Bioinformatika (BIC 30007) - Program Studi S1 Biologi

Fakultas Biologi, Universitas Gadjah Mada

Bioinformatika (BIC 30007)

Bioinformatics Ideas Mini Project

Oleh: Sendi Priyono, M. Si., Nareta Defiani, Fauzana Zahran
Mei 2022

Pendahuluan 1

Ide yang Disarankan 1

Ketentuan Pengumpulan 1

1. Pendahuluan
Bioinformatics Ideas Mini Project merupakan topik terakhir dalam praktikum
bioinformatika yang bertujuan menggali pengalaman praktikal dalam mengerjakan masalah
penelitian bioinformatika (skala mini) menggunakan data biologis nyata, serta mendorong
kreativitas mahasiswa terhadap penelitian bioinformatika terkini.

2. Ide yang Disarankan

Berikut beberapa ide mini project untuk bioinformatik yang bisa dipilih (urutan semakin
kebawah mendapat poin plus, 4 tertinggi):
1. Analisis database yang tersedia online (misal filogenetik atau molecular docking dengan
database sekuens di ncbi, semakin komphrensif semakin baik)
2. Re-analisis hasil dari suatu publikasi (cari publikasi yang menyediakan database publik
dan metode yang detil, kemudian analisis ulang; misal ditemukan residual atau variants
baru dari data wgs)
3. Eksplorasi penggunaan software bioinformatik yang belum pernah disampaikan ketika
praktikum (berikan deskripsi tentang software, kemudian contoh hasil analisis)
4. Benchmarking software-software yang memiliki fungsi yang sama dalam bioinformatik
(bandingkan dan cari kelebihan dan kekurangan tiap software)

3. Ketentuan Project
Project dikerjakan berkelompok, sesuai dengan kelompok hasil plotting bioinformatika.
Laporan disampaikan dalam bentuk :

1. Makalah (maksimal 10 lembar),

2. 1 poster ukuran A3 (berupa file .jpg/.png, struktur poster ilmiah),
3. dan video tutorial (optional; nilai plus).

Mahasiswa perlu menyediakan reference journal & source code (jika ada) serta dokumentasi
tiap langkahnya, sehingga analisis dapat dilakukan ulang (reproduce). Project dikerjakan
Bioinformatika (BIC 30007) - Program Studi S1 Biologi
Fakultas Biologi, Universitas Gadjah Mada

selama 2 minggu dan dikumpulkan serta dipresentasikan pada Rabu, 8 Juni 2022 secara daring
(link dan urutan presentasi akan diumumkan selanjutnya).