METALLOENZIM

ENZIM KARBOKSIPEPTIDASE
Disusun Oleh:
PUTRI INTAN PRATIWI 24030112130068
RIYADINI UTARI 24030112130041
Pengertian dan Fungsi Karboksipeptidase
• Karboksipeptidase adalah enzim yang disintesis di pankreas dan disekresi
ke dalam usus halus.
• Enzim ini menghidrolisis peptida pertama atau ikatan amida pada
karboksil atau C-terminal akhir pada protein dan peptida.
 Klasifikasi Enzim Karboksipeptidase
• Enzim yang menggunakan logam sebagai sisi
aktifnya "metallo-carboxypeptidases
• Karboksipeptidase lain yang mengguanak an residu
serin pada sisi aktifnya "serine carboxypeptidases"
• Enzim yang menggunakan sistein sebagai sisi
aktifnya "cysteine carboxypeptidase"
Berdasarkan
mekanisme sisi aktif
Berdasarkan substrat
• Karboksipeptidase yang memiliki preferensi
kuat terhadap asam amino yang mengandung
rantai hidrokarbon aromatik atau bercabang
disebut Carboxypeptidase A (A untuk
aromatik / alifatik)
• Karboksipeptidase yang membelah asam amino
bermuatan positif (arginin, lisin) disebut
Carboxypeptidase B (B untuk Basic )
 Logam Zn dalam Karboksipeptidase

Enzim karboksipeptidase mengandung Zn (II) sebagai kofaktor ion logam

yang merupakan inti dari sisi aktif enzim.

• Ion seng dikoordinasikan dalam geometri tetrahedral dengan tiga rantai samping asam amino pada

sisi aktif: melalui Nitrogen dari histidin-69, melalui N dari Histidin 196, dan
melalui Oksigen dari asam glutamat-72.  Posisi ikatan keempat adalah salah satu molekul air atau
oksigen dari karbonil dari glisin-1 seperti yang ditunjukkan pada gambar berikut.
Posisi logam dalam Karboksipeptidase

Keterangan
• Red = O
• Blue = N
• Cyan = Zn
• Gray = C
• Magenta = Substrate-peptide backbone
Logam Zn dalam Karboksipeptidase
• Karboksipeptidase diisolasi dari pankreas. Secara alami enzim ini
mengandung satu atom Zn per molekul protein. 
• Atom Zn memainkan peran integral dalam pembelahan substrat
• Zn mempolarisasi gugus karbonil dari-substrat,
 Zn+…0ᵟ- - Cᵟ+,
hal ini bertujuan untuk membuat atom karbon dari gugus
karbonil ini lebih rentan terhadap serangan nukleofilik.
 Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim
Karboksipeptidase dengan Substrat
• Ada dua mekanisme yang diusulkan untuk fungsi katalitik Enzim
Carboxypeptidase
• Yang pertama adalah jalur nukleofilik yang melibatkan enzim asil kovalen
intermediet yang mengandung sisi aktif basa Glu-270.
• Mekanisme kedua yang diusulkan adalah jalur air yang dipromosikan.
Mekanisme ini melibatkan serangan molekul air pada ikatan peptida substrat.
Proses ini dipromosikan oleh ion seng dan dibantu oleh residu Glu-270.
 Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim
Karboksipeptidase dengan Substrat
• Fungsi dari enzim Karboksipeptidase adalah untuk menghidrolisis ikatan 
peptida  pada amida pada ujung C-terminal.
• Dalam contoh dipeptida adalah Gly-tyr, dimana tyr adalah di ujung C-
terminal. Ikatan amida adalah antara Gly dan tyr tersebut.

Struktur Gly-Tyr
Mekanisme lain yang diusulkan yaitu arg-127
berinteraksi dengan  karbonil.

Ion seng masih
Ikatan karbonil diaktifkan oleh
mempertahankan ikatan dengan air yang
Berbagai mekanisme telah diusulkan untuk
interaksi denganoleh
kemudian diaktifkan ion Zn. Hal ini
glutathione-270.
bagaimana ikatan peptida ini putus seperti
menyebabkan penambahan-OH dari
yang ditunjukkan oleh garis bergerigi merah 
air ke karbonil untuk menghasilkan asam dan 
putusnyaa iikatan CN. pada
kemudian hidroksida menyerang
karbon karbonil yang mengakibatkan
pemutusan ikatan amida.

Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim Karboksipeptidase dengan Substrat

 Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim
Karboksipeptidase dengan Substrat
•Dalam enzim bebas, bilangan koordinasi seng adalah lima; pusat logam dikoordinasikan
dengan dua nitrogen imidazol Nδ1, dua oksigen karboksilat dari glutamat-72, dan molekul
air untuk membentuk tetrahedral terdistorsi. Namun, setelah substrat mengikat di situs aktif
Carboxypeptidase , bilangan koordinasi ini dapat bervariasi 5-6.

•Ketika terikat dipeptida glycyl-L-tirosin, nitrogen amino dari dipeptida dan oksigen karbonil
menggantikan ligan air. Hal ini akan menghasilkan bilangan koordinasi enam untuk seng
pada kompleks Carboxypeptidase dipeptida A- glycyl-L-tirosin.

•Peta kerapatan elektron memberikan bukti bahwa nitrogen amino menempati posisi kedua
di dekat glutamat-270. Kedekatan dua residu ini akan menghasilkan halangan sterik
mencegah ligan air dari koordinasi dengan seng.
 Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim
Karboksipeptidase dengan Substrat
•Untuk memecah protein menjadi asam amino penyusunnya, sel menggunakan reaksi hidrolisis. Protein
bereaksi dengan molekul air untuk menghasilkan asam amino dan protein baru yang lebih kecil. Enzim
Carboxypeptidase A disekresikan oleh pankreas dan digunakan untuk mempercepat reaksi hidrolisis ini.

•Hidrolisis ikatan peptida kemungkinan besar terjadi jika terminal memiliki rantai samping hidrokarbon
besar atau aromatik. Sebuah ion Zn2+ yang terikat erat di dekat sisi aktif membantu dalam katalisis.

•Tiga ikatan hidrogen dan interaksi elektrostatik sangat penting bagi enzim untuk mengenali asam amino
terminal dalam rantai peptida. Intermediate distabilkan oleh interaksi dengan Zn2 ​+ dan molekul
Carboxypeptidase.

•Langkah terakhir adalah transfer proton dan pembelahan ikatan peptida.

Terima Kasih