Paper Bioinformatika - Indah MR
Paper Bioinformatika - Indah MR
dlingo/dringo, kapulaga, mengkudu/pace, mahkota dewa, Tahap ketiga adalah proses Docking dengan cara
kejibeling, sambiloto, dan lidah buaya [6]. membuka halaman Docthor lalu uploud file protein yang ada
Masing-masing tanaman tersebut memiliki khasiat di folder penyimpanan kemudian klik send. Setelah file
yang berguna sebagai pengobatan, tak terkecuali tanaman obat tercentang, dilanjutkan sent to Dockthor, pilih covactor dan
kunyit. Secara tradisional kunyit digunakan untuk penambah aploud ligan pada folder penyimpanan. Jika sudah tercentang
nafsu makan, peluruh empedu, obat luka dan gatal, anti maka dilanjutkan sent to dockthor dan bisa dilihat hasilnya.
radang, sesak nafas, antidiare, dan merangsang keluarnya
angin perut. Sebagai obat luar digunakan sebagai lulur III. RESULTS AND DISCUSSION
kecantikan dan kosmetika. Secara umum rimpang kunyit
digunakan untuk stimulansia, pemberi warna masakan, dan A. Virus SARS-CoV2 dan siklus hidupnya
minuman serta digunakan sebagai bumbu dapur [7]. Hasil dari penelitian menunjukkan bahwa salah satu
Kurkumin adalah pigmen warna kuning yang agen yang menyebabkan Virus SARS-Cov2 adalah 6YUN
diisolasi dari akar Curcuma longa [8]. Kurkumin memiliki seperti terlihat pada gambar 1
aktivitas yang rendah dalam tubuh akibat adanya metabolisme,
oleh karena itu dilakukan modifikasi terhadap struktur
kurkumin untuk memperoleh senyawa yang lebih poten, stabil,
aman, efektif, dan memiliki aktivitas yang lebih baik.
Beberapa modifikasi senyawa kurkumin telah diteliti dan akan
digunakan sebagai sampel penelitian yaitu struktur 2,6-
dibenzilidenesikloheksanon, struktur 2,5-
dibenzildienasiklopentanon, struktur 1,5–difenil–1,4-
pentadien-3-on telah disintesis oleh Sardjiman et al. [9].
Struktur 1,7-bis(R-fenil)-1,6- heptadien-3,5-dion yang
disintesis oleh Nurfina et al. [10]. Penelitian untuk mengetahui
afinitas senyawa modifikasi kurkumin dapat dilakukan dengan
menggunakan pendekatan secara in silico dengan metode
molecular docking dengan memanfaatkan informasi dari Gambar 1. Salah satu bentuk Virus SARS-Cov-2 6YUN
struktur dan sifat fisikokimia protein target untuk memprediksi Secara ringkas, siklus hidup SARS-CoV-2 diawali oleh
sisi aktif protein yang dapat menimbulkan aktivitas biologis perlekatan virus dengan reseptor Angiotensin Converting
[11]. Enzyme 2 (ACE2) pada permukaan sel inang yang difasilitasi
Pemanfaatan komputer akhir-akhir ini menjadi oleh protein spike (protein S) yang merupakan bagian dari
tawaran yang sangat menarik sebagai alat bantu dalam struktur menyerupai paku pada virus.Proses selanjutnya adalah
penemuan obat. Kemampuan komputasi yang meningkat masuknya virus ke dalam sel inang untuk melepaskan materi
secara eksponensial merupakanpeluang untuk genetiknya yang difasilitasi oleh protein transmembran
mengembangkan simulasi dan kalkulasi dalam merancang TMPRSS2 [13].
obat. In silico merupakan metode pendekatan pada suatu
kondisi atau keadaan nyata ke dalam simulasi computer Setelah materi genetik virus dilepaskan di dalam sel inang,
dengan menggunakan program tertentu. Terminologi in silico, terjadi proses translasi dan perbanyakan materi genetik, serta
analog dengan in vitro dan in vivo merujuk pada pemanfaatan perakitan partikel virus baru yang dilakukan oleh beberapa
komputer dalam studi penemuaan obat, sebagaimana diketahui protein seperti Papain-like protease (PL pro), 3CL pro,
dalam proses penemuan obat membutuhkan waktu yang Helikase dan RdRp [14].
sangat lama dan biaya yang mahal, oleh karena itu Setelah dalam bentuk sempurna, partikel virus (virion)
kecenderungan dalam penggunaan metode in silico pada kimia kemudian lepas dari sel yang terinfeksi melalui eksositosis dan
komputasi dalam pemodelan molekul (desain obat) telah mencari sel inang lainnya. Protein-protein yang terlibat dan
memperoleh momentum yang signifikan [12]. proses yang terjadi pada siklus hidup virus merupakan target
senyawa antivirus yang efektif.
VI. BIOGRAPHIES