Anda di halaman 1dari 37

The Global Reference for Identification

IDENTIFIKASI

Morfologi
Pengamatan
bentuk koloni dan
mikroskopik

Genetik
Teknik biologi
molekuler

Biokimia
Serologi
Reaksi terhadap
substrat biokimiawi,
termasuk reaksi
enzimatik

Reaksi antigen dan


antibodi spesifik

Sistem identifikasi untuk bakteri dan jamur


Dalam 1 strip terdapat 10 atau 20 substrat reaksi biokimiawi
Tipe reaksi biokimiawi :
- Enzimatik
- Assimilasi
- Inhibisi
Total database = 822 organisme (taksonomi berdasarkan
pada International Journal of Systemic Bacteriology)

Microtube berisi substrat kering

Tes enzimatik : menggunakan substrat kromogenik atau


fluorogenik,
seperti : aminopeptidase (Beta-alanine arylamidase), lipase,
esterase, oxidase, ONPG, betaGAL, phosphatase

Tes asimilasi : menggunakan sumber karbon yang unik,


pendeteksian berdasarkan reaksi kekeruhan
seperti : karbohidrat, asam amino, asam organik

Tes inhibisi : menggunakan antibiotik atau substrat toksik,

pendeteksian berdasarkan reaksi kekeruhan

range
Jenis strip
API 20E
API10E/10S
RAPID 20E
API 20 NE
API Staph
API 20 Strep
API 20 C Aux
API Candida
API 20A
API Campy
API Coryne
API NH
API Listeria
API 50 CHB
API 50 CHL
API 50 CHE

Gol. Bakteri/jamur Inkubasi


Gram negative Bacilli
24 jam
Enterobacteria
24 jam
Enterobacteria
4 jam
Non Enterobacteria 24-48jam
Staphylococci
24 jam
Streptococci 4-24 jam
Yeasts
24-48 jam
Yeasts
24 jam
Anaerobes 24-48 jam
Campylobacter
24 jam
Corynebacteria
24 jam
Neisseria/Haemophilus
2 jam
Listeria
24 jam
Bacillus
24-48 jam
Lactobacillus
24-48 jam
Enterobacteria
24-48 jam

Gallery

Bagaimana cara memilih strip?


Lakukan tes orientasi :
Morfologi koloni
Pewarnaan Gram
Tes katalase
Tes oksidase

Kelengkapan

Medium suspensi

Mineral oil

rak
Reagen tambahan
Incubation box

PSIpettes/ pipet steril


Strip

Prosedur Kerja
Suspensi
(McF)

Inokulasi
Inkubasi
Koloni

Pembacaan :
Penambahan reagent

HASIL
transfer

Prinsip Inokulasi

anaerob fakultatif

anaerobic

aerobic

Oil

Oil

GLU

ADH

CIT

Pembacaan : Deteksi
Setelah proses inkubasi
Reaksi dideteksi dengan cara :
perubahan warna secara spontan atau
dengan penambahan reagent tambahan
Penyimpanan :

2 - 8C

VPB - NIT 2 - XYL - VP2 HER

Dalam kondisi gelap : bungkus dengan aluminium foil


FB - FVB - ZYM B - NIN PYZ James - VP2
2 - 30C

VPA - VP1 - NIT 1 - Zn- BCP TDA - ZYM A

Pembacaan
Reaksi setelah inkubasi
Perubahan warna secara spontan

Perubahan warna dengan penambahan reagent

Pembacaan : Deteksi

Gunakan tabel pembacaan (dalam package insert) dan isi


dengan kode ( + ) atau ( - )
Kode tersebut ditransformasikan menjadi profil numerik
dengan menggunakan prinsip pengkodean :
setiap tes pada strip dibagi menjadi 3 grup
setiap tes bernilai : 1, 2 atau 4

Kertas Kerja

Test tambahan

7 angka profile 3604512

Hasil identifikasi dari software

PROSEDUR

INTERPRETASI
Persentase reaksi positif untuk setiap reaksi dan
takson
Taxon = base unit
Species
Biotype
Genus
Species group

bioMrieux Taxonomy = official taxonomy


International Journal of systematic bacteriology

INTERPRETASI
CONTOH :

INTERPRETASI
Identifikasi bakteri berdasarkan pada perbandingan profile
terhadap database takson
Perbandingan memperhitungkan profile yang diperoleh dengan
cara :
Mencari kesamaan dari berbagai takson yang berbeda dari
database
% ID (Persen Identifikasi)
Apakah isolat mikroorganisme tersebut berkaitan dengan suatu
takson dalam database?Takson yang mana?

Mencari kesamaan dari typical profile dari setiap takson


Typicity index (T Index )
Apakah isolat bakteri benar-benar terkait dengan takson
tersebut ?

Interpretasi
Persen Identifikasi :% ID

C
A

Taxon x

Nilai mendekati 100%


Kedekatan relatif ke
berbagai takson dalam
database

Interpretasi

0
Taxon x
the most
typical profile
Nilai mendekati 1
Mendekati typical
profile tertentu

C
Typicity index:T

INTERPRETASI
Setiap hasil identifikasi selalu dilengkapi dengan

HARUS DILIHAT PERTAMA KALI: menunjukkan tingkat hasil


identifikasi berdasarkan pada % of id, dan index T

excellent identification
very good identification
good identification
acceptable Identification

% id > 99.9
% id > 99
% id > 90
% id > 80

et T > 0.75
et T > 0.5
et T > 0.25
et T > 0

Low discrimination : sistem tidak dapat membedakan 2 takson atau lebih


Doubtful profile : terdapat tottaly test againts

INTERPRETASI

Against tests: ?

Partially against tests

Jika persentase positivitas < 25% dan test +


Jika persentase positivitas >75% dan test -

Totally against tests

Jika persentase positivitas = 0% dan test +


Jika persentase positivitas 100% dan test

INTERPRETASI

Low discrimination : lakukan complementary tests


Doubtful profile (test totally against) cek :
Kontaminasi
A typical organism
Technical errors (mineral oil, reagent, shelf-life )
Ulang pengerjaan

APIweb

Rekomendasi Teknis

Isolat muda
Isolat murni
Inkubasi

Media yg
standard

Cara Inokulasi
Tes orientasi

Kekeruhan
inokulum

Penyimpanan
reagent

Rekomendasi Teknis

Why ???

QUALITY CONTROL
Memvalidasi proses transportasi strip API
Kualifikasi teknisi/pengguna

When ???
Setiap nomor lot baru
Setiap ada teknisi baru

How ???
Gunakan strain ATCC yang
direkomendasikan oleh bioMrieux