UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA

PROGRAM STUDI
BIOLOGI

RENCANA PEMBELAJARAN SEMESTER

NAMA MATA KODE MATA RUMPUN MATA KULIAH: BOBOT (SKS): SEMESTER: LEVEL TAKSONOMI TANGGAL PENYUSUNAN:
KULIAH: KULIAH: Wajib 2 3/4 BLOOM: 24-01-2022
Bioteknologi S1BIO16 - A=3, C=4, P=2
BIO404049/
S1BIO20 -
BIO414017
MATAKULIAH PRASYARAT: JENIS:
Biologi Sel dan Molekuler AMBIL/LULUS/TIDAK ADA
OTORISASI DOSEN KOORDINATOR MATA KULIAH. Ketua Program Studi:
PENGEMBANG RPS: Jumailatus Solihah, S.Si., M.Biotech. Najda Rifqiyati, M.Si.
Prodi Jumailatus Solihah,
S.Si., M.Biotech.;
Lela Susilawati,PhD
Anti Damayanti
Hamdani, S.Si.,
MMolBio.
CAPAIAN CAPAIAN 1. Menjunjung tinggi nilai kemanusiaan dalam menjalankan tugas berdasarkan agama,moral,dan etika (S; CP2/LO1)
PEMBELAJARAN PEMBELAJARAN 2. Menguasai konsep aplikasi biologi dan teknologi yang relevan dalam pengelolaan sumber daya hayati dan lingkungannya (P; CP12/LO4)
LULUSAN 3. Menguasai prinsip dasar aplikasi perangkat lunak, instrumen dasar, metode standar untuk analisis dan sintesis pada bidang biologi yang
umum dan spesifik (P; CP13/LO5).
4. Mampu menerapkan pemikiran logis, kritis, sistematis, dan inovatif dalam konteks pengembangan atau implementasi ilmu pengetahuan dan
teknologi yang memperhatikan dan menerapkan nilai humaniora yang sesuai dengan bidang keahliannya (KU; CP17/LO8)
5. Mampu menyajikan solusi dalam memecahkan masalah terkait biologi melalui penerapan pengetahuan, metode biologi dan teknologi yang
relevan secara monodisipliner (KK; CP26/LO10).
CAPAIAN 1. Mahasiswa mampu menjelaskan definisi dan ruang lingkup bioteknologi serta aplikasinya di CP12; CP17 C3
PEMBELAJARAN berbagai bidang
MATA KULIAH 2. Mahasiswa mengaplikasikan prinsip-prinsip biologi dasar dan molekuler pada metode dan proses CP12; CP13; C4
dalam bioteknologi modern CP17
3. Mampu menganalisis berbagai isu etika yang muncul dalam aplikasi bioteknologi modern terhadap manusia CP2; CP17; CP26 A3; C4; P2
dan lingkungan secara kritis
DESKRIPSI SINGKAT MATA Mata kuliah Bioteknologi membahas tentang konsep bioteknologi, menitik beratkan pada konsep bioteknologi modern yang melibatkan prinsip-prinsip
KULIAH: biologi molekuler dan sel, teknik yang digunakan, serta aplikasi bioteknologi dalam berbagai bidang. Berbagai isu etika yang muncul seputar dampak
penerapan bioteknologi juga akan dibahas.
MATERI PEMBELAJARAN/POKOK 1. Pengantar Bioteknologi; Definisi, ruang lingkup, dan aplikasinya
BAHASAN 2. Teknik dasar biologi molekuler
3. Vektor dan enzim restriksi
4. Selectable marker & reporter gene
5. Teknik DNA rekombinan
6. Kloning DNA
7. Transfer gen dan evaluasi hasil transfer gen
8. Kultur Sel dan Jaringan
9. Rekayasa Genomik & Metabolik
10. Teknologi Kloning dan Stem Cell
11. Bioteknologi Protein: Antibodi monoclonal dan immune assay
12. Bioteknologi enzim dan Biosensor
13. Aplikasi bioinformatika dan database molekuler dalam Bioteknologi
14. Regulasi dan Pandangan Etika terkait Aplikasi Bioteknologi

PUSTAKA 1. Kafarski, P. 2012. Rainbow code of biotechnology. Chemik, 66(8), 811-816

2. Shin J. H. 2012. Nucleic Acid Extraction Techniques. Advanced Techniques in Diagnostic Microbiology, 209–225. https://doi.org/10.1007/978-1-
4614-3970-7_11.
3. Lorenz T. C. (2012). Polymerase chain reaction: basic protocol plus troubleshooting and optimization strategies. Journal of visualized experiments :
JoVE, (63), e3998. https://doi.org/10.3791/3998.
4. Applied Biosystems. 2009. DNA Sequencing by Capillary Electrophoresis Applied Biosystems Chemistry Guide.
http://tools.thermofisher.com/content/sfs/manuals/cms_041003.pdf?icid=lsg_gsd_CP1236_PJT8083_blog_seqitout-howsangerworks. Youtube:
https://www.youtube.com/watch?v=e2G5zx-OJIw
5. Nicholas, M. W., & Nelson, K. (2013). North, South, or East? Blotting Techniques. Journal of Investigative Dermatology, 133(7), 1–3.
doi:10.1038/jid.2013.216.
6. Carter, M., & Shieh, J. 2015. Molecular Cloning and Recombinant DNA Technology. Guide to Research Techniques in Neuroscience, 219–237.
doi:10.1016/b978-0-12-800511-8.00010-1.
7. Clark, D. P., & Pazdernik, N. J. (2016). Recombinant DNA Technology. Biotechnology, 63–95. doi:10.1016/b978-0-12-385015-7.00003-x.
8. Rahangdale, Shivangi & Singh, Yogendra & Katkani, Deepak & Surjaye, Naveen. 2020. Chapter -2 Gene Transfer Methods in Plants.
Doi:10.22271/int.book.11. https://www.researchgate.net/publication/346085226_Chapter_-2_Gene_Transfer_Methods_in_Plants.
9. Smith K. R. (2002). Gene transfer in higher animals: theoretical considerations and key concepts. Journal of biotechnology, 99(1), 1–22.
https://doi.org/10.1016/s0168-1656(02)00105-0.
10. Godbey, W.T. 2014. An Introduction to Biotechnology The Science, Technology and Medical Applications. Elsevier.
11. Glick, B.R. & Pasternak, J.J., Patten, C.L. 2010. Molecular Biotechnology Principles and Applications of Recombinan DNA 4th Ed. ASM Press.
Washington DC.
MEDIA PEMBELAJARAN Slide Presentasi (MS powerpoint), Video, Jurnal, YouTube, Zoom, Gmeet
TEAM TEACHING Jumailatus Solihah, S.Si., M.Biotech. & Anti Damayanti Hamdani, MMolBio
METODE ASSESMENT CPMK1 CPMK2 CPMK3
Tugas (20%) P P
Quiz (15%) P P
UTS (30%) P P
UAS (30%) P P
 Peran (5%) P P P

MINGGU KEMAMPUAN AKHIR BAHAN KAJIAN METODE PENILAIAN METODE ALOKA PENGALAMAN MEDIA REFER
KE YANG DIHARAPKAN (MATERI) PEMBELAJ SI BELAJAR PEMBELAJAR ENSI
ARAN WAKTU MAHASISWA AN
INDIKATOR KRITERIA BOBOT
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8) (9) (10) (11)
1 1. Mampu menjelaskan a. Definisi dan ruang a. Ketepatan dalam Ketepatan Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 1
definisi bioteknologi menjelaskan definisi dan diskusi, menit Presentasi (MS
lingkup
2. Mampu menjelaskan dan ruang lingkup penguasaan tanya jawab powerpoint),
ruang lingkup aplikasi bioteknologi serta aplikasi bioteknologi Jurnal
bioteknologi b. Ketepatan dalam Bentuk:
aplikasinya di
3. Mampu menjelaskan memberikan contoh Ujian
contoh-contoh aplikasi berbagai bidang aplikasinya di
bioteknologi di berbagai bidang
b. Kontrak belajar
berbagai bidang

2 Mampu menjelaskan Teknik dasar biologi a. Ketepatan dalam Ketepatan Quiz: 3% Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 2-7
prinsip kerja beberapa molekuler: menjelaskan prinsip dan Tugas: diskusi, menit Quiz: organisasi Presentasi (MS
teknik dasar molekuler a. Isolasi nukleotida kerja Teknik dasar penguasaan 5% tanya jawab genom, struktur powerpoint),
b. PCR biologi molekuler gen dan dogma Jurnal
c. Elektroforesis b. Ketepatan dalam Bentuk: sentral biologi
d. Sanger menjelaskan prosedur Quiz, tugas molekuler
sequencing kerja Teknik dasar dan ujian Tugas:
e. Sintesis cDNA biologi molekuler menonton video
f. Blotting tentang salah
satu prosedur
kerja di youtube
dan membuat
PPT-nya
3 1. Mampu a. Vektor untuk a. Ketepatan dalam Ketepatan Quiz: 3% Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 6,7
membandingkan cloning dan membandingkan dan diskusi, menit Quiz: Presentasi (MS
struktur dan komponen ekspresi struktur dan penguasaan tanya jawab identifikasi powerpoint),
vector cloning dan b. Enzim restriksi komponen vector komponen Jurnal
ekspresi cloning dan ekspresi Bentuk: plasmid
2. Mampu menjelaskan b. Ketepatan dalam Quiz, Ujian
jenis dan fungsi enzim menjelaskan jenis dan
restriksi fungsi enzim restriksi
4 1. Mampu membedakan a. Selectable a. Ketepatan dalam Ketepatan Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 6,7
tujuan dan fungsi marker menjelaskan tujuan dan diskusi, menit Presentasi (MS
selectable marker dan b. Reporter gene dan fungsi selectable penguasaan tanya jawab powerpoint),
reporter gene. marker dan reporter Jurnal
2. Mampu gene Bentuk:
mengaplikasikan b. Ketepatan dalam Ujian
selectable marker dan menjelaskan aplikasi
MINGGU KEMAMPUAN AKHIR BAHAN KAJIAN METODE PENILAIAN METODE ALOKA PENGALAMAN MEDIA REFER
KE YANG DIHARAPKAN (MATERI) PEMBELAJ SI BELAJAR PEMBELAJAR ENSI
ARAN WAKTU MAHASISWA AN
INDIKATOR KRITERIA BOBOT
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8) (9) (10) (11)
reporter gene pada selectable marker dan
metode bioteknologi reporter gene

5 1. Mampu menjelaskan Teknik DNA a. Ketepatan dalam Ketepatan Quiz: 3% Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 6,7
prinsip DNA rekombinan menjelaskan prinsip dan diskusi, menit Quiz Presentasi (MS
rekombinan DNA rekombinan. penguasaan tanya jawab powerpoint),
2. Mampu menjelaskan b. Ketepatan dalam Jurnal
tahapan kerja menjelaskan tahapan Bentuk:
konstruksi plasmid kerja konstruksi Quiz, Ujian
rekombinan plasmid rekombinan
6 1. Mampu menjelaskan Cloning DNA a. Ketepatan dalam Ketepatan Tugas: Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 6,7
prinsip cloning DNA menjelaskan prinsip dan 5% diskusi, menit Tugas: Presentasi (MS
2. Mampu menguraikan cloning DNA penguasaan tanya jawab membuat powerpoint),
tahapan kerja cloning b. Ketepatan dalam konstruk Jurnal
DNA menguraikan tahapan Bentuk: plasmid
kerja cloning DNA Tugas, rekombinan
Ujian untuk cloning
gen
7 1. Mampu menguraikan a. Metode transfer a. Ketepatan dalam Ketepatan Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 8,9
tentang berbagai gen ke hewan menguraikan berbagai dan diskusi, menit Presentasi (MS
metode transfer gen ke dan tumbuhan metode transformasi penguasaan tanya jawab powerpoint),
hewan dan tumbuhan b. Evaluasi hasil b. Ketepatan dalam Jurnal
2. Mampu menjelaskan transfer gen menjelaskan cara Bentuk:
hasil evaluasi transfer seleksi hasil Ujian
gen transformasi
8 Mampu menjawab UTS Ketepatan dalam Ketepatan UTS: Ujian 1 x 100
secara tertulis menjawab pertanyaan dan 30% tertulis menit
pertanyaan terkait materi penguasaan (daring)
Bioteknologi yang
disampaikan pada
Pertemuan 1-7

9 1. Mampu menjelaskan Kultur Sel dan a. Ketepatan dalam Ketepatan Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 10
prinsip dasar dan Jaringan menjelaskan prinsip dan diskusi, menit Presentasi (MS
tujuan kultur in vitro dasar kultur in vitro penguasaan tanya jawab powerpoint),
2. Mampu menjelaskan b. Ketepatan dalam Jurnal
tentang kultur primer menjelaskan kultur
dan cell line dan primer dan cell line Bentuk:
contoh serta penggunaannya Ujian
penggunaannya
MINGGU KEMAMPUAN AKHIR BAHAN KAJIAN METODE PENILAIAN METODE ALOKA PENGALAMAN MEDIA REFER
KE YANG DIHARAPKAN (MATERI) PEMBELAJ SI BELAJAR PEMBELAJAR ENSI
ARAN WAKTU MAHASISWA AN
INDIKATOR KRITERIA BOBOT
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8) (9) (10) (11)
10 Mampu menjelaskan Rekayasa genomic Ketepatan dalam Ketepatan Tugas: Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 11
prinsip metode rekayasa dan metabolic: menjelaskan prinsip dan 5% diskusi, menit Tugas: Presentasi (MS
genomik (genome a. Genome shuffling dasar metode rekayasa penguasaan tanya jawab merangkum powerpoint),
shuffling, random b. Random genomik untuk tujuan salah satu Jurnal
mutagenesis, directed- mutagenesis rekayasa metabolik Bentuk: metode
mutagenesis, genome c. Directed Tugas, ujian rekayasa
editing) untuk tujuan mutagenesis genomik/metab
rekayasa metabolik d. Genome editing olik yang
dimuat dalam
referensi
(jurnal)
11 1. Mampu menjelaskan Teknologi Kloning a. Ketepatan dalam Ketepatan Kuis: Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 11
prinsip dasar, macam a. Reproduktif: Cell- menjelaskan prinsip dan 3% diskusi, menit Quiz: metode Presentasi (MS
dan aplikasi teknologi splitting, transfer dasar, macam dan penguasaan tanya jawab cloning yang powerpoint),
kloning reproduktif nucleus, SCNT. aplikasi teknologi diketahui dan Jurnal
2. Mampu menjelaskan b. Terapeutik: Stem kloning reproduktif aplikasinya
prinsip dasar dan cell b. Ketepatan dalam Bentuk:
aplikasi teknologi menjelaskan prinsip Kuis, Ujian
kloning terapeutik dasar dan aplikasi
(stem cell) stem cell
12 1. Mampu menjelaskan Bioteknologi Protein: a. Ketepatan dalam Ketepatan Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 11
prinsip dasar dan Antibodi monoclonal menjelaskan prinsip dan diskusi, menit Presentasi (MS
aplikasi teknologi dan immune assay dasar dan aplikasi penguasaan tanya jawab powerpoint),
antibodi monoklonal teknologi antibodi Jurnal
2. Mampu menjelaskan monoklonal Bentuk:
prinsip immune assay b. Ketepatan dalam Ujian
yang melibatkan reaksi menjelaskan prinsip
antigen-antibodi immune assay yang
melibatkan reaksi
antigen-antibodi
13 1. Mampu menjelaskan Bioteknologi enzim a. Ketepatan dalam Ketepatan Tugas: Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 11
prinsip teknologi enzim dan Biosensor menjelaskan prinsip dan 5% diskusi, menit Presentasi (MS
dan contoh aplikasinya teknologi enzim dan penguasaan tanya jawab powerpoint),
dalam bidang industri contoh aplikasinya Jurnal
dan lingkungan dalam bidang industry Bentuk:
2. Mampu menjelaskan dan lingkungan Tugas,
prinsip biosensor b. Ketepatan dalam Ujian
dengan menggunakan menjelaskan prinsip
enzim, mikrobia dan biosensor dengan
antibodi contoh menggunakan
enzim, mikrobua dan
MINGGU KEMAMPUAN AKHIR BAHAN KAJIAN METODE PENILAIAN METODE ALOKA PENGALAMAN MEDIA REFER
KE YANG DIHARAPKAN (MATERI) PEMBELAJ SI BELAJAR PEMBELAJAR ENSI
ARAN WAKTU MAHASISWA AN
INDIKATOR KRITERIA BOBOT
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8) (9) (10) (11)
antibodi
14 1. Mampu menjelaskan Regulasi serta a. Ketepatan dalam Ketepatan Kuis: 3% Ceramah, 1 x 100 Kuliah Slide 11
contoh regulasi Pandangan Etika dan menjelaskan contoh dan diskusi, menit Quiz: Contoh Presentasi (MS
berkaitan dengan agama terkait Aplikasi regulasi berkaitan penguasaan tanya jawab issue aplikasi powerpoint),
aplikasi bioteknologi Bioteknologi dengan aplikasi bioteknologi di Jurnal
2. Mampu memberikan bioteknologi Bentuk: masyarakat dan
pendapat berdasarkan b. Keluasan pandangan Kuis bagaimana
pandangan etika, dalam memberikan Ujian sikap yang
agama dan regulasi pendapat berkenaan diberikan
yang berlaku terhadap dengan issue aplikasi berdasarkan
issue aplikasi bioteknologi di pandangan
bioteknologi di masyarakat etis/agama
masyarakat berdasarkan terhadap issue
pandangan etika, tersebut
agama dan regulasi
yang berlaku

Integrasi-Interkoneksi
1. Matakuliah pendukung integrasi-interkoneksi: Biologi Sel dan Molekuler, ‘Ulum al-Quran, Asistensi Biologi Profetik
2. Level integrasi-interkoneksi
a. Filosofis
b. Materi
3. Proses integrasi-interkoneksi
a. Pada level filosofis, ditekankan bahwa bioteknologi merupakan bidang yang multidisiplin sehingga secara keilmuan sangat berkaitan erat dengan
keilmuan lain dan dalam penerapannya sangat berkaitan dengan nilai-nilai etika, agama dan kemanusiaan.
b. Pada level materi, khususnya pada materi di pertemuan terakhir, dibahas mengenai contoh regulasi serta bagaimana menyikapi issue-issue etis
dan agama berkaitan penerapan bioteknologi di masyarakat.

Disusun oleh: Diperiksa oleh: Disahkan oleh:

Dosen Pengampu Penanggungjawab Keilmuan Ketua Program Studi Dekan

Jumailatus Solihah, M.Biotech Lela Susilawati, PhD. Jumailatus Solihah, M.Biotech. Najda Rifqiyati, M.Si Dr. Khurul Wardati, M.Si.
CPMK Bioteknologi
Mahasiswa mampu menjelaskan definisi dan ruang lingkup bioteknologi serta
aplikasinya di berbagai bidang (CPMK1)
Mahasiswa mengaplikasikan prinsip-prinsip biologi dasar dan molekuler pada metode
dan proses dalam bioteknologi modern (CPMK2)
Mahasiswa mampu menganalisis berbagai isu etika yang muncul dalam aplikasi
bioteknologi modern terhadap manusia dan lingkungan secara kritis (CPMK3)
Students can explain the definition and scope of biotechnology and its application in
various fields
Students can apply basic and molecular biology principles to methods and
processes in modern biotechnology
Students are able to critically analyze various ethical issues that arise in the
application of modern biotechnology to humans and the environment