Manual Book GeNose PDF
Manual Book GeNose PDF
Electronic Nose
(GeNose C19-S)
Sebagai Alat Skrining Cepat Infeksi Sars-Cov2
Melalui Hembusan Nafas Pasien Covid-19
1. Pendahuluan ................................................................................................................................... 1
Latar Belakang ......................................................................................................................... 1
Informasi Produk ..................................................................................................................... 2
Tujuan Pembuatan .................................................................................................................. 2
2. Spesifikasi GeNose .......................................................................................................................... 3
Spesifikasi ................................................................................................................................ 3
Aksesoris dan Material ............................................................................................................ 3
2.2.1 Daftar aksesoris .......................................................................................................... 3
2.2.2 Daftar material yang di indikasi oleh pabrik ............................................................... 5
Foto Dan Keterangan Produk .................................................................................................. 5
2.3.1 Tampak Depan ............................................................................................................ 5
2.3.2 Tampak Kanan ............................................................................................................ 6
2.3.3 Tampak Belakang ........................................................................................................ 6
2.3.4 Tampak Atas ............................................................................................................... 7
Block Diagram .......................................................................................................................... 7
Skematik Pengkabelan............................................................................................................. 8
Tampilan Layar Info ................................................................................................................. 8
Moda Ventilasi ....................................................................................................................... 12
Peringatan Produk ................................................................................................................. 12
Tata Cara Penggantian HEPA filter ........................................................................................ 12
3. Panduan Instalasi (OS Windows) .................................................................................................. 14
Panduan Instalasi GeNose Ai Dashboard .............................................................................. 14
Panduan Instalasi Driver GeNose C19 secara manual ........................................................... 17
4. GeNose Ai Dashboard ................................................................................................................... 19
Spesifikasi Umum .................................................................................................................. 21
Sistem Minimum Laptop/PC .................................................................................................. 21
Penjelasan Software GeNose AI Dashboard .......................................................................... 21
4.3.1 Menu......................................................................................................................... 22
4.3.2 Menu Tombol (Ai-Unit Control) ................................................................................ 27
4.3.3 Informasi Gambar (Icon) ........................................................................................... 27
4.3.4 Informasi (Status display) ......................................................................................... 28
4.3.5 Pesan (Message Box) ................................................................................................ 30
Panduan update GeNose Ai Dashboard ................................................................................ 32
5. Petunjuk Penggunaan GeNose C19 .............................................................................................. 33
Persiapan ............................................................................................................................... 33
Koneksi sampel ...................................................................................................................... 34
Panduan Analisis Sampel Nafas ............................................................................................. 34
Interpretasi dan tindak lanjut ................................................................................................ 38
Pemeliharaan......................................................................................................................... 39
6. Dekontaminasi Cleaning, Desinfeksi dan Sterilisasi ...................................................................... 40
Cleaning ................................................................................................................................. 40
Desinfeksi............................................................................................................................... 40
Sterilisasi ................................................................................................................................ 41
7. Troubleshooting Checklist............................................................................................................. 42
1
1. Pendahuluan
Pemanfaatan kemajuan teknologi sensor yang dikombinasikan dengan sistem piranti lunak
kecerdasan buatan atau artificial intelligence (AI) menjadikan harapan akan hadirnya alat
deteksi cepat dan akurat untuk berbagai bidang aplikasi. Alat deteksi yang dimaksud adalah
hidung elektronik atau electronic nose. Prinsip kerja dari electronic nose adalah dengan
meniru cara kerja indera penciuman manusia. Oleh sebab itu, sifat dari alat ini antara lain
adalah (a) harus dilatih mengenali sampel yang valid sebelum digunakan untuk aplikasi
deteksi, (b) hasil deteksinya bersifat kualitatif dan (c) cepat. Untuk dapat mengingat, alat ini
dilengkapi dengan AI yang sesuai dan telah dioptimasi.
Secara umum, aplikasi electronic nose sangat luas, seperti di bidang Pertanian (yaitu,
perlindungan tanaman, penyimpanan daging, makanan laut dan produk ikan, stres hewan,
dan otentikasi herbal), bidang Makanan dan Kosmetik (yaitu, otentikasi halal, kontaminasi
makanan, karakteristik bau, kualitas penilaian kontrol, dan aditif wewangian), dan bidang
penyalahgunaan Narkoba (yaitu, tes cepat untuk ganja, tes cepat untuk prekursor obat, dan
tes obat urin). Selain itu, electronic nose dapat diaplikasikan dalam bidang kesehatan, seperti
deteksi TBC melalui nafas, deteksi pneumonia, terutama dalam bidang diagnostik cepat suatu
penyakit. Dalam bidang medis, senyawa mudah menguap atau volatile organic compound
(VOC) yang diemisikan melalui nafas pasien dan dalam berbagai kondisi terbukti dapat
digunakan sebagai indikasi suatu penyakit tertentu.
Volatile organic compound (VOC) yang diemisikan melalui nafas pasien telah diteliti sebagai
marker biologis (biomarker) untuk diagnosis dari penyakit kanker paru dan penyakit inflamasi
saluran nafas lainnya. Hal ini dikaitkan dengan proses/reaksi biokimia yang menghasilkan
suatu pola/ breath pattern di level molekuler yang berbeda antara pasien dengan penyakit
paru/penyakit pernafasan dengan orang sehat. Penelitian oleh Chen et al pada tahun 2020,
menunjukkan adanya perubahan karakteristik protein serta metabolit dan senyawa kimia dari
pasien yang terinfeksi SARS-CoV 2 dibandingkan orang sehat. Hal ini dapat dianalisis dari
VOC yang diemisikan melalui nafas pasien (breath-borne VOC biomarkers). Oleh karena itu,
pada sistem ini terdapat kombinasi antara electronic nose yang bertugas untuk mendeteksi
senyawa VOC pada rentang yang luas berupa data-data respon sensor dengan perangkat
lunak AI yang bertugas membaca data-data respon sensor ke dalam pola-pola tertentu. Pada
2
sistem GeNose C19-S ini, perangkat lunak AI inilah yang berfungsi sebagai pengklasifikasi
pola-pola dari data respon sensor ke dalam label diagnostik berdasarkan data medis pasien
yang dicurigai terinfeksi SARS-CoV 2 dan yang negatif SARs-CoV 2.
Agar menghasilkan diagnosis (skrining) yang tepat maka perangkat lunak AI ini dilatih
mengenali pola sampel nafas pasien berdasar label tertentu yang diberikan oleh tenaga
medis. Untuk itu, perangkat lunak AI versi pertama ini telah dilatih untuk mengenali pola
respon nafas pasien SARS-COV 2 dan pasien sehat dari data respon sensor electronic nose
sehingga bisa digunakan untuk melakukan diagnosis apakah seseorang terpapar SARS-COV
2 atau tidak.
Khususnya, GeNose versi C19-S atau GeNose C19-S merupakan alat skrining infeksi Sars-
Cov2 melalui hembusan nafas pasien Covid-19. GeNose C19-S merupakan perangkat
GeNose yang dikombinasikan dengan software Ai yang terlatih untuk membedakan sampel
nafas positif covid-19 atau negatif covid-19 dari data keluaran GeNose. Keunggulan GeNose
C19-S adalah pengujian yang akurat, cepat, persiapan sederhana, analisis mudah, dan
pengoperasian mudah.
2. Spesifikasi GeNose
2.1 Spesifikasi
Dimensi unit GeNose : 250 mm × 145 mm × 110 mm (p × l × t)
Dimensi unit HEPA filter : 85 mm × 80 mm × 110 mm (p × l × t)
Berat total : 5.00 kg ± 0.05 kg
Catu daya : 12 VDC, 5 A (maksimum)
Suhu operasi (ruang sensor) : (30 – 60) °C ± 1 C
Kelembaban operasi (ruang sensor) : Maksimum 80 %RH ± 5 %RH
Jumlah sensor : 10 sensor gas dan 1 sensor suhu/kelembaban
Laju aliran pompa : 0.95 LPM ± 0.05 LPM
Koneksi antarmuka : Serial RS-232 & USB 2.0
Antar muka : Layar sentuh 4,3 inci (panel info) & Perangkat lunak
GeNose Ai Dashboard
Unit GeNose
4
Unit HEPA
Adaptor
Kit sampling
Keterangan:
1. Layar sentuh 4,3 inci (panel info, unit GeNose)
6
2. Unit HEPA
3. Konektor 4 mm REF.
4. Konektor 4 mm SAMPLE
Keterangan:
3. Konektor 4 mm REF.
4. Konektor 4 mm SAMPLE
Keterangan:
1. Tombol power
2. Slot MicroSD
3. Konektor USB 2.0
4. Konektor Serial RS-232
5. Konektor catu daya 12V DC, 5A (maksimum)
6. Konektor 4 mm exhaust
7
Tampilan utama layar info berisi menu: Information, How to use, dan About
10
Lubang ventilasi berada di bagian bawah GeNose dan dilengkapi kipas DC 12V (40 × 40) mm
sebagai pendingin.
Gunakan stop kontak listrik PLN yang baik dan pastikan catu daya terpasang dengan baik di
konektor yang disediakan. Pastikan tombol catu daya dalam keadaan mati saat memasang
catu daya ke perangkat GeNose.
Jangan gunakan cairan pembersih yang mengandung alkohol selama proses pengambilan
data karena akan mempengaruhi hasil pembacaan sensor. Untuk menghindari hal tersebut,
gunakan selang disposable. Bersihkan GeNose saat sedang tidak digunakan. Hindarkan
perangkat GeNose dari percikan air atau di ruangan yang mengandung kelembaban sangat
tinggi (lebih dari 80 %RH). Pastikan untuk satu komputer (unit Ai) terhubung hanya satu unit
GeNose.
Keterangan:
3. Untuk Fresh install Langkah pertama adalah menginstal Framework[1], hingga muncul
window dan ikuti langkah berikut ini:
15
6. Langkah selanjutnya adalah instalasi driver, tekan enter untuk melanjutkan proses.
Tekan Extract untuk menjalankan instalasi driver.
16
7. Setelah itu restart GeNoseAiInstaller (TUTUP dan BUKA), kemudian Install GeNose
Ai [2].
Ekstrak masing-masing driver, kemudian lakukan installasi dengan cara menjalakan masing-
masing setup (.exe).
4. GeNose Ai Dashboard
GeNose C19 terdiri dari unit atau perangkat keras (hardware) GeNose yang dikombinasikan
dengan sistem kecerdasan buatan (artificial intelligence, Ai) yang terlatih membedakan hasil
respons keluaran sensor unit GeNose dari nafas orang sehat (negatif) dan nafas positif Covid-
19. Kederdasan buatan ini disimpan di dalam unit Ai yang disertakan. Hasil respons keluaran
sensor GeNose dari nafas membentuk pola khusus yang hanya bisa dibaca oleh program
kecerdasan buatan yang terlatih, yang dinamakan GeNose Ai Dashboard. Dari pola khusus
nafas tersebut, GeNose Ai Dashboard dapat memprediksi sampel nafas tersebut adalah
positif atau negatif Covid-19. Selain itu, unit Ai memiliki perangkat lunak (software) GeNose
Ai Dashboard. Software ini digunakan sebagai interface untuk menghubungkan unit GeNose
dengan unit Ai. GeNose Ai Dashboard mengkombinasikan sistem datalogger unit GeNose
dan sistem GeNose Ai Dashboard. Kombinasi ini memungkinan untuk memprediksi data yang
dikirim unit GeNose ke datalogger secara langsung.
Alur sistem skrining GeNose dapat ditunjukkan dalam gambar di bawah ini.
Pertama, sampel nafas akan dianalisis oleh unit GeNose. Unit GeNose memberi keluaran
berupa data respons masing-masing sensor terhadap sampel nafas yang dideteksi. Data (raw
data) disimpan oleh datalogger di dalam GeNose Ai Dashboard. Data respons tersebut
membentuk pola sensor khusus yang hanya bisa dibaca oleh GeNose Ai. Melalui sistem
kecerdasan buatan yang terlatih, GeNose Ai Dashboard menganalisis pola tersebut dan
memprediksi pola respons sensor sampel nafas tersebut adalah dari nafas orang positif atau
negatif Covid-19.
20
Teknologi
Integrasi : Hardware GeNose
Format masukan : Data keluaran sensor GeNose
Format keluaran : Laporan prediksi positif atau negatif Covid-19
Deployment : Khusus hardware GeNose
Trigger : Tombol Analyze di layar GeNose Ai Dashboard
Waktu proses : 3 menit (maksimum, 1 menit analisis, 2 menit proses
pembersihan ruang sensor)
4.3.1 Menu
Label Sub Label Keterangan
File Open debug Berfungsi untuk membuka berkas debug selama menjalankan
aplikasi GeNose Ai Dashboard
Save data Berfungsi untuk menyimpan data dalam format *.json atau
*.csv
Save figure Berfungsi untuk menyimpan chart dalam format *.png, *.pdf,
atau *.eps
Save history Berfungsi untuk menyimpan tabel history dalam format *.xlsx
Exit Berfungsi untuk menutup aplikasi
Edit Mode Berfungsi untuk memilih mode:
• Mode Default
Mode ini digunakan untuk umum dengan hasil prediksi
yaitu Positif, Positif with high probability dan
Negatif
• Mode Public
Mode ini digunakan untuk kebutuhan publik seperti
transportasi dengan hasil prediksi yaitu Positif dan
Negatif
Backup Report Berfungsi untuk membackup template report
Template
23
NB:
Jangan mengubah kode berupa {{ huruf }}
Configuration Berfungsi untuk mengatur aplikasi, terdapat
• Search
Digunakan untuk mencari PORT unit GeNose yang aktif
terhubung dengan unit Ai. PORT yang aktif akan
ditampilkan di menu Device port.
• History (days)
Digunakan untuk mengatur lama waktu penyimpanan,
data history yang disimpan melebihi waktu akan dihapus
secara otomatis.
• Waiting time (second)
Digunakan untuk mengatur lama waktu proses
pembersihan ruang sensor setelah proses sampling
sampel nafas.
• HIGH DPI Display
Digunakan untuk mengaktifkan mode High DPI Display.
Non-aktifkan mode ini jika layout tidak sesuai (font terlalu
besar).
• Run as administrator
Digunakan untuk menjalankan software sebagai
administrator.
24
Tekan scan folder dan cari folder tempat data sampel nafas
disimpan untuk mulai proses prediksi semua data dalam folder
tersebut. Tekan sekali lagi untuk menyimpan tabel prediksi
dalam file Excel (*.xlsx).
Stop cleaning Tekan YES untuk mulai menghentikan Peringatan yang muncul pada
process proses cleaning. saat menghentikan proses
pembersihan HEPA baru, belum
selesai.
Closing event Tekan YES untuk menutup GeNose Ai Peringatan sebelum menutup
Dashboard aplikasi GeNose Ai Dashboard
Warning Invalid atau LOW data, mohon dilakukan Peringatan yang muncul karena
pengulanan prosedur pengambilan data diprediksi kategori tipe data
data! INVALID atau respons LOW.
Connection Unit GeNose tidak dapat terhubung. PORT unit GeNose tidak dapat
Periksa kembali kabel penghubung terhubung dengan GeNose Ai
(USB)! Dashboard.
Penyebab kemungkinan
sambungan kabel USB terputus
atau nama PORT tidak terbaca.
3. Pastikan koneksi internet aktif, secara otomatis update file akan diunduh. Ekstrak file
dengan program zip, jalankan GeNose Ai Installer dan kemudian klik GeNose Ai
update.
33
PERHATIAN
Pemakaian GeNose C19 untuk mendeteksi COVID-19 dapat dikerjakan dengan baik
hanya apabila persyaratan dan kondisi lingkungan, pasien dan pemrosesan
berlangsung sesuai dengan kondisi yang dipersyaratkan.
5.1 Persiapan
1. PASTIKAN GeNose C19 berada di ruang terbuka atau ruang dengan sistem sirkulasi
udara adekuat di mana terdapat aliran udara konstan mengalir.
2. PASTIKAN GeNose C19 telah dipanaskan dengan baik sebelum dipergunakan, dengan
cara menyalakan mesin dan mengatur “Flushing”
jam (Untuk mesin baru yang memiliki jam operasi kurang dari 500 jam, maka
disarankan untuk menyalakan mesin selama lebih dari 1 jam).
3. DISARANKAN untuk menganalisis kondisi saturasi ruangan sebelum memulai proses
pemeriksaan, seperti dalam sub bab 4.3 atau
4. CARA: “Analyze” .
didapatkan sinyal lebih tinggi dari 200 mV (View – shift signal activated), maka kondisi
“ v ” ( , ,
debu) dan disarankan memindahkan GeNose C19 ke tempat lain.
5. PASTIKAN katup ungu HEPA filter yang dipasang pada selang sampling dalam kondisi
tertutup
6. Apabila mesin harus dipindahkan: Matikan power terlebih dahulu lalu pindahkan ke
tempat lain yang sesuai, dan silakan dinyalakan kembali dalam kondisi telah terkoneksi
dengan komputer jinjing (laptop). Lakukan flushing sesaat kembali (+ 5 menit) sebelum
memulai menggunakan mesin.
7. PASTIKAN mesin GeNose C19 jauh dari sumber bau yang kuat dan mencolok, seperti
minyak kayu putih, parfum, hand sanitizer, dll.
34
• Jika GeNose baru saja dihidupkan, klik No. Pada Ai dashboard akan muncul
proses Warming Up dan count dari 0 – 100%. Nilai presentase tersebut
merepresentasikan waktu dari 0 – 30 menit.
• Jika GeNose sudah dihidupkan selama 30 menit, klik Yes.
f. Jika tombol Connect sudah berwarna biru dan keterangan GeNose telah
terkoneksi, maka GeNose C19 siap digunakan.
2. Terdapat dua mode dalam pengoperasian GeNose C19 yaitu:
• Mode Default
Mode ini digunakan untuk umum dengan hasil prediksi yaitu Positif, Positif with high
probability dan Negatif
• Mode Public
Mode ini digunakan untuk kebutuhan publik seperti transportasi dengan hasil prediksi
yaitu Positif dan Negatif
3. Periksa respons sensor terhadap lingkungan dengan cara menekan tombol Flushing.
Pastikan nilai respon sensor di bawah area kuning. Apabila nilai beberapa sensor ada di
dalam area kuning atau merah maka ikuti panduan TROUBLESHOOTING CHECKLIST.
36
4. Siapkan kit sampling dan ambil sampel nafas melalui kantong sampel. Langkah
pengambilan nafas sebagai berikut:
a. Ambil nafas melalui hidung kemudian buang nafas melalui mulut (dengan memakai
masker). Ulangi langkah ini sebanyak 2 kali.
b. Setelah itu, ambil nafas melalui hidung, kemudian tiup kantong sampel sampai
penuh (Valve OPEN). Setelah penuh tekan kunci kantong sampel agar nafas tidak
keluar (Valve CLOSE). Posisi valve OPEN dan valve CLOSE ditunjukkan dalam
Gambar A dan Gambar B.
5. Pasang kantong sampel ke unit HEPA, seperti gambar berikut ini:
Pastikan posisi kantong nafas sejajar dengan unit GeNose (horisontal)
37
Sejajar (horisontal)
Prosedur pemasangan kit sampel dan unit HEPA adalah sebagai berikut:
a. Pastikan valve yang berisi sampel nafas dalam posisi terkunci. Posisi valve OPEN
dan valve CLOSE ditunjukkan seperti Gambar A dan Gambar B
b. Pasang kit sampel di unit GeNose seperti dalam Gambar D. Pastikan tidak terlalu
dalam, batas maksimum ada di bagian kit sampel seperti yang ditunjukkan dalam
Gambar C.
6. Tekan tombol Analyze untuk melakukan perekaman dan prediksi data sampel nafas.
Selanjutnya akan diminta untuk mengisi form input identitas seperti ini:
38
NB: Jika save folder diaktifkan (*Enable), maka secara otomatis, data akan disimpan
dalam folder yang dipilih melalui tombol Browse.
7. Buka kembali kunci kantong sampel yang sudah terpasang pada HEPA dan klik RUN.
Tunggu sampai proses analisis selesai.
8. Kunci kantong sampel dan buang kantong sampel ke tempat pembuangan medis.
9. Sebaiknya, pengambilan nafas selanjutnya dilaksanakan saat waktu tunggu (waiting time)
selesai.
6. Apabila pasien dinyatakan POSITIVE WITH HIGH PROBABILITY pada satu kali kantung
nafas, maka disarankan untuk melakukan pemeriksaan PCR konfirmasi dengan timing
sebagaimana disebutkan di poin 5 di atas.
7. DISARANKAN untuk melakukan update dari AI secara berkala melalui unduh informasi
di laman daring nantinya, agar diperoleh peningkatan performa dari AI selanjutnya.
5.5 Pemeliharaan
1. Pada pemeliharaan awal penggunaan GeNose C19, mesin perlu dikalibrasi dan dicek
ulang setelah testing 5000 sampel nafas.
2. Pengecekan dan pemeliharaan berikutnya dilakukan setelah pemeriksaan 100.000
sampel nafas atau apabila muncul malfungsi atau gangguan.
3. Dekontaminasi mesin dapat dilakukan seperti yang akan dijelaskan dalam Bab
selanjutnya.
40
6.1 Cleaning
Permukaan luar GeNose C19 butuh dibersihkan setiap bulan terutama dari debu. Jangan
menggunakan cairan pembersih yang memiliki aroma kuat, sebaiknya gunakan air suling.
1. Saat membersihkan GeNose C19, pastikan perangkat dalam keadaan mati dan catu daya
dilepas.
2. Tunggu selama 10 detik untuk mencegah kemungkinan terjadi elektro-statik.
3. Gunakan lap lembut yang dibasahi sedikit air.
4. Lap permukaan luar GeNose C19 sampai bersih.
5. Lakukan sesering mungkin jika dibutuhkan.
Pembersihan ruang sensor di dalam mesin GeNose, secara otomatis dilakukan pada saat
proses Flushing dan Waiting time (setelah proses analisis sampel nafas). Selama proses ini,
udara dari referensi akan membersihkan ruang sensor.
6.2 Desinfeksi
Dalam kondisi tertentu, untuk mencegah pantogen di permukaan luar GeNose C19, gunakan
cairan desinfektan tanpa pewangi. Jangan menyemprot langsung cairan desinfektan, tetapi
gunakan lap seperti dalam metode pembersihan (desinfektan tipe swab/oles, seperti alkohol
96%). Pastikan tidak perangkat GeNose C19 dalam keadaan mati dan catu daya dilepas.
Menggunakan cairan desinfektan dalam keadaan GeNose C19 menyala dapat
mempengaruhi sensor di dalam GeNose C19. Gunakan cairan desinfektan yang mudah
menguap. Apabila perlu, keringkan di bawah sinar matahari dan tidak mengoperasikan secara
langsung setelah dilakukan desinfeksi.
41
6.3 Sterilisasi
Prosedur sterilisasi sama dengan prosedur desinfeksi. Agar perangkat dalam keadaan steril,
patuhi protokol kesehatan. Disposable HEPA filter wajib digunakan pada saat analisis sampel
nafas.
42
7. Troubleshooting Checklist
Pasien 1. Pasien tidak dapat 1. Edukasi dan latih pasien untuk dapat
menghembuskan nafas menghembuskan nafas pelan-pelan dan
kuat bertahap
2. Tujuannya adalah untuk membuat kantung
penuh dan tidak harus dipenuhi dalam
sekali tarikan dan hembusan nafas
3. Latih pasien untuk dapat berlatih menarik
dan menghembuskan nafas dalam 1−2x
sebelumnya dengan tetap
MENGGUNAKAN MASKER DI WAJAH
4. Peniupan bertahap dilakukan dengan cara:
MENARIK NAFAS LEWAT HIDUNG dan
MENIUPKAN LEWAT MULUT.