Copyright © 2010 Floyd Beck A.. Ini adalah sebuah artikel akses terbuka didistribusikan di bawah
Creative Commons Attribution License, yang memungkinkan tidak dibatasi penggunaan, distribusi, dan
reproduksi dalam media apapun, asalkan karya asli benar dikutip.
Reaksi dari [(η6-p-simen) Ru (ATSC) Cl] PF6 (ATSC = 9-anthraldehyde thiosemicarbazone) dengan
albumin serum manusia diselidiki pada temperatur yang berbeda menggunakan fluorescence dan
spektrofotometri inframerah. K mengikat konstan,, untuk reaksi tersebut menggunakan beberapa
metode yang berbeda. Menggunakan persamaan Stern-Volmer dimodifikasi, K ditetapkan menjadi 9,09
× 104,12.1 × 104, dan 13,1 × 104 M-1 pada 293 K, 298 K, dan 308 K, masing-masing. Sebuah analisis
termodinamika menunjukkan bahwa reaksi spontan dengan? G yang negatif. Entalpi reaksi ΔH = 16,5 kJ
mol-1 dan entropi reaksi ΔS = 152 Jmol-1K-1. Nilai ΔH dan ΔS menunjukkan bahwa kekuatan hidrofobik
yang dominan dalam modus interaksi dan bahwa proses ini sebagian besar didorong entropi.
1. Pengantar
kompleks Rutenium berbagai jenis aktif dipelajari sebagai metallodrugs seperti yang diyakini memiliki
toksisitas rendah dan selektivitas yang baik untuk tumor [1]. Baru-baru ini, dua ruthenium-(III) kompleks
juga telah berhasil menyelesaikan tahap I uji klinis, yaitu, Nami-A [2-5] (Nami-A, (ImH) [trans-Ru (III)
Cl4Im (Me2SO)]; im = imidazol), dan KP1019, indazolium [tetrachlorobis (1H-indazole) ruthenate (III)]
trans-[6-8]. Kinetika senyawa organologam menunjukkan pertukaran ligan yang berbeda dalam solusi
untuk kompleks koordinasi, serta motif struktural novel dan ruthenium organologam (II) kompleks-aren
(dari jenis [(η 6-aren) Ru (LL) Cl] +, LL = ligan ) juga sedang menarik minat meningkat sebagai senyawa
antikanker [9, 10]. Kompleks seperti [(aren) Ru (en) Cl] + bahkan aktif dalam baris sel cisplatin-tahan [9].
Sementara diyakini bahwa DNA merupakan target utama kompleks ini, karena replikasi DNA merupakan
bagian integral dari perkembangan penyakit ini, ada juga pengakuan bahwa aktivitas biologis yang
diamati tidak selalu terkait dengan kemampuan mereka DNA-mengikat. Sebagai akibatnya, investigasi
yang berusaha untuk meneliti interaksi dengan protein serum dan seluler mulai dilakukan [11-14].
Sebagai protein ekstraseluler utama dari sistem peredaran darah, serum albumin manusia (HSA),
berfungsi sebagai pengangkut utama obat-obatan serta senyawa endogen seperti asam lemak karena
dapat mengikat senyawa ini reversibel ke [, 15 16] ASM. Telah ditunjukkan bahwa distribusi, konsentrasi
bebas, dan metabolisme berbagai obat dapat diubah secara signifikan sebagai akibat dari mengikat
mereka untuk ASM. ASM juga sering meningkatkan kelarutan obat hidrofobik jelas dalam plasma. Sejak
ASM berfungsi sebagai pembawa transportasi untuk obat, penting untuk mempelajari potensi interaksi
obat dengan protein ini. Pengetahuan tentang mekanisme interaksi antara obat dan protein plasma
adalah sangat penting bagi pemahaman tentang farmakodinamik dan farmakokinetik suatu obat atau
prospek obat.
Banyak protein assay interaksi dirancang di sekitar perubahan intensitas dan atau posisi chromophores
utama protein pada konjugasi dengan zat lain. quenching Fluoresensi dan FTIR merupakan alat yang
kuat dan metode penting untuk mempelajari interaksi molekul kecil dengan protein. Keduanya relatif
mudah digunakan dan mampu merasakan konsentrasi kecil dari reaktan. Selain kedua teknik yang
mampu mendeteksi perubahan lingkungan protein, perubahan khususnya di fluoresensi tryptophan
atau perubahan dalam pita amida saya absorbansi yang disebabkan oleh perubahan struktur protein.
Komunikasi ini menggambarkan sifat interaksi antara sebuah kompleks rutenium organologam, [(η6-p-
simen) Ru (thiosemicarbazone anthraldehyde) Cl] PF6, 1 (Gambar 1) dan ASM.
975756.fig.001
Gambar 1: Struktur [(η6-p-simen) Ru (thiosemicarbazone anthraldehyde) Cl] PF6, 1.
2. Eksperimental
Analytical grade pereaksi atau bahan kimia digunakan di seluruh. Semua bahan kimia termasuk pelarut
diperoleh dari Sigma-Aldrich (St Louis, MO, USA) atau vendor komersial lainnya dan digunakan sebagai
diterima. Kompleks logam disintesis seperti yang dijelaskan sebelumnya [17]. Air yang dimurnikan ganda
yang digunakan dalam penelitian semua berasal dari sistem Milli-Q (Millipore Inc). Solusi ASM disusun
dalam buffer Tris (50 mM Tris, pH 7,40, 100 mM NaCl) dan disimpan dalam gelap pada suhu 4 ° C.
Konsentrasi protein ditentukan secara spektrofotometri menggunakan absorptivitas molar 36 000-1 cm
M-1 pada 280 nm [18]. Konsentrat solusi kompleks itu dibuat di sebuah campuran 70% DMSO dan buffer
Tris. Spektrum fluoresensi direkam pada spektrofotometer Varian Cary Eclipse. Untuk percobaan
fluoresensi titrasi, larutan 3,0 cm3 ASM (3 pM) ditempatkan dalam sebuah mangkuk yg dihiasi dgn
ukiran kuarsa dan dititrasi dengan berbagai jumlah larutan terkonsentrasi dari kompleks menghasilkan
solusi dengan rasio mol beragam kompleks untuk ASM. Konsentrasi kompleks berkisar 3-30 pM. Setelah
setiap tambahan larutan tersebut dicampur selama 30 detik dan diizinkan untuk duduk pada suhu yang
tepat selama 5 menit sebelum pengukuran. Spektrum fluoresensi solusi diperoleh dengan menarik pada
295 nm dan pengukuran spektrum emisi 300-500 nm menggunakan celah 5 nm. Suhu dikontrol
menggunakan sel-tunggal Peltier aksesori. Inframerah (IR) spektrum di kisaran 1200-2000 cm-1
diperoleh dengan menggunakan ATR aksesori (dengan kristal berlian) pada 6700 spektrofotometer FTIR
Nicolet dilengkapi dengan detektor KBr DTGS dan beam splitter KBr. Spektrum inframerah dari ASM,
ASM ditambah kompleks (1:1 rasio molar), dan kompleks saja dicatat. Solusi ASM-kompleks yang
diinkubasi selama 24 jam sebelum pengukuran. Absorbansi buffer adalah dikurangi dari spektrum dari
solusi. Kemudian Spektrum perbedaan dihitung menggunakan paket perangkat lunak instrument.
3. Hasil dan Diskusi
3.1. Interaksi 1 dengan ASM
Gambar 2 menunjukkan bahwa penambahan kompleks untuk hasil ASM pengurangan yang signifikan
dalam intensitas fluoresensi dengan pergeseran biru untuk 330 nm (Δλ = 17 nm). Perubahan ini
menunjukkan bahwa konformasi protein dipengaruhi oleh mengikat ke kompleks logam. Pergeseran
panjang gelombang ini kemungkinan disebabkan oleh lingkungan triptofan yang menjadi lebih nonpolar
[19].
975756.fig.002
Gambar 2: Pendar emisi ASM di hadapan meningkatnya jumlah 1. [ASM] = 3.0 pM; [Ru] = (a) 0, (b) 3.0,
(c) 6.0, (d) 9.0, (e) 12,0, (f) 15,0, (g) 18,0, (h) 21,0 , (i) 24.0, (j) 27,0, dan (k) 30.0 pM. Suhu = 20 ° C.
3.2. Analisa Data Kuantitatif Titrasi
3.2.1. Analisis Nonlinier
Sebuah penilaian kuantitatif dari data fluoresensi untuk menentukan kekuatan dan modus kemungkinan
mengikat dapat dibuat dengan memperlakukan data menggunakan beberapa metode yang berbeda.
quenching Fluoresensi dapat terjadi oleh apa yang sering digambarkan sebagai mekanisme statis atau
mekanisme dinamis. Kuantitatif, ini dapat dijelaskan oleh persamaan Stern-Volmer
Atau mungkin ada lebih dari satu situs pengikatan independen atas ASM dan mereka tidak semua
diakses kompleks. Ketika kedua quenching statis dan dinamis ini terjadi, data quenching dapat diobati
dengan menggunakan persamaan berikut:
Dengan asumsi bahwa proses quenching didominasi statis (pada konsentrasi rendah 1), konstanta
mengikat untuk reaksi dapat diperoleh dari analisis (MSV) diubah Stern-Volmer. Ini melibatkan
memperlakukan data menggunakan
Untuk lebih menguji kekuatan mengikat, metode Scatchard digunakan untuk menganalisis data. Metode
ini memiliki keterbatasan (terutama sejak transformasi mendistorsi kesalahan eksperimental) tetapi itu
tetap merupakan metode umum untuk analisis dan penyajian data yang mengikat. Metode ini
didasarkan pada persamaan berikut:
Metode lain yang umum dalam literatur untuk analisis data yang mengikat adalah penggunaan
persamaan Lineweaver-Burk
Sehingga Tabel 1 menunjukkan, semua metode analisis memberikan nilai yang sebanding untuk
konstanta mengikat. Nilai 105 adalah mengenai urutan besarnya lebih besar daripada senyawa logam
anorganik. Kompleks Ni (OAc) 2L2 · 2H2O dan Cu (OAc) 2L2 · 2H2O (L = N, N'-dibenzylethane-1 ,2-
diamina) memiliki konstanta mengikat sebesar 1,97 × 104 M-1 dan 2,36 × 104 M-1 , masing-masing [22,
23]. Keppler telah melaporkan bahwa Pt (II) kompleks dari alkohol amino memiliki konstanta asosiasi
dengan ASM mulai dari 1,0 × 103-2,4 × 104-M 1 [23]. Peningkatan konstanta mengikat dengan suhu
menunjukkan bahwa beberapa interaksi kovalen-tipe yang bermain dalam mengikat. Nilai untuk f dan n
(dekat persatuan) menyatakan bahwa alasan untuk lengkungan ke atas plot Stern-Volmer rumit dan sulit
untuk menjelaskan. quenching itu bisa diawali dengan pembentukan sebuah kompleks tanah negara,
tapi fakta bahwa peningkatan suhu konstanta mengikat dengan jelas menyatakan bahwa dinamis
(tumbukan) mekanisme berperan dalam fluoresensi quenching terutama pada konsentrasi logam-
kompleks tinggi. Hal ini disarankan oleh Gambar 2 juga karena situs mengikat protein yang awalnya
terkena 1 diaktifkan sebuah formasi aduk menjadi semakin dikubur sebagai lebih 1 telah ditambahkan.
3.3. Analisis Binding Mode
Dalam protein-ligan mengikat sejumlah gaya antarmolekul umum mungkin memainkan peran penting.
Ini termasuk ikatan hidrogen, van der Waals interaksi serta elektrostatik dan hidrofobik (dan lainnya
noncovalent) interaksi. Analisis termodinamika, yang termasuk menentukan entalpi tersebut (ΔH °) dan
entropi (ΔS °) reaksi, memberikan wawasan mode mengikat. Konstanta mengikat pada berbagai
temperatur yang digunakan untuk menghitung parameter-parameter ini dengan menggunakan
persamaan van't Hoff
Tidak ada preseden literatur untuk kompleks seperti 1 berinteraksi dengan ASM, namun ada
kemungkinan bahwa kovalen mengikat ke pusat ruthenium tidak terjadi. Tingkat aquation ini untuk
senyawa serupa sangat tinggi (meskipun angka ini tergantung pada chelating ligan) dan kompleks
aquated umumnya diyakini akan lebih reaktif. Telah diketahui bahwa DNA mengikat sangat kuat (melalui
residu guanin) untuk kompleks tersebut dengan bantuan kekuatan hidrofobik [25]. Reaksi serupa
dengan ASM melalui cincin indola pada triptofan akan lemah namun karena akan membutuhkan
deprotonasi nitrogen indola. Dengan analogi dengan basa purin DNA, hal ini kurang kemungkinan di
bawah pH fisiologis. Namun, dengan data di tangan tidak jelas bahwa kita kuantitatif dapat memisahkan
kontribusi dari setiap interaksi kovalen. Namun ide ini adalah bagian dari strategi desain kelas ini
senyawa antikanker: penggabungan fitur yang hidrofobik meningkatkan koordinasi dan kovalen simultan
dalam rangka mengoptimalkan biologis penargetan.
3.4. Spektrofotometri Inframerah
Suatu penilaian kualitatif dari reaksi 1 dengan ASM juga dilakukan dengan menggunakan
spektrofotometri inframerah. Spektrum inframerah protein pameran amida saya band (karena
peregangan dari grup C O = fungsional dari gugus peptida) antara 1600 dan 1700 cm-1. Band ini
dikaitkan dengan struktur sekunder dari protein [26] dan gangguan obligasi pada interaksi dengan
senyawa logam dapat memberikan informasi tentang mengikat. Gambar 7 menunjukkan spektra
inframerah sebelum dan sesudah inkubasi ASM dengan 1. Untuk rasio molar 1:1 dari HSA ke 1, amida
saya band menggeser posisi 1.653,2-1650,7 cm-1. Hal ini menunjukkan bahwa struktur sekunder
terganggu terasa pada interaksi dengan 1 dan mungkin disebabkan oleh aduk membentuk.
4. Kesimpulan
ruthenium senyawa organologam terbukti menjadi target bermanfaat sebagai antikanker dan agen
antimetastic. Hal ini diyakini bahwa protein bisa menjadi sasaran biologis senyawa ini dan kami telah
menunjukkan bahwa senyawa dengan ligan thiosemicarbazone dapat mengikat kuat untuk albumin
serum manusia. Akibatnya adalah wajar untuk menunjukkan bahwa kompleks seperti 1 dapat lebih
dikembangkan untuk aplikasi biologis.
Pengakuan
Proyek ini digambarkan didukung oleh Amerika Serikat NIH Grant no. RR P20-16460 dari Jaringan IDEA
dari Biomedical Research Excellence (INBRE) Program Pusat Penelitian Sumber Daya Nasional.
Referensi
1. G. Sava, S. Pacor, A. Bergamo, M. Cocchietto, G. Mestroni, dan E. Alessio, "Dampak kompleks
rutenium pada tumor eksperimental: Ketidakrelevanan sitotoksisitas untuk penghambatan metastasis,"
Interaksi Chemico-Biologi, vol. 95, no. 1-2, hlm 109-126, 1995.
2. G. Sava dan A. Bergamo, "senyawa Rutenium berbasis dan mengontrol pertumbuhan tumor
(review)," International Journal of Oncology, vol. 17, no. 2, hal 353-365, 2000.
3. JM Rademaker-Lakhai, D. van den Bongard, D. Pluim, JH Beijnen, dan JH Schellens, "A tahap I dan
studi farmakologi dengan imidazolium-trans-DMSO-imidazol-tetrachlororuthenate, sebuah novel
ruthenium agen antikanker," Clinical Cancer Research , vol. 10, no. 11, hal 3717-3727, 2004.
4. G. Sava, R. Gagliardi, A. Bergamo, E. Alessio, dan G. Mestroni, "Pengobatan metastasis tumor tikus
padat oleh Nami-A: perbandingan dengan cisplatin, cyclophosphamide dan dacarbazine," antikanker
Research, vol. 19, no. 2, hal 969-972, 1999.
5. A. Bergamo, B. Gava, E. Alessio, et al., "Nami Rutenium berbasis tipe A kompleks dengan
pengurangan metastasis vivo selektif dan dalam penghambatan invasi vitro tidak berhubungan dengan
sitotoksisitas sel," International Journal of Oncology, vol. 21, no. 6, hal 1331-1338, 2002.
6. CG Hartinger, S. Zorbas-Seifried, MA Jakupec, B. Kynast, H. Zorbas, dan BK Keppler, "Dari bangku
untuk pengembangan klinis samping tempat tidur-praklinis dan awal dari agen antikanker tetrachlorobis
indazolium trans-[(1H-indazole) ruthenate (III)] (KP1019 atau FFC14A), "Journal of Biochemistry
anorganik, vol. 100, no. 5-6, hlm 891-904, 2006.
7. S. Kapitza, M. Pongratz, MA Jakupec, et al., "Heterosiklik kompleks ruthenium (III) menginduksi
apoptosis dalam sel karsinoma kolorektal," Journal of Cancer Research and Clinical Oncology, vol. 131,
no. 2, hal 101-110, 2005.
8. ED Kreuser, BK Keppler, KAMI Berdel, A. Piest, dan E. Thiel, "interaksi antitumor Sinergis antara
kompleks rutenium baru disintesis dan sitokin dalam baris sel kanker usus besar manusia," Seminar
dalam Onkologi, vol. 19, no. 2, suplemen 3, hlm 73-81, 1992.
9. RE Morris, RE Aird, P. Murdoch, et al., "Penghambatan pertumbuhan sel kanker oleh ruthenium (II)
kompleks aren," Journal of Medicinal Chemistry, vol. 44, no. 22, hal 3616-3621, 2001.
10. O. Novakova, J. Kasparkova, Bursova V., et al, "konformasi DNA dimodifikasi oleh monofungsional
(II) Ru aren:. Pengakuan oleh protein DNA mengikat dan perbaikan. Hubungan dengan sitotoksisitas,
"Kimia & Biologi, vol. 12, no. 1, hal 121-129, 2005.
11. A. Casini, A. Guerri, C. Gabbiani, dan L. Messori, "karakterisasi biofisik dari adduct terbentuk antara
metallodrugs antikanker dan protein yang dipilih: wawasan baru dari difraksi X-ray dan studi
spektrometri massa," Journal of anorganik Biochemistry, vol. 108, no. 5-6, hlm 995-1006, 2002.
12. J. Will, A. Kyas, WS Sheldrick, dan D. Wolters, "Identifikasi (η6-aren) ruthenium (II) situs binding
protein dalam sel E. coli dengan kromatografi cair gabungan multidimensi dan ESI spektrometri massa
tandem: mengikat spesifik [(η6-p-simen) RuCl2 (DMSO)] untuk protein stres diatur dan untuk helicases,
"Journal of Biological Anorganik Kimia, vol. 12, no. 6, hal 883-894, 2007.
13. A. Casini, G. Mastrobuoni, M. Terenghi, et al, "obat antikanker Rutenium dan protein:. Suatu studi
tentang interaksi dari ruthenium (III) imidazolium kompleks tetrakloro trans-[(dimetil sulfoxide)
(imidazole) ruthenate (III )] dengan lisozim ayam putih telur dan kuda jantung sitokrom c, "Journal of
Biological Anorganik Kimia, vol. 12, no. 8, hal 1107-1117, 2007.
14. A. Casini, C. Gabbiani, E. Michelucci, et al, "Menjelajahi metallodrug-interaksi protein dengan
spektrometri massa: perbandingan antara kompleks koordinasi platina dan ruthenium senyawa
organologam,". Journal of Biological Anorganik Kimia, vol. 14, no. 5, hal 761-770, 2009.
15. PA Zunszain, J. Ghuman, T. Komatsu, E. Tsuchida, dan S. Curry, "Crystal analisis struktur albumin
serum manusia dikomplekskan dengan asam hemin dan lemak," BMC Biologi Struktural, vol. 3, pasal 6,
2003.
16. B. Honore, "perubahan konformasi dalam serum albumin manusia disebabkan oleh ligan mengikat,"
Farmakologi dan Toksikologi, vol. 66, suplemen 2, hal 7-26, 1990.
17. FA Beck, G. Leblanc, J. Thessing, et al, "ruthenium kompleks organologam dengan ligan
thiosemicarbazone:. Sintesis, struktur dan sitotoksisitas [(η6-p-simen) Ru (NS) CI] + (NS = 9-
anthraldehyde thiosemicarbazones), "Kimia anorganik Communications, vol. 12, no. 11, hal 1094-1098,
2009.
18. S. Krimm dan J. Bandekar, "getaran spektroskopi dan konformasi peptida, polipeptida, dan protein,"
Kemajuan Protein Kimia, vol. 38, hlm 181-364, 1986.
19. J.-S. Mandeville, E. Froehlich, dan HA Tajmir-Riahi, "Studi interaksi kurkumin dan genistein dengan
albumin serum manusia," Jurnal Farmasi dan Analisis Biomedis, vol. 49, no. 2, hal 468-474, 2009.
20. JR Lakowicz dan JG Weber, "Quenching dari fluoresensi oleh oksigen. Probe untuk fluktuasi
struktural dalam makromolekul, "Biokimia, vol. 12, no. 21, hal 4161-4170, 1973.
21. WR Ware, "Oksigen pendinginan dari fluoresensi dalam larutan: suatu studi eksperimental dari
proses difusi," The Journal of Fisik Kimia, vol. 66, no. 3, hlm 455-458, 1962.
22. S.-S. Wu, W.-B. Yuan, H.-Y. Wang, Q. Zhang, M. Liu, dan K.-B. Yu, "Synthesis, struktur kristal dan
interaksi dengan DNA dan ASM dari (N, N'-dibenzylethane-1 ,2-diamina) kompleks logam transisi,"
Journal of anorganik Biochemistry, vol. 102, no. 11, hal 2026-2034, 2008.
23. SS Aleksenko, CG Hartinger, O. Semenova, K. Meelich, AR Timerbaev, dan BK Keppler, "Karakterisasi
interaksi antara albumin serum manusia dan platinum alkohol menghambat tumor-amino (II) kompleks
menggunakan elektroforesis kapiler," Journal of Chromatography A, vol. 1155, tidak. 2, hal 218-221,
2007.
24. PD Ross dan S. Subramanian, "Termodinamika reaksi asosiasi protein: Pasukan berkontribusi
terhadap stabilitas," Biokimia, vol. 20, no. 11, hal 3096-3102, 1981.
25. O. Novakova, H. Chen, O. Vrana, A. Rodger, PJ Sadler, dan V. Brabec, "DNA interaksi dari
monofungsional organologam (II) kompleks antitumor ruthenium di tengah sel-bebas," jilid Biokimia,.
42, no. 39, hlm 11544-11554, 2003.
26. DM Byler dan H. Susi, "Pemeriksaan struktur sekunder dari protein melalui FTIR deconvolved,"
biopolimer, vol. 25, no. 3, hlm 469-487, 1986.