Pertemuan 6 : STRUKTUR DAN

EKSPRESI GEN

Dosen : Cico Jhon Karunia Simamora, SP. MSi.

 STRUKTUR DAN EKSPRESI GEN

Sub Pokok Bahasan:

1. Sifat Bahan Genetik
2. Replikasi
3. Ekspresi Gen

Tujuan Instruksional Khusus:

1. Menjelaskan sifat kimia gen (DNA dan RNA)
2. Menjelaskan proses replikasi DNA
3. Menjelaskan proses ekspresi gen: transkripsi dan translasi

2
 STRUKTUR BAHAN GENETIK

Percobaan memperlihatkan bahwa DNA adalah bahan genetik

Percobaan Hershey-Chase
memperlihatkan bahwa virus
tertentu mereprogram kepala
DNA
ekor

serabut
Sel inang untuk menghasilkan ekor

lebih banyak virus dengan

cara menyuntikan DNA nya
DNAmengandung unsur P(fosfor)
Protein mengandung unsur S(belerang)

3
 Siklus Reproduktif Fage

DNA

Fage menempel Fage menyuntikkan Fage DNA mengarahkan

pada sel bakteri DNA. sel inang membuat DNA
dan bagian-bagian
protein fage. Fage baru
terbentuk
Sel lisis dan
melepaskan fage baru.

Virus T2 menyerang bakteri disebut bakteriofage (fage)

4
 Percobaan Hershey-Chase
1 2 3 4
Mix radioactively Agitate in a blender Centrifuge the mixture Measure the
labeled phages with to separate phages so bacteria form a radioactivity in
bacteria. The phages outside the bacteria pellet at the bottom of the pellet and
infect the bacterial from the cells and the test tube. liquid.
cells. their contents.

Radioactive Empty Radioactivity

Phage protein protein shell in liquid
Bacterium Phage
DNA
DNA
Batch 1
Radioactive (S)
protein
Centrifuge

Pellet

Radioactive
Batch 2 DNA
Radioactive (P)
DNA Centrifuge
Radioactivity
Pellet in pellet

5
 DNA and RNA adalah Polimer Nukleotida

DNA adalah asam nukleat, terbentuk dari rantai panjang nukleotida

Grup fosfat

Basa
Nitrogen
basa Nitrogen
(A, G, C, or T)
Grup fosfat

gula
Nukleotida

Thymine (T)

gula
(deoxiribose)

nukleotida DNA
polinukleotida backbond fosfat-gula

6
 Basa Nitrogen

DNA mempunyai empat Basa Nitrogen

7
 RNA termasuk Asam Nukleat

• RNA mempunyai gula yang berbeda dari gula DNA

• RNA mempunyai U bukan T
Basa Nitrogen
(A, G, C, or U)

grup fosfat

Urasil (U)

gula
(ribose)

8
 DNA Merupakan Helix Sulur-Ganda
James Watson dan Francis Crick menciptakan model struktur tiga-dimensi
DNA (1953), berdasarkan hasil kerja Rosalind Franklin

dipilin

Rosalind Franklin

Foto sinar-X DNA

9
 Tiga Model DNA

Ikatan hidrogen

model pita struktur kimia parsial model komputer

10
 Replikasi DNA

Karakteristik DNA sebagai bahan genetik:

• diwariskan
• harus tetap sama antar generasi
• harus dapat menggandakan diri (mereplikasi) sebelum diwariskan

Tiga Kemungkinan Pola Replikasi DNA

• semikonservatif
• konservatif
• dispersif

11
 Kemungkinan Pola Replikasi DNA

pola yang benar

12
Replikasi DNA Dimulai pada Lokasi Spesifik

sulur mula-mula
asal (origin) replikasi sulur baru

gelembung (bubble)

dua molekul DNA

13
 Proses Replikasi DNA: Semikonservatif

ujung5’ ujung3’

ujung3’ ujung5’

14
 Bagaimana Mensintesis Sulur DNA baru?
3
Molekul DNApolymerase 5

DNA mula-mula sulur bersaudara

(parental DNA) disintesis kontinu
5
3
sulur bersaudara
P disintesis potongan

3
5

5 P
3

Molekul DNA baru

identik dengan molekul
DNA mula-mula DNA ligase

arah keseluruhan replikasi

15
 Alur Informasi Genetik: DNA - RNA - Protein

Genotipe DNA diekspresikan ke protein, yang merupakan

molekul dasar fenotipe sifat

Konstitusi information genotipe suatu organisme dibawa oleh

sekuen basa DNA

Hasil studi pewarisan ketidaknormalan metabolisme

memberikan petunjuk awal bahwa fenotipe di ekspresikan
melalui protein

Hasil studi pada cendawan roti Neurospora crassa menujukkan

ke hipotesis “satu gen-satu polipeptida”

16
 Hubungan antara DNA (Gen) dengan Protein (Enzim)

• DNA berada di inti sel (nukleus) dan tidak dijumpai di sitoplasma

• Protein yang berperan dalam metabolisme ada di sitoplasma dan tidak
ada di inti
• Perlu adanya penghubung antara DNA dengan protein, yaitu
molekul yang dijumpai di inti maupun di sitoplasma

Penghubung antara DNA dengan Protein adalah RNA

17
Ekspresi Gen

RNA

18
 Transkripsi

• Heliks/ulir DNA digunakan sebagai model cetakan, dan enzim

RNA polimerase sebagai katalisator.
• Sintesis/transkripsi RNA hanya dari salah satu utas DNA (dari utasDNA
cetakan, tidak dari utas DNA pendamping)
• Sintesis RNA dengan arah 5’P 3’OH (antiparalel dari utas DNAcetakan)

19
Transkripsi

• Gen merupakan fragmen DNA yg

menyandikan protein/enzim.
• Dalam proses transkripsi melibatkan
RNA polimerase, DNA promotor,
dan DNA terminator

20
 RNA Eukariot Diproses sebelum Meninggalkan Nukleus

Exon Intron Exon Intron Exon

• Segmen noncoding disebut DNA

intron dikeluarkan Cap

Transcription
Addition of cap and tail

RNA
• Topi dan ekor ditambahkan transcript
Introns removed Tail
with cap
diujung RNA hasil transkripsi and tail

(A cap and a tail are added to the

ends) Exons spliced together

mRNA

Coding sequence
NUCLEUS

CYTOPLASM

21
 Informasi Genetik Ditulis dalam Kodon yang Diterjemahkan
(ditranslasikan) ke dalam Sekuen Asam Amino

• “Kata” dari “bahasa” DNA adalah triplet basa disebut kodon

• Kodon-kodon pada suatu gen menentukan sekuen asam

amino dari suatu polipeptida

22
Model DNA Dikemas dalam Kromosom Eukariot
DNA
double helix
(2-nm diameter)

histon
“beads on
a string”

nukleosom
(10-nm diameter)

tight helical fiber

(30-nm diameter) superkoil
(200-nm diameter)

700
nm
kromosom metafase
23
Model DNA Dikemas dalam Kromosom Eukariot

gen 1 gen 3
molekul DNA

gen 2

Utas DNA

TRANSKRIPSI

RNA

Kodon
TRANSLASI

polipeptida
asam amino
24
 Tabel Kode Genetik
Basa II
Basa I

25
 Contoh Translasi Kode Genetik
sulur ditranskripsi

DNA

transkripsi

RNA

start stop
kodon tanslasi kodon

polipeptida

26
Proses Translasi

mRNA protein

Molekul yang terlibat dalam proses

translasi:
• mRNA
• tRNA-asam amino
• Ribosom (rRNA dan protein
ribosom)

27
 Ringkasan Transkripsi dan Translasi
DNA TRANSKRIPSI

1
mRNADITRANSKRIPSI
mRNA
dari DNAtemplate
RNA
polimerase

asam amino
TRANSLASI

Enzim 2
setiap asam amino menempel ke
tRNA dengan bantuan enzim spesifik
tRNA dan ATP.

initiator antikodon 3
tRNA
subunit inisisasi sintesispolipeptida
besar
ribosom
mRNA, tRNA pertama,
Start subunit dan subunit ribosom
Codon kecil bergabung
mRNA
ribosom

28
 Ringkasan Transkripsi dan Translasi (lanjutan)

pembentukan
ikatan peptida
pembentukan baru 4
polipeptida
fase elongasi
Asuccession of tRNAs add their amino
acids to the polypeptide chain as the
mRNAis moved through the ribosome,
one codon at a time.

kodon
mRNA
polipeptida

5
fase terminasi
Stop The ribosome recognizes a stop
codon. The poly-peptide is
terminated and released.
kodon

29
 Mutasi Dapat Mengubah Pengertian Gen
Mutasi adalah perubahan dalam sekuen DNA bisa karena kesalahan dalam
replikasi DNA atau oleh mutagen
tipe-tipe Mutasi

GEN NORMAL mRNA

protein
Met Lys Phe Gly Ala

SUBSTITUSI BASA

Met Lys Phe Ser Ala

Hilang

DELESI BASA

Met Lys Leu Ala His

30
Perubahan Satu Nukleotida DNA Penyebab Penyakit Sickle-Cell

hemoglobin DNA normal hemoglobin DNA mutan

mRNA mRNA

Normal hemoglobin Sickle-cell hemoglobin

hemoglobin normal hemoglobin sickle-cell

Glu Val

31
terima kasih

32