RENCANA PROGRAM KEGIATAN PEMBELAJARAN SEMESTER

BIOKIMIA II
(MKS-2602, Semester IV)

Oleh
Dr. Tri Joko Raharjo, M.Si

JURUSAN KIMIA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS GADJAH MADA
2012

0
A. LATAR BELAKANG

Perkembangan globalisasi menuntut bahwa untuk dapat bersaing dalam merebut

pasar kerja lulusan UGM dituntut tidak hanya mempunyai kemampuan berpikir ( hard
skill) namun yang lebih penting adalah kemampuan soft skillnya. Sejalan dengan hal
tersebut UGM telah memperkenalkan sistem pembelajaran SCL ( Student Centered
Learning) dimana sosialisasinya telah dilakukan dengan pelatihan-pelatihan baik di tingkat
Fakultas maupun Universitas. Sistem pembelajaran SCL diharapkan mampu memotivasi
rasa ingin tahu dan semangat belajar mahasiswa ke arah long-life learning untuk
mencapai suatu kompetensi tertentu sebagaimana yang telah dirumuskan untuk setiap
program studi. SCL juga diharapkan mampu meningkatkan kemampuan soft skill
mahasiswa yang meliputi: kepemimpinan, kerja sama dalam tim, komunikasi dan
presentasi ide. Pelaksanaan metode SCL harus disesuikan dengan masing-masing
program studi dan atau karakter masing-masing matakuliah.
Pelaksananan kuliah Biokimia II, dirancang dengan memadukan metode
pembelajaran interaktif dan metode pembelajaran konvensional (kuliah kelas). Untuk
memacu ketertarikan mahasiswa, sebagai pengantar diberikan berbagai masalah terkini
dalam masayarakat yang penyelesaiannya dilakukan dengan dasar-dasar dari matakuliah
Biokimia II. perkembangan dengan mengambil contoh-contoh yang lebih aplikatif dan
sering dijumpai dalam kehidupan sehari-hari. Mahasiswa juga didorong untuk
menggunakan berbagai fasilitas teknologi informasi melalui tugas-tugas mandiri maupun
kelompok yang didesain harus menggunakan berbagai database terkait di web.
Agar pembelajaran lebih terfokus dan terarah, perlu disusun RPKPS yang memuat
perencanaan pembelajaran, monitoring dan evaluasi sebagai acuan dalam perencanaan
dan persiapan mengajar agar tujuan program pembelajaran mata kuliah ini dapat
tercapai sesuai dengan Lima Pilar Utama RPKPS.
Mata kuliah Biokimia II merupakan mata kuliah wajib yang disajikan pada
semester genap tahun kedua serta merupakan kelanjutan dari matakuliah Biokimia I.
Pada mata kuliah Biokimia II, mahasiswa diperkenalkan proses metabolisme dalam sistem
hidup yang meliputi katabolisme dan biosintesis (anabolisme) makromolekul beserta
mekanisme kontrolnya . Selain itu dibahas secara detail proses tranformasi informasi dan
mekanisme kontrolnya beserta aplikasinya dalam kehidupan sehari-hari.

B. PERENCANAAN PEMBELAJARAN
1. Nama Mata Kuliah : Biokimia II
2. Kode / sks : MKS 2602 / 3 sks
3. Semester : IV(genap)
4. Tujuan Pembelajaran
Tujuan Pembelajaran mata kuliah Biokimia II ini adalah menjadikan mahasiswa
yang:
a. Mempunyai kompetensi keilmuan dalam memahami proses reaksi dalam sistem
hidup
b. Mempunyai pemahaman tentang pola reaksi yang dialami katabolisme
makromolekul dalam sistem hidup beserta mekanisme kontrolnya
c. Mempunyai pemahaman tentang proses biosintesinya molekul dalam sistem
hidup beserta mekanisme kontrolnya
d. Mempunyai pemahaman tentang peranan energi dalam semua proses
katabolisme dan anabolisme
e. Mempunyai pemahaman tentang alur informasi genetik, mekanisme kontrolnya,
peranananya dalam sistem hidup, dan aplikasinya dalam kehidupan
1
 f. Meningkatkan minat mahasiswa untuk memahami lebih lanjut mata kuliah, dan
terciptanya suasana belajar yang lebih kondusif serta mengintroduksikan
Student Centered Learning (SCL)

5. Outcome Pembelajaran
Outcome pembelajaran mata kuliah Biokimia II adalah mahasiswa mampu:
a. Menjelaskan ruang lingkup yang menjadi materi biokimia 2
b. Menjelaskan pola umum reaksi kimia dalam sistem hidup
c. Menjelaskan reaksi dan biosintesis karbohidrat dalam sistem hidup
d. Menjelaskan proses fotosintesis
e. Menjelaskan reaksi dan biosintesis lemak dalam sistem hidup
f. Menjelaskan reaksi dan biosintesis senyawa N dalam sistem hidup
g. Menjelaskan integrasi pengaturan reaksi metabolisme dalam sistem hidup
h. Menjelaskan penaturan dan pemanfaatan informasi genetik dalam sistem hidup
i. Menjelaskan prinsip dasar teknik DNA rekombinan untuk pengembangan
bioteknologi

6. Jumlah Jam dan Pembagiannya

Jumlah tatap muka ada 26 kali tatap muka, terbagi dalam 13 minggu kuliah, 2 kali
ujian: Dalam 1 minggu tatap muka sebanyak 2 kali masing-masing berlangsung
100 menit dan 50 menit dengan garis besar perkuliahan Biokimia II sebagai
berikut :

Cacah
No Jenis Kegiatan Jumlah Jam
Kegiatan
1. Pengantar Kuliah Biokimia II : posisi 1 kali 2 jam
matakuliah dalam peta kurikulum, kontrak
kuliah, cara evaluasi @ 60 menit
2. Metabolisme umum dan bioenergetika 1 kali 2 jam
(minggu ke-1)
3. Metabolisme karbohidrat (minggu ke-2, 3, 4) 6 kali 9 jam
4. Fotosintesis (minggu ke-5) 2 kali 3 jam
5. Metabolisme lemak (minggu ke 6, 7) 4 kali 6 jam
6. Ujian Tengah Semester (minggu ke-8) 2 kali 3 jam
7. Metabolisme senyawa N (minggu ke-9, 10) 4 kali 6 jam
8. Integrasi dan regulasi metabolisme 2 kali 2 jam
(minggu ke-11)
9. Jalur informasi (minggu ke-11, 12, 13) 5 kali 7 jam
10. Pengantar teknologi DNA rekombinan 2 kali 3 jam
(minggu ke-14)
11. Ujian Akhir Semester (minggu ke 15) @120 1 kali 3 jam
menit
TOTAL 28 kali 46 jam

7. Jadwal Kegiatan Mingguan

2
Minggu Pokok Metode
Sub Pokok Bahasan Waktu
Ke- Bahasan Pembelajaran

1 Pendahuluan Ruang lingkup Biokimia 2 1 x 50 Kuliah dan

Posisi matakuliah diskusi
Kontrak kuliah
2 x 50
Metabolisme Jalur utama metabolisme
umum dan Bioenergetika
bioenergetika Kontrol umum metabolisme
Studi metabolisme

2-4 Metabolisme Glikolisis 9 x 50 Kuliah, diskusi

karbohidrat Siklus asam sitrat quiz
Anaplerotik dan siklus
glioksilat
Jalur pentosa fosfat
Transport elektron dan
fosforilasi oksisatif
Glukoneogenesis
Biosintesis glikogen
Biosintesis polisakarida lain

5 Fotosintesis Proses dasar fotosintesis 3 x 50 Kuliah, diskusi

Kloroplas
Reaksi terang
Reaksi gelap (siklus Calvin)
Fotorespirasi

6-7 Metabolisme Sistem penggunaan dan 6 x 50 Kuliah, diskusi

lemak transport lemak quiz
Oksidasi asam lemak
Biointesis asam lemak
Biosintesis triasilgliserol

8 UJIAN Topik sampai dengan minggu 2 x 60 Ujian tertulis

SISIPAN ke-7

9-10 Metabolisme Siklus N dan biogenesis N 9 x 50 Kuliah, diskusi

senyawa N organik dan latihan
Degradasi asam amino
Biosintesis dan katabolisme
Glu, Asp, Ala, Gln dan Asn
Metabolisme asam amino
mengandung S Asam amino
aromatis
Asam amino Ser, Gly, Thr
Asam amino Val, Leu,
Iso,Lys
Metabolisme nukleotida

3
 11 Integrasi dan Regulasi hormone pada 2 x 50 Kuliah, diskusi
regulasi metabolisme bahan baker quiz
metabolisme Mekanisme kerja hormone
Signal transduction

11-13 Jalur Genome, kromosom dan gen 5 x 50 Kuliah, diskusi

informasi Pengkopian informasi presentasi
genetik
Restrisi, repair, rekombinasi,
penataan ulang dan
amplifikasi
Pembacaan informasi
genetik
Dekoding informasi genetik
Gen eukariot dan
ekspresinya
Pembacaan informasi
genetik
Dekoding informasi genetik
Gen eukariot dan
ekspresinya

14 Pengantar Pustaka genome, cDNA dan 3 x 50 Kuliah, diskusi

teknologi PCR presentasi
DNA Kloning
rekombinan Produksi protein

15 UJIAN AKHIR Seluruh topik 2 x 60 Ujian tertulis

8. Penilaian
Sesuai dengan desain pembelajaran yang menggabungkan unsur konvensional
dan unsur SCL, penilaian juga didasarkan atas kedua unsur tersebut. Mengingat tujuan
matakuliah adalah pada tingkat pemahaman, makan unsur penguasaan materi masih
mendapat porsi terbesar yang diukur dalam UTS da UAS dan quiz. Semua nilai,
jawaban ujian dan quiz sedapat mungkin akan diumumkan secara terbuka sehingga
dapat diakses secara transparan melalui papan pengumuman. Dengan demikian
mahasiswa dapat melakukan banding jika mahasiswa merasa nilai yang diperoleh tidak
sesuai dengan capaian mereka. Unsur SCL yang bertujuan meningkatkan softskil
mahasiswa dinilai dari tugas kelompok, presentasi maupun keaktivan mahasiswa dalam
setiap diskusi . Pembagian porsi dari nilai-nilai dengan melibatkan keaktifan mahasiswa
dalam kelas diharapkan dapat memacu mahasiswa untuk mengikuti dengan baik setiap
kegiatan perkulihan karena penilaian seperti ini akan memotivasi mahasiswa untuk aktif
dan tidak hanya mengandalkan nilai ujian saja.

4
 Berikut adalah pembagian porsi penilaian selama satu semester kegiatan
perkuliahan Biokimia II :
No Komponen Penilaian Prosentase
1. Ujian tengah semester 45%
(UTS)
2. Ujian akhir semester (UAS) 45%
3. Tugas Mandiri/Quiz 10%
4. Tugas Kelompok/Presentasi 0%

Kriteria Penilaian :
Pencapaian kompetensi mata kuliah Biokimia II bagi seorang mahasiswa yang
mengambil adalah mampu menerima, meresapi, menyampaikan dan mengaplikasikan
dalam masalah/kuliah lain yang terkait dengan Biokimia II. Dalam mata kuliah Biokimia
II ini, mahasiswa akan memperoleh nilai A atau B jika mahasiswa tersebut secara
memuaskan dapat mengintegrasikan apa yang telah dipelajari dengan persoalan-
persoalan nyata terkait proses kimia dalam sistem hidup. Nilai huruf yang dicapai
mahasiswa diperoleh dengan mengkonversikan prosentase dari semua komponen
penilaian sebagai berikut :
Nilai Angka yang dicapai Konversi ke Nilai Huruf
0 30 E
31 45 D
45 59 C
60 69 B
70 100 A

9. Bahan, Sumber Informasi dan Referensi

1. David L. Nelson, Michael M. Cox, Lehninger Principles of Biochemistry, 2000, Worth
Publisher Inc., New York
2. C. K. Mathews, K.E. Van Holde, 2000, Biochemistry, Edisi 2,The Benjamin/Cummings
Publishing Company Inc, New York

C. PERENCANAAN UMPAN BALIK

Proses pembelajaran perkuliahan Biokimia II diharapkan dapat memotivasi
mahasiswa untuk belajar aktif dalam memahami dan memperluas wawasan keilmuan
tentang berbagai proses kimia dalam sistem hidup beserta aplikasinya. Dalam rangka
mengetahui apakah proses pembelajaran dapat diterima oleh mahasiswa serta dalam
rangka perbaikan proses pembelajaran yang terus menerus diperlukan umpan balik dari
mahasiswa terhadap proses dan hasil pembelajaran matakuliah.
1. Umpan Balik dari Mahasiswa
5
 Untuk mendapat umpan balik dari mahasiswa akan dilakukan dengan metode
kuesioner yang diisi mahasiswa pada saat ujian tengah semester dan dan ujian
akhir semester sebagai tolak ukur keberhasilan perkuliahan Biokimia II.
Di samping kuesioner, unpan balik dari mahasiswa yang mengikuti perkuliahan
Biokimia II juga digali setiap saat baik selama kuliah atau di luar kuliah baik secara
langsung. Mahasiswa juga dapat secara aktif memberikan masukan melalui diskusi
maupun lewat e-mail dosen pengampu, sehingga setiap hambatan yang dijumpai
dalam proses perkuliahan segera dapat diatasi.
Adapun form kuesioner yang direncanakan adalah sebagai berikut :
No. Pernyataan 1 2 3 4 5
1. Fasilitas perkuliahan yang disediakan telah memadai
2. Modul kuliah Biokimia II dapat diperoleh dengan mudah
3. Dosen hadir sesuai jadwal
4. Dosen menguasai materi kuliah dengan baik
5. Cara dosen mengajar tidak terburu-buru sehingga
mudah dipahami
6. Proses Pembelajaran telah secara optmal memanfaatkan
teknologi informasi dan/atau e-learning
7. Materi kuliah disampaikan dengan jelas dan runtut
8. Mahasiswa mampu dengan baik menyerap setiap
materi yang disajikan
9. Proses pembelajaran sesuai RPKPS dengan memberi
kesempatan diskusi/bertanya bagi mahasiswa
10. Soal Ujian Tengah Semenster dan Ujian Akhir Semester
sesuai dengan materi kuliah
Komentar/Saran untuk perbaikan :
Keterangan nilai :
Nilai 1: sangat kurang (pernyataan tidak sesuai dengan kenyataan)
Nilai 5: sangat baik (pernyataan sangat sesuai dengan kenyataan)
Pernyataan dalam kuesioner di atas masih dapat dikembangkan sesuai dengan
kondisi yang ada pada saat kuliah. Hasil kuesioner tersebut akan direkap dan
dianalisis untuk kemudian disosialisasikan kepada mahasiswa yang mengambil mata
kuliah Biokimia II melalui papan pengumuman dan akan dijadikan acuan guna
perbaikan/evaluasi pelaksanaan perkuliahan di masa yang akan datang.

2. Tanggapan (perbaikan dan perubahan rencana)

Pada awal-awal kuliah berjalan (3 minggu pertama), mahasiswa diminta
memberi masukan tentang sistem pembelajaran yang diterapkan dalam perkuliahan
Biokimia II. Masukan dari mahasiswa adalah hal penting mengingat peran
6
 mahasiswa sebagai elemen yang terlibat langsung dengan penerapan sistem
pembelajaran ini.
Sebagai tindak lanjut masukan dari mahasiswa dimungkinkan adanya
perubahan dalam proses pembelajaran yang diharapkan menjadi lebih baik. Dalam
setiap kebijaksanaan perubahan rencana diusahakan bahwa mahasiswa sebagai
elemen penting dalam proses pembelajaran merupakan pihak yang harus
diuntungkan. Sebagai contoh: sarana multimedia kurang baik, komputer sering
hang, LCD kurang terang atau masukan terhadap kecepatan mengajar dosen serta
minimnya kesempatan yang diberikan oleh dosen untuk berdiskusi. Jika hal-hal
semacam ini dapat diidentifikasi lebih dini maka dapat diusahakan untuk melakukan
perbaikan-perbaikan pada hal-hal di atas sehingga pelaksanaan perkuliahan sisanya
dapat berjalan denga lebih kondusif

D. PERENCANAAN EVALUASI
Rencana dokumen untuk evaluasi :
1. Hasil Pembelajaran
Evaluasi ujian tengah semester (UTS), juga dilakukan Ujian Akhir semester
(UAS) bertujuan sebagai evaluasi total dengan tujuan melihat kompetensi
mahasiswa di akhir perkuliahan. Diharapkan pada akhir perkuliahan mahasiswa
mampu mengerti dan paham prinsip dan mekanisme proses transformasi kimia
dalam sistem hidup beserta kontrolnya serta paham contoh-contoh aplikasi konsep
yang dipelajari dipelajari dalam kehidupan sehari-hari. Targer pencapaian nilai A
dan B lebih dari 50% dan nilai D dan E kurang dari 15%.
Teknis penyajian informasi nilai mahasiswa yang mengambil mata kuliah
Biokimia II menggunakan diagram batang dengan menampilkan prosentase nilai
A,B,C,D dan E.

2. Proses Pembelajaran
Kesusesuai rencana dan pelaksanaan proses pembelajaran akan selalu
dipantau. Hasil monitopring ditindaklanjuti dengan tindakan perbaikan dalam proses
pembelajaran sehingga mahasiwa dapat merasakan sistem pembelajaran yang
kondusif yang diharapkan mampu memotivasi mereka untuk maju secara intelektual
dan sosial.

3. Hambatan dan Kekurangan

7
 Hambatan dan Kekurangan yang timbul dalam evaluasi perkuliahan ini akan
dianalisis dan dicari penyelesaiannya dengan kesepakatan agar perkuliahan tetap
dapat berjalan sesuai rencana dan mencapai tujuan yang diharapkan.
Kendala utama pada saat ini adalah minimnya persediaan buku acuan di
perpustakaan, kendala ini dapat diatasi dengan menyiapkan serta mendistribusikan
handout setiap kali pokok bahasan sebelum pembahasan poko bahasan tersebut.

4. Kemungkinan Perbaikan
Untuk mengevaluasi apakah rencana perkuliahan telah sesuai dengan
pelaksanaan perkuliahan akan didasarka pada hasil evaluasi setiap akhir paroh
semester untuk meluruskan penyimpangan yang terjadi dan untuk menjajaki.

8
9