Nama : Rita Maya Lestari

NIM : 17/417042/PBI/01479

Jelaskan tentang mekanisme biosintesis lipid ?

Lipid penting dalam pembentukan struktur dan fungsi membrane sel

prokariotik. Lipid adalah komponan utama penyusun struktur membran sel-sel
pada mikroba seperti membran sitoplasma, membran dari bakteri gram negatif,
membran intrasitoplasmik dan bakteri fotosintetik, Biosintesis asam lemak
bukan merupakan kebalikan dari degradasi asam lemak.

1. Acyl carrier protein

Ciri unik sintesis asam lemak pada bakteri adalah kehadiran ACE merupakan
produk dari gen acpP. ACP adalah salah satunya protein yang paling melimpah di
E. coli. Asil intermediet dari biosintesis asam lemak terikat pada protein melalui
hubungan tioester ke terminal sulfhidril dari 4'phosphopantetheine kelompok
prostetik. Kelompok sulfhidril prostetik adalah satu-satunya kelompok thiol ACP
melekat pada protein melalui linkage phosphodiester. ACP berinteraksi secara
khusus dan transien dengan semua enzim biosintesis asam lemak (kecuali asetil-
CoA karboksilase), dan melakukannya melalui interaksi melalui residu negatif
pada ACP dengan residu positif pada permukaan enzim. Kelompok prostetik dari
ACP diproduksi dari CoA, dan fitur umum dari keduanya adalah lengan
pantetheine untuk pembentukan thioester. Senyawa tioester merupakan protein
dengan berat molekul yang lebih rendah yang disebut protein pembawa asil
(ACP) yang mempuyai gugus SH-esensial. ACP bekerja sebagai suatu alat
pembawa yang mengangkut rantai asil lemak, yang terikat pada gugus –SH ujung
akhir dari tingkatan perpanjangan rantai asam lemak yang satu ke rantai
berikutnya didalam asam lemak sintetase kompleks. Gugus prostetik dari ACP
Protein pembawa asil merupakan protein kecil yang mengandung suatu gugus
asam pentotenat terikat secara kovalen pada sisa serin dari protein dengan
perantaraan jembatan fosfat. Gugus –SH pada ujung akhir dari bagian asam
pentatonat dari ACP, memebetuk sebuah ikatan tioester dengan gugus asetil,
gugus malonil atau gugus asillemak.

2. AcetyI-CoA carboxylase
Asetil CoA karboksilase, suatu enzim yang memerlukan biotin yang
mengkatalisis penambahan suatu gugus karboksil kepada asetil KoA sehingga
menghasilkan produk yang berupa malonil KoA yang merupaka precursor utama
dalam sintesis asam lemak. Proses pembentukan malonil KoA dengan bantuan
enzim asetil KoA karbosilase. Reaksi karboksilase asetil-CoA dilakukan dalam
dua langkah. Biotin, secara kovalen melekat pada BCCP (protein pembawa
karboksil biotin), dikarboksilasi oleh subunit karboksilase (accc). Heterodimerik
transcarboxylase (accA dan accD) kemudian mentransfer CO2 ke acetyl-CoA,
membentuk malonyl-CoA.

Gambar 1. The acetyl-CoA carboxylase reaction is performed in two steps. Biotin,

covalently attached to BCCP (biotin carboxyl carrier protein, accB), is
carboxylated by the carboxylase subunit (accC). The heterodimeric
transcarboxylase (accA and accD) then transfers the CO2 to acetyl-CoA, forming
malonyl-CoA.

3. Inisiasi biosintesis asam lemak

Untuk kelompok malonat yang akan digunakan untuk sintesis asam
lemak ditransfer terlebih dahulu dari malonyl-CoA ke malonyl-ACP oleh
monomeric malonyl-CoA:ACP transasilase, produk dari gen fabD. Enzim
 malonyl-serine intermediate terbentuk selama reaksi FabD, dan gangguan
nukleofilik pada ester ini oleh sulfhidril dari ACP menghasilkan malonyl-
ACE. Tingginya reaktivitas serine dalam malonyl-ACP transacylase adalah
karena situs aktif sedang disusun dari siku nukleofilik hidrolase. Serin
terikat hidrogen pada His-201 dengan cara yang mirip dengan hidrolase
serin.

Gambar 2. Initiation of fatty acid synthesis. (1) Malonyl-CoA : ACP transacylase

(FabD) transfers the malonyl group from CoA to ACP and then (2) [3-ketoacyl-
ACP synthase III (FabH) catalyzes the initial irreversible condensation of
malonyl-ACP with acetyl-CoA to form acetoacetyl-ACE
Dua karbon terakhir dari rantai asam adalah yang pertama kali
diperkenalkan ke dalam rantai yang baru lahir, dan asetilCoA dapat
dianggap sebagai molekul 'primer' sintesis asam lemak dalam E. coli.
Reaksi kondensasi awal, dikatalisis oleh 3-ketoacyl-ACP synthase III
(FabH), menggunakan asetil-CoA dan malonyl-ACP untuk membentuk
empat karbon acetoacetyl-ACP dengan hilangnya CO2 secara bersamaan.
FabH juga memiliki acetyl-CoA: ACP transacylase.

4. Elongation of acyl chains

Empat enzim berpartisipasi dalam setiap siklus berulang pemanjangan
rantai. Pertama, β-ketoacyl-ACP synthase I atau II (fabB atau fabF)
menambahkan unit dua-karbon dari malonyl-ACP ke asil-ACP yang
sedang tumbuh. Ketoester yang dihasilkan reduksi oleh NADPH-
dependent β-ketoacyl-ACP reductase (fabG), dan molekul air kemudian
dihilangkan oleh β-hydroxyacyl-ACP dehydrase (fabA atau fabZ).
Langkah terakhir dikatalisis oleh enoyl-ACP reductase (fabl) untuk
membentuk acyl-ACP jenuh, yang berfungsi sebagai substrat untuk reaksi
kondensasi lainnya.
Gambar 1. Biosynthesis and degradation of fatty acids and membrane lipids. (ATP
dan reduksi ekuivalen berwarna merah jika dikonsumsi dan hijau jika diperoleh.
Enzim berwarna biru. FAB, biosintesis asam lemak; FAD, degradasi asam lemak).

Gambar 2. Cycles of fatty acyl chain elongation.

Referensi
Richard JH, Suzanne J, Charles OR. 2002. Fatty acid and phospholipid
metabolism in prokaryotes. Biochemistry of Lipids, Lipoprotein and Membranes
(4 th edn.).
Helge JJ , Alexander S. 2014. Fatty acid synthesis in Escherichia coli and its
applications towards the production of fatty acid based biofuels.
Biotechnology for Biofuels.7:7.