2022
Program Magister (S2) – Departemen Biologi ITS
STRUKTUR SEL
Oleh : Refer Iqbal Tawakkal (6005212007)
ORGANISME DAN SEL
SIZES OF LIVING THINGS
UKURAN SEL
Sitoplasma
a. Semifluid solution
- Dibatasi oleh membran plasma
- Mengandung air, molekul anorganik dan organik, dan enzim.
b. Nukleoid adalah wilayah yang berisi molekul DNA tunggal melingkar.
c. Plasmid adalah cincin aksesori (ekstrachromosomal) kecil dari DNA
Pelengkap
a. Flagela – Memberikan motilitas
b. Fimbriae – serat kecil seperti bulu yang tumbuh dari permukaan sel
c. Sex pili – struktur tubular kaku yang digunakan untuk meneruskan DNA dari sel
ke sel
SEL EUKARIOTIK
Domain Eukarya meliputi:
a. Protista
b. Fungi
c.Tumbuhan
d. Hewan
Sel mengandung:
a. Nukleus terikat membran yang menampung DNA
b. Organel khusus
c. Membran plasma
d. Jauh lebih besar dari sel prokariotik
e. Beberapa sel (misalnya, sel tumbuhan) memiliki dinding sel
HIPOTESIS ASAL SEL EUKARIOTIK
SEL EUKARIOTIK: ORGANEL
Sel eukariotik terkotak-kotak
- Mengandung struktur kecil yang disebut organel
* Melakukan fungsi tertentu
* Mengisolasi reaksi dari orang lain
Dua kelas organel:
- Sistem endomembran:
* Organel yang berkomunikasi satu sama lain
^ Melalui saluran membran
^ Melalui vesikel kecil
- Organel terkait energi
* Mitokondria & kloroplas
* Pada dasarnya mandiri & mandiri
MEMBRAN PLASMA
ANATOMI SEL HEWAN
ANATOMI SEL TUMBUHAN
NUCLEUS
Pusat komando sel, biasanya dekat pusat
Dipisahkan dari sitoplasma oleh selubung nukleus
- Terdiri dari lapisan ganda membran
- Pori-pori inti memungkinkan pertukaran antara nukleoplasma &
sitoplasma
Mengandung kromatin dalam nukleoplasma setengah cair
- Kromatin mengandung DNA gen, dan protein
- Memadat untuk membentuk kromosom
* Kromosom terbentuk selama pembelahan sel
Nukleolus gelap terdiri dari rRNA
- Menghasilkan subunit ribosom
ANATOMI NUKLEUS
RIBOSOMES
Merupakan tempat sintesis protein di dalam sel
Terdiri dari rRNA
- Terdiri dari subunit besar dan subunit kecil
- Subunit yang dibuat dalam nukleolus
Mungkin terletak:
- Pada retikulum endoplasma (sehingga membuatnya “kasar”), atau
- Bebas di sitoplasma, baik sendiri-sendiri maupun berkelompok,
disebut poliribosom
Nukleus, Ribosom, dan Retikulum Endoplasma (RE)
KHEYRODIN, H., JAMI, R AND REHMAN F.U.R . 2022 . CELLULAR STRUCTURE AND MOLECULAR FUNCTIONS OF
PLANTS,ANIMALS, BACTERIA AND VIRUSES. CELL. MOL. BIOMED. 2(1) : 33-41.
ABSTRAK
Dinding sel tanaman dapat memberikan kerangka struktural untuk mendukung pertumbuhan tanaman dan pertahanan
sel terhadap berbagai patogen virus dan bakteri. Dinding sel dapat mempertahankan fleksibilitas, juga ketika mengalami
rangsangan perkembangan, biotik, abiotik, dan tekanan.
Gen yang mengkode enzim mampu membuat atau menghidrolisis zat dari dinding sel tanaman yang menunjukkan
ekspresi diferensial ketika mengalami tekanan yang berbeda seperti menunjukkan mereka dapat memfasilitasi toleransi
stres seperti logam berat, akumulasi debu, dan media asin melalui perubahan komposisi dinding sel.
Bakteri adalah organisme bersel tunggal kecil yang mendapatkan nutrisi yang mereka butuhkan dari lingkungan mereka.
Bakteri dapat membantu sistem pencernaan dan mencegah bakteri berbahaya masuk ke dalam tubuh manusia serta
beberapa bakteri lain juga digunakan untuk memproduksi obat dan vaksin.
Dinding sel sebagai komponen tak hidup dapat menutupi lapisan terluar sel. Menurut jenis organisme, dinding sel
memiliki komposisi yang berbeda. Dinding sel memisahkan isi dalam sel dari lingkungan luar. Selain itu, dinding sel
memberikan bentuk, dukungan, dan perlindungan pada sel dan organelnya. Namun, komponen seluler ini ada pada
tumbuhan eukariotik, jamur, dan beberapa organisme prokariotik.
Beberapa senyawa yang ditemukan dalam sel tumbuhan tidak ada dalam sel hewan yang dapat dilihat dari urutan basa
DNA. Selain itu, DNA tumbuhan seringkali lebih besar dari DNA hewan.
PERBEDAAN SEL TUMBUHAN DAN SEL HEWAN
Sifat Mekanik Lapisan Dinding
Semua dinding sel mengandung dua lapisan yaitu lamela tengah dan dinding sel primer. Tetapi
sebagian banyak sel menghasilkan lapisan tambahan, yang disebut dinding sekunder.
Lamela tengah berfungsi sebagai lapisan penyemenan antara dinding primer sel yang berdekatan.
Dinding primer adalah lapisan yang mengandung selulosa yang diletakkan oleh sel-sel yang
membelah dan tumbuh.
Sebagai kemampuan utama selama pertumbuhan, dinding primer lebih tipis dan kurang kaku
dibandingkan dengan sel yang telah berhenti tumbuh. Sebuah sel tumbuhan yang tumbuh penuh
dapat mempertahankan dinding sel utamanya atau mungkin menyimpan lapisan tambahan yang
kaku dari komposisi yang berbeda; ini adalah dinding sekunder.
Dinding sel sekunder bertanggung jawab untuk sebagian besar perlindungan mekanik tanaman
serta sifat mekanik dalam kayu. Berbeda dengan kekakuan permanen dan daya dukung beban dari
dinding sekunder yang tebal, dinding primer yang tipis mampu melayani peran struktural dan
suportif hanya ketika vakuola di dalam sel diisi dengan air sampai pada titik di mana mereka
memberikan tekanan turgor terhadap dinding sel.
KOMPOSISI KIMIA DINDING
Membran sel adalah penutup luar sel yang melindungi organ dalam. Membran ini juga
dikenal sebagai membran plasma dan memiliki sejumlah fungsi vital.
Membran sel terdapat pada sel tumbuhan, hewan, jamur, protozoa, serta organisme
eukariotik dan prokariotik hanya terdapat pada bakteri . Sel eukariotik termasuk
dalam struktur utama, yang meliputi bagian-bagian seperti DNA, ribosom, vesikel
(kantung kecil), retikulum endoplasma (kasar dan lunak), aparatus Golgi, sitoskeleton,
mitokondria, vakuola, sentriol, lisosom, sitoplasma, membran plasma dan dinding sel.
Sel tumbuhan memiliki vakuola besar dan dinding sel terbatas, tetapi sel hewan tidak
memiliki dinding sel dan beberapa mungkin memiliki vakuola yang sangat kecil. Oleh
karena itu, pada sel hewan, membran sel merupakan penutup luar.
VAKUOLA
Vakuola adalah organ dalam sel yang bertanggung jawab untuk menyimpan
dan menahan berbagai larutan atau zat. Vakuola adalah larutan dan senyawa
di mana mereka dibuat, disimpan, atau dikeluarkan. Senyawa dalam vakuola
mencakup berbagai ion, gula, asam amino, dan asam organik.
Mitokondria
Mitokondria adalah organ yang bertanggung jawab untuk respirasi sel
dan organ transfer energi yang menghasilkan energi kimia dalam
makanan melalui fosforilasi oksidatif dalam bentuk ikatan energi tinggi
ATP fosfat (adenosin). Organel ini terdapat di semua sel aerob kecuali
pada bakteri yang enzim pernapasannya terletak di membran sitoplasma.
Ribosom
Ribosom berbentuk lebih atau kurang bulat, partikel padat dari elektron
yang diameter berkisar dari 40 sampai sekitar 300 angstrom. Jumlah
ribosom dalam sel mencapai sekitar lima ratus ribu. Jumlah ini sangat
bervariasi dalam sel yang berbeda serta dalam kondisi biologis dan
fisiologis yang berbeda dalam sel.
Retikulum Endoplasma (RE)
Retikulum endoplasma di dalam setiap sel adalah struktur membran
yang ada secara luas di seluruh sel. Organ ini bertindak sebagai situs
untuk modifikasi protein, produksi makromolekul dan lipid, dan
transportasi zat ke seluruh sel. Selain itu, retikulum endoplasma
merupakan tempat translasi dan pelipatan protein serta pembentukan
struktur protein fungsional.
Aparatus Golgi
Aparatus Golgi adalah organ pada organisme eukariotik yang
mengangkut molekul dari retikulum endoplasma ke tujuannya. Aparatus
Golgi terdiri dari satu set kantung datar yang bercabang dari retikulum
endoplasma.
Kloroplas
Kloroplas dengan dua membran memiliki stroma, stroma tilakoid,
tilakoid dan bagian granum. Membran kloroplas dengan klorofil a dan b
sebagai pigmen fotosintesis utama dapat menangkap energi dari sinar
matahari dan mengubahnya menjadi molekul adenosine energy-storage
triphosphate dinucleotide phosphate (ATP) dan nicotinamide adenine
(NADPH) dalam proses fotosintesis. Pigmen ini dapat memiliki respon
yang berbeda terhadap tekanan lingkungan seperti badai debu dan
salinitas, dan logam berat
Sel Bakteri
• Fungsi utama dinding sel adalah untuk memberikan struktur dan perlindungan bagi sel.
Dinding sel pada tumbuhan terutama terdiri dari selulosa dan mengandung tiga lapisan
di banyak tumbuhan. Ketiga lapisan tersebut adalah lamela tengah, dinding sel primer,
dan sel sekunder.
• Bakteri gram negatif, misalnya Staphylococcus aureus yang memiliki peptidoglikan
tebal pada dinding sel dan membran sitoplasma, sedangkan bakteri gram negatif seperti
E. coli memiliki membran dalam dan luar dengan peptidoglikan tipis sebagai dinding sel.
• Virus memiliki lapisan protein pelindung yang disebut struktur kapsid yang terdiri dari
kapsomer dan beberapa virus seperti virus influenza A dan coronavirus juga memiliki
selubung lipid yang berasal dari membran sel inang.
STUDY CASE 2
YOSHIMI, A., MIYAZAWA, K AND ABE, KEIETSU . 2016 . CELL WALL STRUCTURE AND BIOGENESIS IN
ASPERGILLUS SPECIES. BIOSCIENCE, BIOTECHNOLOGY,AND BIOCHEMISTRY. 80 (9) : 1700–1711
Abstrak
Spesies Aspergillus sp. adalah salah satu jamur berfilamen yang paling
penting dari sudut pandang industri, patogenesis, dan produksi
mikotoksin. Sel jamur terkena berbagai rangsangan lingkungan, termasuk
perubahan osmolalitas, suhu, dan pH, yang menciptakan tekanan terutama
pada dinding sel jamur. Selain itu, dinding sel jamur adalah interaksi
pertama dengan sel inang baik pada manusia atau tumbuhan.
DINDING SEL ASPERGILLUS