Nama : Fathul Jannah

NRP : 01111640000088

ETS RADIOTHERAPY
ISOCENTER SHIFTING IMAGE-GUIDANCE
IN SLICER-RT

Nama : Fathul Jannah

NRP : 0111640000088

DEPARTEMEN FISIKA
INSTITUT TEKNOLOGI SEPULUH NOPEMBER SURABAYA
2019
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

ETS
RADIOTHERAPY 2019
ISOCENTER SHIFTING IMAGE-GUIDANCE IN SLICER-RT
TUGAS 1 : Membuat makalah mengenai hasil eksperimen dan pengamatan
TUGAS 2 : Membuat makalah menegnai hasil eksperimen dan pengamatan dari modifikasi
tugas 1 ( Modifikasi ditunjukkan oleh tulisan warna merah)
a. Install SlicerRT Extension
Untuk menginstall SlicerRT Extension dapat dilakukan dengan mengunduh terlebih dahulu
3D Slicer di: https://download.slicer.org/
Kemudian buka 3D Slicer dan pilih menu view. Selanjutnya pilih “Extention
Manager….”atau Ctrl+4. Install SlicerRT dan klik “restart”.
b. Load data dari DICOM dan nrrd file
(2/1-2) Sebelumnya, terlebih dahulu kita harus mengunduh file untuk data-data bernama
SlicerRT_WorldCongress_TutorialIGRT_Dataset.zip kemudian extract file.

Untuk memuat data DICOM, dapat dilakukan dengan dua cara:

 “drag&drop” folder bernama EclipseEntPhantomRtData ke Slicer. Selanjutnya
akan muncul kotak “DICOM directory”.
 Melalui toolbar klik “DCM”

(2/3) Selanjutnya akan muncul kotak dialog “DICOM Directory” dan pilih pasien
“RANDO ENT” dan klik “Load”. Maka akan muncul tampilkan tampilan seperti ini,
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

(2/4) Kita dapat menentukan tampilan volume sesuai yang kita ingikan. Caranya yaitu buka
slice control lalu klik “link slice together”. Hal ini dilakukan agar ketika kita hanya
mengubah pada salah satu tampilan, maka akan berlaku untuk semuanya misalnya kita
melakukan perubahan untuk tampilan sagital, maka akan terjadi perubahan juga pada aksial
dan koronal, Terdapat dua opsi yaitu “2: ENT IMRT” untuk melihat tulang dan
“5:RTDOSE”untuk melihat dosisnya.
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

(2/5) Tampilan keseimbangan. Kita dapat mengatur tampilan gambar dan melakukan
keseimbangan sesuai yang kita butuhkan. Pertama, kita dapat memanipulasi tampilan 3D
untuk kontras dengan “click&drag” ke ke kiri atau ke kanan sebagai berikut

kita dapat memanipulasi tampilan 3D untuk memperbesar dan mengecilkan gambar serta
tampilan menghadap kemana sebagai berikut.
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

(2/6) Explore data. Pertama kita buka tab menu “Data” lalu pilih “Subject Herarchy”. Klik
gambar mata untuk memperlihatkan gambar yang kita inginkan sebagai berikut

Maka akan muncul Field sebagai berikut.

(kiri sebelum, kanan sesudah)

Terdapat 5 field dari berbagai sisi sebagai berikut
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

4
5

(2/7) Input data day 2 dengan cara yang sama tetapi pilih “any data” lalu ok

Karena data tersebut bukan berupa DICOM, maka apabila ingin memasukkan data tersebut
dapat digunakan toolbar berikut

Dan kita juga dapat menyimpan data dengan toolbar berikut

(2/8) menambahkan day 2 non-dicom ke subject herarchy dengan cara sebagai berikut.
Pertama klik kanan pada pasien, lalu buat “child study” dang anti nama menjadi “Day 2”
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

(2/9) Kemudian masukkan “2_ENT_IMRT_Day1” dan “5_RTDOSE_Day2” kedalam

Day2

(2/10) convert day 2 dose volume sebagai berikut

Gambar akan muncul sebagai berikut

c. Menampilkan rigid registration (transform) dengan gambar CT

(3/1) Register volume CT. Pertama buka menu registration lalu pilih “General Registration
(BRAINS)”.
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

Atur pamaremeternya sebagai berikut:

Berikut merupakan modifikasi dari perubahan rigid nya. Setelah itu, klik “apply” dan
muncul gambar seperti berikut.
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

Note: Dapat juga alternative langkah untuk melakukan registrasi dari tab data sebelumnya.
Klik kanan pada “2:ENT_IMRT_Day2” dan pilih register file. Lalu pilih rigid image-based
registration.

(3/2) Explore perubahan volume. Pertama buka slice layers “>>” kemudian atur volume
pada freground layer sebesar 50% Lalu ganti foreground opacity (dapat diatur W/L sesuai
kebutuhan di volume modul)

(Untuk foreground dapat dimodified sesuai keinginan. Dalam hal ini dimodifikasi dengan
0% dan 100%)

d. Transformasi “day 2 dose volume”

(4/1) Menggandakan Dose Volume. Untuk dapat menggabungkan non-registered dan hasil
yang sudah di register. Pertama buka tab “Subject herarchy” lalu pilih “Clone node” di
context menu untuk dosis day 2. Ganti namanya menjadi “5_RTDOSE_Day2 Rigid”
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

(4/2) Transform dose volume yang telah digandakan. Klik dua kali pada transform column
dari dosis yang digandakan. Klik “none” lalu pilih “Transform_Day2ToDay1_Rigid”

e. Akumulasi distribusi volume

(5/1) Akumulasi distribusi dosis. Pertama buka modul radiotherapy lalu pilih “Dose
Accumulation”.

Atur parameter sebagai berikut, Buat output volume lalu klik “apply”
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

Maka berikut adalah hasil gambarnya

(5/2) Selanjutnya hapus centang pada day 2 dose volume. Pilih registered day 2 volume.
Lalu buat output volume baru dan klik “apply”
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

Berikut tampilannya

f. Menghitung Dose Volume Histogram (DVH)

(6/1) Menghitung DVH untuk unregistered. Pertama buka tab modul radiotherapy dan
pilih “Dose Volume Histogram”.
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

Pilih unregistered accumulated dose, pilih “3: RTSTRUCT: ENT” dan pilih individual
structure sesuai kebutuhan (dalam hal ini dilakukan modifikasi memilih semua individual
structures) kemudian klik “Compute DVH”

Kemudian untuk menampilkan Dose Volume Histogram, dapat mengeklik “switch layout”
atau gambar berikut lalu klik show all untuk menampilkan DVH semua bagian.
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

Berikut merupakan tampilan kurva DVH

Kita juga dapat mengetahui dosis di sembarang titik dengan mengarahkan kursor seperti
berikut
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

(6/2) Menghitung DVH untuk data yang telah diregister. Dengan langkah yang sama,
namun pada dose volume, pilih “Accumulated_5:
RTDOSE:BRAI15_RTDOSE_Day2Rigid” lalu klik “compute DVH”. Buat chart lalu klik
pada “show/hide all”.

Kurva DVH akan muncul sebagai berikut

Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

(6/3) Mengukur Peningkatan. Untuk mengukur peningkatan dosis yang diterima masing-
masing bagian tubuh, dapat dilihat pada table berikut.

Selain itu juga dapat diunduh informasi mengenai hasil dosis minimum, dosis maksimum
dan dosis rata-rata yang diterima oleh masing-masing bagian tubuh. Hasil keduanya
memberikan nilai yang sama pada pengukuran dosis nya yaitu sebagai berikut:
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

Mean Min Max

Volume dose dose dose
Structure (cc) (GY) (GY) (GY)
BODY 8053.86 8.76113 0 124.52
BRAIN 1114.72 41.1554 1.27333 124.52
BRSTEM 31.5703 30.5436 1.69507 113.388
CTV 70.1289 122.158 119.76 124.176
Dose
5200[cGy] 0.15625 104.27 93.2519 113.388
GTV 8.49219 122.051 121.093 123.294
Lens - left 0.128906 10.4467 9.39761 11.5707
Lens - right 0.136719 1.82747 1.58457 2.25296
Optic
Chiasm 1.15625 27.6275 19.4199 41.2592
Optic Nerve
- Rt 2.24609 4.86591 2.29281 22.1097
Optic
Nerve-Lt 1.75 15.9196 12.548 20.8686
Orbit - left 8.46484 13.0256 8.94366 16.6208
Orbit - right 8.76172 3.37797 1.40635 16.7599
PTV1 127.031 121.227 91.2398 124.52
optBRAIN 781.98 19.9433 1.27333 86.5119
optOptic 22.25 9.4189 1.40635 41.2592
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

IGRT (Image Guide Radiotherapy Therapy)

IGRT merupakan cara yang menggunakan sinar-X dan citra (scan) tubuh untuk memandu
perawatan secara perorangan. Sinar-X dan scan menunjukkan ukuran, bentuk dan posisi kanker
yang diderita pasien.
Terapi radiasi direncanakan supaya dapat memberikan dosis tinggi radiasi langsung ke kanker.
Jaringan yang sehat di sekelilingnya diberi dosis serendah mungkin untuk mengurangi risiko
cedera pada jaringan ini.

OPTIONAL
(1/1) Permukaan Isodose. Pertama buka tab “Radiotherapy” lalu pilih “Isodose module”

Kemudian pilih “5:RTDOSE_Day2” volume sebagai Dose volumenya, Selanjutnya klik “generate
dose”
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

(1/2) Menampilkan garis isodose. Pertama buka tab “Subject Herarchy” Matikan visualisasi garis
dan permukaan isodose dengan klik gambar mata.

(1/3) Garis/ permukaan isodose sebagai berikut

Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

(2/1) Bandingkan dose volume menggunakan perbandingan gamma. Pertama buka tab
“Radiotherapy” lalu pilih “Dose Comparison”. Atur volume yang ingin di bandingkan

kemudian buat output gamma volume yang baru. Klik “calculate gamma”
Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088

Berikut merupakan hasil perbandingannya

(2/2) Mengevaluasi peningkatan.

a. Plan dose VS Uncorrected Day 2 dose
b. Plan dose VS Corrected Day 2 dose

Perbandingan 5_RTDOSE_Day2 dan 5_RTDOSE_Day2Rigid

Nama : Fathul Jannah
NRP : 01111640000088