akhirnya bermigrasi ke kutub yang berlawanan.

 Gambar 1.12 Tahapan utama (a) mitosis dan (b) meiosis pada organisme yang
bilangan diploidnya (2n) =4.

Mitosis menghasilkan dua sel yang identik dengan induknya. Meiosis menghasilkan

pengurangan jumlah kromosom dan memperkenalkan variasi genetik melalui persilangan.

Gambar 1.13 Pindah silang mengarah pada rekombinasi materi genetik

 Selama persilangan, bagian dari kromosom homolog dipertukarkan. Ini membentuk dasar

rekombinasi genetik pada eukariota dan memastikan bahwa keturunan mengandung kombinasi

baru materi genetik.

 Peran Mikroorganisme dalam Produksi Pangan

Pada akhir abad ke-19, mikroba yang digunakan dalam produksi makanan
ditumbuhkan dalam kultur murni untuk pertama kalinya. Perkembangan ini dengan cepat
mengarah pada pemahaman yang lebih baik tentang hubungan antara mikroba tertentu dan
produk serta aktivitasnya. Periode ini dapat dianggap sebagai awal mikrobiologi makanan
industri.

Misalnya, setelah dipahami bahwa ragi tertentu yang tumbuh dalam kondisi
tertentu menghasilkan bir dan bakteri tertentu dapat merusak bir, pembuat bir lebih mampu
mengontrol kualitas produk mereka. Industri tertentu menjadi aktif dalam penelitian
mikrobiologi dan memilih mikroba tertentu untuk kualitas khusus mereka. Industri
embuatan bir secara ekstensif menyelidiki isolasi dan identifikasi ragi dan memilih ragi
yang dapat menghasilkan lebih banyak alkohol.
1. Produk Olahan Susu

Susu dapat difermentasi untuk menghasilkan berbagai produk, termasuk

mentega, yoghurt, dan keju (Gambar 10). Dalam setiap kasus, asam yang dihasilkan oleh
proses fermentasi menyebabkan koagulasi atau penggumpalan protein susu.
Dalam pembuatan keju, koagulasi ini dipengaruhi oleh penambahan renin protease,
atau oleh aksi bakteri asam laktat (terutama Streptococcus lactis dan S. cremoris). Koagulasi
memungkinkan pemisahan dadih setengah padat dari whey cair. Setelah pemisahan,
sebagian besar dadih (zat padat) keju ditekan dan dibentuk untuk menghilangkan
kelebihan cairan dan memadatkan teksturnya. Dalam beberapa kasus, inokulasi segar
mikroorganisme dilakukan pada titik ini, seperti penambahan spora Penicillium ke keju
Camembert dan Brie. Panjang periode pematangan keju bervariasi dari satu bulan hingga
lebih dari satu tahun menurut jenisnya.

Gambar 10. Produk olahan susu

Yoghurt adalah produk olahan susu lainnya. Terdapat dua bakteri yaitu
Streptococcus thermophilus dan Lactobacillus bulgaricus yang berfungsi untuk
memfermentasi laktosa yang ada dalam susu menjadi asam laktat. Selain itu, L.
bulgaricus berfungsi untuk memberi rasa pada yoghurt. Produk susu lainnya, seperti
sour cream dan buttermilk, juga diproduksi melalui sifat fermentatif spesies
Streptococci dan Lactobacilli
.
 2. Roti
Agen biologis yang berfungsi dalam produksi roti adalah ragi. Sebenarnya ragi roti dan
ragi bir hanyalah strain yang berbeda dari spesies yang sama, yaitu Saccharomyces cerevisiae.
Dalam pembuatan roti, gula yang ada dalam adonan diubah sepenuhnya menjadi karbon
dioksida. Hal inilah yang menyebabkan roti mengembang. Etanol dalam jumlah kecil yang
dihasilkan diuapkan selama proses pemanggangan. Ada banyak bahan makanan populer
lainnya yang merupakan hasil dari proses fermentasi mikroba.

Gambar 11. Penggunaan mikroba dalam proses fermentasi pada pembuatan makanan
dan minunan
Artikel

Pengaruh Penambahan Ekstrak Kulit Nanas dan Gula pada Karakteristik Nata de Soya
dari Limbah Cair Tahu

Nata termasuk makanan yang mempunyai tekstur kenyal, warna putih, agak transparan,
beraroma asam dan memiliki rasa tawar atau sedikit manis. Gula yang terkandung didalam
medium nata yang berupa cairan akan ditransfigurasi menjadi nata oleh aktivitas bakteri
Acetobacter xylinum melalui proses fermentasi. Penamaan produk nata disesuaikan dengan
bahan baku yang digunakan. Nata de Soya adalah nata yang dibuat dari limbah cair tahu. Air
limbah tahu (whey) memiliki kandungan protein dan karbohidrat yang sangat tinggi sehingga
dapat dijadikan media pertumbuhan bakteri Acetobacter xylinum dalam proses pembuatan nata.

Penambahan ekstrak kulit nanas kedalam media pertumbuhan Acetobacter xylinum

mampu memeranguhi karakteristik Nata de Soya yang dihasilkan. Ekstrak kulit nanas dapat
ditambahkan kedalam media untuk pertumbuhan Acetobacter xylinum karena memiliki
karbohidrat dan mineral dalam substrat sebagai nutrisi. Tujuan penelitian ini adalah untuk
mengolah limbah cair tahu menjadi Nata de Soya dengan metode fermentasi dan mengetahui
pengaruh konsentrasi gula dan ekstrak kulit nanas terhadap karakteristik Nata de Soya. Variasi
penambahan konsentrasi sukrosa adalah 28 g/L dan 42 g/L dengan ekstrak kulit nanas sebesar
30 mL/L dan 40 mL/L. Nata de Soya dengan variasi konsentrasi gula 28 g/L dan ekstrak kulit
nanas 30 mL/L memiliki kadar air paling maksimal yaitu 99,24%. Kualitas Nata de Soya
terbaik adalah pada konsentrasi gula 42 g/L dan ekstrak kulit nanas 40 mL/L dengan kadar serat
1,32%, vitamin C 13,80 mg/100 g, rendemen 49,09%, tebal 1,5 cm dan berat 527,27 g.
REFERENSI :

Albert, B., Johnson, A., Lewis, J., Morgan, D., Raff, M., Roberts, K., & Walter, P. (2015).
MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL (sixth). GARLAND SCIENCE.

Albert, B., Bray, D., Hopkin, K., Johnson, A., Morgan, D., Raff, M., Roberts, K., & Walter, P.
(2019). ESSENTIAL CELL BIOLOGY (FIFH). W. W. Norton and company.

Urbaninggar, A., & Fatimah, S. (2021). Pengaruh Penambahan Ekstrak Kulit Nanas dan Gula
pada Karakteristik Nata de Soya dari Limbah Cair Tahu. IJCA (Indonesian Journal of
Chemical Analysis), 4(2), 82–91. https://doi.org/10.20885/ijca.vol4.iss2.art5