(LANJUTAN)
Ujung 5’P Ujung pita yang berakhir dengan gugus fosfat yang
melekat pada atom karbon nomor 5
Ujung 3’OH Ujung pita yang berakhir dengan gugus hidroksil melekat
pada atom karbon nomor 3 pada molekul gula
DNA DAN RNA
DNA = Deoxyribo Nucleic Acid
Asam nukleat yang molekul gulanya berupa deoksiribosa
RNA = Ribo Nucleic Acid
Asam nukleat yang molekul gulanya berupa ribosa
ASAM NUKLEAT
polimer berbentuk rangkaian nukleotida, yang antar jalurnya,
dihubungkan oleh pasangan basa-basa nitrogen melalui ikatan
hidrogen yang sifatnya lemah (mudah lepas).
BASA NITROGEN
EMPAT BASA NITROGEN, NUKLEOSIDA
DAN NUKLEOTIDA DARI MOLEKUL DNA
No Basa Basa + Deoksiribosa Deoksiribosa + Asam Singkata
. Nitrogen = Deoksiribosa Fosfat = Deoksiribosa n
Nukleosida Nukleotida
1 ADENIN (A) DEOKSIADENOSIN ASAM DEOKSIADENILIN d AMP
(DEOKSI ADENOSIN
MONOFOSFAT)
RNA polimerase
RNA
DNA
dATP, dTTP, dGTP, dCTP
DNA polimerase
DNA
DNA RNA
T.d. 2 utas rantai T.d. 1 utas rantai
polinukleotida yang membentuk polinukleotida
struktur double-helix
5’ 3’
A T G C
T A
antiparalel C G
3’ 5’
DNA
RNA
2 utas double helix
t.d. 1 utas rantai
polinukleotida
A T G C
pur pir pur pir A U G C
G C
Hukum berpasangan
.
.
RNA DAN DNA
PERBEDAAN DNA DAN RNA
KONVERSI UKURAN PANJANG
SINTESIS PROTEIN
EKSPRESI GEN
.
EKSPRESI GEN
GEN --- mRNA --- polipeptida/ protein
TRANSKRIPSI TRANSLASI
Upstream Downstream
DNA 5’ ------ ACTGCC ------ 3’ utas coding
3’ ------ TGACGG ------ 5’ utas cetakan
mRNA 5’ --- ACUGCC --- 3’
tRNA 3’-- UGA -- 5’ (bgn antikodon)
Thr (a.a yg dibawa)
JENIS DAN BENTUK RNA
1. mRNA =messenger RNA,
Disebut juga d-RNA = duta RNA, berupa rantai tunggal yang panjang
2. tRNA = transfer RNA, berupa rantai tunggal, berbentuk daun
semanggi bertangan-4
3. rRNA = ribosomal RNA, berupa rantaian tunggal, yang pada daerah
tertentu melipat balik.
MRNA URUTAN KODON
.
Kodon = kode genetik, yaitu :
- Urutan 3 basa nitrogen pada molekul DNA.
- Setiap kodon akan mengkode 1 asam amino
Transkripsi, yaitu :
- Proses pemindahan informasi genetik yang masih berupa kode dari DNA ke
mRNA, agar dapat dikirimkan ke sitoplasma
Sistron, yaitu :
- Serangkaian kodon yang diperlukan untuk sebuah molekul polypeptida (protein)
- Jumlah kodon yang diperlukan tergantung dari jumlah asam amino yang
menyusun protein yang disintesis.
- Dari 1.500 basa nitrogen dihasilkan 500 asam amino.
Sintesis mRNA
mRNA disintesis dari DNA dalam nukleus
Fungsi mRNA
- mengkopi informasi genetik yang didiktekan oleh
DNA
- membawa informasi (yang masih berupa kode)
tersebut dari nukleus ke ribosom dalam sitoplasma untuk
dibentuk menjadi protein
BM mRNA : Terkecil : 500.000 (900 nukleotida)
Terbesar : 4.000.000 (12.000 nukleotida)
mRNA dibentuk oleh DNA jika dibutuhkan saja, bila
tugasnya selesai, maka mRNA hancur dalam plasma
PEMATANGAN MRNA (EUKARIOT)
hn RNA (Eukariot)
PEMATANGAN MRNA (EUKARIOT)
Capping
PEMATANGAN MRNA (EUKARIOT)
.
2. TRNA (TRANSFER RNA)
Ukuran molekulnya sangat kecil.
Ada sekitar 60 macam, yang masing-masing terdiri atas 80 nukleotida
Dibuat dari DNA dalam inti sel, tetapi selalu terdapat dalam sitoplasma
Berbentuk daun semanggi bertangan 4
1. Tangan ke-1 : Merupakan ujung perangkai asam amino yaitu
sebagai aseptor
2. Tangan ke-2 : Merupakan ujung pengenal kodon, yang disebut anti
kodon
3. Tangan ke-3 : Merupaka ujung pengenal enzim bagi asam amino.
4. Tangan ke-4 : Merupakan ujung pengenal ribosom yang cocok
untuk masing-masing tRNAnya
Tangan ke-1 berseberangan dengan tangan ke-2
Tangan ke-3 berseberangan dengan tangan ke-4
STRUKTUR MOLEKUL RNA
FUNGSI T-RNA
1. Mengenal kodon yang telah ditranskripsikan pada
mRNA, dilakukan oleh antikodon pada tRNA
2. Membawa asam amino ke mRNA di ribosom (dalam
sitoplasma), yang sesuai dengan kodon-kodon yang
terdapat pada mRNA tadi
3. Merangkaikan asam amino tersebut dengan asam
amino sebelumnya, sehingga terbentuk protein
4. Pada setiap tangan pengenal kodon dari tRNA
terdapat 3 basa nitrogen (1 antikodon) yang
menggambarkan jenis asam amino tertentu yang
dapat dilihat pada tangan pengenal asam amino.
5. Bila tugasnya selesai, tRNA kembali ke sitoplasma
untuk digunakan lagi pada sintesis berikutnya.
6. Dalam 1 detik terbentuk sebuah rangkaian polipeptida
yang terdiri atas 4.000 asam amino
3. RRNA (RIBOSOMAL RNA)
- Berbentuk rantai tunggal nukleotida, yang pada daerah tertentu
melipat balik, sehingga mirip rantai rangkap
- Merupakan RNA yang terbanyak dalam sel
- Terdapat 2 ukuran rRNA :
a. rRNA ukuran kecil (BM= 600.000) terdapat di dalam
ribosom sub unit kecil
b. rRNA ukuran besar (BM=1.300.000) terdapat di dalam ribosom
sub unit besar
- Disintesis dari prekursor (gen khusus dalam kromatin) dalam
reaksi yang dikatalisis oleh enzim
- Dikode dari DNA dalam nukleolus, menyatu dengan protein,
kemudian menempati ribosom dalam sitoplasma
FUNGSI R-RNA
- Sebagai perakit protein
- rRNA meskipun tidak digunakan selalu berada dalam ribosom
-Ribosom mengandung : 60% rRNA
40% protein basa
- Ribosom subunit besar mengikat tRNA
- Ribosom subunit kecil mengikat mRNA
SINTESIS PROTEIN
Senyawa
makromolekul: DNA
42
DARI GEN KE PROTEIN
Prokariot
43
Eukariot
KEMUNGKINAN REPLIKASI DNA
44
TAHAPAN SINTESIS
PROTEIN
1. DNA mencetak mRNA
2. mRNA meninggalkan inti (nukleus) menuju
ke ribosom yang terdapat dalam sitoplasma
3. tRNA datang membawa asam amino yang
sesuai dengan kode yang diabwa oleh
mRNA
4. Asam-asam amino akan berderet dalam
urutan yang sesuai dengan kode yang
diharapkan
5. Protein terbentuk merupakan enzim yang
mengatur metabolisme sel.
Tahap sintesis protein terdiri dari tahap transkripsi dan
translasi.
1) Transkripsi adalah pembentukan mRNA oleh DNA sense di
inti sel.
mRNA dibuat dengan menyalin rantai DNA yang disebut DNA sense atau
kodogen. Rantai DNA lawan yang tidak disalin disebut DNA antisense.
mRNA dibuat menggunakan RNA polimerase sehingga menghasilkan
kodon.
Komponen-komponen yang bekerja dalam sintesis
protein antara lain mRNA (RNAd), rRNA, tRNA, enzim
RNA polimerase, enzim aminoasil-tRNA sintetase, dan
enzim peptidil transferase.
Kodon adalah urutan basa nitrogen yang merupakan
salinan DNA sense atau kodogen, yang mengkode
asam amino tertentu. Urutan basa nitrogen kodon
sama dengan DNA antisense.
Asam amino dikode oleh triplet kodon, yaitu susunan 3
basa nitrogen yang menentukan jenis 20 asam amino
berbeda.
Redundansi adalah keadaan dimana satu jenis asam
amino dapat dikode oleh >1 triplet kodon.
2). Translasi adalah penerjemahan mRNA oleh tRNA di ribosom.
TRANSLASI
Kode Genetik
Keterangan:
Phe : Fenilalanin
Leu : Leusin
Ser : Serin
Tyr : Tirosin
Cys : Sistein
Trp : Triptofan
Pro : Prolin
His : Histidin
Gln : Glutamin
Arg : Arginin
Ice : Isoleusin
Met : Metionin
Thr : Treonin
Asn : Asparagin
Lys : Lisin
Ser : Serin
Val : Valin
Ala : Alanin
Asp : Asam aspartat
Glu : Asam glutamat
Gly : Glisin
U C A G
U UUU UCU UAU UGU U
UUC phe UCC UAC Tyr UGC Cys
C
UCA ser Kode
UUA UCG UAA stop UGA stop A
UUG Genetik
UAG stop UGG Trp G
CUU
C CUC Leu CCU CAU CGU U
CUA CCC CAC His CGC C
CUG CCA pro CGA Arg
CCG CAA CGG A
CAG Gln
G
A AUU ACU AAU AGU U
AUC Ile AAC Asn AGC Ser
ACC C
AUA
ACA Thr AAA AGA A
AAG Lys AGG Arg
AUG met ACG G
start
G GUU GCU GAU GGU U
GUC Val GCC GAC Asp GGC
C
GUA GCA Ala GGA Gly
GUG GCG GAA GGG A
GAG Glu
G