Struktur Sel, DNA dan

RNA
Replikasi DNA dan
Sintesis Protein
Sr
Struktur Sel
 Nucleus (Inti sel)

• Setiap sel makhluk hidup mempunyai

nucleus (inti sel) dimana didalamnya
terdapat nucleoplasma
• Nucleus berperan dalam:
1. Menyimpan informasi genetik
2. Duplikasi DNA
3. Transkripsi  dalam sintesis protein
• Dalam nucleoplasma terdapat
chromosomes (chromatin pada saat
pembelahan sel) yang strukturnya
sebagian besar terdiri dari DNA dan
protein
• Dalam nucleus juga terdapat nucleoli
(anak inti) yang aktif dalam sintesis
protein. Nucleoli dalam suatu sel dapat
berjumlah satu atau lebih.
• Nucleoli berperan dalam sintesis dan
penyusunan molekul RNA dan
pembentukan sejumlah besar protein
ribosom sebelum ditransfer ke sitoplasma.
 Nucleic Acids (Asam nukleat)

• Dalam tubuh setiap makhluk hidup mengandung

asam nukleat.
• Merupakan makromolekul.
• Bentuknya bisa berupa DNA (deoxyribonucleic
acid) dan RNA (ribonucleic acid)
• Beberapa organisme bersel tunggal seperti virus
tubuhnya hanya terdiri dari DNA atau RNA saja
DNA - “Kode Kehidupan”

• DNA mempunyai cetakan untuk

membangun individu makhluk hidup
• Kode genetik bersifat universal
Struktur Materi Hereditas

• Percobaan pada tahun

1950an menunjukkan
bahwa DNA membawa
sifat hereditas
• Pada 1953 – Watson dan
Crick menemukan bahwa
sturktur DNA adalah
suatru rantai ganda
Watson-Crick Model
 DNA
• DNA merupakan penyimpan utama dari material genetic (informasi
genetik).
• DNA merupakan suatu polymer (polynucleotides) dimana 1 unit
(monomer) dari DNA adalah nucleotides.
• Urutan nukleotida di sepanjang DNA berperan sebagai sandi untuk
menyampaikan semua informasi yang diperlukan untuk memerintahkan
sel agar membuat segala sesuatu yang diperlukan bagi kehidupan
• Setiap nucleotide tdd:
- Basa nitrogen purine (adenine, guanine) atau pyrimidine (cytosine,
thymine)
- deoxyribose sugar (gula deoksiribosa)
- 1,2 or 3 phosphate groups.
 Struktur DNA (Watson dan
Crick)
• Struktur DNA adalah double helix ( rantai ganda),
dengan rangkanya yang terdiri dari deoxyribose—
phosphate—deoxyribose—phosphate—
• Terdapat ikatan hidrogen diatara rantai yang
saling berhadapan
• Basa Purine dan pyrimide yang terikat kepada
gula deoxyribose, dapat berputar bebas. DNA
membentuk pasangan basa yang spesifik A-T(2 H-
bonds), G-C (3 H-bonds).
• Kedua rantai DNA saling berhadapan disebut
antiparallel
Struktur DNA
Struktur DNA
Basa Nitrogen
Gula deoksiribosa dan Phospat
IKATAN HIDROGEN
Jumlah Carbons
Rantai antiparallel
T
A T
A
T A
A
T A
C
G C
G
C G
G
C G
A
T A
T
A T
C
G C
 RNA
• Struktur rantai tunggal, namun cukup kompleks
• Struktur pembentuk rantai sama seperti DNA yaitu terdiri
dari ribose, phosphatase, basa purin (A,G) dan
pyrimidine (C, U)
• Types of RNA:
-messenger RNA berperan membawa kode genetik dalam
sequencing asam amino
-transfer RNA berperan dalam identifikasi dan transfer
asama amino ke ribosom
-ribosomal RNA berperan merupakan bagian dari ribosom
yang berfungsi dalam pembentukan protein(polypeptide)
Perbedaan DNA RNA
Letak Sebagian besar di Dalam sitoplasma,
nukleus, sedikit di nucleolus dan
mitochondria dan kromosom
kloroplast
Pyrimidine bases Cytosine Cytosine
Thymine Urasil
Purine bases Adenine Adenine
Guanine Guanine
Pentose deoxyribose ribose
Hydrolizing Deoxyribonuclease Ribonuclease
enzyme (DNase) (RNase)
Peranan Genetic Synthesis of
information proteins
Genes dan molekul DNA
• Suatu gen merupakan
suatu urutan basa yang
menempati suatu lokasi
spesifik pada molekul
DNA
• Gen ini mengontrol sifat
khusus dengan
membuat suatu protein
khusus dalam jumlah
tertentu
or or

one base pair

in-text, p. 195
 transcribed DNA DNA to be
sugar-phosphate backbone of one strand winds up again transcribed
of nucleotides in a DNA double helix unwinds

newly forming the DNA

RNA transcript template at the
assembly site

sugar-phosphate part of the sequence

backbone of the of growing RNA transcript
other strand of 3’
base pairs in DNA 5’
nucleotides

3’ 5’
direction of transcription

5’ 3’

RNA
polymerase

Fig. 13.4, p. 202-3

Replikasi DNA
• DNA terdiri dari dua rantai nukleotida yang saling
berikatan karena adanya ikatan hidrogen
• Ikatan hidrogen antara dua rantai tersebut
mudah sekali terputus
• Setiap rantai tunggal kemudian berperan sebagai
cetakan untuk pembentukan rantai baru
new old old new
DNA diduplikasi oleh Enzyme:

• enzyme DNA polymerase melepaskan ikatan

rantai DNA, menangkap nukleotida bebas,
memasangkan dengan nkleotida baru yang
sesuai dan membentuk ikatan yang baru

• enzymes lain mengoreksi setiap kesalahan

untuk memastikan tidak ada kesalahan
sedikitpun
 Replikasi DNA
berlangsung selama
mitosis dan meiosis,
untuk membuat sel
baru

new old
old
old

Fig. 12.9, p. 196

 SINTESIS PROTEIN

transcription translation

DNA RNA Protein

What makes a whale a whale?
• Proteins:

• Organisms adalah unik

karena keunikan protein
masing-masing dan …
• Bagaimana protein
tersebut diorganisasi
selama pertumbuhan
Protein

• Merupakan suatu rantai asam amino yang

dibentuk oleh elemen C, H, N, O.

• Terdapat 20 jenis Asam amino

• Rantai asam amino kemudian bergabung dan

berlipat-lipat menjadi bentuk tiga dimensi
Bagaimana DNA mengontrol
perkembangan suatu organisme?
• DNA membedakan
karakteristik suatu
organisme karena
perbedaan urutan
asam amino dalam
semua protein yang
terdapat pada
organisme tersebut
GENETIC CODE
• Setiap asam amino (20 amino acids) diwakili oleh
tiga basa yang disebut dengan kodon
• Setiap kodon mengkodekan satu jenis asam
amino
• Urutan basa akan menentukan urutan asam
amino dalam protein
• Pembentukan protein berlangsung dalam suatu
tahapan proses yang disebut dengan sintesis
protein
Fig. 13.7, p. 204
Tahap 1: Transkripsi

• DNA dipisahkan dengan rantai

pasangannya dan messenger RNA
mengkopi kode genetik
Transkripsi Gen

transcribed DNA DNA to be

winds up again transcribed unwinds

mRNA
transcript
RNA polymerase
Tahap 2- Pemotongan RNA

• RNA dipotong

• Introns (Non- coding sequences) dibuang

• Exons (Expressed sequences) tetap

dibiarkan
 unit of transcription in a DNA
strand
exon intron exon intron exon
3’ 5’

transcription into pre-mRNA

cap poly-A tail

5’ 3’

snipped out snipped out

5’ 3’
mature mRNA transcript

Fig. 13.5, p. 203

Tahap 3 :

• Messenger RNA mengambil kode tersebut

dan menuju ke ribosom di sitoplasma

• Transfer RNA mengambil asam

amino tertentu dan menuju
ribosom
Tahap 4 :Translation

• Di dalam ribosom, kode tersebut dibaca

dan ditranslasikan ke dalam bentuk suatu
urutan asam amino

• Rantai asam amino akan melipat-lipat dan

bergabung menyatu membentuk protein
akhir
Sintesis Protein
Fig. 13.10c, p. 206-7
TRANSCRIPTION Unwinding of gene regions of a DNA molecule

Pre mRNA
Transcript mRNA rRNA tRNA
Processing

Mature mRNA protein ribosomal mature

transcripts subunits subunits tRNA

Convergence
TRANSLATION of RNAs

Cytoplasmic
pools of
amino acids,
tRNAs, and
Synthesis of a ribosomal
polypetide chain subunits
at binding sites
for mRNA and
tRNA on the
surface of an
intact ribosome

FINAL PROTEIN
Destined for use in
cell or for transport Fig. 13.14, p. 210
 Sintesis Protein
• Instruksi pada DNA ditranskripsi (dituliskan
kembali) dalam bentuk serupa kemudian
ditranslasi (diubah) menjadi bahasa protein.
• Pertama2 pesan ditranskripsi menjadi jenis molekul
lain yang dikenal sebagai RNA kurir (mRNA).
Secara kimiawi mRNA sangat serupa dengan DNA,
molekul ini juga dapat mengenali basa pada
untaian DNA dan melalui proses pengenalan mRNA
bekerja menyalin gen yang dibentuk.
 Sintesis Protein
• Proses mentranslasi instruksi pada mRNA menjadi
btk protein kemudian dapat dimulai.
• Urutan basa pada molekl mRNA menentukan urutan
asam amino pada protein.
• Kata-kata pada bahasa mRNA terdiri atas kelompok2
tiga basa berurutan, disebut kodon. Setiap kodon
menyampaikan perintah kepada mesin selular yang
mensintesis protein bahwa asam amino tertentu hrs
digabungkan menjadi protein pada tempat tertentu
Sintesis Protein pada Ribosom
 Sintesis Protein
Translasi mRNA melibatkan puluhan jenis molekul,
diantaranya (rRNA dan tRNA). Keduanya tidak
membawa kode genetik, tetapi membantu sel membaca
informasi yang terkandung pada mRNA. Sekali mRNA
dibuat, molekul ini meninggalkan inti sel dan masuk
tubuh utama sel. Disini struktur globular yang dikenal
dengan nama Ribosom melekat pada mRNA tersebut.
Pada ribosom terdapat rRNA.Sekali Ribosom berikatan
dengan mRNA, tRNA menjalankan tugasnya. Terdapat
berbagai jenis tRNA dan masing2 mampu mengenali
golongan tertentu dari ketiga basa (kodon) pada mRNA.
Setiap jenis tRNA membawa hanya satu jenis asam
amino tertentu
Sintesis Protein
Sintesis Protein
• Setelah sel selesai menyusun suatu rantai asam
amino, rantai ini mulai melipat dirinya sendiri.
Bentuk umum protein adalah rantai berputar
dan melekuk membentuk struktur tiga dimensi
yang kompleks. Pelipatan ini diatur oleh tenaga
kimia.
• Bentuk akhir molekul protein ditentukan oleh
urutan asam amino yang menyusun protein
tersebut.
Replikasi
DNA
dan
Sintesis
Protein
Jenis-jenis Asam Amino sebagai
Penyusun Protein