“GENETIKA MIKROORGANISME”
OLEH :
Dosen Pengampu :
JURUSAN BIOLOGI
2020
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis ucapkan kepada Tuhan Yang Maha Esa, karena atas berkat dan
Rahmat-Nya penulis dapat menyelesaikan tugas CBR yang bertema “Genetika
mikroorganisme”. CBR ini penulis susun untuk memenuhi tugas mata kuliah Mikrobiologi.
Dalam pembuatan CBR ini, penulis berterima kasih kepada Seluruh pihak yang
sudah memberikan bimbingannya untuk tugas CBR ini sehingga dapat selesai dengan baik
dan berjalan dengan lancar. Adapun CBR ini penulis buat berdasarkan informasi yang ada.
Penulis juga menyadari bahwa tugas CBR ini masih banyak kekurangan oleh karena
itu penulis minta maaf jika ada kesalahan dalam penulisan dan penulis juga mengharapkan
kritik dan saran yang membangun guna kesempurnaan tugas CBR ini.
Akhir kata penulis ucapkan terima kasih semoga dapat bermanfaat dan bisa menambah
pengetahuan bagi pembaca.
Kelompok 3
DAFTAR ISI
KATA PENGANTAR............................................................................................................................
DAFTAR ISI............................................................................................................................................
BAB I PENDAHULUAN......................................................................................................................
2.1 Pendahuluan..................................................................................................................................
BAB IV PENUTUP................................................................................................................................
4.1 Kesimpulan....................................................................................................................................
4.2 saran.................................................................................................................................................
DAFTAR PUSTAKA
BAB I
PENDAHULUAN
Selain kita dapat mengetahui apa isi buku tersebut dan menyelesaikan tugas kita
CBR ini juga bisa dapat menambah wawasan dan kita dapat menguasai beberapa
buku tentang mikrobiologi
DESKRIPSI BUKU
2.1. Pendahuluan
Genetika merupakan suatu cabang ilmu yang dinamis dan berkembang dengan cepat.
Penelaahnya dilakukan oleh beribu-ribu ilmuwan diseluruh dunia. Rekayasa genetika
adalah suatu segi baru studi genetika yang menjanjikan pada masyarakat baik
perkembangan yang menguntungkan maupun kemungkinan timbulnya akibat-akibat yang
membawa bencana. Penelaahan tentang genetika pertama kali dilakukan oleh seorang ahli
botani bangsa Austria, Gregor Mendel pada tanaman kacang polongnya. Pada tahun 1860-
an ia menyilangkan galur-galur kacang polong dan mempelajari akibat-akibatnya. Hasilnya
antara lain terjadi perubahan-perubahan pada warna, bentuk, ukuran, dan siat-sifat lain
dari kacang polong tersebut.
Ilmu yang mempelajari cara pengekspresian informasi genetis yang terkandung dalam
molekul DNA serta mekanisme pengendalian hereditas pada organisme oleh DNA adalah
genetika . Molekul DNA yang ditemukan dalam sel terdiri dari dua rantai komplementer
yang berbentuk heliks dan saling membelitsehingga disebut heliks ganda atau double
heliks.Masing-masing rantai DNAterdiri dari empat jenis nukleotida, yang dapat dibedakan
menurut jenis basanitrogennya yaitu adenin (A), timin (T), sitosin (C), dan guanin (G).
Pada masa kini genetika telah mampu menjelaskan cara DNA mengendalikan sifat dan
mempertahankan proses yang penting di dalam sel hidup. Langkah pertama dalam
pengekspresian sifat yang dikandung DNA ialah dengan mencetak molekul RNA
berdasarkan urutan nukleotida pada DNA. Molekul RNAmerupakan polimer rantai tunggal
yang terdiri dari empat macam nukleotida yaitu adenin (A), urasil (U), sitosin (C) dan
guanin (G). (Ristiati, 2000)
Genetika mikrobia telah mengungkapkan bahwa gen terdiri dari DNA, suatu
pengamatan yang melekat dasar bagi biologi molekuler. Genetika bakteri mendasari
perkembangan rekayasa genetika, suatu teknologi yang bertanggung jawab terhadap
perkembangan di bidang kedokteran.
2.2. Deskripsi isi buku
MUTASI
Mutasi adalah perubahan yang diwariskan dalam urutan dasar asam nukleat dalam
genom suatu organisme atau vitus atau lainnya entitas genetic. Dalam semua sel, genom
terdiri dari merek ganda DNA. Dalam virus, sebaliknya, genom dapat terdiri dari DNA atau
RNA untai tunggal atau ganda. Strain sel apapun atau virus yang mebawa perubahan dalam
urutan nukleotida disebut mutan. Mutan menurut defenisi berbeda dari strain induknya di
genotipnya, urutan nukleotida genom. Derivative mutan bisa diperoleh baik langsung dari
strain tipe liar atau dari lainnya strain yang sebelumnya berasal dari tipe liar, misalnya
mutan lain.
Genotip vs fenotip
Tergantung pada mutasi, strain mutan mungkin tidak berbeda dalam fenotip dari
induknya. Dengan konvensi pada bakteri genetika, genotip suatu organimes ditunjuk oleh
tiga huruf kecil huruf diikuti dengan huruf kpital dan bercetak miring yang menunjukkan
gen tertentu. Contohnya, gen hisC dari Escherichia coli mengkode prostein yang disebut
HisC yang berfungsi dalam biosintesis asam amino histidin. Fenotip suatu organisme
ditandai dengan huruf capital diikuti oleh dua huruf kecil, dengan plus atau minus super
script untuk menunjukkan ada tidaknya protein itu. Contohnya, strain +-Nya dari E. coli
mampu membuat sendiri histidin, sedangkan strain His tidak.
Hampir setiap karakteristik suatu organisme dapat diubah oleh mutasi. Namun
beberapa mutasi dapat dipilih, berunding beberapa jenis keuntungan pada organisme yang
memilikinya, sedangkan yang tidak dapat dipilih meskipun mereka mungkin mengarah ke
hal yang sangat jelas perubahannya dalam fenotip suatu organisme.
Mutan dengan kebutuhan nutrisi untuk pertumbuhan disebut auxotroph, dan induk
darimana ia berasal disebut prototroph. Metode cerdik yang banyak digunakan untuk
mengisolasi auksotrof adalah pemilihan penisilin. Biasanya, mutan yang membutuhkan
nutrisi spesifik berada pada posisi yang tidak menguntungkan dan karenanya tidak ada
cara langsung mengisolasi mereka. Namun pemilihan penisilin dapat digunakan untuk
memperkaya auksotrofik mutan dalam populasi sel yang termutasi, setelah itu replica
plating jauh lebih efektif.
Penisilin adalah antibiotik yang hanya membunuh sel yang tumbuh. Jika penisilin
ditambahkan ke populasi sel yang tumbuh dalam medium kekurangan nutrisi yang
dibuthkan oleh mutan yang diinginkan sel sel yang tumbuh akan terbunuh, padahal mutan
yang non growing selnya akan bertahan hidup. Pemilihan penisilin sering digunakan
sebagai pembuka un tuk replica plating untuk meningkatkan peluang untuk mendapatkan
mutan auksotrofik.
Mutasi dapat terjadi secara spontan atau diinduksi. Diinduksi mutasi adalah mereka
yang disebabkan oleh agen di lingkungan dan termasuk mutasi yang dilakukan sengaja oleh
manusia. Mutasi spontan adalah yang gterjadi tanpa interverensi eksternal. Sebagian besar
mutasi spontan hasil dari kesalahan sesekalu dalam pasangan pangkalan selama replikasi
DNA. Mutasi yang mengubah hanya satu pasangan basa disebut titik mutasi. Titik mutasi
disebabkan oleh penggantian pasangan basa dalam DNA atau dengan kehilangan aatu
keuntungan dari pasangan basa tunggal.
Jika suatu titik mutasi berada dalam wilayah pengkodean gen itu mengkodekan
polipeptida, setiap perubahan fenotip sel adalah kemungkinan besar hasil dari perubahan
urutan asam amino polipeptida. Perubahan basis pertama atau kedua dari kodon lebih
sering menyebabkan perubahan signifikan pada polipeptida. Tidak semua mutasi missense
tentu menyebabkan protein nonfungsional. Hasilnya tergantung pada dimana subtitusi
terletal di rantai polipeptida dan bagaimana pengat]ruhnya terhadap lipatan dan aktivitas
protein.
Mutasi juga dapat secara sengaja diperkenalkan oleh transposon mutagenesis. Jika
elemen transposable menyisipkan dalam gen, hilangnya fungsi gen umunya terjadi. Karena
transposable dapat dimasukkan ke dalam kormosom di berbagai lokasi, transposon banyak
digunakan untuk menghasilkan mutasi.
Mutasi situs kedua dapat mengembalikan fenotip tipe liar jika mereka berfungsi
sebagai penekan mutasi mutasi yang mengimbangi efek dari mutasi asli. Beberapa kelas
mutasi penekan dikenal ini termasuk :
1. Mutasi ditempat lain di gen yang sama yang mengembalikan fungsi enzim, seperti
mutasi frameshift kedua didekat yang pengembalikan bingkai aslinya.
2. Mutasi pada gen lain untuk mengembalikan fungsi gen yang bermutasi asli
3. Mutasi pada gen lain yang menghasilkan produksi suatu enzim yang dapat
menggantikan yang bermutasi.
Kelas mutasi penekanan yang menarik adalah yang disebabkan oleh perubahan
tRNA. Mutasi yang tidak masuk akal bisa ditekan oleh mengubah urutan anticodon dari
molekul tRNA sehingga mengenali stop kodon. Perubahan tRNA seperti nitu dikenal
sebagai sebuah penekan tRNA dan akan memasukkan asam amino yang dibawanya
menghentikan kodon yang terbaca. Mutasi penekanan tRNA akan mematikan kecuali sel
memiliki lebih dari satu tRNA untuk kodon tertentu. Biasanya,berapapun besar
frameshift mutasi sulit untuk dikembalikan ke alam liar dan mutan membawa mutasi
frameshift secara genetic dengan cukup baik. Karena alasan ini para ahli genetika sering
menggunkannya dalam persilangan genetic untuk menghindari pengembalikan mutan
yang tidak disengaja strain selama studi genetic.
Tingkat dimana berbagai jenis mutasi terjadi bervariasi secara luas. Beberapa
jenis mutasi sangat jarang terjadi hamper mustahil untuk dideteksi, sedangkan yang
lain sering terjadi bahwa mereka mempertahankan stok yang stabil secara genetic.
Selanjutnya semua organisme memiliki berbagai system untuk perbaikan DNA.
Akibatnya, laju mutasi yang diamati tidak hanya bergantung pada frekuensi perubahan
DNA tetapi juga pada efisiensi perbaikan DNA.
Kesalahan basa tunggal saat replikasi DNA lebih mungkin terjadi menyebabkan
mutasi missense daripada mutasi omong kosong karena sebagian besar pergantian
basis tunggal menghasilkan kodon yang menyandikan lainnya asam amino. Jenis yang
paling sering berikutnya perubahan kodon yang disebabkan oleh perubahan basis
tunggal menyebabkan diam mutasi .Ini karena untuk sebagian beasr kodon alternative
untuk asam amino yang diberikan berbeda satu sama lain oleh oerubahn basa tunggal
di posisi ke tiga”diam”.
Beberapa virus mempunyai genom RNA ,Genom ini bisa juga mengalami
mutasi .Menariknya tingkat mutasi pada RNA genom sekitar 1000 kali lipat lebih tinggi
daripada genom DNA .Mengapa haruskah demikian ?Beberapa polymerase memiliki
aktifitas proofreading seperti itu DNA polymerase ,sehingga membatasi total jumlah
kesalahn polymerase.Namun meski ada bebrapa memperbaiki sistem untuk DNA yang
dapat memperbaiki perubahan sebelum mereka menjadi tetap dalam genop sebgai
mutasi ,sebanding mekanisme perbaikan RNA tidak ada.Ini mengarah ke tinggi tingkat
mutasi untuk genom RNA .Tingkat mutasi yang tinggi ini pada virus RNA memiliki
konsekuensi dramatis.Misalnya ,Genom RNA virus yang menyebabkan penyakit dapat
bermutasi dengan sangat cepat.
10.5 Mutagenesis
Tingkat mutasi spontan sangat rendah ,tetapi ada berbagai bahan kimia ,fisik
dan biologis yang bisa meningkatlan tingkat mutasi dank arena itu dikatakan
menginduksi mutasi.Agen –agen ini disebut mutagen.beberapa kategori utama mutagen
damn aktivitasnya antara lain :
Mutagen kimia
Beberapa kelas kimia ada mutagen .Analog dasar nukleotida adalah molekul itu
yang menyerupai basis pudin dan pirimidin DNA dalam struktur namun
menampilkamn properti pairing yang salah.Jika basis analog dimasukkan ke dalam DNA
di tempat basis alami ,yang DNA dapat bereplikasi secara nrmal hamper sepanjang
waktu.Namun DNA kesalahan replica terjadi pada frekuensi yang lebih tinggi di atas
situs ini karena pemasangan pasangan yang salah.Hasilnya adalah penggabungan yang
salah mendasarkan ke untai DNA baru dengan demikian penegenalan a mutasi .Selama
pemisahan selamjutnya dari untai ini dalam sel devisi ,mutasi terungkap .Mutagen
kimia lainnya menginduksi modifikasi kimia dalam satu basis atau
lainnya,menghasilkan pasangan basisyang salah satu terkait perubahan .
Radiasi
Radiasi pengion
Radiasi pengion adalah bentuk radiasi yang lebih kuat darpada radiasi UV dan
termasuk sinar dengan panjang gelombang pendek seperti Xrays,sinbar kosmik,dan
sinar gamma.Sinar ini menyebabkan air dan zat lainnya terionisasi ,dan bersifat
mutagenetik efek dihasilkan secara tidak langsung dari ionisasi ini.
Jika DNA yang rusak dapat diperbaiki sebelum sel membelah ,tidak ada mutasi
akan terjadi .Sebagian besar sel memiliki variasi proses perbaikan DNA berbeda untuk
memperbaiki kesalahan atau perbaikan kerusakan.Proses perbaikan DNA dapat
dikelompokkan menjadi tiga kategori ; pembalikan langsung,perbaikan kerusakan untai
tunggal,dan perbaikan kerusakan untgai ganda.
Transfer gen
Tiga mekanisme genetic pertukaran dikenal dalam prokariota: (1) transformasi ,di
mana DNA bebas dilepaskan dari satu sel diambil dari yang lain (2) transduksi,di mana
transfer DNA dimediasi oleh virus ;dan (3) konjugasi ,di mana transfer DNA melibatkan
kontak sel ke sel dan plasmid konjugatif dalam sel donor .
Deteksi rekombinasi
Untuk mendekteksi pertukaran fisik segmen DNA ,sel dihasilkan dari rekombinasi
harus secara fanotip berbeda dari keduanya orantua.Persilangan genetic pada bakteri
biasanya tergantung pada penggunaan strain penerima yang tidak memiliki beberapa
karakter yang dapat dipilih rekombinan akan bertambah ..Sensitivitas proses seleksi
sanagt luar biasa memungkinkan bahkan beberapa sel rekimbinan terdeteksi dalam
polulasi yan besar sel-sel non rekombinan.Hanya membutuhkan tingkat mutasi untuk
karakteristik yang dipilih harus rendah,karena revertant juga akan membentuk
koloni.Masalah ini bisa sering diatasi dengan menggunakan muatan ganda –galur yang
membawa dua mutasi berbeda-dalam persilangan genetic karena itu sangat tidak
mungkin dua mutasi kembali akan terjadi di sel yang sama.
Suatu keadaan dimana sel dapat mengambil DNA gratis yang dilepaskan oleh
bakteri lain .Penggabungan DNA donor ke dalam sel penerima membutuhkan aktivitas
protein pengikat untai tunggal ,protein RccA ,dan beberapa lainnya enzim hanya enzim
yang kompeten yang dapat di transformasikan.
10.9 Transduksi
Transduksi adalah transfer gen inang dari suatu bakteri ke bakteri lain oleh virus
bakteri.Dalam transduksi umum ,rusak partikel virus secara acak memasukkan fragmen
sel DNA kromosom,tetapi efiiensi transduksi rendah .Secara khusus transduksi ,DNA
dari virus sedang dieksisi salah dan mengambil gen inang yang berdekatan
dengannya,transduksi efisiensi di sini mungkin makin sangat tinggi.
10.10 Konjugasi
10.11 Kromosom sel donor dapat dimobilisasi untuk transfer ke sel penerima.Ini
membutuhkan F plasmid untuk berintegrasi ke dalam kromosom untuk membentuk
fenotip Hfr.Pemindahan kromosom inang jarang lengkap tetap dapat digunakan untuk
memetakan urutan gen pada kromosom .
10.12 Salinan gen yang cacat dapat dilengkapi dengan keberadaannya salinan
kedua dari gen itu yang tidak dipetakan .Pembangunan merodiploid membawa dua
salinan gen atau gen tertentu memungkinkan untuk tes komplementasi untuk
menentukan apakah ada dua mutasi berada di gen yang sama atau berbeda.Ini
diperlukan saat mutasi dalam gen yang berbeda di jalur yang sama menghasilkan
fenotipe yang sama .Rekombinasi tidak terjadi dalam tes komplikasi.
10.13 Archaea tertinggal dari bakteri dalam pengembangan sistem untuk transfer
gen.banyak antibiotic tidak efektif melawan Archaea,sehingga sulit untuk memilih
rekombinasi secara efektif.
10.14 Transposon dan urutan penyisipan adalah elemen genetic itu dapat
berpindah dari satu lokasi ke molekul DNA inang ke lokasi lain melalui
transposisi,sejenis rekombinasi khusus. Transposisis dapat berupa replikatif atau
konservatif .Transposon sering membawa gen penyundi resistensi antibiotic dan dapat
digunakan sebagai mutagen biologis.
BAB III
PEMBAHASAN
A. KELEBIHAN BUKU
Memiliki penjelasan yang lengkap dalam menjelaskan bagaimana kode
genetika mikroorganisme, mutasi gen dan masih banyak lagi.
Bahasa yang digunakan sangat efisien dan juga mampu memudahkan
pembaca memahami materi yang mampu digunakan sebagai sumber
referensi yang berkaitan dengan bagaimana kode genetika mikroorganisme,
mutasi gen .
Buku ini juga dilengkapi dengan gambar-gambar, tabel, dan juga grafik yang
menunjang penjelasan dari penyampaian materi.
Buku ini menggunakan bahasa internasional, yang baik dan mudah untuk
dimengerti.
Selain itu,buku ini juga disertai gambar dan tulisan yang berwarna yang
dapat menambah nilai estetikanya.
B. KEKURANGAN BUKU :
Bagi pembaca yaitu khususnya orang-orang yang kurang paham mengenai
bahasa internasional akan sedikit kesulitan memahami isi dari buku ini .Hal
ini dapat mengurangi minat baca mereka.
BAB IV
PENUTUP
4.1 Kesimpulan
4.2 Saran
Adapun saran yang menunjang buku ini yaitu sebaiknya sebelum membaca buku ini
haruslah dapat menguasai bahasa internasional agar si pembaca lebih mudah dalam
memahami isi dari buku ini.
DAFTAR PUSTAKA