Kuliah 5

BAKTERIA
(Mikroba Prokaryotik )
 Mikroba adalah organisme yang
berukuran mikro meter dan harus diamati
menggunakan mikroskop.

 Klasifikasi Mikroba
Klasifikasi selalu dinamik, tergantung pada
Perkembangan Ilmu Pengetahuan dan
penemuan spesies baru.
Apa aja 6 Kingdom?
 Archaebacteria
 Eubacteria
 Protista
 Fungi
 Tanaman
 Hewan
Klasifikasi Mikroba
 Klasifikasi Prokaryotik

 Sebelumnya, klasifikasi prokariotik didasarkan pada

pewarnaan gram, morfologi, endospora, mekanisme
metabolisme, motilitas dan reproduksi (ciri struktur
luar).
 Perkembangan ilmu pengetahuan khususnya genetika
memicu terjadinya perubahan klasifikasi. Saat ini
dilakukan klasifikasi genetik yang didasarkan pada :
1. Komposisi DNA Dasar
2. Morfologi DNA
3. Analisis Ribosome RNA
FILOGENI PROKARYOTIK
Green Sulphur Bacteroides
Bacteria and Flavobacteria
Spirochetes
Planctomyces

Deinococci
Chlarmydiae
Non Green
Sulphur Bacteria Gram + Bacteria

Cyanobacteria
Thermotoga
Proteobacteria
Archaebakteria: ekstrim
Eubacteria:
• Heterotrof
• Fotosintetik autotrof
• Kemosintetik autotrof
Metanogen

Archebacteria ini adalah anaerob.

Mereka menjadikan metana (gas
alam) sebagai produk limbah.
Mereka ditemukan di sedimen
rawa, limbah, dan di tempat
pembuangan sampah yang
terkubur. Di masa depan, mereka
dapat digunakan untuk
menghasilkan metana sebagai
produk sampingan dari
pengolahan limbah atau operasi
TPA.
 Halofilik
 Archaebacteria pencinta garam ini tumbuh di
tempat-tempat seperti Great Salt Lake of Utah
atau kolam garam di tepi Teluk San Francisco.
 Sejumlah besar halofil tertentu dapat
mengubah perairan ini menjadi merah jambu
tua.
 Halofil merah muda mengandung pigmen yang
sangat mirip dengan rhodopsin di retina
manusia. Mereka menggunakan pigmen visual
ini untuk jenis fotosintesis yang tidak
menghasilkan oksigen.
 Halophiles adalah aerob, bagaimanapun, dan
melakukan respirasi aerobik.
Halophiles ekstrim dapat hidup di lingkungan yang sangat asin.
Sebagian besar adalah autotrof fotosintesis. Fotosintesis dalam
kategori ini berwarna ungu karena alih-alih menggunakan klorofil
untuk berfotosintesis, mereka menggunakan pigmen serupa yang
disebut bakteriorhodopsin yang menggunakan semua cahaya
kecuali cahaya ungu, membuat sel tampak ungu.
Termofilik
Beberapa bisa tumbuh di atas suhu air mendidih.
Mereka adalah anaerob, melakukan respirasi
anaerobik Beberapa bisa tumbuh di atas suhu air
mendidih. Mereka adalah anaerob, melakukan
respirasi anaerobik.
Termofilik menarik karena mengandung gen untuk
enzim yang tahan panas yang mungkin sangat
berguna dalam industri dan kedokteran. Contohnya
adalah taq polimerase, gen yang diisolasi dari
kumpulan Thermus aquaticus di mata air panas
Yellowstone Park. Taq polimerase digunakan untuk
membuat salinan dalam jumlah besar dari urutan
DNA dalam sampel DNA. Itu sangat berharga untuk
pengobatan, bioteknologi, dan penelitian biologi.
Penjualan tahunan taq polimerase kira-kira
setengah miliar dolar.
Cyanobakteria
Ini adalah kelompok bakteri
yang mencakup beberapa yang
merupakan sel tunggal dan
beberapa yang merupakan
rantai sel. Anda mungkin pernah
melihatnya sebagai "lendir
hijau" di akuarium atau di kolam.

Cyanobakteria dapat
melakukan "fotosintesis
modern", yaitu jenis yang
membuat oksigen dari air.
Semua tumbuhan melakukan
fotosintesis semacam ini dan
mewarisi kemampuan dari
cyanobacteria.
Cyanobacteria adalah organisme pertama di Bumi
yang melakukan fotosintesis modern dan mereka
membuat oksigen pertama di atmosfer bumi.
 Bakteriseringkali
difitnah sebagai
penyebab penyakit
pada manusia dan
hewan. Namun,
bakteri tertentu,
aktinomiset,
menghasilkan
antibiotik seperti
streptomisin dan
nokardisin.
 Bakteri lain hidup secara simbiosis di dalam
usus hewan atau di tempat lain di tubuh
mereka.

 Misalnya, bakteri di usus yang menghasilkan

vitamin K yang penting untuk pembentukan
gumpalan darah.
 Bakteri lain masih
hidup di akar
tanaman tertentu,
mengubah nitrogen
menjadi bentuk
yang dapat
digunakan.
 Bakteri menghasilkan
bau di dalam yogurt
dan asam di roti
penghuni pertama.

 Saproba membantu
memecah bahan
organik mati.

 Bakteri membentuk
dasar jaring makanan
di banyak lingkungan.
Streptococcus thermophilus in yogurt
 Bakteri termasuk dalam Sel Prokariotik. Sel
sederhana, terdiri atas membran sel, sitoplasma,
materi genetik, dan organel sel sederhana.
 Bergey’s Manual adalah buku yang
menjelaskan sistem klasifikasi dan banyak
digunakan.
 Klasifikasi berdasarkan Bergey’s Manual
mendefinisikan bahwa terdapat 35 kelompok
bakteri, 30 kelompok eubacteria dan 5
kelompok archae-bakteri (diterbitkan pada
tahun 84-89).
 Bakteri sangat penting
karena kecepatan
pertumbuhan,
reproduksi, dan
mutasinya yang cepat,
serta kemampuannya
untuk hidup dalam
kondisi yang merugikan.
Fosil tertua yang
diketahui, berusia hampir
3,5 miliar tahun, adalah
fosil organisme mirip
bakteri.
 Bakteri dapat berupa autotrof atau hetertrof.

 Mereka yang diklasifikasikan sebagai autotrof

adalah fotosintesis, memperoleh energi dari
sinar matahari atau kemosintetik, memecah
zat anorganik untuk energi .
 Bakteri yang
diklasifikasikan sebagai
heterotrof memperoleh
energi dari penguraian
senyawa organik
kompleks di lingkungan.
Ini termasuk saprob,
bakteri yang memakan
bahan yang membusuk
dan limbah organik,
serta yang hidup sebagai
parasit, menyerap nutrisi
dari organisme hidup.
 Bergantung pada
spesiesnya, bakteri bisa
aerobik yang berarti
mereka membutuhkan
oksigen untuk hidup
or

 anaerobik yang artinya

oksigen mematikan bagi
mereka.
Bercak hijau adalah bakteri belerang
hijau. Tambalan karat merupakan koloni
bakteri ungu non belerang. Bercak
merah adalah bakteri belerang ungu.
Dua tipe:
◼ Prokaryotik
◼ Eukaryotik
bacterial flagellum membran plasma pilus

Flagela bakteria

Sebagian besar sel prokariotik

memiliki dinding sel di luar
membran plasma, dan banyak
yang memilikinya kapsul tebal
seperti jeli di sekelilingnya dinding.
sitoplasma, dengan DNA ada di
ribosoma daerah
nukleoid
 Komponen utama
membran sel
 Memberi membran
sifat fluida
 Dua layer/lapisan
fosfolipid
  FlagelaBakteria
digunakan untuk
motilitas/pergerakan

 Ituterbuat dari subunit protein yang

disebut flagelin. Secara umum struktur
flagela dijelaskan pada gambar di atas
 Berdasarkan posisi flagela pada bakteri
terdapat 4 jenis flagela.
 Filamen Aksial
Sering ditemukan di Spirochetes; flagela ditutupi oleh
dinding sel.
Fungsi: Pergerakan sel (motilitas).
 Pili dan Fimbriae
Pili mirip dengan flagela tetapi lebih pendek dan lebih
lembut, serta tidak berfungsi dalam motilitas tetapi
digunakan untuk :
1. Konjugasi
2. Menempel di Permukaan
Fimbria dan pili sama. Keduanya berfungsi untuk
menempelkan sel ke permukaan atau ke sel lain yang
sama untuk membentuk koloni
 Pewarnaan Gram, yang membagi bakteri yang
paling signifikan secara klinis menjadi dua
kelompok utama, adalah langkah pertama
dalam identifikasi bakteri.

 Bakteriyang berwarna ungu adalah Gram +

dinding selnya memiliki asam petidoglikan dan
teichoic yang kental.

 Bakteriyang diwarnai merah muda adalah

Gram - dinding selnya memiliki peptidoglikan
tipis dan lipopolisakarida tanpa asam teikoat.
Pada bakteri Gram-positif, warna kristal ungu adalah
terperangkap oleh lapisan peptidoglikan yang membentuk bagian
luar lapisan sel. Pada bakteri Gram-negatif, bagian luar
membran lipopolisakarida mencegah warna mencapai lapisan
peptidoglikan. Kemudian membran luar diserap oleh larutan
aseton, dan safranin merah muda sebagai counterstain terjebak
oleh lapisan peptidoglikan.
Pewarnaan Gram terdiri atas empat
langkah:

 1. kristal violet, pewarna primer : diikuti

 2. iodin, yang bertindak sebagai mordan

dengan membentuk kompleks kristal
violet-iodine, lalu

 3. alkohol, yang menghilangkan warna,

diikuti oleh

4. safranin, pewarna sekunder.
APAKAH PEWARNAAN GRAM POSITIF ATAU NEGATIF? IDENTIFIKASI
BAKTERINYA.
Apakah pewarnaan gram positif atau negatif?
Identifikasi bakterinya.
Karakteristik Sel Gram + Gram -
Lapisan tebal, Lapisan tipis,
Peptidoglikan bersilangan (satu persilangan
dengan lainnya) terbatas
Komponen Lipoprotein,
Asam Teichoic;
Auxiliary membran luar dan
protein
lipo-polisakharida
Resistensi Tekanan
Lebih dari (25 Atm) Kurang dari (5 atm)
Osmotik
Sensitivitas pada Umumnya non-
Umumnya sensitif
penisilin sensitif
Respon pada Dinding sel
Dinding terurai
lisozim resisten (tahan)
Ukuran Bakteria:
- Panjang 2 mm
- Diameter 0.5 mm
Bentuk bakteria:
1. Bacilli
2. Cocco
3. Spiral
4. Square (kotak)
5. Star (bintang)
Bentuk Sel Bakteri
Morfologi Bentuk Bakteria
 Spirochete:
Borrelia burgdorferi
 Sebagaimana organisme hidup lainnya
yang hidup, bakteri berkembang biak
secara aseksual dengan membelah sel
menjadi dua (pembelahan biner)
 Beberapa membentuk filamen panjang, lalu
melepaskan sebagian dari filamen tersebut
 Yang lain membentuk spora di ujung
(Streptomycetes) dan sedikit membentuk
tunas (bertunas) dan menghasilkan sel
kecil di permukaan.
ENDOSPORA
 Bentuk bakteri yang tidak tumbuh dan
berkembang biak, persis seperti dormansi
(tidak menunjukkan aktivitas metabolisme). Ini
biasanya terbentuk ketika kondisi lingkungan
tidak mendukung pertumbuhan sel.
 Dalam bentuk endospora, bakteri dapat
bertahan dalam kondisi ekstrim (panas,
radiasi, kimiawi dll.).
 Endospora akan tumbuh/berkembang jika
kondisi lingkungan sesuai dengan
pertumbuhan sel.
 Bakteri dapat
bertahan hidup
dalam kondisi yang
tidak
menguntungkan
dengan
menghasilkan
endospora.