Prokariot dan Eukariot

Klasifikasi sel

Prokariot dan eukariot

 Sel
Prokariot
Eukariot
Sel prokariot: bakteri
Tidak memiliki nukleus - DNA bebas dalam
sitoplasma
Tidak memiliki membrane-bound organelles
Berukuran lebih kecil
Sebagian besar memiliki dinding sel
Polisakarida menutupi dinding sel pada banyak
spesies
Genom:

Kandungan genetik total pada set haploid kromosom pada

eukariot
Kromosom tunggal pada bakteri atau pada DNA atau RNA
virus
Material genetik pada organisme
Genom bakteri terdiri dari kromosom sirkular

Terkondensasi dengan cara supercoiling

dan looping membentuk badan nukleoid
yang terpak secara rapat

Kromosom bereplikasi di dalam sel dan

sel membelah secara biner
Genom bakteri
Circular dsDNA

G+C = 50%

G+C content merupakan struktur genom

Gen transfer pada bakteri

Transduction:
Melalui bacteriophage

Conjugation:
Kontak langsung

Transformation:
Mengintegrasikan free
DNA atau plasmid
(from Redfield, Nat. Rev. Genet. 2001)
Plasmid adalah DNA sirkular kecil
yang terdapat pada sel prokariot
 Plasmids
Extra chromosomal circular DNAs
 Ditemukan pada bakteri
 Ukuran bervariasi dari ~ 3,000 bp sampai 100,000 bp.
 Bereplikasi secara otonomi (origin of replication)
 Dapat mengandung gen resisten
 Dapat ditransfer dari satu bakteri ke bakteri lainnya
 Dapat ditransfer kepada kingdom yang berbeda
 Multicopy plasmids (~ up to 400 plasmids/per cell)
 Low copy plasmids (1 –2 copies per cell)
 Digunakan sebagai vektor untuk membawa gen yang
diinginkan
Genom bakteri berukuran kecil dan terpak secara padat dengan gen-gen
Spesies Ukuran genom (Mb)
Fungi
Saccharomyces cerevisiae 12.1
Aspergillus nidulans 25.4
Protozoa
Tetrahymena pyriformis 190
Invertebrates
Caenorhabditis elegans 97
Drosophila melanogaster 180
Bombyx mori (silkworm) 490
Strongylocentrotus purpuratus (sea urchin) 845
Locusta migratoria (locust) 5000
Vertebrates
Takifugu rubripes (pufferfish) 400
Homo sapiens 3200
Mus musculus (mouse) 3300
Plants
Arabidopsis thaliana (vetch) 125
Oryza sativa (rice) 430
Zea mays (maize) 2500
Pisum sativum (pea) 4800
Triticum aestivum (wheat) 16 000
Fritillaria assyriaca (fritillary) 120 000
ORGANISASI GEN
EUKARIOT dan PROKARIOT
SITOPLASMA

NUKLEUS INTRON
DNA
EKSON
RNA TRANKRIPSI

DNA

TRANKRIPSI
RNA
PENYAMBATAN TRANSLASI
RNA
mRNA
TRANSLASI PROTEIN

PROTEIN
Eukariot
Genom

Keseluruhan informasi genetik dalam suatu

organisme

Informasi genetik inti: terletak di kromosom

Infromasi genetik organel:
- mitokondria,
- plastid (kloroplast)
 Eucaryotic genomes
Berlokasi pada beberapa kromosom
Low gene density
Juga terdapat genom organel

Kromosom
Terlihat di dalam nukleus dengan zat pewarna
dan diamati dibawah mikroskop.
Material kromosom: Kromatin
Kromatin terdiri atas nukleosom
Nukleosome merupakan lilitan DNA pada molekul
protein yaitu protein histon
 Nukleosom terorganisasi ke dalam 30 nm benang-
benang
 Benang-benang terlipat-lipat membentuk 10,000-fold
compaction yang diperlukan untuk membentuk
kromosom eukariot di dalam nukleus.
Kekompakan genom

Karakteristik Yeast Lalat buah Manusia

Gene density (average number 479 76 11

per Mb)
Introns per gene (average) 0.04 3 9

Amount of the genome that is 3.4% 12% 44%

taken up by genome-wide
repeats
Genom Mitokondria (mtDNA)
Berbentuk circular chromosomes
Terdapat lebih dari satu
Berukuran ~15 Kb pada hewan
Berukuran ~ 200 kb sampai 2,500 kb pada
tumbuhan
Lebih dari 95% protein mitokondria dikode di
genom nuklear.
Genom kloroplas (cpDNA)
Multiple circular molecules
Ukuran berkisar dari 120 kb sampai 160 kb
Mirip dengan mtDNA
Banyak protein kloroplas dikode di nukleus
(separate signal sequence)