METALLOENZIM

ENZIM KARBOKSIPEPTIDASE

Disusun Oleh:
PUTRI INTAN PRATIWI 24030112130068
RIYADINI UTARI
24030112130041

Pengertian dan Fungsi

Karboksipeptidase
Karboksipeptidase adalah enzim yang disintesis di
pankreas dan disekresi ke dalam usus halus.
Enzim ini menghidrolisis peptida pertama atau ikatan
amida pada karboksil atau C-terminal akhir pada protein
dan peptida.

Klasifikasi Enzim
Karboksipeptidase
Enzim yang menggunakan logam
sebagai sisi aktifnya "metallocarboxypeptidases
Karboksipeptidase lain yang
mengguanak an residu serin pada sisi
aktifnya "serine carboxypeptidases"
Enzim yang menggunakan sistein
sebagai sisi aktifnya "cysteine
carboxypeptidase"

Berdasarkan
mekanisme sisi
aktif

Berdasarkan
substrat
Karboksipeptidase yang memiliki
preferensi kuat terhadap asam amino
yang mengandung rantai hidrokarbon
aromatik atau bercabang disebut
Carboxypeptidase A (A untuk
aromatik / alifatik)
Karboksipeptidase yang membelah
asam amino bermuatan positif
(arginin, lisin) disebut
Carboxypeptidase B (B untuk Basic )

Logam Zn dalam Karboksipeptidase

Enzimkarboksipeptidase

mengandungZn

(II)sebagai

kofaktor ionlogam yang merupakan intidari sisiaktif enzim.

Ionsengdikoordinasikandalam geometritetrahedraldengan tiga
rantaisamping asam aminopada sisi aktif: melaluiNitrogen dari histidin-69,
melaluiN dari Histidin196,dan melaluiOksigendariasam glutamat-72. Posisi
ikatan keempat adalah salah satumolekulair atau oksigen
darikarbonildariglisin-1seperti yang ditunjukkan pada gambar berikut.

Posisi logam dalam

Karboksipeptidase
Keterangan
Red = O
Blue = N
Cyan = Zn
Gray = C
Magenta = Substrate-peptide
backbone

Logam Zn dalam
Karboksipeptidase
Karboksipeptidasediisolasi daripankreas.Secara alami
enzim ini mengandungsatu atomZnper molekul protein.
Atom Znmemainkanperan integral dalam
pembelahansubstrat
Zn mempolarisasigugus karbonil dari-substrat,

Zn+0--C+,
hal ini bertujuanuntuk membuat atom karbon darigugus
karbonilinilebih rentan terhadap serangannukleofilik.

Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim

Karboksipeptidase dengan Substrat
Ada dua mekanisme yang diusulkan untuk fungsi katalitik
Enzim Carboxypeptidase
Yang pertama adalah jalur nukleofilik yang melibatkan enzim
asil kovalen intermediet yang mengandung sisi aktif basa Glu270.
Mekanisme kedua yang diusulkan adalah jalur air yang
dipromosikan. Mekanisme ini melibatkan serangan molekul air
pada ikatan peptida substrat. Proses ini dipromosikan oleh ion
seng dan dibantu oleh residu Glu-270.

Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim

Karboksipeptidase dengan Substrat
Fungsi darienzim Karboksipeptidaseadalah
untukmenghidrolisis ikatan peptida padaamidapada
ujungC-terminal.
Dalam contohdipeptidaadalahGly-tyr, dimanatyradalah di
ujungC-terminal.Ikatanamidaadalah antara Gly
dantyrtersebut.
Struktur Gly-Tyr

Mekanismelain yang diusulkanyaitu

arg-127 berinteraksi dengan
karbonil.
Ionsengmasih
Ikatankarbonildiaktifkan oleh
mempertahankanikatandengan
Berbagai mekanismetelah
interaksidengan
ionZn.Hal oleh
ini
airyang
kemudiandiaktifkan
diusulkanuntuk
bagaimanaikatan
menyebabkanpenambahan-OH
dari
glutathione-270.
peptida
ini putusseperti yang
airkekarboniluntuk
ditunjukkanoleh
menghasilkanasam dan putusnyaa
garisbergerigimerah
kemudianhidroksidamenyerang
iikatanCN.
pada karbonkarbonilyang
mengakibatkan
pemutusanikatanamida.

Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim Karboksipeptidase dengan Substrat

Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim

Karboksipeptidase dengan Substrat
Dalam enzim bebas, bilangan koordinasi seng adalah lima; pusat logam
dikoordinasikan dengan dua nitrogen imidazol N1, dua oksigen
karboksilat dari glutamat-72, dan molekul air untuk membentuk
tetrahedral terdistorsi. Namun, setelah substrat mengikat di situs aktif
Carboxypeptidase , bilangan koordinasi ini dapat bervariasi 5-6.
Ketika terikat dipeptida glycyl-L-tirosin, nitrogen amino dari dipeptida dan
oksigen karbonil menggantikan ligan air. Hal ini akan menghasilkan
bilangan koordinasi enam untuk seng pada kompleks Carboxypeptidase
dipeptida A- glycyl-L-tirosin.
Peta kerapatan elektron memberikan bukti bahwa nitrogen amino
menempati posisi kedua di dekat glutamat-270. Kedekatan dua residu ini

Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim

Karboksipeptidase dengan Substrat
Untuk memecah protein menjadi asam amino penyusunnya, sel menggunakan
reaksi hidrolisis. Protein bereaksi dengan molekul air untuk menghasilkan asam
amino dan protein baru yang lebih kecil. Enzim Carboxypeptidase A disekresikan
oleh pankreas dan digunakan untuk mempercepat reaksi hidrolisis ini.
Hidrolisis ikatan peptida kemungkinan besar terjadi jika terminal memiliki rantai
samping hidrokarbon besar atau aromatik. Sebuah ion Zn 2+ yang terikat erat di
dekat sisi aktif membantu dalam katalisis.
Tiga ikatan hidrogen dan interaksi elektrostatik sangat penting bagi enzim untuk
mengenali asam amino terminal dalam rantai peptida. Intermediate distabilkan
oleh interaksi dengan Zn2 + dan molekul Carboxypeptidase.
Langkah terakhir adalah transfer proton dan pembelahan ikatan peptida.

Terima Kasih