ISOLASI DAN APLIKASI BAKTERI ENDOFIT BATANG DAN DAUN CABAI

MERAH UNTUK MENGENDALIKAN PENYAKIT BERCAK DAUN CABAI

Isolation and Application Endophytic Bacteria of Stems and Leaves in Red Chilli to Control
Leaf Spot Disease

Oleh:
Tri Kurniasih , Nur Prihatiningsih2), dan Tamad2)
1)
1)
Mahasiswa Fakultas Pertanian Universitas Jenderal Soedirman
2)
Staf Pengajar Fakultas Pertanian Universitas Jenderal Soedirman
Program Studi Agroteknologi, Fakultas Pertanian, Universitas Jenderal Soedirman
Alamat korespondensi: tri.kurniasiah05@gmail.com

ABSTRAK
Penelitian ini bertujuan untuk mendapat isolat bakteri endofit batang dan daun cabai merah,
mengetahui karakteristiknya melalui uji fisiologis dan biokimia, pengamatan secara makroskopis
dan mikroskopis, mengetahui daya hambat bakteri endofit terhadap pertumbuhan jamur patogen
bercak daun secara in vitro, dan mengetahui daya hambat bakteri endofit terhadap perkembangan
penyakit bercak daun cabai secara in planta. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium
Perlindungan Tanaman dan Screen House Fakultas Pertanian, Universitas Jenderal Soedirman,
Purwokerto mulai bulan Oktober sampai dengan Juli 2018. Penelitian ini diawali dengan isolasi
dan identifikasi bakteri endofit asal batang dan daun tanaman cabai merah. Uji in vitro
menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) dengan 8 perlakuan dan 3 ulangan terdiri atas
perlakuan CB0 (kontrol), CB1 (isolat 1), CB2 (isolat 2), CB3 (isolat 3), CB6 (isolat 6), CB7 (isolat
7), CB8 (isolat 8), dan CB9 (isolat 9). Pengujian in planta menggunakan Rancangan Acak
Kelompok Lengkap(RAKL) dengan 6 perlakuan dan 4 ulangan terdiri atas perlakuan CB0 (kontrol),
CB1 (patogen + isolat 1), CB2 (patogen + isolat 2), CB3 (patogen + isolat 3), CB6 (patogen + isolat
6) dan CB7 (patogen + isolat 7). Variabel yang diamati macam bakteri endofit, masa inkubasi,
intensitas penyakit, laju infeksi, tinggi tanaman dan jumlah daun. Hasil penelitian ini menunjukan
bahwa bakteri endofit batang dan daun cabai yang didapatkan terdiri atas 7 isolat bakteri yaitu 3
isolat bakteri endofit berasal dari batang dan 4 isolat berasal dari daun tanaman cabai merah.
Bakteri isolat 1 dan isolat 3 asal batang, serta isolat 8 dan isolat 9 asal daun belum teridentifikasi.
Bakteri isolat 2 asal batang teridentifikasi memiliki karakteristik genus Bacillus sp. sedangkan
isolat 6 dan isolat 7 memiliki karateristik bakteri genus Arthrobacter sp. Berdasarkan uji in vitro
bakteri endofit batang dan daun dapat menghambat pertumbuhan patogen sampai dengan 14,47%.
Hasil uji in planta menunjukan bakteri endofit isolat 2 dapat menunda masa inkubasi dan menekan
penyakit bercak daun sebesar 26,59%, namun belum efektif untuk menghambat perkembangan
penyakit tersebut. Perlakuan 5 isolat bakteri endofit asal batang dan daun secara in planta belum
mampu meningkatkan tinggi tanaman dan jumlah daun.

Kata Kunci: Bakteri endofit, cabai merah, penyakit bercak daun.

1
ABSTRAK:
This research aims to determine the endophytic bacteria isolates of chilli stem and leaf, to
know its characteristics through physiological and biochemical test, macroscopic and microscopic
test, to know endophytic bacteria inhibition to growth of the patogenic fungi leaf spot using in vitro
testing and to know endophytic bacteria inhibition to development of leaf spot disease using in
planta testing. This research was conducted at the Plant Protection Laboratory and Screen House,
Faculty of Agriculture, Jenderal Soedirman University, Purwokerto, start in October until July
2018. The research started with isolation and identification of endophytic bacteria from stem and
leaves of red chili. in vitro test using Completely Randomized Design with 8 treatments and 3
replications consist of control treatment CB0 (control), CB1 (isolate 1),CB2 (isolate 2), CB3
(isolate 3), CB6 (isolate 6), CB7 (isolate 7), CB8 (isolate 8) and CB9 (isolate 9). in planta test
using Rendomized Complete Block Design with 6 treatments and 4 replications consist of CB0
(control), CB1 (pathogen + isolate 1), CB2 (pathogen + isolate 2), CB3 (pathogen + isolate 3),
CB6 ( pathogen + isolate 6) and CB7 (pathogen + isolate 7). Observed variables in this research
is endophytic bacteria, incubation period, disease intensity, infection rate, plant height and number
of leaves. Result of the research showed that endophytic bacteria of chilli stem and leaves were
obtained 7 endophytic bacteria. 3 isolates from stem and 4 isolates from leaves. Bacteria isolate 1
and isolate 3 from stem, isolate 8 and isolate 9 from leaves has not been identified. Isolate 2 from
stem were identified as have characteristic of the genus Bacillus sp. whereas isolate 6 and 7 have
characteristic of the genus Arthrobacter sp. Based on in vitro test, endophytic bacteria of stems
and leaves were able to inhibit pathogen growth to 14,47%. ‘In planta’ test results showed that
endophytic bacteria isolate 2 can delayed incubation period and suppress leaf spot disease by
26,59%, but it has not been effective to inhibit the development of disease. Treatment with in planta
test of 5 isolates endophytic bacteria from stem and leaves has not been able to increase plant
height and leaf number.

Key Words: Endophytic bacteria, red chili, leaf spot disease

PENDAHULUAN
Cabai merah (Capsicum annuum L.)
merupakan salah satu komoditas yang
banyak dibudidayakan oleh petani di
Indonesia. Cabai merah memiliki prospek
ekonomi yang tinggi dan banyak
dimanfaatkan sebagai bumbu masakan.
Produksi cabai merah di Indonesia
mengalami peningkatan selama beberapa
tahun terakhir. Berdasarkan pada data
statistik produksi tanaman sayuran cabai
besar menurut provinsi menunjukan produksi
cabai besar di Jawa tengah pada tahun 2011
sebanyak 11.9131 ton/ha, tahun 2012
sebanyak 13.0129 ton/ha, tahun 2013
sebanyak 14.5037 ton/ha, tahun 2014
sebanyak 16.7795 ton/ha, tahun 2015
2
16.8412 ton/ha dan pada tahun 2016
sebanyak 16.4980 ton/ha (Badan Pusat
Statistik dan Direktorat Jenderal Hortikultura,
2017).
Penyakit penting pada tanaman cabai
yang disebabkan oleh jamur salah satunya
yaitu penyakit bercak daun. Penyekit ini
disebabkan oleh jamur Cercospora capcisi.
Hal tersebut juga dijelaskan oleh Meilin
(2014) bahwa penyakit bercak daun dapat
menyebabkan kerusakan pada daun tanaman.
Kerusakan parah menyebabkan tanaman
cabai kehilangan semua daunnya sehingga
dapat menurunkan produktivitas cabai
merah. Tsania dan Jackson (2010),
menjelaskan bahwa gejala bercak daun
Cercospora terlihat berwarna coklat
melingkar dengan bagian tengah berwarna
putih dan terdapat halo berwarna kuning.
Gejala lanjut ditunjukan dengan adanya
banyak bercak pada daun, kemudian daun
menjadi cepat mengunging dan rontok.
Selain itu, gejala bercak juga dapat
ditemukan pada bagian batang, tangkai daun
dan tangkai buah, namun pada bagian buah
gejala bercak jarang terjadi (Sulastri et al.,
2013).
Pengedalian penyakit tanaman yang
ramah lingkungan dapat dilakukan dengan
pengendalian hayati yaitu dengan
memanfaatkan mikroba atau agensia hayati
seperti pemanfaatan bakteri endofit sebagai
bakteri antagonis. Ryan et al. (2008),
menjelaskan bahwa bakteri endofit
merupakan bakteri yang hidup di dalam
jaringan tanaman yang tidak menimbulkan
infeksi atau memberikan dampak negatif
bagi inangnya. Bakteri endofit mampu
bertahan hidup pada lingkungan yang
mengandung logam berat dan memiliki sifat
antimikroba. Lodewyckx et al. (2002)
menjelaskan bahwa bakteri endofit telah
diisolasi dari tanaman monokotil dan dikotil
seperti jenis pohon berkayu oak dan pir, dan
tanaman herba. Paul et al. (2013)
mengakatakan bahwa terdapat 283 isolat
yang telah diisolasi dari akar, batang dan
daun tanaman cabai.
Penelitian ini bertujuan untuk
mendapatkan isolat bakteri endofit batang
dan daun, mengetahui karakteristiknya
melalui uji biokimia, pengamatan secara
makroskopis, mengetahui daya hambat
bakteri endofit terhadap pertumbuhan jamur
patogen bercak daun secara in vitro dan
mikroskopis, dan mengetahui daya hambat
bakteri endofit terhadap perkembangan
penyakit bercak daun cabai secara in planta.
3
METODE PENELITIAN
Tempat dan Waktu
Penelitian ini dilakukan di
Laboratorium Perlindungan Tanaman dan
Screen House, Fakultas Pertanian,
Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto.
Penelitian dilakukan pada bulan Oktober
sampai Juli 2018.
Rancangan Percobaan
Uji in vitro menggunakan Rancangan
Acak Lengkap (RAL), perlakuan digunakan
sebanyak 8 jenis dan 3 ulangan dan diperoleh
24 unit percobaan yang terdiri atas:
CB0 = Kontrol (Jamur C. capsici)
CB1 = Jamur C. capsici + Bakteri endofit
isolat 1 asal batang
CB2 = Jamur C. capsici + Bakteri endofit
isolat 2 asal batang
CB3 = Jamur C. capsici + Bakteri endofit
isolat 3 asal batang
CB6 = Jamur C. capsici + Bakteri endofit
isolat 6 asal daun
CB7 = Jamur C. capsici + Bakteri endofit
isolat 7 asal daun
CB8 = Jamur C. capsici + Bakteri endofit
isolat 8 asal daun
CB9 = Jamur C. capsici + Bakteri endofit
isolat 9 asal daun
Uji in planta menggunakan Rancangan
Acak Kelompok (RAK), yang terdisi atas:
CB0 = Kontrol (Tanaman cabai + patogen)
CB1 = Tanaman cabai + Patogen + Bakteri
endofit isolat 1 asal batang
CB2 = Tanaman cabai + Patogen + Bakteri
endofit isolat 2 asal batang
CB3 = Tanaman cabai + Patogen + Bakteri
endofit isolat 3 asal batang
CB6 = Tanaman cabai + Patogen + Bakteri
endofit ioslat 6 asal daun
CB7 = Tanaman cabai + Patogen + Bakteri
endofit isolat 7 asal daun
Perlakuan terdiri dari 6 jenis dan 4 ulangan
sehingga diperoleh 24 unit percobaan dengan
setiap unit terdiri dari 3 tanaman cabai
varietas Lado dan aplikasi bakteri endofit
konsentrasi 108 dilakukan dengan cara
disemprotkan pada bagian daun tanaman
cabai.
Isolasi dan Identifikasi Bakteri Endofit
Isolasi bakteri endofit dari eksplorasi
tanaman cabai sehat dari tiga desa di
Kecamatan Baturaden yaitu desa Pandak,
Kemutug Lor dan Kemutug Kidul. Sampel
tanaman cabai merah sehat diambil, bagian
batang dan daun dipotong kemudian disterilisasi
permukaan menggunakan alkohol 70% dan
dibilas air steril sebanyak 3 kali, maserasi
dan dilakukan pengenceran berseri sampai
pada pengenceran 10-4 dan 10-5. Hasil
pengenceran 10-4 dan 10-5 dibiakan pada
medium NA dengan metode spread
sebanyak 50 µl dan diulang sebanyak 2 kali.
Suspensi bakteri yang telah dispread pada
medium biakan kemudian diinkubasi selama
24-48 jam. Identifikasi dilakukan secara
makroskopis, mikroskopis dan uji biokimia.
Isolat bakteri yang telah diidentifikasi
dimurnikan lagi pada medium miring.
Isolasi Jamur Cercospora capsici
Isolasi jamur C. capsici diperoleh dari
eksplorasi tanaman cabai bergejala bercak
daun, kemudian ditumbuhkan pada medium
CDA (Carrot Dextrose Agar) dengan
komposisi wortel 200 g, glukosa 20 g, agar
20 g dan air 1 L (Suresh, 2013), lalu
diidentifikasi. Isolat yang telah murni
kemudian diperbanyak ada medium CDA
dan diinkubasi pada suhu ruang selama 7 hari.
Uji in vitro
Uji in vitro dilakukan menggunakan
metode dual culture. Isolat bakteri
diremajakan pada medium NA. Isolat C.
capsici dipotong dengan diameter 0.5 cm
4
menggunakan bor gabus sebagai inokulum
dan dibiakan pada medium CDA kemudian
diinkubasi selama satu hari. Setiap bakteri
endofit digoreskan pada cawan yang telah
berisi jamur C. capsici berumur satu hari
dengan jarak 3 cm. Kultur diinkubasi dan
diamati pertumbuhannya selama satu minggu.
Perhitungan daya hambat dilakukan dengan
rumus sebagai berikut (Al Banna dan Hartati,
2017):
𝑅1−𝑅2
DH = × 100%
𝑅1
Keterangan:
DH = Daya hambat bakteri endofit terhadap
jamur patogen.
R1 = Jari-jari koloni jamur yang tumbuh ke
arah yang berlawanan dengan bakteri.
R2 = Jari-jari koloni jamur yang tumbuh
menuju goresan bakteri.
Uji in planta
Bibit tanaman cabai berumur 3 minggu
ditanam pada polybag. Aplikasi bakteri
endofit dilakukan saat tanaman berumur 1
minggu setelah pindah tanam. Bakteri
endofit yang telah dibuat formulasi dari
bahan singkong diaplikasikan dengan cara
disemprot pada bagian daun tanaman dengan
konsentrasi bakteri 108. Selanjutnya aplikasi
jamur C.capsici dilakukan dengan cara
disemprot pada bagian daun satu hari setelah
aplikasi bakteri endofit.
Pengamatan
Komponen Penyakit
Komponen penyakit yang diamati
meliputi masa inkubasi, intensitas penyakit
dan laju infeksi. Intensitas penyakit dihitung
dengan rumus (Prabaningrum dan Moekasan,
2014) :
∑(𝑛 ×𝑣 )
P= × 100%
𝑁 ×𝑍
Keterangan: P = Intensitas Penyakit
(%)., v = Nilai (skor) kerusakan tanaman
berdasarkan luas daun seluruh tanaman yang 2,3 𝑋𝑡 𝑋0
r= (log − log )
terserang. n = Jumlah tanaman yang 𝑡 1−𝑋𝑡 1−𝑋0
memiliki nilai v (kerusakan tanaman) yang Keterangan: e = bilangan hasil koversi (e =
sama. Z = Nilai atau skor tertinggi. N = 2.3). r = Laju infeksi. t = Selang waktu
Jumlah tanaman yang diamati. pengamatan. Xt = Proposdi daun sakit waktu
Kategori serangan (skor), yaitu: 0 = t. X0 = Proporsi daun sakit pada awal
Tidak ada kerusakan sama sekali. 1 = Luas pengamtan.
kerusakan tanaman > 0 - ≤ 10%. 2 = Luas Komponen pertumbuhan
Komponen pertumbuhan yang diamati
kerusakan tanaman > 10 - ≤ 20%. 3 = Luas
meliputi tinggi tanaman dan jumlah daun.
kerusakan tanaman > 20 - ≤ 40%. 4 = Luas
Analisis Data
kerusakan tanaman > 40 - ≤ 60%. 5 = Luas
Data pengamatan dianalisis
kerusakan tanaman > 60%.
menggunakan analisis ragam ANOVA pada
Laju infeksi dihitung dengan rumus
taraf 5%. Jika hasil pengujian terdapat
rumus epidemologi Van der Plank
perbedaan nyata maka pengujian dilanjutkan
(Manengkey dan Senewe, 2011) yaitu:
dengan uji BNT pada taraf 5.

5
 HASIL DAN PEMBAHASAN
A. Isolasi dan Identifikasi Bakteri Endofit Batang dan Daun Cabai Merah
Tabel 1. Karakteristik Fisiologi dan Morfologi Bakteri Endofit Asal Batang dan Daun Cabai Merah
Isolat Karakter Fisiologi dan Morfologi Bakteri Endofit
Bakteri Uji Uji NaCl Perwanaan Morfologi Koloni Morfologi Genus
Gram H2O2 1% 3% 5% Gram Sel Bakteri
Isolat 1 + + + + + Ungu Bentuk:Bulat tidak Batang Belum
(asal (Gram beraturan teridentifikasi
batang) positif) Elevasi:Um- bonat
Warna: kuning
kehijauan
Permukaan: kasar.
Margin: lobate
Isolat 2 + + + + + Ungu Bentuk: Bulat Batang Bacillus sp.
(asal (Gram Elevasi: cembung (Breed et al.,
batang) positif) Warna: putih susu 1957)
Permukaan: kasar
Margin: erose
Isolat 3 + + + + + Ungu Bentuk: Bulat tidak Batang Belum
(asal (Gram beraturan teridentifikasi
batang) positif) Elevasi: cembung
Warna: putih
Permukaan:
mengkilat
Margin: entire
Isolat 6 + + + + + Ungu Bentuk: Bulat Batang Arthrobacter
(asal (Gram Elevasi: cembung (Breed et al.,
daun) positif) Warna: putih susu 1957)
Permukaan:
mengkilat
Margin: undulate
Isolat 7 + + + + + Ungu Bentuk: Bulat Batang Arthrobacter
(asal (Gram Elevasi: cembung (Breed et al.,
daun) positif) Warna: putih susu 1957)
Permukaan: halus
Margin: wavy
Isolat 8 - + - - - Merah Bentuk: Bulat - Batang Belum
(asal (Gram Elevasi: cembung - teridentifikasi
daun) negatif) Warna: putih susu -
Permukaan:
mengkilat, licin
Isolat 9 + + - - - Ungu Bentuk: Bulat tidak Batang Belum
(asal (Gram beraturan teridentifikasi
daun) positif) Elevasi: datar
Warna: putih
Permukaan:
mengkilat
6
 Berdasarkan hasil identifikasi
bakteri endofit asal batang dan daun
tanaman cabai merah (Tabel 1.) diperoleh
tujuh (7) isolat bakteri. Isolat bakteri 1
merupakan isolat asal batang, Gram
positif, sel berbentuk batang, koloni
bakteri berwarna kuning kehijauan
dengan permukaan kasar, koloni bakteri
berbentuk bulat tidak beraturan dengan
elevasi umbonat dan margin lobate. Isolat
bakteri 2 asal batang Gram positif, sel
berbentuk batang, koloni berbentuk bulat
dan berwarna putih susu, elevasi cembung,
permukaan kasar, dan margin erose.
Isolat bakteri 3 asal batang, Gram positif,
sel berbentuk batang, koloni berbentuk
bulat tidak beraturan dan berwarna putih,
elevasi cembung, permukaan mengkilat,
dan margin entire. Isolat bakteri 6 asal
daun Gram positif, koloni berbentuk bulat
dan berwarna putih susu dengan
permukaan mengkilat dan margin
undulate. Isolat bakteri 7 asal daun Gram
positif, koloni berbentuk bulat dan
berwarna putih susu, elevasi cembung,
permukaan halus dan margin
bergelombang (wavy). Isolat 8 asal daun
merupakan Gram negatif dengan sel
berbentuk batang dan katalase positif,
bentuk koloni bulat, elevasi cembung,
berwarna putih susu dengan permukaan
mengkilat dan licin. Isolat 9 asal daun
memiliki karakteristik Gram positif, sel
batang, katalase positif, koloni berbentuk
bulat tidak beraturan, elevasi datar,
berwarna putih dengan permukaan
mengkilat.
Berdasarkan hasil identifikasi
bakteri isolat 2 memiliki karakterisitik
yang dimiliki oleh bakteri genus Bacillus
sp. yaitu koloni bulat, kasar dan convex,
sel bakteri batang, Gram positif dan dapat
7
tumbuh pada media mengandung NaCl
sampai kadar 7%, katalase positif (Breed
et al., 1957). Bakteri isolat 6 dan 7
memiliki karakteristik seperti bakteri dari
genus Arthrobacter sp. yaitu koloni
berwarna putih sampai putih krem, sel
batang, Gram positif, koloni berbentuk
bulat, halus, convex, dan katalase positif
(Breed et al., 1957) dan menurut Paul et
al. (2013) bahwa bakteri Arthrobacter sp.
ditemukan sebagai bakteri endofit pada
tanaman cabai merah. Bakteri isolat 1,
isolat 3, isolat 8 dan isolat 9 belum
teridentifikasi.
Hasil uji Gram bakteri isolat 1, isolat
2, isolat 3, isolat 6, isolat 7, dan isolat 9
menunjukan Gram positif sedangkan
isolat 8 menunjukan Gram negatif, hal ini
menunjukan bahwa bakteri tersebut
merupakan bakteri positif, sedangkan uji
H2O2 3% bereaksi positif dengan
terbentukannya buih pada saat pengujian.
Bakteri yang bereaksi positif pada saat uji
H2O2 menunjukan bahwa bakteri tersebut
memiliki enzim katalase yang mampu
memecah senyawa hidrogen peroksida
yang bersifat beracun bagi bakteri tersebut
menjadi air dan oksigen. MandeepKataria
et al. (2016) yang menjelaskan bahwa uji
katalase positif koloni bakteri yang
ditetesi H2O2 akan menghasilkan buih.
Enzim katalase memiliki peran utama
dalam sel yaitu yaitu mencegah
terakumulasinya senyawa H2O2
meningkat sehingga beracun sebagai
produk sampingan dari proses
metabolisme sistem kehidupan.
Uji pertumbuhan isolat bakteri
endofit pada medium NA + NaCl dengan
konsentrasi 1%, 3%, dan 5% menunjukan
hasil yang positif kecuali bakteri isolat 8
dan isolat 9 asal daun yang menunjukan
 hasil negatif, sehingga dapat diartikan
bahwa bakteri isolat 1, isolat 2, isolat 3,
isolat 6 dan isolat 7 mampu tumbuh dan
beradaptasi pada medium salin atau
mengandung garam. Hal ini sesuai dengan
Anisa et al. (2017) yang menjelaskan
bahwa bakteri yang mampu hidup pada
lingkungan salin merupakan bakteri
halofilik. Nilawati et al. (2014) juga
menjelaskan bahwa bakteri halofilik
dikelompokan berdasarkan kadar garam
yang dibutuhkan meliputi jenis halofil
rendah yang mampu tumbuh optimal pada
kadar 2 – 5% NaCl, jenis halofil sedang
dapat tumbuh optimal pada kadar 5 – 20%
NaCl, dan halofil ekstrim yang dapat
tumbuh secara optimal pada kadar 20 – 30%
NaCl.
B. Daya Hambat Bakteri Endofit Batang
dan Daun Cabai terhadap
Pertumbuhan Jamur C. capsici secara
in vitro
Tabel 2. Daya Hambat Bakteri Endofit
terhadap Pertumbuhan Jamur Cercospora
capsici secara in vitro.
Perlakuan Daya Hambat (%)
CB0 0b
CB1 9,52 a
CB2 14.47 a
CB3 10.71 a
CB6 9.99 a
CB7 11.00 a
CB8 0 b
CB9 0 b
Keterangan: Angka yang diikuti huruf
yang sama (a, b) pada satu kolom menurut
uji BNT pada tarah 5% tidak menunjukan
pengaruh yang berbeda nyata. Data
dianalisis menggunakan data transformasi
=SQRT( X + 0.5). K (kontrol), CB0
(kontrol), CB1 ( jamur ptogen + bakteri
isolat 1), CB2 (jamur patogen + bakteri
isolat 2), CB3 (jamur patogen + bakteri
isolat 3), CB6 (jamur patogen + bakteri
8
isolat 6), CB7 (jamur patogen + bakteri
isolat 7), CB8 (jamur patogen + bakteri
isolat 8), CB9 (jamur patogen + bakteri
isolat 9).
Berdasarkan data daya hambat
bakteri endofit pada Tabel 2. menunjukan
bahwa bakteri endofit yang diujikan
memberikan pengaruh yang berbeda
nyata terhadap pertumbuhan jamur C.
Capsici, namun pada perlakuan CB8 dan
CB9 tidak berbeda nyata dengen kontrol.
Hal ini menunjukan bahwa bakteri isolat
1, isolat 2, isolat 3, isoat 6 dan isolat 7
tersebut berpeluang untuk mengendalikan
penyakit bercak daun cabai oleh jamur C.
capsici. Isolat bakteri pada perlakuan CB2
menunjukkan penghambatan terbesar
yaitu 14.47%, diikuti CB7 sebesar
11.00%, CB3 sebesar 10.71%, CB6
sebesar 9.99% dan CB1 sebesar 9.52%.
Hasil uji antagonis menunjukan bahwa
bakteri endofit tersebut memiliki daya
hambat karena menghasilkan antifungi
yang mampu menghambat pertumbuhan
jamur C. capsici. Ryan et al. (2008) yang
menjelaskan bahwa bakteri endofit dapat
menghasilkan metabolit sekunder seperti
antifungi, antibiotik, senyawa antikanker,
senyawa organik yang mudah menguap,
antivirus, insectisida. Menurut Arios et al.
(2014), zona hambatan terbentuk karena
adanya senyawa antifungi atau enzim
pendegradasi dinding sel. Jenis dan
kestabilan metabolit sebagai antifungi
yang dihasilkan oleh oleh bakteri dapat
mempengaruhi besarnya zona hambatan.
C. Daya Hambat Bakteri Endofit Batang dan Daun Cabai terhadap Perkembangan
Penyakit Bercak Daun Cabai secara in planta
Tabel 3. Daya hambat bakteri endofit terhadap perkembangan penyakit bercak daun secara in
planta.
Laju
Perlakuan MI (hsi) IP (%) infeksi PP (%) JD (Helai) TT (cm)
(unit/hari)
CB0 2 1,80 a 0,06 0 23 a 27,49 a
CB1 2 1,58 a 0,05 12,24 18 a 30,10 a
CB2 3 1,32 a 0,50 26,59 19 a 32,34 a
CB3 3 1,78 a 0,03 1,53 19 a 27,98 a
CB6 2 1,65 a 0,03 8,55 14 a 24,21 a
CB7 3 1,59 a 0,09 12,04 15 a 26,93 a
Keterangan: Angka yang diikuti huruf yang sama (a, b) pada satu kolom menurut uji BNT
pada tarah 5% tidak menunjukan pengaruh yang berbeda nyata. CB0 (kontrol), CB1 ( jamur
ptogen + bakteri isolat 1 asal batang), CB2 (jamur patogen + bakteri isolat 2 asal batang), CB3
(jamur patogen + bakteri isolat 3 asal batang), CB6 (jamur patogen + bakteri isolat 6 asal daun),
CB7 (jamur patogen + bakteri isolat 7 asal daun), MI (Masa Inkubasi), IP (Intensitas Penyakit),
PP (Penekanan Penyakit), JD (Jumlah Daun), TT (Tinggi Tanaman).

1. Masa inkubasi tanaman disebabkan karena

Berdasarkan data pada Tabel 3. terhambatnya perkembangan
perlakuan CB0, CB1, dan CB6 patogen.
memiliki masa inkubasi dua (2) hari 2. Intensitas dan Penekanan
setelah inokulasi, sedangkan Penyakit
perlakuan CB2, CB3 dan CB7 Intensitas penyakit terendah
memiliki masa inkubasi tiga (3) hari ditunjukkan oleh perlakuan CB2
setelah inokulasi. Hal tersebut (isolat 2) sebesar 1.32% dengan
menunjukan bahwa perlakuan penekanan penyakit sebesar 26.59%.
bakteri isolat 2 asal batang, isolat 3 Namu, intensitas penyakit pada
asal batang dan isolat 7 asal daun Tabel 3. menunjukan bahwa
dapat menghambat infeksi jamur C. perlakuan bakteri endofit tidak
capsici dibandingkan dengan berbeda nyata terhadap kontrol.
perlakuan kontrol, bakteri isolat 1 Meskipun berdasarkan uji in vitro
asal batang, dan isolat 6 asal daun. bakteri endofit asal batang dan daun
Hal ini sesuai dengan penelitian cabai memiliki kategori
Parida et al. (2016) yang penghambatan yang lemah.
menjelaskan bahwa bakteri endofit Hal ini dapat disebabkan
mampu memperpanjang masa karena kurangnya nutrisi untuk
inkubasi dan menghambat perkembangan bakteri endofit di
perkembangan penyakit. Afdila et al. daun tanaman cabai, selain itu juga
(2016) juga menjelaskan lamanya dapat disebabkan pengaruh suhu dan
waktu yang dibutuhkan patogen kelembaban yang ada di sekitar
untuk memunculkan gejala pada tanaman. Nutrisi untuk
9
 perkembangan bakteri endofit dapat
dipengaruhi oleh formulasi yang
digunakan, hal ini dijelaskan oleh
Munif et al. (2017) bahwa material
atau bahan pembawa dalam
formulasi dapat menjaga viabilitas
sel bakteri. Bahan yang dipilih juga
dapat menentukan efektivitas bakteri
dalam meningkatkan pertumbuhan
tanaman dan pengendalian patogen.
Selain nutrisi, suhu dan kelembaban
juga menjadi salah satu faktor yang
mempengaruhi efektivitas bakteri
endofit sabagai agensia pengendali
hayati. Menurut Soesanto (2008),
kondisi kering pada daerah sekitar
permukaan daun dapat
mengakibatkan bakteri tidak dapat
tumbuh dan baik. Selain itu, kondisi
iklim mikro di sekitar permukaan
daun yang beragam dan tidak stabil
mengakibatkan bakteri untuk
melakukan penyesuaian yang tinggi
agar dapat tumbuh dan aktif.
3. Laju Infeksi
Berdasarkan Tabel 3.
Perlakuan bakteri endofit isolat 1,
isolat 3 dan isolat 6 menunjukan laju
infeksi lebih rendah dari kontrol,
namun isolat 2 dan 7 menunjukan
laju infeksi yang lebih tinggi dari
kontrol. Hal ini diduga karena bakteri
endofit batang dan daun memiliki
penghambatan yang lemah. Menurut
Paul et al. (2013), berdasarkan hasil
uji in vitro bakteri endofit asal daun
memiliki penghambatan yang lemah
yaitu kurang dari 2 mm,
dibandingkan dengan penghambatan
bakteri asal akar tanaman cabai yang
lebih dari 8 mm. Namun, Munif et al.
(2012) yang menjelaskan bahwa
10
bakteri endofit memiliki peranan
sebagai agensia pengendali hayati
yang menghasilkan senyawa
antifungi untuk melawan patogen
dan dapat menginduksi ketahanan
tanaman. Kompetisi ruang dan
nutrisi juga merupakan mekanisme
mikroba antagonis dalam
menghambat patogen (Serdani et al.,
2018). Senyawa antibiotik yang
dihasilkan oleh bakteri endofit
sebagian besar berperan dalam
menginduksi ketahanan tanaman
dibandingkan perannya secara
langsung sebagai bakterisida
(Leiwakabessy dan Latupeirissa,
2013).
4. Tinggi Tanaman dan Jumlah
Daun
Berdasarkan hasil analisis pada
Tabel 3. Perlakuan bakteri endofit
asal batang dan daun cabai
memberikan pengaruh tidak nyata
pada tinggi tanaman dan jumlah
daun. Hal ini duga bakteri endofit
asal batang dan daun yang
diaplikasikan pada daun tanaman
cabai membutuhkan waktu lama
untuk melakukan penyesuaian
sehingga tidak dapat memproduksi
senyawa yang dapat meningkatkan
pertumbuhan tanaman secara optimal.
Berbeda dengan bakteri endofit asal
akar yang dapat mengkolonisasi
jaringan akar dan tumbuh dengan
baik karena nutrisi yang tersedia
lebih banyak dibandingkan di daun
sehingga dapat menghasilkan
senyawa yang dapat memacu
pertumbuhan tanaman. Menurut
Istiqomah dan Joko (2014), bakteri
endofit dapat menghasilkan hormon
 IAA yang dapat meningkatkan
pertumbuhan tanaman. Bakteri
endofit asal akar tanaman mampu
memacu pertumbuhan akar lateral,
akar adventif, dan akar primer
sehingga tanaman dapat tumbuh
dengan baik. Berdasarkan hasil
penelitian Paul et al. (2013)
menunjukan bahwa terdapat
sebanyak 283 isolat bakteri dari
sampel tanaman cabai merah dan
sebagai besar isolat bakteri berasal
dari bagian akar tanaman. Hal ini
disebabkan karena akar merupakan
tempat utama bakteri endofit masuk
dalam jaringan tanaman.
KESIMPULAN DAN SARAN
Kesimpulan
1. Bakteri endofit batang dan daun cabai
yang didapatkan terdiri atas 7 isolat
yaitu 3 isolat bakteri endofit berasal dari
batang dan 4 isolat berasal dari daun
tanaman cabai merah.
2. Bakteri isolat 1 dan isolat 3 asal batang,
serta isolat 8 dan isolat 9 asal daun belum
teridentifikasi. Bakteri isolat 2 asal
batang teridentifikasi memiliki
karakterisitik genus Bacillus sp.
sedangkan isolat 6 dan isolat 7 memiliki
karateristik bakteri genus Arthrobacter
sp.
3. Bakteri endofit isolat 1 asal batang, isolat
2 asal batang, isolat 3 asal batang, isolat
6 asal daun dan isolat 7 asal daun secara
in vitro mampu menghambat
pertumbuhan jamur C. capsici sampai
dengan 14.47%, sedangkan isolat 8 dan
isolat 9 asal daun belum mampu
menghambat pertumbuhan jamur C.
capsici.
11
4. Uji in planta 5 isolat bakteri endofit
batang dan daun belum mampu
menghambat perkembangan penyakit
bercak daun cabai dan meningkatkan
pertumbuhan tanaman.
Saran
1. Perlu adanya identifikasi bakteri endofit
tersebut sampai pada tingkat molekuler.
2. Perlu adanya penelitian lebih lanjut
untuk pengujian bakteri endofit batang
dan daun cabai untuk mengendalikan
patogen lain.
DAFTAR PUSTAKA
Afdila, R., R. Sriwati dan Tj. Chamzurni.
2016. Pengaruh Media Tanam terhadap
Kemampuan Bakteri Endofit dalam
Mengendalikan Serangan Penyakit
Mati Ranting pada Bibit Pala (Myritica
fragrans).Jurnal Ilmiah Mahasiswa
Pertanian Unsyiah 1(1): 251 – 160.
Al Banna, M. Z., dan Hartati. 2017. Isolasi
dan Uji Antagonistik Bakteri Endofit
dan Rizosfer Bambu Asal Tana Toraja
terhadap Jamur Patogen
Tanaman.Jurnal Dinamika 8(2): 20 –
30.
Anisa, S., N. S. Mulyani dan M. Asy’ari.
2017. Pengaruh Garam Monovalen
(NaCl dan KCl), dan Divalen (CaCl2
dan MgCl2) terhadap Aktivitas
Protease Ektraseluler Bakteri Halofilik
Isolat Bittern Tambak Garam
Madura.Jurnal Kimia Sains dan
Aplikasi 20(1): 37 – 41.
Arios, L. N., D. Suryanto, K. Nurtjahja dan
E. Munir. 2014. Asai Kemampuan
Bakteri Endofit dari Kacang Tanah
dalam Menghambat Pertumbuhan
Sclerotium sp. pada Kecambah Kacang
Tanah.Jurnal HPT Tropika 14(2): 178
– 186.
Badan Pusat Statistik dan Direktorat
Jenderal Hortikultura.2017.Produksi
Tanaman Sayuran Cabai Besar (Ton)
(Tabel Dinamis).(On-line).
https://www.bps.go.id/site/resultTab
diakses tanggal 6 April 2018.
Breed, R. S., E. G. D Murray and N. R. Smith.
1957. Bergey’s Manual of
Determinative Bacteriology. The
William and Wilkins Company,
Baltimore 2, U.S.A.
Istiqomah, D., dan T. Joko. 2014.
Keefektifan Bakteri Endofit dalam
Meningkatan Pertumbuhan Tanamab
Jagung secara in vitro.Prosiding
Seminar Nasional Pengembangan dan
Pemanfaatn IPTEK untuk Kedaulatan
Pangan, hlm: 619 – 126.
Leiwakabessy, C. dan Y. Latupeirissa. 2013.
Eksplorasi Bakteri Endofit sebagai
Agens Hayati pada Tanaman Kersen
(Muntingia calabura L.).Jurnal
Budidaya Pertanian 9(1): 16 – 21.
Lodewyckx, C. et al. 2002. Endophytic
Bacteria and Their Potential
Applications.Critical Reveiws in Plant
Sciences 21(6): 583-606.
MandeepKataria, J. Saini, M. Singh, K.
Kumar. 2016. Isolation of Catalase
Producing Bacteria, Production of
Catalase and Its Aplication to Degrade
Hydrogen Peroxide from
Effuelent.European Journal of
Biotechnology and Bioscience 4(6): 34
– 37.
Manengkey, G. S. J dan E. Senewe. 2011.
Intensitas dan Laju Infeksi Penyakit
Karat Daun Uromyces phaseoli pada
Tanaman Kacang Merah.Eugenia
17(3): 219-223.
Meilin, A. 2014. Hama dan Penyakit pada
Tanaman Cabai serta Pengendaliannya.
Balai Pengkajian Teknologi Pertanian
Jambi, Jambi.
12
Munif, A., S. Wiyono dan Suwarno. 2012.
Isolasi Bakteri Asal Padi Gogo dan
Potensinya sebagai Agens Biokrontrol
dan Pemacu Pertumbuhan.Jurnal
Fitopatologi Indonesia 8(3): 57 – 64.
Munif, A., M. F. Oktafiyanto, dan D.
Dewantara. 2017. The Effectiveness of
Varius Formulation of Endophytic
Bacteria From Mangrove to Control
Phytophthora Leaf Blight on Japanese
Taro.Final Report DIPA, Southeast
Asian Regional Centre for Tropical
Biology (SEAMEO BITROP).
Nilawati, M. dan Marihati. 2014. Pengaruh
Pengadukan Bertahap terhadap
Pertumbuhan Bakteri Halofilik dengan
Nutrisi Artemia salina pada Pembuatan
Garam.Jurnal Biotropal Industri 5(1):
29 – 35.
Parida, I., T. A. Damayanti, Giyanto. 2016.
Isolasi, Seleksi dan Identifikiasi
Bakteri Endofit sebagai Agens
Pengiduksi Ketahanan Padi terhadap
Hawar Daun Bakteri.Jurnal
Fitopatologi Indonesia 12(6): 199 –
208.
Paul, N. C., S. Hyung Ji, J. Xin Deng and S.
Hun Yu. 2013. Assemblages of
Endophytic Bacteria in Chili Pepper
(Capsicum annuum L.) and Thei
Antifungal Activity Against
Phytopathogens in vitro.Plant Omics
Journal 6(6): 441 – 448.
Prabaningrum, L dan Moekasan TK.
2014 .Pengelolaan Organisme
Pengganggu Tumbuhan Utama pada
Budidaya Cabai Merah di Daratan
Tinggi.Jurnal Hortikultura 24(2): 179-
188.
Ryan. R. P., K. Germaine, Ashley Franks,
David J.Ryan and David N.
Dowling.2008.Bacterial Endophytes:
Recent Developments and
Applications.FEMS Microbio Lett 278:
1 – 9.
Serdani, A. D., L. Q. Aini, dan A. L. Abadi.
2018. Isolasi dan Identifikasi Bakteri
Endofit dari Tanaman Padi (Oryza
sativa) sebagai Pengendali Penyakit
Hawar Daun Bakteri Akibat
Xanthomonas oryzae pv. oryzae.Jurnal
Viabel Pertanian 12(1): 18 – 26.
Tsania and G. Jackson. 2010.Capsicum Frog-
Soesanto, L. 2008. Pengantar Pengendalian
Hayati Penyakit Tanaman.Jakarta: PT
RajaGrafindo Persada.
13
Suresh, K.R.2013.Studies on Leaf Spot of
Chilli (Capsicum annuum L.) Caused
by Cercospora capsici Heald &
Wolf.Thesis, Department of Plant
Pathology, University of Agriculture
Sciences, Bangalore.
eye Spot.(On-line).Pasific Pest and
Pathogens Fact Sheet,
http://www.pestnet.org/fact_sheets/ca
psicum_frogeye_spot_092.pdf diakses
tanggal 10 September 2017.