METALLOENZIM

ENZIM KARBOKSIPEPTIDASE
Disusun Oleh:
PUTRI INTAN PRATIWI 24030112130068
RIYADINI UTARI 24030112130041
Pengertian dan Fungsi Karboksipeptidase
• Karboksipeptidase adalah enzim yang disintesis di pankreas
dan disekresi ke dalam usus halus.
• Enzim ini menghidrolisis peptida pertama atau ikatan amida
pada karboksil atau C-terminal akhir pada protein dan
peptida.
 Klasifikasi Enzim Karboksipeptidase
• Enzim yang menggunakan logam sebagai
sisi aktifnya "metallo-carboxypeptidases
• Karboksipeptidase lain yang mengguanak
an residu serin pada sisi aktifnya "serine
carboxypeptidases"
• Enzim yang menggunakan sistein sebagai sisi
aktifnya "cysteine carboxypeptidase"
Berdasarkan
mekanisme sisi
aktif
Berdasarkan
substrat
• Karboksipeptidase yang memiliki
preferensi kuat terhadap asam amino
yang mengandung rantai hidrokarbon
aromatik atau bercabang disebut
Carboxypeptidase A (A untuk aromatik /
alifatik)
• Karboksipeptidase yang membelah
asam amino bermuatan positif (arginin,
lisin) disebut Carboxypeptidase B (B
untuk Basic )
 Logam Zn dalam Karboksipeptidase

Enzim karboksipeptidase mengandung Zn (II) sebagai kofaktor

ion logam yang merupakan inti dari sisi aktif enzim.

• Ion seng dikoordinasikan dalam geometri tetrahedral dengan tiga rantai samping
asam amino pada sisi aktif: melalui Nitrogen dari histidin-69, melalui N dari
Histidin 196, dan melalui Oksigen dari asam glutamat-72. Posisi ikatan keempat
adalah salah satu molekul air atau oksigen dari karbonil dari glisin-1 seperti yang
ditunjukkan pada gambar berikut.
Posisi logam dalam Karboksipeptidase

Keterangan
• Red = O
• Blue = N
• Cyan = Zn
• Gray = C
• Magenta = Substrate-peptide
backbone
Logam Zn dalam Karboksipeptidase
• Karboksipeptidase diisolasi dari pankreas. Secara alami
enzim ini mengandung satu atom Zn per molekul protein.
• Atom Zn memainkan peran integral dalam
pembelahan substrat
• Zn mempolarisasi gugus karbonil dari-substrat,
Zn+…0ᵟ- - Cᵟ+,
hal ini bertujuan untuk membuat atom karbon dari gugus
karbonil ini lebih rentan terhadap serangan nukleofilik.
 Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim
Karboksipeptidase dengan Substrat
• Ada dua mekanisme yang diusulkan untuk fungsi katalitik Enzim
Carboxypeptidase
• Yang pertama adalah jalur nukleofilik yang melibatkan enzim
asil kovalen intermediet yang mengandung sisi aktif basa Glu-
270.
• Mekanisme kedua yang diusulkan adalah jalur air yang
dipromosikan. Mekanisme ini melibatkan serangan molekul air
pada ikatan peptida substrat. Proses ini dipromosikan oleh ion
seng dan dibantu oleh residu Glu-270.
 Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim
Karboksipeptidase dengan Substrat
• Fungsi dari enzim Karboksipeptidase adalah untuk menghidrolisis
ikatan peptida pada amida pada ujung C-terminal.
• Dalam contoh dipeptida adalah Gly-tyr, dimana tyr adalah di
ujung C-terminal. Ikatan amida adalah antara Gly
dan tyr tersebut.

Struktur Gly-Tyr
 Mekanisme lain yang diusulkan yaitu
arg-127 berinteraksi dengan karbonil.

Ion seng masih

Ikatan karbonil diaktifkan
mempertahankan oleh
ikatan dengan
Berbagai mekanisme telah
interaksi
air dengan ion
yang kemudian Zn. Hal oleh
diaktifkan ini
diusulkan untuk bagaimana ikatan
menyebabkan penambahan-OH dari
glutathione-270.
peptida ini putus seperti yang
air ke karbonil untuk
ditunjukkan oleh
menghasilkan
kemudian asam dan putusnyaa
garishidroksida
bergerigi menyerang
merah
pada karbon
iikatan karbonil
CN. yang
mengakibatkan
pemutusan ikatan amida.

Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim Karboksipeptidase dengan Substrat

 Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim
Karboksipeptidase dengan Substrat
•Dalam enzim bebas, bilangan koordinasi seng adalah lima; pusat logam dikoordinasikan
dengan dua nitrogen imidazol Nδ1, dua oksigen karboksilat dari glutamat-72, dan molekul
air untuk membentuk tetrahedral terdistorsi. Namun, setelah substrat mengikat di situs aktif
Carboxypeptidase , bilangan koordinasi ini dapat bervariasi 5-6.

•Ketika terikat dipeptida glycyl-L-tirosin, nitrogen amino dari dipeptida dan oksigen karbonil
menggantikan ligan air. Hal ini akan menghasilkan bilangan koordinasi enam untuk seng
pada kompleks Carboxypeptidase dipeptida A- glycyl-L-tirosin.

•Peta kerapatan elektron memberikan bukti bahwa nitrogen amino menempati posisi kedua
di dekat glutamat-270. Kedekatan dua residu ini akan menghasilkan halangan sterik
mencegah ligan air dari koordinasi dengan seng.
 Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim
Karboksipeptidase dengan Substrat
•Untuk memecah protein menjadi asam amino penyusunnya, sel menggunakan reaksi hidrolisis. Protein
bereaksi dengan molekul air untuk menghasilkan asam amino dan protein baru yang lebih kecil. Enzim
Carboxypeptidase A disekresikan oleh pankreas dan digunakan untuk mempercepat reaksi hidrolisis ini.

•Hidrolisis ikatan peptida kemungkinan besar terjadi jika terminal memiliki rantai samping hidrokarbon
besar atau aromatik. Sebuah ion Zn2+ yang terikat erat di dekat sisi aktif membantu dalam katalisis.

•Tiga ikatan hidrogen dan interaksi elektrostatik sangat penting bagi enzim untuk mengenali asam amino
terminal dalam rantai peptida. Intermediate distabilkan oleh interaksi dengan Zn2 ​+ dan molekul
Carboxypeptidase.

•Langkah terakhir adalah transfer proton dan pembelahan ikatan peptida.

Terima Kasih