METABOLISME

ASAM NUKLEAT
Dr. dr. Doti Wahyuningsih, M. Kes

Kuliah Penunjang Blok EMN-Fisiologi

Selasa, 8 Mei 2023
100 Menit, Daring
Tingkat 1, SEMGEN 2022-2023
 ASAM NUKLEAT
ADALAH POLIMER DARI NUKLEOTIDA
Nukleotida adalah molekul yang terdiri dari 3
komponen: Pospat, Ribosa, dan basa purin atau
basa Pirimidin.
Asam nukleat yang monomer nukleotidanya
mengandung molekul deoksi ribosa → DNA
Asam nukleat yang monomer nukleotidanya
mengandung molekul ribosa → RNA
Doti W
 LANJUTAN
Monomer Polimer
NUKLEOTIDA ASAM NUKLEAT
ASAM AMINO PROTEIN
MONOSAKARIDA POLISAKARIDA

Nukleosida monopospat

DNA RNA

Doti W
Struktur Molekul
NUKLEOSIDA & NUKLEOTIDA

DEOKSI NUKLEOTIDA
NUKLEOTIDA Doti W
Lanjutan…….

Hypoxanthine, derivate purin yang

Doti W Ada di alam
KOMPONEN ASAM NUKLEAT

Doti W
 FUNGSI NUKLEOTIDA
1. Prekursor asam nukleat
2. Purin dan Pirimidin berfungsi pada:
- Energi metabolism
- Sintesis protein
- Regulasi dari aktivitas enzim
- Transduksi sinyal
3. Jika berikatan dengan vitamin atau derivat vitamin akan berfungsi sebagai Ko
enzim
4. Berperan sebagai donor dan aseptor untuk gugus pospat dalam reaksi
metabolism (ATP dan ADP)
5. Mengikat lemak (CDP-acylglycerol, pada sintesa lipid ) atau monosakarida
(UDP-glucose,UDP-galactose , pada sintesis Glikogen).
6. Sebagai second messenger (cAMP dan cGMP)
7. Analog Purin dan Pirimidin (mengandung gugus , atau Nitrogen Tiol,
Halogen) digunakan untuk pengobatan : AID, Ca, supresi respon imun pasca
transplantasi, Allupurinol (sebagai antihiperurisemia).

Doti W
Lanjutan………….

Doti W
 Lanjutan………….

NO NAMA FUNGSI
5-fluoro-uracil
5-iodouracil
3-deoxyuridine Terapi tumor
6-thioguanine
1 6-mercaptopurine
5- atau 6-azauridine
5- atau 6-azacytidine
8-azaguanine
2 Allupurinol antihiperurisemia
3 Cytarabine Khemoterapi Ca
4 Azathiopine Menekan respon imun pasca transplantasi

Doti W
Lanjutan ……..

Doti W
STRUKTUR MOLEKUL ASAM NUKLEAT - DNA

Doti W
Doti W
 STRUKTUR ASAM NUKLEAT - RNA

STRUKTUR PRIMER RNA

STRUKTUR SEKUNDER RNA

Doti W
Lanjutan slide 14

Doti W
mRNA & tRNA

Doti W
rRNA

Doti W
 NUKLEOSIDA TRIPOSPAT
LIHAT LAGI SLIDE 4

• Nukleosida tripospat adalah molekul yang

mengandung basa nitrogen yang terikat pada
atom C-5 dari molekul pentosa (ribosa atau
deoxyribosa), dan pada molekul pentose
tersebut terikat juga tiga pospat. Molekul
Nukleosida tripospat tidak bisa diabsorpsi
dengan baik oleh saluran cerna, karena itu
molekul ini harus disintesis dalam sel.

Doti W
SINTESA NUKLEAT DARI
NUKLEOSIDA TRIPOSPAT

Doti W
REAKSI PEMBENTUKAN POLIMER
ASAM NUKLEAT

Doti W
Lanjutan ……..

Doti W
Lanjutan …..

Doti W
Doti W
PURIN & PIRIMIDIN – SENYAWA NON ESSENSIAL
► Jaringan tubuh mensintesis Purin dan Pirimidin
dari senyawa amfibolik, dgn jml sesuai kebutuhan .
► Asam nukleat dari diet dicerna menjadi pospat, ribose,
dan basa (purin & pirimidin) selanjutnya diabsorpsi di
saluran cerna.
► Purin akan dimetabolisme menjadi asam urat
(Diekskresi dan direabsorpsi di ginjal).
► Basa dari diet tidak/sedikit sekali digunakan untuk asam
nukleat jaringan, tetapi yang diberikan melalui injeksi
(misalnya thymidine berradioktif) dapat dideteksi di DNA
jaringan (sehingga bisa digunakan utk menghitung
kecepatan sintesis DNA).

Doti W
BIOSINTESIS NUKLEOTIDA PURIN & PIRIMIDIN
Melalui 2 Alur

Alur de Novo Alur Salvage

Biosintesis dari bahan Daur ulang dr bahan-2

yg lebih sederhana : hasil katabolisme
Bikarbonat, Aspartat, nukleotida
Glutamin

Doti W
ALUR DE NOVO
BIOSINTESA NUKLETIDA PURIN

Senyawa awal;
PRPP (5-phospho-α-ribosyl-1-pyrophosphate)

Berasal dari Alur

Pentosa Pospat

Doti W
 PENTOSE PHOSPHATE PATHWAY

Fase oksidatif

Doti W
Doti W
LANJUTAN Slide 26 - 27

• DIAWALI DENGAN GLUCOSE 6-PHOSPHATE (G6P

• MENGHASILKAN NADPH ( SENYAWA UNTUK MEREDUKSI

SENYAWA/MOLEKUL LAIN ).

• MENGHASILKAN PENTOSA ( MONOSAKARIDA DENGAN 5 ATOM

KARBON) YG DIGUNAKAN UNTUK SINTESIS NUKLEOTIDA.

•TERDIRI DARI 2 FASE : FASE OKSIDATIF , KEMUDIAN DILANJUTKAN

DENGAN FASE NON OKSIDATIF

• TERJADI DI SITOSOL
Doti W
ALUR DE NOVO BIOSINTESA
NUKLEOTIDA PURIN

Doti W
 Nama senyawa yang terbentuk selama
Alur de Novo biosintesis Purin

PRA (Phosporibosylamin)
GAR ( b-glycinamide ribonucleotide);
FGAR ( formyl glycinamide ribonucleotide);
FGAM (N-formylglycinamidine ribonucleotide);
AIR ( aminoimidazole ribonucleotide);
CAIR (carboxyaminoimidazole ribonucleotide);
SAICAR ( 5-aminoimidazole-4-(N-succinylocarboxamide).
AICAR (Aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide)
FAICAR( formyl 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide);

Doti W
Alur de novo Lanjutan slide 9

Enzim yang diperlukan untuk pembentukan PRPP

menjadi Inosin Monophosphate (IMP)
1. glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
2. glycinamide ribonucleotide synthetase
3. glycinamide ribonucleotide formyltransferase
4. phosphoribosylformylglycinamide synthase
5. aminoimidazole ribonucleotide synthetase
6. aminoimidazole ribonucleotide carboxylase
7. succinylaminoimidazolecarboxamide ribonucleotide
synthetase
8. adenylosuccinate lyase
9. 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide
formyltransferase
10. IMP cyclohydrolase Doti W
ALUR DE NOVO
Lanjutan dari slide 19

- Perhatikan warna huruf

- Amati bagian-2 dengan
warna huruf yang sama

Adenylosuccinate
(AMPS) Xanthosine monophosphate

Doti W
 PEMBENTUKAN NUKLEOSIDA DIPOSPAT &
NUKLEOSIDA TRIPOSPAT

Contoh Reaksi ; Pembentukan ATP dari AMP

IMP
AMP ADP ATP

Biosintesa Purin Alur de NOVO

Mendukung ketersediaan AMP untuk
pembentukan ATP Doti W
 PENGATURAN BIOSINTESA
NUKLEOTIDA PURIN

PRPP Synthase
Adenylosuccinate *
synthase
PRPP Glutamyl Amidotransferase

IMP Dehidrogenase

* Semakin banyak jumlah PRPP

semakin aktif enzim PRPP glutamyl
amido transferase.

Menghambat
Mengaktifkan Doti W
 ALUR DE NOVO
BIOSINTESA PURIN RINGKASAN
• Senyawa awal adalah PRPP (Gula ribosa dengan 3 gugus Pospat). Disintesa dari ribose 5-
pospate ( produk dari Alur pentose phosphate).
• Seluruh atom nitrogen dari purin berasal dari : glutamin, aspartat, dan glisin).
• The first committed step in purine biosynthesis is the conversion of PRPP into 5-
phosphoribosyl amine. The amine comes from glutamine and becomes nitrogen 9 of the
purine base in the nucleotide.
• The enzyme catalyzing the first committed step (PRPP amidotransferase) is feedback
inhibited by AMP or ADP at one inhibitory site or GMP or GDP at another independent
inhibitory site on the enzyme.
• The enzyme can also positively activated by increasing the concentration of PRPP (feed-
forward activation).
• Ada 2 reaksi dari biosintesa purin memerlukan formyl-tetrahydrofolate.
• Penghambatan terhadap dihydrofolate reductase menghentikan biosintesa purin karena
pembentukan 10-formyl-THF tidak terjadi.
• The branch point dari biosintesa purin adalah IMP (inosine 5'-monophosphate).
• The conversion of IMP to either AMP or GMP is also highly regulated - AMP feedback
inhibits the first step from IMP to AMP and GMP feedback inhibits the first step from IMP
to GMP.
• ATP diperlukan untuk sintesa GMP and GTP diperlukan untuk membentuk AMP.

Doti W
 Alur salvage BIOSINTESIS
Daurulang NUKLEOTIDA PURIN
- Purine yang berasal dari penguraian asam nukleat atau
makanan dapat didaurulang untuk membentuk
nukleotida baru.
- Enzim yang bekerja untuk hal tersebut,
Adenine phosphoribosyltransferase (APRT) mendaur-
ulang adenine.
Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase
(HGPRT) mendaurulang guanine dan hypoxanthine.
● Defisiensi genetik HGPRT menyebabkan
Lesch- Nyhan syndrome.
Reaksi Alur salvage di slide 37
Doti W
 ALUR SALVAGE REAKSI BIOSINTESA
NUKLEOTIDA PURIN
Catatan;
- HPRT (Hypoxanthine Phosphorybosyltransferase)
(sering juga disebut HGPRT)
- APRT (Adenine phosphorybosyltransferase)

Apa yang terjadi jika ekspresi

enzim APRT meningkat kronis?

Apa yang terjadi jika fungsi enzim

Doti W
HPRT terganggu ?
 PERAN ALUR SALVAGE PEMBENTUKAN
NUKLEOSIDA DIPOSPAT &
NUKLEOSIDA TRIPOSPAT

ADENOSIN

AMP ADP ATP

PRPP

Biosintesa Purin Alur Salvage

Mendukung ketersediaan AMP untuk
pembentukan ATP
Doti W
Alur salvage PENGATURAN ALUR SALVAGE
PADA BIOSINTESA PURIN

Alur Salvage

GPRT APRT

Doti W
REAKSI REDUKSI RIBONUKLEOSIDA DIPOSPAT
MENJADI
DEOKSI RIBONUKLEOSIDA DIPOSPAT

● Kompleks enzim Ribonucleotide

reductase hanya aktif pada saat
sel bersiap membelah.

● Senyawa yang diperlukan:

- Thioredoxin
- Thioredoxin reductase
- NADPH

Doti W
 3
Lanjutan dari Slide 40 REAKSI LENGKAP
REDUKSI NUKLEOSIDA MENJADI
DEOKSINUKLEOSIDA

Transpor elektron

Doti W
KATABOLISME PURIN
- Perhatikan warna tulisan
- Lihat kembali slide NO. 10

Doti W
 KELAINAN METABOLISME PURIN
• Lesch-Nyhan syndrome. Kelainan genetik yang
berpengaruh pada metabolisme purin.
Kelainan ini diturunkan (x-linked resessive).

Doti W
BIOSINTESIS PIRIMIDIN

Doti W
BIOSINTESIS PIRIMIDIN ALUR DE NOVO

Dari HCO3-

Carbamoyl phosphat synthase II

Berasal dari ATP

Dari Glutamine

REAKSI 1

Doti W
Lanjutan slide NO. 45 Biosintesis Pirimidin
Alur de novo

Doti W
 Biosintesis Pirimidin
REAKSI I (Lanjutan slide 46) Alur De novo

Enzim yang berperan pada reaksi 1:

• 1. aspartate transcarbamoylase( ATCase)
• 2. carbamoyl aspartate dehydratase
• 3. dihydroorotate dehydrogenase
• 4. orotate phosphoribosyltransferase
• 5. orotidine-5'-phosphate decarboxylase (OMP
decarboxylase)
• Aktivitas enzim 4 and 5 terdapat dalam kesatuan
enzim yang berfungsi ganda dikode oleh gen
UMPS

Doti W
 VERSI LENGKAP
SLIDE 45-46

(UMP)

2
PERHATIKAN WARNA
TULISAN

Doti W
Regulasi biosintesa nukleotida Pirimidin

CAP Carbamoyl aspartic acid

Dihydroorotic acid

Doti W
Bagan singkat dari slide 49

Doti W
PEMBENTUKAN NUKLEOSIDA DIPOSPAT &
NUKLEOSIDA TRIPOSPAT

Doti W
PEMBENTUKAN CTP DARI UTP

(Cytidine-5’-triphosphate
Synthetase )

Doti W
BIOSINTESA PIRIMIDIN ALUR SALVAGE

Doti W
 KATABOLISME
PIRIMIDIN
Bersambung ke slide NO. 55

Doti W
LANJUTAN SLIDE NO. 54
REAKSI KATABOLISME
PIRIMIDIN
PERBANDINGAN SINTESA DE NOVO
ANTARA PURIN DAN PIRIMIDIN

Doti W
 TERIMAKASIH
SELAMAT BELAJAR

Doti W DOTI, Mei, 2023