PENYAKIT AKIBAT

KELAINAN GENETIK
Kelompok 3
Nama-nama anggota kelompok
1. Christin Belavista Torsulu ( P07172322059 )
2. Munteka Pattisahusiwa ( P07172322086 )
3. Fini Halim ( P07172322071 )
4. Rasnaj panggawa ( P07172322096 )
5. Hairia Kaplale ( P07172322074 )
6. Zulaiha Rumagorong ( P07172322106 )
7. Satia Salampessy ( P07172322100 )
8. Lebrina Louk ( P07172322083 )
9. Natalia Salkery ( P07172322088 )
10. Jandri Masihuwey ( P07172322078 )
11. Harly Latue ( P07172322075 )
Nama-nama anggota kelompok
12. Fauziah Marasabessy ( P07172322069 )
13. Nur Afni Kamrela ( P07172322090 )
14. Jalinka Orno ( P0717233077 )
15. Ni Putu Imanuela ( P 07172322089 )
16. Amina Rumuar ( P07172322057 )
17. Elvi Rahangiar ( P07172322067 )
18. Siti Rahmiati ( P07172322101 )
 ACHONDROPLASIA
Achondroplasia adalah displasia tulang paling umum yang menyebabkan
perawakan pendek (dwarfisme). Achondroplasia dapat diturunkan secara
dominan autosomal.

Penderita achondroplasia memiliki ukuran tulang dada yang normal, tetapi

ukuran lengan dan tungkainya pendek sehingga menyebabkan penderita
memiliki tubuh kerdil (dwarfisme).

Achondroplasia: a comprehensive clinical review. Orphanet journal of rare diseases, 14(1), 1.

 PENYEBAB ACHONDROPLASIA
Achondroplasia disebabkan oleh mutasi titik pada gen FGFR3 pada
kromosom 4, yang bertugas membuat protein yang disebut
Fibroblast growth factor receptor 3 (FGFR3), yang terlibat dalam
kerja tulang rawan pada tulang. Protein ini penting dalam proses
osifikasi atau proses perubahan tulang rawan menjadi tulang keras

https://yankes.kemkes.go.id/view_artikel/720/mengenal-achondroplasia
 Mutasi Subtitusi

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002929707632108
 PEMERIKSAAN

pengujian molekuler genetik dapat dilakukan dengan Kromatografi cair

kinerja tinggi denaturasi (DHPLC).

Denaturing High Performance Liquid Chromatography (DHPLC),

memungkinkan deteksi substitusi basa tunggal serta penyisipan
kecil dan/atau penghapusan dalam sejumlah besar sampel.
Singkatnya, metode ini mendeteksi ketidakcocokan melalui
pembentukan heteroduplex antara untai DNA tipe liar dan yang
bermutasi.

DHPLC technology for high-throughput detection of mutations in a durum wheat TILLING population. BMC genetics, 17, 43.
https://doi.org/10.1186/s12863-016-0350-0
 Molekul heteroduplex diperoleh dengan mencampurkan,
mendenaturasi dan menganil ulang produk PCR; sampel
kemudian dipisahkan dengan kromatografi cair fase
terbalik pada matriks kolom khusus dengan denaturasi
panas parsial untaian DNA

DHPLC technology for high-throughput detection of mutations in a durum wheat TILLING population. BMC genetics, 17, 43.
https://doi.org/10.1186/s12863-016-0350-0
 TALASEMIA
Talasemia adalah kelompok penyakit
yang ditandai dengan terganggunya produksi
satu atau lebih rantai globin. Talasemia adalah
penyakit resesif autosom, yang artinya berasal
dari kedua orang tua yang terdiagnosis atau
pembawa penyakit untuk pewarisan ke generasi
berikutnya.

Talasemia Beta :Etiologi, Klasifikasi, Faktor Resiko, Diagnosis, Dan Tatalaksana.10(1).159-166

 Molekul hemoglobin terbuat dari rantai alfa dan beta. Ketika terjadi mutasi, produksi kedua
rantai ini berkurang, sehingga menghasilkan thalassemia alfa atau beta.

Mutasi yang pada rantai Alfa globin adalah mutasi delesi pada kromosom 16. Mutasi pada
rantai Beta globin terjadi pada kromosom 11

https://prostem.co.id/stem-cell-untuk-thalassemia/
 PEMERIKSAA
N
Pemeriksaan talasemia secara molekuler dapa dilakukan dengan
menggunakan Gap-PCR.
Gap-PCR adalah pendekatan paling mapan dalam diagnostik DNA untuk menyaring
cacat penghapusan paling umum yang menyebabkan talasemia alfa atau beta.
Prinsip gap-PCR didasarkan pada amplifikasi menggunakan dua primer yang
melengkapi untai sense dan antisense di wilayah DNA yang mengapit penghapusan.
Jika jarak antara dua primer yang mengapit terlalu jauh untuk mengamplifikasi alel
normal, produk hanya diperoleh dari alel delesi. Panjang produk menunjukkan jenis
penghapusan.

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/ijlh.12108
Lanjutan.....

Dengan menggunakan set primer spesifik penghapusan yang

berbeda dalam reaksi amplifikasi multipleks, lebih banyak
penghapusan dapat dideteksi dalam satu percobaan, sehingga
menjadikannya metode penyaringan yang efisien, murah, dan cepat.
Metode ini memerlukan penggunaan kontrol positif untuk setiap
penghapusan yang diuji, selain DNA tipe liar dan blanko.

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/ijlh.12108
 DENTINOGENESIS IMPERFEKRA
• Dentinogenesis imperfekta (DI) adalah kelainan genetik yang
mengakibatkan displasia dentin. Terbentuknya dentin yang rusak
menyebabkan perubahan warna gigi yang rentan terhadap atrisi
dan patah.

• Gigi menunjukkan perubahan warna abu-abu biru atau

cokelat, serta tinggi kecil.
• Merupakan penyakit autosomal dominan

Dentinogenesis imperfecta type I: A case report with literature review on nomenclature system. J Oral Maxillofac Pathol
 PENYEBAB
Penyebab kelainan ini adalah terjadinya mutasi pada gen dentin
sialofoprotein (DSPP). DSPP mengkodekan dentin sialoprotein
(DSP) dan dentin fosfoprotein (DPP) yang berperan dalam proses
dentinogenesis.

Ketika gen DSPP bermutasi, dentin tidak terbentuk dengan benar,

sehingga menyebabkan lapisan tengah gigi menjadi lunak dan
tidak normal.

Dentinogenesis imperfecta type I: A case report with literature review on nomenclature system. J Oral Maxillofac Pathol
Jenis mutasi penyebab DI adalah mutasi nonsense stop yang menghasilkan
stop kodon pada Exon 3 dari gen DSPP yang terdapat pada kromosom 4,
sehingga protein yang dihasilkan sedikit.

Indonesian journal of dentistry.2007.14(1).41-47. Manifestasi klinis, Aspek genetika, dan menagement DI

 Pemeriksaan
• Pemeriksaan Dentinogenesis imperfecta dapat dilakukan dengan
pemeriksaan fisik.Manifestasi klinis yang paling umum pada gigi
dengan DI adalah perubahan warna gigi (abu-abu/opalescent,
kuning/coklat) dan fraktur enamel.
• pemeriksaan radiografi
• Pengujian genetik molekuler dapat digunakan untuk memastikan
diagnosis. Pengujian molekuler dapat dilakukan dengan
menggunakan PCR.

Biria M, Abbas FM, Mozaffar S, Ahmadi R. Dentinogenesis imperfecta associated with osteogenesis imperfecta. Dent Res J
(Isfahan). 2012 Jul;9(4):489-94. PMID: 23162594; PMCID: PMC3491340.
 Prosedur kerja PCR
Genom DNA diekstraksi dari darah utuh perifer menggunakan
kit darah utuh QuickGene DNA S dengan peralatan
QuickGene-Mini80 sesuai dengan instruksi pabrik. Reaksi
PCR dilakukan menggunakan premix DNA polimerase, dan
produk PCR dimurnikan dengan Kit Pemurnian PCR
(ElpisBio). Semua penomoran nukleotida dimulai dari A
kodon inisiasi translasi ATG dari urutan referensi DSPP
manusia (NM-014208.3).

A DSPP mutation causing dentinogenesis imperfecta and characterization of the mutational effect. Biomed Res Int.
2013;2013:948181. doi: 10.1155/2013/948181.
 ATAKSIA SPINOCEREBELLAR
• Spinocerebellar ataxia (SCA) adalah penyakit yang
dicirikan dengan penurunan fungsi otak dan saraf
tulang belakang. Kondisi ini menyerang bagian
cerebellum atau otak kecil yang terletak di
belakang batang otak.

• SCA yang paling umum disebabkan oleh perluasan

pengulangan trinukleotida CAG, yang mengkode
poliglutamin dalam produk protein.

Spinocerebellar ataxia clinical trials: opportunities and challenges. Annals of clinical and
translational neurology, 8(7), 1543–1556.
• SCA yang paling umum disebabkan oleh perluasan pengulangan trinukleotida CAG, yang
mengkode poliglutamin dalam produk protein.

https://prostem.co.id/stem-cell-untuk-thalassemia/
 PEMERIKSAAN
Pemeriksaan yang digunakan untuk mendiagnosis penyakit ataksia spinocerebellar adalah
menggunakan PCR.
Untuk menentukan jumlah mikrosatelit, reaksi berantai polimerase (PCR) biasanya digunakan
untuk memperkuat wilayah genom yang diminati (ROI) dan kemudian jumlah yang ditentukan
ditentukan dengan berbagai teknik, seperti elektroforesis kecil, elektroforesisgel, analisis noda
selatan, deteksi elektrokimia, analisis kurva leleh, massa spektrometri, atau biosensor molekul
kecil.

Interrogating the “unsequenceable” genomic trinucleotide repeat disorders by long-read sequencing. Genome Med 9, 65 (2017).
https://doi.org/10.1186/s13073-017-0456-7
 sampel diamplifikasi dengan tahap denaturasi awal 95 °C selama 5
menit, diikuti 35 siklus 98 °C selama 10 detik, 56 °C selama 15 detik, 68
°C selama 1 menit 40 detik, dengan tahap ekstensi akhir 68 °C selama
10 menit, lalu ditahan pada suhu 4°C.

Interrogating the “unsequenceable” genomic trinucleotide repeat disorders by long-read sequencing. Genome Med 9, 65 (2017).
https://doi.org/10.1186/s13073-017-0456-7
 SINDROM DOWN

Kelainan ini pertama kali

diperkenalkan oleh John Langdon
Down pada tahun 1866. Sindrom
Down atau kelainan trisomi
merupakan penyakit genetik
paling umum di seluruh dunia dan
penyebab genetik paling umum
terjadinya kecacatan intelektual

Bunga Rampai Deteksi Dini Kelainan Genetik.2022

 SINDROM DOWN
Ciri-ciri kelainan ini yang dapat diketahui
sejak neonatus adalah telinga kecil, wajah
datar, jembatan hidung datar, mulut kecil
dengan lidah besar yang menonjol, leher
pendek dengan tonjolan lemak di
punggung, tangan lebar, garis melintang di
telapak tangan yang disebut “lipatan
Simian,” celah antara jari pertama dan jari
kaki kedua yang dikenal sebagai “celah
sandal”.

Bunga Rampai Deteksi Dini Kelainan Genetik.2022

 PENYEBAB SINDROM DOWN
Kelainan Sindrom Down disebabkan oleh penambahan kromosom
pada kromosom 21. Kromosom ekstrak tersebut dapat
menyebabkan protein tertentu berlebih sehingga mengganggu
pertumbuhan normal dari tubuh, dan ketidakmampuan belajar dan
lainnya.
 Pemeriksaan
Metode molekuler untuk diagnosis sindrom down adalah Paralogous Sequence Quantification
(PSQ).

PSQ adalah metode berbasis PCR untuk mendeteksi kelainan jumlah kromosom yang
ditargetkan yang disebut paralogous sequence quantification (PSQ), berdasarkan penggunaan
gen paralogous. kuantifikasi urutan paralogous (PSQ), menggunakan urutan paralogous untuk
mengukur nomor salinan Hsa 21.

Urutan paralog memiliki tingkat identitas urutan yang tinggi, tetapi mengakumulasi substitusi
nukleotida dengan cara lokus tertentu. Perbedaan urutan ini, yang disebut sebagai paralogous
sequence mismatches (PSMs), dapat diukur menggunakan teknologi pyrosequencing, untuk
memperkirakan dosis relatif antara kromosom yang berbeda.

“Down syndrome: an insight of the disease”. J Biomed Sci 22, 41 (2015). https://doi.org/10.1186/s12929-015-0138-y
 Lanjutan....

PSQ adalah metode yang kuat, mudah diinterpretasikan, dan

mudah diatur untuk diagnosis aneuploidi umum, dan dapat
dilakukan dalam waktu kurang dari 48 jam, mewakili alternatif
kompetitif untuk digunakan secara luas di laboratorium
diagnostik. Pengurutan dilakukan secara kuantitatif dengan
menggunakan pyrosequencing

“Down syndrome: an insight of the disease”. J Biomed Sci 22, 41 (2015). https://doi.org/10.1186/s12929-015-0138-y
HIPERKOLESTEROLEMIA FIMILIAL (FH)
Hiperkolesterolemia familial (FH) adalah
penyakit autosomal dominan yang
ditandai dengan kelainan klinis dan
molekuler. Kelainan klinis ditandai
dengan peningkatan kadar kolesterol dan
low-density lipoprotein (LDL) dalam
darah. Sedangkan kelainan molekuler
ditandai dengan tidak adanya reseptor
LDL. Penderita FH akan memiliki kadar
kolesterol darah yang tinggi sejak lahir.
 PENYEBAB FH
Hiperkolesterolemia familial (FH) terjadi
karena adanya mutasi pada gen untuk
reseptor low-density lipoprotein (LDL) di
kromosom 19. Mutasi gen berupa perubahan
dari C ke T pada kodon ke33 gen reseptor
LDL.
Familial hypercholesterolemia: Review of diagnosis, screening, and treatment.
Canadian family physician Medecin de famille canadien, 62(1), 32–37.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30214904/
 PEMERIKSAAN

Pemeriksaan Hiperkolesterolemia familial (FH) dapat

dilakukan dengan menggunakan PCR real-time.
PCR real-time dengan genotipe SNP dapat digunakan untuk
mendiagnosis FH terutama pada gen APOB dan PCSK9 ,
karena jumlah mutasi penyebab FH pasti yang diketahui

Molecular diagnosis methods in familial hypercholesterolemia. Anatolian journal of cardiology, 23(3), 120–127.
https://doi.org/10.14744/AnatolJCardiol.2019.95038
 PEMERIKSAAN

Tahapan PCR adalah menaikkan suhu hingga 95 °C

selama 10 menit, diikuti oleh 40 siklus denaturasi pada
95 °C selama 15 detik, anil pada 58 °C selama 1 menit,
dan ekstensi pada suhu 72°C selama 1 menit.

LDLR gene’s promoter region hypermethylation in patients with familial hypercholesterolemia. Sci Rep 13, 9241 (2023).
https://doi.org/10.1038/s41598-023-34639-1
 DAFTAR PUSTAKA
• Ambreen Asim, A. K. M., 2015. Down syndrome:An insight of the disease. journal of biomedical science, 22(41), pp. 2-9.
• Anon., 2022. Mengenal Achondroplasia. [Online]
Available at: https://yankes.kemkes.go.id/view_artikel/720/mengenal-achondroplasia [Accessed 29 Oktober 2023].
• Brooker, S. M. E. C. R. A. S. M. K. S. H. &. O. P., 2021. Spinocerebellar ataxia clinical trials: opportunities and challenges.
Annals of clinical and translational neurology, 8(7), p. 1543–1556.
• Devaraju D, D. B. V. V. M. V., 2014. Dentinogenesis imperfecta type I: A case report with literature review on
nomenclature system. J Oral Maxillofac Pathol, 18 September, 18(1), pp. 131-134.
• Faizah, Z. et al., 2022. BUNGA RAMPAI Deteksi Dini Kelainan Genetik. Surabaya: Airlangga University Press.
• Haq, F. M. S. &. H. R., 2023. Talasemia Beta :Etiologi, Klasifikasi, Faktor Resiko, Diagnosis, Dan Tatalaksana.
Agromedicine. 10(1), pp. 159-166.
• HARTEVELD, C. L., 2014. State of the art and new developments in molecular diagnostics for hemoglobinopathies in
multiethnic societies. International Journal of Laboratory Hematology , Volume 36, pp. 1-12.
• Lee SK, L. K. S. S. H. H. L. S. K. J., 2013. A DSPP mutation causing dentinogenesis imperfecta and characterization of the
mutational effect. Biomed Res Int.
• Liu, Q. Z. P. W. D. e. a., 2017. Interrogating the “unsequenceable” genomic trinucleotide repeat disorders by long-read
sequencing. Genome Med , 9(65).
 DAFTAR PUSTAKA
• Harteveld, C.L., 2014. State of the art and new developments in molecular diagnostics for
hemoglobinopathies in multiethnic societies. Int J Lab Hematology 36, 1–12. https://
doi.org/10.1111/ijlh.12108
• Moldovan, V. B. C. &. D. M., 2020. Molecular diagnosis methods in familial hypercholesterolemia.. Anatolian
journal of cardiology, 23(3), p. 120–127.
• Pauli, R. M., 2019. Achondroplasia: a comprehensive clinical review. Journal of Rare Diseases, 14(1), pp. 2-49.
• Su, Y. L. C. C. S. e. a., 2004. Rapid detection of FGFR3 gene mutation in achondroplasia by DHPLC system-
coupling heteroduplex and fluorescence-enhanced primer-extension analysis.. J Hum Genet , Volume 49, p.
399–403.
• Turgeon, R. D. B. A. R. &. P. G. J., 2016. Familial hypercholesterolemia: Review of diagnosis, screening, and
treatment. Canadian family physician Medecin de famille canadien. 62(1), p. 32–37.
• Zorzo, R. S. V. S. J. e. a., 2023. LDLR gene’s promoter region hypermethylation in patients with familial
hypercholesterolemia. 13.https://doi.org/10.1038/s41598-023-34639-1
• Harteveld, C.L., 2014. State of the art and new developments in molecular diagnostics for
hemoglobinopathies in multiethnic societies. Int J Lab Hematology 36, 1–12.
https://doi.org/10.1111/ijlh.12108