Denaturasi Protein

Kehilangan
Menurun / hilangnya
karakteristik bentuk
fungsi protein
tiga dimensi
Denaturasi tidak merubah struktur primer protein

1. Suhu
Pergerakan Mengalami Kerusakan Protein Koagulasi
Suhu >> molekul >> vibrasi ikatan terdenaturasi protein
2. pH Muatan +
Penambahan
Karakteristik basa
Protein dinetralkan
gugus R Muatan - Penambahan isoelektrik

asam

Menggumpal
dan
mengendap
 3. Pelarut Organik

Rantai samping residu

Pelarut Organik Ikatan hidrogen,
Merusak ikatan asam amino nonpolar lebih
interaksi hidrofobik
larut pada pelarut organik
dibandingkan air.

4. Detergen

hidrofil hidrofob detergen merusak interaksi

rantai protein tidak melipat
hidrofilik

5. Logam Berat
membentuk ikatan
dengan gugus rantai Protein kehilangan
samping asam amino konformasi

6. Gerakan Mekanik Pengocokan

Merusak interaksi yang
Pukulan memelihara konformasi
protein
Goncangan
Protein pada basis data Cazy, PDB dan Genbank
• Cazy : data yang berhubungan dengan enzim
dan substratnya karbohidrat
• PDB (Protein Data Bank) : data protein
terutama berhubungan dengan struktur tiga
dimensi
• GenBank : sekuens residu asam amino suatu
protein dan sekuens basa nukleotida suatu gen
Contoh data bio exoinulinase dari Bacillus subtilis