Tata Nama Enzim

Prinsip Penamaan
Enzim dikelompokkan dan diberi nama menurut reaksi yang dikatalisisnya. Hanya
merujuk pada perubahan reaksi kimia yang disebabkan oleh enzim. Mekanisme reaksi
tidak dimasukkan dan juga gugus prostetik atau kofaktor tidak masuk dalam nama.

Tata Nama
Menurut Enzyme Commission (1961), enzim dibagi atas enam kelas tergantung pada
reaksi yang dikatalisis.
E.C.a.b.c.d
– a. Kelas enzim
– b. subkelas enzim
– c. Sub-sub kelas enzim
– d.Sub-sub-sub kelas enzim
Pengelompokan tidak berdasarkan urutan asam amino, struktur tiga dimensi dan juga
tidak berdasarkan mekanisme reaksi

Klasifikasi Enzim

1. Oksidoreduktase

2. Transferase

3. Hidrolase

4. Liase

5. Isomerase
 6. Ligase
1. Oksidoreduktase
Mengkatalisis transfer atom H, O atau elektron dari satu substrat ke yang lain.
Digit kedua: Hidrogen atau donor elektron
 1. Alkohol
 2. Aldehid atau keton
 3. CH-CH
 4. Amin primer
 5. Amin sekunder
 6. NADH atau NADPH
Digit ketiga: Hidrogen atau akseptor elektron
 1. NAD+ atau NADP+
 2. Fe 3+
 3. O2
 99. Akseptor lain

Nama sistematik ditulis menurut: donor:akseptor oksidoreduktase

– EC. 1.1.1.1
– Nama Sistematik: Alkohol:NAD+ oksidoreduktase
– Nama Trivial: Alkohol dehidrogenase
(Nama trivial: Oksidase, transfer H ke O2; dan dehidrogenase, untuk transfer H ke
akseptor selain O2)

2. Transferase
• Katalisis transfer gugus fungsi khusus seperti metil, asil, amino, glikosil, atau fosfat
dari satu senyawa ke senyawa lain.
AX + B -------- BX + A
• Nama berakhiran X-Transferase, X adalah gugus yang ditransfer.
• Nama sistematik ditulis menurut: Donor:akseptor gugus transferase
• Digit kedua merupakan gugus yang ditransfer
– 1. satu gugus karbon
– 2. Gugus Aldehid atau keton
– 3. Gugus Asil
– 4. Gugus glikosil
– 7. Gugus fosfat
• Digit ketiga: menjelaskan lebih lanjut gugus yang ditransfer
– E.C.2.1.1: metiltransferase
– E.C.2.1.2: hidroksimetiltransferase
– E.C.2.1.3: karboksil atau karbamoil transferase

3. Hidrolase
• E.C.2.7.1: fosfotransferase dengan gugus alkohol sebagai akseptor
• E.C.2.7.2: Fosfotransferase dengan gugus karboksil sebagai akseptor
• E.C.2.7.3: fosfotransferase dengan gugus nitrogen sebagai akseptor
• Fosfotransferase mempunyai nama trivial dengan akhiran kinase
• Hidrolase
• Mengkatalisis reaksi hidrolis
A-X + H2O --------- X-OH + HA

Digit kedua: Jenis ikatan yang dihidrolisis

• 1. ester
• 2. glikosidik
• 4. peptida
• 5. C-N selain peptida

Digit ketiga: menjelaskan lebih lanjut jenis ikatan yang dihidrolisis

• Nama substrat diberi akhiran –ase. Nama sistematik selalu mengikuti hidrolase.
• E.C.3.1.1. Ester karboksilat
• E.C.3.1.2. Ester tiol
• E.C.3.1.3 Monoester fosfat
• E.C.3.1.4 Diester fosfat

4. Liase
• Mengkatalisis pemutusan ikatan C-C, C-O, C-N, C-S.
• Nama sistematik ditulis menurut substrat gugus liase.
• Nama trivial, misalnya dekarboksilase, aldolase, dehidratase (eliminasi CO 2, aldehid,
dan air).
• Digit kedua: ikatan yang diputus
– 1. C-C
– 2. C-O
– 3. C-N
– 4. C-S
• Digit ketiga: gugus yang dihilangkan. Untuk C-C liase
– 1. gugus karboksil
– 2. gugus aldehid
– 3. gugus asam keto

5. Isomerase
• Mengkatalisis penataan struktur atau geometri dalam molekul.
• Enzim diklasifikasikan menurut jenis reaksi yang terlibat.
• Digit kedua: Jenis Reaksi
 1. Rasemisasi atau epimerisasi
 2. Isomerisasi cis-trans
 3. Oksidoreduktase intramolekul
 4. Reaksi transfer intramolekul
• Digit Ketiga: jenis molekul yang mengalami isomerisasi
 1. asam amino
 2. asam hidroksi
 3. Karbohidrat

6. Ligase
• Mengkatalisis pembentukan ikatan baru, disertai dengan hidrolisis ATP atau
nukleosida trifosfat lainnya.
X + Y + ATP ------------- X-Y + ADP + Pi
• Nama sistematik X:Y ligase
• Digit kedua: jenis ikatan yang dibentuk
 1. C-O
 2. C-S
 3. C-N
 4. C-C
• Digit ketiga: menjelaskan lebih lanjut ikatan yang dibentuk
• E.C. 6.3.1 asam-amonia ligase (amida, sintase)
• E.C. 6.3.2 asam-asam amino ligase (peptida, sintase)
• Contoh
• ATP + D-glukosa ------------------- ADP + D-glucose 6-phosphate
• Nama Sistematis: ATP:glucose phosphotransferase
• Nama yang Direkomendasi (trivial): Heksokinase
• EC number: 2.7.1.1
 (2) transferase
 (7) phosphotransferase
 (1) gugus hidroksil sebagai akseptor

 (1) nomor seri yang diberikan secara acak

Sumber : https://wanenoor.blogspot.com/2014/11/tata-nama-enzim.html#.XX4nmFQzbIV

 EC7 Translocases
In enzyme science, Translocases [EC 7] are class of enzymes that catalyse
the movement of ions or molecules across membranes or their separation
within membranes.
Translocases [EC 7] are enzymes that catalyze the movement of ions or
molecules across membranes or their separation within membranes, the
reaction is designated as a transfer from ‘side 1’ to ‘side 2’ because the
designations ‘in’ and ‘out’, which had previously been used, can be
ambiguous.
The subclasses designate the types of components transferred and the sub-
subclasses indicate the reaction processes that provide the driving force for
the translocation.
The translocase enzyme class [EC 7 class] include:

 EC 7.1 translocase enzymes catalyzing the translocation of hydrons

o EC 7.1.1 translocases linked to oxidoreductase reactions

o EC 7.1.2 translocases linked to nucleoside triphosphate

o EC 7.1.3 translocases linked to diphosphate

 EC 7.2 translocase enzymes catalyzing the translocation of inorganic

cations

o EC 7.2.1 translocases linked to oxidoreductase reactions

o EC 7.2.2 translocases linked to nucleoside triphosphate

o EC 7.2.4 translocases linked to decarboxylation

 EC 7.3 catalyzing the translocation of inorganic anions and their

chelates
 EC 7.4 catalyzing the translocation of amino acids and peptides

 EC 7.5 catalyzing the translocation of carbohydrates and their

derivatives

 EC 7.6 catalyzing the translocation of other compounds

EC 7 - Translocases
Deskripsi
Enzim-enzim ini mengkatalisasi pergerakan ion atau molekul melintasi membran atau pemisahannya di
dalam membran, reaksi ini ditetapkan sebagai transfer dari 'sisi 1' ke 'sisi 2' karena sebutan 'masuk'
dan 'keluar', yang sebelumnya telah digunakan , bisa ambigu. Subkelas menunjuk jenis komponen
yang ditransfer dan subkelas menunjukkan proses reaksi yang memberikan kekuatan pendorong
untuk translokasi.

Isi
EC 7.1 Mengkatalisis translokasi hidron
EC 7.1.1 Translokasi hidron atau pemisahan muatan terkait dengan reaksi oksidoreduktase
EC 7.1.1.1 NAD (P) + transhidrogenase proton-translokasi
EC 7.1.1.2 NADH: ubiquinone reductase (H + -translokasi)
EC 7.1.1.3 ubiquinol oxidase (H + -transporting)
EC 7.1.1.4 caldariellaquinol oxidase (H + -transporting)
EC 7.1.1.5 menaquinol oxidase (H + -transporting)
EC 7.1.1.6 plastoquinol — plastocyanin reductase
EC 7.1.1.7 ubiquinol oxidase (elektrogenik, pembangkit gaya gerak proton)
EC 7.1.1.8 quinol — reduktase sitokrom-c
EC 7.1.2 Translokasi hidron terkait dengan hidrolisis nukleosida trifosfat
EC 7.1.2.1 Transporter ekspor tipe-P H +
EC 7.1.2.2 H + -mengangkut ATPase dua sektor
EC 7.1.3 Translokasi hidron terkait dengan hidrolisis difosfat
EC 7.1.3.1 H + -mengekspor diphosphatase
EC 7.2 Mengatalisis translokasi kation anorganik
EC 7.2.1 Terkait dengan reaksi oksidoreduktase
EC 7.2.1.1 NADH: ubiquinone reductase (Na + -transporting)
EC 7.2.1.2 ferredoxin — NAD + oxidoreductase (Na + -transporting)
EC 7.2.1.3 askorbat ferrireductase (transmembran)
EC 7.2.2 Terkait dengan hidrolisis nukleosida trifosfat
EC 7.2.2.1 Na + -mengangkut ATPase dua sektor
EC 7.2.2.2 Transporter tipe Cd2 + ABC
EC 7.2.2.3 Transporter tipe-P P
EC 7.2.2.4 Transporter tipe ABC + ABC
EC 7.2.2.5 Mn2 + transporter tipe ABC
EC 7.2.2.6 K-transporter tipe P
 EC 7.2.2.7 Pengangkut Fe3 + tipe-ABC
EC 7.2.2.8 Transporter Cu tipe P
EC 7.2.2.9 P-type transporter Cu2 +
EC 7.2.2.10 Transporter tipe Ca2 + tipe P
EC 7.2.2.11 Transporter tipe ABC Ni2 +
EC 7.2.2.12 P-type Zn2 + transporter
EC 7.2.2.13 Na + / K + - bertukar ATPase
EC 7.2.2.14 Transporter tipe-Mg2 + P
EC 7.2.2.15 Ag-transporter P-type
EC 7.2.2.16 transporter ferric hydroxamate tipe ABC
EC 7.2.2.17 transporter enterobaktin besi tipe ABC
EC 7.2.2.18 transporter besi sitrat tipe ABC
EC 7.2.2.19 H + / K + - bertukar ATPase
EC 7.2.3 Ditautkan ke dekarboksilasi

EC 7.2.4 Ditautkan ke dekarboksilasi

EC 7.2.4.1 carboxybiotin decarboxylase
EC 7.2.4.2 oksaloasetat dekarboksilase (ekstrusi Na +)
EC 7.2.4.3 (S) -methylmalonyl-CoA decarboxylase (pengangkutan natrium)
EC 7.2.4.4 malarate decarboxylase yang bergantung pada biotin
EC 7.2.4.5 glutaconyl-CoA decarboxylase
EC 7.3 Mengatalisis translokasi anion anorganik
Subclass ini berisi translocases yang mentransfer anion kation anorganik. Subkelas didasarkan
pada proses reaksi yang memberikan kekuatan pendorong untuk translokasi. Saat ini hanya satu
subkelas yang diwakili: EC 7.3.2 Translokasi anion anorganik terkait dengan hidrolisis nukleosida
trifosfat.
EC 7.3.2 - Terkait dengan hidrolisis nukleosida trifosfat
EC 7.3.2.1 Transporter fosfat tipe ABC
EC 7.3.2.2 Transporter fosfon jenis-ABC
EC 7.3.2.3 Transporter sulfat tipe ABC
EC 7.3.2.4 Pengangkut nitrat tipe ABC
EC 7.3.2.5 transporter molybdate tipe-ABC
EC 7.3.2.6 Transporter tungstate tipe ABC
EC 7.3.2.7 ATPase pengangkut arsenit
EC 7.4 Mengatalisis translokasi asam amino dan peptide
 Subkelas didasarkan pada proses reaksi yang memberikan kekuatan pendorong untuk translokasi.
Saat ini hanya ada satu subclass: EC 7.4.2 Translokasi asam amino dan peptida yang terkait
dengan hidrolisis nukleosida trifosfat.

EC 7.4.2 Terkait dengan hidrolisis nukleosida trifosfat

EC 7.4.2.1 Transporter polar-amino-asam tipe ABC
EC 7.4.2.2 Transporter nonpolar-asam amino amino tipe ABC
EC 7.4.2.3 ATPase pengangkut protein mitokondria
EC 7.4.2.4 ATPase pengangkut protein kloroplas
EC 7.4.2.5 bakteri transporter protein tipe-ABC
EC 7.4.2.6 Transporter oligopeptida tipe ABC
EC 7.4.2.7 Transporter feromon tipe-faktor-ABC
EC 7.4.2.8 ATPase yang mensekresi protein
EC 7.4.2.9 Transporter dipeptide tipe ABC
EC 7.4.2.10 Transporter glutathione tipe ABC
EC 7.4.2.11 Pengangkut metionin tipe ABC
EC 7.4.2.12 Transporter sistin tipe ABC
EC 7.5 Mengkatalisasi karbohidrat translokasi dan turunannya
Subkelas didasarkan pada proses reaksi yang memberikan kekuatan pendorong untuk translokasi.
Saat ini hanya satu subkelas yang diwakili: EC 7.5.2 Translokasi karbohidrat dan turunannya terkait
dengan hidrolisis nukleosida trifosfat.
EC 7.5.2 Dikaitkan dengan hidrolisis nukleosida trifosfat
EC 7.5.2.1 Transporter maltosa tipe ABC
EC 7.5.2.2 Transporter oligosakarida tipe ABC
EC 7.5.2.3 Transporter β-glukan tipe-ABC
EC 7.5.2.4 Transporter asam teichoat tipe ABC
EC 7.5.2.5 transporter lipopolisakarida tipe ABC
EC 7.5.2.6 Pengangkut oligosakarida lipid tipe-A tipe ABC
EC 7.5.2.7 Transporter D-ribosa tipe ABC
EC 7.5.2.8 transporter D-allose tipe ABC
EC 7.5.2.9 Transporter D-galactofuranose tipe-ABC
EC 7.5.2.10 Transporter D-xylose tipe-ABC
EC 7.5.2.11 Transporter D-galaktosa tipe-ABC
EC 7.5.2.12 Transporter L-arabinose tipe ABC
EC 7.5.2.13 Pengangkut tipe D-xylose / L-arabinose tipe ABC
EC 7.6 Mengatalisis translokasi senyawa lain
 Subkelas didasarkan pada proses reaksi yang memberikan kekuatan pendorong untuk translokasi.
Saat ini hanya satu subkelas yang diwakili: EC 7.6.2 Translokasi senyawa lain yang terkait dengan
hidrolisis nukleosida trifosfat.
EC 7.6.2 Terkait dengan hidrolisis nukleosida trifosfat
EC 7.6.2.1 Transporter fosfolipid tipe-P
EC 7.6.2.2 Transporter xenobiotik tipe ABC
EC 7.6.2.3 Transporter konjugat-S-konjugat tipe-ABC
EC 7.6.2.4 Transporter lemak-asil-CoA tipe-ABC
EC 7.6.2.5 transporter heme tipe ABC
EC 7.6.2.6 Transporter guanine tipe ABC
EC 7.6.2.7 Transporter taurine tipe ABC
EC 7.6.2.8 transporter vitamin B12 jenis ABC
EC 7.6.2.9 Transporter amina kuartener tipe ABC
EC 7.6.2.10 Transporter gliserol 3-fosfat tipe-ABC
EC 7.6.2.11 transporter poliamin tipe ABC
EC 7.6.2.12 transporter kapsis-polisakarida tipe ABC
EC 7.6.2.13 transporter autinducer-2 tipe-ABC
Sumber : https://www.ebi.ac.uk/intenz/query?cmd=SearchEC&ec=7