Nutrisi dan

Pertumbuhan Sel
N U T R ISI
L I N GKUNGAN HI DU P M I K ROBA
P E RTUMBUHAN
Nutrisi
Semua yang diambil dari lingkungan digunakan untuk pertumbuhan
dan metabolisme

Semua mahluk membutuhkan Bio-elemen : C, O,H,P,K, N,S, Ca, Fe,

Na,Cl, Mg dan sedikit molekul lainnya untuk bertahan hidup.

Nutrisi yang dibutuhkan bervariasi berdasarkan sumber, bentuk

kimia dan jumlah.
Hubungan antara sumber nutrisi dan
aktifitas sel
CO2

respirasi energi

nutrisi pelestarian
molekul bebas metabolisme
diri

sintesa perbaikan sel

pertumbuhan sel
perkembangan
internal
Nutrien mikroorganisme
Fungsi nutrien :
◦ Sumber energi
◦ Bahan pembangun sel
◦ Akseptor elektron dalam reaksi
biologik
Cara makanan masuk dalam
mikroorganisme:
- Holozoik : ditelan langsung (padat)
- Holofitik : Dicerna diluar sel dengan
enzim ekstraseluler (cair)
Actinophyris feeding on Colpidium (green)
Esensial nutrisi
◦ Macro-nutrients dibutuhkan oAir
dalam jumlah banyak. oSumber mineral
◦ Untuk membangun dan
metabolisme sel oSumber energi
◦ Misal: proteins, carbohydrates. oSumber karbon
◦ Micro-nutrients / trace oFaktor pertumbuhan/suplemen
elements dibutuhkan dalam
oBelerang dan Nitrogen
jumlah kecil.
◦ Bantu fungsi enzim dan menjaga oOksigen
struktur protein
◦ Ada zinc, manganese, dan nickel.
Sumber mineral
(komponen sel, mengatur tek. osmosa, kadar ion H, permeabilitas, reaksi oks-red
dalam medium)
Unsur makro Unsur mikro
C, H, O, N, S, P, K, Ca, Mg, Fe (trace element)
Mg, Mo, Zn, Cu, Co, Ni, Va, Br, Cl,
Na, Se, Silika dll
Unsur makro, sumber dan fungsi
http://www.textbookofbacteriology.net/nutgro.html

Elemen % DW Sumber Fungsi

Carbon 50 Bahan organik / CO2 Bahan utama pembangun sel

Bahan pembangun sel dan cairan sel ;
H2O, bahan organik, CO2,
Oxygen 20 O2 akseptor elektron dalam respirasi
and O2
aerobik

NH3, NO3, bahan Bahan pembangun asam amino, asam

Nitrogen 14
organik, N2 nukleat dan koenzim
Pembangun bahan organik dan cairan
Hydrogen 8 H2O, bahan organik, H2
sel

Phosphates anorganik Pembangun asam nukleat, nucleotida,

Phosphorus 3
(PO4) phospholipids, LPS, asam teikoat

SO4, H2S, So, sulfur Pembangun cysteine, methionine,

Sulfur 1
organik glutathione, dan bbrp koenzim
Unsur makro, sumber dan fungsi
http://www.textbookofbacteriology.net/nutgro.html

Elemen % DW Sumber Fungsi

Komponen kation anorganik sel

Potassium 1 Garam potassium
dan kofaktor enzim ttt
kation anorganik sel dan kofaktor
Magnesium 0.5 Garam Magnesium
enzim ttt
kation anorganik sel dan kofaktor
Calcium 0.5 Garam Calcium enzim ttt dan komponen
endospora
Komponen sitokrom dan
Iron 0.2 Garam Iron nonheme iron-proteins dan
kofaktor enzim ttt
Sumber Nutrisi
Sumber energi Sumber Elektron (Potensi
◦Phototrof Pengurangan)
◦Menggunakan cahaya sebagai ◦Organotrof
sumber energi ◦Menggunakan senyawa organik
◦Chemotrof tereduksi sebagai sumber
◦Menggunakan energi dari potensial reduksi
oksidasi senyawa kimia tereduksi ◦Lithotrof
◦Menggunakan senyawa
anorganik tereduksi sebagai
sumber potensial reduksi
Sumber Nutrisi
Sumber karbon Sumber nitrogen
◦Autotrof ◦Nitrogen organik
◦Dapat menggunakan CO2 sebagai ◦Terutama dari katabolisme asam
sumber karbon tunggal (Carbon amino
fixation) ◦Nitrogen anorganik
◦Heterotrof teroksidasi
◦Membutuhkan sumber karbon ◦Nitrat (NO32-) dan nitrit (NO2-)
organik; tidak dapat ◦Mengurangi nitrogen anorganik
menggunakan CO2 sebagai ◦Ammonium (NH4 + )
sumber karbon ◦Gas nitrogen terlarut (N2) (Fiksasi
Nitrogen)
 Major nutritional types of procaryotes
http://www.textbookofbacteriology.net/nutgro.html

Nutritional Type Energy Source Carbon Source Examples

Cyanobacteria, some
Photoautotrophs Light CO2 Purple and Green
Bacteria

Some Purple and

Photoheterotrophs Light Organic compounds
Green Bacteria

Chemoautotrophs or Inorganic
A few Bacteria and
Lithotrophs compounds, e.g. H2, CO2
many Archaea
(Lithoautotrophs) NH3, NO2, H2S

Chemoheterotrophs Most Bacteria, some

Organic compounds Organic compounds
or Heterotrophs Archaea
 Photoautotroph
Algae, Cyanobacteria
Light + Chlorophyll
CO2 + H2O （CH2O） +O2

Purple and green bacteria

Light + bacteriochlorophyll
CO2 + 2H2S （CH2O） + H2O + 2S

Photoheterotroph
Purple nonsulfur bacteria (Rhodospirillum)
Light + bacteriochlorophyll
CO2 + 2CH3CHOHCH3 （CH2O） + H2O + 2CH3COCH3
Sumber Nutrisi
Air: Faktor pertumbuhan khusus
◦ Sumber Oksigen ◦Asam amino : untuk sintesis protein
◦ Pelarut ◦Senyawa purin dan pirimidin: untuk
sintesis asam nukleat (DNA/RNA)
◦ Alat angkut dalam proses ◦Vitamin : dibutuhkan sebagai
metabolisme koenzim dan gugus prostetik oleh
sel sebagai katalitik
Sumber Nutrisi
Sumber fosfat Sumber belerang
◦Fosfat organik ◦Sulfur organik
◦Fosfat anorganik (H2PO4- dan ◦Belerang anorganik
HPO42-) teroksidasi
◦Sulfat (SO42-)
◦Mengurangi belerang
anorganik
◦Sulfida (S2- atau H2S)
◦Elemental sulfur (S0)
Nutrient Transport Processes
Difusi Sederhana
◦ Pergerakan zat secara langsung
melintasi lapisan ganda fosfolipid,
tanpa membutuhkan protein
transpor
◦ Gerakan dari konsentrasi tinggi 
rendah
◦ Tidak ada pengeluaran energi (mis.
ATP) dari sel
◦ Molekul kecil yang tidak
bermuatan dapat diangkut melalui
proses ini, mis. H2O, O2, CO2
Difusi yang terfasilitasi
(Facilitated Diffusion)
◦ Gerakan zat melintasi membran
dengan bantuan protein transpor
◦ Gerakan dari konsentrasi tinggi 
rendah
◦ Tidak ada pengeluaran energi (mis.
ATP) dari sel
◦ Dua mekanisme: sebagai saluran &
protein pembawa
Nutrient Transport Processes
Transportasi aktif
◦ Gerakan zat melintasi membran dengan bantuan protein transpor
◦ Gerakan dari konsentrasi rendah  tinggi
◦ Pengeluaran energi (mis. ATP atau gradien ion) dari sel
◦ Pompa transpor aktif biasanya merupakan protein pembawa
Sistem transportasi aktif pada bakteri
Pembawa (carrier) ATP: Target mengikat ke protein larut (dalam periplasma
bakteri gram negatif, atau terletak terikat pada selebaran luar membran plasma
dalam bakteri gram positif). Kompleks target kemudian mengikat ke pompa
ATPase membran integral yang mengangkut target melintasi membran plasma.
Sistem transportasi: Pengangkutan satu zat dari konsentrasi rendah ke tinggi
karena zat lain diangkut secara simultan dari tinggi ke rendah. Sebagai contoh:
permeakta laktosa dalam E. coli: Ketika ion hidrogen dipindahkan dari
konsentrasi tinggi di luar, konsentrasi rendah di dalam, laktosa dipindahkan dari
konsentrasi rendah di luar, konsentrasi tinggi di dalam.
Sistem translokasi kelompok: Molekul diangkut dimodifikasi secara kimia.
Sebagai contoh: phosphoenolpyruvate: gula phosphotransferase systems (PTS)
PEP + gula (di luar sel) pyruvate + gula-fosfat (di dalam sel)
Perbedaan transportasi aktif dan pasif
Transportasi aktif Transportasi pasif
Sel memerlukan energi Sel tidak memerlukan energi
Molekul melewati membran Molekul melewati membran
melawan aliran gradien tanpa melawan gradien
konsentrasi konsentrasi
Konsentrasi
◦ konsentrasi senyawa pada satu sisi
lebih tinggi dari sisi lain serta
membran harus permeable
terhadap substansi tersebut.
MICROBIOLOGY EASY NOTES ON NUTRITION
IN BACTERIA
https://www.youtube.com/watch?v=i9Wg8EC
ERMo
TRANSPORT IN CELLS: ACTIVE TRANSPORT
https://www.youtube.com/watch?v=eDeCgTR
FCbA
https://www.youtube.com/watch?v=2-
icEADP0J4
 Medium Mikrobia
Klasifikasi media kultur bakteri atas dasar konsistensi
Media padat
Media padat mengandung agar-agar
pada konsentrasi 1,5-2,0% atau
lainnya, sebagian besar zat penguat
lembam. Media padat memiliki
struktur fisik dan memungkinkan
bakteri tumbuh dengan cara yang
informatif atau berguna secara fisik
(misalnya sebagai koloni atau garis).
Media padat berguna untuk
mengisolasi bakteri atau untuk
menentukan sifat koloni dari isolat
tersebut.
Media setengah padat
Media setengah padat dibuat
dengan agar-agar pada konsentrasi
0,5% atau kurang. Media setengah
padat memiliki konsistensi seperti
custard yang lembut dan berguna
untuk budidaya bakteri
mikroaerofilik atau untuk
penentuan motilitas bakteri.
Medium cair (kaldu)
Media ini mengandung nutrisi
dalam jumlah tertentu tetapi
tidak memiliki jejak zat
pembentuk gel seperti gelatin
atau agar. Media kaldu
melayani berbagai keperluan
seperti perbanyakan organisme
dalam jumlah besar, studi
fermentasi, dan berbagai tes
lainnya. misalnya tes fermentasi
gula, kaldu MR-VP
Klasifikasi media kultur bakteri berdasarkan
tujuan / fungsional penggunaan / aplikasi
Banyak media tujuan khusus diperlukan untuk memfasilitasi pengenalan dan isolasi jenis bakteri tertentu.
Agar Nutrisi:
Media tujuan umum / media dasar
◦ Media basal pada dasarnya adalah media sederhana yang mendukung pertumbuhan sebagian besar bakteri. Air pepton,
kaldu nutrisi, dan nutrient agar (NA) dianggap sebagai media basal. Media ini umumnya digunakan untuk isolasi utama
mikroorganisme.
Media yang diperkaya (faktor pertumbuhan tambahan)
◦ Agar Darah
◦ Penambahan nutrien ekstra berupa darah, serum, kuning telur, dll ke basal medium membuat medium yang diperkaya.
Media yang diperkaya digunakan untuk menumbuhkan bakteri yang menuntut nutrisi ttt. Agar darah, agar coklatadalah
beberapa contoh media yang diperkaya. Agar darah dibuat dengan menambahkan 5-10% (volume) darah ke dasar agar darah.
Agar coklat juga dikenal sebagai agar darah yang dipanaskan atau agar darah lisis.
◦ Media selektif dan pengayaan
◦ Media ini dirancang untuk menghambat bakteri komensal atau pencemar yang tidak diinginkan dan membantu memulihkan
patogen dari campuran bakteri. Sementara media selektif berbahan dasar agar-agar, media pengayaan berbentuk cair. Kedua
media ini memiliki tujuan yang sama. Setiap media agar dapat dibuat selektif dengan penambahan agen penghambat
tertentu yang tidak mempengaruhi patogen yang diinginkan. Berbagai pendekatan untuk membuat selektif media termasuk
penambahan antibiotik, pewarna, bahan kimia, perubahan pH, atau kombinasi keduanya.
Media selektif (selective medium)
Prinsip: Penekanan pertumbuhan diferensial
Media selektif dirancang untuk menekan pertumbuhan beberapa mikroorganisme sekaligus
memungkinkan pertumbuhan mikroorganisme lainnya. Media selektif adalah media berbasis
agar (padat) sehingga individu koloni dapat diisolasi.
Contoh media selektif meliputi:
◦ Agar Garam Mannitol dan Agar Susu Garam yang digunakan untuk memulihkan S.aureus mengandung
10% NaCl.
◦ Agar MacConkey yang digunakan untuk anggota Enterobacteriaceae mengandung garam empedu yang
menghambat sebagian besar bakteri gram positif.
◦ Crystal Violet Blood Agar yang digunakan untuk memulihkan S. pyogenes mengandung 0,0002% crystal
violet.
◦ Medium Lowenstein Jensen yang digunakan untuk M. tuberculosis dibuat selektif dengan memasukkan
warna hijau perunggu.
Media pengayaan
(Enrichment culture medium)
Media pengayaan digunakan untuk meningkatkan konsentrasi relatif
mikroorganisme tertentu dalam kultur sebelum pada media selektif
padat.
Tidak seperti media selektif, kultur pengayaan biasanya digunakan
sebagai media kaldu.
Media pengayaan merupakan media cair yang juga berfungsi sebagai
penghambat komensal dalam spesimen klinis.
Kaldu selenite F, kaldu tetrationat, dan air pepton alkali (APW)
digunakan untuk memulihkan patogen dari spesimen tinja.
Media diferensial / indikator
(Differential medium)
Media tertentu dirancang sedemikian rupa sehingga bakteri yang berbeda dapat dikenali
berdasarkan warna koloninya. Berbagai pendekatan termasuk penggabungan pewarna, substrat
metabolik, dll, sehingga bakteri yang memanfaatkannya muncul sebagai koloni dengan warna
berbeda. Media semacam itu disebut media diferensial atau media indikator. Media diferensial
memungkinkan pertumbuhan lebih dari satu mikroorganisme yang diinginkan tetapi dengan
koloni yang dapat dibedakan secara morfologis.
Contoh media diferensial meliputi:
◦ Agar garam manitol (fermentasi manitol = kuning)
◦ Agar darah (berbagai jenis hemolisis yaitu hemolisis α, β dan γ)
◦ Mac Conkey agar (fermentasi laktosa, koloni merah muda sedangkan fermentor non-laktosa
menghasilkan koloni pucat atau tidak berwarna.
◦ TCBS (Vibrio cholerae menghasilkan koloni kuning akibat fermentasi sukrosa)
Media transportasi
(Transport media)
Spesimen klinis harus diangkut ke laboratorium segera setelah pengumpulan
untuk mencegah pertumbuhan berlebih dari organisme atau bahan makanan
yang mengkontaminasi. Ini dapat dicapai dengan menggunakan media
transportasi. Media semacam itu mencegah pengeringan (pengeringan)
spesimen, menjaga patogen terhadap rasio komensal, dan menghambat
pertumbuhan berlebih dari bakteri yang tidak diinginkan. Beberapa dari media
ini memiliki konsistensi semi-solid. Penambahan arang berfungsi untuk
menetralkan faktor penghambat.
◦ Medium transport Cary Blair dan medium Venkatraman Ramakrishnan (VR) digunakan untuk
mengangkut feses dari penderita suspek kolera.
◦ Saline gliserol buffer Sach digunakan untuk mengangkut kotoran dari pasien yang diduga
menderita disentri basil.
◦ Media Pike digunakan untuk mengangkut streptokokus dari spesimen tenggorokan.
Media anaerobik:
Bakteri anaerob memerlukan media khusus untuk pertumbuhannya karena membutuhkan
kandungan oksigen yang rendah, potensi reduksi oksidasi yang berkurang dan nutrisi tambahan.
Media anaerob mungkin harus ditambah dengan nutrisi seperti hemin dan vitamin K. Media
tersebut mungkin juga harus dikurangi dengan cara fisik atau kimiawi. Perebusan pada medium
berfungsi untuk mengeluarkan oksigen terlarut. Penambahan glukosa 1%, tioglikolat 0,1%, asam
askorbat 0,1%, sistein 0,05%, atau Fe panas dapat membuat media berkurang. Sebelum
menggunakan media harus direbus dalam penangas air untuk mengeluarkan oksigen terlarut
dan kemudian ditutup dengan parafin cair steril.

◦ Medium Robertson Cooked Meat (RCM) yang biasa digunakan untuk menanam Clostridium spps berisi
2,5 cm kolom daging jantung lembu jantan dan 15 ml nutrient broth. Kaldu tioglikolat mengandung
natrium tioglikolat, glukosa, sistin, ekstrak ragi dan kasein hidrolisat.
◦ Methylene blue atau resazurin adalah indikator potensial reduksi oksidasi yang digabungkan dalam
medium. Dalam kondisi berkurang, biru metilen tidak berwarna.
Faktor-Faktor yang Mempengaruhi Pertumbuhan
Pertumbuhan vs Toleransi
"Pertumbuhan" umumnya digunakan untuk merujuk pada perolehan
biomassa yang mengarah pada pembelahan sel, atau reproduksi
Banyak mikroba dapat bertahan hidup dalam kondisi di mana mereka tidak
dapat tumbuh
“Toleran" menggambarkan kondisi di mana organisme bertahan hidup, tetapi
tidak selalu tumbuh
Misalnya, "bakteri termofilik" tumbuh di bawah kondisi suhu tinggi,
sementara "bakteri termotoleran" bertahan suhu tinggi, tetapi tumbuh pada
suhu yang lebih rendah
Lingkungan hidup mikroba
Faktor abiotik Faktor biotik
- Temperatur - Bebas hama/steril
- Kelembaban - Asosiasi/simbiosis
- Tekanan osmosa - Komensialisme
- pH
- Mutualisme
- Kadar oksigen
- Parasitisme
- Senyawa toksik
- Antibiosisme
- Radiasi
- Tegangan permukaan - Sinergisme
- Tekanan hidrostatik dan mekanik - Sintropisme
Faktor-Faktor yang Mempengaruhi
Pertumbuhan
Obligat (harus) vs fakultatif
“Obligate" berarti bahwa kondisi yang diperlukan untuk pertumbuhan
“Facultative” berarti bahwa organisme dapat tumbuh di bawah kondisi
tersebut, tetapi tidak memerlukannya
Istilah "fakultatif" sering diterapkan pada kondisi yang kurang optimal
Misalnya, termofil obligat membutuhkan suhu tinggi untuk
pertumbuhan, sementara termofil fakultatif dapat tumbuh baik pada
suhu tinggi atau suhu lebih rendah.
Faktor-Faktor yang Mempengaruhi
Pertumbuhan
Suhu
Sebagian besar bakteri tumbuh pada kisaran
sekitar 20 derajat Celcius, dengan tingkat
pertumbuhan maksimum pada "suhu
optimum" tertentu
Psychrophiles: Tumbuh dengan baik pada 0ºC;
optimal antara 0ºC - 15ºC
Mesofil: Optimal sekitar 20 - 45ºC
Termofil sedang: Optimal sekitar 55 - 65 ºC
Termofil ekstrim (Hiperthermofil): Optimal
sekitar 80 - 113 ºC
Temperatur
Rentang Optimum Dalam metabolisme terjadi rangkaian
reaksi kimia, kenaikan temperatur
sampai pada batas tertentu akan
Psikrofilik 0 – 30oC 15oC
mempercepat proses metabolisme.
Tetapi bila melebihi max, akan
sebabkan denaturasi protein dan
kerusakan enzim. Sehingga proses
Mesofilik 15 – 55oC 25 – 37oC metabolisme terhenti.

Termofilik 40 – 75oC 55 – 60oC

Faktor-Faktor yang
Mempengaruhi Pertumbuhan
Mikroba mempunyai pH
tertentu bagi kegiatan enzim
-Asidofilik : 2,0 – 5,0
-Mesofilik : 5,5 – 8,0 (Neutrofilik)
-Alkalifilik : 8,4 – 9,5
Faktor-Faktor yang Mempengaruhi
Pertumbuhan
Konsentrasi garam
Halofil membutuhkan konsentrasi garam tinggi untuk tumbuh;
sering membutuhkan kekuatan ionik 0,2 M atau lebih besar dan
beberapa dapat tumbuh pada 1 M atau lebih besar; contohnya,
Halobacterium
Organisme osmotolerant (halotolerant) tumbuh pada berbagai
konsentrasi garam atau kekuatan ionik;
misalnya, Staphylococcus aureus
Tekanan osmosa
Sel adalah 80 hingga 90% air.
A. Hipertonik: Tekanan osmotik tinggi
menghilangkan air dari sel,
menyebabkan penyusutan sel
membran (plasmolisis). Digunakan
untuk mengontrol pembusukan dan
pertumbuhan mikroba.
B. Hipotonik: Tekanan osmotik rendah
menyebabkan air masuk ke dalam sel.
Dalam kebanyakan kasus, dinding sel
mencegah masuknya air secara
berlebihan. Mikroba dapat melisiskan
atau pecah jika dinding sel lemah.
Effects of Osmosis on Bacterial Cells
Plasmolisis, plasmoptisis
Osmotoleran : rentang aw dan tek. Osmotik besar
Halophili : konsentrasi kadar garam yang tinggi
Hypertonic, Hypotonic and Isotonic
Solutions
https://www.youtube.com/watch?v=rMa9MzP
19zI
Water activity
Aktivitas air atau water activity (aw)
sering disebut juga air bebas, karena
mampu membantu aktivitas
pertumbuhan mikroba dan aktivitas
reaksi-reaksi kimiawi pada bahan
pangan. Bahan pangan yang
mempunyai kandungan atau nilai aw
tinggi pada umumnya cepat
mengalami kerusakan, baik akibat
pertumbuhan mikroba maupun akibat
reaksi kimia tertentu seperti oksidasi
dan reaksi enzimatik.
Kelembaban (relative humidity, RH)
Pada umumnya bakteri memerlukan
kelembaban relatif yang cukup tinggi,
kira-kira 85%.
Kelembaban relatif dapat didefinisikan
sebagai kandungan air yang terdapat di Bakteri gram positif cenderung hidup
udara.
Mikroba mempunyai kelembaban
optimum:
- Ragi dan bakteri > 85%
- Jamur < 80%
Bakteri Escherichia coli akan
mengalami penurunan daya tahan dan
elastisitas dinding selnya saat RH
lingkungan kurang dari 84%.
pada kelembaban udara yang lebih
tinggi dibandingkan dengan bakteri
gram negatif terkait dengan perubahan
struktur membran selnya yang
mengandung lipid bilayer.
Faktor-Faktor yang Mempengaruhi Pertumbuhan
Kadar oksigen
a) Aerobik obligat: Membutuhkan oksigen
untuk pertumbuhan (~ 20%) A B C D E
b) Anaerob obligat: Tumbuh tanpa adanya
oksigen; tidak bisa tumbuh di hadapan
oksigen
c) Anaerob fakultatif: Tumbuh terbaik di
hadapan oksigen, tetapi mampu tumbuh
(pada tingkat yang berkurang) tanpa adanya
oksigen
d) Aerotolerant anaerob: Dapat tumbuh sama
baiknya dengan ada atau tidak adanya
oksigen
e) Mikroaerofil: Memerlukan pengurangan
konsentrasi oksigen (~ 2 - 10%) untuk
pertumbuhan
Bila ada O2 semua mikroba akan menghasilkan sejumlah kecil
superoksida (O2-) yang sifatnya tidak stabil pada medium cair dan
racun.
Pada mikroba aerob mempunyai enzim dimutase superoksida yang
mengubah O2- menjadi H2O2 yang sifatnya beracun juga. Oleh sebab
itu mikroba tersebut dapat menghasilkan enzim katalase yang dapat
mengubah H2O2 menjadi H2O dan O2
Reaksi kimia yang terjadi pada mikroba aerob

Enzim dimutase
O2- + O2- + 2H+ ---------------------------- H2O2 + O2
superoksida

Enzim katalase
2 H2O2 ----------------------------- H2O + O2
Senyawa toksik
Logam berat : Hg, Ag, Cu, Au, Zn, Li, Pb
Dalam kadar rendah akan bereaksi dengan gugusan senyawa sel.
Akumulasi dalam sel
Radiasi
Energi radiasi yang terserap oleh sel akan menimbulkan reaksi
ionisasi dalam komponen sel. Ionisasi molekul tertentu dari
protoplasma akan menyebabkan:
- kematian sel
- perubahan genetik
- menghambat pertumbuhan
Tekanan hidrostatik dan mekanik
Kebanyakkan mikroba hidup dengan tekanan dibawah 1
atm. Tetapi mikroba di dasar laut hidup dengan tekanan
hidrostatik sampai 1,1 – 600 atm denga suhu 2 – 3 derajat
Celcius  mikroba barofilik
Toksin
Susunannya Susunannya
Toksofora Haptofora
- Menyebabkan sakit/kematian - Menyebabkan kekebalan
- Termolabil (56oC) - Termostabil
Jenisnya Eksotoksin Jenisnya Endotoksin
Larut dalam air, protein, perlu masa Tidak larut dalam air, tanpa masa
inkubasi, hsl sekresi, merangsang inkubasi,merupakan bagian dari sel,
terbentuknya antibodi dg nilai merangsang terbentuknya antibodi dg
protektif tinggi nilai protektif rendah
Asosiasi/simbiosis
Komensialisme: satu diuntungkan yang lain tidak
Mutualisme : saling menguntungkan
Parasitisme : merugikan
Antibiosis : hambat/tekan pertumbuhan mikroba lain
Sinergisme : mampu melakukan perubahan kimia dalam substrat
Sintropisme : kegiatan bersama menguraikan bahan menjadi sumber
nutrisi
 BACTERIAL GROWTH CURVE AND
BACTERIAL GROWTH
CALCULATIONS
https://www.youtube.com/watch?v=DfA- https://www.youtube.com/watch?v=7fOKaejh
MHgi2ws r-A
 Fisiologi Pertumbuhan
Pertumbuhan :
Penambahan substansi hidup, biasanya disertai
penambahan ukuran dan pembelahan sel
Pertumbuhan  pertambahan secara teratur semua
komponen di dlm sel hidup.

◦ Organisme multiselular (jamur/kapang) :

peningkatan ukuran dan kerapatan miselia,
tetapi belum tentu peningkatan jumlah sel.

◦ Organisme uniselular (bersel tunggal) :

peningkatan jumlah sel yg diikuti peningkatan
biomassa.
Pembelahan biner sederhana
Progresi geometrik
Pelipat gandaan bakteri secara Progresi Geometrik = 2n
Jumlah pembelahan/ generasi (n)
Konstanta rata-rata laju pertumbuhan (k)
Waktu generasi/doubling time (g)
 Matematika pertumbuhan….1
No = populasi mikroba awal (t=0) konstanta rata-rata laju pertumbuhan (k)
Nt = populasi mikroba pada waktu t n log Nt – log No
n = jumlah generasi k = ---- = [ --------------------- ] /t (generasi /jam)
Nt = No x 2n t 0,301
log Nt = log No + n log 2

log Nt – log No log Nt – log No

n = --------------------------- = ------------------------
log 2 0,301
 Matematika pertumbuhan….2
Waktu yang diperlukan untuk penggandaan = doubling time= rata-rata waktu generasi (g)
Jika populasi menjadi 2 kali (pada t=g), maka :
Nt = 2 No
Substitusi 2No pada persamaan rata-rata laju pertumbuhan, maka:

log (2No) – log No log 2 + log No – log No

k = ----------------------- = ---------------------------------
0,301 x g 0,301 x g

1 1
k = --------- maka g = ---------- jam/generasi
g k
Laju pertumbuhan dan Waktu Generasi
Waktu generasi rata-rata (waktu penggandaan) adalah jumlah waktu yang
dibutuhkan untuk konsentrasi sel untuk menggandakan selama tahap log. Ini
dinyatakan dalam satuan menit.

1
Laju pertumbuhan (min-1) =
rata 2 waktu _ generasi

Waktu generasi rata-rata dapat ditentukan langsung dari plot semilog konsentrasi
bakteri vs waktu setelah inokulasi
Untuk menentukan waktu generasi (g) dapat dilakuan dengan :
Melihat pada grafik pertumbuhan
Perhitungan
Rata-rata Waktu dan Laju Pertumbuhan Generasi
Yield pertumbuhan (Y)
Jumlah massa mikroba yang dihasilkan dari substrat/sumber makanan
gram sel yang dihasilkan
Y = ------------------------------
gram substrat yang dikonsumsi

Pada medium yang kaya nutrisi, bakteri akan menggunakan karbohidrat dalam proses
fermentasi hanya untuk menghasilkan energi dan menggunakan substansi lain seperti
asam amino sebagai bahan baku untuk biosintesis.
Efisiensi ATP (sumber energi) digunakan selama fermentasi dinyatakan dalam Y ATP
gram sel yang terbentuk
Y = ----------------------------------------
gram substrat yang dihasilkan
Pertumbuhan di kultur batch
"Pertumbuhan" umumnya Biasanya, budaya kumpulan melewati
digunakan untuk merujuk pada empat tahap yang berbeda:
perolehan biomassa yang mengarah ◦ Tahap lag
pada pembelahan sel, atau ◦ Pertumbuhan logaritmik
reproduksi (eksponensial)
◦ Panggung stasioner
"Kultur batch" adalah sistem
tertutup dalam medium kaldu di ◦ Tahap kematian
mana tidak ada nutrisi tambahan
ditambahkan setelah inokulasi
kaldu.
Kurva tumbuh (batch)

http://www.google.co.id/imgres?imgurl=http://
Kurva tumbuh bakteri
hanya dapat ditentukan pada reaktor batch dan medium tunggal
Lag phase
Jumlah sel tidak bertambah karena sel beradaptasi dengan lingkungan yang baru.
Membutuhkan waktu untuk sintesis enzim baru, memperbaiki sel yang rusak dan
replikasi kromosom.
Log phase
Periode ini sel berkembangbiak dengan cepat. Dari kurva dapat ditentukan laju
pertumbuhan spesifik dari mikroba pada lingkungan tersebut.
Stationer phase
Pertumbuhan melambat dan bahkan mulai terhenti karena nutrisi berkurang atau
hambatan dari metabolit yang terbentuk.
Death phase
Tidak ada pertumbuhan, sel mengalami lisis, mati.
Pertumbuhan dalam biak sinambung
Sel-sel dapat ditumbuhkan untuk waktu yang panjang dengan konsentrasi substrat
yang tetap sama  tahap exponensial dapat dipertahankan

KEMOSTAT TURBIDOSTAT

Metode kultur kontinyu. Kultur dibuat konstan

dengan memanipulasi laju dengan mengatur
nutrisi dalam medium. Jika turbiditas meningkat,
laju nutrisi diatur melambat dan bila turbiditi
meningkat laju nutrisi dipercepat agar cenderung
tetap.
Sinkronisasi pembelahan sel
Pembelahan sel dalam waktu yang bersamaan
Tujuan : agar proses metabolisme siklus pembelahan bakteri dapat
dipelajari
Endospore
[spore, sporulation, sporogenesis, activation, germination]

Tough, dormant state:

◦ Sangat keras, bentuk dorman dari
sel bakteri tertentu sangat resistent
terhadap desikasi, panas, bahan
kimia, radiasi yang mematikan
terhadap sel bukan endospora.
◦ Bagian yang keras dari endospora
terdapat diluar lapisan disebut
lapisan pelindung (coat).
◦ Hanya bakteri yang membentuk
endospora.

http://www.microbeworld.org/
Mikroba dalam bioreaktor
Mikroorganisme digunakan dalam industri
untuk menghasilkan berbagai senyawa kimia,
enzim, dan obat-obatan.
Mikroba ukurannya kecil dan dapat ditanam
secara ekonomis dalam fermentor baik pada
media padat atau cair
Mikroba memiliki tingkat pertumbuhan yang
cepat sehingga dapat menghasilkan hasil yang
besar dalam periode waktu yang singkat
Mikroba dapat dimodifikasi secara genetik
dengan relatif mudah untuk mensintesis
produk-produk non-alami yang menarik
Mungkin dapat mentolerir kondisi
pertumbuhan yang tidak biasa (mis. Ekstrofil
dapat tumbuh pada suhu tinggi atau kondisi
asam)
Ketika tumbuh dalam fermentor, laju
pertumbuhan mikroorganisme pada akhirnya
akan dibatasi oleh produk-produk limbah
metabolisme
Reaksi fermentasi dapat dihentikan secara
berkala untuk mengisi kembali nutrisi dan
menghilangkan limbah (kultur batch)
Atau, tingkat nutrisi dan limbah dapat
disesuaikan secara dinamis untuk
mempertahankan reaksi tanpa batas (kultur
kontinyu)
 Fermentor
Fermentor adalah reaktor tertutup dan disterilisasi yang
mempertahankan kondisi optimal untuk pertumbuhan
mikroorganisme
Mikroorganisme mengalami fermentasi untuk menghasilkan
sejumlah besar metabolit yang diinginkan untuk penggunaan
komersial
Produk dapat dikumpulkan dari fermentor setelah waktu yang
tetap (budidaya batch) atau berkelanjutan (budidaya berkelanjutan)
Dalam budidaya batch, mikroorganisme melewati semua tahap
pertumbuhan sebelum pengumpulan produk
Dalam budidaya berkelanjutan, mikroorganisme dipertahankan
pada tingkat puncak pertumbuhan (fase eksponensial)
Pertumbuhan Batch
Medium pada awalnya diisi ke dalam
wadah, dicampur dengan baik, dan
dibiarkan bereaksi untuk periode
tertentu. Campuran yang dihasilkan
kemudian dibuang.
Prinsip Kerja
Reaktor batch tidak memiliki aliran
masuk atau keluar reaktan atau produk
saat reaksi dilakukan
Pertumbuhan Kontinyu
“Kultur berkelanjutan/kontinyu”
adalah sistem terbuka di mana
media baru ditambahkan secara
terus-menerus ke kultur pada laju
yang konstan, dan kaldu lama
dihilangkan pada laju yang sama.
Metode ini dilakukan dalam
perangkat yang disebut chemostat.
Biasanya, konsentrasi sel akan
mencapai tingkat keseimbangan
yang tetap konstan selama pakan
nutrisi dipertahankan.
Continue fermenters
FERMENTOR
Batch fermentor
Fermentasi dilakukan dalam fermentor
tertutup, dengan tidak ada yang ditambahkan
atau dihapus selama proses (kecuali ventilasi
gas)
Mikroorganisme dan nutrisi dibiarkan selama
periode waktu tertentu, di mana stok nutrisi
habis
Keuntungan dari kultur batch adalah bahwa
fermentor dapat digunakan untuk reaksi yang
berbeda dengan masing-masing penggunaan
terpisah
Kelemahan dari kultur batch adalah bahwa hal
itu menghasilkan periode waktu idle yang
signifikan antara penggunaan, menghasilkan
biaya yang lebih tinggi
Continue fermentor
Fermentasi dilakukan dalam fermentor
terbuka, dengan nutrisi ditambahkan dan
produk dihilangkan pada tingkat yang stabil di
seluruh
Ini menghasilkan reaksi berkelanjutan tanpa
waktu menganggur, mengurangi biaya tenaga
kerja dan meningkatkan hasil produk
Kelemahan dari budaya berkelanjutan adalah
bahwa ada risiko kontaminasi yang lebih tinggi
karena penyesuaian yang konstan
Fermentasi berkelanjutan hanya
dimungkinkan jika sel-sel yang diinokulasi
stabil secara genetik
 Penicilin – batch reaktor
Penisilin antibiotik dapat diproduksi secara massal
melalui penggunaan fermentasi batch dalam tangki
Fermentor industri besar dibangun yang memiliki
kapasitas untuk menampung ribuan liter
Cetakan penicillium ditanam di fermentor batch
tangki dalam setelah penambahan gula dan bahan-
bahan utama lainnya
Proses produksi biasanya berlangsung 6-8 hari,
dengan fermentor dikeringkan pada akhir siklus
fermentasi
Penisilin dipisahkan dari larutan dan dimurnikan
melalui proses hilir untuk meningkatkan potensi https://ib.bioninja.com.au/options/untitled/b1-microbiology-organisms/batch-versus-continuous.html

antibiotiknya
 Asam sitrat
Asam sitrat (sitrat) banyak digunakan sebagai penambah
rasa, pengawet dalam makanan buatan dan antioksidan
Ini diproduksi sebagai perantara dari siklus Krebs dalam
kondisi aerobik
Asam sitrat diproduksi secara massal oleh sistem fermentor
berkelanjutan dari kultur jamur Aspergillus niger
Karbohidrat secara terus-menerus dimasukkan ke dalam
fermentor untuk menjaga produksi asam sitrat
Besi (ion Fe2 +) dikeluarkan dari campuran untuk
memperlambat konversi lebih lanjut dari asam sitrat dalam
siklus Krebs
Ketika asam sitrat menumpuk, ia diekstraksi sebagai bagian
dari medium yang terus-menerus ditarik dari fermentor
Mengukur Pertumbuhan Mikroba
Ada tiga macam pengukuran dasar :
◦ Penentuan jumlah sel : dilakukan bagi organisme bersel tunggal,
misalnya bakteri.

◦ Penentuan massa sel : dpt dilakukan tdk hanya bagi organisme

bersel tunggal tetapi juga bagi organisme berfilamen seperti jamur.

◦ Pendugaan massa sel secara tdk langsung.

Pengukuran Pengenceran serial dan
penghitungan koloni
pertumbuhan mikroba ◦ Perhitungan jumlah sel hidup
Jumlah sel mikroskopis ◦ Sampel terkonsentrasi diencerkan
dengan pengenceran serial
◦ Ruang hitung hemacytometer
◦ Sulit bagi bakteri karena sel
cenderung bergerak masuk dan
keluar dari kotak/daerah
penghitungan
◦ Pewarnaan khusus (mis.
Pewarnaan serologis atau
pewarnaan sel hidup)
Pengukuran pertumbuhan mikroba
● Filtrasi membran
● Digunakan untuk sampel dengan konsentrasi mikroba rendah
● Volume yang diukur (biasanya 1 hingga 100 ml) sampel disaring
melalui filter membran (biasanya dengan ukuran pori 0,45 μm)
● Filter ditempatkan pada media agar nutrisi dan diinkubasi
● Koloni tumbuh di filter dan dapat dihitung
Pengukuran pertumbuhan mikroba
Kekeruhan/turbidity
◦ Berdasarkan difraksi atau
"hamburan" cahaya oleh bakteri
dalam kultur kaldu
◦ Hamburan cahaya diukur sebagai
serapan optik dalam
spektrofotometer
◦ Absorbansi optik berbanding lurus
dengan konsentrasi bakteri dalam
suspensi
Penentuan massa
◦ Sel dipisahkan dari kultur kaldu
dengan sentrifugasi dan ditimbang
untuk menentukan "massa basah."
◦ Sel-sel dapat dikeringkan dan
ditimbang untuk menentukan
"massa kering."
Pendugaan Massa Sel Secara Tidak Langsung
Pengukuran konsumsi nutrien
Pengukuran komponen sel
Pengukuran produk yang terbentuk
Pengukuran panas dari hasil fermentasi
Perubahan viskositas